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COVID-19 Point épidémiologique hebdomadaire du 9 juillet 2020 Santé publique France, dans le cadre de ses missions de surveillance et d’alerte, analyse les données con- cernant COVID-19 issues de son réseau de partenaires. Ce bilan est basé sur les données épidémiologiques de surveillance du COVID-19 (SARS-CoV-2) rapportées à Santé publique France jusqu’au 07 juillet 2020. Situation au 7 juillet 2020 Page 1 Point épidémiologique COVID-19 Santé publique France s’appuie sur un réseau d’acteurs pour assurer la surveillance COVID-19 médecins libéraux, SAMU Centre 15, médecins hospi- taliers, Laboratoires de biologie médicale hospitaliers et de ville Agences régionales de santé (ARS) Les Sociétés savantes d’infectiologie, de réanima- tion, de médecine d’urgence En France et à l’exception de la Mayenne, de la Guyane et de Mayotte Nouvelle tendance à l’augmentation de la circulation du virus SARS-COV-2, mais maintien de la circulation virale à un niveau bas Nombre hebdomadaire de clusters signalés stable sur les 5 dernières semaines En Mayenne Augmentation du nombre de nouveaux cas et des taux de positivité des prélèvements, 1 cluster avec diffusion communautaire Renforcement des mesures dans ce département. Dépistage de la population en cours En Guyane, augmentation de la circulation du SARS-CoV-2 à un niveau élevé et avec diffusion communautaire A Mayotte, diminution de l’épidémie mais maintien de la circulation du SARS-CoV-2 à un niveau élevé 6,7 % de la population de France métropolitaine infectée par le SARS-CoV-2 avant mi-avril 2020 (4 368 000 personnes) (enquête de séroprévalence) Diminution de l’adoption systématique des mesures de prévention (garder une distance d’au moins 1 m, saluer sans serrer la main, arrêter les embrassades), stabilisation des mesures d’hygiène et port du masque. Points clés Chiffres clés en France Indicateurs hebdomadaires, semaine 27 (29 juin - 5 juillet 2 020) S27 S26 Nombre de nouveaux cas confirmés de COVID-19 (SI-DEP) 3797 (3 406)* Taux de positivité (%) pour SARS-COV-2 (SI-DEP) 1,3 (1,4)* Nombre d’actes SOS Médecins pour suspicion de COVID-19 1 523 (1 082)* Nombre de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (réseau OSCOUR®) 1 330 (1 402)* Nombre de nouvelles hospitalisations de patients COVID-19 (SI-VIC) 646 (666)* Nombre de nouvelles admissions en réanimation de patients CO- VID-19 (SI-VIC) 73 (82)* Nombre de décès liés au COVID-19 (incluant les décès en hospitalisation et décès en EHPA et autres EMS) 124 (164)* Indicateurs cumulés du 1 er mars au 7 juillet 2020 Nombre de cas de COVID-19 ayant été hospitalisés (SI-VIC) 105 152 Nombre de décès liés au COVID-19 (incluant les décès en hospitalisation et décès en EHPA et autres EMS) 29 933 * données consolidées

COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

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Page 1: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

COVID-19

Point eacutepideacutemiologique hebdomadaire du 9 juillet 2020

Santeacute publique France dans le cadre de ses missions de surveillance et drsquoalerte analyse les donneacutees con-cernant COVID-19 issues de son reacuteseau de partenaires Ce bilan est baseacute sur les donneacutees eacutepideacutemiologiques de surveillance du COVID-19 (SARS-CoV-2) rapporteacutees agrave Santeacute publique France jusqursquoau 07 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 1 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Santeacute publique France srsquoappuie sur un reacuteseau drsquoacteurs pour assurer la surveillance COVID-19 meacutedecins libeacuteraux SAMU Centre 15 meacutedecins hospi-taliers Laboratoires de biologie meacutedicale hospitaliers et de ville Agences reacutegionales de santeacute (ARS) Les Socieacuteteacutes savantes drsquoinfectiologie de reacuteanima-tion de meacutedecine drsquourgence

En France et agrave lrsquoexception de la Mayenne de la Guyane et de Mayotte

minus Nouvelle tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus SARS-COV-2 mais

maintien de la circulation virale agrave un niveau bas

minus Nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes stable sur les 5 derniegraveres semaines

En Mayenne

minus Augmentation du nombre de nouveaux cas et des taux de positiviteacute des

preacutelegravevements 1 cluster avec diffusion communautaire

minus Renforcement des mesures dans ce deacutepartement Deacutepistage de la population en cours

En Guyane augmentation de la circulation du SARS-CoV-2 agrave un niveau eacuteleveacute et avec diffusion communautaire

A Mayotte diminution de lrsquoeacutepideacutemie mais maintien de la circulation du SARS-CoV-2 agrave un niveau eacuteleveacute

67 de la population de France meacutetropolitaine infecteacutee par le SARS-CoV-2 avant mi-avril 2020 (4 368 000 personnes) (enquecircte de seacuteropreacutevalence)

Diminution de lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention (garder une distance drsquoau moins 1 m saluer sans serrer la main arrecircter les embrassades) stabilisation des mesures drsquohygiegravene et port du masque

Points cleacutes

Chiffres cleacutes en France

Indicateurs hebdomadaires semaine 27 (29 juin - 5 juillet 2 020) S27 S26

Nombre de nouveaux cas confirmeacutes de COVID-19 (SI-DEP) 3797 (3 406)

Taux de positiviteacute () pour SARS-COV-2 (SI-DEP) 13 (14)

Nombre drsquoactes SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 1 523 (1 082)

Nombre de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (reacuteseau OSCOURreg)

1 330 (1 402)

Nombre de nouvelles hospitalisations de patients COVID-19 (SI-VIC)

646 (666)

Nombre de nouvelles admissions en reacuteanimation de patients CO-VID-19 (SI-VIC)

73 (82)

Nombre de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 (incluant les deacutecegraves en hospitalisation et deacutecegraves en EHPA et autres EMS)

124 (164)

Indicateurs cumuleacutes du 1er mars au 7 juillet 2020

Nombre de cas de COVID-19 ayant eacuteteacute hospitaliseacutes (SI-VIC) 105 152

Nombre de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 (incluant les deacutecegraves en hospitalisation et deacutecegraves en EHPA et autres EMS)

29 933

donneacutees consolideacutees

Situation au 7 juillet 2020 Page 2 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Sommaire Page

Chiffres cleacutes en France 1

Surveillance en meacutedecine ambulatoire 3

Surveillance agrave partir des associations SOS Meacutedecins 4

Surveillance agrave partir des laboratoires de virologie 5-6

Surveillance en population COVIDnet 7

Cas confirmeacutes de COVID-19 8

Signalement des clusters agrave viseacutee drsquoalerte 9-11

Surveillance dans les eacutetablissements sociaux et meacutedicaux sociaux 12-13

Surveillance aux urgences 14

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo 15

Surveillance en milieu hospitalier 16-18

Seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine 19-20

Surveillance de la mortaliteacute 21-24

Situation internationale 25

Preacutevention 26-27

Discussion 28-31

Meacutethodes 32

Scheacutema de la surveillance du COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Situation au 7 juillet 2020 Page 3 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Reacuteseau Sentinelles

La surveillance speacutecifique du COVID-19 du Reacuteseau Sentinelles (Inserm Sorbonne Universiteacute) a eacuteteacute mise en place le 16 mars 2020 Apregraves le deacuteconfinement la surveillance virologique en vigueur des IRA (infection respiratoire aigueuml) effectueacutee par les meacutedecins du reacuteseau a eacuteteacute suspendue durant les semaines 20 et 21 et relayeacutee par une surveillance baseacutee sur les recommandations de la DGS1 qui preacuteconise la reacutealisation drsquoun test pour tout patient suspect de COVID-19 Les preacutelegravevements et analyses sont donc reacutealiseacutes par les laboratoires de ville depuis la semaine 22

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le taux de consultations (ou teacuteleacuteconsultations) pour une IRA estimeacute

eacutetait de 17100 000 habitants [intervalle de confiance agrave 95 12-22] en France meacutetropolitaine Il suivait une tendance agrave la hausse non significative par rapport agrave celui de la semaine 26 (du 22 au 28 juin 2020) 11100 000 habitants [IC agrave 95 8-14]

En semaine 27 sur les 145 cas suspects de COVID-19 identifieacutes un preacutelegravevement a eacuteteacute prescrit pour 97 drsquoentre eux Les reacutesultats des analyses eacutetaient connus pour 63 patients et aucun patient nrsquoavait eacuteteacute testeacute positifs Depuis le 25 mai 2020 un preacutelegravevement a eacuteteacute prescrit pour 93 des 1038 cas suspects de COVID-19 identifieacutes Les reacutesultats des analyses eacutetaient connus pour 744 patients et eacutetaient positifs pour 20 (27) patients Ces donneacutees seront consolideacutees au cours des prochaines semaines

Surveillance en meacutedecine ambulatoire

[1] DGS-Urgent Prise en charge par les meacutedecins de ville des patients de COVID-19 en phase de deacuteconfinement

Situation au 7 juillet 2020 Page 4 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Associations SOS Meacutedecins

Depuis le 3 mars 2020 60 613 actes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID 19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 523 actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes par les associations SOS Meacutedecins ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Ce nombre drsquoactes eacutetait en hausse pour la seconde semaine conseacutecutive soit +41 par rapport agrave S26 (1 082 actes) tous acircges confondus

Cette augmentation est plus marqueacutee chez les enfants de moins de 15 ans (397 actes en S27 vs 235 en S26 soit +69) Cette tendance agrave la hausse peut srsquoexpliquer par la reprise de lrsquoeacutecole qui a eu lieu avant les vacances scolaires drsquoeacuteteacute et pour laquelle le retour agrave la collectiviteacute a favoriseacute les tableaux respiratoires (notamment les pathologies ORL) qui eacutetaient agrave la hausse chez les enfants (+106 en S27 par rapport agrave la S26) Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave appliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter le nombre de demandes de tests pour COVID-19 et par conseacutequent le nombre drsquoactes codeacutes comme suspicion de COVID-19

La part des actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 dans lrsquoactiviteacute totale tous acircges confondus eacutetait en leacutegegravere hausse 27 en S27 vs 21 en S26 (Figure 1)

En reacutegion les hausses observeacutees (tous acircges confondus) srsquoeacutetendent de +118 agrave +16 sur 10 reacutegions (Centre Val-de-Loire Nouvelle-Aquitaine Hauts-de-France Bretagne Auvergne Rhocircne-Alpes Occitanie Ile-de-France Provence-Alpes-Cocircte dAzur Pays de La Loire et Grand-Est) Parmi ces reacutegions ce sont lrsquoIle-de-France (22) et lrsquoAuvergne-Rhocircne-Alpes (15) qui comptent le plus drsquoactes pour suspicion de COVID-19 parmi ceux enregistreacutes au niveau national

Figure 1 Nombre drsquoactes SOS Meacutedecins et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 et depuis le 1

er juin 2020 France (source SOS Meacutedecins)

Figure 2 Taux drsquoactes meacutedicaux hebdomadaires pour 10 000 actes pour suspicion de COVID-19 semaine 27 (source SOS Meacutedecins)

Pour en savoir plus sur les donneacutees SOS Meacutedecins consulter GEODES

Situation au 7 juillet 2020 Page 5 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance virologique

Les objectifs de la surveillance virologique baseacutee sur les laboratoires sont de suivre lrsquoeacutevolution des taux de positiviteacute des tests dans le temps par reacutegion ou par deacutepartement ainsi que le nombre de patients positifs pour le SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population (taux drsquoincidence) Les donneacutees sont consolideacutees dans le temps Ces indicateurs associeacutes aux autres permettent de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie Jusqursquoagrave la semaine 19 la surveillance virologique srsquoest appuyeacutee sur les donneacutees non exhaustives transmises agrave Santeacute publique France par le reacuteseau 3 Labo (Cerba Eurofins-Biomnis Inovie) et par les laboratoires hospitaliers Depuis la se-maine 20 elle srsquoappuie sur le systegraveme SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) opeacuterationnel depuis le 13 mai 2020 et dont la monteacutee en charge a eacuteteacute progressive Ce nouveau systegraveme de surveillance vise au suivi exhaustif de lrsquoensemble des patients testeacutes en France dans les laboratoires de ville et dans les laboratoires hospitaliers Actuellement les donneacutees trans-mises concernent les tests RT-PCR reacutealiseacutes

Au 07 juillet la quasi-totaliteacute des laboratoires (5 485 sites de preacutelegravevements) a transmis des donneacutees

Du 28 juin au 4 juillet 2020 300 817 patients ont eacuteteacute testeacutes pour le SARS-CoV-2 et le test eacutetait positif pour 3 797 patients Le taux de positiviteacute national hebdomadaire eacutetait de 13 (calculeacute sur les tests valides) Le taux national est en diminution par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (14) Ce taux de positiviteacute en France meacutetropolitaine eacutetait en leacutegegravere diminution par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (08 vs 09) (Figure 3)

Pour en savoir plus sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

En France meacutetropolitaine le taux de positiviteacute eacutetait infeacuterieur agrave 5 dans lrsquoensemble des deacutepartements sauf en Mayenne ougrave ce taux eacutetait de 85 Des clusters sont en cours drsquoinvestigation dans ce deacutepartement dont un preacutesentant une diffusion communautaire des deacutepistages sont en cours pour la semaine S28 (Figure 4)

Du 28 juin au 4 juillet 2020 le taux drsquoincidence (nombre de nouveaux cas rapporteacutes agrave la population pour 100 000 habitants) eacutetait de 56100 000 habitants au niveau national (52100 000 h en semaine 26) et de 35100 000 h en meacutetropole (32100 000 h en semaine 26) Il eacutetait infeacuterieur agrave 10100 000 h dans tous les

deacutepartements de France meacutetropolitaine sauf pour la Mayenne (45100 000 h) (Figure 5)

En outre-mer

minus A Mayotte en semaine 27 le taux de positiviteacute eacutetait de 114 (vs183 en S26) et le taux drsquoincidence de

34100 000 habitants (vs 46100 000 h en S26) valeurs agrave la baisse

minus En Guyane en semaine 27 le taux de positiviteacute eacutetait de 265 (vs 255 en S26) et le taux drsquoincidence de 458100 000 habitants (vs 436100 000 h en S26) valeurs agrave la hausse

Figure 3 Nombre de tests reacutealiseacutes nombre de tests positifs pour le SARS-CoV-2 et taux de positiviteacute

dans les laboratoires par semaine France 2020 (source S9-S19 3 Labo et laboratoires hospitaliers

depuis S20 SI-DEP)

Situation au 7 juillet 2020 Page 6 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du 28 juin au 4 juillet 2020 le taux de deacutepistage (nombre de patients testeacutes pour SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) eacutetait de 448 pour 100 000 habitants au niveau national (Figure 6) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage du 21 au 27 juin 2020 eacutetaient la Meurthe-et-Moselle (892100 000 h) le Calvados (720100 000 h) la Seine-Maritime (702100 000 h) et les Bouches-du-Rhocircne (698100 000 h) (Figure 6bis) Le nombre de patients testeacutes en France meacutetropolitaine est en augmentation (+26 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente)

En outre-mer le plus fort taux de deacutepistage a eacuteteacute observeacute en Guyane (1 729100 000 habitants) A Mayotte le taux de deacutepistage eacutetait de 297100 000 h Le nombre de patients testeacutes en outre-mer est en augmentation (+13 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente)

Au niveau national le nombre de patients testeacutes est en augmentation sur les derniegraveres semaines (179 897 en S25 244 231 en S26 et 304 049 en S27)

Figure 4 Taux de positiviteacute des personnes

testeacutees pour le SARS-CoV-2 par deacutepartement

France 28 juin au 4 juillet 2020 (source SI-DEP)

Figure 5 Taux drsquoincidence de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 pour 100 000 habitants par deacutepartement France 28 juin au 4 juillet 2020 (source SI-DEP)

Figure 6bis Taux de deacutepistage ( 100 000 habi-

tants) pour le SARS-CoV-2 par deacutepartement

France du 28 juin au 4 juillet (source SI-DEP)

Figure 6 Evolution du taux de deacutepistage ( 100 000 habi-

tants) pour le SARS-CoV-2 par semaine depuis le 13 mai

2020 France (source SI-DEP)

Situation au 7 juillet 2020 Page 7 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance en population COVIDnetfr

GrippeNetfr est un reacuteseau de surveillance mis en place en janvier 2012 par le reacuteseau Sentinelles (Inserm ndash Sorbonne Universiteacute) et Santeacute publique France avec pour objectif de recueillir directement aupregraves de la population des donneacutees eacutepideacutemiologiques sur les syndromes grippaux par internet et de faccedilon anonyme Il permet drsquoeacutetudier les symptocircmes preacutesenteacutes par les personnes malades qui nrsquoont pas recours au systegraveme de soins Depuis le 30 mars 2020 le projet GrippeNetfr sest adapteacute agrave la surveillance du COVID-19 et est devenu COVIDnetfr Pregraves de 6 000 personnes remplissent actuellement chaque semaine un questionnaire rapportant les symptocircmes qursquoelles ont eacuteventuellement eus depuis leur derniegravere connexion 12 133 personnes ont rempli au moins un questionnaire depuis le deacutebut de la saison hivernale 2019-2020

Pour la semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 5 011 questionnaires hebdomadaires ont eacuteteacute remplis

En semaine 27 la proportion de participants ayant deacuteclareacute des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 (deacutefinition sappuyant sur les recommandations du Haut Conseil de la santeacute publique concernant la prescription dun test diagnostique par un meacutedecin) eacutetait de 10 [06 14] stable par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (Figure 7)

La surveillance GrippeNetfrCOVIDnetfr srsquoachegravevera dimanche 12 juillet et reprendra en fin deacuteteacute ou deacutebut dautomne en fonction de lrsquoeacutevolution de leacutepideacutemie de COVID-19 Les donneacutees de la derniegravere semaine de surveillance de la saison seront publieacutees la semaine prochaine

Figure 7 Proportion ( redresseacute) de participants ayant deacuteclareacute des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 par semaine (donneacutees du 24 feacutevrier au 5 juillet 2020 source COVIDnetfr)

Note Deux nouveaux symptocircmes anosmie et agueusie ont eacuteteacute ajouteacutes au questionnaire hebdomadaire en semaine 14 afin dameacuteliorer le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Les donneacutees de la cohorte COVIDnetfr montrent que seules 46 en moyenne des personnes ayant deacuteclareacute des symptocircmes drsquoinfection respiratoire aigueuml ont consulteacute un meacutedecin Ce pourcentage a peu varieacute au cours de la peacuteriode eacutepideacutemique et depuis la leveacutee du confinement De plus il apparait que seules 17 en moyenne des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et que seules 12 (soit 71 des personnes avec prescription drsquoun test) ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Parmi les personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 et ayant consulteacute un meacutedecin geacuteneacute-raliste seuls 39 auraient reccedilu une prescription pour un test diagnostique Ces reacutesultats sont agrave interpreacuteter avec preacutecaution car les donneacutees ne sont pas redresseacutees par rapport agrave la population franccedilaise et sont soumises agrave des fluctuations importantes drsquoune semaine agrave lrsquoautre en raison de faibles effectifs

Ils suggegraverent cependant que le recours aux soins pour suspicion de COVID-19 ainsi que la reacutealisation

des tests RT-PCR agrave viseacutee de diagnostic sont aujourdrsquohui tregraves insuffisants chez les personnes

symptomatiques

Situation au 7 juillet 2020 Page 8 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Cas confirmeacutes de COVID-19

Les donneacutees permettant drsquoestimer le nombre de cas confirmeacutes en France sont issues de plusieurs sources

Entre le 21 janvier et le 25 mars 2020 25 233 cas de COVID-19 ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France via lrsquoapplication GoData ou par transmission des cellules reacutegionales de Santeacute publique France

Entre le 26 mars et le 12 mai 2020 115 010 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes (cas incidents hospitaliers et cas positifs en laboratoire) par les remonteacutees des donneacutees de laboratoires de biologie meacutedicale (source 3 Labo) et des patients hospitaliseacutes pour COVID-19 (source SI-VIC)

Depuis le 13 mai 2020 les cas de COVID-19 sont rapporteacutes par le Systegraveme drsquoInformation de Deacutepistage (SI-DEP) permettant une estimation agrave viseacutee exhaustive des nombres de cas confirmeacutes en France Entre le 13 mai et le 7 juillet 2020 28 567 cas ont eacuteteacute rapporteacutes dans SI-DEP

Il est ainsi estimeacute un total de 168 810 cas confirmeacutes de COVID-19 en France au 07 juillet 2020

De la semaine 15 agrave la semaine 24 le nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes a eacuteteacute en diminution passant de 30 111 cas confirmeacutes en S14 agrave 2 949 cas en S24 Neacuteanmoins depuis la semaine 24 le nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes est agrave nouveau en augmentation passant de 2 949 cas confirmeacutes en S24 agrave 3 684 cas en S27 (Figure 8) On peut notamment expliquer cette augmentation par la situation eacutepideacute-miologique en Guyane Le nombre de cas confirmeacutes en France meacutetropolitaine est eacutegalement en augmenta-tion entre le S26 et la S27 (+290 cas +14) et est en partie lieacutee agrave une augmentation des cas en Mayenne

Au cours de la vague eacutepideacutemique et jusqursquoagrave la leveacutee des mesures de confinement de la population tous les patients preacutesentant des signes de COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer une infection (recommandations ministeacuterielles du 13 mars 2020) Le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France eacutetait donc supeacuterieur au nombre estimeacute de cas confirmeacutes pendant cette peacuteriode Depuis le deacuteconfinement il est demandeacute que les patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 ainsi que les sujets contacts drsquoun cas confirmeacute soient deacutepisteacutes pour le SARS-CoV-2 [1] A compter de cette date et gracircce au systegraveme SI-DEP le nombre de cas confirmeacutes permet deacutesormais theacuteoriquement drsquoestimer le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France Ce nombre peut cependant ecirctre sous-estimeacute du fait de lrsquoabsence de deacutepistage systeacutematique de personnes infecteacutees symptomatiques ou asymptomatiques [1] DGS-Urgent Prise en charge par les meacutedecins de ville des patients de COVID-19 en phase de

deacuteconfinement Disponible via ce lien cliquez ici

Figure 8 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine rapporteacutes agrave Santeacute publique France du 23 janvier au 4 juillet 2020 (donneacutees arrecircteacutees le 7 juillet 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 9 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Signalement agrave viseacutee drsquoalerte des clusters (ou foyers de transmission)

Preacuteambule Depuis la leveacutee du confinement les ARS en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France et les

partenaires locaux investiguent les clusters deacutetecteacutes selon le guide en vigueur [1] Le traccedilage et le deacutepistage des

personnes contacts permettent de controcircler ces foyers Un cluster est deacutefini par la survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes

ou probables dans une peacuteriode de 7 jours et qui appartiennent agrave une mecircme communauteacute ou ont participeacute agrave un mecircme

rassemblement de personnes qursquoils se connaissent ou non Le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute

publique France permet de preacutesenter ce bilan

Cluster hors Ehpad et milieu familial restreint

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 333 clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) rapporteacutes depuis le

9 mai 313 clusters en France meacutetropolitaine et 20 dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (Figures 9 et 10) Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est stable sur les 5 derniegraveres semaines (S23

- S27) et reste infeacuterieur aux nombres observeacutes sur les semaines S20 agrave S22 Au 8 juillet 68 clusters eacutetaient

toujours en cours drsquoinvestigation

Moins drsquoun quart des clusters signaleacutes depuis le 9 mai sont encore en cours drsquoinvestigation (204

n=68) 126 sont maitriseacutes (suivi des contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le

dernier cas) 622 sont clocirctureacutes (absence de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du

dernier cas ET la fin de la quatorzaine des contacts) Des clusters (48) ont diffuseacute dans la communauteacute

Les 15 clusters en Guyane sont consideacutereacutes agrave diffusion communautaire En France meacutetropolitaine 2

clusters sont en diffusion communautaire 1 en Normandie et 1 en Pays de Loire En termes de criticiteacute (potentiel de transmission ou critegraveres de graviteacute) 79 des clusters sont de criticiteacute

modeacutereacutee (44) agrave eacuteleveacutee (35) Parmi ceux qui restent en cours drsquoinvestigation 31 ont une criticiteacute eacuteleveacutee

Les clusters concernent notamment des eacutetablissements de santeacute (22) des entreprises (18 en entreprises

priveacutees et publiques hors santeacute) et des personnes en situation de preacutecariteacute et de vulneacuterabiliteacute (14 en

eacutetablissements drsquoheacutebergement social et drsquoinsertion et 5 en communauteacutes vulneacuterables) (Tableau 1)

La majoriteacute (70) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 153 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 333 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 5 111 cas

Figure 9 Distribution du nombre de clusters selon leur statut (hors Ehpad et milieu familial restreint) et

du nombre de cas (tous clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020

(N=333) au 8 juillet 2020 (Source MONIC)

[1] Pour en savoir plus Guide pour lidentification et linvestigation de situations de cas groupeacutes de COVID-19

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 10 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 1 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) par type de collectiviteacute

inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=333) (Source MONIC)

Figure 10 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) en cours drsquoinvestigation

par deacutepartement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet juin 2020 (N=68) (Source MONIC)

ES eacutetablissement de santeacute EMS eacutetablissement meacutedico-social

Pour en savoir plus sur les donneacutees reacutegionales consulter Santeacute publique France

Type de collectiviteacutes

Ensemble des

clusters

Clusters en

cours dinvesti-

gation

N=333 N=68

Etablissements de santeacute 74 222 3 44

Entreprises priveacutees et publiques (hors ES) 60 180 17 250

Etablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion 48 144 10 147

Milieu familial eacutelargi (concerne plusieurs foyers familiaux) 43 129 14 206

Milieu scolaire et universitaire 17 51 6 88

EMS de personnes handicapeacutees 16 48 1 15

Communauteacutes vulneacuterables (gens du voyage migrants en situation preacutecaire etc) 16 48 3 44

Uniteacute geacuteographique de petite taille (suggeacuterant exposition commune) 11 33 2 29

Evegravenement public ou priveacute rassemblements temporaires de personnes 9 27 5 74

Etablissement peacutenitentiaires 5 15 0 00

Cregraveches 4 12 0 00

Transport (avion bateau train) 4 12 2 29

Structure de laide sociale agrave lenfance 2 06 0 00

Structures de soins reacutesidentiels des personnes sans domicile fixe 0 00 0 00

Autre 24 72 5 74

Situation au 7 juillet 2020 Page 11 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Clusters en Ehpad

Parallegravelement aux dispositifs de surveillance mis en place dans les ESMS (cf page 12) les eacutepisodes

reacutepondant agrave la deacutefinition de cas drsquoun cluster (survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes ou probables dans une

peacuteriode de 7 jours) sont inteacutegreacutes dans le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute publique

France

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 104 clusters inclus depuis le 9 mai (Figure 11) Le nombre

hebdomadaire de clusters signaleacutes en Ehpad est en nette diminution depuis la semaine 23

Au 8 juillet 87 (n=9) clusters sont encore en cours drsquoinvestigation 163 sont maitriseacutes (suivi des

contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le dernier cas) et 750 sont clocirctureacutes (absence

de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du dernier cas ET la fin de la quatorzaine des

contacts)

La majoriteacute (67) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 13 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 104 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 1 298 cas

De par la nature de cette collectiviteacute lrsquointeacutegraliteacute des clusters en Ehpad est de criticiteacute eacuteleveacutee

Figure 11 Distribution du nombre de clusters en Ehpad selon leur statut et du nombre de cas (tous

clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=104) au 8 juillet 2020

(Source MONIC)

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 12 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS)

Entre le 1er mars et le 06 juillet 2020 8 032 signalements rapportaient un ou plusieurs cas de COVID-19 deacuteclareacutes dans le portail national des signalements de Santeacute publique France et le portail de lrsquoARS Ile-de-France

Il srsquoagissait de 5 051 (63 ) signalements provenant drsquoeacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD EHPA et autres eacutetablissements) et 2 981 (37 ) drsquoautres eacutetablissements meacutedico-sociaux (ESMS)

Parmi les 8 032 signalements (Tableau 2)

minus 39 256 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents

minus 10 476 cas sont deacuteceacutedeacutes dans lrsquoeacutetablissement drsquoaccueil dont 10 390 (99 ) dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

minus 3 916 cas sont deacuteceacutedeacutes agrave lrsquohocircpital

minus 20 391 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes parmi les membres du personnel des ESMS

Depuis le 1er mars et jusqursquoau 06 juillet 2020 parmi les 5 051 signalements en eacutetablissements drsquoheacutebergements pour personnes acircgeacutees (EHPA) 3 379 eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Au cours des deux semaines S26 et S27 (du 22 juin au 5 juillet) parmi lrsquoensemble des EHPA en France (Ile-de-France exclue) 38 eacutetablissements (04) ont deacuteclareacute au moins un nouveau cas confirmeacute de COVID-19 parmi les reacutesidents ou le personnel Sur la mecircme peacuteriode parmi les EHPA en France (Ile-de-France exclue) 22 (02) eacutetablissements ont signaleacute un nouvel eacutepisode (date de deacutebut des signes du premier cas ou agrave deacutefaut date de signalement comprise entre le 22 juin et le 5 juillet) avec au moins un cas confirmeacute

Tableau 2 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoeacutetablissement chez les reacutesidents et le personnel dans les ESMS rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 France

Depuis le 29 juin les nombres de signalements et de deacutecegraves chez les reacutesidents ont diminueacute et ceci est ducirc agrave linfirmation deacutepisodes apregraves

investigation (8 271 signalements et 10 497 deacutecegraves en eacutetablissement avaient eacuteteacute rapporteacutes dans le bulletin de la semaine preacuteceacutedente)

1Etablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres eacutetablissements-EHPA reacutesidences autonomie reacutesidences seniors)

2Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (FAM IME autres eacutetablissements pour enfants (ITEP EAAP IEM Instituts pour deacuteficient auditifs et

visuels) autre eacutetablissements pour adultes (foyer de vie foyer drsquoheacutebergement) 3Aide sociale agrave lrsquoenfance (centres deacutepartementaux de lrsquoenfance

foyers de lrsquoenfance MECS) 4Autres eacutetablissements (LAM LHSS SCAPA avec heacutebergement) 5Un signalement COVID-19 est deacutefini par la

survenue drsquoau moins un cas COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas confirmeacute COVID-19 toute personne symptomatique ou non avec un

preacutelegravevement confirmant lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 parmi les personnes reacutesidentes ou les membres du personnel drsquoun ESMSEHPA 7Cas pos-

sibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Du fait du deacutelai court entre le signalement par les eacutetablissements et la production du point eacutepideacutemiologique les donneacutees les plus reacutecentes ne sont pas consolideacutees Les processus drsquoassurance qualiteacute mis en place au niveau reacutegional peuvent conduire agrave des corrections ulteacuterieures de donneacutees A noter que depuis le 01 juillet 2020 les ESMS drsquoIle-de-France ont commenceacute agrave deacuteclarer leurs eacutepisodes via lrsquoapplication de Santeacute publique France Les donneacutees drsquoIle-de-France sont agrave interpreacuteter avec prudence en attendant que le transfert de donneacutees soit stabiliseacute De plus apregraves investigation 333 eacutepisodes ont eacuteteacute infirmeacutes ce qui influence le nombre de signalements mais peu le nombre de deacutecegraves et pas le nombre de cas confirmeacutes

EHPA1 HPH2

Aide en-

fance3 Autres4 Total

Signalements5 5 051 2 290 367 324 8 032

Chez les

reacutesidents

Cas confirmeacutes6 34 688 3 946 164 458 39 256

Deacutecegraves hocircpitaux7 3 691 204 0 21 3 916

Deacutecegraves eacutetablissements7 10 390 75 0 11 10 476

Chez le

personnel Cas confirmeacutes6 16 522 3 404 279 186 20 391

Situation au 7 juillet 2020 Page 13 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 12 Nombre de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 (n=6 484) par date de deacutebut des signes du premier cas du 1er mars au 6 juillet 2020 France (hors Ile-de-France)

Figure 13 Nombre moyen (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 en France hors

Ile-de-France

Apregraves la deacutecroissance observeacutee depuis deacutebut avril le nombre de signalements reste tregraves faible depuis deacutebut mai il est infeacuterieur agrave 10 signalements par jour depuis au moins 30 jours en France hors

Ile-de-France (Figure 12)

Le nombre de deacutecegraves chez les reacutesidents en eacutetablissement et agrave lrsquohocircpital a atteint un pic deacutebut avril et deacutecroicirct continuellement depuis ce nombre varie entre 0 et 13 deacutecegraves par jour depuis le 1er Juin et eacutetait toujours infeacuterieur agrave 5 deacutecegraves par jour cette derniegravere semaine en France hors Ile-de-France (Figure 13)

Situation au 7 juillet 2020 Page 14 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (Reacuteseau OSCOUR

reg)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 330 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont

eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode repreacutesentant 05 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence du reacuteseau OSCOURreg

Ces passages eacutetaient en leacutegegravere baisse de 5 par rapport agrave la semaine 26 avec une part drsquoactiviteacute stable (1 402 passages et 05 de lrsquoactiviteacute totale en S26 ndash donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020) (Figure 14)

En semaine 27 sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 enregistreacutes au niveau national 21 ont eacuteteacute enregistreacutes en Icircle-de-France 16 en Guyane 8 en Auvergne Rhocircne-Alpes et 8 en Bretagne

