Type de Licence · les domaines de la physiopathologie, biotechnologie des végétaux , ... Atlas de poche de biotechnologie et de génie génétique / Rolf D. Schmid

Domaine : Science de la nature et de la vie

Filière : Biologie Spécialité : Innovation et Ecophysiologie des plantes

Formation Académique

Arrêté N° 344 du 01/09/10

- Responsable de l'équipe de spécialité

Nom & prénom : Ababou Adda Grade : : Maître assistant A. : 027 72 63 04 Fax : 027 72 63 04 E - mail :

– Contexte et objectifs de la formation

A – Conditions d’accès

Les étudiants qui peuvent accéder au Master Biotechnologie végétale doivent être titulaire d'une licence dans les spécialités suivantes : Biotechnologie Microbienne et végétale, Analyse Biologique et Biochimique, physiologie végétale et génie biologie C - Objectifs de la formation

Ils sont de former des chercheurs et cadres afin de soutenir la dynamique de recherche dans le secteur des Sciences, des Productions et de la santé .Il s'agit d'un Master qui couvre deux parcours le premier sera centré sur les connaissances portant sur le bio médicament, le contrôle microbiologique des produits de santé, les méthodes de stérilisation et de décontamination ainsi que sur le contrôle de la qualité des bio médicaments et leurs commercialisation .Le second fournira aux étudiants les moyens d’appréhender de manière intégrée les sciences du végétal et leurs applications agronomiques, biotechnologiques et agroalimentaires .Cette formation est un pré requis essentiel pour accéder au secteur de la recherche/développement. Face aux enjeux économiques et sociétaux et à l’évolution de l’agriculture (en particulier les filières végétales), il s’agit de préparer, à et par la recherche, des cadres compétents capables de maîtriser les moyens et les enjeux des productions végétales et de définir les priorités en matière d’investigation et d’innovation en lien avec des objectifs de durabilité, de compétitivité et de qualité. Le cursus proposé permettra l’acquisition de connaissances récentes, largement irriguées par les thématiques de recherche des différents partenaires, sur l’organisation, le fonctionnement et les fonctionnalités de la plante, du peuplement et de l’agrosystème et sur les mécanismes d’élaboration de la qualité des productions. Ces objectifs de formation prendront largement en compte les contraintes imposées par les plans d’aménagement et de développement durables et notamment celles liées à la nécessité de préserver la qualité de l’environnement et d’assurer la

prévention des risques liés à l’évolution rapide des connaissances et des technologies D – Profils et compétences visées

Ils sont de former des chercheurs et cadres afin de soutenir la dynamique de

recherche dans le secteur des Sciences, des Productions et de la santé et

Acquérir des connaissances théoriques sur les principales voies de

signalisation de la cellule végétale et une expertise dans l’analyse critique

Formation concrète du point de vue des approches expérimentales qui

apportent une ouverture sur les applications de la recherche dans les

secteurs sanitaire, agronomique, environnemental et industriel. Celles-ci

tiennent compte des thèmes fédérateurs s'inscrivant dans les thématiques

soutenues par les établissements habilités et des besoins socio-

économiques. Ce type de master convient aux étudiants qui envisagent une

carrière à l'issue du Master 2, les étudiants intègrent principalement un

laboratoire de recherche afin de poursuivre en doctorat. Leur formation dans

les domaines de la physiopathologie, biotechnologie des végétaux ,

phytothérapie et des biomolécules leur ouvre des perspectives démontrées

dans des laboratoires de recherche ou de développement dans le secteur

industriel des biotechnologies, de l’agro-alimentaire et de la santé

E- Potentialités régionales et nationales d’employabilité Institutions d'enseignements supérieurs et les laboratoires de recherche F – Passerelles vers les autres spécialités Génie biologie

Analyses biologique et biochimique

Physiologie de la reproduction végétale Pharmacologie

G – Indicateurs de suivi du projet

L'équipe pédagogique s'appuie sur un ensemble cohérent basé sur la synergie des

savoir-faire scientifiques, des moyens techniques, des expériences dans le domaine de la

recherche et de l'enseignement durant toute la formation. Une évaluation continue des

étudiants, Un accompagnement permanent durant la réalisation des stages et

l’estimation du nombre de diplômés par rapport au total d’étudiants inscrits constituent

des indicateurs, qui seront renseignés régulièrement, témoignent de l’efficacité des actions

qui concourent, elles mêmes, à l’atteinte des objectifs stratégiques globaux

– Fiche d’organisation semestrielle des enseignements

1- Semestre 1 : M1 biotechnologie végétale

Unité d’Enseignement VHS V.H hebdomadaire

Coeff Crédits Mode d'évaluation

14-16 sem

C TD TP Autres Continu Examen

UE fondamentales

UEF1 (O/P)

