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LICENCE des Sciences de la Vie (LMD4)

Parcours

BiotechnologiesBiotraçabilitéBioressources

Parcours

Microbiologie

Parcours MICMarie-Hélène BOYER

(marie-helene.boyer-lavergne@umontpellier.fr)

Responsables

Parcours BBB

Jean-luc AYMERIC (jean-luc.aymeric@umontpellier.fr)

Tel : 04 67 14 46 66Bât 24 - 3ème étage droite (labo DGIMI)

5 UE obligatoires :

- HLBI501 : Infection et Immunité Jean-Luc AYMERIC

- HLBI502 : Génétique Anne-Marie MARTINEZ

- HLBI504 : Biologie Cellulaire et Moléculaire 2 Vincent COULON

- HLBI512 : Biotechnologies Lien BACH

- HLBI514 : Techniques de la communication et anglais scientifiqueAnne-Marie MARTINEZ et Ian ROBBINS

L3 Semestre 5

HLBI501: Infection et Immunité

Micro-organismes pathogènes

• facteurs du pouvoir pathogènes adhésines enzymes systèmes de sécrétion échappement immunitaire

• toxines

Réponse immunitaire

reconnaissance micro-organismes

distinction pathogènes vs commensaux

Symptômes Réponse ou toléranceréparation

Un exemple d’interaction

Interactions étroites entre les 2 disciplines Enseignements : Microbiologie et immunologie dans les mêmes séquences

Enseignants : bivalence des enseignants dans ces 2 domaines

Répartition horaire

CM : 27 h

TD : 13,5 h

TP : 10 h (microbiologie)

MCC :

écrit (80 %) ; contrôle terminal, 2 sessions

TP (20 %) ; contrôle continu, 1 session* (absence = 0, même justifiée)

Début des cours : lundi 11/09 à 11h30 en Amphi A6.02

Début des TP pour le groupe MIC A: le 18/09 à 15h bât 26

Début des TP pour le groupe BBB 1: le 22/09 à 8h bât 26

Début des TD : semaine du 25 septembre

HLBI502 GENETIQUE

Le cours de génétique débutera le LUNDI 11 septembre de 9h45 à 11H15 dans le GA (amphi Dumontet)

Les TDs débuteront la semaine du 18 septembre

Anne-Marie.Martinez@igh.cnrs.fr

HLBI504 Biologie cellulaire et moléculaire 2

Le cours de BCM2 débutera le MARDI 12 septembre de 8H à 9H30 en amphi 6.02

Les TD débuteront la semaine du 18 septembre

vincent.coulon@umontpellier.fr

Il s’agit ce semestre surtout de biologie moléculaire, que l’on abordera en tant que sujet d’étude en soi (modalités des transactions impliquant acides nucléiques et protéines), mais aussi en tant qu’outil au service des autres branches de la biologie.

HLBI514 : TEXAS

Objectif pédagogique : d’appréhender les bases de l’organisation d’un travailscientifique, depuis sa conception (établissement d’un projet) jusqu’à sa publication(communications écrites et orales) en anglais.

Compétences visées : d’une part, l’approfondissement d’une discipline par le biais d’untravail bibliographique personnel et, d’autre part, la qualité de l’expression orale etécrite.

Cette U.E s’articule en deux parties :

1/ Une partie théorique et méthodique dispensée en TDs

2/ Une partie pratique au cours de laquelle les étudiants travailleront parbinôme

Biotechnologies HLBI512

Responsable UE: Liên BACHlien.bach@umontpellier.fr

Biotechnologies Végétales Biotechnologies Animales et Humaines

Biotechnologie des Microorganismes

Biotechnologies

Multiplication in vitro Production de plantes OGMPlant farming

Thérapie géniqueClonageAide à la fertilité

FermentationProduction de substances (médicaments, additifs alimentaires…)

insuline

Biotechnologies HLBI512

Responsable UE: Liên BACHlien.bach@umontpellier.fr

But du module:

• Assimilation des cultures de base en biotechnologies (clonage, technique de l’ADN recombinant…)

• Donner un ancrage des cours théoriques sur la réalité socio-économique

• Assimilation et révisions de connaissances complémentaires (biologie animale, physiologie végétale, biologie moléculaire et cellulaire, biologie moléculaire des procaryotes…)

• Découvrir un domaine ou l’emploi est important (médecine, agronomie, environnement…)

