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FACULTE des SCIENCES PHARMACEUTIQUES 31062 TOULOUSE Cedex 9
EENNSSEEIIGGNNEEMMEENNTTSS ddee llaa 22èèmmee AANNNNEEEE
ANNEE UNIVERSITAIRE 2010-2011
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P R E S E N T A T I O N G E N E R A L E
OBJECTIFS
- rappeler aux enseignants que les enseignements présentés dans ce programme
correspondent à une Formation Commune de Base (FCB) qui peut et doit souvent
être complétée par des enseignements optionnels plus approfondis,
- apporter à cette deuxième année une plus grande spécificité pharmaceutique,
- dégager un volume horaire important en deuxième cycle pour permettre la réforme
de ce cycle,
- grâce à une réflexion élargie, proposer la solution la plus adaptée,
- mettre en place des TP intitulés ‘’ gestes de base ‘’,
- éviter les redondances,
- faire communiquer les enseignants,
- obtenir un programme détaillé des enseignements,
- faire connaître à chaque enseignant le contenu des autres enseignements,
- évaluer les procédures et les enseignements grâce à un document de référence.
METHODOLOGIE
- état des lieux de la formation commune de base de la deuxième année
- positionnement des contenus dans le premier cycle et par rapport aux autres cycles
- choix de certaines options
- examen des propositions des responsables
- audition et discussion avec les enseignants concernés
- proposition terminale dans un volume horaire de 500 h pour étude par les différentes
instances
-
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PRINCIPALES MODIFICATIONS La spécificité plus pharmaceutique des enseignements est apportée par le transfert de la troisième année en deuxième année d’une partie de l’enseignement de pharmacologie moléculaire et générale et du module coordonné « matières premières d’origine naturelle ou de synthèse ou issues des biotechnologies ». L'enseignement de Chimie Analytique a été en grande partie restructuré. Les enseignants de la discipline ont accepté de faire des propositions avec une réduction importante des volumes horaires ce qui a permis de recentrer cette discipline en deuxième année et de dégager des volumes horaires pour le deuxième cycle. C’est exactement la démarche proposée et il faut rendre hommage à cette discipline pour ces propositions qui vont dans le sens de l’intérêt général
Les enseignants de Chimie Physique Générale et Minérale ont fait de propositions allant dans le sens des attentes de la Commission Pédagogique. Toutefois, les membres de cette commission proposent en fonction des contenus exposés une heure de cours supplémentaire pour traiter les halogènes et une organisation différente des TP tout en supprimant une séance concernant la recherche des ions. Les enseignants de Chimie Organique n'ont pas fait de propositions conformes aux souhaits de la Commission Pédagogique malgré trois réunions et un temps de discussion voisin de 10 heures. Leurs argumentations sont basées essentiellement sur le manque d'heures attribuées à cette discipline. En l’absence de propositions, la commission pédagogique a du faire des choix de volumes horaires en privilégiant les TD par rapport aux cours magistraux comme semblait le souhaiter l’enseignant responsable des enseignements de deuxième année Les enseignements de Physique ont été reformulés entre la première et la deuxième année pour les adapter à la réduction du volume horaire proposé. C’est exactement la démarche adaptée et il faut rendre hommage à cette discipline pour ces propositions L'enseignement de Statistiques qui est prévu en première année « tronc commun » a été maintenu en deuxième année pour une meilleure cohérence pédagogique. Les enseignements d'Anatomie et Physiologie ont été modifiés. La partie cardio-vasculaire et organes des sens a été transférée en deuxième année dans l'objectif d'un déplacement progressif vers la première année et la deuxième année de cette discipline et pour dégager des volumes horaires en deuxième cycle. L'enseignement de botanique a été maintenu en deuxième année sachant que les contenus des modules de la future première année « tronc commun » ne contiennent pas actuellement ce type de discipline.
L’enseignement de Biochimie métabolique est maintenu en deuxième année. Il est indispensable à l'enseignement de Biochimie Clinique qui est effectué lors du deuxième cycle. L’enseignement de biologie animale est maintenu en deuxième année avec une réduction de volume horaire (de 12 h à 9 h de TP).
L'enseignement de physiologie hématologie fondamentale est transféré en troisième année. Il sera dispensé au premier semestre avant un enseignement coordonné au deuxième semestre.
4 L’enseignement de Langues Etrangères appliquées est à 16 h de TD. La Commission Pédagogique propose que l'anglais soit choisi comme langue obligatoire : en effet, les échanges dans le monde scientifique sont réalisés le plus souvent en anglais et les revues les plus connues sont rédigées dans cette langue. Par ailleurs, une grande partie des propositions consiste en une refonte importante de la partie des travaux pratiques. En effet, il est proposé des TP intitulés ‘’ gestes de base ‘ qui sont répartis en six thèmes pour un volume horaire de 124 h 30. Ces différents modules doivent assurer la connaissance de base pour : - l’initiation à la manipulation, - l’extraction, la séparation et la purification de molécules synthétiques et naturelles, - l’instrumentation, - l’initiation à la biologie cellulaire, - l’observation des caractères organoleptiques des plantes toxiques et médicinales,
produits galéniques et produits chimiques, - l’informatique, la documentation et la communication.
Ces propositions sont le résultat d’un important travail de concertation réalisé entre les enseignants des différentes disciplines. Cette organisation doit permettre de mieux préparer les étudiants pour les TP spécifiques et d’éviter les redondances. Elle permet aussi une meilleure lisibilité qui entraînera un choix plus opérationnel lors de l’appel d’offre du Bonus Qualité Enseignement (BQE).
De plus, l’introduction à la préparation au C2i Certificat Informatique et Internet niveau 1 a été instauré ainsi que la présentation du référentiel ABCdoc, un guide de méthodologique de recherche et de traitement de l’information scientifique et technique.
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R E P A R T I T I O N des HORAIRES
DISCIPLINES Cours T.D. T.P.