En semaine 27 les passages aux urgences eacutetaient en baisse ou se maintenaient agrave un niveau bas pour la 14egraveme semaine conseacutecutive au niveau national et reacutegional (Figure 15) Chez les enfants on observait une seconde semaine conseacutecutive de hausse dans de faibles effectifs (+26 passages soit +31)

La proportion drsquohospitalisations apregraves passage pour suspicion de COVID-19 indicateur de graviteacute agrave lrsquoarriveacutee aux urgences eacutetait en leacutegegravere baisse agrave 35 en semaine S27 (versus 36 en S26 - donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020)

Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 171 631 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

Figure 14 Nombre de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier et depuis le 1er juin 2020 France (source OSCOURreg)

Figure 15 Taux hebdomadaires de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences semaine 27 France (source OSCOURreg)

Situation au 7 juillet 2020 Page 15 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission A partir de cette semaine les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests PCR positifs) en remplacement de lrsquoindicateur R calculeacute agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) Lrsquoavantage de cet indicateur est de repo-ser sur les donneacutees des cas confirmeacutes de COVID-19 et de srsquoappuyer sur un recours au test qui a vocation agrave intervenir rapidement apregraves la survenue des signes eacutevocateurs de COVID-19 Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Le R effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Le nombre de tests positifs peut ecirctre influenceacute par les actions locales de deacutepistage en particulier en cas drsquoidentification de clusters qui permettent drsquoidentifier des infections asymptomatiques Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais doivent ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Les estimations du nombre de reproduction sont baseacutees sur les nombre de tests PCR positifs au SARS-CoV-2 reacutealiseacutes entre le 21 juin et le 27 juin 2020 remonteacutes par le systegraveme SI-DEP

Le nombre de reproduction au niveau de la France meacutetropolitaine est de 105 (intervalle de confiance (IC95 1003-1090) (Tableau 3) et est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (R effectif=090 IC95 086-094) Cet indicateur est significatif en France meacutetropolitaine

Quatre reacutegions ont un nombre de reproduction R estimeacute supeacuterieur agrave 1 de faccedilon significative en Guyane (R=114 IC95 108-121) en diminution pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Nouvelle-Aquitaine (R=132 IC95 104-164) Pays-de-la-Loire (R= 152 IC95 131-173) et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (R = 124 IC95 105-146)

Les reacutegions Bretagne (107 IC95 072-149) Hauts-de-France (106 IC95 094-118) Ile-de-France

(106 IC95 099-113) Normandie (100 IC95 083-117) et La Reacuteunion (147 IC95 093-214) ont des estimations supeacuterieures agrave 1 mais non significativement supeacuterieures (valeur laquo 1 raquo comprise dans lrsquointervalle de confiance) (Tableau 3)

Tableau 3 Nombre de reproduction effectif (R effectif) agrave partir des tests PCR positifs au SARS-COV-2

par reacutegion France entiegravere sur 7 jours glissants du 28 juin au 4 juillet 2020 (Source SI-DEP)

NC le taux de reproduction nrsquoest pas calculable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am

J Epidemiol 2013 178 pp 1505-1512

Reacutegions R effectif Intervalle de confiance (95)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 098 086-112

Bourgogne-Franche-Comteacute 098 074-124

Bretagne 107 072-149

Centre-Val de Loire 097 075-121

Corse NC NC

Grand Est 078 066-091

Hauts-de-France 106 094-118

Ile-de-France 106 099-113

Normandie 100 083-117

Nouvelle-Aquitaine 132 104-164

Occitanie 097 081-115

Pays de la Loire 152 131-173

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 124 105-146

France meacutetropolitaine 105 1003-1094

Guadeloupe NC

La Reacuteunion NC

Martinique NC

Mayotte 076 061-092

Guyane 114 108-121

Situation au 7 juillet 2020 Page 16 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC)

Depuis le 1er mars 2020 1 508 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 105 152 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 4)

minus Lrsquoacircge meacutedian des patients est de 72 ans et 53 sont des hommes

minus 19 457 patients sont deacuteceacutedeacutes 71 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 59 eacutetaient des hommes

minus 77 655 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 07 juillet 2020 7 594 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 538 cas en reacuteanimation

Tableau 4 Nombre de personnes hospitaliseacutees et en reacuteanimation pour COVID-19 le 07 juillet 2020 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars par classe drsquoacircge et par reacutegion France (source SI-VIC)

Figure 16 Evolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 07 juillet France (source SI-VIC)

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

du 10 juin au 16 juin

Surveillance en milieu hospitalier

du 17 juin au 23 juin du 24 juin au 30 juin du 1er au 7 juillet

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

32

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 2: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 2 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Sommaire Page

Chiffres cleacutes en France 1

Surveillance en meacutedecine ambulatoire 3

Surveillance agrave partir des associations SOS Meacutedecins 4

Surveillance agrave partir des laboratoires de virologie 5-6

Surveillance en population COVIDnet 7

Cas confirmeacutes de COVID-19 8

Signalement des clusters agrave viseacutee drsquoalerte 9-11

Surveillance dans les eacutetablissements sociaux et meacutedicaux sociaux 12-13

Surveillance aux urgences 14

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo 15

Surveillance en milieu hospitalier 16-18

Seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine 19-20

Surveillance de la mortaliteacute 21-24

Situation internationale 25

Preacutevention 26-27

Discussion 28-31

Meacutethodes 32

Scheacutema de la surveillance du COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Situation au 7 juillet 2020 Page 3 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Reacuteseau Sentinelles

La surveillance speacutecifique du COVID-19 du Reacuteseau Sentinelles (Inserm Sorbonne Universiteacute) a eacuteteacute mise en place le 16 mars 2020 Apregraves le deacuteconfinement la surveillance virologique en vigueur des IRA (infection respiratoire aigueuml) effectueacutee par les meacutedecins du reacuteseau a eacuteteacute suspendue durant les semaines 20 et 21 et relayeacutee par une surveillance baseacutee sur les recommandations de la DGS1 qui preacuteconise la reacutealisation drsquoun test pour tout patient suspect de COVID-19 Les preacutelegravevements et analyses sont donc reacutealiseacutes par les laboratoires de ville depuis la semaine 22

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le taux de consultations (ou teacuteleacuteconsultations) pour une IRA estimeacute

eacutetait de 17100 000 habitants [intervalle de confiance agrave 95 12-22] en France meacutetropolitaine Il suivait une tendance agrave la hausse non significative par rapport agrave celui de la semaine 26 (du 22 au 28 juin 2020) 11100 000 habitants [IC agrave 95 8-14]

En semaine 27 sur les 145 cas suspects de COVID-19 identifieacutes un preacutelegravevement a eacuteteacute prescrit pour 97 drsquoentre eux Les reacutesultats des analyses eacutetaient connus pour 63 patients et aucun patient nrsquoavait eacuteteacute testeacute positifs Depuis le 25 mai 2020 un preacutelegravevement a eacuteteacute prescrit pour 93 des 1038 cas suspects de COVID-19 identifieacutes Les reacutesultats des analyses eacutetaient connus pour 744 patients et eacutetaient positifs pour 20 (27) patients Ces donneacutees seront consolideacutees au cours des prochaines semaines

Surveillance en meacutedecine ambulatoire

[1] DGS-Urgent Prise en charge par les meacutedecins de ville des patients de COVID-19 en phase de deacuteconfinement

Situation au 7 juillet 2020 Page 4 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Associations SOS Meacutedecins

Depuis le 3 mars 2020 60 613 actes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID 19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 523 actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes par les associations SOS Meacutedecins ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Ce nombre drsquoactes eacutetait en hausse pour la seconde semaine conseacutecutive soit +41 par rapport agrave S26 (1 082 actes) tous acircges confondus

Cette augmentation est plus marqueacutee chez les enfants de moins de 15 ans (397 actes en S27 vs 235 en S26 soit +69) Cette tendance agrave la hausse peut srsquoexpliquer par la reprise de lrsquoeacutecole qui a eu lieu avant les vacances scolaires drsquoeacuteteacute et pour laquelle le retour agrave la collectiviteacute a favoriseacute les tableaux respiratoires (notamment les pathologies ORL) qui eacutetaient agrave la hausse chez les enfants (+106 en S27 par rapport agrave la S26) Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave appliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter le nombre de demandes de tests pour COVID-19 et par conseacutequent le nombre drsquoactes codeacutes comme suspicion de COVID-19

La part des actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 dans lrsquoactiviteacute totale tous acircges confondus eacutetait en leacutegegravere hausse 27 en S27 vs 21 en S26 (Figure 1)

En reacutegion les hausses observeacutees (tous acircges confondus) srsquoeacutetendent de +118 agrave +16 sur 10 reacutegions (Centre Val-de-Loire Nouvelle-Aquitaine Hauts-de-France Bretagne Auvergne Rhocircne-Alpes Occitanie Ile-de-France Provence-Alpes-Cocircte dAzur Pays de La Loire et Grand-Est) Parmi ces reacutegions ce sont lrsquoIle-de-France (22) et lrsquoAuvergne-Rhocircne-Alpes (15) qui comptent le plus drsquoactes pour suspicion de COVID-19 parmi ceux enregistreacutes au niveau national

Figure 1 Nombre drsquoactes SOS Meacutedecins et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 et depuis le 1

er juin 2020 France (source SOS Meacutedecins)

Figure 2 Taux drsquoactes meacutedicaux hebdomadaires pour 10 000 actes pour suspicion de COVID-19 semaine 27 (source SOS Meacutedecins)

Pour en savoir plus sur les donneacutees SOS Meacutedecins consulter GEODES

Situation au 7 juillet 2020 Page 5 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance virologique

Les objectifs de la surveillance virologique baseacutee sur les laboratoires sont de suivre lrsquoeacutevolution des taux de positiviteacute des tests dans le temps par reacutegion ou par deacutepartement ainsi que le nombre de patients positifs pour le SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population (taux drsquoincidence) Les donneacutees sont consolideacutees dans le temps Ces indicateurs associeacutes aux autres permettent de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie Jusqursquoagrave la semaine 19 la surveillance virologique srsquoest appuyeacutee sur les donneacutees non exhaustives transmises agrave Santeacute publique France par le reacuteseau 3 Labo (Cerba Eurofins-Biomnis Inovie) et par les laboratoires hospitaliers Depuis la se-maine 20 elle srsquoappuie sur le systegraveme SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) opeacuterationnel depuis le 13 mai 2020 et dont la monteacutee en charge a eacuteteacute progressive Ce nouveau systegraveme de surveillance vise au suivi exhaustif de lrsquoensemble des patients testeacutes en France dans les laboratoires de ville et dans les laboratoires hospitaliers Actuellement les donneacutees trans-mises concernent les tests RT-PCR reacutealiseacutes

Au 07 juillet la quasi-totaliteacute des laboratoires (5 485 sites de preacutelegravevements) a transmis des donneacutees

Du 28 juin au 4 juillet 2020 300 817 patients ont eacuteteacute testeacutes pour le SARS-CoV-2 et le test eacutetait positif pour 3 797 patients Le taux de positiviteacute national hebdomadaire eacutetait de 13 (calculeacute sur les tests valides) Le taux national est en diminution par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (14) Ce taux de positiviteacute en France meacutetropolitaine eacutetait en leacutegegravere diminution par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (08 vs 09) (Figure 3)

Pour en savoir plus sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

En France meacutetropolitaine le taux de positiviteacute eacutetait infeacuterieur agrave 5 dans lrsquoensemble des deacutepartements sauf en Mayenne ougrave ce taux eacutetait de 85 Des clusters sont en cours drsquoinvestigation dans ce deacutepartement dont un preacutesentant une diffusion communautaire des deacutepistages sont en cours pour la semaine S28 (Figure 4)

Du 28 juin au 4 juillet 2020 le taux drsquoincidence (nombre de nouveaux cas rapporteacutes agrave la population pour 100 000 habitants) eacutetait de 56100 000 habitants au niveau national (52100 000 h en semaine 26) et de 35100 000 h en meacutetropole (32100 000 h en semaine 26) Il eacutetait infeacuterieur agrave 10100 000 h dans tous les

deacutepartements de France meacutetropolitaine sauf pour la Mayenne (45100 000 h) (Figure 5)

En outre-mer

minus A Mayotte en semaine 27 le taux de positiviteacute eacutetait de 114 (vs183 en S26) et le taux drsquoincidence de

34100 000 habitants (vs 46100 000 h en S26) valeurs agrave la baisse

minus En Guyane en semaine 27 le taux de positiviteacute eacutetait de 265 (vs 255 en S26) et le taux drsquoincidence de 458100 000 habitants (vs 436100 000 h en S26) valeurs agrave la hausse

Figure 3 Nombre de tests reacutealiseacutes nombre de tests positifs pour le SARS-CoV-2 et taux de positiviteacute

dans les laboratoires par semaine France 2020 (source S9-S19 3 Labo et laboratoires hospitaliers

depuis S20 SI-DEP)

Situation au 7 juillet 2020 Page 6 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du 28 juin au 4 juillet 2020 le taux de deacutepistage (nombre de patients testeacutes pour SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) eacutetait de 448 pour 100 000 habitants au niveau national (Figure 6) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage du 21 au 27 juin 2020 eacutetaient la Meurthe-et-Moselle (892100 000 h) le Calvados (720100 000 h) la Seine-Maritime (702100 000 h) et les Bouches-du-Rhocircne (698100 000 h) (Figure 6bis) Le nombre de patients testeacutes en France meacutetropolitaine est en augmentation (+26 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente)

En outre-mer le plus fort taux de deacutepistage a eacuteteacute observeacute en Guyane (1 729100 000 habitants) A Mayotte le taux de deacutepistage eacutetait de 297100 000 h Le nombre de patients testeacutes en outre-mer est en augmentation (+13 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente)

Au niveau national le nombre de patients testeacutes est en augmentation sur les derniegraveres semaines (179 897 en S25 244 231 en S26 et 304 049 en S27)

Figure 4 Taux de positiviteacute des personnes

testeacutees pour le SARS-CoV-2 par deacutepartement

France 28 juin au 4 juillet 2020 (source SI-DEP)

Figure 5 Taux drsquoincidence de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 pour 100 000 habitants par deacutepartement France 28 juin au 4 juillet 2020 (source SI-DEP)

Figure 6bis Taux de deacutepistage ( 100 000 habi-

tants) pour le SARS-CoV-2 par deacutepartement

France du 28 juin au 4 juillet (source SI-DEP)

Figure 6 Evolution du taux de deacutepistage ( 100 000 habi-

tants) pour le SARS-CoV-2 par semaine depuis le 13 mai

2020 France (source SI-DEP)

Situation au 7 juillet 2020 Page 7 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance en population COVIDnetfr

GrippeNetfr est un reacuteseau de surveillance mis en place en janvier 2012 par le reacuteseau Sentinelles (Inserm ndash Sorbonne Universiteacute) et Santeacute publique France avec pour objectif de recueillir directement aupregraves de la population des donneacutees eacutepideacutemiologiques sur les syndromes grippaux par internet et de faccedilon anonyme Il permet drsquoeacutetudier les symptocircmes preacutesenteacutes par les personnes malades qui nrsquoont pas recours au systegraveme de soins Depuis le 30 mars 2020 le projet GrippeNetfr sest adapteacute agrave la surveillance du COVID-19 et est devenu COVIDnetfr Pregraves de 6 000 personnes remplissent actuellement chaque semaine un questionnaire rapportant les symptocircmes qursquoelles ont eacuteventuellement eus depuis leur derniegravere connexion 12 133 personnes ont rempli au moins un questionnaire depuis le deacutebut de la saison hivernale 2019-2020

Pour la semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 5 011 questionnaires hebdomadaires ont eacuteteacute remplis

En semaine 27 la proportion de participants ayant deacuteclareacute des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 (deacutefinition sappuyant sur les recommandations du Haut Conseil de la santeacute publique concernant la prescription dun test diagnostique par un meacutedecin) eacutetait de 10 [06 14] stable par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (Figure 7)

La surveillance GrippeNetfrCOVIDnetfr srsquoachegravevera dimanche 12 juillet et reprendra en fin deacuteteacute ou deacutebut dautomne en fonction de lrsquoeacutevolution de leacutepideacutemie de COVID-19 Les donneacutees de la derniegravere semaine de surveillance de la saison seront publieacutees la semaine prochaine

Figure 7 Proportion ( redresseacute) de participants ayant deacuteclareacute des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 par semaine (donneacutees du 24 feacutevrier au 5 juillet 2020 source COVIDnetfr)

Note Deux nouveaux symptocircmes anosmie et agueusie ont eacuteteacute ajouteacutes au questionnaire hebdomadaire en semaine 14 afin dameacuteliorer le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Les donneacutees de la cohorte COVIDnetfr montrent que seules 46 en moyenne des personnes ayant deacuteclareacute des symptocircmes drsquoinfection respiratoire aigueuml ont consulteacute un meacutedecin Ce pourcentage a peu varieacute au cours de la peacuteriode eacutepideacutemique et depuis la leveacutee du confinement De plus il apparait que seules 17 en moyenne des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et que seules 12 (soit 71 des personnes avec prescription drsquoun test) ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Parmi les personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 et ayant consulteacute un meacutedecin geacuteneacute-raliste seuls 39 auraient reccedilu une prescription pour un test diagnostique Ces reacutesultats sont agrave interpreacuteter avec preacutecaution car les donneacutees ne sont pas redresseacutees par rapport agrave la population franccedilaise et sont soumises agrave des fluctuations importantes drsquoune semaine agrave lrsquoautre en raison de faibles effectifs

Ils suggegraverent cependant que le recours aux soins pour suspicion de COVID-19 ainsi que la reacutealisation

des tests RT-PCR agrave viseacutee de diagnostic sont aujourdrsquohui tregraves insuffisants chez les personnes

symptomatiques

Situation au 7 juillet 2020 Page 8 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Cas confirmeacutes de COVID-19

Les donneacutees permettant drsquoestimer le nombre de cas confirmeacutes en France sont issues de plusieurs sources

Entre le 21 janvier et le 25 mars 2020 25 233 cas de COVID-19 ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France via lrsquoapplication GoData ou par transmission des cellules reacutegionales de Santeacute publique France

Entre le 26 mars et le 12 mai 2020 115 010 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes (cas incidents hospitaliers et cas positifs en laboratoire) par les remonteacutees des donneacutees de laboratoires de biologie meacutedicale (source 3 Labo) et des patients hospitaliseacutes pour COVID-19 (source SI-VIC)

Depuis le 13 mai 2020 les cas de COVID-19 sont rapporteacutes par le Systegraveme drsquoInformation de Deacutepistage (SI-DEP) permettant une estimation agrave viseacutee exhaustive des nombres de cas confirmeacutes en France Entre le 13 mai et le 7 juillet 2020 28 567 cas ont eacuteteacute rapporteacutes dans SI-DEP

Il est ainsi estimeacute un total de 168 810 cas confirmeacutes de COVID-19 en France au 07 juillet 2020

De la semaine 15 agrave la semaine 24 le nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes a eacuteteacute en diminution passant de 30 111 cas confirmeacutes en S14 agrave 2 949 cas en S24 Neacuteanmoins depuis la semaine 24 le nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes est agrave nouveau en augmentation passant de 2 949 cas confirmeacutes en S24 agrave 3 684 cas en S27 (Figure 8) On peut notamment expliquer cette augmentation par la situation eacutepideacute-miologique en Guyane Le nombre de cas confirmeacutes en France meacutetropolitaine est eacutegalement en augmenta-tion entre le S26 et la S27 (+290 cas +14) et est en partie lieacutee agrave une augmentation des cas en Mayenne

Au cours de la vague eacutepideacutemique et jusqursquoagrave la leveacutee des mesures de confinement de la population tous les patients preacutesentant des signes de COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer une infection (recommandations ministeacuterielles du 13 mars 2020) Le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France eacutetait donc supeacuterieur au nombre estimeacute de cas confirmeacutes pendant cette peacuteriode Depuis le deacuteconfinement il est demandeacute que les patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 ainsi que les sujets contacts drsquoun cas confirmeacute soient deacutepisteacutes pour le SARS-CoV-2 [1] A compter de cette date et gracircce au systegraveme SI-DEP le nombre de cas confirmeacutes permet deacutesormais theacuteoriquement drsquoestimer le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France Ce nombre peut cependant ecirctre sous-estimeacute du fait de lrsquoabsence de deacutepistage systeacutematique de personnes infecteacutees symptomatiques ou asymptomatiques [1] DGS-Urgent Prise en charge par les meacutedecins de ville des patients de COVID-19 en phase de

deacuteconfinement Disponible via ce lien cliquez ici

Figure 8 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine rapporteacutes agrave Santeacute publique France du 23 janvier au 4 juillet 2020 (donneacutees arrecircteacutees le 7 juillet 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 9 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Signalement agrave viseacutee drsquoalerte des clusters (ou foyers de transmission)

Preacuteambule Depuis la leveacutee du confinement les ARS en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France et les

partenaires locaux investiguent les clusters deacutetecteacutes selon le guide en vigueur [1] Le traccedilage et le deacutepistage des

personnes contacts permettent de controcircler ces foyers Un cluster est deacutefini par la survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes

ou probables dans une peacuteriode de 7 jours et qui appartiennent agrave une mecircme communauteacute ou ont participeacute agrave un mecircme

rassemblement de personnes qursquoils se connaissent ou non Le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute

publique France permet de preacutesenter ce bilan

Cluster hors Ehpad et milieu familial restreint

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 333 clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) rapporteacutes depuis le

9 mai 313 clusters en France meacutetropolitaine et 20 dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (Figures 9 et 10) Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est stable sur les 5 derniegraveres semaines (S23

- S27) et reste infeacuterieur aux nombres observeacutes sur les semaines S20 agrave S22 Au 8 juillet 68 clusters eacutetaient

toujours en cours drsquoinvestigation

Moins drsquoun quart des clusters signaleacutes depuis le 9 mai sont encore en cours drsquoinvestigation (204

n=68) 126 sont maitriseacutes (suivi des contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le

dernier cas) 622 sont clocirctureacutes (absence de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du

dernier cas ET la fin de la quatorzaine des contacts) Des clusters (48) ont diffuseacute dans la communauteacute

Les 15 clusters en Guyane sont consideacutereacutes agrave diffusion communautaire En France meacutetropolitaine 2

clusters sont en diffusion communautaire 1 en Normandie et 1 en Pays de Loire En termes de criticiteacute (potentiel de transmission ou critegraveres de graviteacute) 79 des clusters sont de criticiteacute

modeacutereacutee (44) agrave eacuteleveacutee (35) Parmi ceux qui restent en cours drsquoinvestigation 31 ont une criticiteacute eacuteleveacutee

Les clusters concernent notamment des eacutetablissements de santeacute (22) des entreprises (18 en entreprises

priveacutees et publiques hors santeacute) et des personnes en situation de preacutecariteacute et de vulneacuterabiliteacute (14 en

eacutetablissements drsquoheacutebergement social et drsquoinsertion et 5 en communauteacutes vulneacuterables) (Tableau 1)

La majoriteacute (70) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 153 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 333 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 5 111 cas

Figure 9 Distribution du nombre de clusters selon leur statut (hors Ehpad et milieu familial restreint) et

du nombre de cas (tous clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020

(N=333) au 8 juillet 2020 (Source MONIC)

[1] Pour en savoir plus Guide pour lidentification et linvestigation de situations de cas groupeacutes de COVID-19

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 10 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 1 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) par type de collectiviteacute

inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=333) (Source MONIC)

Figure 10 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) en cours drsquoinvestigation

par deacutepartement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet juin 2020 (N=68) (Source MONIC)

ES eacutetablissement de santeacute EMS eacutetablissement meacutedico-social

Pour en savoir plus sur les donneacutees reacutegionales consulter Santeacute publique France

Type de collectiviteacutes

Ensemble des

clusters

Clusters en

cours dinvesti-

gation

N=333 N=68

Etablissements de santeacute 74 222 3 44

Entreprises priveacutees et publiques (hors ES) 60 180 17 250

Etablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion 48 144 10 147

Milieu familial eacutelargi (concerne plusieurs foyers familiaux) 43 129 14 206

Milieu scolaire et universitaire 17 51 6 88

EMS de personnes handicapeacutees 16 48 1 15

Communauteacutes vulneacuterables (gens du voyage migrants en situation preacutecaire etc) 16 48 3 44

Uniteacute geacuteographique de petite taille (suggeacuterant exposition commune) 11 33 2 29

Evegravenement public ou priveacute rassemblements temporaires de personnes 9 27 5 74

Etablissement peacutenitentiaires 5 15 0 00

Cregraveches 4 12 0 00

Transport (avion bateau train) 4 12 2 29

Structure de laide sociale agrave lenfance 2 06 0 00

Structures de soins reacutesidentiels des personnes sans domicile fixe 0 00 0 00

Autre 24 72 5 74

Situation au 7 juillet 2020 Page 11 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Clusters en Ehpad

Parallegravelement aux dispositifs de surveillance mis en place dans les ESMS (cf page 12) les eacutepisodes

reacutepondant agrave la deacutefinition de cas drsquoun cluster (survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes ou probables dans une

peacuteriode de 7 jours) sont inteacutegreacutes dans le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute publique

France

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 104 clusters inclus depuis le 9 mai (Figure 11) Le nombre

hebdomadaire de clusters signaleacutes en Ehpad est en nette diminution depuis la semaine 23

Au 8 juillet 87 (n=9) clusters sont encore en cours drsquoinvestigation 163 sont maitriseacutes (suivi des

contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le dernier cas) et 750 sont clocirctureacutes (absence

de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du dernier cas ET la fin de la quatorzaine des

contacts)

La majoriteacute (67) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 13 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 104 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 1 298 cas

De par la nature de cette collectiviteacute lrsquointeacutegraliteacute des clusters en Ehpad est de criticiteacute eacuteleveacutee

Figure 11 Distribution du nombre de clusters en Ehpad selon leur statut et du nombre de cas (tous

clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=104) au 8 juillet 2020

(Source MONIC)

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 12 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS)

Entre le 1er mars et le 06 juillet 2020 8 032 signalements rapportaient un ou plusieurs cas de COVID-19 deacuteclareacutes dans le portail national des signalements de Santeacute publique France et le portail de lrsquoARS Ile-de-France

Il srsquoagissait de 5 051 (63 ) signalements provenant drsquoeacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD EHPA et autres eacutetablissements) et 2 981 (37 ) drsquoautres eacutetablissements meacutedico-sociaux (ESMS)

Parmi les 8 032 signalements (Tableau 2)

minus 39 256 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents

minus 10 476 cas sont deacuteceacutedeacutes dans lrsquoeacutetablissement drsquoaccueil dont 10 390 (99 ) dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

minus 3 916 cas sont deacuteceacutedeacutes agrave lrsquohocircpital

minus 20 391 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes parmi les membres du personnel des ESMS

Depuis le 1er mars et jusqursquoau 06 juillet 2020 parmi les 5 051 signalements en eacutetablissements drsquoheacutebergements pour personnes acircgeacutees (EHPA) 3 379 eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Au cours des deux semaines S26 et S27 (du 22 juin au 5 juillet) parmi lrsquoensemble des EHPA en France (Ile-de-France exclue) 38 eacutetablissements (04) ont deacuteclareacute au moins un nouveau cas confirmeacute de COVID-19 parmi les reacutesidents ou le personnel Sur la mecircme peacuteriode parmi les EHPA en France (Ile-de-France exclue) 22 (02) eacutetablissements ont signaleacute un nouvel eacutepisode (date de deacutebut des signes du premier cas ou agrave deacutefaut date de signalement comprise entre le 22 juin et le 5 juillet) avec au moins un cas confirmeacute

Tableau 2 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoeacutetablissement chez les reacutesidents et le personnel dans les ESMS rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 France

Depuis le 29 juin les nombres de signalements et de deacutecegraves chez les reacutesidents ont diminueacute et ceci est ducirc agrave linfirmation deacutepisodes apregraves

investigation (8 271 signalements et 10 497 deacutecegraves en eacutetablissement avaient eacuteteacute rapporteacutes dans le bulletin de la semaine preacuteceacutedente)

1Etablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres eacutetablissements-EHPA reacutesidences autonomie reacutesidences seniors)

2Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (FAM IME autres eacutetablissements pour enfants (ITEP EAAP IEM Instituts pour deacuteficient auditifs et

visuels) autre eacutetablissements pour adultes (foyer de vie foyer drsquoheacutebergement) 3Aide sociale agrave lrsquoenfance (centres deacutepartementaux de lrsquoenfance

foyers de lrsquoenfance MECS) 4Autres eacutetablissements (LAM LHSS SCAPA avec heacutebergement) 5Un signalement COVID-19 est deacutefini par la

survenue drsquoau moins un cas COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas confirmeacute COVID-19 toute personne symptomatique ou non avec un

preacutelegravevement confirmant lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 parmi les personnes reacutesidentes ou les membres du personnel drsquoun ESMSEHPA 7Cas pos-

sibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Du fait du deacutelai court entre le signalement par les eacutetablissements et la production du point eacutepideacutemiologique les donneacutees les plus reacutecentes ne sont pas consolideacutees Les processus drsquoassurance qualiteacute mis en place au niveau reacutegional peuvent conduire agrave des corrections ulteacuterieures de donneacutees A noter que depuis le 01 juillet 2020 les ESMS drsquoIle-de-France ont commenceacute agrave deacuteclarer leurs eacutepisodes via lrsquoapplication de Santeacute publique France Les donneacutees drsquoIle-de-France sont agrave interpreacuteter avec prudence en attendant que le transfert de donneacutees soit stabiliseacute De plus apregraves investigation 333 eacutepisodes ont eacuteteacute infirmeacutes ce qui influence le nombre de signalements mais peu le nombre de deacutecegraves et pas le nombre de cas confirmeacutes

EHPA1 HPH2

Aide en-

fance3 Autres4 Total

Signalements5 5 051 2 290 367 324 8 032

Chez les

reacutesidents

Cas confirmeacutes6 34 688 3 946 164 458 39 256

Deacutecegraves hocircpitaux7 3 691 204 0 21 3 916

Deacutecegraves eacutetablissements7 10 390 75 0 11 10 476

Chez le

personnel Cas confirmeacutes6 16 522 3 404 279 186 20 391

Situation au 7 juillet 2020 Page 13 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 12 Nombre de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 (n=6 484) par date de deacutebut des signes du premier cas du 1er mars au 6 juillet 2020 France (hors Ile-de-France)

Figure 13 Nombre moyen (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 en France hors

Ile-de-France

Apregraves la deacutecroissance observeacutee depuis deacutebut avril le nombre de signalements reste tregraves faible depuis deacutebut mai il est infeacuterieur agrave 10 signalements par jour depuis au moins 30 jours en France hors

Ile-de-France (Figure 12)

Le nombre de deacutecegraves chez les reacutesidents en eacutetablissement et agrave lrsquohocircpital a atteint un pic deacutebut avril et deacutecroicirct continuellement depuis ce nombre varie entre 0 et 13 deacutecegraves par jour depuis le 1er Juin et eacutetait toujours infeacuterieur agrave 5 deacutecegraves par jour cette derniegravere semaine en France hors Ile-de-France (Figure 13)

Situation au 7 juillet 2020 Page 14 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (Reacuteseau OSCOUR

reg)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 330 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont

eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode repreacutesentant 05 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence du reacuteseau OSCOURreg

Ces passages eacutetaient en leacutegegravere baisse de 5 par rapport agrave la semaine 26 avec une part drsquoactiviteacute stable (1 402 passages et 05 de lrsquoactiviteacute totale en S26 ndash donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020) (Figure 14)

En semaine 27 sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 enregistreacutes au niveau national 21 ont eacuteteacute enregistreacutes en Icircle-de-France 16 en Guyane 8 en Auvergne Rhocircne-Alpes et 8 en Bretagne

En semaine 27 les passages aux urgences eacutetaient en baisse ou se maintenaient agrave un niveau bas pour la 14egraveme semaine conseacutecutive au niveau national et reacutegional (Figure 15) Chez les enfants on observait une seconde semaine conseacutecutive de hausse dans de faibles effectifs (+26 passages soit +31)

La proportion drsquohospitalisations apregraves passage pour suspicion de COVID-19 indicateur de graviteacute agrave lrsquoarriveacutee aux urgences eacutetait en leacutegegravere baisse agrave 35 en semaine S27 (versus 36 en S26 - donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020)

Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 171 631 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

Figure 14 Nombre de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier et depuis le 1er juin 2020 France (source OSCOURreg)

Figure 15 Taux hebdomadaires de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences semaine 27 France (source OSCOURreg)

Situation au 7 juillet 2020 Page 15 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission A partir de cette semaine les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests PCR positifs) en remplacement de lrsquoindicateur R calculeacute agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) Lrsquoavantage de cet indicateur est de repo-ser sur les donneacutees des cas confirmeacutes de COVID-19 et de srsquoappuyer sur un recours au test qui a vocation agrave intervenir rapidement apregraves la survenue des signes eacutevocateurs de COVID-19 Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Le R effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Le nombre de tests positifs peut ecirctre influenceacute par les actions locales de deacutepistage en particulier en cas drsquoidentification de clusters qui permettent drsquoidentifier des infections asymptomatiques Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais doivent ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Les estimations du nombre de reproduction sont baseacutees sur les nombre de tests PCR positifs au SARS-CoV-2 reacutealiseacutes entre le 21 juin et le 27 juin 2020 remonteacutes par le systegraveme SI-DEP

