Evaluation génétique des bovins laitiers sous le modèle de...

Evaluation génétique des bovins laitiers sous le modèle de lactation de référence et

le modèle de contrôle individuel

I. Boujenane, M. Benbouajili et A. Tijani

De quoi s’agit-il au juste?L’évaluation génétique des bovins laitiers se base sur l’analyse de la PL par lactation de référence

Ce système présente plusieurs lacunes:• La PLR est calculée à partir des contrôles laitiers mensuels en utilisant différentes méthodes

• Pour les lactations non terminées, la PLR est obtenue par extension des lactations partielles àla durée de 305 j

• L’utilisation de la PLR ne permet pas de tenir compte directement des influences des facteurs de variation de la PL

• Certains facteurs de variation ont une influence significative sur la PL, mais le système d’évaluation actuel ne permet pas de les prendre en compte

L’utilisation directe des productions laitières journalières obtenues le jour du contrôle laitier

Modèle de contrôle individuel

Modèle de test journalier

« Test day model »

Quelle est l’alternative?

Les avantages du TDM

�Disparition des procédures de calcul et d’extension de la PLR imposées par le système actuel

� Prise en compte des effets génétiques et du milieu sur les performances de PL mesurées le jour du contrôle laitier

� Evaluation génétique rapide et, donc sélection précoce des reproducteurs

� Evaluation génétique précise des animaux puisqu’elle sera basée sur une dizaine de mesures de PLJ au lieu de la seule information de PLR

� Une grande souplesse dans les protocoles de contrôle laitier par un prolongement de l’intervalle entre les contrôles

� Réduction du coût de l’opération de contrôle laitier à travers l’allégement du schéma de collecte des données

Objectifs de l’étude

�Evaluation génétique des bovins laitiers sous le modèle de lactation de référence et le modèle de contrôle individuel

�Estimation du progrès génétique réalisé

Matériel & Méthodes

• Résultats du contrôle laitier réalisé dans une exploitation privée entre 1997 et 2006

• Contrôles mensuels sont réguliers; l’intervalle entre 2 contrôles successifs est en moyenne de 33 jours

Origine des données

Matériel animal• 1655 vaches de race Holstein• Rang de lactation: de 1 à 5• Age au vêlage: 3,5 ans• Vêlages étalés sur toute l’année

Conduite de la reproduction• Génisses mises à la reproduction à l’âge de 16 à 17 mois, avec un poids > 380 kg• IA est la plus utilisée, la MN en cas d’échec sur 3 IA

Conduite alimentaire• Vaches en stabulation libre et permanente durant

toute l’année• Alimentation à base de fourrages et de concentré

� La ration de base couvre une PL de 25 l� 1 kg de concentré pour toute production de 2,5 l de lait supplémentaire

Analyse des données

Le fichier analysé inclut:�2537 lactations�21466 contrôles laitiers réalisés entre le 5ème et le 305ème jour de lactation

Les variables étudiées sont: �PLR�PLJ

Détermination des effets du milieu

• PLR:- Vache: 1655- Age au vêlage: 5- Rang de lactation: 5- Saison de vêlage: 2- Année de vêlage: 9

• PLJ:- Vache: 1655 -Age au vêlage: 5- Rang de lactation: 5- Saison de vêlage: 2- Année de vêlage: 9- Stade de lactation: 10- Jour de contrôle: 109

Le modèle mixte utilisé inclut:

Estimation des paramètres génétiques et évaluation génétique

• Méthode BLUP appliquée à un modèle unicaractère du type répétitif

• Modèle mixte:- Effets fixes du milieu- Effet génétique additif de la vache- Effet de l’environnement permanent- Effet résiduel

Coefficient de régression de la valeur génétique additive de chaque animal sur son année de naissance

Estimation du progrès génétique

33,527,6PLJ (kg)

23,97693PLR (kg)

CV (%)MoyenneCaractère

Moyennes arithmétiques de la PLR et PLJ des vaches

Résultats

Courbe de lactation moyenne des vaches

PLJ max.: 33,6 kgPic de lactation: 45ème jour

26,77828Age > 5

26,876244 < Age ≤ 5

27,374753 < Age ≤ 4

25,264722 < Age ≤ 3

23,66184Age ≤ 2

*****

PLJ (kg)PLR (kg)Age au vêlage (ans)

Effet de l’âge au vêlage

25,465744

27,783273

24,262435

26,270792

26,173611

******

PLJ (kg)PLR (kg)Rang de lactation

Effet du rang de lactation

25,77268Oct. - Avril

26,16965Mai - Sept.

NS***

PLJ (kg)PLR (kg)Saison de vêlage

Effet de la saison de vêlage

5000

5500

6000

6500

7000

7500

8000

1997

1998

1999

2000

2001

2002

2003

2004

2005

Année de vêlage

PL3

05J

(kg)

1012141618202224262830

PLJ

(kg

)

PL305J PLJ

Effet de l’année de vêlage

18,9275 < DIM ≤ 305

20,1245 < DIM ≤ 275

21,5215 < DIM ≤ 245

23,2185 < DIM ≤ 215

25,1155 < DIM ≤ 185

27,1125 < DIM ≤ 155

29,095 < DIM ≤ 125

30,965 < DIM ≤ 95

32,435 < DIM ≤ 65

30,65 ≤ DIM ≤ 35

***

PLJ (kg)Stade de lactation (jours)

Effet du stade de lactation

Effet du jour de contrôle

Très hautement significatif sur la PLJ

0,110,25Héritabilité

0,340,26Répétabilité

PLJPLRParamètre

Répétabilité et héritabilité

1,37

577,8

Ecart-type

-4,18

-1961,0

Min.

+5,250,13Index PLJ (kg)

+2702,940,3Index PLR (kg)

Max.MoyenneCaractère

Moyenne, écart-type, minimum et maximum des index PLR et PLJ des animaux

-150

-100

-50

0

50

100

150

200

250

300

350

89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 00 01 02 03

Année de naissance

Moy

enne

des

inde

x P

L305

J (k

g)

-0.6

-0.4

-0.2

0

0.2

0.4

0.6

0.8

1

1.2

Moy

enne

des

inde

x P

LJ (

kg)

PL305 PLJ

Evolution des moyennes des index PLR et PLJselon l’année de naissance

• 11,5 kg/an pour la PLR

• 0,06 kg/an pour la PLJ

Le progrès génétique réalisé est de:

∆Gannuel représente 1% de la moyenne, soit 60 à 100 kg/an pour la PLR

Coefficient de corrélation de rang= 0,17

Conclusions

� Le progrès génétique réalisé est faible

� La production laitière des vaches est élevée

� Le modèle de contrôle individuel semble plus précis que le modèle de lactation de référence, car il a permis de:

� Le classement des animaux sur la base de leurs index PLR et PLJ est différent

� Eliminer les erreurs dues au calcul de laPLR et à l’extension des lactations partielles

� Utiliser toutes les informations des contrôles journaliers disponibles

�Modéliser correctement les facteurs de variation affectant la production laitière

�Réformer rapidement les vaches faibles productrices

� Révision du système de contrôle laitier�Allégement du schéma de collecte des données�Réduction du coût de l’opération CL�Retour de l’information aux éleveurs

Implications

� Adoption du modèle de contrôle individuel pour l’évaluation génétique des bovins laitiers�Constitution de la population de référence�Confirmation des index génomiques�Connaissance des vaches laitières à utiliser en

race pure ou en croisement industriel

Merci de votre attention