spécifiques CHIMIE ANALYTIQUE PR JP SOUCHARD 42 h 9 h CHIMIE MINERALE PR BAZIARD 16 h 4 h 30 10 h CHIMIE ORGANIQUE MME EL HAGE 19 h 9 h 15 h BIOPHYSIQUE MME BON 12 h 4 h 30 STATISTIQUES PR BENDERBOUS 15 h 12 h PHARMACOLOGIE GENERALE PR GAIRIN 15 h 4 h 30 5 h ANATOMIE ET PHYSIOLOGIE HUMAINES PR CAMPISTRON 40 h 6 h 20 h BIOCHIMIE PR FAVRE 30 h 9 h
BOTANIQUE C. CHATELAIN 15 h 4 h 30 15 h BIOLOGIE ANIMALE A. COSTES 9 h LANGUE MME S. DENEVE 16 h
204 h 79 h 74 h TOTAL 357 h
ENSEIGNEMENTS COORDONNES Cours - TD - TP
E.C.I. M 1 MATIERES PREMIERES d'ORIGINE NATURELLE ou de SYNTHESE ou ISSUES de BIOTECHNOLOGIES (DONT 23H CM / 2H TD)
25 h
TP GESTES DE BASE (DETAIL DES 6 THEMES)
THEME 1 INITIATION A LA MANIPULATION (DONT 21H TP/3H TD) JL STIGLIANI THEME 2 EXTRACTION, SEPARATION, PURIFICATION DE MOLECULES SYNTHETIQUES ET NATURELLES MME EL HAGE THEME 3 INSTRUMENTATION MME C. BON THEME 4 INITIATION A LA BIOLOGIE CELLULAIRE M. H. BENOIST THEME 5 OBSERVATION DES CARACTERES ORGANOLEPTIQUES DES PLANTES TOXIQUES ET MEDICINALES, PRODUITS GALENIQUES ET PRODUITS CHIMIQUES M. F. BROUILLET/ MME C. DEREAVE THEME 6 INFORMATIQUE, DOCUMENTATION ET COMMUNICATION PREPARATION AU C2I, NIVEAU 1 M.C. PASQUIER
TOTAL
24 h
18 h
45 h
12 h
6 h
19 h 30
124 h 30 TOTAL 149 h 30
RECAPITULATIF
ENSEIGNEMENTS par DISCIPLINE 357 h 00 ENSEIGNEMENTS COORDONNES 149 h 30
TOTAL GENERAL 506 h 30
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C H I M I E A N A L Y T I Q U E
7 COURS 42 h
GENERALITES : Place et rôle de la chimie analytique dans le domaine des sciences pharmaceutiques. Classification des méthodes analytiques (1 h). 1 - BASES DES METHODES DE L’ANALYSE QUANTITATIVE (2h) Notions d’étalon, critères de qualité d’une méthode d’analyse. Expression des résultats. Bonnes pratiques de laboratoire. 2 - REACTIONS et EQUILIBRES EN SOLUTION, METHODES POTENTIO METRIQUES (9,5h) 2.1 - Réactions acido-basiques : - pH de solutions d’électrolytes forts et faibles, notion de pKa (rappels)
- diagrammes des espèces ioniques en solution : zwitterions, ampholytes - préparation et propriétés des solutions tampon - analyses acido-basiques en milieu aqueux et non aqueux. 2.2 - Réactions de complexation - agents complexants et formation de complexes - paramètres et applications analytiques de la complexométrie 2.3 - Réactions de précipitation
- principe et applications
2.4 - Méthodes potentiométriques : - Potentiométrie directe : électrodes sélectives et applications
- Potentiométrie indirecte : détermination de paramètres analytiques en milieu aqueux et non aqueux
2.5 - Titrateurs électrochimiques et biocapteurs
- Méthodes électrochimiques, bases et classement - Titrateurs coulométriques et ampéromètriques - Applications : analyse et contrôle du médicament, analyses biologiques (gaz du sang)
3 - METHODES INSTRUMENTALES D’ANALYSE ET APPLICATIONS (19 h) 3.1- Méthodes spectroscopiques moléculaires d’absorption et d’émission . 3.1.1 - Spectrophotométrie UV-visible - Transitions électroniques et principaux chromophores
- Caractéristiques spectrales : A, λmax, E 1 % 1cm
- Loi de Beer-Lambert et applications analytiques - Spectroscopie dérivée
3.1.2 - Spectrofluorimétrie - origine et propriétés du phénomène de fluorescence, - facteurs agissant sur la fluorescence (structure chimique, solvant, concentration…) - applications analytiques, fluorophores 3.1.3 - Spectroscopie infrarouge - Différents modes de vibration en infrarouge - Techniques d’examen de l’échantillon
8 - Caractéristiques des bandes d’absorption des principaux groupes fonctionnels 3.1.4 - Spectroscopie de résonance magnétique nucléaire ( 1H et 13 C) - Origine et données de RMN : déplacement chimique, couplage spin-spin… - Analyses de spectres
3.1.5 - Spectroscopies d'émission et d'absorption atomique
SEA, SAA, SEA-ICP
3.1.6 - Spectrométrie de masse - Modes d'ionisation et analyseurs
- Interprétation d'un spectre de masse et analyse structurale de macromolécules (protéines) - Analyse quantitative en MS et analyse MS/MS
3.1.7- Méthodes combinées (UV, IR, RMN et MS) appliquées à l’analyse et à l’identification structurales
3.2 - Méthodes de Séparation (8,5 h)
3.2.1 - Méthodes électrophorétiques
- Théorie de la migration électrophorétique - Principe et différents modes de séparation électrocinétique - Electrophorèse capillaire de zone et applications.
3.2.2 - Techniques chromatographiques - Paramètres de la séparation chromatographique - Divers modes: GC, CCM, HPLC, CI - Analyse quantitative en chromatographie (méthodes d'étalonnage)
3.3 - Couplages et automatisation des méthodes d'analyse (2 h) - Méthodes GC-MS et LC-MS et autres méthodes couplées - Automates en analyse
TRAVAUX DIRIGES 9 h
Les séances de travaux dirigés seront consacrées à l'illustration du cours et à l'application des techniques d'analyse pour identifier des principes actifs (séparation et analyse structurale), contrôler leur pureté et/ou les doser dans une matrice complexe ( galénique ou biologique). Elles seront réparties comme suit:
1 Equilibres ioniques et analyses électrochimiques ( 1 séance ) 2. Méthodes spectrométriques ( 4 séances )
a) Spectroscopie UV-visible et spectrofluorimétrie (1 séance ) b) Spectroscopie de résonance magnétique nucléaire 1H et 13C (1 séance )
c) Spectroscopie infrarouge et spectrométrie de masse (1 séance )
d) Méthodes combinées (UV, IR, RMN et SM) appliquées à l'analyse structurale (1 séance )
3. Méthodes de séparation: EC, GC, CCM et HPLC (1 séance )
C H I M I E P H Y S I Q U E G E N E R A L E e t M I N E R A L E
9 COURS 16 h CHIMIE MINERALE
- Les oxydes de carbone (CO et CO2) et dérivés (1h30) Propriétés physico chimiques équilibres thermiques → domaines de stabilité toxicité de ces composés, effet de serre... - Les oxydes de soufre et dérivés (SO2, SO3, H2SO4, H2SO3) (1h30) Propriétés physico chimiques toxicité de ces composés, pluies acides, effets délétères sur la santé... usages : conservateurs (sulfites, bisulfites), antioxydants.... - les oxydes d'azote et dérivés (NO, NO2, N2O, HNO3, HNO2) (2h) Propriétés physico chimiques toxicité de ces composés : pluies acides, brouillards (NO2, smog) formation des nitrosamines cancérigènes usages : conservateurs (sels nitrés) propriétés physiologiques (monoxyde d'azote, protoxyde d'azote) - dérivés de l'oxygène (H2O2, radicaux libres) (1h30) Réactivité et impacts biologiques - Les principaux alcalins (Li, Na, K) (2h) Réactivité chimique comparée (pouvoir réducteur, basicité des oxydes et hydroxydes... ) taux dans l'organisme, toxicité de certains sels.
Etude et propriétés des principaux sels inscrits à la pharmacopée ou d'intérêt biologique : carbonates, bicarbonates, sulfates, oxydes et hydroxydes, nitrates, cyanures, hypochlorites... Alcalins entrant dans la composition de médicaments : carbonate de lithium
- Les principaux alcalino-terreux (Mg, Ca, Sr, Ba) (2h) Réactivité chimique comparée (pouvoir réducteur, basicité des oxydes et hydroxydes... ) Taux dans l'organisme, toxicité de certains sels (Ba)
étude et propriétés de certains sels inscrits à la pharmacopée ou d'intérêt biologique : chlorures, carbonates, sulfates, hydroxydes et oxydes (chaux, magnésie...)
usages : purgatifs, cholagogues, produits de contraste, pansements antiacides toxicité : sels de baryum... - Quelques éléments de transition : Cr, Mn, Fe, Co, Ni, Cu... (1h30) Réactivité chimique comparée, états d'oxydation des sels étude et propriétés de certains oxydes et sels : permanganate, chromates, bichromates - Les complexes et la théorie du champ cristallin (2h) Géométrie et propriétés magnétiques des complexes
Exemples de complexes d'intérêts biologiques : hème, cytochromes (toxicité du cyanure) chlorophylle, cobalamines, EDTA...