Le nombre de reproduction au niveau de la France meacutetropolitaine est de 105 (intervalle de confiance (IC95 1003-1090) (Tableau 3) et est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (R effectif=090 IC95 086-094) Cet indicateur est significatif en France meacutetropolitaine

Quatre reacutegions ont un nombre de reproduction R estimeacute supeacuterieur agrave 1 de faccedilon significative en Guyane (R=114 IC95 108-121) en diminution pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Nouvelle-Aquitaine (R=132 IC95 104-164) Pays-de-la-Loire (R= 152 IC95 131-173) et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (R = 124 IC95 105-146)

Les reacutegions Bretagne (107 IC95 072-149) Hauts-de-France (106 IC95 094-118) Ile-de-France

(106 IC95 099-113) Normandie (100 IC95 083-117) et La Reacuteunion (147 IC95 093-214) ont des estimations supeacuterieures agrave 1 mais non significativement supeacuterieures (valeur laquo 1 raquo comprise dans lrsquointervalle de confiance) (Tableau 3)

Tableau 3 Nombre de reproduction effectif (R effectif) agrave partir des tests PCR positifs au SARS-COV-2

par reacutegion France entiegravere sur 7 jours glissants du 28 juin au 4 juillet 2020 (Source SI-DEP)

NC le taux de reproduction nrsquoest pas calculable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am

J Epidemiol 2013 178 pp 1505-1512

Reacutegions R effectif Intervalle de confiance (95)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 098 086-112

Bourgogne-Franche-Comteacute 098 074-124

Bretagne 107 072-149

Centre-Val de Loire 097 075-121

Corse NC NC

Grand Est 078 066-091

Hauts-de-France 106 094-118

Ile-de-France 106 099-113

Normandie 100 083-117

Nouvelle-Aquitaine 132 104-164

Occitanie 097 081-115

Pays de la Loire 152 131-173

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 124 105-146

France meacutetropolitaine 105 1003-1094

Guadeloupe NC

La Reacuteunion NC

Martinique NC

Mayotte 076 061-092

Guyane 114 108-121

Situation au 7 juillet 2020 Page 16 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC)

Depuis le 1er mars 2020 1 508 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 105 152 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 4)

minus Lrsquoacircge meacutedian des patients est de 72 ans et 53 sont des hommes

minus 19 457 patients sont deacuteceacutedeacutes 71 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 59 eacutetaient des hommes

minus 77 655 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 07 juillet 2020 7 594 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 538 cas en reacuteanimation

Tableau 4 Nombre de personnes hospitaliseacutees et en reacuteanimation pour COVID-19 le 07 juillet 2020 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars par classe drsquoacircge et par reacutegion France (source SI-VIC)

Figure 16 Evolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 07 juillet France (source SI-VIC)

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

du 10 juin au 16 juin

Surveillance en milieu hospitalier

du 17 juin au 23 juin du 24 juin au 30 juin du 1er au 7 juillet

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 3: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 3 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Reacuteseau Sentinelles

La surveillance speacutecifique du COVID-19 du Reacuteseau Sentinelles (Inserm Sorbonne Universiteacute) a eacuteteacute mise en place le 16 mars 2020 Apregraves le deacuteconfinement la surveillance virologique en vigueur des IRA (infection respiratoire aigueuml) effectueacutee par les meacutedecins du reacuteseau a eacuteteacute suspendue durant les semaines 20 et 21 et relayeacutee par une surveillance baseacutee sur les recommandations de la DGS1 qui preacuteconise la reacutealisation drsquoun test pour tout patient suspect de COVID-19 Les preacutelegravevements et analyses sont donc reacutealiseacutes par les laboratoires de ville depuis la semaine 22

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le taux de consultations (ou teacuteleacuteconsultations) pour une IRA estimeacute

eacutetait de 17100 000 habitants [intervalle de confiance agrave 95 12-22] en France meacutetropolitaine Il suivait une tendance agrave la hausse non significative par rapport agrave celui de la semaine 26 (du 22 au 28 juin 2020) 11100 000 habitants [IC agrave 95 8-14]

En semaine 27 sur les 145 cas suspects de COVID-19 identifieacutes un preacutelegravevement a eacuteteacute prescrit pour 97 drsquoentre eux Les reacutesultats des analyses eacutetaient connus pour 63 patients et aucun patient nrsquoavait eacuteteacute testeacute positifs Depuis le 25 mai 2020 un preacutelegravevement a eacuteteacute prescrit pour 93 des 1038 cas suspects de COVID-19 identifieacutes Les reacutesultats des analyses eacutetaient connus pour 744 patients et eacutetaient positifs pour 20 (27) patients Ces donneacutees seront consolideacutees au cours des prochaines semaines

Surveillance en meacutedecine ambulatoire

[1] DGS-Urgent Prise en charge par les meacutedecins de ville des patients de COVID-19 en phase de deacuteconfinement

Situation au 7 juillet 2020 Page 4 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Associations SOS Meacutedecins

Depuis le 3 mars 2020 60 613 actes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID 19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 523 actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes par les associations SOS Meacutedecins ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Ce nombre drsquoactes eacutetait en hausse pour la seconde semaine conseacutecutive soit +41 par rapport agrave S26 (1 082 actes) tous acircges confondus

Cette augmentation est plus marqueacutee chez les enfants de moins de 15 ans (397 actes en S27 vs 235 en S26 soit +69) Cette tendance agrave la hausse peut srsquoexpliquer par la reprise de lrsquoeacutecole qui a eu lieu avant les vacances scolaires drsquoeacuteteacute et pour laquelle le retour agrave la collectiviteacute a favoriseacute les tableaux respiratoires (notamment les pathologies ORL) qui eacutetaient agrave la hausse chez les enfants (+106 en S27 par rapport agrave la S26) Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave appliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter le nombre de demandes de tests pour COVID-19 et par conseacutequent le nombre drsquoactes codeacutes comme suspicion de COVID-19

La part des actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 dans lrsquoactiviteacute totale tous acircges confondus eacutetait en leacutegegravere hausse 27 en S27 vs 21 en S26 (Figure 1)

En reacutegion les hausses observeacutees (tous acircges confondus) srsquoeacutetendent de +118 agrave +16 sur 10 reacutegions (Centre Val-de-Loire Nouvelle-Aquitaine Hauts-de-France Bretagne Auvergne Rhocircne-Alpes Occitanie Ile-de-France Provence-Alpes-Cocircte dAzur Pays de La Loire et Grand-Est) Parmi ces reacutegions ce sont lrsquoIle-de-France (22) et lrsquoAuvergne-Rhocircne-Alpes (15) qui comptent le plus drsquoactes pour suspicion de COVID-19 parmi ceux enregistreacutes au niveau national

Figure 1 Nombre drsquoactes SOS Meacutedecins et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 et depuis le 1

er juin 2020 France (source SOS Meacutedecins)

Figure 2 Taux drsquoactes meacutedicaux hebdomadaires pour 10 000 actes pour suspicion de COVID-19 semaine 27 (source SOS Meacutedecins)

Pour en savoir plus sur les donneacutees SOS Meacutedecins consulter GEODES

Situation au 7 juillet 2020 Page 5 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance virologique

Les objectifs de la surveillance virologique baseacutee sur les laboratoires sont de suivre lrsquoeacutevolution des taux de positiviteacute des tests dans le temps par reacutegion ou par deacutepartement ainsi que le nombre de patients positifs pour le SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population (taux drsquoincidence) Les donneacutees sont consolideacutees dans le temps Ces indicateurs associeacutes aux autres permettent de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie Jusqursquoagrave la semaine 19 la surveillance virologique srsquoest appuyeacutee sur les donneacutees non exhaustives transmises agrave Santeacute publique France par le reacuteseau 3 Labo (Cerba Eurofins-Biomnis Inovie) et par les laboratoires hospitaliers Depuis la se-maine 20 elle srsquoappuie sur le systegraveme SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) opeacuterationnel depuis le 13 mai 2020 et dont la monteacutee en charge a eacuteteacute progressive Ce nouveau systegraveme de surveillance vise au suivi exhaustif de lrsquoensemble des patients testeacutes en France dans les laboratoires de ville et dans les laboratoires hospitaliers Actuellement les donneacutees trans-mises concernent les tests RT-PCR reacutealiseacutes

Au 07 juillet la quasi-totaliteacute des laboratoires (5 485 sites de preacutelegravevements) a transmis des donneacutees

Du 28 juin au 4 juillet 2020 300 817 patients ont eacuteteacute testeacutes pour le SARS-CoV-2 et le test eacutetait positif pour 3 797 patients Le taux de positiviteacute national hebdomadaire eacutetait de 13 (calculeacute sur les tests valides) Le taux national est en diminution par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (14) Ce taux de positiviteacute en France meacutetropolitaine eacutetait en leacutegegravere diminution par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (08 vs 09) (Figure 3)

Pour en savoir plus sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

En France meacutetropolitaine le taux de positiviteacute eacutetait infeacuterieur agrave 5 dans lrsquoensemble des deacutepartements sauf en Mayenne ougrave ce taux eacutetait de 85 Des clusters sont en cours drsquoinvestigation dans ce deacutepartement dont un preacutesentant une diffusion communautaire des deacutepistages sont en cours pour la semaine S28 (Figure 4)

Du 28 juin au 4 juillet 2020 le taux drsquoincidence (nombre de nouveaux cas rapporteacutes agrave la population pour 100 000 habitants) eacutetait de 56100 000 habitants au niveau national (52100 000 h en semaine 26) et de 35100 000 h en meacutetropole (32100 000 h en semaine 26) Il eacutetait infeacuterieur agrave 10100 000 h dans tous les

deacutepartements de France meacutetropolitaine sauf pour la Mayenne (45100 000 h) (Figure 5)

En outre-mer

minus A Mayotte en semaine 27 le taux de positiviteacute eacutetait de 114 (vs183 en S26) et le taux drsquoincidence de

34100 000 habitants (vs 46100 000 h en S26) valeurs agrave la baisse

minus En Guyane en semaine 27 le taux de positiviteacute eacutetait de 265 (vs 255 en S26) et le taux drsquoincidence de 458100 000 habitants (vs 436100 000 h en S26) valeurs agrave la hausse

Figure 3 Nombre de tests reacutealiseacutes nombre de tests positifs pour le SARS-CoV-2 et taux de positiviteacute

dans les laboratoires par semaine France 2020 (source S9-S19 3 Labo et laboratoires hospitaliers

depuis S20 SI-DEP)

Situation au 7 juillet 2020 Page 6 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du 28 juin au 4 juillet 2020 le taux de deacutepistage (nombre de patients testeacutes pour SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) eacutetait de 448 pour 100 000 habitants au niveau national (Figure 6) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage du 21 au 27 juin 2020 eacutetaient la Meurthe-et-Moselle (892100 000 h) le Calvados (720100 000 h) la Seine-Maritime (702100 000 h) et les Bouches-du-Rhocircne (698100 000 h) (Figure 6bis) Le nombre de patients testeacutes en France meacutetropolitaine est en augmentation (+26 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente)

En outre-mer le plus fort taux de deacutepistage a eacuteteacute observeacute en Guyane (1 729100 000 habitants) A Mayotte le taux de deacutepistage eacutetait de 297100 000 h Le nombre de patients testeacutes en outre-mer est en augmentation (+13 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente)

Au niveau national le nombre de patients testeacutes est en augmentation sur les derniegraveres semaines (179 897 en S25 244 231 en S26 et 304 049 en S27)

Figure 4 Taux de positiviteacute des personnes

testeacutees pour le SARS-CoV-2 par deacutepartement

France 28 juin au 4 juillet 2020 (source SI-DEP)

Figure 5 Taux drsquoincidence de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 pour 100 000 habitants par deacutepartement France 28 juin au 4 juillet 2020 (source SI-DEP)

Figure 6bis Taux de deacutepistage ( 100 000 habi-

tants) pour le SARS-CoV-2 par deacutepartement

France du 28 juin au 4 juillet (source SI-DEP)

Figure 6 Evolution du taux de deacutepistage ( 100 000 habi-

tants) pour le SARS-CoV-2 par semaine depuis le 13 mai

2020 France (source SI-DEP)

Situation au 7 juillet 2020 Page 7 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance en population COVIDnetfr

GrippeNetfr est un reacuteseau de surveillance mis en place en janvier 2012 par le reacuteseau Sentinelles (Inserm ndash Sorbonne Universiteacute) et Santeacute publique France avec pour objectif de recueillir directement aupregraves de la population des donneacutees eacutepideacutemiologiques sur les syndromes grippaux par internet et de faccedilon anonyme Il permet drsquoeacutetudier les symptocircmes preacutesenteacutes par les personnes malades qui nrsquoont pas recours au systegraveme de soins Depuis le 30 mars 2020 le projet GrippeNetfr sest adapteacute agrave la surveillance du COVID-19 et est devenu COVIDnetfr Pregraves de 6 000 personnes remplissent actuellement chaque semaine un questionnaire rapportant les symptocircmes qursquoelles ont eacuteventuellement eus depuis leur derniegravere connexion 12 133 personnes ont rempli au moins un questionnaire depuis le deacutebut de la saison hivernale 2019-2020

Pour la semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 5 011 questionnaires hebdomadaires ont eacuteteacute remplis

En semaine 27 la proportion de participants ayant deacuteclareacute des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 (deacutefinition sappuyant sur les recommandations du Haut Conseil de la santeacute publique concernant la prescription dun test diagnostique par un meacutedecin) eacutetait de 10 [06 14] stable par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (Figure 7)

La surveillance GrippeNetfrCOVIDnetfr srsquoachegravevera dimanche 12 juillet et reprendra en fin deacuteteacute ou deacutebut dautomne en fonction de lrsquoeacutevolution de leacutepideacutemie de COVID-19 Les donneacutees de la derniegravere semaine de surveillance de la saison seront publieacutees la semaine prochaine

Figure 7 Proportion ( redresseacute) de participants ayant deacuteclareacute des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 par semaine (donneacutees du 24 feacutevrier au 5 juillet 2020 source COVIDnetfr)

Note Deux nouveaux symptocircmes anosmie et agueusie ont eacuteteacute ajouteacutes au questionnaire hebdomadaire en semaine 14 afin dameacuteliorer le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Les donneacutees de la cohorte COVIDnetfr montrent que seules 46 en moyenne des personnes ayant deacuteclareacute des symptocircmes drsquoinfection respiratoire aigueuml ont consulteacute un meacutedecin Ce pourcentage a peu varieacute au cours de la peacuteriode eacutepideacutemique et depuis la leveacutee du confinement De plus il apparait que seules 17 en moyenne des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et que seules 12 (soit 71 des personnes avec prescription drsquoun test) ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Parmi les personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 et ayant consulteacute un meacutedecin geacuteneacute-raliste seuls 39 auraient reccedilu une prescription pour un test diagnostique Ces reacutesultats sont agrave interpreacuteter avec preacutecaution car les donneacutees ne sont pas redresseacutees par rapport agrave la population franccedilaise et sont soumises agrave des fluctuations importantes drsquoune semaine agrave lrsquoautre en raison de faibles effectifs

Ils suggegraverent cependant que le recours aux soins pour suspicion de COVID-19 ainsi que la reacutealisation

des tests RT-PCR agrave viseacutee de diagnostic sont aujourdrsquohui tregraves insuffisants chez les personnes

symptomatiques

Situation au 7 juillet 2020 Page 8 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Cas confirmeacutes de COVID-19

Les donneacutees permettant drsquoestimer le nombre de cas confirmeacutes en France sont issues de plusieurs sources

Entre le 21 janvier et le 25 mars 2020 25 233 cas de COVID-19 ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France via lrsquoapplication GoData ou par transmission des cellules reacutegionales de Santeacute publique France

Entre le 26 mars et le 12 mai 2020 115 010 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes (cas incidents hospitaliers et cas positifs en laboratoire) par les remonteacutees des donneacutees de laboratoires de biologie meacutedicale (source 3 Labo) et des patients hospitaliseacutes pour COVID-19 (source SI-VIC)

Depuis le 13 mai 2020 les cas de COVID-19 sont rapporteacutes par le Systegraveme drsquoInformation de Deacutepistage (SI-DEP) permettant une estimation agrave viseacutee exhaustive des nombres de cas confirmeacutes en France Entre le 13 mai et le 7 juillet 2020 28 567 cas ont eacuteteacute rapporteacutes dans SI-DEP

Il est ainsi estimeacute un total de 168 810 cas confirmeacutes de COVID-19 en France au 07 juillet 2020

De la semaine 15 agrave la semaine 24 le nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes a eacuteteacute en diminution passant de 30 111 cas confirmeacutes en S14 agrave 2 949 cas en S24 Neacuteanmoins depuis la semaine 24 le nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes est agrave nouveau en augmentation passant de 2 949 cas confirmeacutes en S24 agrave 3 684 cas en S27 (Figure 8) On peut notamment expliquer cette augmentation par la situation eacutepideacute-miologique en Guyane Le nombre de cas confirmeacutes en France meacutetropolitaine est eacutegalement en augmenta-tion entre le S26 et la S27 (+290 cas +14) et est en partie lieacutee agrave une augmentation des cas en Mayenne

Au cours de la vague eacutepideacutemique et jusqursquoagrave la leveacutee des mesures de confinement de la population tous les patients preacutesentant des signes de COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer une infection (recommandations ministeacuterielles du 13 mars 2020) Le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France eacutetait donc supeacuterieur au nombre estimeacute de cas confirmeacutes pendant cette peacuteriode Depuis le deacuteconfinement il est demandeacute que les patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 ainsi que les sujets contacts drsquoun cas confirmeacute soient deacutepisteacutes pour le SARS-CoV-2 [1] A compter de cette date et gracircce au systegraveme SI-DEP le nombre de cas confirmeacutes permet deacutesormais theacuteoriquement drsquoestimer le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France Ce nombre peut cependant ecirctre sous-estimeacute du fait de lrsquoabsence de deacutepistage systeacutematique de personnes infecteacutees symptomatiques ou asymptomatiques [1] DGS-Urgent Prise en charge par les meacutedecins de ville des patients de COVID-19 en phase de

deacuteconfinement Disponible via ce lien cliquez ici

Figure 8 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine rapporteacutes agrave Santeacute publique France du 23 janvier au 4 juillet 2020 (donneacutees arrecircteacutees le 7 juillet 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 9 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Signalement agrave viseacutee drsquoalerte des clusters (ou foyers de transmission)

Preacuteambule Depuis la leveacutee du confinement les ARS en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France et les

partenaires locaux investiguent les clusters deacutetecteacutes selon le guide en vigueur [1] Le traccedilage et le deacutepistage des

personnes contacts permettent de controcircler ces foyers Un cluster est deacutefini par la survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes

ou probables dans une peacuteriode de 7 jours et qui appartiennent agrave une mecircme communauteacute ou ont participeacute agrave un mecircme

rassemblement de personnes qursquoils se connaissent ou non Le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute

publique France permet de preacutesenter ce bilan

Cluster hors Ehpad et milieu familial restreint

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 333 clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) rapporteacutes depuis le

9 mai 313 clusters en France meacutetropolitaine et 20 dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (Figures 9 et 10) Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est stable sur les 5 derniegraveres semaines (S23

- S27) et reste infeacuterieur aux nombres observeacutes sur les semaines S20 agrave S22 Au 8 juillet 68 clusters eacutetaient

toujours en cours drsquoinvestigation

Moins drsquoun quart des clusters signaleacutes depuis le 9 mai sont encore en cours drsquoinvestigation (204

n=68) 126 sont maitriseacutes (suivi des contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le

dernier cas) 622 sont clocirctureacutes (absence de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du

dernier cas ET la fin de la quatorzaine des contacts) Des clusters (48) ont diffuseacute dans la communauteacute

Les 15 clusters en Guyane sont consideacutereacutes agrave diffusion communautaire En France meacutetropolitaine 2

clusters sont en diffusion communautaire 1 en Normandie et 1 en Pays de Loire En termes de criticiteacute (potentiel de transmission ou critegraveres de graviteacute) 79 des clusters sont de criticiteacute

modeacutereacutee (44) agrave eacuteleveacutee (35) Parmi ceux qui restent en cours drsquoinvestigation 31 ont une criticiteacute eacuteleveacutee

Les clusters concernent notamment des eacutetablissements de santeacute (22) des entreprises (18 en entreprises

priveacutees et publiques hors santeacute) et des personnes en situation de preacutecariteacute et de vulneacuterabiliteacute (14 en

eacutetablissements drsquoheacutebergement social et drsquoinsertion et 5 en communauteacutes vulneacuterables) (Tableau 1)

La majoriteacute (70) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 153 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 333 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 5 111 cas

Figure 9 Distribution du nombre de clusters selon leur statut (hors Ehpad et milieu familial restreint) et

du nombre de cas (tous clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020

(N=333) au 8 juillet 2020 (Source MONIC)

[1] Pour en savoir plus Guide pour lidentification et linvestigation de situations de cas groupeacutes de COVID-19

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 10 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 1 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) par type de collectiviteacute

inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=333) (Source MONIC)

Figure 10 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) en cours drsquoinvestigation

par deacutepartement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet juin 2020 (N=68) (Source MONIC)

ES eacutetablissement de santeacute EMS eacutetablissement meacutedico-social

Pour en savoir plus sur les donneacutees reacutegionales consulter Santeacute publique France

Type de collectiviteacutes

Ensemble des

clusters

Clusters en

cours dinvesti-

gation

N=333 N=68

Etablissements de santeacute 74 222 3 44

Entreprises priveacutees et publiques (hors ES) 60 180 17 250

Etablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion 48 144 10 147

Milieu familial eacutelargi (concerne plusieurs foyers familiaux) 43 129 14 206

Milieu scolaire et universitaire 17 51 6 88

EMS de personnes handicapeacutees 16 48 1 15

Communauteacutes vulneacuterables (gens du voyage migrants en situation preacutecaire etc) 16 48 3 44

Uniteacute geacuteographique de petite taille (suggeacuterant exposition commune) 11 33 2 29

Evegravenement public ou priveacute rassemblements temporaires de personnes 9 27 5 74

Etablissement peacutenitentiaires 5 15 0 00

Cregraveches 4 12 0 00

Transport (avion bateau train) 4 12 2 29

Structure de laide sociale agrave lenfance 2 06 0 00

Structures de soins reacutesidentiels des personnes sans domicile fixe 0 00 0 00

Autre 24 72 5 74

Situation au 7 juillet 2020 Page 11 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Clusters en Ehpad

Parallegravelement aux dispositifs de surveillance mis en place dans les ESMS (cf page 12) les eacutepisodes

reacutepondant agrave la deacutefinition de cas drsquoun cluster (survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes ou probables dans une

peacuteriode de 7 jours) sont inteacutegreacutes dans le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute publique

France

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 104 clusters inclus depuis le 9 mai (Figure 11) Le nombre

hebdomadaire de clusters signaleacutes en Ehpad est en nette diminution depuis la semaine 23

Au 8 juillet 87 (n=9) clusters sont encore en cours drsquoinvestigation 163 sont maitriseacutes (suivi des

contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le dernier cas) et 750 sont clocirctureacutes (absence

de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du dernier cas ET la fin de la quatorzaine des

contacts)

La majoriteacute (67) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 13 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 104 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 1 298 cas

De par la nature de cette collectiviteacute lrsquointeacutegraliteacute des clusters en Ehpad est de criticiteacute eacuteleveacutee

Figure 11 Distribution du nombre de clusters en Ehpad selon leur statut et du nombre de cas (tous

clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=104) au 8 juillet 2020

(Source MONIC)

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 12 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS)

Entre le 1er mars et le 06 juillet 2020 8 032 signalements rapportaient un ou plusieurs cas de COVID-19 deacuteclareacutes dans le portail national des signalements de Santeacute publique France et le portail de lrsquoARS Ile-de-France

Il srsquoagissait de 5 051 (63 ) signalements provenant drsquoeacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD EHPA et autres eacutetablissements) et 2 981 (37 ) drsquoautres eacutetablissements meacutedico-sociaux (ESMS)

Parmi les 8 032 signalements (Tableau 2)

minus 39 256 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents

minus 10 476 cas sont deacuteceacutedeacutes dans lrsquoeacutetablissement drsquoaccueil dont 10 390 (99 ) dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

minus 3 916 cas sont deacuteceacutedeacutes agrave lrsquohocircpital

minus 20 391 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes parmi les membres du personnel des ESMS

Depuis le 1er mars et jusqursquoau 06 juillet 2020 parmi les 5 051 signalements en eacutetablissements drsquoheacutebergements pour personnes acircgeacutees (EHPA) 3 379 eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Au cours des deux semaines S26 et S27 (du 22 juin au 5 juillet) parmi lrsquoensemble des EHPA en France (Ile-de-France exclue) 38 eacutetablissements (04) ont deacuteclareacute au moins un nouveau cas confirmeacute de COVID-19 parmi les reacutesidents ou le personnel Sur la mecircme peacuteriode parmi les EHPA en France (Ile-de-France exclue) 22 (02) eacutetablissements ont signaleacute un nouvel eacutepisode (date de deacutebut des signes du premier cas ou agrave deacutefaut date de signalement comprise entre le 22 juin et le 5 juillet) avec au moins un cas confirmeacute

Tableau 2 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoeacutetablissement chez les reacutesidents et le personnel dans les ESMS rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 France

Depuis le 29 juin les nombres de signalements et de deacutecegraves chez les reacutesidents ont diminueacute et ceci est ducirc agrave linfirmation deacutepisodes apregraves

investigation (8 271 signalements et 10 497 deacutecegraves en eacutetablissement avaient eacuteteacute rapporteacutes dans le bulletin de la semaine preacuteceacutedente)

1Etablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres eacutetablissements-EHPA reacutesidences autonomie reacutesidences seniors)

2Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (FAM IME autres eacutetablissements pour enfants (ITEP EAAP IEM Instituts pour deacuteficient auditifs et

visuels) autre eacutetablissements pour adultes (foyer de vie foyer drsquoheacutebergement) 3Aide sociale agrave lrsquoenfance (centres deacutepartementaux de lrsquoenfance

foyers de lrsquoenfance MECS) 4Autres eacutetablissements (LAM LHSS SCAPA avec heacutebergement) 5Un signalement COVID-19 est deacutefini par la

survenue drsquoau moins un cas COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas confirmeacute COVID-19 toute personne symptomatique ou non avec un

preacutelegravevement confirmant lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 parmi les personnes reacutesidentes ou les membres du personnel drsquoun ESMSEHPA 7Cas pos-

sibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Du fait du deacutelai court entre le signalement par les eacutetablissements et la production du point eacutepideacutemiologique les donneacutees les plus reacutecentes ne sont pas consolideacutees Les processus drsquoassurance qualiteacute mis en place au niveau reacutegional peuvent conduire agrave des corrections ulteacuterieures de donneacutees A noter que depuis le 01 juillet 2020 les ESMS drsquoIle-de-France ont commenceacute agrave deacuteclarer leurs eacutepisodes via lrsquoapplication de Santeacute publique France Les donneacutees drsquoIle-de-France sont agrave interpreacuteter avec prudence en attendant que le transfert de donneacutees soit stabiliseacute De plus apregraves investigation 333 eacutepisodes ont eacuteteacute infirmeacutes ce qui influence le nombre de signalements mais peu le nombre de deacutecegraves et pas le nombre de cas confirmeacutes

EHPA1 HPH2

Aide en-

fance3 Autres4 Total

Signalements5 5 051 2 290 367 324 8 032

Chez les

reacutesidents

Cas confirmeacutes6 34 688 3 946 164 458 39 256

Deacutecegraves hocircpitaux7 3 691 204 0 21 3 916

Deacutecegraves eacutetablissements7 10 390 75 0 11 10 476

Chez le

personnel Cas confirmeacutes6 16 522 3 404 279 186 20 391

Situation au 7 juillet 2020 Page 13 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 12 Nombre de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 (n=6 484) par date de deacutebut des signes du premier cas du 1er mars au 6 juillet 2020 France (hors Ile-de-France)

Figure 13 Nombre moyen (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 en France hors

Ile-de-France

Apregraves la deacutecroissance observeacutee depuis deacutebut avril le nombre de signalements reste tregraves faible depuis deacutebut mai il est infeacuterieur agrave 10 signalements par jour depuis au moins 30 jours en France hors

Ile-de-France (Figure 12)

Le nombre de deacutecegraves chez les reacutesidents en eacutetablissement et agrave lrsquohocircpital a atteint un pic deacutebut avril et deacutecroicirct continuellement depuis ce nombre varie entre 0 et 13 deacutecegraves par jour depuis le 1er Juin et eacutetait toujours infeacuterieur agrave 5 deacutecegraves par jour cette derniegravere semaine en France hors Ile-de-France (Figure 13)

Situation au 7 juillet 2020 Page 14 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (Reacuteseau OSCOUR

reg)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 330 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont

eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode repreacutesentant 05 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence du reacuteseau OSCOURreg

Ces passages eacutetaient en leacutegegravere baisse de 5 par rapport agrave la semaine 26 avec une part drsquoactiviteacute stable (1 402 passages et 05 de lrsquoactiviteacute totale en S26 ndash donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020) (Figure 14)

En semaine 27 sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 enregistreacutes au niveau national 21 ont eacuteteacute enregistreacutes en Icircle-de-France 16 en Guyane 8 en Auvergne Rhocircne-Alpes et 8 en Bretagne

En semaine 27 les passages aux urgences eacutetaient en baisse ou se maintenaient agrave un niveau bas pour la 14egraveme semaine conseacutecutive au niveau national et reacutegional (Figure 15) Chez les enfants on observait une seconde semaine conseacutecutive de hausse dans de faibles effectifs (+26 passages soit +31)

La proportion drsquohospitalisations apregraves passage pour suspicion de COVID-19 indicateur de graviteacute agrave lrsquoarriveacutee aux urgences eacutetait en leacutegegravere baisse agrave 35 en semaine S27 (versus 36 en S26 - donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020)

Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 171 631 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

Figure 14 Nombre de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier et depuis le 1er juin 2020 France (source OSCOURreg)

Figure 15 Taux hebdomadaires de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences semaine 27 France (source OSCOURreg)

Situation au 7 juillet 2020 Page 15 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission A partir de cette semaine les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests PCR positifs) en remplacement de lrsquoindicateur R calculeacute agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) Lrsquoavantage de cet indicateur est de repo-ser sur les donneacutees des cas confirmeacutes de COVID-19 et de srsquoappuyer sur un recours au test qui a vocation agrave intervenir rapidement apregraves la survenue des signes eacutevocateurs de COVID-19 Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Le R effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Le nombre de tests positifs peut ecirctre influenceacute par les actions locales de deacutepistage en particulier en cas drsquoidentification de clusters qui permettent drsquoidentifier des infections asymptomatiques Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais doivent ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Les estimations du nombre de reproduction sont baseacutees sur les nombre de tests PCR positifs au SARS-CoV-2 reacutealiseacutes entre le 21 juin et le 27 juin 2020 remonteacutes par le systegraveme SI-DEP

Le nombre de reproduction au niveau de la France meacutetropolitaine est de 105 (intervalle de confiance (IC95 1003-1090) (Tableau 3) et est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (R effectif=090 IC95 086-094) Cet indicateur est significatif en France meacutetropolitaine

Quatre reacutegions ont un nombre de reproduction R estimeacute supeacuterieur agrave 1 de faccedilon significative en Guyane (R=114 IC95 108-121) en diminution pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Nouvelle-Aquitaine (R=132 IC95 104-164) Pays-de-la-Loire (R= 152 IC95 131-173) et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (R = 124 IC95 105-146)

Les reacutegions Bretagne (107 IC95 072-149) Hauts-de-France (106 IC95 094-118) Ile-de-France

(106 IC95 099-113) Normandie (100 IC95 083-117) et La Reacuteunion (147 IC95 093-214) ont des estimations supeacuterieures agrave 1 mais non significativement supeacuterieures (valeur laquo 1 raquo comprise dans lrsquointervalle de confiance) (Tableau 3)

Tableau 3 Nombre de reproduction effectif (R effectif) agrave partir des tests PCR positifs au SARS-COV-2

par reacutegion France entiegravere sur 7 jours glissants du 28 juin au 4 juillet 2020 (Source SI-DEP)

NC le taux de reproduction nrsquoest pas calculable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am

J Epidemiol 2013 178 pp 1505-1512

Reacutegions R effectif Intervalle de confiance (95)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 098 086-112

Bourgogne-Franche-Comteacute 098 074-124

Bretagne 107 072-149

Centre-Val de Loire 097 075-121

Corse NC NC

Grand Est 078 066-091

Hauts-de-France 106 094-118

Ile-de-France 106 099-113

Normandie 100 083-117

Nouvelle-Aquitaine 132 104-164

Occitanie 097 081-115

Pays de la Loire 152 131-173

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 124 105-146

France meacutetropolitaine 105 1003-1094

Guadeloupe NC

La Reacuteunion NC

Martinique NC

Mayotte 076 061-092

Guyane 114 108-121

Situation au 7 juillet 2020 Page 16 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC)

Depuis le 1er mars 2020 1 508 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 105 152 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 4)

minus Lrsquoacircge meacutedian des patients est de 72 ans et 53 sont des hommes

minus 19 457 patients sont deacuteceacutedeacutes 71 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 59 eacutetaient des hommes

minus 77 655 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 07 juillet 2020 7 594 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 538 cas en reacuteanimation