Biochimie pathologie 45 1h30 1h30 4 5

Méthodes d’étude et de production de cellule et protéine

60 1h30 2h30 4 5

UEF2 (O/P)

Biothérapie et biotechnologie 60 1h30 2h30 4 5

Outils biotechnologiques 45 1h30 1h30 4 5

UE méthodologie

UEM1(O/P)

Métabolismes et métabolites végétaux

60 1h30 2h30 3 4

Adaptation des plantes aux contraintes de l’environnement

45 1h30 1h30 3 4

UE découverte

UED1(O/P)

anglais 45 1h30 1h30 2 2

Total Semestre 1 360 10h30 4h 9h30 24 30

2- Semestre 2 : M1 biotechnologie végétale



14-16 sem

C TD TP Autres Continu Examen

UE fondamentales

UEF1(O/P)

Découverte, conception et structure des molécules thérapeutiques

60 1h30 2h30 4 6

Gestion de la qualité et des risques en santé

45 1h30 sortie 4 6

UEF2(O/P)

phytothérapie 60 1h30 2h30 3 6

UE méthodologie

UEM1(O/P)

toxicologie 60 2h30 1h30 (1/15) 1h30 (1/15) sortie 3 4

UEM2(O/P)

Stratégie des bio-entreprise 45 1h30 1h30 sortie 3 4

UE découverte

UED1(O/P)

Technique de documentation et analyse des données

30 2h 3 4

Total Semestre 2 300 9H30 7H 1H30 30

3- Semestre 3 : M2 INNOVATION ET ECOPHYSIOLOGIE VEGETALE



14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen

UE fondamentales

UEF1(O/P)

Signalisation chez les plantes

60 1h30 1h30 1h 4 6

Génétique et évolution des plantes

60 1h30 2h30 4 6

UEF2(O/P)

Interaction plante-pathogene et épidémiologie

60 1h30 2h30 4 5

Ecophysiologie 45 1h30 1h30 3 5

UE méthodologie

UEM1(O/P)

Interface recherche-industrie et veille technologique

60 1h30 1h30 1h 3 4

UE découverte

UED1(O/P)

Initiation a la communication scientifique

45 1h30 1h30 2 4

Total Semestre 3 270 9h 7h 6h 22 30

4- Semestre 4 : Domaine : Filière : Spécialité : Travail de recherche au sein de l'entreprise ou d’un laboratoire spécialise avec des exposés oraux de l'état d'avancement. L’ensemble est sanctionné par un mémoire et une soutenance. .

VHS Coeff Crédits

Travail Personnel 30h 4 15

Stage en entreprise 30h 3 15

Séminaires

Autre (préciser)

Total Semestre 4 60h 30

- Programme détaillé par matière

Intitulé du Master : Innovation & Ecophysiologie des plantes

Intitulé de la matière : Biochimie pathologique

Semestre : s1

Enseignant responsable de l’UE : Mme Allem

Enseignant responsable de la matière: Mlle Koiche

Objectifs de l’enseignement (permet aux étudiants d'approfondir leurs connaissances

sur les équilibres hydrominéral, acido-basique et le fonctionnement métabolique vis-à-vis

des enzymes et des protéines

Connaissances préalables recommandées : biochimie, microbiologie, virologie et

infectiologie

Contenu de la matière :

1. Equilibre hydrominéral et troubles 2. Equilibre acido basique et troubles 3. Métabolisme phosphocalcique et troubles 4. Métabolisme du fer et troubles 5. Urée, créatinine sérique et urinaire 6. Enzymes sériques 7. Exploration électrophorétique des protéines sériques 8. Pathologie hormonale

Mode d’évaluation : …continu et examen ecrit……………………………………………

Références (Livres et polycopiés, sites internet, etc).

Biochimie pathologique : aspects moléculaires et cellulaires: Jacques Delattre

Biochimie des tissus conjonctifs normaux et pathologiques, 2. Paris, Val-de-

Marne, 28-30 août 1978

Biochimie des tissus conjonctifs normaux et pathologiques, :Ed. du CNRS

(Paris) Abrégé d'anatomie pathologique / Hans-Ulric Zollinger

http://bu.univ-chlef.dz/index.php?lvl=author_see&id=44823

http://bu.univ-chlef.dz/index.php?lvl=serie_see&id=4886

http://bu.univ-chlef.dz/index.php?lvl=publisher_see&id=5308




Intitulé de la matière : Méthode d’étude et de production de cellules et

de protéines

Semestre : s1

Enseignant responsable de l’UE : Bensaid A.