- Etat solide; importance du polymorphisme dans la biodisponibilité des principes actifs. (1h)
TRAVAUX DIRIGES 4 h 30
10 1ère séance : nomenclature ; 2ème séance : les complexes métalliques ; 3ème séance : complément et développement de certaines parties du cours ;
TRAVAUX PRATIQUES 10 h • ANALYSE DES IONS : 3 séances de 2h30
- analyse qualitative et identification des principaux anions et cations, en se basant sur des techniques décrites dans la rubrique "identification" de la pharmacopée Européenne.
- Il s'agit ici d'une approche qualitative simple à mettre en œuvre (diagnoses) permettant à l'étudiant de se familiariser avec quelques substances minérales qui, pour certaines présentent une toxicité à connaître pour de futurs pharmaciens. Ces TP sont complémentaires de ceux de chimie analytique (analyses quantitatives) ou de ceux de toxicologie et d'hydrologie (recherche des traces d'arsenic, nitrates, plomb, mercure...).
- Certains de ces ions (mercure, plomb,arsenic, cadmium...) ne sont pas abordés dans le cours de chimie minérale, faute de temps.
- Chaque séance est précédée d'une "conférence" fixant les objectifs et fait l'objet d'un développement théorique dans le manuel de TP
Contenu de chaque séance :
1ère séance : sels d'argent, mercure, plomb; nitrates, nitrites, sulfates. 2ème séance : sels d'antimoine, bismuth, arsenic, cadmium, cuivre; halogénures. 3ème séance : sels de fer, aluminium, chrome ; hexacyanoferrates, (bi)chromates, (bi)carbonates 4ème séance : sels de potassium, sodium, lithium, ammonium, calcium, baryum, strontium.
• MANIPULATION : 1 séances de 2h30 qui est le prolongement du cours de Chimie Générale et Minérale : mesure du produit de solubilité d'un composé ou étude cinétique d'une réaction chimique.
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C H I M I E O R G A N I Q U E COURS 19 h - CYCLANES - CYCLENES – CYCLANONES - TERPENES - AROMATICITE, REGLES de HUCKEL - SUBSTITUTION ELECTROPHILE, REGLES de HOLLEMAN - BENZÈNE, ALKYL et ALKENYL BENZÈNES - BIPHENYLE, DITANE, TRITANE - NAPHTALENE, ANTHRACENE, PHENANTHRENE - DERIVES HALOGENES NUCLEAIRES et EXTRANUCLEAIRES - ACIDES SULFONIQUES et SULFOCHLORURES - PHENOLS - DERIVES NITRES - ANILINE et AMINES AROMATIQUES - DIAZOÏQUES AROMATIQUES - AZOÏQUES - HYDRAZINES - ALDEHYDES et QUINONES - NOMENCLATURE des HETEROCYCLES (Polycopié) - HETEROCYCLES à TROIS CHAINONS - FURANNE, THIOPHENE, PYRROLE - INDOLE
- PYRIDINES - QUINOLEINES et ISOQUINOLEINES
TRAVAUX DIRIGES 09 h
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TRAVAUX PRATIQUES 15 h 1) Synthèse d’un Médicament : Acide Acétylsalicylique (Aspirine) 3h
par acétylation de la fonction phénolique de l’Acide ortho-hydroxybenzoïque (Acide Salicylique) par l’anhydride acétique.
2) Réaction d’Acylation d’une Amine 3h
Synthèse de l’Acétanilide à partir de l’Aniline Synthèse de Colorants Azoïques : Réaction de copulation d’un sel de diazonium avec une amine, préparation de l’Hélianthine.
3) Préparation de la paranitroacétanilide à partir de l’Acétanilide 3h
Préparation du cyclohexanol par Réduction de la cyclohexanone par le borohydrure de sodium.
4) Réaction d’Oxydo-Réduction : Réaction de Cannizzaro 3h 5) Réaction d’Oxydation : Préparation de l’Acide benzoïque par oxydation 3h
de l’alcool benzylique. Stéréochimie : Etude des Structures au moyen des modèles moléculaires
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B I O P H Y S I Q U E COURS 12 h 1) PHYSIQUE NUCLEAIRE (8 H) 1.1 Particules élémentaires 1.2 Le noyau atomique
1.3 Radioactivité - Cinétique 1.4 Transformations radioactives – Réaction nucléaires 1.5 Interaction avec la matière 1.6 Détection et dosimétrie 1.7 Effets biologiques des rayonnements ionisants
2) PROPRIETES des SOLUTIONS (4 h) 2.1 Propriétés colligatives des solutions vraies 2.2 Solutions colloïdales TRAVAUX DIRIGES 4 h 30
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S T A T I S T I Q U E S
COURS 15 h
STATISTIQUE DESCRIPTIVE : différents types de données ( variables aléatoires) 2 h représentations graphiques ( diagrammes en camembert, en bâtonnets, histogrammes…) notions de distributions, de répartition – résumés numériques caractérisant la position, la dispersion, la forme-
QUELQUES LOIS DE PROBABILITES : Lois discrètes ( Bernoulli, Binomiale, Poisson…) , 3 h lois continues ( Gauss, Student, Khi-carré, Fischer-Snedecor…)
ESTIMATION DE PARAMETRES, INTERFERENCES STATISTIQUES : estimations 2 h ponctuelles et par intervalle de confiance - principe des tests statistiques (notion de risque, puissance d’un test…)
TESTS PARAMETRIQUES SIMPLES Comparaison d’une moyenne à une valeur théorique – d’une proportion à une valeur 3 h Théorique – de 2 moyennes (échantillons indépendantes ou appariés )- de 2 proportions
REGRESSION ET CORRELATION LINEAIRES 3 h LE TEST DU KHI –CARRE : tests d’ajustement-d’homogénéité-d’indépendance 2 h
TRAVAUX DIRIGES 12 h
6 SEANCES DE 2 HEURES 12 H
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A N A T O M I E P H Y S I O L O G I E
COURS 40 h 1) SNC 1.1 LCR ) Anatomie ) 5 h 1.2 Moëlle épinière ) Histologie ) 1.3 Nerfs rachidiens ) 1.4 Télencéphale ) 1.5 Diencéphale ) Physiologie ) 6 h 1.6 Tronc cérébral ) 1.7 Nerfs crâniens ) 2) SNA 2.1 Organisation ) Anatomie ) 2.2 S.N. sympathique ) Histologie ) 10 h 2.3 S.N. parasympathique ) Physiologie ) 2.4 Synapses ) 2.5 Récepteurs ) 2.6 Contrôle du SNA par le SNC ) 3) Organes des sens : goût, odorat, vue, audition )
) 3 h Peau et annexes )
