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LICENCE des Sciences de la Vie (LMD4)
Parcours
BiotechnologiesBiotraçabilitéBioressources
Parcours
Microbiologie
Parcours MICMarie-Hélène BOYER
Responsables
Parcours BBB
Jean-luc AYMERIC ([email protected])
Tel : 04 67 14 46 66Bât 24 - 3ème étage droite (labo DGIMI)
5 UE obligatoires :
- HLBI501 : Infection et Immunité Jean-Luc AYMERIC
- HLBI502 : Génétique Anne-Marie MARTINEZ
- HLBI504 : Biologie Cellulaire et Moléculaire 2 Vincent COULON
- HLBI512 : Biotechnologies Lien BACH
- HLBI514 : Techniques de la communication et anglais scientifiqueAnne-Marie MARTINEZ et Ian ROBBINS
L3 Semestre 5
HLBI501: Infection et Immunité
Micro-organismes pathogènes
• facteurs du pouvoir pathogènes adhésines enzymes systèmes de sécrétion échappement immunitaire
• toxines
Réponse immunitaire
reconnaissance micro-organismes
distinction pathogènes vs commensaux
Symptômes Réponse ou toléranceréparation
Un exemple d’interaction
Interactions étroites entre les 2 disciplines Enseignements : Microbiologie et immunologie dans les mêmes séquences
Enseignants : bivalence des enseignants dans ces 2 domaines
Répartition horaire
CM : 27 h
TD : 13,5 h
TP : 10 h (microbiologie)
MCC :
écrit (80 %) ; contrôle terminal, 2 sessions
TP (20 %) ; contrôle continu, 1 session* (absence = 0, même justifiée)
Début des cours : lundi 11/09 à 11h30 en Amphi A6.02
Début des TP pour le groupe MIC A: le 18/09 à 15h bât 26
Début des TP pour le groupe BBB 1: le 22/09 à 8h bât 26
Début des TD : semaine du 25 septembre
HLBI502 GENETIQUE
Le cours de génétique débutera le LUNDI 11 septembre de 9h45 à 11H15 dans le GA (amphi Dumontet)
Les TDs débuteront la semaine du 18 septembre
HLBI504 Biologie cellulaire et moléculaire 2
Le cours de BCM2 débutera le MARDI 12 septembre de 8H à 9H30 en amphi 6.02
Les TD débuteront la semaine du 18 septembre
Il s’agit ce semestre surtout de biologie moléculaire, que l’on abordera en tant que sujet d’étude en soi (modalités des transactions impliquant acides nucléiques et protéines), mais aussi en tant qu’outil au service des autres branches de la biologie.
HLBI514 : TEXAS
Objectif pédagogique : d’appréhender les bases de l’organisation d’un travailscientifique, depuis sa conception (établissement d’un projet) jusqu’à sa publication(communications écrites et orales) en anglais.
Compétences visées : d’une part, l’approfondissement d’une discipline par le biais d’untravail bibliographique personnel et, d’autre part, la qualité de l’expression orale etécrite.