Enseignant responsable de la matière: Mme Nadji D.

Objectifs de l’enseignement (Les stratégies à mettre en oeuvre pour maximiser la production et l’obtention de biomolécules à partir des végétaux (cultures cellulaires, production in planta, transgenèse, purification et bioprocédés). Seront abordés des aspects fondamentaux et appliqués via des cours, TPs,

Connaissances préalables recommandées ( génétique , biochimie , biologie végétale et

animale , biologie moléculaire et génie génétique)


1 Production de protéines

o Systèmes de production

o Méthodes de caractérisation et contrôles qualité

o Evolution moléculaire pour la conception de protéines médicament

o Downstream process

2 Méthodes d’étude et de production de cellules mammifères

o Techniques d’études et d’analyse

o Modification in vitro des cellules

o Production de protéines recombinantes : différents exemples

3 stratégies de production et d'obtention des biomolécules à partir de végétaux (technique de

culture in vitro, production de métabolites secondaires par culture in vitro)



Production des substances naturelles par culture in-vitro de tissus et de cellules des végétaux

Acides nucléiques et synthèse des protéines chez les végétaux Agriculture biologique / Laurence Amand


Intitulé du module : Biothérapie et biotechnologie

Semestre : s1

Enseignant responsable de l’UE : Saadi A.

Enseignant responsable de la matière: Kouidri M.

Objectifs de l’enseignement (permettre aux étudiants d'approfondir leurs connaissances

sur les équilibres hydrominérals , acido-basique et les fonctions métaboliques des

enzymes et des protéines

Connaissances préalables recommandées (biochimie, chimie organique, physiologie

animale, enzymologie)


1. Equilibre hydrominéral et troubles 2. Equilibre acido basique et troubles 3. Métabolisme phosphocalcique et troubles 4. Métabolisme du fer et troubles 5. Urée, créatinine sérique et urinaire 6. Enzymes sériques 7. Exploration électrophorétique des protéines sériques 8. Pathologie hormonale

Mode d’évaluation : ……continu et examen ecrit…………………………………………


Amélioration des plantes et biotechnologies / Yves Demarly

L'Application des biotechnologies dans l'industrie chimique / Commissariat général du plan FRANCE

Les Applications des biotechnologies à l'agriculture et à l'industrie agroalimentaire / Daniel Chevallier

Arts et biotechnologies

Atlas de poche de biotechnologie et de génie génétique / Rolf D. Schmid

12 plantes et leurs huiles essentielles / Christian Brun


Intitulé du module : outils biotechnologiques

Semestre : S1

Enseignant responsable de l’UE : Sbaihia N.

Enseignant responsable de la matière: Mahieddine M.

Objectifs de l’enseignement (L'objectif est de présenter un panorama des

développements technologiques récents qui ont permis l'essor des approches

génomiques et des méthodes d'ingénierie moléculaire.

Connaissances préalables recommandées (biologie moléculaire et génie génétique)


1-Analyse des génomes (Construction de banques, validation ,Cartographies, linkage et Séquençage )

2- Etudes systématiques d'expression et d'interactions (Transcriptome, ChIp, ChIp on chip, Protéomique ,Double hybride et Tap-tag)

3- Approches systématiques de perturbation d'expression : (RNAi, génération systématique de mutants ) 4-Expression de protéines recombinantes 5- Méthodes et Applications de l'ingénierie des protéines: (Ingénierie rationnelle Evolution dirigée des protéines et des Acides nucléiques)

Mode d’évaluation : ………continu et examen ecrit………………………………………


Abrégé de biologie moléculaire / Gérard Lucotte Aide-mémoire de biochimie et biologie moléculaire / Pierre Kamoun Bio-informatique moléculaire / Pavel A. Pevzner Biochimie génétique, biologie moléculaire / Jacqueline Etienne Biologie et génétique moléculaires / Bernard Swynghedauw Les biomolécules / Christopher A. Smith

Chimie biologique des proteînes / Serge Mandel


Intitulé du module : Métabolismes et métabolites végétaux

Semestre : S1

Enseignant responsable de l’UE : Hamdani F/Z

Enseignant responsable de la matière: Examen et contrôle continu

Objectifs de l’enseignement (Acquérir des connaissances en biologie intégrative (approches physiologique et moléculaire) sur les voies métaboliques et leurs régulations chez les plantes. Initier aux concepts de métabolique et fluxomique. Aborder la notion de contrôle et de régulation du gène au réseau..