4) Appareil cardiovasculaire Coeur - Vaisseaux - Système lymphatique : anatomie, histologie, physiologie 7 h Régulation de la pression artérielle
5) DIGESTIF 9 h 3.1 LA BOUCHE 3.1.1 Amygdales ) Anatomie 3.1.2 Dents ) Histologie 3.1.3 Glandes salivaires ) Physiologie : la salive 3.2 LE PHARYNX - Anatomie - Histologie - Physiologie : la déglutition 3.3 L'OESOPHAGE - Anatomie - Histologie - Physiologie : la motricité 3.4 L'ESTOMAC - Anatomie - Histologie - Physiologie : .Rôle mécanique .Rôle digestif
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- Anatomie - Histologie - Physiologie : . Fonctions métaboliques . Autres fonctions 3.6 LE PANCREAS - Anatomie - Histologie - Physiologie : . Suc pancréatique . Contrôle de la sécrétion 3.7 L'INTESTIN GRELE - Anatomie - Histologie - Physiologie : . Rôle mécanique . Rôle digestif 3.8 LE COLON - Anatomie - Histologie - Physiologie : . Rôle mécanique . Rôle digestif
TRAVAUX DIRIGES 6 h 1) SYSTÈME NERVEUX CENTRAL I : 1 h 30 LCR, Réflexes, Aires et Voies Motrices 2) SYSTEME NERVEUX CENTRAL II : 1 h 30 Corps striés, Aires et voies sensitives, Hypothalamus 3) SYSTEME NEURO VEGETATIF : 1 h 30 (= Système nerveux Autonome : Sympathique et Parasympathique) 4) Régulation de la pression artérielle 1 h 30
TRAVAUX PRATIQUES 20 h 1) HISTOLOGIE de la MOËLLE EPINIERE et du GANGLION SPINAL 3 h 2) ANATOMIE de l'ENCEPHALE 3H 3) HISTOLOGIE DE LA PEAU HUMAINE ET DE LA RETINE ANATOMIE ET PHYSIOLOGIE DE DE L’OREILLE 3 h 4) ANATOMIE DU CŒUR ET DE L’APPAREIL CIRCULATOIRE 3 h - Electrocardiogramme - Histologie des vaisseaux 5) MESURE DE LA PRESSION ARTERIELLE 3 h Méthode auscultatoire chez l’homme 6) MOTILITE INTESTINALE sur un FRAGMENT de DUODENUM de RAT 2 h 7) ETUDE HISTOLOGIQUE de la PAROTIDE, du FOIE, du DUODENUM 3 h
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B I O L O G I E A N I M A L E TRAVAUX PRATIQUES 9 h
Première séance 3H 1) LES ASSOCIATIONS ANIMALES 1.1 Commensalisme 1.2 Symbiose 1.3 Inquilinisme 1.4 Parasitismes 2) LES PROTOZOAIRES 3) LES METAZOAIRES 3.1 Diblastiques : 3.1.1 Porifera 3.1.2 Cnidaires 3.2 Triblastiques acoelomates : 3.2.1 Plathelminthes ) cycles 3.2.2 Nématodes ) parasitaires 3.3 Triblastiques coelomates : Protostomiens 3.3.1 Annélides 3.3.2 Mollusques 3.3.2.1 Comparaison des appareils respiratoires 3.3.2.2 Adaptation aux différents modes de vie
3.3.2.3 Transmission de parasites Deuxième séance 3H
3.3.3 Arthropodes 3.3.3.1 Chélicérates (scorpions, araignées, acariens) 3.3.3.2 Crustacés 3.3.3.3 Insectes : 4 types en fonction du mode de vie seront abordés
: les prédateurs utiles, les nuisibles, les nuisants 3.3.3.4 Myriapodes 3.3.3.5.Différenciation du sexe chez les insectes (démonstration)
3.4 Triblastiques coelomates : Deutérostomiens 3.4.1 Echinodermes (Epithélioneuriens) 3.4.2 Prochordés ) ) 3.4.3 Vertébrés ) (Epineuriens) ) 3.4.3.1 Vertébrés à sang froid )
18 1) Cyclostomes 2) Poissons : 2.1 cartilagineux 2.2 osseux Dissection d'un poisson osseux : la truite Appareils : 2.2.1 digestif 2.2.2 génital 2.2.3 urinaire 2.2.4 cardiovasculaire 3) Vertébrés Amphibiens : 3.1 Anoures 3.2 Urodèles
Troisième séance
4) Vertébrés Reptiles : ) ) 4.1 Sauriens ) 4.2 Ophidiens : - couleuvres ) - vipères ) 4.3 Chéloniens : - tortues ) 3.4.4.2 Vertébrés à sang chaud : ) 3 h ) 1) Oiseaux ) ) 2) Mammifères ) ) Dissection des appareils digestif et urogénital de la souris )
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BOTANIQUE
COURS 15 h - ETUDE SYSTEMATIQUE des VEGETAUX SUPERIEURS 15 h 1ère Partie : Magnolopsida (= Dicotylédones) - Magnolidae - Caryophyllidae - Hamamelidae - Dilleniidae - Rosidae - Asteridae 2ème Partie : Liliopsida (= Monocotylédones) - Arecidae - Commelinïdae
- Lilïdae
TRAVAUX DIRIGES 4 h 30 AIDE à la CONSTITUTION d'un HERBIER TRAVAUX PRATIQUES 15 h 1) MICROGRAPHIE 1.1 Axe de structure primaire 1.2 Axe de structure secondaire 1.3 Feuilles 1.4 Fleurs et fruits 2) RECONNAISSANCES de PLANTES
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PHARMACOLOGIE MOLECULAIRE et GENERALE
Cours 15 h
INTRODUCTION La pharmacologie, science du médicament
I - Mécanismes d’action des médicaments
Les cibles pharmacologiques
1. Les récepteurs membranaires Les superfamilles, les mécanismes de transduction des signaux et leurs régulations Récepteurs ionophores Récepteurs enzymes Récepteurs couplés aux protéines G
2. Les récepteurs nucléaires Les familles et les facteurs de transcription
3. Les enzymes, cibles de médicaments L’inhibition enzymatique
4. Les autre cibles Transporteurs, canaux, pompes ioniques, acides nucléiques
II - Quantification des effets pharmacologiques
1. L’interaction ligand – récepteur 2. La réponse fonctionnelle (cellulaire, intégrée) 3. Les essais pharmacologiques
De la cible … à l’homme, via l’animal
III - Variabilité de la réponse pharmacologique
1. Métabolisme des médicaments 2. Pharmacogénomique
TRAVAUX DIRIGES 4 h 30
TD1 - Exercices de quantification d’une interaction ligand-récepteur : analyse des résultats
d’expériences de saturation (KD, Bmax) et d’inhibition compétitive (CI50, KI).
TD2 - Exercices de quantification d’un effet pharmacologique : courbe effet-dose, DE50 ; agonisme et antagonisme. Etudes de corrélation in vivo-in vitro.
TD3 - Métabolisme des médicaments : variabilité inter-espèces, pharmacogénétique, exemples.
TRAVAUX PRATIQUES 5 h TP1- Interaction ligand-récepteur : étude in vitro de la liaison à l’équilibre. TP2- Etude des contractions du duodénum isolé de rat sous l’influence de différents agents
pharmacologiques (TP coordonné avec la Physiologie).