Tableau 4 Nombre de personnes hospitaliseacutees et en reacuteanimation pour COVID-19 le 07 juillet 2020 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars par classe drsquoacircge et par reacutegion France (source SI-VIC)

Figure 16 Evolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 07 juillet France (source SI-VIC)

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

du 10 juin au 16 juin

Surveillance en milieu hospitalier

du 17 juin au 23 juin du 24 juin au 30 juin du 1er au 7 juillet

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 4: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 4 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Associations SOS Meacutedecins

Depuis le 3 mars 2020 60 613 actes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID 19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 523 actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes par les associations SOS Meacutedecins ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode Ce nombre drsquoactes eacutetait en hausse pour la seconde semaine conseacutecutive soit +41 par rapport agrave S26 (1 082 actes) tous acircges confondus

Cette augmentation est plus marqueacutee chez les enfants de moins de 15 ans (397 actes en S27 vs 235 en S26 soit +69) Cette tendance agrave la hausse peut srsquoexpliquer par la reprise de lrsquoeacutecole qui a eu lieu avant les vacances scolaires drsquoeacuteteacute et pour laquelle le retour agrave la collectiviteacute a favoriseacute les tableaux respiratoires (notamment les pathologies ORL) qui eacutetaient agrave la hausse chez les enfants (+106 en S27 par rapport agrave la S26) Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave appliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter le nombre de demandes de tests pour COVID-19 et par conseacutequent le nombre drsquoactes codeacutes comme suspicion de COVID-19

La part des actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 dans lrsquoactiviteacute totale tous acircges confondus eacutetait en leacutegegravere hausse 27 en S27 vs 21 en S26 (Figure 1)

En reacutegion les hausses observeacutees (tous acircges confondus) srsquoeacutetendent de +118 agrave +16 sur 10 reacutegions (Centre Val-de-Loire Nouvelle-Aquitaine Hauts-de-France Bretagne Auvergne Rhocircne-Alpes Occitanie Ile-de-France Provence-Alpes-Cocircte dAzur Pays de La Loire et Grand-Est) Parmi ces reacutegions ce sont lrsquoIle-de-France (22) et lrsquoAuvergne-Rhocircne-Alpes (15) qui comptent le plus drsquoactes pour suspicion de COVID-19 parmi ceux enregistreacutes au niveau national

Figure 1 Nombre drsquoactes SOS Meacutedecins et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et par classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier 2020 et depuis le 1

er juin 2020 France (source SOS Meacutedecins)

Figure 2 Taux drsquoactes meacutedicaux hebdomadaires pour 10 000 actes pour suspicion de COVID-19 semaine 27 (source SOS Meacutedecins)

Pour en savoir plus sur les donneacutees SOS Meacutedecins consulter GEODES

Situation au 7 juillet 2020 Page 5 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance virologique

Les objectifs de la surveillance virologique baseacutee sur les laboratoires sont de suivre lrsquoeacutevolution des taux de positiviteacute des tests dans le temps par reacutegion ou par deacutepartement ainsi que le nombre de patients positifs pour le SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population (taux drsquoincidence) Les donneacutees sont consolideacutees dans le temps Ces indicateurs associeacutes aux autres permettent de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie Jusqursquoagrave la semaine 19 la surveillance virologique srsquoest appuyeacutee sur les donneacutees non exhaustives transmises agrave Santeacute publique France par le reacuteseau 3 Labo (Cerba Eurofins-Biomnis Inovie) et par les laboratoires hospitaliers Depuis la se-maine 20 elle srsquoappuie sur le systegraveme SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) opeacuterationnel depuis le 13 mai 2020 et dont la monteacutee en charge a eacuteteacute progressive Ce nouveau systegraveme de surveillance vise au suivi exhaustif de lrsquoensemble des patients testeacutes en France dans les laboratoires de ville et dans les laboratoires hospitaliers Actuellement les donneacutees trans-mises concernent les tests RT-PCR reacutealiseacutes

Au 07 juillet la quasi-totaliteacute des laboratoires (5 485 sites de preacutelegravevements) a transmis des donneacutees

Du 28 juin au 4 juillet 2020 300 817 patients ont eacuteteacute testeacutes pour le SARS-CoV-2 et le test eacutetait positif pour 3 797 patients Le taux de positiviteacute national hebdomadaire eacutetait de 13 (calculeacute sur les tests valides) Le taux national est en diminution par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (14) Ce taux de positiviteacute en France meacutetropolitaine eacutetait en leacutegegravere diminution par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (08 vs 09) (Figure 3)

Pour en savoir plus sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

En France meacutetropolitaine le taux de positiviteacute eacutetait infeacuterieur agrave 5 dans lrsquoensemble des deacutepartements sauf en Mayenne ougrave ce taux eacutetait de 85 Des clusters sont en cours drsquoinvestigation dans ce deacutepartement dont un preacutesentant une diffusion communautaire des deacutepistages sont en cours pour la semaine S28 (Figure 4)

Du 28 juin au 4 juillet 2020 le taux drsquoincidence (nombre de nouveaux cas rapporteacutes agrave la population pour 100 000 habitants) eacutetait de 56100 000 habitants au niveau national (52100 000 h en semaine 26) et de 35100 000 h en meacutetropole (32100 000 h en semaine 26) Il eacutetait infeacuterieur agrave 10100 000 h dans tous les

deacutepartements de France meacutetropolitaine sauf pour la Mayenne (45100 000 h) (Figure 5)

En outre-mer

minus A Mayotte en semaine 27 le taux de positiviteacute eacutetait de 114 (vs183 en S26) et le taux drsquoincidence de

34100 000 habitants (vs 46100 000 h en S26) valeurs agrave la baisse

minus En Guyane en semaine 27 le taux de positiviteacute eacutetait de 265 (vs 255 en S26) et le taux drsquoincidence de 458100 000 habitants (vs 436100 000 h en S26) valeurs agrave la hausse

Figure 3 Nombre de tests reacutealiseacutes nombre de tests positifs pour le SARS-CoV-2 et taux de positiviteacute

dans les laboratoires par semaine France 2020 (source S9-S19 3 Labo et laboratoires hospitaliers

depuis S20 SI-DEP)

Situation au 7 juillet 2020 Page 6 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du 28 juin au 4 juillet 2020 le taux de deacutepistage (nombre de patients testeacutes pour SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) eacutetait de 448 pour 100 000 habitants au niveau national (Figure 6) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage du 21 au 27 juin 2020 eacutetaient la Meurthe-et-Moselle (892100 000 h) le Calvados (720100 000 h) la Seine-Maritime (702100 000 h) et les Bouches-du-Rhocircne (698100 000 h) (Figure 6bis) Le nombre de patients testeacutes en France meacutetropolitaine est en augmentation (+26 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente)

En outre-mer le plus fort taux de deacutepistage a eacuteteacute observeacute en Guyane (1 729100 000 habitants) A Mayotte le taux de deacutepistage eacutetait de 297100 000 h Le nombre de patients testeacutes en outre-mer est en augmentation (+13 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente)

Au niveau national le nombre de patients testeacutes est en augmentation sur les derniegraveres semaines (179 897 en S25 244 231 en S26 et 304 049 en S27)

Figure 4 Taux de positiviteacute des personnes

testeacutees pour le SARS-CoV-2 par deacutepartement

France 28 juin au 4 juillet 2020 (source SI-DEP)

Figure 5 Taux drsquoincidence de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 pour 100 000 habitants par deacutepartement France 28 juin au 4 juillet 2020 (source SI-DEP)

Figure 6bis Taux de deacutepistage ( 100 000 habi-

tants) pour le SARS-CoV-2 par deacutepartement

France du 28 juin au 4 juillet (source SI-DEP)

Figure 6 Evolution du taux de deacutepistage ( 100 000 habi-

tants) pour le SARS-CoV-2 par semaine depuis le 13 mai

2020 France (source SI-DEP)

Situation au 7 juillet 2020 Page 7 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance en population COVIDnetfr

GrippeNetfr est un reacuteseau de surveillance mis en place en janvier 2012 par le reacuteseau Sentinelles (Inserm ndash Sorbonne Universiteacute) et Santeacute publique France avec pour objectif de recueillir directement aupregraves de la population des donneacutees eacutepideacutemiologiques sur les syndromes grippaux par internet et de faccedilon anonyme Il permet drsquoeacutetudier les symptocircmes preacutesenteacutes par les personnes malades qui nrsquoont pas recours au systegraveme de soins Depuis le 30 mars 2020 le projet GrippeNetfr sest adapteacute agrave la surveillance du COVID-19 et est devenu COVIDnetfr Pregraves de 6 000 personnes remplissent actuellement chaque semaine un questionnaire rapportant les symptocircmes qursquoelles ont eacuteventuellement eus depuis leur derniegravere connexion 12 133 personnes ont rempli au moins un questionnaire depuis le deacutebut de la saison hivernale 2019-2020

Pour la semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 5 011 questionnaires hebdomadaires ont eacuteteacute remplis

En semaine 27 la proportion de participants ayant deacuteclareacute des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 (deacutefinition sappuyant sur les recommandations du Haut Conseil de la santeacute publique concernant la prescription dun test diagnostique par un meacutedecin) eacutetait de 10 [06 14] stable par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (Figure 7)

La surveillance GrippeNetfrCOVIDnetfr srsquoachegravevera dimanche 12 juillet et reprendra en fin deacuteteacute ou deacutebut dautomne en fonction de lrsquoeacutevolution de leacutepideacutemie de COVID-19 Les donneacutees de la derniegravere semaine de surveillance de la saison seront publieacutees la semaine prochaine

Figure 7 Proportion ( redresseacute) de participants ayant deacuteclareacute des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 par semaine (donneacutees du 24 feacutevrier au 5 juillet 2020 source COVIDnetfr)

Note Deux nouveaux symptocircmes anosmie et agueusie ont eacuteteacute ajouteacutes au questionnaire hebdomadaire en semaine 14 afin dameacuteliorer le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Les donneacutees de la cohorte COVIDnetfr montrent que seules 46 en moyenne des personnes ayant deacuteclareacute des symptocircmes drsquoinfection respiratoire aigueuml ont consulteacute un meacutedecin Ce pourcentage a peu varieacute au cours de la peacuteriode eacutepideacutemique et depuis la leveacutee du confinement De plus il apparait que seules 17 en moyenne des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et que seules 12 (soit 71 des personnes avec prescription drsquoun test) ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Parmi les personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 et ayant consulteacute un meacutedecin geacuteneacute-raliste seuls 39 auraient reccedilu une prescription pour un test diagnostique Ces reacutesultats sont agrave interpreacuteter avec preacutecaution car les donneacutees ne sont pas redresseacutees par rapport agrave la population franccedilaise et sont soumises agrave des fluctuations importantes drsquoune semaine agrave lrsquoautre en raison de faibles effectifs

Ils suggegraverent cependant que le recours aux soins pour suspicion de COVID-19 ainsi que la reacutealisation

des tests RT-PCR agrave viseacutee de diagnostic sont aujourdrsquohui tregraves insuffisants chez les personnes

symptomatiques

Situation au 7 juillet 2020 Page 8 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Cas confirmeacutes de COVID-19

Les donneacutees permettant drsquoestimer le nombre de cas confirmeacutes en France sont issues de plusieurs sources

Entre le 21 janvier et le 25 mars 2020 25 233 cas de COVID-19 ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France via lrsquoapplication GoData ou par transmission des cellules reacutegionales de Santeacute publique France

Entre le 26 mars et le 12 mai 2020 115 010 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes (cas incidents hospitaliers et cas positifs en laboratoire) par les remonteacutees des donneacutees de laboratoires de biologie meacutedicale (source 3 Labo) et des patients hospitaliseacutes pour COVID-19 (source SI-VIC)

Depuis le 13 mai 2020 les cas de COVID-19 sont rapporteacutes par le Systegraveme drsquoInformation de Deacutepistage (SI-DEP) permettant une estimation agrave viseacutee exhaustive des nombres de cas confirmeacutes en France Entre le 13 mai et le 7 juillet 2020 28 567 cas ont eacuteteacute rapporteacutes dans SI-DEP

Il est ainsi estimeacute un total de 168 810 cas confirmeacutes de COVID-19 en France au 07 juillet 2020

De la semaine 15 agrave la semaine 24 le nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes a eacuteteacute en diminution passant de 30 111 cas confirmeacutes en S14 agrave 2 949 cas en S24 Neacuteanmoins depuis la semaine 24 le nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes est agrave nouveau en augmentation passant de 2 949 cas confirmeacutes en S24 agrave 3 684 cas en S27 (Figure 8) On peut notamment expliquer cette augmentation par la situation eacutepideacute-miologique en Guyane Le nombre de cas confirmeacutes en France meacutetropolitaine est eacutegalement en augmenta-tion entre le S26 et la S27 (+290 cas +14) et est en partie lieacutee agrave une augmentation des cas en Mayenne

Au cours de la vague eacutepideacutemique et jusqursquoagrave la leveacutee des mesures de confinement de la population tous les patients preacutesentant des signes de COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer une infection (recommandations ministeacuterielles du 13 mars 2020) Le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France eacutetait donc supeacuterieur au nombre estimeacute de cas confirmeacutes pendant cette peacuteriode Depuis le deacuteconfinement il est demandeacute que les patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 ainsi que les sujets contacts drsquoun cas confirmeacute soient deacutepisteacutes pour le SARS-CoV-2 [1] A compter de cette date et gracircce au systegraveme SI-DEP le nombre de cas confirmeacutes permet deacutesormais theacuteoriquement drsquoestimer le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France Ce nombre peut cependant ecirctre sous-estimeacute du fait de lrsquoabsence de deacutepistage systeacutematique de personnes infecteacutees symptomatiques ou asymptomatiques [1] DGS-Urgent Prise en charge par les meacutedecins de ville des patients de COVID-19 en phase de

deacuteconfinement Disponible via ce lien cliquez ici

Figure 8 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine rapporteacutes agrave Santeacute publique France du 23 janvier au 4 juillet 2020 (donneacutees arrecircteacutees le 7 juillet 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 9 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Signalement agrave viseacutee drsquoalerte des clusters (ou foyers de transmission)

Preacuteambule Depuis la leveacutee du confinement les ARS en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France et les

partenaires locaux investiguent les clusters deacutetecteacutes selon le guide en vigueur [1] Le traccedilage et le deacutepistage des

personnes contacts permettent de controcircler ces foyers Un cluster est deacutefini par la survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes

ou probables dans une peacuteriode de 7 jours et qui appartiennent agrave une mecircme communauteacute ou ont participeacute agrave un mecircme

rassemblement de personnes qursquoils se connaissent ou non Le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute

publique France permet de preacutesenter ce bilan

Cluster hors Ehpad et milieu familial restreint

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 333 clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) rapporteacutes depuis le

9 mai 313 clusters en France meacutetropolitaine et 20 dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (Figures 9 et 10) Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est stable sur les 5 derniegraveres semaines (S23

- S27) et reste infeacuterieur aux nombres observeacutes sur les semaines S20 agrave S22 Au 8 juillet 68 clusters eacutetaient

toujours en cours drsquoinvestigation

Moins drsquoun quart des clusters signaleacutes depuis le 9 mai sont encore en cours drsquoinvestigation (204

n=68) 126 sont maitriseacutes (suivi des contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le

dernier cas) 622 sont clocirctureacutes (absence de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du

dernier cas ET la fin de la quatorzaine des contacts) Des clusters (48) ont diffuseacute dans la communauteacute

Les 15 clusters en Guyane sont consideacutereacutes agrave diffusion communautaire En France meacutetropolitaine 2

clusters sont en diffusion communautaire 1 en Normandie et 1 en Pays de Loire En termes de criticiteacute (potentiel de transmission ou critegraveres de graviteacute) 79 des clusters sont de criticiteacute

modeacutereacutee (44) agrave eacuteleveacutee (35) Parmi ceux qui restent en cours drsquoinvestigation 31 ont une criticiteacute eacuteleveacutee

Les clusters concernent notamment des eacutetablissements de santeacute (22) des entreprises (18 en entreprises

priveacutees et publiques hors santeacute) et des personnes en situation de preacutecariteacute et de vulneacuterabiliteacute (14 en

eacutetablissements drsquoheacutebergement social et drsquoinsertion et 5 en communauteacutes vulneacuterables) (Tableau 1)

La majoriteacute (70) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 153 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 333 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 5 111 cas

Figure 9 Distribution du nombre de clusters selon leur statut (hors Ehpad et milieu familial restreint) et

du nombre de cas (tous clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020

(N=333) au 8 juillet 2020 (Source MONIC)

[1] Pour en savoir plus Guide pour lidentification et linvestigation de situations de cas groupeacutes de COVID-19

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 10 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 1 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) par type de collectiviteacute

inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=333) (Source MONIC)

Figure 10 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) en cours drsquoinvestigation

par deacutepartement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet juin 2020 (N=68) (Source MONIC)

ES eacutetablissement de santeacute EMS eacutetablissement meacutedico-social

Pour en savoir plus sur les donneacutees reacutegionales consulter Santeacute publique France

Type de collectiviteacutes

Ensemble des

clusters

Clusters en

cours dinvesti-

gation

N=333 N=68

Etablissements de santeacute 74 222 3 44

Entreprises priveacutees et publiques (hors ES) 60 180 17 250

Etablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion 48 144 10 147

Milieu familial eacutelargi (concerne plusieurs foyers familiaux) 43 129 14 206

Milieu scolaire et universitaire 17 51 6 88

EMS de personnes handicapeacutees 16 48 1 15

Communauteacutes vulneacuterables (gens du voyage migrants en situation preacutecaire etc) 16 48 3 44

Uniteacute geacuteographique de petite taille (suggeacuterant exposition commune) 11 33 2 29

Evegravenement public ou priveacute rassemblements temporaires de personnes 9 27 5 74

Etablissement peacutenitentiaires 5 15 0 00

Cregraveches 4 12 0 00

Transport (avion bateau train) 4 12 2 29

Structure de laide sociale agrave lenfance 2 06 0 00

Structures de soins reacutesidentiels des personnes sans domicile fixe 0 00 0 00

Autre 24 72 5 74

Situation au 7 juillet 2020 Page 11 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Clusters en Ehpad

Parallegravelement aux dispositifs de surveillance mis en place dans les ESMS (cf page 12) les eacutepisodes

reacutepondant agrave la deacutefinition de cas drsquoun cluster (survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes ou probables dans une

peacuteriode de 7 jours) sont inteacutegreacutes dans le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute publique

France

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 104 clusters inclus depuis le 9 mai (Figure 11) Le nombre

hebdomadaire de clusters signaleacutes en Ehpad est en nette diminution depuis la semaine 23

Au 8 juillet 87 (n=9) clusters sont encore en cours drsquoinvestigation 163 sont maitriseacutes (suivi des

contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le dernier cas) et 750 sont clocirctureacutes (absence

de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du dernier cas ET la fin de la quatorzaine des

contacts)

La majoriteacute (67) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 13 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 104 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 1 298 cas

De par la nature de cette collectiviteacute lrsquointeacutegraliteacute des clusters en Ehpad est de criticiteacute eacuteleveacutee

Figure 11 Distribution du nombre de clusters en Ehpad selon leur statut et du nombre de cas (tous

clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=104) au 8 juillet 2020

(Source MONIC)

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 12 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS)

Entre le 1er mars et le 06 juillet 2020 8 032 signalements rapportaient un ou plusieurs cas de COVID-19 deacuteclareacutes dans le portail national des signalements de Santeacute publique France et le portail de lrsquoARS Ile-de-France

Il srsquoagissait de 5 051 (63 ) signalements provenant drsquoeacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD EHPA et autres eacutetablissements) et 2 981 (37 ) drsquoautres eacutetablissements meacutedico-sociaux (ESMS)

Parmi les 8 032 signalements (Tableau 2)

minus 39 256 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents

minus 10 476 cas sont deacuteceacutedeacutes dans lrsquoeacutetablissement drsquoaccueil dont 10 390 (99 ) dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

minus 3 916 cas sont deacuteceacutedeacutes agrave lrsquohocircpital

minus 20 391 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes parmi les membres du personnel des ESMS

Depuis le 1er mars et jusqursquoau 06 juillet 2020 parmi les 5 051 signalements en eacutetablissements drsquoheacutebergements pour personnes acircgeacutees (EHPA) 3 379 eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Au cours des deux semaines S26 et S27 (du 22 juin au 5 juillet) parmi lrsquoensemble des EHPA en France (Ile-de-France exclue) 38 eacutetablissements (04) ont deacuteclareacute au moins un nouveau cas confirmeacute de COVID-19 parmi les reacutesidents ou le personnel Sur la mecircme peacuteriode parmi les EHPA en France (Ile-de-France exclue) 22 (02) eacutetablissements ont signaleacute un nouvel eacutepisode (date de deacutebut des signes du premier cas ou agrave deacutefaut date de signalement comprise entre le 22 juin et le 5 juillet) avec au moins un cas confirmeacute

Tableau 2 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoeacutetablissement chez les reacutesidents et le personnel dans les ESMS rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 France

Depuis le 29 juin les nombres de signalements et de deacutecegraves chez les reacutesidents ont diminueacute et ceci est ducirc agrave linfirmation deacutepisodes apregraves

investigation (8 271 signalements et 10 497 deacutecegraves en eacutetablissement avaient eacuteteacute rapporteacutes dans le bulletin de la semaine preacuteceacutedente)

1Etablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres eacutetablissements-EHPA reacutesidences autonomie reacutesidences seniors)

2Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (FAM IME autres eacutetablissements pour enfants (ITEP EAAP IEM Instituts pour deacuteficient auditifs et

visuels) autre eacutetablissements pour adultes (foyer de vie foyer drsquoheacutebergement) 3Aide sociale agrave lrsquoenfance (centres deacutepartementaux de lrsquoenfance

foyers de lrsquoenfance MECS) 4Autres eacutetablissements (LAM LHSS SCAPA avec heacutebergement) 5Un signalement COVID-19 est deacutefini par la

survenue drsquoau moins un cas COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas confirmeacute COVID-19 toute personne symptomatique ou non avec un

preacutelegravevement confirmant lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 parmi les personnes reacutesidentes ou les membres du personnel drsquoun ESMSEHPA 7Cas pos-

sibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Du fait du deacutelai court entre le signalement par les eacutetablissements et la production du point eacutepideacutemiologique les donneacutees les plus reacutecentes ne sont pas consolideacutees Les processus drsquoassurance qualiteacute mis en place au niveau reacutegional peuvent conduire agrave des corrections ulteacuterieures de donneacutees A noter que depuis le 01 juillet 2020 les ESMS drsquoIle-de-France ont commenceacute agrave deacuteclarer leurs eacutepisodes via lrsquoapplication de Santeacute publique France Les donneacutees drsquoIle-de-France sont agrave interpreacuteter avec prudence en attendant que le transfert de donneacutees soit stabiliseacute De plus apregraves investigation 333 eacutepisodes ont eacuteteacute infirmeacutes ce qui influence le nombre de signalements mais peu le nombre de deacutecegraves et pas le nombre de cas confirmeacutes

EHPA1 HPH2

Aide en-

fance3 Autres4 Total

Signalements5 5 051 2 290 367 324 8 032

Chez les

reacutesidents

Cas confirmeacutes6 34 688 3 946 164 458 39 256

Deacutecegraves hocircpitaux7 3 691 204 0 21 3 916

Deacutecegraves eacutetablissements7 10 390 75 0 11 10 476

Chez le

personnel Cas confirmeacutes6 16 522 3 404 279 186 20 391

Situation au 7 juillet 2020 Page 13 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 12 Nombre de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 (n=6 484) par date de deacutebut des signes du premier cas du 1er mars au 6 juillet 2020 France (hors Ile-de-France)

Figure 13 Nombre moyen (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 en France hors

Ile-de-France

Apregraves la deacutecroissance observeacutee depuis deacutebut avril le nombre de signalements reste tregraves faible depuis deacutebut mai il est infeacuterieur agrave 10 signalements par jour depuis au moins 30 jours en France hors

Ile-de-France (Figure 12)

Le nombre de deacutecegraves chez les reacutesidents en eacutetablissement et agrave lrsquohocircpital a atteint un pic deacutebut avril et deacutecroicirct continuellement depuis ce nombre varie entre 0 et 13 deacutecegraves par jour depuis le 1er Juin et eacutetait toujours infeacuterieur agrave 5 deacutecegraves par jour cette derniegravere semaine en France hors Ile-de-France (Figure 13)

Situation au 7 juillet 2020 Page 14 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (Reacuteseau OSCOUR

reg)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 330 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont

eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode repreacutesentant 05 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence du reacuteseau OSCOURreg

Ces passages eacutetaient en leacutegegravere baisse de 5 par rapport agrave la semaine 26 avec une part drsquoactiviteacute stable (1 402 passages et 05 de lrsquoactiviteacute totale en S26 ndash donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020) (Figure 14)

En semaine 27 sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 enregistreacutes au niveau national 21 ont eacuteteacute enregistreacutes en Icircle-de-France 16 en Guyane 8 en Auvergne Rhocircne-Alpes et 8 en Bretagne

En semaine 27 les passages aux urgences eacutetaient en baisse ou se maintenaient agrave un niveau bas pour la 14egraveme semaine conseacutecutive au niveau national et reacutegional (Figure 15) Chez les enfants on observait une seconde semaine conseacutecutive de hausse dans de faibles effectifs (+26 passages soit +31)

La proportion drsquohospitalisations apregraves passage pour suspicion de COVID-19 indicateur de graviteacute agrave lrsquoarriveacutee aux urgences eacutetait en leacutegegravere baisse agrave 35 en semaine S27 (versus 36 en S26 - donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020)

Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 171 631 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

Figure 14 Nombre de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier et depuis le 1er juin 2020 France (source OSCOURreg)

Figure 15 Taux hebdomadaires de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences semaine 27 France (source OSCOURreg)

Situation au 7 juillet 2020 Page 15 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission A partir de cette semaine les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests PCR positifs) en remplacement de lrsquoindicateur R calculeacute agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) Lrsquoavantage de cet indicateur est de repo-ser sur les donneacutees des cas confirmeacutes de COVID-19 et de srsquoappuyer sur un recours au test qui a vocation agrave intervenir rapidement apregraves la survenue des signes eacutevocateurs de COVID-19 Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Le R effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Le nombre de tests positifs peut ecirctre influenceacute par les actions locales de deacutepistage en particulier en cas drsquoidentification de clusters qui permettent drsquoidentifier des infections asymptomatiques Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais doivent ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Les estimations du nombre de reproduction sont baseacutees sur les nombre de tests PCR positifs au SARS-CoV-2 reacutealiseacutes entre le 21 juin et le 27 juin 2020 remonteacutes par le systegraveme SI-DEP

Le nombre de reproduction au niveau de la France meacutetropolitaine est de 105 (intervalle de confiance (IC95 1003-1090) (Tableau 3) et est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (R effectif=090 IC95 086-094) Cet indicateur est significatif en France meacutetropolitaine

Quatre reacutegions ont un nombre de reproduction R estimeacute supeacuterieur agrave 1 de faccedilon significative en Guyane (R=114 IC95 108-121) en diminution pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Nouvelle-Aquitaine (R=132 IC95 104-164) Pays-de-la-Loire (R= 152 IC95 131-173) et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (R = 124 IC95 105-146)

Les reacutegions Bretagne (107 IC95 072-149) Hauts-de-France (106 IC95 094-118) Ile-de-France

(106 IC95 099-113) Normandie (100 IC95 083-117) et La Reacuteunion (147 IC95 093-214) ont des estimations supeacuterieures agrave 1 mais non significativement supeacuterieures (valeur laquo 1 raquo comprise dans lrsquointervalle de confiance) (Tableau 3)

Tableau 3 Nombre de reproduction effectif (R effectif) agrave partir des tests PCR positifs au SARS-COV-2

par reacutegion France entiegravere sur 7 jours glissants du 28 juin au 4 juillet 2020 (Source SI-DEP)

NC le taux de reproduction nrsquoest pas calculable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am

J Epidemiol 2013 178 pp 1505-1512

Reacutegions R effectif Intervalle de confiance (95)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 098 086-112

Bourgogne-Franche-Comteacute 098 074-124

Bretagne 107 072-149

Centre-Val de Loire 097 075-121

Corse NC NC

Grand Est 078 066-091

Hauts-de-France 106 094-118

Ile-de-France 106 099-113

Normandie 100 083-117

Nouvelle-Aquitaine 132 104-164

Occitanie 097 081-115

Pays de la Loire 152 131-173

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 124 105-146

France meacutetropolitaine 105 1003-1094

Guadeloupe NC

La Reacuteunion NC

Martinique NC

Mayotte 076 061-092

Guyane 114 108-121

Situation au 7 juillet 2020 Page 16 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC)

Depuis le 1er mars 2020 1 508 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 105 152 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 4)

minus Lrsquoacircge meacutedian des patients est de 72 ans et 53 sont des hommes

minus 19 457 patients sont deacuteceacutedeacutes 71 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 59 eacutetaient des hommes

minus 77 655 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 07 juillet 2020 7 594 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 538 cas en reacuteanimation

Tableau 4 Nombre de personnes hospitaliseacutees et en reacuteanimation pour COVID-19 le 07 juillet 2020 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars par classe drsquoacircge et par reacutegion France (source SI-VIC)

Figure 16 Evolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 07 juillet France (source SI-VIC)

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

du 10 juin au 16 juin

Surveillance en milieu hospitalier

du 17 juin au 23 juin du 24 juin au 30 juin du 1er au 7 juillet

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 5: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 5 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance virologique

Les objectifs de la surveillance virologique baseacutee sur les laboratoires sont de suivre lrsquoeacutevolution des taux de positiviteacute des tests dans le temps par reacutegion ou par deacutepartement ainsi que le nombre de patients positifs pour le SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population (taux drsquoincidence) Les donneacutees sont consolideacutees dans le temps Ces indicateurs associeacutes aux autres permettent de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie Jusqursquoagrave la semaine 19 la surveillance virologique srsquoest appuyeacutee sur les donneacutees non exhaustives transmises agrave Santeacute publique France par le reacuteseau 3 Labo (Cerba Eurofins-Biomnis Inovie) et par les laboratoires hospitaliers Depuis la se-maine 20 elle srsquoappuie sur le systegraveme SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) opeacuterationnel depuis le 13 mai 2020 et dont la monteacutee en charge a eacuteteacute progressive Ce nouveau systegraveme de surveillance vise au suivi exhaustif de lrsquoensemble des patients testeacutes en France dans les laboratoires de ville et dans les laboratoires hospitaliers Actuellement les donneacutees trans-mises concernent les tests RT-PCR reacutealiseacutes

Au 07 juillet la quasi-totaliteacute des laboratoires (5 485 sites de preacutelegravevements) a transmis des donneacutees

Du 28 juin au 4 juillet 2020 300 817 patients ont eacuteteacute testeacutes pour le SARS-CoV-2 et le test eacutetait positif pour 3 797 patients Le taux de positiviteacute national hebdomadaire eacutetait de 13 (calculeacute sur les tests valides) Le taux national est en diminution par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (14) Ce taux de positiviteacute en France meacutetropolitaine eacutetait en leacutegegravere diminution par rapport agrave celui de la semaine preacuteceacutedente (08 vs 09) (Figure 3)

Pour en savoir plus sur les donneacutees SI-DEP consulter GEODES

En France meacutetropolitaine le taux de positiviteacute eacutetait infeacuterieur agrave 5 dans lrsquoensemble des deacutepartements sauf en Mayenne ougrave ce taux eacutetait de 85 Des clusters sont en cours drsquoinvestigation dans ce deacutepartement dont un preacutesentant une diffusion communautaire des deacutepistages sont en cours pour la semaine S28 (Figure 4)

Du 28 juin au 4 juillet 2020 le taux drsquoincidence (nombre de nouveaux cas rapporteacutes agrave la population pour 100 000 habitants) eacutetait de 56100 000 habitants au niveau national (52100 000 h en semaine 26) et de 35100 000 h en meacutetropole (32100 000 h en semaine 26) Il eacutetait infeacuterieur agrave 10100 000 h dans tous les

deacutepartements de France meacutetropolitaine sauf pour la Mayenne (45100 000 h) (Figure 5)

En outre-mer

minus A Mayotte en semaine 27 le taux de positiviteacute eacutetait de 114 (vs183 en S26) et le taux drsquoincidence de

34100 000 habitants (vs 46100 000 h en S26) valeurs agrave la baisse

minus En Guyane en semaine 27 le taux de positiviteacute eacutetait de 265 (vs 255 en S26) et le taux drsquoincidence de 458100 000 habitants (vs 436100 000 h en S26) valeurs agrave la hausse

Figure 3 Nombre de tests reacutealiseacutes nombre de tests positifs pour le SARS-CoV-2 et taux de positiviteacute

dans les laboratoires par semaine France 2020 (source S9-S19 3 Labo et laboratoires hospitaliers

depuis S20 SI-DEP)

Situation au 7 juillet 2020 Page 6 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du 28 juin au 4 juillet 2020 le taux de deacutepistage (nombre de patients testeacutes pour SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) eacutetait de 448 pour 100 000 habitants au niveau national (Figure 6) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage du 21 au 27 juin 2020 eacutetaient la Meurthe-et-Moselle (892100 000 h) le Calvados (720100 000 h) la Seine-Maritime (702100 000 h) et les Bouches-du-Rhocircne (698100 000 h) (Figure 6bis) Le nombre de patients testeacutes en France meacutetropolitaine est en augmentation (+26 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente)