Connaissances préalables recommandées (biothérapie et biotechnologie, base

physiologique de la reproduction


-Métabolismes primaire et secondaire chez les végétaux (modèles biologiques

d'étude ; voies de biosynthèses ; applications. Terpènes, phenylpropanoïdes,

alcaloïdes, etc).

-Méthodes d'étude (enzymologie, métabolome, notions et mesures de flux).

-Contrôles et régulations (théorie du contrôle métabolique ; régulation génique ;

régulation allostérique ; régulation à l'échelle cellulaire et à l'échelle de la plante

entière).

-Étude des voies métaboliques par la transgénèse.

-Structure des membranes biologiques : asymétrie et diffusion transversale des

lipides, fluidité, lipid rafts, modulation des activités enzymatiques membranaires par

les lipides.

Mode d’évaluation : ………continu et examen écrit………………………………………


Physiologie végétale, 1. Nutrition et métabolisme / Paul Mazliak

ABC des grandes familles végétales / Raymonde Auger Amélioration des espèces végétales cultivées

L'Analyse végétale dans le contrôle de l'alimentation des plantes tempérées et tropicales / P.

Martin-Prevel


Intitulé du module :Adaptation des plantes aux contraintes de l’environnement

Semestre : S1

Enseignant responsable de l’UE : Bouthiba A.

Enseignant responsable de la matière: Bouthiba A.

Objectifs de l’enseignement (Acquérir des connaissances en biologie intégrative

(approches physiologique et moléculaire) sur la diversité des mécanismes de réponse des

plantes à leur environnement biotique et abiotique.

Connaissances préalables recommandées bases physiologique de la reproduction des

végétaux, biologie moléculaire, écologie microbienne, infectiologie végétal


Adaptation des plantes aux contraintes abiotiques :

-Adaptations physiologiques aux contraintes hydriques et salines (perception et transduction du

signal de stress, réorganisation de l'expression du génome, modifications métaboliques.

-Effet de l'intensité lumineuse sur les plantes : le stress oxydant, la photo-protection, le cycle des

xanthophylles, le rôle de l'acide ascorbique, des superoxydes dismutases, des catalases.

-Amélioration de la résistance aux stress environnementaux chez les espèces d'intérêt

agronomique.

Adaptations aux contraintes biotiques - Interactions plantes-bioagresseurs :

-Introduction à la pathologie végétale : classification, symptomatologie, processus parasitaire

des principaux agents pathogènes.

-Mécanismes de défense des plantes : étapes de reconnaissance, voies de signalisation et

mécanismes de défense (défense passive/active, métabolites antimicrobiens, la résistance

systémique acquise, la réaction hypersensible ).

Rôles des lipides dans la réponse des plantes aux contraintes biotiques et abiotiques :

o Réponses des plantes au froid et composition lipidique membranaire.

o Lipides membranaires et signalisation des processus de défense des plantes.

o Lipides cuticulaires : rôle dans la réponse au stress hydrique et aux attaques de pathogènes.



Fonctionnement des peuplements végétaux sous contraintes environnementales/ : Pascale

Maillard

Les introductions de plantes non indigènes dans l'environnement naturel/ : J. Lambinon

Organisation et adaptation à l'environnement / Richard Vairez

Les plantes sauvages du Sahel malien

1000 mariages de plantes / Didier Willery






Intitulé du module : Anglais scientifique

Semestre : S1

Enseignant responsable de l’UE : Mostefa Della h.

Enseignant responsable de la matière: Mostefa Della h.

Objectifs de l’enseignement (Maîtrise de l'anglais véhiculaire ; exploitation, analyse et

restitution de documents techniques ou scientifiques en langue anglaise. Il s’agit d’une

mise en pratique de la langue anglaise à travers des exercices écrits et oraux qui ont trait

à la communication scientifique.).

Connaissances préalables recommandées (Anglais du secondaire)


Analyse d'offres d'emploi, étude et réalisation de CV et lettre de motivation

Entretiens téléphoniques et entretiens d'embauche

Journée d'immersion anglaise

Outils pour l'installation éventuelle en pays étranger

Mode d’évaluation : contrôle continu et examen écrit………………


Anglais, compétence en prépa / Jean-Pierre Ancèle L'anglais des scientifiques / Anne Paquette Do you speak science? / Marc Défourneaux L'Anglais des prépas / Florent Gusdorf

Dictionnaire scientifique anglais-français / Jacques Bert


Intitulé du module : découverte, conception et structure des molécules

thérapeutiques

Semestre : S2

Enseignant responsable de l’UE : Mme Zidane A.

Enseignant responsable de la matière: Mme Zidane A.