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B I O C H I M I E M E T A B O L I Q U E COURS 30 h INTRODUCTION : Aspects généraux du métabolisme 1 h 1) METABOLISME des LIPIDES et de leurs DERIVES 5 h 30 1.1 Métabolisme des acides gras : biosynthèse et béta-oxydation 1 h 30 1.2 Métabolisme des triglycérides 1 h 1.3 Métabolisme des lipides complexes : phospholipides et sphingolipides 1 h 30 1.4 Biosynthèse du cholestérol, mécanisme biochimique et régulation 1 h 30 Transformations du cholestérol : passage aux acides biliaires 2) METABOLISME des GLUCIDES et de leurs DERIVES 7 h 2.1 Les réactions de glucogénèse 1 h 2.2 La néoglucogénèse 1 h 2.3 Mécanisme biochimique de la glycolyse et sa régulation 2 h Cycle des pentose-phosphates : mécanisme, intérêt Carrefours du glucose 6 phosphate 2.4 Biosynthèse et dégradation du glycogène : 1 h 30 mécanisme biochimique et régulation 2.5 Biosynthèse des glycoprotéines et des mucopolysaccharides 1 h 2.6 Cycle de Krebs : mécanisme, régulation 1 h 3) MECANISMES de REGULATION de l'ACTIVITE des PROTEINES 5 h 30 3.1 Modifications conformationnelles par interaction protéine-ligand : 3.1.1 Définition et représentation graphique 1 h 3.1.2 Allostérie et coopérativité , exemple de l'hémoglobine 1 h 3.2 Modifications covalentes : 2 h 3.2.1 Acétylation, isoprénylation, acylation 3.2.2 Protéolyse limitée : exemple des sérine-protéases 3.2.3 A.D.P. - ribosylation 3.2.4 Phosphorylation : types de protéine-kinases 3.3 Signalisation cellulaire : voies de transduction du signal, protéines G 1 h 30
4) ENZYMOLOGIE 3h 30
22 4.1 Cinétique enzymatique. Inhibiteurs enzymatiques 1h 30 4.2 Notion de site actif et mécanisme de catalyse 2 h (exemple des sérine-protéases) 5) BIOENERGETIQUE et OXYDO-REDUCTIONS PHOSPHORYLANTES 3 h 5.1 Notions de bioénergétique cellulaire ; l'ATP et sa formation 1 h 30 5.2 Chaîne respiratoire et phosphorylation oxydative 1 h 30 6) METABOLISME GENERAL des AMINOACIDES 3 h 30 6.1 Mécanismes généraux de transformation : 2 h Transamination, désamination oxydative, décarboxylation Ammoniogénèse. Uréogénèse 7) BIOSYNTHESE des BASES PURIQUES et PYRIMIDIQUES et leur REGULATION 2 h TRAVAUX DIRIGES 9 h
1) ENZYMOLOGIE 1 h 30 2) MODIFICATIONS ET REGULATION de l'ACTIVITE des PROTEINES : 1 h 30 3) METABOLISME des LIPIDES et DERIVES 1 h 30 4) METABOLISME des GLUCIDES et DERIVES 1 h 30 5) METABOLISME des AMINO-ACIDES 1 h 30 6) METABOLISME : RECAPITULATIF 1 h 30
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L A N G U E S E T R A N G E R E S ( A N G L A I S ) TRAVAUX DIRIGES 16 h
Révisions grammaticales pour les quatre niveaux, plus approfondies et plus fréquentes en séries C et D qui présentent davantage de lacunes. l Travail de compréhension orale à partir de documents audio et vidéo sur des sujets divers. Expression orale et écrite à partir de ces mêmes documents. l Rédaction de compte-rendus avec, à la séance suivante, une correction des erreurs commises qui donne l'occasion de revoir des points de grammaire ou de syntaxe qui ne sont pas bien maîtrisés. l Un premier contrôle testera l'expression orale individuelle sur des documents connus et approfondis en cours ; un second contrôle vérifiera la compréhension orale et l'expression écrite sur un document vidéo à orientation scientifique en vue de l'enseignement de 3ème année qui portera sur des documents exclusivement scientifiques.
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E.C.I. MODULE 1 MATIERES PREMIERES d’ORIGINE NATURELLE ou de SYNTHESE ou ISSUES de BIOTECHNOLOGIES (23 H CM + 2 H TD) 1) SUBSTANCES NATURELLES - GENERALITES 1.1 Assurance Qualité
Normalisation des plantes médicinales ; essais généraux des substances naturelles 1.2 Généralités sur certains groupes chimiques de substances naturelles médicamenteuses (suite de l'enseignement de 2ème année)
Pour chaque cas seront traités :
- Définition - Mode d'obtention - Propriétés physico-chimiques - Contrôles - Usages 1.2.1 Généralités 1.2.2 Holosides 1.2.3 Hétérosides à noyau stéroidique (saponines les cardiotoniques sont traités dans le module 2)
Hétérosides à noyau flavonoïdique (flavonoides sensu stricto, anthocyanes, tanins...)
Hétérosides à noyau anthraquinonique (ce chapitre est taité dans le module 3) 1.2.4 Huiles essentielles 2) SUBSTANCES de SYNTHESE - GENERALITES 2.1 Dénomination des substances actives 2.1.1 Dénomination chimique 2.1.2 Dénominations usuelles : vulgaires, communes (dénomination commune internationale)
2.1.3 Dénomination commune 2.1.4 Marques déposées 2.1.5 Formation des dénominations communes : segments clés, préfixes et suffixes
2.2 Plan d'étude d'un principe actif et essais généraux des médicaments 2.2.1 Méthodes générales d'identification et de contrôle 2.2.2 Recherche des impuretés : impuretés générales, ions courants, impuretés particulières 2.2.3 Essai quantitatif : dosage de l'eau, dosage du principe actif
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2.3 Généralités sur les stéroïdes : cet enseignement sert d’introduction à différents modules de 3ème année et de 4ème année où apparaissent des principes actifs à structure stéroïde. 2.3.1 Classification chimique des hormones stéroïdes : isoméries et nomenclature 2.3.2 Obtention à partir des matières premières naturelles - les matières premières - dégradation de la chaîne latérale : cas des stérols (voie enzymatique, voie chimique), de la diosgénine et des acides biliaires - modification au niveau des cycles et interconversions : groupe hydroxyles des acides biliaires, passage de l'androstane à l'estrane ou au pregnane, passage du pregnane à l'androstane, hydroxylation en 11, fonctionnalisation en 9 et en 11,... 2.3.3 Modulation de l'activité dans les différentes séries par l'introduction de substituants ou de modifications structurales 3) BIOTECHNOLOGIE - GENERALITES Définition Principaux dérivés 3.1 obtenus par fermentation 3.1.1 Principe de la production 3.1.2 Contrôles (assurance de qualité) 3.1.3 Exemples : antibiotiques, dextrans, cyclodextrine, gomme xanthane,... 3.2 obtenus par génie génétique 3.2.1 Principe de la production 3.2.2 Contrôles : prescriptions de la Pharmacopée Européenne pour les "Produits obtenus par la méthode dite de l'ADN recombinant". 3.2.3 Exemples de médicaments :
- hormones et facteurs de croissance : insuline, somatotropine, facteurs de croissance hématopoïétique (lignées blanche, rouge plaquettaire),...