En outre-mer le plus fort taux de deacutepistage a eacuteteacute observeacute en Guyane (1 729100 000 habitants) A Mayotte le taux de deacutepistage eacutetait de 297100 000 h Le nombre de patients testeacutes en outre-mer est en augmentation (+13 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente)

Au niveau national le nombre de patients testeacutes est en augmentation sur les derniegraveres semaines (179 897 en S25 244 231 en S26 et 304 049 en S27)

Figure 4 Taux de positiviteacute des personnes

testeacutees pour le SARS-CoV-2 par deacutepartement

France 28 juin au 4 juillet 2020 (source SI-DEP)

Figure 5 Taux drsquoincidence de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 pour 100 000 habitants par deacutepartement France 28 juin au 4 juillet 2020 (source SI-DEP)

Figure 6bis Taux de deacutepistage ( 100 000 habi-

tants) pour le SARS-CoV-2 par deacutepartement

France du 28 juin au 4 juillet (source SI-DEP)

Figure 6 Evolution du taux de deacutepistage ( 100 000 habi-

tants) pour le SARS-CoV-2 par semaine depuis le 13 mai

2020 France (source SI-DEP)

Situation au 7 juillet 2020 Page 7 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance en population COVIDnetfr

GrippeNetfr est un reacuteseau de surveillance mis en place en janvier 2012 par le reacuteseau Sentinelles (Inserm ndash Sorbonne Universiteacute) et Santeacute publique France avec pour objectif de recueillir directement aupregraves de la population des donneacutees eacutepideacutemiologiques sur les syndromes grippaux par internet et de faccedilon anonyme Il permet drsquoeacutetudier les symptocircmes preacutesenteacutes par les personnes malades qui nrsquoont pas recours au systegraveme de soins Depuis le 30 mars 2020 le projet GrippeNetfr sest adapteacute agrave la surveillance du COVID-19 et est devenu COVIDnetfr Pregraves de 6 000 personnes remplissent actuellement chaque semaine un questionnaire rapportant les symptocircmes qursquoelles ont eacuteventuellement eus depuis leur derniegravere connexion 12 133 personnes ont rempli au moins un questionnaire depuis le deacutebut de la saison hivernale 2019-2020

Pour la semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 5 011 questionnaires hebdomadaires ont eacuteteacute remplis

En semaine 27 la proportion de participants ayant deacuteclareacute des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 (deacutefinition sappuyant sur les recommandations du Haut Conseil de la santeacute publique concernant la prescription dun test diagnostique par un meacutedecin) eacutetait de 10 [06 14] stable par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (Figure 7)

La surveillance GrippeNetfrCOVIDnetfr srsquoachegravevera dimanche 12 juillet et reprendra en fin deacuteteacute ou deacutebut dautomne en fonction de lrsquoeacutevolution de leacutepideacutemie de COVID-19 Les donneacutees de la derniegravere semaine de surveillance de la saison seront publieacutees la semaine prochaine

Figure 7 Proportion ( redresseacute) de participants ayant deacuteclareacute des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 par semaine (donneacutees du 24 feacutevrier au 5 juillet 2020 source COVIDnetfr)

Note Deux nouveaux symptocircmes anosmie et agueusie ont eacuteteacute ajouteacutes au questionnaire hebdomadaire en semaine 14 afin dameacuteliorer le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Les donneacutees de la cohorte COVIDnetfr montrent que seules 46 en moyenne des personnes ayant deacuteclareacute des symptocircmes drsquoinfection respiratoire aigueuml ont consulteacute un meacutedecin Ce pourcentage a peu varieacute au cours de la peacuteriode eacutepideacutemique et depuis la leveacutee du confinement De plus il apparait que seules 17 en moyenne des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et que seules 12 (soit 71 des personnes avec prescription drsquoun test) ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Parmi les personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 et ayant consulteacute un meacutedecin geacuteneacute-raliste seuls 39 auraient reccedilu une prescription pour un test diagnostique Ces reacutesultats sont agrave interpreacuteter avec preacutecaution car les donneacutees ne sont pas redresseacutees par rapport agrave la population franccedilaise et sont soumises agrave des fluctuations importantes drsquoune semaine agrave lrsquoautre en raison de faibles effectifs

Ils suggegraverent cependant que le recours aux soins pour suspicion de COVID-19 ainsi que la reacutealisation

des tests RT-PCR agrave viseacutee de diagnostic sont aujourdrsquohui tregraves insuffisants chez les personnes

symptomatiques

Situation au 7 juillet 2020 Page 8 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Cas confirmeacutes de COVID-19

Les donneacutees permettant drsquoestimer le nombre de cas confirmeacutes en France sont issues de plusieurs sources

Entre le 21 janvier et le 25 mars 2020 25 233 cas de COVID-19 ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France via lrsquoapplication GoData ou par transmission des cellules reacutegionales de Santeacute publique France

Entre le 26 mars et le 12 mai 2020 115 010 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes (cas incidents hospitaliers et cas positifs en laboratoire) par les remonteacutees des donneacutees de laboratoires de biologie meacutedicale (source 3 Labo) et des patients hospitaliseacutes pour COVID-19 (source SI-VIC)

Depuis le 13 mai 2020 les cas de COVID-19 sont rapporteacutes par le Systegraveme drsquoInformation de Deacutepistage (SI-DEP) permettant une estimation agrave viseacutee exhaustive des nombres de cas confirmeacutes en France Entre le 13 mai et le 7 juillet 2020 28 567 cas ont eacuteteacute rapporteacutes dans SI-DEP

Il est ainsi estimeacute un total de 168 810 cas confirmeacutes de COVID-19 en France au 07 juillet 2020

De la semaine 15 agrave la semaine 24 le nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes a eacuteteacute en diminution passant de 30 111 cas confirmeacutes en S14 agrave 2 949 cas en S24 Neacuteanmoins depuis la semaine 24 le nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes est agrave nouveau en augmentation passant de 2 949 cas confirmeacutes en S24 agrave 3 684 cas en S27 (Figure 8) On peut notamment expliquer cette augmentation par la situation eacutepideacute-miologique en Guyane Le nombre de cas confirmeacutes en France meacutetropolitaine est eacutegalement en augmenta-tion entre le S26 et la S27 (+290 cas +14) et est en partie lieacutee agrave une augmentation des cas en Mayenne

Au cours de la vague eacutepideacutemique et jusqursquoagrave la leveacutee des mesures de confinement de la population tous les patients preacutesentant des signes de COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer une infection (recommandations ministeacuterielles du 13 mars 2020) Le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France eacutetait donc supeacuterieur au nombre estimeacute de cas confirmeacutes pendant cette peacuteriode Depuis le deacuteconfinement il est demandeacute que les patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 ainsi que les sujets contacts drsquoun cas confirmeacute soient deacutepisteacutes pour le SARS-CoV-2 [1] A compter de cette date et gracircce au systegraveme SI-DEP le nombre de cas confirmeacutes permet deacutesormais theacuteoriquement drsquoestimer le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France Ce nombre peut cependant ecirctre sous-estimeacute du fait de lrsquoabsence de deacutepistage systeacutematique de personnes infecteacutees symptomatiques ou asymptomatiques [1] DGS-Urgent Prise en charge par les meacutedecins de ville des patients de COVID-19 en phase de

deacuteconfinement Disponible via ce lien cliquez ici

Figure 8 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine rapporteacutes agrave Santeacute publique France du 23 janvier au 4 juillet 2020 (donneacutees arrecircteacutees le 7 juillet 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 9 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Signalement agrave viseacutee drsquoalerte des clusters (ou foyers de transmission)

Preacuteambule Depuis la leveacutee du confinement les ARS en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France et les

partenaires locaux investiguent les clusters deacutetecteacutes selon le guide en vigueur [1] Le traccedilage et le deacutepistage des

personnes contacts permettent de controcircler ces foyers Un cluster est deacutefini par la survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes

ou probables dans une peacuteriode de 7 jours et qui appartiennent agrave une mecircme communauteacute ou ont participeacute agrave un mecircme

rassemblement de personnes qursquoils se connaissent ou non Le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute

publique France permet de preacutesenter ce bilan

Cluster hors Ehpad et milieu familial restreint

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 333 clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) rapporteacutes depuis le

9 mai 313 clusters en France meacutetropolitaine et 20 dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (Figures 9 et 10) Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est stable sur les 5 derniegraveres semaines (S23

- S27) et reste infeacuterieur aux nombres observeacutes sur les semaines S20 agrave S22 Au 8 juillet 68 clusters eacutetaient

toujours en cours drsquoinvestigation

Moins drsquoun quart des clusters signaleacutes depuis le 9 mai sont encore en cours drsquoinvestigation (204

n=68) 126 sont maitriseacutes (suivi des contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le

dernier cas) 622 sont clocirctureacutes (absence de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du

dernier cas ET la fin de la quatorzaine des contacts) Des clusters (48) ont diffuseacute dans la communauteacute

Les 15 clusters en Guyane sont consideacutereacutes agrave diffusion communautaire En France meacutetropolitaine 2

clusters sont en diffusion communautaire 1 en Normandie et 1 en Pays de Loire En termes de criticiteacute (potentiel de transmission ou critegraveres de graviteacute) 79 des clusters sont de criticiteacute

modeacutereacutee (44) agrave eacuteleveacutee (35) Parmi ceux qui restent en cours drsquoinvestigation 31 ont une criticiteacute eacuteleveacutee

Les clusters concernent notamment des eacutetablissements de santeacute (22) des entreprises (18 en entreprises

priveacutees et publiques hors santeacute) et des personnes en situation de preacutecariteacute et de vulneacuterabiliteacute (14 en

eacutetablissements drsquoheacutebergement social et drsquoinsertion et 5 en communauteacutes vulneacuterables) (Tableau 1)

La majoriteacute (70) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 153 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 333 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 5 111 cas

Figure 9 Distribution du nombre de clusters selon leur statut (hors Ehpad et milieu familial restreint) et

du nombre de cas (tous clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020

(N=333) au 8 juillet 2020 (Source MONIC)

[1] Pour en savoir plus Guide pour lidentification et linvestigation de situations de cas groupeacutes de COVID-19

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 10 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 1 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) par type de collectiviteacute

inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=333) (Source MONIC)

Figure 10 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) en cours drsquoinvestigation

par deacutepartement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet juin 2020 (N=68) (Source MONIC)

ES eacutetablissement de santeacute EMS eacutetablissement meacutedico-social

Pour en savoir plus sur les donneacutees reacutegionales consulter Santeacute publique France

Type de collectiviteacutes

Ensemble des

clusters

Clusters en

cours dinvesti-

gation

N=333 N=68

Etablissements de santeacute 74 222 3 44

Entreprises priveacutees et publiques (hors ES) 60 180 17 250

Etablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion 48 144 10 147

Milieu familial eacutelargi (concerne plusieurs foyers familiaux) 43 129 14 206

Milieu scolaire et universitaire 17 51 6 88

EMS de personnes handicapeacutees 16 48 1 15

Communauteacutes vulneacuterables (gens du voyage migrants en situation preacutecaire etc) 16 48 3 44

Uniteacute geacuteographique de petite taille (suggeacuterant exposition commune) 11 33 2 29

Evegravenement public ou priveacute rassemblements temporaires de personnes 9 27 5 74

Etablissement peacutenitentiaires 5 15 0 00

Cregraveches 4 12 0 00

Transport (avion bateau train) 4 12 2 29

Structure de laide sociale agrave lenfance 2 06 0 00

Structures de soins reacutesidentiels des personnes sans domicile fixe 0 00 0 00

Autre 24 72 5 74

Situation au 7 juillet 2020 Page 11 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Clusters en Ehpad

Parallegravelement aux dispositifs de surveillance mis en place dans les ESMS (cf page 12) les eacutepisodes

reacutepondant agrave la deacutefinition de cas drsquoun cluster (survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes ou probables dans une

peacuteriode de 7 jours) sont inteacutegreacutes dans le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute publique

France

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 104 clusters inclus depuis le 9 mai (Figure 11) Le nombre

hebdomadaire de clusters signaleacutes en Ehpad est en nette diminution depuis la semaine 23

Au 8 juillet 87 (n=9) clusters sont encore en cours drsquoinvestigation 163 sont maitriseacutes (suivi des

contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le dernier cas) et 750 sont clocirctureacutes (absence

de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du dernier cas ET la fin de la quatorzaine des

contacts)

La majoriteacute (67) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 13 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 104 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 1 298 cas

De par la nature de cette collectiviteacute lrsquointeacutegraliteacute des clusters en Ehpad est de criticiteacute eacuteleveacutee

Figure 11 Distribution du nombre de clusters en Ehpad selon leur statut et du nombre de cas (tous

clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=104) au 8 juillet 2020

(Source MONIC)

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 12 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS)

Entre le 1er mars et le 06 juillet 2020 8 032 signalements rapportaient un ou plusieurs cas de COVID-19 deacuteclareacutes dans le portail national des signalements de Santeacute publique France et le portail de lrsquoARS Ile-de-France

Il srsquoagissait de 5 051 (63 ) signalements provenant drsquoeacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD EHPA et autres eacutetablissements) et 2 981 (37 ) drsquoautres eacutetablissements meacutedico-sociaux (ESMS)

Parmi les 8 032 signalements (Tableau 2)

minus 39 256 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents

minus 10 476 cas sont deacuteceacutedeacutes dans lrsquoeacutetablissement drsquoaccueil dont 10 390 (99 ) dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

minus 3 916 cas sont deacuteceacutedeacutes agrave lrsquohocircpital

minus 20 391 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes parmi les membres du personnel des ESMS

Depuis le 1er mars et jusqursquoau 06 juillet 2020 parmi les 5 051 signalements en eacutetablissements drsquoheacutebergements pour personnes acircgeacutees (EHPA) 3 379 eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Au cours des deux semaines S26 et S27 (du 22 juin au 5 juillet) parmi lrsquoensemble des EHPA en France (Ile-de-France exclue) 38 eacutetablissements (04) ont deacuteclareacute au moins un nouveau cas confirmeacute de COVID-19 parmi les reacutesidents ou le personnel Sur la mecircme peacuteriode parmi les EHPA en France (Ile-de-France exclue) 22 (02) eacutetablissements ont signaleacute un nouvel eacutepisode (date de deacutebut des signes du premier cas ou agrave deacutefaut date de signalement comprise entre le 22 juin et le 5 juillet) avec au moins un cas confirmeacute

Tableau 2 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoeacutetablissement chez les reacutesidents et le personnel dans les ESMS rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 France

Depuis le 29 juin les nombres de signalements et de deacutecegraves chez les reacutesidents ont diminueacute et ceci est ducirc agrave linfirmation deacutepisodes apregraves

investigation (8 271 signalements et 10 497 deacutecegraves en eacutetablissement avaient eacuteteacute rapporteacutes dans le bulletin de la semaine preacuteceacutedente)

1Etablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres eacutetablissements-EHPA reacutesidences autonomie reacutesidences seniors)

2Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (FAM IME autres eacutetablissements pour enfants (ITEP EAAP IEM Instituts pour deacuteficient auditifs et

visuels) autre eacutetablissements pour adultes (foyer de vie foyer drsquoheacutebergement) 3Aide sociale agrave lrsquoenfance (centres deacutepartementaux de lrsquoenfance

foyers de lrsquoenfance MECS) 4Autres eacutetablissements (LAM LHSS SCAPA avec heacutebergement) 5Un signalement COVID-19 est deacutefini par la

survenue drsquoau moins un cas COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas confirmeacute COVID-19 toute personne symptomatique ou non avec un

preacutelegravevement confirmant lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 parmi les personnes reacutesidentes ou les membres du personnel drsquoun ESMSEHPA 7Cas pos-

sibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Du fait du deacutelai court entre le signalement par les eacutetablissements et la production du point eacutepideacutemiologique les donneacutees les plus reacutecentes ne sont pas consolideacutees Les processus drsquoassurance qualiteacute mis en place au niveau reacutegional peuvent conduire agrave des corrections ulteacuterieures de donneacutees A noter que depuis le 01 juillet 2020 les ESMS drsquoIle-de-France ont commenceacute agrave deacuteclarer leurs eacutepisodes via lrsquoapplication de Santeacute publique France Les donneacutees drsquoIle-de-France sont agrave interpreacuteter avec prudence en attendant que le transfert de donneacutees soit stabiliseacute De plus apregraves investigation 333 eacutepisodes ont eacuteteacute infirmeacutes ce qui influence le nombre de signalements mais peu le nombre de deacutecegraves et pas le nombre de cas confirmeacutes

EHPA1 HPH2

Aide en-

fance3 Autres4 Total

Signalements5 5 051 2 290 367 324 8 032

Chez les

reacutesidents

Cas confirmeacutes6 34 688 3 946 164 458 39 256

Deacutecegraves hocircpitaux7 3 691 204 0 21 3 916

Deacutecegraves eacutetablissements7 10 390 75 0 11 10 476

Chez le

personnel Cas confirmeacutes6 16 522 3 404 279 186 20 391

Situation au 7 juillet 2020 Page 13 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 12 Nombre de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 (n=6 484) par date de deacutebut des signes du premier cas du 1er mars au 6 juillet 2020 France (hors Ile-de-France)

Figure 13 Nombre moyen (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 en France hors

Ile-de-France

Apregraves la deacutecroissance observeacutee depuis deacutebut avril le nombre de signalements reste tregraves faible depuis deacutebut mai il est infeacuterieur agrave 10 signalements par jour depuis au moins 30 jours en France hors

Ile-de-France (Figure 12)

Le nombre de deacutecegraves chez les reacutesidents en eacutetablissement et agrave lrsquohocircpital a atteint un pic deacutebut avril et deacutecroicirct continuellement depuis ce nombre varie entre 0 et 13 deacutecegraves par jour depuis le 1er Juin et eacutetait toujours infeacuterieur agrave 5 deacutecegraves par jour cette derniegravere semaine en France hors Ile-de-France (Figure 13)

Situation au 7 juillet 2020 Page 14 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (Reacuteseau OSCOUR

reg)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 330 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont

eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode repreacutesentant 05 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence du reacuteseau OSCOURreg

Ces passages eacutetaient en leacutegegravere baisse de 5 par rapport agrave la semaine 26 avec une part drsquoactiviteacute stable (1 402 passages et 05 de lrsquoactiviteacute totale en S26 ndash donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020) (Figure 14)

En semaine 27 sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 enregistreacutes au niveau national 21 ont eacuteteacute enregistreacutes en Icircle-de-France 16 en Guyane 8 en Auvergne Rhocircne-Alpes et 8 en Bretagne

En semaine 27 les passages aux urgences eacutetaient en baisse ou se maintenaient agrave un niveau bas pour la 14egraveme semaine conseacutecutive au niveau national et reacutegional (Figure 15) Chez les enfants on observait une seconde semaine conseacutecutive de hausse dans de faibles effectifs (+26 passages soit +31)

La proportion drsquohospitalisations apregraves passage pour suspicion de COVID-19 indicateur de graviteacute agrave lrsquoarriveacutee aux urgences eacutetait en leacutegegravere baisse agrave 35 en semaine S27 (versus 36 en S26 - donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020)

Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 171 631 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

Figure 14 Nombre de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier et depuis le 1er juin 2020 France (source OSCOURreg)

Figure 15 Taux hebdomadaires de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences semaine 27 France (source OSCOURreg)

Situation au 7 juillet 2020 Page 15 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission A partir de cette semaine les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests PCR positifs) en remplacement de lrsquoindicateur R calculeacute agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) Lrsquoavantage de cet indicateur est de repo-ser sur les donneacutees des cas confirmeacutes de COVID-19 et de srsquoappuyer sur un recours au test qui a vocation agrave intervenir rapidement apregraves la survenue des signes eacutevocateurs de COVID-19 Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Le R effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Le nombre de tests positifs peut ecirctre influenceacute par les actions locales de deacutepistage en particulier en cas drsquoidentification de clusters qui permettent drsquoidentifier des infections asymptomatiques Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais doivent ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Les estimations du nombre de reproduction sont baseacutees sur les nombre de tests PCR positifs au SARS-CoV-2 reacutealiseacutes entre le 21 juin et le 27 juin 2020 remonteacutes par le systegraveme SI-DEP

Le nombre de reproduction au niveau de la France meacutetropolitaine est de 105 (intervalle de confiance (IC95 1003-1090) (Tableau 3) et est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (R effectif=090 IC95 086-094) Cet indicateur est significatif en France meacutetropolitaine

Quatre reacutegions ont un nombre de reproduction R estimeacute supeacuterieur agrave 1 de faccedilon significative en Guyane (R=114 IC95 108-121) en diminution pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Nouvelle-Aquitaine (R=132 IC95 104-164) Pays-de-la-Loire (R= 152 IC95 131-173) et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (R = 124 IC95 105-146)

Les reacutegions Bretagne (107 IC95 072-149) Hauts-de-France (106 IC95 094-118) Ile-de-France

(106 IC95 099-113) Normandie (100 IC95 083-117) et La Reacuteunion (147 IC95 093-214) ont des estimations supeacuterieures agrave 1 mais non significativement supeacuterieures (valeur laquo 1 raquo comprise dans lrsquointervalle de confiance) (Tableau 3)

Tableau 3 Nombre de reproduction effectif (R effectif) agrave partir des tests PCR positifs au SARS-COV-2

par reacutegion France entiegravere sur 7 jours glissants du 28 juin au 4 juillet 2020 (Source SI-DEP)

NC le taux de reproduction nrsquoest pas calculable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am

J Epidemiol 2013 178 pp 1505-1512

Reacutegions R effectif Intervalle de confiance (95)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 098 086-112

Bourgogne-Franche-Comteacute 098 074-124

Bretagne 107 072-149

Centre-Val de Loire 097 075-121

Corse NC NC

Grand Est 078 066-091

Hauts-de-France 106 094-118

Ile-de-France 106 099-113

Normandie 100 083-117

Nouvelle-Aquitaine 132 104-164

Occitanie 097 081-115

Pays de la Loire 152 131-173

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 124 105-146

France meacutetropolitaine 105 1003-1094

Guadeloupe NC

La Reacuteunion NC

Martinique NC

Mayotte 076 061-092

Guyane 114 108-121

Situation au 7 juillet 2020 Page 16 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC)

Depuis le 1er mars 2020 1 508 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 105 152 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 4)

minus Lrsquoacircge meacutedian des patients est de 72 ans et 53 sont des hommes

minus 19 457 patients sont deacuteceacutedeacutes 71 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 59 eacutetaient des hommes

minus 77 655 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 07 juillet 2020 7 594 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 538 cas en reacuteanimation

Tableau 4 Nombre de personnes hospitaliseacutees et en reacuteanimation pour COVID-19 le 07 juillet 2020 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars par classe drsquoacircge et par reacutegion France (source SI-VIC)

Figure 16 Evolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 07 juillet France (source SI-VIC)

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

du 10 juin au 16 juin

Surveillance en milieu hospitalier

du 17 juin au 23 juin du 24 juin au 30 juin du 1er au 7 juillet

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 6: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 6 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du 28 juin au 4 juillet 2020 le taux de deacutepistage (nombre de patients testeacutes pour SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) eacutetait de 448 pour 100 000 habitants au niveau national (Figure 6) Les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage du 21 au 27 juin 2020 eacutetaient la Meurthe-et-Moselle (892100 000 h) le Calvados (720100 000 h) la Seine-Maritime (702100 000 h) et les Bouches-du-Rhocircne (698100 000 h) (Figure 6bis) Le nombre de patients testeacutes en France meacutetropolitaine est en augmentation (+26 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente)

En outre-mer le plus fort taux de deacutepistage a eacuteteacute observeacute en Guyane (1 729100 000 habitants) A Mayotte le taux de deacutepistage eacutetait de 297100 000 h Le nombre de patients testeacutes en outre-mer est en augmentation (+13 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente)

Au niveau national le nombre de patients testeacutes est en augmentation sur les derniegraveres semaines (179 897 en S25 244 231 en S26 et 304 049 en S27)

Figure 4 Taux de positiviteacute des personnes

testeacutees pour le SARS-CoV-2 par deacutepartement

France 28 juin au 4 juillet 2020 (source SI-DEP)

Figure 5 Taux drsquoincidence de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 pour 100 000 habitants par deacutepartement France 28 juin au 4 juillet 2020 (source SI-DEP)

Figure 6bis Taux de deacutepistage ( 100 000 habi-

tants) pour le SARS-CoV-2 par deacutepartement

France du 28 juin au 4 juillet (source SI-DEP)

Figure 6 Evolution du taux de deacutepistage ( 100 000 habi-

tants) pour le SARS-CoV-2 par semaine depuis le 13 mai

2020 France (source SI-DEP)

Situation au 7 juillet 2020 Page 7 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance en population COVIDnetfr

GrippeNetfr est un reacuteseau de surveillance mis en place en janvier 2012 par le reacuteseau Sentinelles (Inserm ndash Sorbonne Universiteacute) et Santeacute publique France avec pour objectif de recueillir directement aupregraves de la population des donneacutees eacutepideacutemiologiques sur les syndromes grippaux par internet et de faccedilon anonyme Il permet drsquoeacutetudier les symptocircmes preacutesenteacutes par les personnes malades qui nrsquoont pas recours au systegraveme de soins Depuis le 30 mars 2020 le projet GrippeNetfr sest adapteacute agrave la surveillance du COVID-19 et est devenu COVIDnetfr Pregraves de 6 000 personnes remplissent actuellement chaque semaine un questionnaire rapportant les symptocircmes qursquoelles ont eacuteventuellement eus depuis leur derniegravere connexion 12 133 personnes ont rempli au moins un questionnaire depuis le deacutebut de la saison hivernale 2019-2020

Pour la semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 5 011 questionnaires hebdomadaires ont eacuteteacute remplis

En semaine 27 la proportion de participants ayant deacuteclareacute des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 (deacutefinition sappuyant sur les recommandations du Haut Conseil de la santeacute publique concernant la prescription dun test diagnostique par un meacutedecin) eacutetait de 10 [06 14] stable par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (Figure 7)

La surveillance GrippeNetfrCOVIDnetfr srsquoachegravevera dimanche 12 juillet et reprendra en fin deacuteteacute ou deacutebut dautomne en fonction de lrsquoeacutevolution de leacutepideacutemie de COVID-19 Les donneacutees de la derniegravere semaine de surveillance de la saison seront publieacutees la semaine prochaine

Figure 7 Proportion ( redresseacute) de participants ayant deacuteclareacute des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 par semaine (donneacutees du 24 feacutevrier au 5 juillet 2020 source COVIDnetfr)

Note Deux nouveaux symptocircmes anosmie et agueusie ont eacuteteacute ajouteacutes au questionnaire hebdomadaire en semaine 14 afin dameacuteliorer le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Les donneacutees de la cohorte COVIDnetfr montrent que seules 46 en moyenne des personnes ayant deacuteclareacute des symptocircmes drsquoinfection respiratoire aigueuml ont consulteacute un meacutedecin Ce pourcentage a peu varieacute au cours de la peacuteriode eacutepideacutemique et depuis la leveacutee du confinement De plus il apparait que seules 17 en moyenne des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et que seules 12 (soit 71 des personnes avec prescription drsquoun test) ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Parmi les personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 et ayant consulteacute un meacutedecin geacuteneacute-raliste seuls 39 auraient reccedilu une prescription pour un test diagnostique Ces reacutesultats sont agrave interpreacuteter avec preacutecaution car les donneacutees ne sont pas redresseacutees par rapport agrave la population franccedilaise et sont soumises agrave des fluctuations importantes drsquoune semaine agrave lrsquoautre en raison de faibles effectifs

Ils suggegraverent cependant que le recours aux soins pour suspicion de COVID-19 ainsi que la reacutealisation

des tests RT-PCR agrave viseacutee de diagnostic sont aujourdrsquohui tregraves insuffisants chez les personnes

symptomatiques

Situation au 7 juillet 2020 Page 8 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Cas confirmeacutes de COVID-19

Les donneacutees permettant drsquoestimer le nombre de cas confirmeacutes en France sont issues de plusieurs sources

Entre le 21 janvier et le 25 mars 2020 25 233 cas de COVID-19 ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France via lrsquoapplication GoData ou par transmission des cellules reacutegionales de Santeacute publique France

Entre le 26 mars et le 12 mai 2020 115 010 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes (cas incidents hospitaliers et cas positifs en laboratoire) par les remonteacutees des donneacutees de laboratoires de biologie meacutedicale (source 3 Labo) et des patients hospitaliseacutes pour COVID-19 (source SI-VIC)

Depuis le 13 mai 2020 les cas de COVID-19 sont rapporteacutes par le Systegraveme drsquoInformation de Deacutepistage (SI-DEP) permettant une estimation agrave viseacutee exhaustive des nombres de cas confirmeacutes en France Entre le 13 mai et le 7 juillet 2020 28 567 cas ont eacuteteacute rapporteacutes dans SI-DEP

Il est ainsi estimeacute un total de 168 810 cas confirmeacutes de COVID-19 en France au 07 juillet 2020

De la semaine 15 agrave la semaine 24 le nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes a eacuteteacute en diminution passant de 30 111 cas confirmeacutes en S14 agrave 2 949 cas en S24 Neacuteanmoins depuis la semaine 24 le nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes est agrave nouveau en augmentation passant de 2 949 cas confirmeacutes en S24 agrave 3 684 cas en S27 (Figure 8) On peut notamment expliquer cette augmentation par la situation eacutepideacute-miologique en Guyane Le nombre de cas confirmeacutes en France meacutetropolitaine est eacutegalement en augmenta-tion entre le S26 et la S27 (+290 cas +14) et est en partie lieacutee agrave une augmentation des cas en Mayenne

Au cours de la vague eacutepideacutemique et jusqursquoagrave la leveacutee des mesures de confinement de la population tous les patients preacutesentant des signes de COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer une infection (recommandations ministeacuterielles du 13 mars 2020) Le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France eacutetait donc supeacuterieur au nombre estimeacute de cas confirmeacutes pendant cette peacuteriode Depuis le deacuteconfinement il est demandeacute que les patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 ainsi que les sujets contacts drsquoun cas confirmeacute soient deacutepisteacutes pour le SARS-CoV-2 [1] A compter de cette date et gracircce au systegraveme SI-DEP le nombre de cas confirmeacutes permet deacutesormais theacuteoriquement drsquoestimer le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France Ce nombre peut cependant ecirctre sous-estimeacute du fait de lrsquoabsence de deacutepistage systeacutematique de personnes infecteacutees symptomatiques ou asymptomatiques [1] DGS-Urgent Prise en charge par les meacutedecins de ville des patients de COVID-19 en phase de

deacuteconfinement Disponible via ce lien cliquez ici

Figure 8 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine rapporteacutes agrave Santeacute publique France du 23 janvier au 4 juillet 2020 (donneacutees arrecircteacutees le 7 juillet 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 9 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Signalement agrave viseacutee drsquoalerte des clusters (ou foyers de transmission)

Preacuteambule Depuis la leveacutee du confinement les ARS en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France et les

partenaires locaux investiguent les clusters deacutetecteacutes selon le guide en vigueur [1] Le traccedilage et le deacutepistage des

personnes contacts permettent de controcircler ces foyers Un cluster est deacutefini par la survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes

ou probables dans une peacuteriode de 7 jours et qui appartiennent agrave une mecircme communauteacute ou ont participeacute agrave un mecircme

rassemblement de personnes qursquoils se connaissent ou non Le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute

publique France permet de preacutesenter ce bilan

Cluster hors Ehpad et milieu familial restreint

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 333 clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) rapporteacutes depuis le

9 mai 313 clusters en France meacutetropolitaine et 20 dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (Figures 9 et 10) Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est stable sur les 5 derniegraveres semaines (S23

- S27) et reste infeacuterieur aux nombres observeacutes sur les semaines S20 agrave S22 Au 8 juillet 68 clusters eacutetaient

toujours en cours drsquoinvestigation

Moins drsquoun quart des clusters signaleacutes depuis le 9 mai sont encore en cours drsquoinvestigation (204

n=68) 126 sont maitriseacutes (suivi des contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le

dernier cas) 622 sont clocirctureacutes (absence de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du

dernier cas ET la fin de la quatorzaine des contacts) Des clusters (48) ont diffuseacute dans la communauteacute

Les 15 clusters en Guyane sont consideacutereacutes agrave diffusion communautaire En France meacutetropolitaine 2

clusters sont en diffusion communautaire 1 en Normandie et 1 en Pays de Loire En termes de criticiteacute (potentiel de transmission ou critegraveres de graviteacute) 79 des clusters sont de criticiteacute

modeacutereacutee (44) agrave eacuteleveacutee (35) Parmi ceux qui restent en cours drsquoinvestigation 31 ont une criticiteacute eacuteleveacutee

Les clusters concernent notamment des eacutetablissements de santeacute (22) des entreprises (18 en entreprises

priveacutees et publiques hors santeacute) et des personnes en situation de preacutecariteacute et de vulneacuterabiliteacute (14 en

eacutetablissements drsquoheacutebergement social et drsquoinsertion et 5 en communauteacutes vulneacuterables) (Tableau 1)

La majoriteacute (70) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 153 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 333 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 5 111 cas

Figure 9 Distribution du nombre de clusters selon leur statut (hors Ehpad et milieu familial restreint) et

du nombre de cas (tous clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020

(N=333) au 8 juillet 2020 (Source MONIC)

[1] Pour en savoir plus Guide pour lidentification et linvestigation de situations de cas groupeacutes de COVID-19

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 10 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 1 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) par type de collectiviteacute

inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=333) (Source MONIC)