Objectifs de l’enseignement Initiation à l’étude de médicaments et à la recherche de nouveaux principes actifs en exploitant les connaissances liées à l’interface Chimie Biologie

Connaissances préalables recommandées (en chimie, biochimie et pharmacologie).


1) Découverte, conception de principes actifs et développement de médicaments Découverte et identification Optimisation du principe actif :

2) Interaction ligand-cible 3) Relations Structure-pharmacocinétique (ADME : Absorption, Distribution, Métabolisation,



Structures et fonctions des molécules biologiques / J. Barrère Structures des protéines / Max Ferdinand Perutz

Structure et organisation / Michel Chastellain


Intitulé du module: gestion de la qualité et des risques en santé

Semestre : S2

Enseignant responsable de l’UE : Bensaid A.

Enseignant responsable de la matière: Bensaid A.

Objectifs de l’enseignement Connaissance des concepts et des principales méthodes de gestion de la qualité et des risques.

Connaissances préalables recommandées : pharmacologie, ecotoxicologie , outils

biotechnologique)


1) Concepts et méthodes de gestion de la qualité - Historique et évolution des concepts de gestion de la qualité : assurance qualité et amélioration continue de la qualité ; les normes ISO 9000 et les organismes de certification. - Le développement de la gestion de la qualité dans le domaine de la santé en France et à l’étranger : les organismes et les politiques ; l’accréditation et la certification des établissements de santé. - L’évaluation des pratiques professionnelles cadre réglementaire et principales méthodes : audit clinique, Revue de mortalité-morbidité, Revue de pertinence des soins, Indicateurs de performance, Chemin clinique. - Place des usagers dans les dispositifs de gestion de la qualité : comités d’usagers, satisfaction des usagers, gestion des plaintes. - Les outils de gestion de la qualité : méthodes de résolution de problèmes, documentation qualité. 2) gestion des risques sanitaires - Définitions et concepts : risques iatrogènes et nosocomiaux, la dimension systémique des risques, gestion des risques a priori et a posteriori, les vigilances sanitaires, réglementation, organisation. - Epidémiologie des risques iatrogènes : Sinistralité hospitalière ; étude ENEIS. - Systèmes de déclaration et de traitement des incidents ; méthodes d’analyse des événements indésirables. - Risque infectieux nosocomial - Risque lié aux médicaments - Autres risques spécifiques : risques liés aux produits sanguins ; toxicovigilance, risques liés aux dispositifs médicaux, biovigilance, réactovigilance, risque anesthésique, etc.. Mode d’évaluation : continu et examen ecrit………………………………………………


- Gestion prévisionnelle et valorisation des ressources humaines / L. Mathis

- Contrôle de gestion / Léo-Paul Lauzon

maitriser les cout et les performances caches / Henri Savall


Intitulé du module: phytothérapie

Semestre : s2

Enseignant responsable de l’UE : M’hammedi Bouzina M.

Enseignant responsable de la matière: M’hammedi Bouzina M.

Objectifs de l’enseignement : Ce programme doit permettre aux étudiants d’assurer dans les meilleurs conditions : la gestion du rayon phytothérapique de l’officine, le conseil dans le domaine du phytomedicament et de bien situer l’intérêt et les limites des médicaments a base de plantes.

Connaissances préalables recommandées (biologie végétale, physiologie de la

reproduction des végétaux, biochimie, pharmacologie etc


- Généralité et Définition de la Phytothérapie

- L’herboristerie à l’officine (Locaux, Achat des plantes médicinales, Réception, stockage des plantes médicinales, Aspect législatif)

- Plantes médicinales et leurs indications thérapeutiques

- Matières premières d’origine naturelle - Reconnaissance de drogues - Formes galéniques utilisées en phytothérapie, phytocosmétique

Mode d’évaluation : ……continu et écrit…………………………………………


167 plantes pour soigner les animaux / Jacques Cabaret

ABC de phytothérapie dans les maladies infectieuses / Christian Duraffourd

Abrégé de phytothérapie pratique / Maurice Rubin

Botanique, pharmacognosie, phytothérapie, homéopathie

Guide de la phytothérapie / Jorg Grünwald


Intitulé du module: Toxicologie

Semestre : S2

Enseignant responsable de l’UE : Setti B.

Enseignant responsable de la matière: Setti B.