- modificateurs de la réponse immunitaire : interférons, interleukines - produits du sang : alteplase, facteur VIII,... - antigènes et vaccins
- anticorps monoclonaux
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T P g e s t e s d e b a s e
1 : initiation à la manipulation : 24 h
1 . HYGIENE ET SECURITE : Durée 3 heures Bonnes pratiques de manipulation. Mise en place d’un cahier de Travaux pratiques devant être utilisé pour les 3 années de formation commune de base. Deux séances de T.D. de 1 h 30 chacune. 1 : Sécurité des produits chimiques (Durée 1h30). Etiquetage, solutions corrosives, inflammables…. 2: Sécurité des produits biologiques (Durée 1h30) II. B.P.L, VERRERIE, PIPETTES, BURETTES, PESEE, TITRES, DOSAGES Durée 15 heures Proposition de T.P de Chimie Minérale/Générale élaborée en concertation avec les enseignants de Chimie Analytique . 1er T.P (Durée 3 h) Préparation de l’Acide Borique A partir du borax par action HCl, à froid. Préparation, réaction, filtration, lavage, purification par recristallisation. Dosage selon la Pharmacopée. Détermination de la pureté. Caractères organoleptiques. Ou bien Préparation du Carbonate de Calcium Par double décomposition. Préparation, pesée, réaction, filtration, lavage, contrôle pureté, rendement, identification des différents ions. 2ème T.P (Durée 3 h) Etude de la stabilité d’une solution d’eau oxygénée. Cette manipulation se situe en continuité d’une séance d’apprentissage proposée par la Chimie Analytique. La finalité est de mettre en évidence le rôle d’un catalyseur dans la vitesse d’un processus réactionnel et de montrer que la stabilité de certains produits (eau oxygénée, eau de javel) peut être fortement modifiée par la présence d’impuretés.
Décomposition de l’eau oxygénée: L’étudiant comparera l’évolution d’une solution d’eau oxygénée seule ou en présence de perchlorure de fer. La réaction de décomposition est suivie dans le temps par un dosage à la burette de l’eau oxygénée restante. L’intégrité du catalyseur est vérifiée en fin de manipulation. Compte rendu avec interprétation des résultats, pourcentage de dégradation et caractéristiques cinétiques de la réaction…. 3ème T.P (Durée 3h)
27 Préparation et étude d’un complexe métallique Manipulation qui permet de mettre en évidence certains types de réactions retrouvées dans les équilibres en solution (complexation, précipitation). On se propose de déterminer la valeur de la constante d’équilibre K (reflet de la stabilité du complexe) du système Ag+ + 2 NH3 • • • • 3)2]
+
La concentration en ion Ag+, à l’équilibre, sera déterminée par dosage à l’aide d’une solution titrée de KBr. La constante d’équilibre mesurée expérimentalement permet à l’étudiant de voir que plusieurs équilibres chimiques peuvent cohabiter au sein d’une solution. Les solutions titrées d’AgNO3 et KBr seront préparées par les étudiants.
4ème T.P (Durée 3h) Dosage acido-basique d’un ampholyte ( phenobarbital ) et dosage par oxydo-réduction de l’eau oxygénée (manganimétrie) Choix de la solution titrante (HCI ou NaOH) et des indicateurs colorés Choix du matériel, jaugé ou gradué
Préparation des solutions titrantes (acide chlorhydrique, dikution, soude, pesée ou ou dilution) et étalonnage avec des solutions de référence préparées extemporanément (bicarbonate de potassium, phalate acide de potassium, pesée). Ajustement des solutions si nécessaire. Dosage du phénobarbital en présence de l’indicateur choisi. Préparation d’une solution d’acide oxalique (produit pur, pesée) pour étalonner le permanganate de potassium(pesée, filtration) Dosage de l’eau oxygénée après dilution.
5ème T.P (Durée 3h) Dosages iodométriques de l’hypochlorite de sodium et bromométrique de l’acide salicylique. Préparation d’une solution de thiosulfate de sodium(pesée), étalonnée par une solution d’acide chlothydrique (dilution). Dosage d’une solution d’hypochlorite après dilution Dosage indirect d’une solution d’acide salicylique par bromométrie :
- Génération de brome à partir d’un mélange bromate/bromure en milieu acide. - Dosage du brome restant par le thiosulfate
Matériel utilisé : balance, Erlen, fiole jaugée, pipette graduée et jaugée, burette
III. MICROPIPETTES. MANIPULATION. Une séance de T.P. Durée 3 heures Initiation aux manipulations des micropipettes: application au contrôle de qualité des méthodes de dosages par des mesures de reproductibilité, de répétabilité et calcul d’exactitude. IV. MICROSCOPIE OPTIQUE
28 Une séance de T.P. Durée 3 heures Principes du microscope et précautions d’usage, mise au point (Durée 1h30 PHYSIQUE) Mesures et précisions de mesures: Du pas de vis micrométrique Du coefficient micrométrique Du grossissement commercial.
Applications (Durée 1h30 BOTANIQUE MYCOLOGIE, MICROBIOLOGIE, PARASITOLOGIE, PHYSIOLOGIE HEMATOLOGIE) Mesures de dimensions Analyse de lames Comptage à l’aide de la cellule de Malassez.
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2 : Extraction, séparation, purification de molécules synthétiques et naturelles : 18 h
1. EXTRACTION LIQUIDE/LIQUIDE EN MILIEU BASIQUE : FITRATION, RECRISTALLISATION, UTILISATION D’UN EVAPORATEUR ROTATIF
• Principe et montage
• Séparation d’un acide et d’un phénol
• Filtration, recristallisation, évaporation
• Caractérisation chimique des groupements fonctionnels : acide carboxylique (FeCl3, NaHCO3), phénol (FeCl3, eau de brome)
• Calcul de % et de rendement
• Caractérisation analytique : point de fusion, IR, RMN du proton
• Contrôle de pureté par chromatographie sur couche mince 2. DISTILLATION SOUS PRESSION ATMOSPHERIQUE ET REDUITE, SUBLIMATION
1. Distillation
• Principe et montage
• Séparation de l’acétone et de la N-méthylpyrrolidone
• Caractérisation chimique : acétone (Legal, DNPH)
• Caractérisation analytique : Point d’ébullition, indice de réfraction, IR, RMN du proton
2. Sublimation
• Principe et montage
• Sublimation du camphre
• Caractérisation chimique
• Caractérisation analytique : CCM, IR, RMN
3 .ENTRAINEMENT A LA VAPEUR D’EAU. FORMATION DE DIASTEREOISOMERES
1 - Entrainement à la vapeur d’eau :
• Principe et montage
• Séparation du phénol
• Calcul du rendement
• Caractérisation chimique : amine aromatique (diazotation), phénol (résorcinol, ß-naphtol)
• Caractérisation analytique : indice de réfraction, IR, RMN du proton
1. Formation de diastéréoisomères :
• Principe
• Formation du tartrate de α-méthyl-benzylamine racémique
30 4. EXTRACTION PAR SOLVANTS SUCCESSIFS : OBTENTION DE DIFFERENTS COMPOSANTS A PARTIR D’UNE DROGUE (EXEMPLE : L’ECORCE D’ORANGE AMERE..) L’extraction successive de composés d’une drogue végétale par l’hexane, le chlorure de méthylène puis une solution hydro-alcoolique conduit à trois fractions organiques de composition très différentes : a) la fraction hexanique est riche en composés apolaires ( huile essentielle, matières grasses et cireuses..) b) la fraction dichlorométhanique contient des citroflavonoïdes (génines et monohétérosides..) c) la fraction hydro-alcoolique est riche en dérivés polaires dont certains sont glycosylés…. L’analyse, par chromatographie sur couche mince, des différentes fractions permet de comprendre le bien fondé du principe de l’extraction, d’expliquer la nécessité d’un choix raisonné des solvants à utiliser en fonction des objectifs de l’extraction. De plus, par l’utilisation de révélateurs spécifiques en CCM, il est évalué la complexité des fractions et prévisible le suivi phytochimique préliminaire des molécules biologiquement actives.
