8/14/2019 Biologie : Microbiologie prdictive
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24 s LACTUALIT POITOU-CHARENTES s N 54 s
Microbiologie
tre jeunes docteurs en science. Laurat de plusieurs
concours daide la cration dentreprise, le projet
voit le jour et la socit MTis Biotechnologies (du
nom de Mtis, desse de toutes les sciences et de tous
les savoirs dans la mythologie grecque), implante
Limoges, est effectivement cre en fvrier 2000.
La cytomtrie en flux est une technique analytique et
prparative relativement rcente. Son objectif est
danalyser, pour ventuellement les trier, des cellules
en suspension. Le principe utilis est simple : les cel-
lules sont incubes en prsence de marqueurs spci-fiques de molcules choisies. On peut par exemple
marquer spcifiquement deux populations de cellu-
les du sang : les lymphocytes T et les lymphocytes B.
La suspension est ensuite injecte devant un faisceau
laser. Les cellules, qui passent en file indienne devant
la source lumineuse, diffractent la lumire et met-
tent alors une fluorescence. Cette mission de lumire
varie selon la nature et la quantit de marqueur fix
par la cellule. Les donnes lumineuses sont collec-
tes puis filtres avant dtre converties en donnes
numriques et analyses par ordinateur. Un modulede tri peut aussi sparer les cellules, toujours sur le
mme principe de marquages diffrents. Cette tech-
nique en plein essor sapplique aujourdhui divers
domaines de la biologie vgtale, animale (dont
lhomme), et de la microbiologie.Les activits de MTis Biotechnologies sexercent
autour de trois ples : la microbiologie, la sant hu-
maine et la recherche et le dveloppement, particu-
lirement dans le domaine du diagnostic vtrinaire,
explique Stphane Sermadiras, le prsident de
lentreprise. Nous disposons de trois laboratoires. Le
premier est ddi la sant humaine, la culture de
cellules et au tri cellulaire. Nous y effectuons de la
recherche sous contrat en mettant notre technologie
et nos comptences au service des industries phar-
maceutiques, cosmtiques et mme de certains labo-ratoire de recherche. Le second est un laboratoire de
recherche et dveloppement, ax sur le dveloppement
et la validation de nouveaux tests microbiologiques
et sur lamlioration de protocoles existant dj dans
ce domaine. Enfin, un laboratoire ddi lanalyse
de routine, entirement automatis, sera opration-
nel cet automne. Sa capacit de production sera de
800 analyses par jour.
La cration de cette entreprise rpondait un besoin
vident. En effet, par comparaison avec des mtho-
des plus traditionnelles danalyse microbiologique, lesintrts de la cytomtrie en flux sont nombreux. Les
classiques cultures sur bote de Ptri sont longues (de
E
biologie
Une analyse rapide spcifique et fiable : la cytomtrie
en flux rpond la demande des industries
pharmaceutique, agroalimentaire et vtrinaire
Par Laetitia Becq-Giraudon
prdictive
n 1998, lide de crer une socit qui dve-
lopperait les nouvelles applications de la
cytomtrie en flux nat dans lesprit de qua-
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2 14 jours), peu sensibles et peu fiables. Des mtho-
des alternatives pour lanalyse microbiologique ra-
pide ont donc petit petit fait leur apparition. Lune
des plus utilises est la PCR, qui fait appel directe-
ment la biologie molculaire. Bien que spcifique,
cette mthode reste encore chre, brevete et relati-
vement longue. Dautre part, elle ne permet pas de
visualiser une diffrence entre un micro-organisme
viable ou non viable. Lindustrie tait donc deman-
deuse dune mthode rapide, fiable, spcifique et
quantitative et peu coteuse. En matire de micro-
biologie, MTis Biotechnologies a donc pour objectif
de rpondre cette demande de service venant de
toute lindustrie agroalimentaire. Les mthodes que