Objectifs de l’enseignement (Présentation très générale des risques environnementaux

et de leurs effets sur la santé de l’homme. Pour cela les principaux polluants de

l’atmosphère

Connaissances préalables recommandées (biochimie, physiologie animale,

immunologie et pharmacologie


- Généralités sur la toxicologie expérimentale - Sort des molécules dans l’organisme : - pharmacocinétique des médicaments - toxicocinétique des xénobiotiques - Métabolisme et toxicité : toxification et détoxification - Facteurs physiologiques de variation de la toxicité - Toxicovigilance et centre antipoison - Toxicité organospécifique, mécanismes en hépatoxicité, néphrotoxicité, - neurotoxicité, hématoxicité, cancérogénicité, mutagénécité, - tératogénicité, immunotoxicité.

Mode d’évaluation : ……continu et examen ecrit…………………………………………


Abrégé de toxicologie clinique / R. H. Dreisbach Cas cliniques en toxicologie / Chantal Bismuth Dictionnaire de toxicologie clinique / Jean-Charles Hachet

Eléments de toxicologie / Alain Viala

Etude de la pharmacodépendance et de la toxicologie neurocomportementale : quo vadis? / J.

Berthe

Guide pratique de toxicologie / Franz-Xavier Reichl


Intitulé du module : Stratégie des bio entreprise

Semestre : S2

Enseignant responsable de l’UE : Saadoud M.

Enseignant responsable de la matière: Saadoud M.

Objectifs de l’enseignement (Sensibiliser des biologistes au monde de l'entreprise en

leur apportant de solides connaissances en gestion, marketing et communication

Connaissances préalables recommandées (maths et statistique)


- Création d'entreprise (" entrepreneurship " )

- Les bases de la création d'entreprise, le parcours du créateur, l'approche du

marché, le marketing selon MacKenna, les obstacles psychologiques, le montage

juridique et financier, témoignages de créateurs sous forme de conférences

- Gestion (Savoir lire un bilan, un compte d'exploitation à travers des études de

cas, quelques bases de comptabilité

- 3 Gestion des ressources humaines et sociologie de l'entreprise

Les différents types de management, la culture d'entreprise, le recrutement et

l'évolution de carrière, la PME opposée à la multinationale

Mode d’évaluation : ……………Continu et examen écrit…………………………………


- La gestion financière de l'entreprise : cas et commentaire / Elie Cohen

- mesure de la performance financiere de l'entreprise / Pierre Paucher - Modèles de croissance des entreprises / Jacques Lesourne

- le nouveau mecanisme economique en algeie / debboub,youssef


Intitulé du module : Techniques de documentation

Semestre : S2

Enseignant responsable de l’UE : Amzert D.

Enseignant responsable de la matière: Amzert D.

Objectifs de l’enseignement (permettre eux étudiants d’avoir les outils indispensable à

une bonne recherche bibliographique et la resolution d’une problématique posé

Connaissances préalables recommandées (descriptif succinct des connaissances

requises pour pouvoir suivre cet enseignement – Maximum 2 lignes).


1. Aborder une étude bibliographique sur un thème d’article permettant de donner au sujet une vision historique c’est à dire resortir les travaux antérieurs et leurs problématique et faire des recherches bibliographiques pour comprendre le rationnel des méthodes et stratégies employées dans l’article,

2. A partir de ça, les étudiants devront commencer à préparer leur présentation orale,

qui aura lieu vers la fin du semestre. Elle aura lieu sous la forme d’une présentation de 30 minutes suivie de questions posées par l’enseignant et les autres étudiants.



- Recherche bibliographique et documentaire / Christine Gérard

- La recherche bibliographique en médecine et santé publique / Évelyne Mouillet - La recherche documentaire et bibliographique en médecine et pharmacie / Pierre-

Marie Belbenoit-Avich

Master : Innovation & Ecophysiologie des plantes

Intitulé du module : signalisation chez les plantes

Semestre : S3 (parcours Innovation et Ecophysiologie végétale)


Enseignant responsable de la matière: Saadi A.

Objectifs de l’enseignement (Acquérir des connaissances théoriques sur les principales voies de signalisation de la cellule végétale et une expertise dans l’analyse critique et déductive de données expérimentales.

Connaissances préalables recommandées (biologie végétale, cytologie, base

physiologique de la reproduction chez les végétaux


1) Introduction à la biotechnologie végétale: Totipotence cellulaire et régénération, transformation du génome des plantes: aspects méthodologiques, hybridation somatique et transgénèse. Stratégies d'étiquetage des gènes. Plantes transgéniques: exemples d'applications. Inactivation des gènes: silencing, co-suppression et antisens. La problématique des plantes transgéniques.