5 . EXTRACTION ET PURIFICATION D’ADN. ANALYSE PAR ELECTROPHORESE
L’extraction d’acides nucléiques est une étape préalable à toutes analyses géniques (empreinte génomique, analyse de l’expression de gènes, facteurs géniques de prédisposition à des pathologies etc .....).
L’ADN est extrait à partir de cellules d’origines différentes par :
• lyse des cellules par traitement au NaOH, SDS et EDTA
• élimination des membranes et organites par précipitation à l’acétate de potassium puis centrifugation
• précipitation des acides nucléiques à l’isopropanol
• purification des acides nucléiques part chromatographie d’affinité (colonnes de silice). Les acides nucléiques sont ensuite analysés et comparés après électrophorèse sur gel d’agarose.
6 .PURIFICATION DE PROTEINES PAR IMMUNOCHIMIE. ANALYSE PAR ELECTROPHORESE
• Purification de l’albumine sérique par immunoprécipitation :
• Elimination des immunoglobulines par précipitation au sulfate d’amonium
• Incubation du surnageant avec un anticorps anti-albumine couplé à la protéine A
• Centrifugation et dénaturation de l’immunoprécipité
• Electrophorèse analytique des échantillons avant et après (immuno)précipitations
• Révélation au bleu de Coomassie
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3 : Instrumentation : 45 h
1 - PH-METRIE
Mesures potentiométriques avec une électrode à membrane de verre, tracé d’une courbe de neutralisation d’un polyacide, détermination des pKa et appréciation du pouvoir tampon
2 - ELECTRODES SELECTIVES F − ET AG
+
• Dosage direct de l’ion fluorure dans une formulation pharmaceutique avec une électrode à membrane par la méthode d'étalonnage et par la méthode des ajouts.
• Dosage d’ions halogénures ( I− et Cl− ) dans un collyre ou d'un principe actif sous la forme d'un chlorhydrate par le nitrate d'argent avec une électrode d'argent. Détermination de produits de solubilité.
3 - PRINCIPES DE LA SPECTROPHOTOMETRIE UV/VISIBLE
• Tracé du spectre ultraviolet d’un principe actif (paracétamol, benzocaïne, phénacétine…), vérification expérimentale de la loi de Beer-Lambert.
• Détermination des paramètres spectraux ( ε et E 1% 1 cm ) et physicochimiques (pKa). Dosage du principe actif à partir d’une courbe étalon.
4 - APPLICATION DE LA SPECTROPHOTOMETRIE UV/VISIBLE
• Dosage colorimétrique : établissement d’une courbe étalon
• Dosage enzymatique : détermination de la constante de Michaelis de la phosphatase acide
5 - SPECTROMETRIE IR, ANALYSE STRUCTURALE
• Traitement de l'échantillon (pastille KBr, Nujol, liquide).
• Enregistrement et étude comparative des spectres infra-rouge de composés d'intérêt pharmaceutique.
• Détermination de la formule développée d'un principe actif à partir de données spectrales expérimentales IR, UV et RMN, SM.
6 - EMISSION DE FLUORESCENCE
• Etude de la fluorescence de la quinine (spectres d'excitation et d'émission) et de son extinction (quenching) à concentrations élevées.
• Dosage de la quinine dans une formulation à partir d'une gamme étalon. 7 - EMISSION DE FLAMME ET ABSORPTION ATOMIQUE
• Tracé d'une courbe d'étalonnage à partir d'une gamme étalon, limites de détection. Dosage du sodium et du potassium dans un soluté isotonique injectable par perfusion ou dans une eau minérale par émission de flamme. Interférence du sodium sur le dosage du potassium.
• Dosage par absorption atomique en four du cuivre, du fer et du manganèse dans des "oligosols".
32 8 - CHROMATOGRAPHIES: CCM – HPLC
• Caractérisation de trois xanthines (théobromine, théophylline et caféine) par leur temps de rétention après détermination par CCM du meilleur éluant.
• Identification et dosage d'une xanthine dans une solution en présence d'étalon interne. 9 - ELECTROPHORESE
• Séparation de protéines par électrophorèse verticale sur gel de polyacrylamide.
• Etude de la migration des molécules en fonction du degré de polymérisation du gel. Détermination de la pureté et de la masse molaire des protéines.
10 - ELECTROPHORESE CAPILLAIRE.
• Caractérisation et dosage des ions NO3- et NO2- dans une eau de consommation en présence d'un étalon interne.
• Influence des variations de la concentration de l'électrolyte, de la tension et de la température sur le temps de migration.
11 - La radioactivité : Spectrométrie et radioprotection
• Tracé du spectre du 137Cs
- Détermination de l'énergie du photon émis par le 137Cs.
- Calcul du pouvoir de résolution de l'échelle de comptage.
• Interaction du rayonnement avec la matière : - Influence de la distance source compteur, vérification de la loi en 1/d²
- Détermination du coefficient d'atténuation du plomb. Calcul de la CDA.
12 - L'œil et la vision :
• Etude de l'évolution de la vergence du cristallin en fonction de son rayon de courbure. calcul
de l'amplitude dioptrique d'accommodation de l'œil normal.
• Anomalies de l'œil :
- Etude de la myopie :
* calcul du punctum remotum
* correction de la myopie
- étude de l'hypermétropie :
* calcul du punctum remotum
* correction de l'hypermétropie
- étude de la presbytie :
* correction de la presbytie
13 - Polarimétrie (2h30) :
Principe de la polarimétrie. Etude de la loi de Biot, détermination à partir de la courbe du
pouvoir rotatoire spécifique d' une substance optiquement active.
33 Etude de la cinétique de transformation du saccharose en milieu acide. Calcul de la
constante de vitesse, et détermination par extrapolation du pouvoir rotatoire du
saccharose à partir des courbes obtenues.
14 - Crymétrie, viscosimétrie, mesure de la tension superficielle
Mesure de la tension superficielle et propriétés colligatives des solutions (cryoscopie et
pression osmotique).
1 - Mesure de la tension superficielle :
- Méthodes relatives : * méthode de Duclaux
* méthode de l'arrachement
- Méthode absolue : * lame immergée
2 - Cryoscopie et pression osmotique :
- Recherche du palier de congélation d'une solution pure, détermination de
l'abaissement du point de congélation d'électrolytes et de non électrolytes.
- calcul de la pression osmotique de ces solutions.
Mesure de la viscosité par des liquides :
- méthode relative : viscosimètre d'Oswald (loi de Poiseuille)
- méthode absolue :
* chute de bille (utilisation de la loi de Stokes)
* cylindre tournant
- étude de l'évolution de la viscosité relative en fonction de la concentration de la solution (relation
d'Einstein). Détermination du rayon de la molécule à partir de la courbe obtenue.