nous mettons au point permettent danalyser des pro-
duits solides, liquides ou gazeux. Grce des proc-
dures de marquage par anticorps ou activit enzyma-
tique spcifique par exemple, ces produits sont ana-
lyss par cytomtrie en flux, ajoute Stphane
Sermadiras. Les avantages de la mthode sont trs
comptitifs. En particulier, grce lautomatisation,
les rsultats sont obtenus en quelques minutes au lieu
de plusieurs jours et avec une sensibilit prs de mille
fois suprieure une analyse classique. Et ils sont
quantitatifs, ce qui est primordial en matire de scu-
rit alimentaire par exemple. Quarante tests sont dis-
ponibles dans ce domaine et quarante-quatre suppl-
mentaires devraient ltre dici la fin de lanne. Nous
pouvons par exemple rechercher, outre la flore totale
dun aliment, les bactries Escherichia coli, Salmonella
ou Listeria. Cest le cas dans le lait ou le poisson. Nous
effectuons ces tests pour un panel dentreprises assez
large : salaisons et industries charcutires, industries
de la viande, fruits, jus de fruits, compotes, eaux, pro-
duits laitiers, crales, poissons... Nous intervenons
aussi bien sur les matires premires que sur des pro-
duits finis ou en cours de fabrication. Dun point de
vue plus pratique, cette microbiologie prdictive vise
dterminer quelle sera la qualit microbiologique dun
produit au moment de sa date limite de consommation,
par exemple partir de la connaissance de sa qualit
microbiologique le jour de la premire analyse.Enfin,MTis Biotechnologiesse positionne aussi au
sein de lindustrie vtrinaire dont les attentes sont
les mmes que celles de lindustrie agroalimentaire :
disposer dune analyse rapide, sensible, spcifique et
fiable. Les solutions dveloppes pour lhygine ali-
mentaire sont applicables au diagnostic vtrinaire.
Il sagit danalyser les micro-organismes pathognes
vecteurs de maladies, notamment dans les troupeaux
dlevage. Dans ce cadre, les objectifs de lentreprise
sont donc le dveloppement de tests plus rapides et
plus sensibles que ceux existant dj, avec, terme,lespoir de commercialiser des kits de diagnostics
auprs des laboratoires danalyses vtrinaires. s
Phnotype de la
population de
lymphocites B
purifie partir
de cellulesmononucles.
Christian Dumas est professeur
lEcole normale suprieure de Lyon
et membre de lInstitut universitaire
de France. Par ailleurs, il dirige un
laboratoire mixte CNRS-ENS-
Universit de Lyon sur la
reproduction sexue des plantes.
LActualit. Quels sont les
apports de la bioinformatique
la biologie vgtale?
Christian Dumas. Labioinformatique est une discipline
assez rcente. Ses apports la
biologie vgtale sont du mme
ordre que ceux fournis aux autres
disciplines biologiques : humaine,
animale, etc. Il sagitessentiellement de comparer des
squences et de mettre au point
des dispositifs permettant
didentifier tout ou partie dune
squence qui prsente des
homologies avec dautres dj
stockes dans les banques de
donnes. Il peut sagir de mettre au
point des modles informatiques
danalyse pour tudier lvolution
de certains gnes (squences) et de
retrouver les filiations entre gnes
(donc les individus, les familles).
Enfin, linformatique et les
mathmatiques vont peut-tre
apporter des lois de codification
du vivant qui nexistent pas encore.
La connaissance approfondie
des gnomes et de leur
organisation a permis la
cration de plantes
gntiquement modifies.
A-t-elle modifi les notions
dthique en matire de
biologie vgtale ?
Il y a la mme thique en matire de
biologie vgtale que dans les
autres sciences en gnral, les
sciences biologiques en
particulier : celle du chercheur.
Concernant les OGM, on devrait
parler de prsomptions plutt que
de risques avrs, surtout pour lesplantes transgniques dites de
nouvelles gnrations.
Codifier
le vivant