Cette U.E s’articule en deux parties :
1/ Une partie théorique et méthodique dispensée en TDs
2/ Une partie pratique au cours de laquelle les étudiants travailleront parbinôme
Biotechnologies HLBI512
Responsable UE: Liên [email protected]
Biotechnologies Végétales Biotechnologies Animales et Humaines
Biotechnologie des Microorganismes
Biotechnologies
Multiplication in vitro Production de plantes OGMPlant farming
Thérapie géniqueClonageAide à la fertilité
FermentationProduction de substances (médicaments, additifs alimentaires…)
insuline
Biotechnologies HLBI512
Responsable UE: Liên [email protected]
But du module:
• Assimilation des cultures de base en biotechnologies (clonage, technique de l’ADN recombinant…)
• Donner un ancrage des cours théoriques sur la réalité socio-économique
• Assimilation et révisions de connaissances complémentaires (biologie animale, physiologie végétale, biologie moléculaire et cellulaire, biologie moléculaire des procaryotes…)
• Découvrir un domaine ou l’emploi est important (médecine, agronomie, environnement…)
Biotechnologies HLBI512
Responsable UE: Liên [email protected]
14 Cours Magistraux: début cours mercredi 13 septembre => 8h00-9h30 en A5-06- Biotechnologie des Microorganismes (Jean-Luc Aymeric)- Biotechnologies Végétales (Liên BACH)- Biotechnologies Animales et Humaines (Soazig Guyomarc’h)- Entreprises de Biotechnologies (Liên BACH)
13 Travaux Dirigés: Approfondissement de certaines biotechnologies- Exposés sur les OGM en groupe (Soazig Guyomarc’h et Liên BACH)
9h de Travaux Pratiques + travail personnel:- Fabrication de bières par les microorganismes- Découverte de la culture in vitro de plantes (Liên BACH, Mathieu Ingouff et Olivier Rodriguez
Notation et Evaluation: Examen Final + Oral (note exposé OGM+note compte rendu TP)
1 UE optionnelle parmi :
Parcours BBB Parcours MIC
HLBI503 : Biochimie structurale –enzymologie
Rachel Cerdan
HLBI511 : Biodiversité et développement durable
Olivier THALER
HLBI507 : TP de Physiologie animale
Jean-Paul ROUSSEL
HLBI510 : Approche pratique de la biodiversité bactérienne
Catherine BRAUN-BRETON
HLMA507 : Plan d'expérimentation -Statistiques
Jean-Noel BACRO
HLBI503 – Biochimie Structurale et Enzymologie
A- La cinétique formelle
B- Cinétique Enzymatique mono-substrat
C- Cinétique Enzymatique pluri-substrats
D- Les liaisons à l’équilibre
E- Relation Structure-Fonction
Investissement personnel ++++
HLBI503 – Biochimie Structurale et Enzymologie
- Cours/TD : le mardi 9h45
- 1 contrôle TD (20%) + Examen final (80%)
Toutes les informations au premier cours
Responsable : [email protected]
HLBI507 : TP de Physiologie animale
Module de 50h de TP
Animaux : rat et grenouille
Travail en binôme
MCC
50 % CC (binôme) + 50 % CT (individuel)
CC : moyenne des CR des TP ; chaque CR est rendu la séance suivante.
La note tient compte des résultats, mais plus encore de la participation et la
motivation des étudiants
HLBI507 : informations pratiques
Matériel
• 1 blouse
• 1 paire de ciseaux fins
• 2 pinces AA (voir auprès d'associations étudiantes ; ex : Xénope)
Inscription des étudiants
Mercredi 13 septembre à 13h30 en salle TP de Physiologie Animale (Bat 26)
Les polycops des cours et le planning des séances seront distribués
Le premier TP commence jeudi 21 septembre
HLMA507 : Plan d'expérimentation - Statistiques
1) traitement statistique de données
- Comment décrire l'information à disposition ?
- Comment estimer des quantités d'intérêt, liées soit à une population, soit à une
modélisation du phénomène étudié ?
- Comment tester correctement des hypothèses d'intérêt ?
- Comment quantifier les risques d'erreur associés aux décisions prises ?
2) recueil de données.
- Des données oui mais pour quelles questions ?
- Approche échantillonnage ou expérimentation ?
- Pourquoi le recueil des données est une étape fondamentale de toute analyse
statistique et comment l'appréhender ?
5 étudiants seulement ; UE mutualisée avec la L3 Pro EVAPPMT
Responsable : Jean-Noël Bacro ([email protected])
Début des enseignements : mardi 19 septembre à 15h en salle TD 5.19
UE Biodiversité HLBI511
lEnseignement de Biodiversité par
lGuillaume Bagnolini et Olivier Thaler
l- 7 Travaux Dirigés = 2 parties
l- Une partie théorique et une partie d'exercices
l- 1 sortie sur le terrain avec un naturaliste
l- 1 séance d'exposés
l
UE Biodiversité HLBI511
lContenu:
l- Introduction à la notion de biodiversité
l- Valeurs et usage
l- Spéciation
l- Classification phylogénétique
l- Forces évolutives
l- Diversité végétale
l- Diversité animale
l
Début des enseignements : mardi 26 septembre, 13h15
jusqu’au 19 décembre
Approche pratique
de la biodiversité bactérienne
• UE de 50h
• UE exclusivement de Travaux Pratiques
• Début: Mardi 26 Septembre 13h15
salle de TP de microbiologie du bâtiment 26 • Matériel: blouse, marqueur permanent
• Responsables: Catherine Braun-Breton ([email protected])
Mauld Lamarque([email protected])
• Evaluation: un rapport écrit et une présentation orale de
15 min
Approche pratiquede la biodiversité bactérienne
But
• L’objectif de ce TP est d’explorer en travaux
pratiques des outils de bactériologie classique, de
génomique et de biologie moléculaire, afin de sonder
la diversité des micro-organismes de l’environnement.