15 - INITIATION A LA CYTOMETRIE DE FLUX Cet enseignement devrait se faire postérieurement au TP “ Emission de fluorescence ”. Objectif général: Initiation à l’analyse automatisée de la fluorescence de cellules en suspension Objectifs pédagogiques :
• Principe de la cytométrie de flux : mesure et analyse de la lumière diffusée et de la fluorescence cellulaire
• Présentation schématique de l’appareillage
• Principales applications en biologie (clinique, recherche et développement), intérêt et limites.
• Illustrations autour du marquage membranaire : dot blot, sélection des fenêtres d’observation, analyse d’histogrammes (simple, double et triple marquages)
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4 : Initiation à la biologie cellulaire : 12 h Les TP de Biologie cellulaire sont organisés en 4 séances de 3h et abordent les 3 points suivants :
1 - BASES THEORIQUES ET PRATIQUES DE LA CULTURE DE CELLULES PROCARYOTES ET EUCARYOTES
Les cellules seront mises en culture en présence ou non d’agents mitogènes, cytotoxiques ou mutagènes.
2 - MISE EN EVIDENCE DE LA PROLIFERATION, DE LA VIABILITE CELLULAIRE ET DE LA MUTAGENESE
• Evaluation des traitements mutagènes.
• Etude de la prolifération et de la mort cellulaire 3 - OBSERVATION MICROSCOPIQUE DES CELLULES EUCARYOTES
• Identification des principaux constituants cellulaires
• Mise en évidence de l’apoptose et de l’endocytose
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5 : observation des caractères organoleptiques des plantes toxiques et médicinales, produits galéniques et produits chimiques : 6 h
2 séances de 3h = 6 h 1 - OBSERVATION DES CARACTERES ORGANOLEPTIQUES DES PLANTES TOXIQUES ET MEDICINALES.
• Initiation à l’observation des particularités de la drogue, à l’observation de la méthodologie de la description, au vocabulaire botanique, à l’expression du résultat des observations
• Réalisation de certains essais prescrits par la pharmacopée [recherche des éléments étrangers (2.8.2), Indice d’amertume (2.8.15) …]
2 - OBSERVATION DES CARACTERES ORGANOLEPTIQUES DES PRODUITS GALENIQUES ET DES PRODUITS CHIMIQUES. )
• Utilisation des caractères organoleptiques et d’examens faciles à réaliser (loupe binoculaire, fil de platine, réaction au tournesol, etc..) pour apprendre à connaître les produits galéniques et les produits chimiques
• Rédaction de fiches d’observation.
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6 : informatique, documentation et communication – Préparation au C2i niveau 1 et d’ABCdoc : 19 h 30
INITIATION A L’INFORMATIQUE : 8 H 1 - PRISE EN MAIN RAPIDE DU SYSTEME D’EXPLOITATION (WINDOWS OU AUTRE) : 2H
• Bureau
• Réglages écran, clavier, souris
• Sauvegarde sur diskettes ou CD
• Logiciels disponibles
2 - LOGICIEL FEUILLE DE CALCUL (TABLEUR STARCALC) : 2H
• Structure, contenu, cellules, plages.
• Adressages absolu et relatif.
• Utilisation des formules.
• Fonctions mathématiques, statistiques.
• Fonctions date et heure, finances, texte
• Fonctions logiques, recherche et décisions.
• Graphiques : séries temporelles, nuages de points.
• Mise en page pour impression.
• Etude de l’utilisation en TP de Physique.
• Passage StarCalc à Excel et vice-versa 3 - TRAITEMENT DE TEXTE (STARWRITER) : 2H
• Manipulation des principales fonctionnalités d’un traitement de texte.
• Frappe au kilomètre.
• Copier, couper, coller
• Style et formatage de paragraphe.
• Insertion d’objets, graphes et tableaux.
• Editeur d’équations.
• Mise en page, en-tête et pied de page.
• Table des matières
• Passage StarWriter à Word et vice-versa
37 4 - PRESENTATION (A L’ECRAN OU DIAPOS,…) (STARIMPRESS) : 2H
• Utilisation de l’auto-pilote
• Les modèles
• Création de diapos avec mise en page
• Transition entre écrans ou diapos
• Animation des objets
• Ajout de tableaux, graphes et sons.
• Passage StarImpress à PowerPoint et vice-versa
INITIATION A LA GESTION DOCUMENTAIRE : 7 H
1- PRESENTATION GENERALE (2H30)
• Principes de fonctionnement d’un réseau (internet) et d’une base de donnée
• Notions minimales sur les virus et la sécurité informatiques
• Exemple : logiciel de gestion d’une officine et connexion avec la CPAM
2 - TRAVAUX PRATIQUES (4H30) A partir d’une pathologie prise en exemple (polyarthrite rhumatoïde), l’étudiant sera guidé pas à pas pour effectuer des recherches documentaires, thérapeutiques et des consultations de bases de données ou de sites offrants des outils utiles pour la recherche biomédicale.
Initiation à la recherche bibliographique
utilisation de PubMed (Internet) et Science citation Index (SCD UPS)
réalisation d’une recherche bibliographique guidée pas par pas, téléchargement d’articles (pdf), …
démonstration d’autres possibilités : thèses, gestion personnelle et utilisation de la bibliographie, présentation des formations offertes par le SCD, site de biblio de l’institut Pasteur
• Médicament :
utilisation du Vidal et de la Pharmacopée
recherche d’interactions médicamenteuses
• Présentation du C2i niveau 1 : objectifs, organisation de la formation, modalités d’évaluation CM 1h.
Test de positionnement : test C2i théorique sur la plateforme d’évaluation TP 1h30 (6 groupes) Pour les étudiants ayant plus de 10/20 au Test : auto-apprentissage sur la plateforme Moodle UPS ou le site C2imes.
38 Pour les étudiants volontaires (ceux ayant moins de 8/20 sont prioritaires pour l’utilisation des postes informatiques) : participation à des ateliers de formation sur chacun des domaines du programme (TP en salle informatique). Attention, la séance 3 fait l’objet d’un contrôle continu. Ateliers de formation :
Séance 1 : (2 groupes TP)
A1- Tenir compte du caractère évolutif des TIC
A2- Intégrer la dimension éthique et le respect de la déontologie Séance 2 : (2 groupes TP)
B1- S’approprier son environnement de travail
B3- Sauvegarder, sécuriser, archiver ses données en local et en réseau filaire ou sans fil B4- Réaliser des documents destinés à être imprimés (partie tableur I)
Séance 3 : (6 groupes TP)
B6- Echanger et communiquer à distance B7- Mener des projets en travail collaboratif à distance B4- Réaliser des documents destinés à être imprimés (partie tableur II) avec contrôle continu.
Séance 4 : (3 groupes TP)
B2- Rechercher de l’information
B4- Réaliser des documents destinés à être imprimés (traitement de texte) Séance 5 : (3 groupes TP)
B5- Réaliser la présentation de ses travaux en présentiel et en ligne (logiciel de présentation)
Présentation du référentiel ABCdoc (guide méthodologique de recherche et de traitement de l’information scientifique et technique) sur : http://sup.ups-tlse.fr/abcdoc/rechercher-traiter-information/index2.html
ENSEIGNEMENT DE COMMUNICATION : 4H30 1- COMMUNICATION ORALE (3H)
Présentation orale sous forme de fichier power point des recherches effectuées en documentation
2 - COMMUNICATION ECRITE ET SUPPORT (1H30) CV Lettre de motivation