Biotechnologies HLBI512

Responsable UE: Liên BACHlien.bach@umontpellier.fr

14 Cours Magistraux: début cours mercredi 13 septembre => 8h00-9h30 en A5-06- Biotechnologie des Microorganismes (Jean-Luc Aymeric)- Biotechnologies Végétales (Liên BACH)- Biotechnologies Animales et Humaines (Soazig Guyomarc’h)- Entreprises de Biotechnologies (Liên BACH)

13 Travaux Dirigés: Approfondissement de certaines biotechnologies- Exposés sur les OGM en groupe (Soazig Guyomarc’h et Liên BACH)

9h de Travaux Pratiques + travail personnel:- Fabrication de bières par les microorganismes- Découverte de la culture in vitro de plantes (Liên BACH, Mathieu Ingouff et Olivier Rodriguez

Notation et Evaluation: Examen Final + Oral (note exposé OGM+note compte rendu TP)

1 UE optionnelle parmi :

Parcours BBB Parcours MIC

HLBI503 : Biochimie structurale –enzymologie

Rachel Cerdan

HLBI511 : Biodiversité et développement durable

Olivier THALER

HLBI507 : TP de Physiologie animale

Jean-Paul ROUSSEL

HLBI510 : Approche pratique de la biodiversité bactérienne

Catherine BRAUN-BRETON

HLMA507 : Plan d'expérimentation -Statistiques

Jean-Noel BACRO

HLBI503 – Biochimie Structurale et Enzymologie

A- La cinétique formelle

B- Cinétique Enzymatique mono-substrat

C- Cinétique Enzymatique pluri-substrats

D- Les liaisons à l’équilibre

E- Relation Structure-Fonction

Investissement personnel ++++

HLBI503 – Biochimie Structurale et Enzymologie

- Cours/TD : le mardi 9h45

- 1 contrôle TD (20%) + Examen final (80%)

Toutes les informations au premier cours

Responsable : rachel.cerdan@umontpellier.fr

HLBI507 : TP de Physiologie animale

Module de 50h de TP

Animaux : rat et grenouille

Travail en binôme

MCC

50 % CC (binôme) + 50 % CT (individuel)

CC : moyenne des CR des TP ; chaque CR est rendu la séance suivante.

La note tient compte des résultats, mais plus encore de la participation et la

motivation des étudiants

HLBI507 : informations pratiques

Matériel

• 1 blouse

• 1 paire de ciseaux fins

• 2 pinces AA (voir auprès d'associations étudiantes ; ex : Xénope)

Inscription des étudiants

Mercredi 13 septembre à 13h30 en salle TP de Physiologie Animale (Bat 26)

Les polycops des cours et le planning des séances seront distribués

Le premier TP commence jeudi 21 septembre

HLMA507 : Plan d'expérimentation - Statistiques

1) traitement statistique de données

- Comment décrire l'information à disposition ?

- Comment estimer des quantités d'intérêt, liées soit à une population, soit à une

modélisation du phénomène étudié ?

- Comment tester correctement des hypothèses d'intérêt ?

- Comment quantifier les risques d'erreur associés aux décisions prises ?

2) recueil de données.

- Des données oui mais pour quelles questions ?

- Approche échantillonnage ou expérimentation ?

- Pourquoi le recueil des données est une étape fondamentale de toute analyse

statistique et comment l'appréhender ?

5 étudiants seulement ; UE mutualisée avec la L3 Pro EVAPPMT

Responsable : Jean-Noël Bacro (jean-noel.bacro@umontpellier.fr)

Début des enseignements : mardi 19 septembre à 15h en salle TD 5.19

UE Biodiversité HLBI511

lEnseignement de Biodiversité par

lGuillaume Bagnolini et Olivier Thaler

l- 7 Travaux Dirigés = 2 parties

l- Une partie théorique et une partie d'exercices

l- 1 sortie sur le terrain avec un naturaliste

l- 1 séance d'exposés

l

UE Biodiversité HLBI511

lContenu:

l- Introduction à la notion de biodiversité

l- Valeurs et usage

l- Spéciation

l- Classification phylogénétique

l- Forces évolutives

l- Diversité végétale

l- Diversité animale

l

Début des enseignements : mardi 26 septembre, 13h15

jusqu’au 19 décembre

Approche pratique

de la biodiversité bactérienne

• UE de 50h

• UE exclusivement de Travaux Pratiques

• Début: Mardi 26 Septembre 13h15

salle de TP de microbiologie du bâtiment 26 • Matériel: blouse, marqueur permanent