Figure 10 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) en cours drsquoinvestigation

par deacutepartement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet juin 2020 (N=68) (Source MONIC)

ES eacutetablissement de santeacute EMS eacutetablissement meacutedico-social

Pour en savoir plus sur les donneacutees reacutegionales consulter Santeacute publique France

Type de collectiviteacutes

Ensemble des

clusters

Clusters en

cours dinvesti-

gation

N=333 N=68

Etablissements de santeacute 74 222 3 44

Entreprises priveacutees et publiques (hors ES) 60 180 17 250

Etablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion 48 144 10 147

Milieu familial eacutelargi (concerne plusieurs foyers familiaux) 43 129 14 206

Milieu scolaire et universitaire 17 51 6 88

EMS de personnes handicapeacutees 16 48 1 15

Communauteacutes vulneacuterables (gens du voyage migrants en situation preacutecaire etc) 16 48 3 44

Uniteacute geacuteographique de petite taille (suggeacuterant exposition commune) 11 33 2 29

Evegravenement public ou priveacute rassemblements temporaires de personnes 9 27 5 74

Etablissement peacutenitentiaires 5 15 0 00

Cregraveches 4 12 0 00

Transport (avion bateau train) 4 12 2 29

Structure de laide sociale agrave lenfance 2 06 0 00

Structures de soins reacutesidentiels des personnes sans domicile fixe 0 00 0 00

Autre 24 72 5 74

Situation au 7 juillet 2020 Page 11 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Clusters en Ehpad

Parallegravelement aux dispositifs de surveillance mis en place dans les ESMS (cf page 12) les eacutepisodes

reacutepondant agrave la deacutefinition de cas drsquoun cluster (survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes ou probables dans une

peacuteriode de 7 jours) sont inteacutegreacutes dans le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute publique

France

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 104 clusters inclus depuis le 9 mai (Figure 11) Le nombre

hebdomadaire de clusters signaleacutes en Ehpad est en nette diminution depuis la semaine 23

Au 8 juillet 87 (n=9) clusters sont encore en cours drsquoinvestigation 163 sont maitriseacutes (suivi des

contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le dernier cas) et 750 sont clocirctureacutes (absence

de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du dernier cas ET la fin de la quatorzaine des

contacts)

La majoriteacute (67) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 13 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 104 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 1 298 cas

De par la nature de cette collectiviteacute lrsquointeacutegraliteacute des clusters en Ehpad est de criticiteacute eacuteleveacutee

Figure 11 Distribution du nombre de clusters en Ehpad selon leur statut et du nombre de cas (tous

clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=104) au 8 juillet 2020

(Source MONIC)

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 12 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS)

Entre le 1er mars et le 06 juillet 2020 8 032 signalements rapportaient un ou plusieurs cas de COVID-19 deacuteclareacutes dans le portail national des signalements de Santeacute publique France et le portail de lrsquoARS Ile-de-France

Il srsquoagissait de 5 051 (63 ) signalements provenant drsquoeacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD EHPA et autres eacutetablissements) et 2 981 (37 ) drsquoautres eacutetablissements meacutedico-sociaux (ESMS)

Parmi les 8 032 signalements (Tableau 2)

minus 39 256 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents

minus 10 476 cas sont deacuteceacutedeacutes dans lrsquoeacutetablissement drsquoaccueil dont 10 390 (99 ) dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

minus 3 916 cas sont deacuteceacutedeacutes agrave lrsquohocircpital

minus 20 391 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes parmi les membres du personnel des ESMS

Depuis le 1er mars et jusqursquoau 06 juillet 2020 parmi les 5 051 signalements en eacutetablissements drsquoheacutebergements pour personnes acircgeacutees (EHPA) 3 379 eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Au cours des deux semaines S26 et S27 (du 22 juin au 5 juillet) parmi lrsquoensemble des EHPA en France (Ile-de-France exclue) 38 eacutetablissements (04) ont deacuteclareacute au moins un nouveau cas confirmeacute de COVID-19 parmi les reacutesidents ou le personnel Sur la mecircme peacuteriode parmi les EHPA en France (Ile-de-France exclue) 22 (02) eacutetablissements ont signaleacute un nouvel eacutepisode (date de deacutebut des signes du premier cas ou agrave deacutefaut date de signalement comprise entre le 22 juin et le 5 juillet) avec au moins un cas confirmeacute

Tableau 2 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoeacutetablissement chez les reacutesidents et le personnel dans les ESMS rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 France

Depuis le 29 juin les nombres de signalements et de deacutecegraves chez les reacutesidents ont diminueacute et ceci est ducirc agrave linfirmation deacutepisodes apregraves

investigation (8 271 signalements et 10 497 deacutecegraves en eacutetablissement avaient eacuteteacute rapporteacutes dans le bulletin de la semaine preacuteceacutedente)

1Etablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres eacutetablissements-EHPA reacutesidences autonomie reacutesidences seniors)

2Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (FAM IME autres eacutetablissements pour enfants (ITEP EAAP IEM Instituts pour deacuteficient auditifs et

visuels) autre eacutetablissements pour adultes (foyer de vie foyer drsquoheacutebergement) 3Aide sociale agrave lrsquoenfance (centres deacutepartementaux de lrsquoenfance

foyers de lrsquoenfance MECS) 4Autres eacutetablissements (LAM LHSS SCAPA avec heacutebergement) 5Un signalement COVID-19 est deacutefini par la

survenue drsquoau moins un cas COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas confirmeacute COVID-19 toute personne symptomatique ou non avec un

preacutelegravevement confirmant lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 parmi les personnes reacutesidentes ou les membres du personnel drsquoun ESMSEHPA 7Cas pos-

sibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Du fait du deacutelai court entre le signalement par les eacutetablissements et la production du point eacutepideacutemiologique les donneacutees les plus reacutecentes ne sont pas consolideacutees Les processus drsquoassurance qualiteacute mis en place au niveau reacutegional peuvent conduire agrave des corrections ulteacuterieures de donneacutees A noter que depuis le 01 juillet 2020 les ESMS drsquoIle-de-France ont commenceacute agrave deacuteclarer leurs eacutepisodes via lrsquoapplication de Santeacute publique France Les donneacutees drsquoIle-de-France sont agrave interpreacuteter avec prudence en attendant que le transfert de donneacutees soit stabiliseacute De plus apregraves investigation 333 eacutepisodes ont eacuteteacute infirmeacutes ce qui influence le nombre de signalements mais peu le nombre de deacutecegraves et pas le nombre de cas confirmeacutes

EHPA1 HPH2

Aide en-

fance3 Autres4 Total

Signalements5 5 051 2 290 367 324 8 032

Chez les

reacutesidents

Cas confirmeacutes6 34 688 3 946 164 458 39 256

Deacutecegraves hocircpitaux7 3 691 204 0 21 3 916

Deacutecegraves eacutetablissements7 10 390 75 0 11 10 476

Chez le

personnel Cas confirmeacutes6 16 522 3 404 279 186 20 391

Situation au 7 juillet 2020 Page 13 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 12 Nombre de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 (n=6 484) par date de deacutebut des signes du premier cas du 1er mars au 6 juillet 2020 France (hors Ile-de-France)

Figure 13 Nombre moyen (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 en France hors

Ile-de-France

Apregraves la deacutecroissance observeacutee depuis deacutebut avril le nombre de signalements reste tregraves faible depuis deacutebut mai il est infeacuterieur agrave 10 signalements par jour depuis au moins 30 jours en France hors

Ile-de-France (Figure 12)

Le nombre de deacutecegraves chez les reacutesidents en eacutetablissement et agrave lrsquohocircpital a atteint un pic deacutebut avril et deacutecroicirct continuellement depuis ce nombre varie entre 0 et 13 deacutecegraves par jour depuis le 1er Juin et eacutetait toujours infeacuterieur agrave 5 deacutecegraves par jour cette derniegravere semaine en France hors Ile-de-France (Figure 13)

Situation au 7 juillet 2020 Page 14 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (Reacuteseau OSCOUR

reg)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 330 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont

eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode repreacutesentant 05 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence du reacuteseau OSCOURreg

Ces passages eacutetaient en leacutegegravere baisse de 5 par rapport agrave la semaine 26 avec une part drsquoactiviteacute stable (1 402 passages et 05 de lrsquoactiviteacute totale en S26 ndash donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020) (Figure 14)

En semaine 27 sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 enregistreacutes au niveau national 21 ont eacuteteacute enregistreacutes en Icircle-de-France 16 en Guyane 8 en Auvergne Rhocircne-Alpes et 8 en Bretagne

En semaine 27 les passages aux urgences eacutetaient en baisse ou se maintenaient agrave un niveau bas pour la 14egraveme semaine conseacutecutive au niveau national et reacutegional (Figure 15) Chez les enfants on observait une seconde semaine conseacutecutive de hausse dans de faibles effectifs (+26 passages soit +31)

La proportion drsquohospitalisations apregraves passage pour suspicion de COVID-19 indicateur de graviteacute agrave lrsquoarriveacutee aux urgences eacutetait en leacutegegravere baisse agrave 35 en semaine S27 (versus 36 en S26 - donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020)

Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 171 631 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

Figure 14 Nombre de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier et depuis le 1er juin 2020 France (source OSCOURreg)

Figure 15 Taux hebdomadaires de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences semaine 27 France (source OSCOURreg)

Situation au 7 juillet 2020 Page 15 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission A partir de cette semaine les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests PCR positifs) en remplacement de lrsquoindicateur R calculeacute agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) Lrsquoavantage de cet indicateur est de repo-ser sur les donneacutees des cas confirmeacutes de COVID-19 et de srsquoappuyer sur un recours au test qui a vocation agrave intervenir rapidement apregraves la survenue des signes eacutevocateurs de COVID-19 Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Le R effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Le nombre de tests positifs peut ecirctre influenceacute par les actions locales de deacutepistage en particulier en cas drsquoidentification de clusters qui permettent drsquoidentifier des infections asymptomatiques Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais doivent ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Les estimations du nombre de reproduction sont baseacutees sur les nombre de tests PCR positifs au SARS-CoV-2 reacutealiseacutes entre le 21 juin et le 27 juin 2020 remonteacutes par le systegraveme SI-DEP

Le nombre de reproduction au niveau de la France meacutetropolitaine est de 105 (intervalle de confiance (IC95 1003-1090) (Tableau 3) et est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (R effectif=090 IC95 086-094) Cet indicateur est significatif en France meacutetropolitaine

Quatre reacutegions ont un nombre de reproduction R estimeacute supeacuterieur agrave 1 de faccedilon significative en Guyane (R=114 IC95 108-121) en diminution pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Nouvelle-Aquitaine (R=132 IC95 104-164) Pays-de-la-Loire (R= 152 IC95 131-173) et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (R = 124 IC95 105-146)

Les reacutegions Bretagne (107 IC95 072-149) Hauts-de-France (106 IC95 094-118) Ile-de-France

(106 IC95 099-113) Normandie (100 IC95 083-117) et La Reacuteunion (147 IC95 093-214) ont des estimations supeacuterieures agrave 1 mais non significativement supeacuterieures (valeur laquo 1 raquo comprise dans lrsquointervalle de confiance) (Tableau 3)

Tableau 3 Nombre de reproduction effectif (R effectif) agrave partir des tests PCR positifs au SARS-COV-2

par reacutegion France entiegravere sur 7 jours glissants du 28 juin au 4 juillet 2020 (Source SI-DEP)

NC le taux de reproduction nrsquoest pas calculable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am

J Epidemiol 2013 178 pp 1505-1512

Reacutegions R effectif Intervalle de confiance (95)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 098 086-112

Bourgogne-Franche-Comteacute 098 074-124

Bretagne 107 072-149

Centre-Val de Loire 097 075-121

Corse NC NC

Grand Est 078 066-091

Hauts-de-France 106 094-118

Ile-de-France 106 099-113

Normandie 100 083-117

Nouvelle-Aquitaine 132 104-164

Occitanie 097 081-115

Pays de la Loire 152 131-173

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 124 105-146

France meacutetropolitaine 105 1003-1094

Guadeloupe NC

La Reacuteunion NC

Martinique NC

Mayotte 076 061-092

Guyane 114 108-121

Situation au 7 juillet 2020 Page 16 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC)

Depuis le 1er mars 2020 1 508 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 105 152 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 4)

minus Lrsquoacircge meacutedian des patients est de 72 ans et 53 sont des hommes

minus 19 457 patients sont deacuteceacutedeacutes 71 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 59 eacutetaient des hommes

minus 77 655 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 07 juillet 2020 7 594 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 538 cas en reacuteanimation

Tableau 4 Nombre de personnes hospitaliseacutees et en reacuteanimation pour COVID-19 le 07 juillet 2020 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars par classe drsquoacircge et par reacutegion France (source SI-VIC)

Figure 16 Evolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 07 juillet France (source SI-VIC)

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

du 10 juin au 16 juin

Surveillance en milieu hospitalier

du 17 juin au 23 juin du 24 juin au 30 juin du 1er au 7 juillet

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

32

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 7: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 7 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance en population COVIDnetfr

GrippeNetfr est un reacuteseau de surveillance mis en place en janvier 2012 par le reacuteseau Sentinelles (Inserm ndash Sorbonne Universiteacute) et Santeacute publique France avec pour objectif de recueillir directement aupregraves de la population des donneacutees eacutepideacutemiologiques sur les syndromes grippaux par internet et de faccedilon anonyme Il permet drsquoeacutetudier les symptocircmes preacutesenteacutes par les personnes malades qui nrsquoont pas recours au systegraveme de soins Depuis le 30 mars 2020 le projet GrippeNetfr sest adapteacute agrave la surveillance du COVID-19 et est devenu COVIDnetfr Pregraves de 6 000 personnes remplissent actuellement chaque semaine un questionnaire rapportant les symptocircmes qursquoelles ont eacuteventuellement eus depuis leur derniegravere connexion 12 133 personnes ont rempli au moins un questionnaire depuis le deacutebut de la saison hivernale 2019-2020

Pour la semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 5 011 questionnaires hebdomadaires ont eacuteteacute remplis

En semaine 27 la proportion de participants ayant deacuteclareacute des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 (deacutefinition sappuyant sur les recommandations du Haut Conseil de la santeacute publique concernant la prescription dun test diagnostique par un meacutedecin) eacutetait de 10 [06 14] stable par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (Figure 7)

La surveillance GrippeNetfrCOVIDnetfr srsquoachegravevera dimanche 12 juillet et reprendra en fin deacuteteacute ou deacutebut dautomne en fonction de lrsquoeacutevolution de leacutepideacutemie de COVID-19 Les donneacutees de la derniegravere semaine de surveillance de la saison seront publieacutees la semaine prochaine

Figure 7 Proportion ( redresseacute) de participants ayant deacuteclareacute des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 par semaine (donneacutees du 24 feacutevrier au 5 juillet 2020 source COVIDnetfr)

Note Deux nouveaux symptocircmes anosmie et agueusie ont eacuteteacute ajouteacutes au questionnaire hebdomadaire en semaine 14 afin dameacuteliorer le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Les donneacutees de la cohorte COVIDnetfr montrent que seules 46 en moyenne des personnes ayant deacuteclareacute des symptocircmes drsquoinfection respiratoire aigueuml ont consulteacute un meacutedecin Ce pourcentage a peu varieacute au cours de la peacuteriode eacutepideacutemique et depuis la leveacutee du confinement De plus il apparait que seules 17 en moyenne des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et que seules 12 (soit 71 des personnes avec prescription drsquoun test) ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Parmi les personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 et ayant consulteacute un meacutedecin geacuteneacute-raliste seuls 39 auraient reccedilu une prescription pour un test diagnostique Ces reacutesultats sont agrave interpreacuteter avec preacutecaution car les donneacutees ne sont pas redresseacutees par rapport agrave la population franccedilaise et sont soumises agrave des fluctuations importantes drsquoune semaine agrave lrsquoautre en raison de faibles effectifs

Ils suggegraverent cependant que le recours aux soins pour suspicion de COVID-19 ainsi que la reacutealisation

des tests RT-PCR agrave viseacutee de diagnostic sont aujourdrsquohui tregraves insuffisants chez les personnes

symptomatiques

Situation au 7 juillet 2020 Page 8 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Cas confirmeacutes de COVID-19

Les donneacutees permettant drsquoestimer le nombre de cas confirmeacutes en France sont issues de plusieurs sources

Entre le 21 janvier et le 25 mars 2020 25 233 cas de COVID-19 ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France via lrsquoapplication GoData ou par transmission des cellules reacutegionales de Santeacute publique France

Entre le 26 mars et le 12 mai 2020 115 010 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes (cas incidents hospitaliers et cas positifs en laboratoire) par les remonteacutees des donneacutees de laboratoires de biologie meacutedicale (source 3 Labo) et des patients hospitaliseacutes pour COVID-19 (source SI-VIC)

Depuis le 13 mai 2020 les cas de COVID-19 sont rapporteacutes par le Systegraveme drsquoInformation de Deacutepistage (SI-DEP) permettant une estimation agrave viseacutee exhaustive des nombres de cas confirmeacutes en France Entre le 13 mai et le 7 juillet 2020 28 567 cas ont eacuteteacute rapporteacutes dans SI-DEP

Il est ainsi estimeacute un total de 168 810 cas confirmeacutes de COVID-19 en France au 07 juillet 2020

De la semaine 15 agrave la semaine 24 le nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes a eacuteteacute en diminution passant de 30 111 cas confirmeacutes en S14 agrave 2 949 cas en S24 Neacuteanmoins depuis la semaine 24 le nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes est agrave nouveau en augmentation passant de 2 949 cas confirmeacutes en S24 agrave 3 684 cas en S27 (Figure 8) On peut notamment expliquer cette augmentation par la situation eacutepideacute-miologique en Guyane Le nombre de cas confirmeacutes en France meacutetropolitaine est eacutegalement en augmenta-tion entre le S26 et la S27 (+290 cas +14) et est en partie lieacutee agrave une augmentation des cas en Mayenne

Au cours de la vague eacutepideacutemique et jusqursquoagrave la leveacutee des mesures de confinement de la population tous les patients preacutesentant des signes de COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer une infection (recommandations ministeacuterielles du 13 mars 2020) Le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France eacutetait donc supeacuterieur au nombre estimeacute de cas confirmeacutes pendant cette peacuteriode Depuis le deacuteconfinement il est demandeacute que les patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 ainsi que les sujets contacts drsquoun cas confirmeacute soient deacutepisteacutes pour le SARS-CoV-2 [1] A compter de cette date et gracircce au systegraveme SI-DEP le nombre de cas confirmeacutes permet deacutesormais theacuteoriquement drsquoestimer le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France Ce nombre peut cependant ecirctre sous-estimeacute du fait de lrsquoabsence de deacutepistage systeacutematique de personnes infecteacutees symptomatiques ou asymptomatiques [1] DGS-Urgent Prise en charge par les meacutedecins de ville des patients de COVID-19 en phase de

deacuteconfinement Disponible via ce lien cliquez ici

Figure 8 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine rapporteacutes agrave Santeacute publique France du 23 janvier au 4 juillet 2020 (donneacutees arrecircteacutees le 7 juillet 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 9 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Signalement agrave viseacutee drsquoalerte des clusters (ou foyers de transmission)

Preacuteambule Depuis la leveacutee du confinement les ARS en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France et les

partenaires locaux investiguent les clusters deacutetecteacutes selon le guide en vigueur [1] Le traccedilage et le deacutepistage des

personnes contacts permettent de controcircler ces foyers Un cluster est deacutefini par la survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes

ou probables dans une peacuteriode de 7 jours et qui appartiennent agrave une mecircme communauteacute ou ont participeacute agrave un mecircme

rassemblement de personnes qursquoils se connaissent ou non Le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute

publique France permet de preacutesenter ce bilan

Cluster hors Ehpad et milieu familial restreint

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 333 clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) rapporteacutes depuis le

9 mai 313 clusters en France meacutetropolitaine et 20 dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (Figures 9 et 10) Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est stable sur les 5 derniegraveres semaines (S23

- S27) et reste infeacuterieur aux nombres observeacutes sur les semaines S20 agrave S22 Au 8 juillet 68 clusters eacutetaient

toujours en cours drsquoinvestigation

Moins drsquoun quart des clusters signaleacutes depuis le 9 mai sont encore en cours drsquoinvestigation (204

n=68) 126 sont maitriseacutes (suivi des contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le

dernier cas) 622 sont clocirctureacutes (absence de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du

dernier cas ET la fin de la quatorzaine des contacts) Des clusters (48) ont diffuseacute dans la communauteacute

Les 15 clusters en Guyane sont consideacutereacutes agrave diffusion communautaire En France meacutetropolitaine 2

clusters sont en diffusion communautaire 1 en Normandie et 1 en Pays de Loire En termes de criticiteacute (potentiel de transmission ou critegraveres de graviteacute) 79 des clusters sont de criticiteacute

modeacutereacutee (44) agrave eacuteleveacutee (35) Parmi ceux qui restent en cours drsquoinvestigation 31 ont une criticiteacute eacuteleveacutee

Les clusters concernent notamment des eacutetablissements de santeacute (22) des entreprises (18 en entreprises

priveacutees et publiques hors santeacute) et des personnes en situation de preacutecariteacute et de vulneacuterabiliteacute (14 en

eacutetablissements drsquoheacutebergement social et drsquoinsertion et 5 en communauteacutes vulneacuterables) (Tableau 1)

La majoriteacute (70) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 153 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 333 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 5 111 cas

Figure 9 Distribution du nombre de clusters selon leur statut (hors Ehpad et milieu familial restreint) et

du nombre de cas (tous clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020

(N=333) au 8 juillet 2020 (Source MONIC)

[1] Pour en savoir plus Guide pour lidentification et linvestigation de situations de cas groupeacutes de COVID-19

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 10 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 1 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) par type de collectiviteacute

inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=333) (Source MONIC)

Figure 10 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) en cours drsquoinvestigation

par deacutepartement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet juin 2020 (N=68) (Source MONIC)

ES eacutetablissement de santeacute EMS eacutetablissement meacutedico-social

Pour en savoir plus sur les donneacutees reacutegionales consulter Santeacute publique France

Type de collectiviteacutes

Ensemble des

clusters

Clusters en

cours dinvesti-

gation

N=333 N=68

Etablissements de santeacute 74 222 3 44

Entreprises priveacutees et publiques (hors ES) 60 180 17 250

Etablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion 48 144 10 147

Milieu familial eacutelargi (concerne plusieurs foyers familiaux) 43 129 14 206

Milieu scolaire et universitaire 17 51 6 88

EMS de personnes handicapeacutees 16 48 1 15

Communauteacutes vulneacuterables (gens du voyage migrants en situation preacutecaire etc) 16 48 3 44

Uniteacute geacuteographique de petite taille (suggeacuterant exposition commune) 11 33 2 29

Evegravenement public ou priveacute rassemblements temporaires de personnes 9 27 5 74

Etablissement peacutenitentiaires 5 15 0 00

Cregraveches 4 12 0 00

Transport (avion bateau train) 4 12 2 29

Structure de laide sociale agrave lenfance 2 06 0 00

Structures de soins reacutesidentiels des personnes sans domicile fixe 0 00 0 00

Autre 24 72 5 74

Situation au 7 juillet 2020 Page 11 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Clusters en Ehpad

Parallegravelement aux dispositifs de surveillance mis en place dans les ESMS (cf page 12) les eacutepisodes

reacutepondant agrave la deacutefinition de cas drsquoun cluster (survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes ou probables dans une

peacuteriode de 7 jours) sont inteacutegreacutes dans le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute publique

France

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 104 clusters inclus depuis le 9 mai (Figure 11) Le nombre

hebdomadaire de clusters signaleacutes en Ehpad est en nette diminution depuis la semaine 23

Au 8 juillet 87 (n=9) clusters sont encore en cours drsquoinvestigation 163 sont maitriseacutes (suivi des

contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le dernier cas) et 750 sont clocirctureacutes (absence

de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du dernier cas ET la fin de la quatorzaine des

contacts)

La majoriteacute (67) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 13 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 104 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 1 298 cas

De par la nature de cette collectiviteacute lrsquointeacutegraliteacute des clusters en Ehpad est de criticiteacute eacuteleveacutee

Figure 11 Distribution du nombre de clusters en Ehpad selon leur statut et du nombre de cas (tous

clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=104) au 8 juillet 2020

(Source MONIC)

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 12 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS)

Entre le 1er mars et le 06 juillet 2020 8 032 signalements rapportaient un ou plusieurs cas de COVID-19 deacuteclareacutes dans le portail national des signalements de Santeacute publique France et le portail de lrsquoARS Ile-de-France

Il srsquoagissait de 5 051 (63 ) signalements provenant drsquoeacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD EHPA et autres eacutetablissements) et 2 981 (37 ) drsquoautres eacutetablissements meacutedico-sociaux (ESMS)

Parmi les 8 032 signalements (Tableau 2)

minus 39 256 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents

minus 10 476 cas sont deacuteceacutedeacutes dans lrsquoeacutetablissement drsquoaccueil dont 10 390 (99 ) dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

minus 3 916 cas sont deacuteceacutedeacutes agrave lrsquohocircpital

minus 20 391 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes parmi les membres du personnel des ESMS

Depuis le 1er mars et jusqursquoau 06 juillet 2020 parmi les 5 051 signalements en eacutetablissements drsquoheacutebergements pour personnes acircgeacutees (EHPA) 3 379 eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Au cours des deux semaines S26 et S27 (du 22 juin au 5 juillet) parmi lrsquoensemble des EHPA en France (Ile-de-France exclue) 38 eacutetablissements (04) ont deacuteclareacute au moins un nouveau cas confirmeacute de COVID-19 parmi les reacutesidents ou le personnel Sur la mecircme peacuteriode parmi les EHPA en France (Ile-de-France exclue) 22 (02) eacutetablissements ont signaleacute un nouvel eacutepisode (date de deacutebut des signes du premier cas ou agrave deacutefaut date de signalement comprise entre le 22 juin et le 5 juillet) avec au moins un cas confirmeacute

Tableau 2 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoeacutetablissement chez les reacutesidents et le personnel dans les ESMS rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 France

Depuis le 29 juin les nombres de signalements et de deacutecegraves chez les reacutesidents ont diminueacute et ceci est ducirc agrave linfirmation deacutepisodes apregraves

investigation (8 271 signalements et 10 497 deacutecegraves en eacutetablissement avaient eacuteteacute rapporteacutes dans le bulletin de la semaine preacuteceacutedente)

1Etablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres eacutetablissements-EHPA reacutesidences autonomie reacutesidences seniors)

2Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (FAM IME autres eacutetablissements pour enfants (ITEP EAAP IEM Instituts pour deacuteficient auditifs et

visuels) autre eacutetablissements pour adultes (foyer de vie foyer drsquoheacutebergement) 3Aide sociale agrave lrsquoenfance (centres deacutepartementaux de lrsquoenfance

foyers de lrsquoenfance MECS) 4Autres eacutetablissements (LAM LHSS SCAPA avec heacutebergement) 5Un signalement COVID-19 est deacutefini par la

survenue drsquoau moins un cas COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas confirmeacute COVID-19 toute personne symptomatique ou non avec un

preacutelegravevement confirmant lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 parmi les personnes reacutesidentes ou les membres du personnel drsquoun ESMSEHPA 7Cas pos-

sibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Du fait du deacutelai court entre le signalement par les eacutetablissements et la production du point eacutepideacutemiologique les donneacutees les plus reacutecentes ne sont pas consolideacutees Les processus drsquoassurance qualiteacute mis en place au niveau reacutegional peuvent conduire agrave des corrections ulteacuterieures de donneacutees A noter que depuis le 01 juillet 2020 les ESMS drsquoIle-de-France ont commenceacute agrave deacuteclarer leurs eacutepisodes via lrsquoapplication de Santeacute publique France Les donneacutees drsquoIle-de-France sont agrave interpreacuteter avec prudence en attendant que le transfert de donneacutees soit stabiliseacute De plus apregraves investigation 333 eacutepisodes ont eacuteteacute infirmeacutes ce qui influence le nombre de signalements mais peu le nombre de deacutecegraves et pas le nombre de cas confirmeacutes

EHPA1 HPH2

Aide en-

fance3 Autres4 Total

Signalements5 5 051 2 290 367 324 8 032

Chez les

reacutesidents

Cas confirmeacutes6 34 688 3 946 164 458 39 256

Deacutecegraves hocircpitaux7 3 691 204 0 21 3 916

Deacutecegraves eacutetablissements7 10 390 75 0 11 10 476

Chez le

personnel Cas confirmeacutes6 16 522 3 404 279 186 20 391

Situation au 7 juillet 2020 Page 13 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 12 Nombre de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 (n=6 484) par date de deacutebut des signes du premier cas du 1er mars au 6 juillet 2020 France (hors Ile-de-France)

Figure 13 Nombre moyen (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 en France hors

Ile-de-France

Apregraves la deacutecroissance observeacutee depuis deacutebut avril le nombre de signalements reste tregraves faible depuis deacutebut mai il est infeacuterieur agrave 10 signalements par jour depuis au moins 30 jours en France hors

Ile-de-France (Figure 12)

Le nombre de deacutecegraves chez les reacutesidents en eacutetablissement et agrave lrsquohocircpital a atteint un pic deacutebut avril et deacutecroicirct continuellement depuis ce nombre varie entre 0 et 13 deacutecegraves par jour depuis le 1er Juin et eacutetait toujours infeacuterieur agrave 5 deacutecegraves par jour cette derniegravere semaine en France hors Ile-de-France (Figure 13)

Situation au 7 juillet 2020 Page 14 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (Reacuteseau OSCOUR

reg)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 330 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont

eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode repreacutesentant 05 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence du reacuteseau OSCOURreg

Ces passages eacutetaient en leacutegegravere baisse de 5 par rapport agrave la semaine 26 avec une part drsquoactiviteacute stable (1 402 passages et 05 de lrsquoactiviteacute totale en S26 ndash donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020) (Figure 14)

En semaine 27 sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 enregistreacutes au niveau national 21 ont eacuteteacute enregistreacutes en Icircle-de-France 16 en Guyane 8 en Auvergne Rhocircne-Alpes et 8 en Bretagne

En semaine 27 les passages aux urgences eacutetaient en baisse ou se maintenaient agrave un niveau bas pour la 14egraveme semaine conseacutecutive au niveau national et reacutegional (Figure 15) Chez les enfants on observait une seconde semaine conseacutecutive de hausse dans de faibles effectifs (+26 passages soit +31)

La proportion drsquohospitalisations apregraves passage pour suspicion de COVID-19 indicateur de graviteacute agrave lrsquoarriveacutee aux urgences eacutetait en leacutegegravere baisse agrave 35 en semaine S27 (versus 36 en S26 - donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020)

Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 171 631 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

Figure 14 Nombre de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier et depuis le 1er juin 2020 France (source OSCOURreg)

Figure 15 Taux hebdomadaires de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences semaine 27 France (source OSCOURreg)

Situation au 7 juillet 2020 Page 15 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission A partir de cette semaine les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests PCR positifs) en remplacement de lrsquoindicateur R calculeacute agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) Lrsquoavantage de cet indicateur est de repo-ser sur les donneacutees des cas confirmeacutes de COVID-19 et de srsquoappuyer sur un recours au test qui a vocation agrave intervenir rapidement apregraves la survenue des signes eacutevocateurs de COVID-19 Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Le R effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Le nombre de tests positifs peut ecirctre influenceacute par les actions locales de deacutepistage en particulier en cas drsquoidentification de clusters qui permettent drsquoidentifier des infections asymptomatiques Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais doivent ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Les estimations du nombre de reproduction sont baseacutees sur les nombre de tests PCR positifs au SARS-CoV-2 reacutealiseacutes entre le 21 juin et le 27 juin 2020 remonteacutes par le systegraveme SI-DEP

Le nombre de reproduction au niveau de la France meacutetropolitaine est de 105 (intervalle de confiance (IC95 1003-1090) (Tableau 3) et est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (R effectif=090 IC95 086-094) Cet indicateur est significatif en France meacutetropolitaine

Quatre reacutegions ont un nombre de reproduction R estimeacute supeacuterieur agrave 1 de faccedilon significative en Guyane (R=114 IC95 108-121) en diminution pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Nouvelle-Aquitaine (R=132 IC95 104-164) Pays-de-la-Loire (R= 152 IC95 131-173) et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (R = 124 IC95 105-146)

Les reacutegions Bretagne (107 IC95 072-149) Hauts-de-France (106 IC95 094-118) Ile-de-France

(106 IC95 099-113) Normandie (100 IC95 083-117) et La Reacuteunion (147 IC95 093-214) ont des estimations supeacuterieures agrave 1 mais non significativement supeacuterieures (valeur laquo 1 raquo comprise dans lrsquointervalle de confiance) (Tableau 3)

Tableau 3 Nombre de reproduction effectif (R effectif) agrave partir des tests PCR positifs au SARS-COV-2

par reacutegion France entiegravere sur 7 jours glissants du 28 juin au 4 juillet 2020 (Source SI-DEP)

NC le taux de reproduction nrsquoest pas calculable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am

J Epidemiol 2013 178 pp 1505-1512

Reacutegions R effectif Intervalle de confiance (95)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 098 086-112

