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Séminaire INRA-LORIA 1/03/2010 ,
LAE Nancy - Colmar Equipe Agriculture Durable
Françoise LASSERRE-JOULIN
UMR Nancy-Université - INRAAgronomie-Environnement (LAE)
Equipe Agriculture [email protected]
Construction d’indicateurs de mesure de l’impact des pratiques agricoles et de gestion du paysage sur le service écosystémique de régulation des
ravageurs
Séminaire INRA-LORIA 1/03/2010
LAE Nancy - Colmar Equipe Agriculture Durable
Contexte général
• A/ Objectifs équipe LAE• B/ Objectif équipe
INRA Mirecourt axe 1Elaboration outils d’évaluation
des pratiques agricoles et de gestion paysage sur services écosystémiques rendus par biodiversité
Elaboration outils pilotage systèmes de production innovants « partenaires de la nature »
Conversion AB station
Construction indicateur impact des pratiques sur efficience prédation par auxiliaires terrestres
Impact systèmes productions sur dynamiques populations auxiliaires terrestres
• Mes objectifs • Objectifs communs
Séminaire INRA-LORIA 1/03/2010
LAE Nancy - Colmar Equipe Agriculture Durable
Travaux de recherches préalables
A1/ comparaison deux méthodes construction indicateur (thèse B. Clergué)
Arbre décision Arbre décision
à dire expert par fouille données
(algorithme C4.5. Weka)
-intérêt de fouille données pour prise en compte concomitante de différentes échelles (parcelle, exploitation, territoire)
- garantie de plus d’objectivité / méthode à dire d’expert (ou mesure incertitude plus aisée)
B/ Impact systèmes prod sur dynamiques pop auxiliaires terrestres
- évolution pop point zéro 2006 (stage M1)
- évolution pop en 2010 (stage M1)
- premières tendances à conforter sur analyses plusieurs années
- nécessité recours à méthodes analyses multivariées, spatialisation données
Séminaire INRA-LORIA 1/03/2010
LAE Nancy - Colmar Equipe Agriculture Durable
attributs var1 Var n Var sortie
Site 1 Nb espèces
Site 2 …
…
Site n ….
Algorithme C4 5(Quinlan, 1993)
weka 3.4.
3 bases données source
Arbres décision
A1/ Comparaison deux méthodes construction indicateur (thèse Boris Clergué)
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Arbre de décision obtenu par fouille
données
Classe de nombre d’espècescarabes
Echelle = parcelle| Nombre d’applications de pesticides = 0| | Type d’habitat = Prairie permanente : | | Type d’habitat = Prairie temporaire :| | Type d’habitat = Céréale : | | Type d’habitat = Haie| | | âge de la haie <= 5 ans : | | | âge de la haie > 5 ans : CCS : 40,7%ACS : 73,5%
2 (14.28/6.35)2 (16.28/10.51)3 (25.11/15.44) 7 (2.17/0.17)6 (3.25/1.25)
- supériorité méthode fouille de données, mais nécessité d’affiner connaissance conditions d’usage
- 3 échelles concomittantes: parcelle, exploitation, territoire
- insuffisance variable de sortie (diversité spécifique)
- validation partielle à l’échelle parcelle sur base données publications internationales
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A2/ Mesure impact pratiques agricoles + gestion bordures sur effectifs prédateurs/proies et efficience prédation (pg Casdar + Thèse INRA-Région )
•Évaluation de la diversité et l’abondance des prédateurs (2009-2011) et proies.
•Évaluation efficience prédation (2010-2011) avec mise en place « proies sentinelles »
• Protection proies par des cages en grillage d’une maille carrée de 12,8 mm (Meek et al., 2002).
• comptage des proies sentinelles prédatées effectué après 24 et 48 heures.
Différents types de bordures de champs
Témoin sans prédation
Séminaire INRA-LORIA 1/03/2010
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Quels outils d’analyse pour résoudre nos questions?
• quelle est la hiérarchie des variables de l’environnement (pratiques, paysage) selon leur impact sur la fonction de régulation?
• quels autres outils de classification que l’algorithme C4.5. (intégrant de façon concomitante différentes échelles)?
• comment faire si l’on a deux variables de sortie à confronter (proies/prédateurs)
• comment intégrer la spatialisation des données dans bases de données source?
• comment intégrer données spatiales avec niveaux précision différentes (description bordures champs / paysage environnant)?
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Quels outils d’analyse pour résoudre nos questions?
• comment établir une variable de sortie complexe « d ’efficience de la régulation des ravageurs »?
• comment intégrer différentes variables de sorties?
• peut-on agréger résultats d’expériences avec différents couples prédateurs/proies ? Et comment?
• comment intégrer la prédation à différentes distances de bordure?
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B/ Impact systèmes production sur dynamiques populations auxiliaires terrestres
Réseau 72 pièges Barber
Répartis dans les différentes parcelles, selon systèmes cultures
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Impact du type de culture sur les effectifs moyens des différents ordres d'arthropodes piégés au printemps 2006
-10
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
110
120
Araneida Isopodes Coleopteraautres
Carabidae Staphylinidae Diptera ND Orthoptera Myriapodes ND
luzerne blé blé-fétuque orge orge-luz tritical tritical-pois avoine-féverole
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LAE Nancy - Colmar Equipe Agriculture Durable
Quels outils d’analyse pour résoudre nos questions?
• quelle est la hiérarchie des variables de l’environnement (pratiques, paysage) selon leur impact sur la diversité et l’abondance des différents ordres, espèces arthropodes?
• quels outils d’analyse utiliser pour intégrer la spatialisation des données, tout en conservant l’objectif de hiérarchisation des variables de l’environnement?
• comment intégrer différentes variables de description de la dynamique de population des arthropodes (diversité, abondance…..) sans forcément avoir recours à des indices complexes à interpréter (ex: Indice de Shannon, équitabilité,….)?
Séminaire INRA-LORIA 1/03/2010
LAE Nancy - Colmar Equipe Agriculture Durable
Quels outils d’analyse pour résoudre nos questions?
• quel est l’impact des nouveaux systèmes de production sur la dynamique des populations au long terme ? (4 ans de recul)
• doit-on attendre fin d’une rotation complète pour cela? (6 ou 8 ans)
• quel outil d’analyse le plus adapté pour faire ressortir les évolutions les plus « saillantes », alors que chaque piège constitue une situation particulière?….
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Conclusion
• Mur « méthodologique »: besoin véritable boîte à outils
• Thèse INRA région 2010-2013• Volonté de déposer projet CRCT pour
2011-2012