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30.01.2004 Génétique-Biostatistique 1 sélection des lapins sur la taille de la portée. Utilisation d'une population contrôle cryopréservée et des tendances génétiques. Bartholomew C., Beausoleil R., Bergès N., 2004.

Bartholomew C., Beausoleil R., Bergès N., 2004

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Estimation de la réponse corrélée des caractères de croissance lors de sélection des lapins sur la taille de la portée. Utilisation d'une population contrôle cryopréservée et des tendances génétiques. Bartholomew C., Beausoleil R., Bergès N., 2004. Introduction. - PowerPoint PPT Presentation

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Estimation de la réponse corrélée des caractères de

croissance lors de sélection des lapins sur la taille de la

portée. Utilisation d'une population

contrôle cryopréservée et des tendances génétiques.Bartholomew C., Beausoleil R., Bergès N., 2004.

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Introduction Sélection génétique prolificité

productivité (lapins, porcs)

Succès de la sélection à long terme sur la taille des portées.

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But de l’étude: montrer si il y a eu des réponses corrélées sur différents caractères de croissance quand l’objet de la sélection était la taille de la portée.(Cf. synthèse de l’article)

Résultats de la littérature variés. Réponse définitive?

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Synthèse de l’article

Principales méthodes statistiques = modèles mixtes pour l’analyse des données: Amélioration de la production

du bétail Prédiction des valeurs de

reproduction Estimation des paramètres et des

tendances génétiques.

IntroductionIntroduction:

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Importance des caractères de croissance pour la production de viande de lapin: Poids au sevrage et à la fin de la

période d’engraissement GQM en post-sevrage Prise de nourriture Index de conversion (aliments

poids vif)

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Deux approches expérimentales possibles: Comparer la dernière génération

avec une génération préalablement cryoconservée,

Appliquer les modèles mixtes pour calculer les tendances génétiques.

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La lignée V : lignée maternelle sélectionnée durant 21 générations en fonction du nombre de jeunes par portée, selon la procédure BLUP utilisant un modèle animal répétable.

Les jeunes: sevrés à 28 jours; engraissement 5 semaines (nourriture commerciale ad libitum: 16% PB, 15.5% FB, 3.4% EE).

Les animaux:Les animaux:

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Le groupe contrôle (GC): descendance de 73 femelles et 31 mâles provenant de la génération 15 (cryoconservée).

Le groupe sélectionné (GS): jeunes de la génération 21 (actuelle) et contemporains du GC.

Total: 1854 lapins (cages de 7 à 9 lapins).

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Poids individuel au sevrage (28 j): WW (g)

Poids individuel en fin d’engraissement (63j): WS (g)

Données récoltées:Données récoltées:

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GQM individuel durant l’engraissement: DG (g/j)

Consommation journalière entre sevrage et abattage: FC (g)

Index de conversion alimentation poids vif pendant l’engraissement: IC(g/g)

(Les 2 derniers points ont été récoltés sous forme de moyenne pour chaque cage.)

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Le modèle prends en compte: La proportion d’animaux en cage

pour chaque effet fixe et aléatoire La moyenne des covariables

Les données ont été analysées suivant un modèle mixte où tous les caractères ont les mêmes effets fixes et aléatoires, et selon la covariable de la taille totale de la portée à la naissance.

Traitement des données:Traitement des données:

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Méthode de calcul: algorithme REML

Modèle animal bivariable: Caractères de croissance Taille de la portée au sevrage

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Le modèle mixte utilisé pour les caractères de croissance est:

yijklmn = µ+b*LS+Ysi+POj+ak+pl+cm+eijklmn

Le modèle mixte utilisé pour la taille de la portée au sevrage est:

yijkl = µ+YSRi+RSj+ak+pk+eijkl

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La lignée V ayant été sélectionnée selon la taille de la portée, cette covariable a été incluse dans le modèle . Cela permet de distinguer: les différences entre groupes dues aux

différences de taille de portée les différences dues à d’autres causes.

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WW WS DG h² 0.224 0.302 0.198

WW: poids au sevrage; WS: poids à l’abattage; DG:gain journalier moyen

Héritabilité de WW, WS, DG.

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Primiparité: effet négatif sur les caractères de croissance (autres auteurs: idem)

Covariable taille de portée à la naissance: effet négatif significatif, sauf pour l’IC.

Après comparaison avec le groupe contrôle: modifications des caractères de croissance strictement dues à la modification de la taille de la portée.

Résultats:Résultats:

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L’effet taille de la portée diminue avec le temps valeurs plus élevées au sevrage qu’à l’abattage.

Corrélation non-additive permanente: significative (négative) pour le poids au sevrage ; 0 pour le poids à l’abattage.

En terme de tendances génétiques: réponses corrélées significatives pour le poids au sevrage et le GQM;

pour le poids à l’abattage: non significative.

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Poids à l’abattage = poids au sevrage + [GQM * 35j (post-sevrage)] ; or

Tendance génétique (TG) TG (poids au

sevrage) + 35 * TG (gain post-sevrage)

contradiction ? Prévisible car:

–Chiffres très petits– estimations actuelles des

corrélations génétiques très petites

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Résultats de l’article: Pas de réponse corrélée des caractères de croissance par rapport à une population contrôle

Rochambeau et al. (1994): sélection pour la taille de la portée poids individuel au sevrage mais poids total de la portée au sevrage .

Objectifs de sélection des lignées maternelles.

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Discussion: Intérêt limité d’une sélection unique sur la

taille de la portée.

Méthodologie?

Effets de la cryopréservation connus lors de l’expérience?