Bourgogne-Franche-Comteacute 098 074-124

Bretagne 107 072-149

Centre-Val de Loire 097 075-121

Corse NC NC

Grand Est 078 066-091

Hauts-de-France 106 094-118

Ile-de-France 106 099-113

Normandie 100 083-117

Nouvelle-Aquitaine 132 104-164

Occitanie 097 081-115

Pays de la Loire 152 131-173

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 124 105-146

France meacutetropolitaine 105 1003-1094

Guadeloupe NC

La Reacuteunion NC

Martinique NC

Mayotte 076 061-092

Guyane 114 108-121

Situation au 7 juillet 2020 Page 16 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC)

Depuis le 1er mars 2020 1 508 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 105 152 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 4)

minus Lrsquoacircge meacutedian des patients est de 72 ans et 53 sont des hommes

minus 19 457 patients sont deacuteceacutedeacutes 71 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 59 eacutetaient des hommes

minus 77 655 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 07 juillet 2020 7 594 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 538 cas en reacuteanimation

Tableau 4 Nombre de personnes hospitaliseacutees et en reacuteanimation pour COVID-19 le 07 juillet 2020 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars par classe drsquoacircge et par reacutegion France (source SI-VIC)

Figure 16 Evolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 07 juillet France (source SI-VIC)

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

du 10 juin au 16 juin

Surveillance en milieu hospitalier

du 17 juin au 23 juin du 24 juin au 30 juin du 1er au 7 juillet

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

32

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 8: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 8 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Cas confirmeacutes de COVID-19

Les donneacutees permettant drsquoestimer le nombre de cas confirmeacutes en France sont issues de plusieurs sources

Entre le 21 janvier et le 25 mars 2020 25 233 cas de COVID-19 ont eacuteteacute signaleacutes agrave Santeacute publique France via lrsquoapplication GoData ou par transmission des cellules reacutegionales de Santeacute publique France

Entre le 26 mars et le 12 mai 2020 115 010 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes (cas incidents hospitaliers et cas positifs en laboratoire) par les remonteacutees des donneacutees de laboratoires de biologie meacutedicale (source 3 Labo) et des patients hospitaliseacutes pour COVID-19 (source SI-VIC)

Depuis le 13 mai 2020 les cas de COVID-19 sont rapporteacutes par le Systegraveme drsquoInformation de Deacutepistage (SI-DEP) permettant une estimation agrave viseacutee exhaustive des nombres de cas confirmeacutes en France Entre le 13 mai et le 7 juillet 2020 28 567 cas ont eacuteteacute rapporteacutes dans SI-DEP

Il est ainsi estimeacute un total de 168 810 cas confirmeacutes de COVID-19 en France au 07 juillet 2020

De la semaine 15 agrave la semaine 24 le nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes a eacuteteacute en diminution passant de 30 111 cas confirmeacutes en S14 agrave 2 949 cas en S24 Neacuteanmoins depuis la semaine 24 le nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes est agrave nouveau en augmentation passant de 2 949 cas confirmeacutes en S24 agrave 3 684 cas en S27 (Figure 8) On peut notamment expliquer cette augmentation par la situation eacutepideacute-miologique en Guyane Le nombre de cas confirmeacutes en France meacutetropolitaine est eacutegalement en augmenta-tion entre le S26 et la S27 (+290 cas +14) et est en partie lieacutee agrave une augmentation des cas en Mayenne

Au cours de la vague eacutepideacutemique et jusqursquoagrave la leveacutee des mesures de confinement de la population tous les patients preacutesentant des signes de COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer une infection (recommandations ministeacuterielles du 13 mars 2020) Le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France eacutetait donc supeacuterieur au nombre estimeacute de cas confirmeacutes pendant cette peacuteriode Depuis le deacuteconfinement il est demandeacute que les patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs du COVID-19 ainsi que les sujets contacts drsquoun cas confirmeacute soient deacutepisteacutes pour le SARS-CoV-2 [1] A compter de cette date et gracircce au systegraveme SI-DEP le nombre de cas confirmeacutes permet deacutesormais theacuteoriquement drsquoestimer le nombre reacuteel de cas de COVID-19 en France Ce nombre peut cependant ecirctre sous-estimeacute du fait de lrsquoabsence de deacutepistage systeacutematique de personnes infecteacutees symptomatiques ou asymptomatiques [1] DGS-Urgent Prise en charge par les meacutedecins de ville des patients de COVID-19 en phase de

deacuteconfinement Disponible via ce lien cliquez ici

Figure 8 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine rapporteacutes agrave Santeacute publique France du 23 janvier au 4 juillet 2020 (donneacutees arrecircteacutees le 7 juillet 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 9 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Signalement agrave viseacutee drsquoalerte des clusters (ou foyers de transmission)

Preacuteambule Depuis la leveacutee du confinement les ARS en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France et les

partenaires locaux investiguent les clusters deacutetecteacutes selon le guide en vigueur [1] Le traccedilage et le deacutepistage des

personnes contacts permettent de controcircler ces foyers Un cluster est deacutefini par la survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes

ou probables dans une peacuteriode de 7 jours et qui appartiennent agrave une mecircme communauteacute ou ont participeacute agrave un mecircme

rassemblement de personnes qursquoils se connaissent ou non Le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute

publique France permet de preacutesenter ce bilan

Cluster hors Ehpad et milieu familial restreint

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 333 clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) rapporteacutes depuis le

9 mai 313 clusters en France meacutetropolitaine et 20 dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (Figures 9 et 10) Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est stable sur les 5 derniegraveres semaines (S23

- S27) et reste infeacuterieur aux nombres observeacutes sur les semaines S20 agrave S22 Au 8 juillet 68 clusters eacutetaient

toujours en cours drsquoinvestigation

Moins drsquoun quart des clusters signaleacutes depuis le 9 mai sont encore en cours drsquoinvestigation (204

n=68) 126 sont maitriseacutes (suivi des contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le

dernier cas) 622 sont clocirctureacutes (absence de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du

dernier cas ET la fin de la quatorzaine des contacts) Des clusters (48) ont diffuseacute dans la communauteacute

Les 15 clusters en Guyane sont consideacutereacutes agrave diffusion communautaire En France meacutetropolitaine 2

clusters sont en diffusion communautaire 1 en Normandie et 1 en Pays de Loire En termes de criticiteacute (potentiel de transmission ou critegraveres de graviteacute) 79 des clusters sont de criticiteacute

modeacutereacutee (44) agrave eacuteleveacutee (35) Parmi ceux qui restent en cours drsquoinvestigation 31 ont une criticiteacute eacuteleveacutee

Les clusters concernent notamment des eacutetablissements de santeacute (22) des entreprises (18 en entreprises

priveacutees et publiques hors santeacute) et des personnes en situation de preacutecariteacute et de vulneacuterabiliteacute (14 en

eacutetablissements drsquoheacutebergement social et drsquoinsertion et 5 en communauteacutes vulneacuterables) (Tableau 1)

La majoriteacute (70) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 153 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 333 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 5 111 cas

Figure 9 Distribution du nombre de clusters selon leur statut (hors Ehpad et milieu familial restreint) et

du nombre de cas (tous clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020

(N=333) au 8 juillet 2020 (Source MONIC)

[1] Pour en savoir plus Guide pour lidentification et linvestigation de situations de cas groupeacutes de COVID-19

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 10 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 1 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) par type de collectiviteacute

inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=333) (Source MONIC)

Figure 10 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) en cours drsquoinvestigation

par deacutepartement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet juin 2020 (N=68) (Source MONIC)

ES eacutetablissement de santeacute EMS eacutetablissement meacutedico-social

Pour en savoir plus sur les donneacutees reacutegionales consulter Santeacute publique France

Type de collectiviteacutes

Ensemble des

clusters

Clusters en

cours dinvesti-

gation

N=333 N=68

Etablissements de santeacute 74 222 3 44

Entreprises priveacutees et publiques (hors ES) 60 180 17 250

Etablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion 48 144 10 147

Milieu familial eacutelargi (concerne plusieurs foyers familiaux) 43 129 14 206

Milieu scolaire et universitaire 17 51 6 88

EMS de personnes handicapeacutees 16 48 1 15

Communauteacutes vulneacuterables (gens du voyage migrants en situation preacutecaire etc) 16 48 3 44

Uniteacute geacuteographique de petite taille (suggeacuterant exposition commune) 11 33 2 29

Evegravenement public ou priveacute rassemblements temporaires de personnes 9 27 5 74

Etablissement peacutenitentiaires 5 15 0 00

Cregraveches 4 12 0 00

Transport (avion bateau train) 4 12 2 29

Structure de laide sociale agrave lenfance 2 06 0 00

Structures de soins reacutesidentiels des personnes sans domicile fixe 0 00 0 00

Autre 24 72 5 74

Situation au 7 juillet 2020 Page 11 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Clusters en Ehpad

Parallegravelement aux dispositifs de surveillance mis en place dans les ESMS (cf page 12) les eacutepisodes

reacutepondant agrave la deacutefinition de cas drsquoun cluster (survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes ou probables dans une

peacuteriode de 7 jours) sont inteacutegreacutes dans le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute publique

France

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 104 clusters inclus depuis le 9 mai (Figure 11) Le nombre

hebdomadaire de clusters signaleacutes en Ehpad est en nette diminution depuis la semaine 23

Au 8 juillet 87 (n=9) clusters sont encore en cours drsquoinvestigation 163 sont maitriseacutes (suivi des

contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le dernier cas) et 750 sont clocirctureacutes (absence

de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du dernier cas ET la fin de la quatorzaine des

contacts)

La majoriteacute (67) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 13 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 104 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 1 298 cas

De par la nature de cette collectiviteacute lrsquointeacutegraliteacute des clusters en Ehpad est de criticiteacute eacuteleveacutee

Figure 11 Distribution du nombre de clusters en Ehpad selon leur statut et du nombre de cas (tous

clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=104) au 8 juillet 2020

(Source MONIC)

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 12 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS)

Entre le 1er mars et le 06 juillet 2020 8 032 signalements rapportaient un ou plusieurs cas de COVID-19 deacuteclareacutes dans le portail national des signalements de Santeacute publique France et le portail de lrsquoARS Ile-de-France

Il srsquoagissait de 5 051 (63 ) signalements provenant drsquoeacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD EHPA et autres eacutetablissements) et 2 981 (37 ) drsquoautres eacutetablissements meacutedico-sociaux (ESMS)

Parmi les 8 032 signalements (Tableau 2)

minus 39 256 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents

minus 10 476 cas sont deacuteceacutedeacutes dans lrsquoeacutetablissement drsquoaccueil dont 10 390 (99 ) dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

minus 3 916 cas sont deacuteceacutedeacutes agrave lrsquohocircpital

minus 20 391 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes parmi les membres du personnel des ESMS

Depuis le 1er mars et jusqursquoau 06 juillet 2020 parmi les 5 051 signalements en eacutetablissements drsquoheacutebergements pour personnes acircgeacutees (EHPA) 3 379 eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Au cours des deux semaines S26 et S27 (du 22 juin au 5 juillet) parmi lrsquoensemble des EHPA en France (Ile-de-France exclue) 38 eacutetablissements (04) ont deacuteclareacute au moins un nouveau cas confirmeacute de COVID-19 parmi les reacutesidents ou le personnel Sur la mecircme peacuteriode parmi les EHPA en France (Ile-de-France exclue) 22 (02) eacutetablissements ont signaleacute un nouvel eacutepisode (date de deacutebut des signes du premier cas ou agrave deacutefaut date de signalement comprise entre le 22 juin et le 5 juillet) avec au moins un cas confirmeacute

Tableau 2 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoeacutetablissement chez les reacutesidents et le personnel dans les ESMS rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 France

Depuis le 29 juin les nombres de signalements et de deacutecegraves chez les reacutesidents ont diminueacute et ceci est ducirc agrave linfirmation deacutepisodes apregraves

investigation (8 271 signalements et 10 497 deacutecegraves en eacutetablissement avaient eacuteteacute rapporteacutes dans le bulletin de la semaine preacuteceacutedente)

1Etablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres eacutetablissements-EHPA reacutesidences autonomie reacutesidences seniors)

2Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (FAM IME autres eacutetablissements pour enfants (ITEP EAAP IEM Instituts pour deacuteficient auditifs et

visuels) autre eacutetablissements pour adultes (foyer de vie foyer drsquoheacutebergement) 3Aide sociale agrave lrsquoenfance (centres deacutepartementaux de lrsquoenfance

foyers de lrsquoenfance MECS) 4Autres eacutetablissements (LAM LHSS SCAPA avec heacutebergement) 5Un signalement COVID-19 est deacutefini par la

survenue drsquoau moins un cas COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas confirmeacute COVID-19 toute personne symptomatique ou non avec un

preacutelegravevement confirmant lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 parmi les personnes reacutesidentes ou les membres du personnel drsquoun ESMSEHPA 7Cas pos-

sibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Du fait du deacutelai court entre le signalement par les eacutetablissements et la production du point eacutepideacutemiologique les donneacutees les plus reacutecentes ne sont pas consolideacutees Les processus drsquoassurance qualiteacute mis en place au niveau reacutegional peuvent conduire agrave des corrections ulteacuterieures de donneacutees A noter que depuis le 01 juillet 2020 les ESMS drsquoIle-de-France ont commenceacute agrave deacuteclarer leurs eacutepisodes via lrsquoapplication de Santeacute publique France Les donneacutees drsquoIle-de-France sont agrave interpreacuteter avec prudence en attendant que le transfert de donneacutees soit stabiliseacute De plus apregraves investigation 333 eacutepisodes ont eacuteteacute infirmeacutes ce qui influence le nombre de signalements mais peu le nombre de deacutecegraves et pas le nombre de cas confirmeacutes

EHPA1 HPH2

Aide en-

fance3 Autres4 Total

Signalements5 5 051 2 290 367 324 8 032

Chez les

reacutesidents

Cas confirmeacutes6 34 688 3 946 164 458 39 256

Deacutecegraves hocircpitaux7 3 691 204 0 21 3 916

Deacutecegraves eacutetablissements7 10 390 75 0 11 10 476

Chez le

personnel Cas confirmeacutes6 16 522 3 404 279 186 20 391

Situation au 7 juillet 2020 Page 13 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 12 Nombre de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 (n=6 484) par date de deacutebut des signes du premier cas du 1er mars au 6 juillet 2020 France (hors Ile-de-France)

Figure 13 Nombre moyen (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 en France hors

Ile-de-France

Apregraves la deacutecroissance observeacutee depuis deacutebut avril le nombre de signalements reste tregraves faible depuis deacutebut mai il est infeacuterieur agrave 10 signalements par jour depuis au moins 30 jours en France hors

Ile-de-France (Figure 12)

Le nombre de deacutecegraves chez les reacutesidents en eacutetablissement et agrave lrsquohocircpital a atteint un pic deacutebut avril et deacutecroicirct continuellement depuis ce nombre varie entre 0 et 13 deacutecegraves par jour depuis le 1er Juin et eacutetait toujours infeacuterieur agrave 5 deacutecegraves par jour cette derniegravere semaine en France hors Ile-de-France (Figure 13)

Situation au 7 juillet 2020 Page 14 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (Reacuteseau OSCOUR

reg)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 330 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont

eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode repreacutesentant 05 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence du reacuteseau OSCOURreg

Ces passages eacutetaient en leacutegegravere baisse de 5 par rapport agrave la semaine 26 avec une part drsquoactiviteacute stable (1 402 passages et 05 de lrsquoactiviteacute totale en S26 ndash donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020) (Figure 14)

En semaine 27 sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 enregistreacutes au niveau national 21 ont eacuteteacute enregistreacutes en Icircle-de-France 16 en Guyane 8 en Auvergne Rhocircne-Alpes et 8 en Bretagne

En semaine 27 les passages aux urgences eacutetaient en baisse ou se maintenaient agrave un niveau bas pour la 14egraveme semaine conseacutecutive au niveau national et reacutegional (Figure 15) Chez les enfants on observait une seconde semaine conseacutecutive de hausse dans de faibles effectifs (+26 passages soit +31)

La proportion drsquohospitalisations apregraves passage pour suspicion de COVID-19 indicateur de graviteacute agrave lrsquoarriveacutee aux urgences eacutetait en leacutegegravere baisse agrave 35 en semaine S27 (versus 36 en S26 - donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020)

Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 171 631 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

Figure 14 Nombre de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier et depuis le 1er juin 2020 France (source OSCOURreg)

Figure 15 Taux hebdomadaires de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences semaine 27 France (source OSCOURreg)

Situation au 7 juillet 2020 Page 15 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission A partir de cette semaine les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests PCR positifs) en remplacement de lrsquoindicateur R calculeacute agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) Lrsquoavantage de cet indicateur est de repo-ser sur les donneacutees des cas confirmeacutes de COVID-19 et de srsquoappuyer sur un recours au test qui a vocation agrave intervenir rapidement apregraves la survenue des signes eacutevocateurs de COVID-19 Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Le R effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Le nombre de tests positifs peut ecirctre influenceacute par les actions locales de deacutepistage en particulier en cas drsquoidentification de clusters qui permettent drsquoidentifier des infections asymptomatiques Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais doivent ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Les estimations du nombre de reproduction sont baseacutees sur les nombre de tests PCR positifs au SARS-CoV-2 reacutealiseacutes entre le 21 juin et le 27 juin 2020 remonteacutes par le systegraveme SI-DEP

Le nombre de reproduction au niveau de la France meacutetropolitaine est de 105 (intervalle de confiance (IC95 1003-1090) (Tableau 3) et est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (R effectif=090 IC95 086-094) Cet indicateur est significatif en France meacutetropolitaine

Quatre reacutegions ont un nombre de reproduction R estimeacute supeacuterieur agrave 1 de faccedilon significative en Guyane (R=114 IC95 108-121) en diminution pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Nouvelle-Aquitaine (R=132 IC95 104-164) Pays-de-la-Loire (R= 152 IC95 131-173) et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (R = 124 IC95 105-146)

Les reacutegions Bretagne (107 IC95 072-149) Hauts-de-France (106 IC95 094-118) Ile-de-France

(106 IC95 099-113) Normandie (100 IC95 083-117) et La Reacuteunion (147 IC95 093-214) ont des estimations supeacuterieures agrave 1 mais non significativement supeacuterieures (valeur laquo 1 raquo comprise dans lrsquointervalle de confiance) (Tableau 3)

Tableau 3 Nombre de reproduction effectif (R effectif) agrave partir des tests PCR positifs au SARS-COV-2

par reacutegion France entiegravere sur 7 jours glissants du 28 juin au 4 juillet 2020 (Source SI-DEP)

NC le taux de reproduction nrsquoest pas calculable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am

J Epidemiol 2013 178 pp 1505-1512

Reacutegions R effectif Intervalle de confiance (95)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 098 086-112

Bourgogne-Franche-Comteacute 098 074-124

Bretagne 107 072-149

Centre-Val de Loire 097 075-121

Corse NC NC

Grand Est 078 066-091

Hauts-de-France 106 094-118

Ile-de-France 106 099-113

Normandie 100 083-117

Nouvelle-Aquitaine 132 104-164

Occitanie 097 081-115

Pays de la Loire 152 131-173

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 124 105-146

France meacutetropolitaine 105 1003-1094

Guadeloupe NC

La Reacuteunion NC

Martinique NC

Mayotte 076 061-092

Guyane 114 108-121

Situation au 7 juillet 2020 Page 16 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC)

Depuis le 1er mars 2020 1 508 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 105 152 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 4)

minus Lrsquoacircge meacutedian des patients est de 72 ans et 53 sont des hommes

minus 19 457 patients sont deacuteceacutedeacutes 71 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 59 eacutetaient des hommes

minus 77 655 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 07 juillet 2020 7 594 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 538 cas en reacuteanimation

Tableau 4 Nombre de personnes hospitaliseacutees et en reacuteanimation pour COVID-19 le 07 juillet 2020 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars par classe drsquoacircge et par reacutegion France (source SI-VIC)

Figure 16 Evolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 07 juillet France (source SI-VIC)

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

du 10 juin au 16 juin

Surveillance en milieu hospitalier

du 17 juin au 23 juin du 24 juin au 30 juin du 1er au 7 juillet

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

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Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

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Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

32

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Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 9: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 9 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Signalement agrave viseacutee drsquoalerte des clusters (ou foyers de transmission)

Preacuteambule Depuis la leveacutee du confinement les ARS en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France et les

partenaires locaux investiguent les clusters deacutetecteacutes selon le guide en vigueur [1] Le traccedilage et le deacutepistage des

personnes contacts permettent de controcircler ces foyers Un cluster est deacutefini par la survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes

ou probables dans une peacuteriode de 7 jours et qui appartiennent agrave une mecircme communauteacute ou ont participeacute agrave un mecircme

rassemblement de personnes qursquoils se connaissent ou non Le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute

publique France permet de preacutesenter ce bilan

Cluster hors Ehpad et milieu familial restreint

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 333 clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) rapporteacutes depuis le

9 mai 313 clusters en France meacutetropolitaine et 20 dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (Figures 9 et 10) Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est stable sur les 5 derniegraveres semaines (S23

- S27) et reste infeacuterieur aux nombres observeacutes sur les semaines S20 agrave S22 Au 8 juillet 68 clusters eacutetaient

toujours en cours drsquoinvestigation

Moins drsquoun quart des clusters signaleacutes depuis le 9 mai sont encore en cours drsquoinvestigation (204

n=68) 126 sont maitriseacutes (suivi des contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le

dernier cas) 622 sont clocirctureacutes (absence de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du

dernier cas ET la fin de la quatorzaine des contacts) Des clusters (48) ont diffuseacute dans la communauteacute

Les 15 clusters en Guyane sont consideacutereacutes agrave diffusion communautaire En France meacutetropolitaine 2

clusters sont en diffusion communautaire 1 en Normandie et 1 en Pays de Loire En termes de criticiteacute (potentiel de transmission ou critegraveres de graviteacute) 79 des clusters sont de criticiteacute

modeacutereacutee (44) agrave eacuteleveacutee (35) Parmi ceux qui restent en cours drsquoinvestigation 31 ont une criticiteacute eacuteleveacutee

Les clusters concernent notamment des eacutetablissements de santeacute (22) des entreprises (18 en entreprises

priveacutees et publiques hors santeacute) et des personnes en situation de preacutecariteacute et de vulneacuterabiliteacute (14 en

eacutetablissements drsquoheacutebergement social et drsquoinsertion et 5 en communauteacutes vulneacuterables) (Tableau 1)

La majoriteacute (70) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 153 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 333 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 5 111 cas

Figure 9 Distribution du nombre de clusters selon leur statut (hors Ehpad et milieu familial restreint) et

du nombre de cas (tous clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020

(N=333) au 8 juillet 2020 (Source MONIC)

[1] Pour en savoir plus Guide pour lidentification et linvestigation de situations de cas groupeacutes de COVID-19

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 10 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 1 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) par type de collectiviteacute

inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=333) (Source MONIC)

Figure 10 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) en cours drsquoinvestigation

par deacutepartement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet juin 2020 (N=68) (Source MONIC)

ES eacutetablissement de santeacute EMS eacutetablissement meacutedico-social

Pour en savoir plus sur les donneacutees reacutegionales consulter Santeacute publique France

Type de collectiviteacutes

Ensemble des

clusters

Clusters en

cours dinvesti-

gation

N=333 N=68

Etablissements de santeacute 74 222 3 44

Entreprises priveacutees et publiques (hors ES) 60 180 17 250

Etablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion 48 144 10 147

Milieu familial eacutelargi (concerne plusieurs foyers familiaux) 43 129 14 206

Milieu scolaire et universitaire 17 51 6 88

EMS de personnes handicapeacutees 16 48 1 15

Communauteacutes vulneacuterables (gens du voyage migrants en situation preacutecaire etc) 16 48 3 44

Uniteacute geacuteographique de petite taille (suggeacuterant exposition commune) 11 33 2 29

Evegravenement public ou priveacute rassemblements temporaires de personnes 9 27 5 74

Etablissement peacutenitentiaires 5 15 0 00

Cregraveches 4 12 0 00

Transport (avion bateau train) 4 12 2 29

Structure de laide sociale agrave lenfance 2 06 0 00

Structures de soins reacutesidentiels des personnes sans domicile fixe 0 00 0 00

Autre 24 72 5 74

Situation au 7 juillet 2020 Page 11 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Clusters en Ehpad

Parallegravelement aux dispositifs de surveillance mis en place dans les ESMS (cf page 12) les eacutepisodes

reacutepondant agrave la deacutefinition de cas drsquoun cluster (survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes ou probables dans une

peacuteriode de 7 jours) sont inteacutegreacutes dans le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute publique

France

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 104 clusters inclus depuis le 9 mai (Figure 11) Le nombre

hebdomadaire de clusters signaleacutes en Ehpad est en nette diminution depuis la semaine 23

Au 8 juillet 87 (n=9) clusters sont encore en cours drsquoinvestigation 163 sont maitriseacutes (suivi des

contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le dernier cas) et 750 sont clocirctureacutes (absence

de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du dernier cas ET la fin de la quatorzaine des

contacts)

La majoriteacute (67) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 13 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 104 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 1 298 cas

De par la nature de cette collectiviteacute lrsquointeacutegraliteacute des clusters en Ehpad est de criticiteacute eacuteleveacutee

Figure 11 Distribution du nombre de clusters en Ehpad selon leur statut et du nombre de cas (tous

clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=104) au 8 juillet 2020

(Source MONIC)

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 12 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS)

Entre le 1er mars et le 06 juillet 2020 8 032 signalements rapportaient un ou plusieurs cas de COVID-19 deacuteclareacutes dans le portail national des signalements de Santeacute publique France et le portail de lrsquoARS Ile-de-France

Il srsquoagissait de 5 051 (63 ) signalements provenant drsquoeacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD EHPA et autres eacutetablissements) et 2 981 (37 ) drsquoautres eacutetablissements meacutedico-sociaux (ESMS)

Parmi les 8 032 signalements (Tableau 2)

minus 39 256 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents

minus 10 476 cas sont deacuteceacutedeacutes dans lrsquoeacutetablissement drsquoaccueil dont 10 390 (99 ) dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

minus 3 916 cas sont deacuteceacutedeacutes agrave lrsquohocircpital

minus 20 391 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes parmi les membres du personnel des ESMS

Depuis le 1er mars et jusqursquoau 06 juillet 2020 parmi les 5 051 signalements en eacutetablissements drsquoheacutebergements pour personnes acircgeacutees (EHPA) 3 379 eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Au cours des deux semaines S26 et S27 (du 22 juin au 5 juillet) parmi lrsquoensemble des EHPA en France (Ile-de-France exclue) 38 eacutetablissements (04) ont deacuteclareacute au moins un nouveau cas confirmeacute de COVID-19 parmi les reacutesidents ou le personnel Sur la mecircme peacuteriode parmi les EHPA en France (Ile-de-France exclue) 22 (02) eacutetablissements ont signaleacute un nouvel eacutepisode (date de deacutebut des signes du premier cas ou agrave deacutefaut date de signalement comprise entre le 22 juin et le 5 juillet) avec au moins un cas confirmeacute

Tableau 2 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoeacutetablissement chez les reacutesidents et le personnel dans les ESMS rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 France

Depuis le 29 juin les nombres de signalements et de deacutecegraves chez les reacutesidents ont diminueacute et ceci est ducirc agrave linfirmation deacutepisodes apregraves

investigation (8 271 signalements et 10 497 deacutecegraves en eacutetablissement avaient eacuteteacute rapporteacutes dans le bulletin de la semaine preacuteceacutedente)

1Etablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres eacutetablissements-EHPA reacutesidences autonomie reacutesidences seniors)

2Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (FAM IME autres eacutetablissements pour enfants (ITEP EAAP IEM Instituts pour deacuteficient auditifs et

visuels) autre eacutetablissements pour adultes (foyer de vie foyer drsquoheacutebergement) 3Aide sociale agrave lrsquoenfance (centres deacutepartementaux de lrsquoenfance

foyers de lrsquoenfance MECS) 4Autres eacutetablissements (LAM LHSS SCAPA avec heacutebergement) 5Un signalement COVID-19 est deacutefini par la

survenue drsquoau moins un cas COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas confirmeacute COVID-19 toute personne symptomatique ou non avec un

preacutelegravevement confirmant lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 parmi les personnes reacutesidentes ou les membres du personnel drsquoun ESMSEHPA 7Cas pos-

sibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Du fait du deacutelai court entre le signalement par les eacutetablissements et la production du point eacutepideacutemiologique les donneacutees les plus reacutecentes ne sont pas consolideacutees Les processus drsquoassurance qualiteacute mis en place au niveau reacutegional peuvent conduire agrave des corrections ulteacuterieures de donneacutees A noter que depuis le 01 juillet 2020 les ESMS drsquoIle-de-France ont commenceacute agrave deacuteclarer leurs eacutepisodes via lrsquoapplication de Santeacute publique France Les donneacutees drsquoIle-de-France sont agrave interpreacuteter avec prudence en attendant que le transfert de donneacutees soit stabiliseacute De plus apregraves investigation 333 eacutepisodes ont eacuteteacute infirmeacutes ce qui influence le nombre de signalements mais peu le nombre de deacutecegraves et pas le nombre de cas confirmeacutes

EHPA1 HPH2

Aide en-

fance3 Autres4 Total

Signalements5 5 051 2 290 367 324 8 032

Chez les

reacutesidents

Cas confirmeacutes6 34 688 3 946 164 458 39 256

Deacutecegraves hocircpitaux7 3 691 204 0 21 3 916

Deacutecegraves eacutetablissements7 10 390 75 0 11 10 476

Chez le

personnel Cas confirmeacutes6 16 522 3 404 279 186 20 391

Situation au 7 juillet 2020 Page 13 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 12 Nombre de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 (n=6 484) par date de deacutebut des signes du premier cas du 1er mars au 6 juillet 2020 France (hors Ile-de-France)

Figure 13 Nombre moyen (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 en France hors

Ile-de-France

Apregraves la deacutecroissance observeacutee depuis deacutebut avril le nombre de signalements reste tregraves faible depuis deacutebut mai il est infeacuterieur agrave 10 signalements par jour depuis au moins 30 jours en France hors

Ile-de-France (Figure 12)

Le nombre de deacutecegraves chez les reacutesidents en eacutetablissement et agrave lrsquohocircpital a atteint un pic deacutebut avril et deacutecroicirct continuellement depuis ce nombre varie entre 0 et 13 deacutecegraves par jour depuis le 1er Juin et eacutetait toujours infeacuterieur agrave 5 deacutecegraves par jour cette derniegravere semaine en France hors Ile-de-France (Figure 13)

Situation au 7 juillet 2020 Page 14 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (Reacuteseau OSCOUR

reg)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 330 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont

eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode repreacutesentant 05 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence du reacuteseau OSCOURreg

Ces passages eacutetaient en leacutegegravere baisse de 5 par rapport agrave la semaine 26 avec une part drsquoactiviteacute stable (1 402 passages et 05 de lrsquoactiviteacute totale en S26 ndash donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020) (Figure 14)

En semaine 27 sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 enregistreacutes au niveau national 21 ont eacuteteacute enregistreacutes en Icircle-de-France 16 en Guyane 8 en Auvergne Rhocircne-Alpes et 8 en Bretagne

En semaine 27 les passages aux urgences eacutetaient en baisse ou se maintenaient agrave un niveau bas pour la 14egraveme semaine conseacutecutive au niveau national et reacutegional (Figure 15) Chez les enfants on observait une seconde semaine conseacutecutive de hausse dans de faibles effectifs (+26 passages soit +31)

La proportion drsquohospitalisations apregraves passage pour suspicion de COVID-19 indicateur de graviteacute agrave lrsquoarriveacutee aux urgences eacutetait en leacutegegravere baisse agrave 35 en semaine S27 (versus 36 en S26 - donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020)

Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 171 631 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

Figure 14 Nombre de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier et depuis le 1er juin 2020 France (source OSCOURreg)

Figure 15 Taux hebdomadaires de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences semaine 27 France (source OSCOURreg)

Situation au 7 juillet 2020 Page 15 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission A partir de cette semaine les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests PCR positifs) en remplacement de lrsquoindicateur R calculeacute agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) Lrsquoavantage de cet indicateur est de repo-ser sur les donneacutees des cas confirmeacutes de COVID-19 et de srsquoappuyer sur un recours au test qui a vocation agrave intervenir rapidement apregraves la survenue des signes eacutevocateurs de COVID-19 Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Le R effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Le nombre de tests positifs peut ecirctre influenceacute par les actions locales de deacutepistage en particulier en cas drsquoidentification de clusters qui permettent drsquoidentifier des infections asymptomatiques Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais doivent ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Les estimations du nombre de reproduction sont baseacutees sur les nombre de tests PCR positifs au SARS-CoV-2 reacutealiseacutes entre le 21 juin et le 27 juin 2020 remonteacutes par le systegraveme SI-DEP

Le nombre de reproduction au niveau de la France meacutetropolitaine est de 105 (intervalle de confiance (IC95 1003-1090) (Tableau 3) et est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (R effectif=090 IC95 086-094) Cet indicateur est significatif en France meacutetropolitaine

Quatre reacutegions ont un nombre de reproduction R estimeacute supeacuterieur agrave 1 de faccedilon significative en Guyane (R=114 IC95 108-121) en diminution pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Nouvelle-Aquitaine (R=132 IC95 104-164) Pays-de-la-Loire (R= 152 IC95 131-173) et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (R = 124 IC95 105-146)

Les reacutegions Bretagne (107 IC95 072-149) Hauts-de-France (106 IC95 094-118) Ile-de-France