2 Aspects cellulaires et moléculaires de la signalisation chez les végétaux

- Les plantes dans un environnement variable, - Signaux biotiques et abiotiques ; - Principaux messagers secondaires ; - Transport de macromolécules informationnelles (ex : floraison) - Les photorécepteurs et la lumière dans le développement des végétaux. - Perception et transduction des signaux (Ex : l’ouverture stomatique, les stratégies

de défense chez les végétaux), - Les récepteurs membranaires, les protéines G, les phospholipases, la signature

calcique (Ex : signal calcium dans la perception de la pesanteur et des mécanismes d’ouverture et de fermeture des stomates),

- rôle complexe des phytohormones (Auxine, Gibbérrélines, Cytokinines, Acide Abscissique ou Ethylène),

Mode d’évaluation : …continu et examen écrit……………………………………………


- Le pouvoir des plantes / James Alan Duke - plantes alimentaires chez tous les peuples et à travers les âges, 2. Phanérogames

fruitières / Désiré Bois - Des vampires chez les plantes / Georges Sallé

- 38 000 plantes / SOCIETE NATIONALE D'HORTICULTURE DE FRANCE


Intitulé du module : génétique et évolution des plantes

Semestre : S3 (parcours Innovation et Ecophysiologie végétale)

Enseignant responsable de l’UE : Nadji D.

Enseignant responsable de la matière: : Nadji D.

Objectifs de l’enseignement Se familiariser avec les concepts de la biologie de l'évolution. Acquérir les notions de base de génétique des caractères complexes, de génétique des populations, de phylogénie moléculaire et d'évolution.:

Connaissances préalables recommandées : génétique, biologie végétale, biothérapie et

biotechnologie


- - Architecture génétique des caractères complexes (analyse de liaison génétique,

étude du déséquilibre de liaison, détection de QTL, études d'associations

marqueur/caractère).

- Génétique des populations (structure des populations, dérive, flux de gènes,

sélection ; principe de délimitation des espèces, étude de l'hybridation, prédiction

de l'adaptation locale dans des modèles hôtes-parasites)

- Phylogénie intra et inter spécifique, phylogéographie, phylogénomique

- Evolution moléculaire (test de neutralité et signature de sélection)

- Evo-dévo (introduction à la biologie évolutive du développement chez les plantes

à fleur)

Applications : organisation de la diversité génétique à plusieurs échelles spatiales ;

méthodes bayésiennes d'identification de populations ; utilisation de logiciels

d'analyse de séquences ; simulation d'évolution des populations et de

reconstruction phylogénétique

Mode d’évaluation : contrôle continu et examen ecrit…………


L'évolution des plantes / Renato Massa

Origine et évolution des plantes à fleurs / Jean-François Leroy

L'Odyssée des plantes / MaryE. White


Intitule du module: Interactions plantes-pathogènes et épidémiologie Semestre : S3 (parcours innovation et écophysiologie végétale

Enseignant responsable de l’UE : Koudjil M.

Enseignant responsable de la matière: Koudjil M.

Objectifs de l’enseignement (Acquisition d'un socle de connaissances concernant les

interactions plantes-pathogènes , initiation à la recherche reposant sur les concepts appris

antérieurement. Cette initiation est abordée par le biais de problématiques scientifiques

pertinentes et supportée par des approches expérimentales raisonnées.

Connaissances préalables recommandées ( infectiologie végétale , biologie moléculaire


Interactions Plantes-Mollicutes.

-Interactions Plantes-Virus.

-Exemples de mécanismes de défense des plantes impliquant l'interaction gène pour gène.

-RNAi (silencing) : mécanisme d'extinction génique post-transcriptionnelle identifiée

comme un mode naturel de défense antivirale que certains phytovirus sont capables

d'inhiber.

-Diversité et adaptation des populations parasitaires (marqueurs, processus et

conséquences épidémiologiques, pressions de sélection, résistances génétiques aux

toxiques, diversité).

-Développement des épidémies (méthodologie : quantification des maladies et des pertes,

échantillonnage, exemples de facteurs de risque biotiques et abiotiques en épidémiologie)

Mode d’évaluation : ……continu et examen ecrit …………………………………………


Associations et interactions des anti-infectieux / Maur Neuman

Communications et interactions cellulaires / Max de Ceccatty

Origine et expression de la diversité des anticorps

Intéractions chimie-biologie, 2. Mécanismes de reconnaissance moléculaire


Intitulé du module : Interface recherche industrie et veille technologique

Semestre : S3 ( parcours innovation et écophysiologie végétale)

Enseignant responsable de l’UE : Djermoune A.

Enseignant responsable de la matière: Djermoune A.