• Responsables: Catherine Braun-Breton (cbb@univ-montp2.fr)

Mauld Lamarque(mauld.lamarque02@univ-montp2.fr)

• Evaluation: un rapport écrit et une présentation orale de

15 min

Approche pratiquede la biodiversité bactérienne

But

• L’objectif de ce TP est d’explorer en travaux

pratiques des outils de bactériologie classique, de

génomique et de biologie moléculaire, afin de sonder

la diversité des micro-organismes de l’environnement.

• Ce TP permettra, à partir d’un échantillon de terre,

d’accéder à une identification définitive de genre et

d’espèce bactérienne (en allant jusqu’au séquençage

d’un ADN bactérien), et donc, au niveau du groupe

d’étudiants, à une description qualitative de la diversité

bactérienne de ce biotope.

Approches

Approche pratiquede la biodiversité bactérienne

Micro-organismes

du sol cultivables

colonies isolées

et pures

Identifier des

bactéries

Déterminer

le Gram

BACTERIOLOGIE CLASSIQUE

Echantillon

de terre

Déterminer le type

respiratoire

Identification du

genre et espèce

Caractéristiques

biochimiques

Galeries Api

BACTERIOLOGIE CLASSIQUE

1. Identification bactérienne par bactériologie classique

Le diagnostic de genre repose sur la détermination:

de leur morphologie

de leur mobilité

de la présence d’une capsule ou de spores

de leurs principales caractéristiques biochimiques

Le diagnostic d’espèce est réalisé par ensemencement d’une galerie Api appropriée

Extraire l’ADN

génomique

Identification du

genre et espèce

Amplifier le gène rssA Cloner dans

un vecteur

GENOMIQUE ET BIOLOGIE MOLECULAIRE

Extraire l’ADN

plasmidiqueSéquençer Analyse

bioinformatique

2. Identification bactérienne par génomique et biologie moléculaire

Cette approche consiste à :

amplifier le gène rssA (codant pour l’ARNr 16S) en utilisant la technique de

PCR

le cloner dans un vecteur

amplifier et purifier ce vecteur

séquencer le gène rssA

réaliser une analyse informatique des résultats de séquençage

Donne accès :

• au Master Biologie Santé (UM)

• au Master IMHE (interactions microorganismes hôtes environnement)(UM)

• autres Masters en France

L3 Microbiologie

Débouchés en Master de la Licence BBB

D. TOUSCH

Masters Bio de l’UM (MEEF, Eau, IMHE)

Masters Gestion- Qualité d’autres universités

Biologie-Santé

M. VIGNES

P. BERTA

S. PEYRON

Inscriptions

les IA sont ouvertes à la MDE jusqu’au 21 septembre.

les IP démarrent le mercredi 6 septembre et se poursuivront jusqu'au mercredi 27 septembre

le compte informatique des étudiants est automatiquement re-activé le lendemain de leur IA.

l'EDT est accessible à partir de l’ENT ou du site FDS

Inscription pédagogique

Elle est obligatoire

dans un semestre-type : via le Web

dans un semestre-type + une UE supplémentaire : via le Web pour le semestre-type + une inscription papier pour l'UE supplémentaire

les documents spécifiques (PP, 7ème UE, VAC) sont à télécharger à partir de l'onglet "espace étudiants", menu "Cursus licence" http://sciences.edu.umontpellier.fr/espace-etudiants/cursus-licence/

Modalités de Contrôle des Connaissances

(MCC)

Une UE est acquise :

- si la note est supérieure ou égale à 10/20,

- par compensation si la note est inférieure à 10/20 mais que cette UE fait partie d’un semestre acquis ou acquis par compensation.

Compensation entre les UE d’un semestre

Compensation annuelle

En seconde session, possibilité de repasser les UE acquises ou validées par compensation, mais il faut en faire la demande (lettre de renonciation).

La meilleure note entre les 2 sessions est prise en compte pour recalculer la moyenne.

Impossible de changer de parcours entre le S5 et le S6

Evaluation des enseignements

Nomination de 2 ou 3 délégués par parcours

dans les semaines à venir