• Ce TP permettra, à partir d’un échantillon de terre,
d’accéder à une identification définitive de genre et
d’espèce bactérienne (en allant jusqu’au séquençage
d’un ADN bactérien), et donc, au niveau du groupe
d’étudiants, à une description qualitative de la diversité
bactérienne de ce biotope.
Approches
Approche pratiquede la biodiversité bactérienne
Micro-organismes
du sol cultivables
colonies isolées
et pures
Identifier des
bactéries
Déterminer
le Gram
BACTERIOLOGIE CLASSIQUE
Echantillon
de terre
Déterminer le type
respiratoire
Identification du
genre et espèce
Caractéristiques
biochimiques
Galeries Api
BACTERIOLOGIE CLASSIQUE
1. Identification bactérienne par bactériologie classique
Le diagnostic de genre repose sur la détermination:
de leur morphologie
de leur mobilité
de la présence d’une capsule ou de spores
de leurs principales caractéristiques biochimiques
Le diagnostic d’espèce est réalisé par ensemencement d’une galerie Api appropriée
Extraire l’ADN
génomique
Identification du
genre et espèce
Amplifier le gène rssA Cloner dans
un vecteur
GENOMIQUE ET BIOLOGIE MOLECULAIRE
Extraire l’ADN
plasmidiqueSéquençer Analyse
bioinformatique
2. Identification bactérienne par génomique et biologie moléculaire
Cette approche consiste à :
amplifier le gène rssA (codant pour l’ARNr 16S) en utilisant la technique de
PCR
le cloner dans un vecteur
amplifier et purifier ce vecteur
séquencer le gène rssA
réaliser une analyse informatique des résultats de séquençage
Donne accès :
• au Master Biologie Santé (UM)
• au Master IMHE (interactions microorganismes hôtes environnement)(UM)
• autres Masters en France
L3 Microbiologie
Débouchés en Master de la Licence BBB
D. TOUSCH
Masters Bio de l’UM (MEEF, Eau, IMHE)
Masters Gestion- Qualité d’autres universités
Biologie-Santé
M. VIGNES
P. BERTA
S. PEYRON
Inscriptions
les IA sont ouvertes à la MDE jusqu’au 21 septembre.
les IP démarrent le mercredi 6 septembre et se poursuivront jusqu'au mercredi 27 septembre
le compte informatique des étudiants est automatiquement re-activé le lendemain de leur IA.
l'EDT est accessible à partir de l’ENT ou du site FDS
Inscription pédagogique
Elle est obligatoire
dans un semestre-type : via le Web
dans un semestre-type + une UE supplémentaire : via le Web pour le semestre-type + une inscription papier pour l'UE supplémentaire
les documents spécifiques (PP, 7ème UE, VAC) sont à télécharger à partir de l'onglet "espace étudiants", menu "Cursus licence" http://sciences.edu.umontpellier.fr/espace-etudiants/cursus-licence/
Modalités de Contrôle des Connaissances
(MCC)
Une UE est acquise :
- si la note est supérieure ou égale à 10/20,
- par compensation si la note est inférieure à 10/20 mais que cette UE fait partie d’un semestre acquis ou acquis par compensation.
Compensation entre les UE d’un semestre
Compensation annuelle
En seconde session, possibilité de repasser les UE acquises ou validées par compensation, mais il faut en faire la demande (lettre de renonciation).
La meilleure note entre les 2 sessions est prise en compte pour recalculer la moyenne.
Impossible de changer de parcours entre le S5 et le S6
Evaluation des enseignements
Nomination de 2 ou 3 délégués par parcours
dans les semaines à venir