Objectifs de l’enseignement (En plus d'une formation pratique sur la valorisation et le

transfert technologique (intervention de professionnels ayant une activité dans ces

domaines), les étudiants seront les acteurs de projets relevant d'une veille technologique

sur des sujets d'actualité. Ils utiliseront le réseau web pour élaborer un journal traitant des

avancées récentes relatives à l'évolution des méthodologies en biotechnologie, sur les

aspects de valorisation des produits agricoles, enjeux des défis et risques des OGM,

détection des OGM dans les produits agroalimentaires.




Transfert technologique, la valorisation des déchets agricoles, la seconde révolution verte

(biocarburant, énergie renouvelable, produits industriels basés sur la valorisation de la

biomasse).

Mode d’évaluation : …continu et examen écrit……………………………………………


Les accords de transfert de technologie /Philippe de Moulins

La Coopération technologique internationale/ : Claude Durand




Intitule du module : : Ecophysiologie végétale Semestre : S3 (parcours Innovation et Ecophysiologie végétale)


Enseignant responsable de la matière: Saadi A.

Objectifs de l’enseignement (d'acquérir des connaissances concernant la survie des

végétaux en milieu extrême ou tout simplement perturbé et d'aborder tous les problèmes

d'ordre écologique traitant de l'adaptation à un biotope donné,

Connaissances préalables recommandées (biologie végétale, cytologie, écologie, base

physiologique de la reproduction chez les végétaux , infectiologie et écologie

microbienne


1) Rappel sur l'environnement des végétaux, photosynthèse, équilibre hydrominéral

2) Ecophysiologie du développement

3) Adaptation des plantes aux milieux extrêmes : plantes reviviscentes… Stress abiotique : Réponses des plantes aux stress hydrique, salin, gel. Stress biotique : relation micro-organismes/plantes et défenses Production de plantes transgéniques résistantes.

4)Présentation des techniques de traçages isotopiques permettant le suivi de

l’absorption, de l’allocation, de la réallocation et de l’excrétion de certains éléments

type C, N, P, S dans les plantes



- Ecophysiologie végétale/J.c Leclerc - Botanique systématique, une perspective phylogénétique/ W.S JUDD - La photosynthèse processus physiques/ J.FARINEAU - Physiologie végétale/ HOPKINS - Ecosystèmes, structure, fonctionnement, évolution


Intitulé du module : initiation à la communication scientifique

Semestre : S3 (parcours innovation et écophysiologie végétale)

Enseignant responsable de l’UE : Mme Bouthiba Abla

Enseignant responsable de la matière: Mme Bouthiba Abla

Objectifs de l’enseignement apprendre aux étudiants à élaborer et mener de façon

autonome un projet de recherche et de les familiariser avec la communication scientifique.

L'UE est organisée sous forme de travaux pratiques intégrés et est structurée en trois

phases : i) élaboration libre d'un sujet de recherche à partir d'un thème scientifique défini ii)

réalisation des expériences, iii) analyse des résultats obtenus et mise en forme en vue

d'une communication scientifique.




Analyse d'articles scientifique : présentation orale accompagnée d'un PowerPoint et

argumentation, grammaire et vocabulaire vus de façon contextuelle.

Mode d’évaluation : ………………………………………………

50% contrôle continu : présentation orale d'article(s).

50% examen final écrit


La Communication écrite, scientifique et technique / Louis Timbal-Duclaux

La communication orale scientifique en anglais / Didier Carnet

La communication scientifique / Daniel Jacobi

La communication scientifique à l'épreuve de l'Internet / Josette F. de La Vega

Initiation à la bibliographie scientifique / Marie-France Such


Semestre : s4

Enseignant responsable de l’UE : Travail personnel et Mémoire de fin d’études.

Enseignant responsable de la matière: Toute l’équipe de formation

Objectifs de l’enseignement

Stage en entreprise permettant l’adaptation entre la formation et le marché de l'emploi avec la concrétisation d’un projet de fin de formation

Connaissances préalables recommandées :

Analyse expérimentale, techniques de recherche de document, capacité d’analyse, de Synthèse, de rédaction. Connaissance en langues étrangères.


Au semestre 4, un stage en entreprise ou dans un laboratoire est obligatoire et constitue le semestre. La recherche de stage est une démarche personnelle de l’étudiant fait partie de la formation. Les tuteurs de stage sont en contact direct ou à distance avec le stagiaire et son maître de stage. Le travail du stagiaire, son implication dans la mission qui lui est confiée et son intégration dans la structure d’accueil est évaluée par le maître de stage..

Documents

Type de Licence · les domaines de la physiopathologie, biotechnologie des végétaux , ... Atlas de poche de biotechnologie et de génie génétique / Rolf D. Schmid