(106 IC95 099-113) Normandie (100 IC95 083-117) et La Reacuteunion (147 IC95 093-214) ont des estimations supeacuterieures agrave 1 mais non significativement supeacuterieures (valeur laquo 1 raquo comprise dans lrsquointervalle de confiance) (Tableau 3)

Tableau 3 Nombre de reproduction effectif (R effectif) agrave partir des tests PCR positifs au SARS-COV-2

par reacutegion France entiegravere sur 7 jours glissants du 28 juin au 4 juillet 2020 (Source SI-DEP)

NC le taux de reproduction nrsquoest pas calculable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am

J Epidemiol 2013 178 pp 1505-1512

Reacutegions R effectif Intervalle de confiance (95)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 098 086-112

Bourgogne-Franche-Comteacute 098 074-124

Bretagne 107 072-149

Centre-Val de Loire 097 075-121

Corse NC NC

Grand Est 078 066-091

Hauts-de-France 106 094-118

Ile-de-France 106 099-113

Normandie 100 083-117

Nouvelle-Aquitaine 132 104-164

Occitanie 097 081-115

Pays de la Loire 152 131-173

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 124 105-146

France meacutetropolitaine 105 1003-1094

Guadeloupe NC

La Reacuteunion NC

Martinique NC

Mayotte 076 061-092

Guyane 114 108-121

Situation au 7 juillet 2020 Page 16 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC)

Depuis le 1er mars 2020 1 508 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 105 152 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 4)

minus Lrsquoacircge meacutedian des patients est de 72 ans et 53 sont des hommes

minus 19 457 patients sont deacuteceacutedeacutes 71 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 59 eacutetaient des hommes

minus 77 655 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 07 juillet 2020 7 594 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 538 cas en reacuteanimation

Tableau 4 Nombre de personnes hospitaliseacutees et en reacuteanimation pour COVID-19 le 07 juillet 2020 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars par classe drsquoacircge et par reacutegion France (source SI-VIC)

Figure 16 Evolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 07 juillet France (source SI-VIC)

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

du 10 juin au 16 juin

Surveillance en milieu hospitalier

du 17 juin au 23 juin du 24 juin au 30 juin du 1er au 7 juillet

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

32

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 10: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 10 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 1 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) par type de collectiviteacute

inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=333) (Source MONIC)

Figure 10 Reacutepartition des clusters (hors Ehpad et milieu familial restreint) en cours drsquoinvestigation

par deacutepartement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet juin 2020 (N=68) (Source MONIC)

ES eacutetablissement de santeacute EMS eacutetablissement meacutedico-social

Pour en savoir plus sur les donneacutees reacutegionales consulter Santeacute publique France

Type de collectiviteacutes

Ensemble des

clusters

Clusters en

cours dinvesti-

gation

N=333 N=68

Etablissements de santeacute 74 222 3 44

Entreprises priveacutees et publiques (hors ES) 60 180 17 250

Etablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion 48 144 10 147

Milieu familial eacutelargi (concerne plusieurs foyers familiaux) 43 129 14 206

Milieu scolaire et universitaire 17 51 6 88

EMS de personnes handicapeacutees 16 48 1 15

Communauteacutes vulneacuterables (gens du voyage migrants en situation preacutecaire etc) 16 48 3 44

Uniteacute geacuteographique de petite taille (suggeacuterant exposition commune) 11 33 2 29

Evegravenement public ou priveacute rassemblements temporaires de personnes 9 27 5 74

Etablissement peacutenitentiaires 5 15 0 00

Cregraveches 4 12 0 00

Transport (avion bateau train) 4 12 2 29

Structure de laide sociale agrave lenfance 2 06 0 00

Structures de soins reacutesidentiels des personnes sans domicile fixe 0 00 0 00

Autre 24 72 5 74

Situation au 7 juillet 2020 Page 11 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Clusters en Ehpad

Parallegravelement aux dispositifs de surveillance mis en place dans les ESMS (cf page 12) les eacutepisodes

reacutepondant agrave la deacutefinition de cas drsquoun cluster (survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes ou probables dans une

peacuteriode de 7 jours) sont inteacutegreacutes dans le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute publique

France

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 104 clusters inclus depuis le 9 mai (Figure 11) Le nombre

hebdomadaire de clusters signaleacutes en Ehpad est en nette diminution depuis la semaine 23

Au 8 juillet 87 (n=9) clusters sont encore en cours drsquoinvestigation 163 sont maitriseacutes (suivi des

contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le dernier cas) et 750 sont clocirctureacutes (absence

de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du dernier cas ET la fin de la quatorzaine des

contacts)

La majoriteacute (67) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 13 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 104 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 1 298 cas

De par la nature de cette collectiviteacute lrsquointeacutegraliteacute des clusters en Ehpad est de criticiteacute eacuteleveacutee

Figure 11 Distribution du nombre de clusters en Ehpad selon leur statut et du nombre de cas (tous

clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=104) au 8 juillet 2020

(Source MONIC)

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 12 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS)

Entre le 1er mars et le 06 juillet 2020 8 032 signalements rapportaient un ou plusieurs cas de COVID-19 deacuteclareacutes dans le portail national des signalements de Santeacute publique France et le portail de lrsquoARS Ile-de-France

Il srsquoagissait de 5 051 (63 ) signalements provenant drsquoeacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD EHPA et autres eacutetablissements) et 2 981 (37 ) drsquoautres eacutetablissements meacutedico-sociaux (ESMS)

Parmi les 8 032 signalements (Tableau 2)

minus 39 256 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents

minus 10 476 cas sont deacuteceacutedeacutes dans lrsquoeacutetablissement drsquoaccueil dont 10 390 (99 ) dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

minus 3 916 cas sont deacuteceacutedeacutes agrave lrsquohocircpital

minus 20 391 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes parmi les membres du personnel des ESMS

Depuis le 1er mars et jusqursquoau 06 juillet 2020 parmi les 5 051 signalements en eacutetablissements drsquoheacutebergements pour personnes acircgeacutees (EHPA) 3 379 eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Au cours des deux semaines S26 et S27 (du 22 juin au 5 juillet) parmi lrsquoensemble des EHPA en France (Ile-de-France exclue) 38 eacutetablissements (04) ont deacuteclareacute au moins un nouveau cas confirmeacute de COVID-19 parmi les reacutesidents ou le personnel Sur la mecircme peacuteriode parmi les EHPA en France (Ile-de-France exclue) 22 (02) eacutetablissements ont signaleacute un nouvel eacutepisode (date de deacutebut des signes du premier cas ou agrave deacutefaut date de signalement comprise entre le 22 juin et le 5 juillet) avec au moins un cas confirmeacute

Tableau 2 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoeacutetablissement chez les reacutesidents et le personnel dans les ESMS rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 France

Depuis le 29 juin les nombres de signalements et de deacutecegraves chez les reacutesidents ont diminueacute et ceci est ducirc agrave linfirmation deacutepisodes apregraves

investigation (8 271 signalements et 10 497 deacutecegraves en eacutetablissement avaient eacuteteacute rapporteacutes dans le bulletin de la semaine preacuteceacutedente)

1Etablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres eacutetablissements-EHPA reacutesidences autonomie reacutesidences seniors)

2Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (FAM IME autres eacutetablissements pour enfants (ITEP EAAP IEM Instituts pour deacuteficient auditifs et

visuels) autre eacutetablissements pour adultes (foyer de vie foyer drsquoheacutebergement) 3Aide sociale agrave lrsquoenfance (centres deacutepartementaux de lrsquoenfance

foyers de lrsquoenfance MECS) 4Autres eacutetablissements (LAM LHSS SCAPA avec heacutebergement) 5Un signalement COVID-19 est deacutefini par la

survenue drsquoau moins un cas COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas confirmeacute COVID-19 toute personne symptomatique ou non avec un

preacutelegravevement confirmant lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 parmi les personnes reacutesidentes ou les membres du personnel drsquoun ESMSEHPA 7Cas pos-

sibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Du fait du deacutelai court entre le signalement par les eacutetablissements et la production du point eacutepideacutemiologique les donneacutees les plus reacutecentes ne sont pas consolideacutees Les processus drsquoassurance qualiteacute mis en place au niveau reacutegional peuvent conduire agrave des corrections ulteacuterieures de donneacutees A noter que depuis le 01 juillet 2020 les ESMS drsquoIle-de-France ont commenceacute agrave deacuteclarer leurs eacutepisodes via lrsquoapplication de Santeacute publique France Les donneacutees drsquoIle-de-France sont agrave interpreacuteter avec prudence en attendant que le transfert de donneacutees soit stabiliseacute De plus apregraves investigation 333 eacutepisodes ont eacuteteacute infirmeacutes ce qui influence le nombre de signalements mais peu le nombre de deacutecegraves et pas le nombre de cas confirmeacutes

EHPA1 HPH2

Aide en-

fance3 Autres4 Total

Signalements5 5 051 2 290 367 324 8 032

Chez les

reacutesidents

Cas confirmeacutes6 34 688 3 946 164 458 39 256

Deacutecegraves hocircpitaux7 3 691 204 0 21 3 916

Deacutecegraves eacutetablissements7 10 390 75 0 11 10 476

Chez le

personnel Cas confirmeacutes6 16 522 3 404 279 186 20 391

Situation au 7 juillet 2020 Page 13 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 12 Nombre de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 (n=6 484) par date de deacutebut des signes du premier cas du 1er mars au 6 juillet 2020 France (hors Ile-de-France)

Figure 13 Nombre moyen (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 en France hors

Ile-de-France

Apregraves la deacutecroissance observeacutee depuis deacutebut avril le nombre de signalements reste tregraves faible depuis deacutebut mai il est infeacuterieur agrave 10 signalements par jour depuis au moins 30 jours en France hors

Ile-de-France (Figure 12)

Le nombre de deacutecegraves chez les reacutesidents en eacutetablissement et agrave lrsquohocircpital a atteint un pic deacutebut avril et deacutecroicirct continuellement depuis ce nombre varie entre 0 et 13 deacutecegraves par jour depuis le 1er Juin et eacutetait toujours infeacuterieur agrave 5 deacutecegraves par jour cette derniegravere semaine en France hors Ile-de-France (Figure 13)

Situation au 7 juillet 2020 Page 14 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (Reacuteseau OSCOUR

reg)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 330 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont

eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode repreacutesentant 05 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence du reacuteseau OSCOURreg

Ces passages eacutetaient en leacutegegravere baisse de 5 par rapport agrave la semaine 26 avec une part drsquoactiviteacute stable (1 402 passages et 05 de lrsquoactiviteacute totale en S26 ndash donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020) (Figure 14)

En semaine 27 sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 enregistreacutes au niveau national 21 ont eacuteteacute enregistreacutes en Icircle-de-France 16 en Guyane 8 en Auvergne Rhocircne-Alpes et 8 en Bretagne

En semaine 27 les passages aux urgences eacutetaient en baisse ou se maintenaient agrave un niveau bas pour la 14egraveme semaine conseacutecutive au niveau national et reacutegional (Figure 15) Chez les enfants on observait une seconde semaine conseacutecutive de hausse dans de faibles effectifs (+26 passages soit +31)

La proportion drsquohospitalisations apregraves passage pour suspicion de COVID-19 indicateur de graviteacute agrave lrsquoarriveacutee aux urgences eacutetait en leacutegegravere baisse agrave 35 en semaine S27 (versus 36 en S26 - donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020)

Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 171 631 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

Figure 14 Nombre de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier et depuis le 1er juin 2020 France (source OSCOURreg)

Figure 15 Taux hebdomadaires de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences semaine 27 France (source OSCOURreg)

Situation au 7 juillet 2020 Page 15 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission A partir de cette semaine les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests PCR positifs) en remplacement de lrsquoindicateur R calculeacute agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) Lrsquoavantage de cet indicateur est de repo-ser sur les donneacutees des cas confirmeacutes de COVID-19 et de srsquoappuyer sur un recours au test qui a vocation agrave intervenir rapidement apregraves la survenue des signes eacutevocateurs de COVID-19 Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Le R effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Le nombre de tests positifs peut ecirctre influenceacute par les actions locales de deacutepistage en particulier en cas drsquoidentification de clusters qui permettent drsquoidentifier des infections asymptomatiques Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais doivent ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Les estimations du nombre de reproduction sont baseacutees sur les nombre de tests PCR positifs au SARS-CoV-2 reacutealiseacutes entre le 21 juin et le 27 juin 2020 remonteacutes par le systegraveme SI-DEP

Le nombre de reproduction au niveau de la France meacutetropolitaine est de 105 (intervalle de confiance (IC95 1003-1090) (Tableau 3) et est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (R effectif=090 IC95 086-094) Cet indicateur est significatif en France meacutetropolitaine

Quatre reacutegions ont un nombre de reproduction R estimeacute supeacuterieur agrave 1 de faccedilon significative en Guyane (R=114 IC95 108-121) en diminution pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Nouvelle-Aquitaine (R=132 IC95 104-164) Pays-de-la-Loire (R= 152 IC95 131-173) et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (R = 124 IC95 105-146)

Les reacutegions Bretagne (107 IC95 072-149) Hauts-de-France (106 IC95 094-118) Ile-de-France

(106 IC95 099-113) Normandie (100 IC95 083-117) et La Reacuteunion (147 IC95 093-214) ont des estimations supeacuterieures agrave 1 mais non significativement supeacuterieures (valeur laquo 1 raquo comprise dans lrsquointervalle de confiance) (Tableau 3)

Tableau 3 Nombre de reproduction effectif (R effectif) agrave partir des tests PCR positifs au SARS-COV-2

par reacutegion France entiegravere sur 7 jours glissants du 28 juin au 4 juillet 2020 (Source SI-DEP)

NC le taux de reproduction nrsquoest pas calculable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am

J Epidemiol 2013 178 pp 1505-1512

Reacutegions R effectif Intervalle de confiance (95)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 098 086-112

Bourgogne-Franche-Comteacute 098 074-124

Bretagne 107 072-149

Centre-Val de Loire 097 075-121

Corse NC NC

Grand Est 078 066-091

Hauts-de-France 106 094-118

Ile-de-France 106 099-113

Normandie 100 083-117

Nouvelle-Aquitaine 132 104-164

Occitanie 097 081-115

Pays de la Loire 152 131-173

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 124 105-146

France meacutetropolitaine 105 1003-1094

Guadeloupe NC

La Reacuteunion NC

Martinique NC

Mayotte 076 061-092

Guyane 114 108-121

Situation au 7 juillet 2020 Page 16 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC)

Depuis le 1er mars 2020 1 508 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 105 152 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 4)

minus Lrsquoacircge meacutedian des patients est de 72 ans et 53 sont des hommes

minus 19 457 patients sont deacuteceacutedeacutes 71 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 59 eacutetaient des hommes

minus 77 655 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 07 juillet 2020 7 594 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 538 cas en reacuteanimation

Tableau 4 Nombre de personnes hospitaliseacutees et en reacuteanimation pour COVID-19 le 07 juillet 2020 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars par classe drsquoacircge et par reacutegion France (source SI-VIC)

Figure 16 Evolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 07 juillet France (source SI-VIC)

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

du 10 juin au 16 juin

Surveillance en milieu hospitalier

du 17 juin au 23 juin du 24 juin au 30 juin du 1er au 7 juillet

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

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Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

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Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 11: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 11 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Clusters en Ehpad

Parallegravelement aux dispositifs de surveillance mis en place dans les ESMS (cf page 12) les eacutepisodes

reacutepondant agrave la deacutefinition de cas drsquoun cluster (survenue drsquoau moins 3 cas confirmeacutes ou probables dans une

peacuteriode de 7 jours) sont inteacutegreacutes dans le systegraveme drsquoinformation MONIC deacuteveloppeacute par Santeacute publique

France

Au 8 juillet 2020 le bilan srsquoeacutelegraveve agrave 104 clusters inclus depuis le 9 mai (Figure 11) Le nombre

hebdomadaire de clusters signaleacutes en Ehpad est en nette diminution depuis la semaine 23

Au 8 juillet 87 (n=9) clusters sont encore en cours drsquoinvestigation 163 sont maitriseacutes (suivi des

contacts en cours et absence de nouveaux cas 7 jours apregraves le dernier cas) et 750 sont clocirctureacutes (absence

de nouveaux cas 14 jours apregraves la date de deacutebut des signes du dernier cas ET la fin de la quatorzaine des

contacts)

La majoriteacute (67) des clusters comporte plus de 5 cas Le nombre moyen de cas par cluster est de 13 cas

(meacutediane = 7 cas) Au total les 104 clusters rapporteacutes sont agrave lrsquoorigine de 1 298 cas

De par la nature de cette collectiviteacute lrsquointeacutegraliteacute des clusters en Ehpad est de criticiteacute eacuteleveacutee

Figure 11 Distribution du nombre de clusters en Ehpad selon leur statut et du nombre de cas (tous

clusters) par semaine de signalement inclus entre le 9 mai et le 8 juillet 2020 (N=104) au 8 juillet 2020

(Source MONIC)

donneacutees provisoires

Situation au 7 juillet 2020 Page 12 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS)

Entre le 1er mars et le 06 juillet 2020 8 032 signalements rapportaient un ou plusieurs cas de COVID-19 deacuteclareacutes dans le portail national des signalements de Santeacute publique France et le portail de lrsquoARS Ile-de-France

Il srsquoagissait de 5 051 (63 ) signalements provenant drsquoeacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD EHPA et autres eacutetablissements) et 2 981 (37 ) drsquoautres eacutetablissements meacutedico-sociaux (ESMS)

Parmi les 8 032 signalements (Tableau 2)

minus 39 256 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents

minus 10 476 cas sont deacuteceacutedeacutes dans lrsquoeacutetablissement drsquoaccueil dont 10 390 (99 ) dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

minus 3 916 cas sont deacuteceacutedeacutes agrave lrsquohocircpital

minus 20 391 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes parmi les membres du personnel des ESMS

Depuis le 1er mars et jusqursquoau 06 juillet 2020 parmi les 5 051 signalements en eacutetablissements drsquoheacutebergements pour personnes acircgeacutees (EHPA) 3 379 eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Au cours des deux semaines S26 et S27 (du 22 juin au 5 juillet) parmi lrsquoensemble des EHPA en France (Ile-de-France exclue) 38 eacutetablissements (04) ont deacuteclareacute au moins un nouveau cas confirmeacute de COVID-19 parmi les reacutesidents ou le personnel Sur la mecircme peacuteriode parmi les EHPA en France (Ile-de-France exclue) 22 (02) eacutetablissements ont signaleacute un nouvel eacutepisode (date de deacutebut des signes du premier cas ou agrave deacutefaut date de signalement comprise entre le 22 juin et le 5 juillet) avec au moins un cas confirmeacute

Tableau 2 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoeacutetablissement chez les reacutesidents et le personnel dans les ESMS rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 France

Depuis le 29 juin les nombres de signalements et de deacutecegraves chez les reacutesidents ont diminueacute et ceci est ducirc agrave linfirmation deacutepisodes apregraves

investigation (8 271 signalements et 10 497 deacutecegraves en eacutetablissement avaient eacuteteacute rapporteacutes dans le bulletin de la semaine preacuteceacutedente)

1Etablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres eacutetablissements-EHPA reacutesidences autonomie reacutesidences seniors)

2Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (FAM IME autres eacutetablissements pour enfants (ITEP EAAP IEM Instituts pour deacuteficient auditifs et

visuels) autre eacutetablissements pour adultes (foyer de vie foyer drsquoheacutebergement) 3Aide sociale agrave lrsquoenfance (centres deacutepartementaux de lrsquoenfance

foyers de lrsquoenfance MECS) 4Autres eacutetablissements (LAM LHSS SCAPA avec heacutebergement) 5Un signalement COVID-19 est deacutefini par la

survenue drsquoau moins un cas COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas confirmeacute COVID-19 toute personne symptomatique ou non avec un

preacutelegravevement confirmant lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 parmi les personnes reacutesidentes ou les membres du personnel drsquoun ESMSEHPA 7Cas pos-

sibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Du fait du deacutelai court entre le signalement par les eacutetablissements et la production du point eacutepideacutemiologique les donneacutees les plus reacutecentes ne sont pas consolideacutees Les processus drsquoassurance qualiteacute mis en place au niveau reacutegional peuvent conduire agrave des corrections ulteacuterieures de donneacutees A noter que depuis le 01 juillet 2020 les ESMS drsquoIle-de-France ont commenceacute agrave deacuteclarer leurs eacutepisodes via lrsquoapplication de Santeacute publique France Les donneacutees drsquoIle-de-France sont agrave interpreacuteter avec prudence en attendant que le transfert de donneacutees soit stabiliseacute De plus apregraves investigation 333 eacutepisodes ont eacuteteacute infirmeacutes ce qui influence le nombre de signalements mais peu le nombre de deacutecegraves et pas le nombre de cas confirmeacutes

EHPA1 HPH2

Aide en-

fance3 Autres4 Total

Signalements5 5 051 2 290 367 324 8 032

Chez les

reacutesidents

Cas confirmeacutes6 34 688 3 946 164 458 39 256

Deacutecegraves hocircpitaux7 3 691 204 0 21 3 916

Deacutecegraves eacutetablissements7 10 390 75 0 11 10 476

Chez le

personnel Cas confirmeacutes6 16 522 3 404 279 186 20 391

Situation au 7 juillet 2020 Page 13 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 12 Nombre de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 (n=6 484) par date de deacutebut des signes du premier cas du 1er mars au 6 juillet 2020 France (hors Ile-de-France)

Figure 13 Nombre moyen (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 en France hors

Ile-de-France

Apregraves la deacutecroissance observeacutee depuis deacutebut avril le nombre de signalements reste tregraves faible depuis deacutebut mai il est infeacuterieur agrave 10 signalements par jour depuis au moins 30 jours en France hors

Ile-de-France (Figure 12)

Le nombre de deacutecegraves chez les reacutesidents en eacutetablissement et agrave lrsquohocircpital a atteint un pic deacutebut avril et deacutecroicirct continuellement depuis ce nombre varie entre 0 et 13 deacutecegraves par jour depuis le 1er Juin et eacutetait toujours infeacuterieur agrave 5 deacutecegraves par jour cette derniegravere semaine en France hors Ile-de-France (Figure 13)

Situation au 7 juillet 2020 Page 14 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (Reacuteseau OSCOUR

reg)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 330 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont

eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode repreacutesentant 05 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence du reacuteseau OSCOURreg

Ces passages eacutetaient en leacutegegravere baisse de 5 par rapport agrave la semaine 26 avec une part drsquoactiviteacute stable (1 402 passages et 05 de lrsquoactiviteacute totale en S26 ndash donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020) (Figure 14)

En semaine 27 sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 enregistreacutes au niveau national 21 ont eacuteteacute enregistreacutes en Icircle-de-France 16 en Guyane 8 en Auvergne Rhocircne-Alpes et 8 en Bretagne

En semaine 27 les passages aux urgences eacutetaient en baisse ou se maintenaient agrave un niveau bas pour la 14egraveme semaine conseacutecutive au niveau national et reacutegional (Figure 15) Chez les enfants on observait une seconde semaine conseacutecutive de hausse dans de faibles effectifs (+26 passages soit +31)

La proportion drsquohospitalisations apregraves passage pour suspicion de COVID-19 indicateur de graviteacute agrave lrsquoarriveacutee aux urgences eacutetait en leacutegegravere baisse agrave 35 en semaine S27 (versus 36 en S26 - donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020)

Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 171 631 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

Figure 14 Nombre de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier et depuis le 1er juin 2020 France (source OSCOURreg)

Figure 15 Taux hebdomadaires de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences semaine 27 France (source OSCOURreg)

Situation au 7 juillet 2020 Page 15 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission A partir de cette semaine les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests PCR positifs) en remplacement de lrsquoindicateur R calculeacute agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) Lrsquoavantage de cet indicateur est de repo-ser sur les donneacutees des cas confirmeacutes de COVID-19 et de srsquoappuyer sur un recours au test qui a vocation agrave intervenir rapidement apregraves la survenue des signes eacutevocateurs de COVID-19 Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Le R effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Le nombre de tests positifs peut ecirctre influenceacute par les actions locales de deacutepistage en particulier en cas drsquoidentification de clusters qui permettent drsquoidentifier des infections asymptomatiques Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais doivent ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Les estimations du nombre de reproduction sont baseacutees sur les nombre de tests PCR positifs au SARS-CoV-2 reacutealiseacutes entre le 21 juin et le 27 juin 2020 remonteacutes par le systegraveme SI-DEP

Le nombre de reproduction au niveau de la France meacutetropolitaine est de 105 (intervalle de confiance (IC95 1003-1090) (Tableau 3) et est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (R effectif=090 IC95 086-094) Cet indicateur est significatif en France meacutetropolitaine

Quatre reacutegions ont un nombre de reproduction R estimeacute supeacuterieur agrave 1 de faccedilon significative en Guyane (R=114 IC95 108-121) en diminution pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Nouvelle-Aquitaine (R=132 IC95 104-164) Pays-de-la-Loire (R= 152 IC95 131-173) et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (R = 124 IC95 105-146)

Les reacutegions Bretagne (107 IC95 072-149) Hauts-de-France (106 IC95 094-118) Ile-de-France

(106 IC95 099-113) Normandie (100 IC95 083-117) et La Reacuteunion (147 IC95 093-214) ont des estimations supeacuterieures agrave 1 mais non significativement supeacuterieures (valeur laquo 1 raquo comprise dans lrsquointervalle de confiance) (Tableau 3)

Tableau 3 Nombre de reproduction effectif (R effectif) agrave partir des tests PCR positifs au SARS-COV-2

par reacutegion France entiegravere sur 7 jours glissants du 28 juin au 4 juillet 2020 (Source SI-DEP)

NC le taux de reproduction nrsquoest pas calculable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am

J Epidemiol 2013 178 pp 1505-1512

Reacutegions R effectif Intervalle de confiance (95)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 098 086-112

Bourgogne-Franche-Comteacute 098 074-124

Bretagne 107 072-149

Centre-Val de Loire 097 075-121

Corse NC NC

Grand Est 078 066-091

Hauts-de-France 106 094-118

Ile-de-France 106 099-113

Normandie 100 083-117

Nouvelle-Aquitaine 132 104-164

Occitanie 097 081-115

Pays de la Loire 152 131-173

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 124 105-146

France meacutetropolitaine 105 1003-1094

Guadeloupe NC

La Reacuteunion NC

Martinique NC

Mayotte 076 061-092

Guyane 114 108-121

Situation au 7 juillet 2020 Page 16 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC)

Depuis le 1er mars 2020 1 508 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 105 152 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 4)

minus Lrsquoacircge meacutedian des patients est de 72 ans et 53 sont des hommes

minus 19 457 patients sont deacuteceacutedeacutes 71 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 59 eacutetaient des hommes

minus 77 655 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 07 juillet 2020 7 594 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 538 cas en reacuteanimation

Tableau 4 Nombre de personnes hospitaliseacutees et en reacuteanimation pour COVID-19 le 07 juillet 2020 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars par classe drsquoacircge et par reacutegion France (source SI-VIC)

Figure 16 Evolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 07 juillet France (source SI-VIC)

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

du 10 juin au 16 juin

Surveillance en milieu hospitalier

du 17 juin au 23 juin du 24 juin au 30 juin du 1er au 7 juillet

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

32

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 12: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 12 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS)

Entre le 1er mars et le 06 juillet 2020 8 032 signalements rapportaient un ou plusieurs cas de COVID-19 deacuteclareacutes dans le portail national des signalements de Santeacute publique France et le portail de lrsquoARS Ile-de-France

Il srsquoagissait de 5 051 (63 ) signalements provenant drsquoeacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD EHPA et autres eacutetablissements) et 2 981 (37 ) drsquoautres eacutetablissements meacutedico-sociaux (ESMS)

Parmi les 8 032 signalements (Tableau 2)

minus 39 256 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents

minus 10 476 cas sont deacuteceacutedeacutes dans lrsquoeacutetablissement drsquoaccueil dont 10 390 (99 ) dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees

minus 3 916 cas sont deacuteceacutedeacutes agrave lrsquohocircpital

minus 20 391 cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes parmi les membres du personnel des ESMS

Depuis le 1er mars et jusqursquoau 06 juillet 2020 parmi les 5 051 signalements en eacutetablissements drsquoheacutebergements pour personnes acircgeacutees (EHPA) 3 379 eacutepisodes comprenaient au moins un cas confirmeacute parmi les reacutesidents ou le personnel

Au cours des deux semaines S26 et S27 (du 22 juin au 5 juillet) parmi lrsquoensemble des EHPA en France (Ile-de-France exclue) 38 eacutetablissements (04) ont deacuteclareacute au moins un nouveau cas confirmeacute de COVID-19 parmi les reacutesidents ou le personnel Sur la mecircme peacuteriode parmi les EHPA en France (Ile-de-France exclue) 22 (02) eacutetablissements ont signaleacute un nouvel eacutepisode (date de deacutebut des signes du premier cas ou agrave deacutefaut date de signalement comprise entre le 22 juin et le 5 juillet) avec au moins un cas confirmeacute

Tableau 2 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoeacutetablissement chez les reacutesidents et le personnel dans les ESMS rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 France

Depuis le 29 juin les nombres de signalements et de deacutecegraves chez les reacutesidents ont diminueacute et ceci est ducirc agrave linfirmation deacutepisodes apregraves

investigation (8 271 signalements et 10 497 deacutecegraves en eacutetablissement avaient eacuteteacute rapporteacutes dans le bulletin de la semaine preacuteceacutedente)

1Etablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPAD et autres eacutetablissements-EHPA reacutesidences autonomie reacutesidences seniors)

2Heacutebergement pour personnes handicapeacutees (FAM IME autres eacutetablissements pour enfants (ITEP EAAP IEM Instituts pour deacuteficient auditifs et

visuels) autre eacutetablissements pour adultes (foyer de vie foyer drsquoheacutebergement) 3Aide sociale agrave lrsquoenfance (centres deacutepartementaux de lrsquoenfance

foyers de lrsquoenfance MECS) 4Autres eacutetablissements (LAM LHSS SCAPA avec heacutebergement) 5Un signalement COVID-19 est deacutefini par la

survenue drsquoau moins un cas COVID-19 confirmeacute ou possible 6Cas confirmeacute COVID-19 toute personne symptomatique ou non avec un

preacutelegravevement confirmant lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 parmi les personnes reacutesidentes ou les membres du personnel drsquoun ESMSEHPA 7Cas pos-

sibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

Du fait du deacutelai court entre le signalement par les eacutetablissements et la production du point eacutepideacutemiologique les donneacutees les plus reacutecentes ne sont pas consolideacutees Les processus drsquoassurance qualiteacute mis en place au niveau reacutegional peuvent conduire agrave des corrections ulteacuterieures de donneacutees A noter que depuis le 01 juillet 2020 les ESMS drsquoIle-de-France ont commenceacute agrave deacuteclarer leurs eacutepisodes via lrsquoapplication de Santeacute publique France Les donneacutees drsquoIle-de-France sont agrave interpreacuteter avec prudence en attendant que le transfert de donneacutees soit stabiliseacute De plus apregraves investigation 333 eacutepisodes ont eacuteteacute infirmeacutes ce qui influence le nombre de signalements mais peu le nombre de deacutecegraves et pas le nombre de cas confirmeacutes

EHPA1 HPH2

Aide en-

fance3 Autres4 Total

Signalements5 5 051 2 290 367 324 8 032

Chez les

reacutesidents

Cas confirmeacutes6 34 688 3 946 164 458 39 256

Deacutecegraves hocircpitaux7 3 691 204 0 21 3 916

Deacutecegraves eacutetablissements7 10 390 75 0 11 10 476

Chez le

personnel Cas confirmeacutes6 16 522 3 404 279 186 20 391

Situation au 7 juillet 2020 Page 13 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 12 Nombre de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 (n=6 484) par date de deacutebut des signes du premier cas du 1er mars au 6 juillet 2020 France (hors Ile-de-France)

Figure 13 Nombre moyen (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 en France hors

Ile-de-France

Apregraves la deacutecroissance observeacutee depuis deacutebut avril le nombre de signalements reste tregraves faible depuis deacutebut mai il est infeacuterieur agrave 10 signalements par jour depuis au moins 30 jours en France hors

Ile-de-France (Figure 12)

Le nombre de deacutecegraves chez les reacutesidents en eacutetablissement et agrave lrsquohocircpital a atteint un pic deacutebut avril et deacutecroicirct continuellement depuis ce nombre varie entre 0 et 13 deacutecegraves par jour depuis le 1er Juin et eacutetait toujours infeacuterieur agrave 5 deacutecegraves par jour cette derniegravere semaine en France hors Ile-de-France (Figure 13)

Situation au 7 juillet 2020 Page 14 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (Reacuteseau OSCOUR

reg)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 330 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont

eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode repreacutesentant 05 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence du reacuteseau OSCOURreg

Ces passages eacutetaient en leacutegegravere baisse de 5 par rapport agrave la semaine 26 avec une part drsquoactiviteacute stable (1 402 passages et 05 de lrsquoactiviteacute totale en S26 ndash donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020) (Figure 14)

En semaine 27 sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 enregistreacutes au niveau national 21 ont eacuteteacute enregistreacutes en Icircle-de-France 16 en Guyane 8 en Auvergne Rhocircne-Alpes et 8 en Bretagne

En semaine 27 les passages aux urgences eacutetaient en baisse ou se maintenaient agrave un niveau bas pour la 14egraveme semaine conseacutecutive au niveau national et reacutegional (Figure 15) Chez les enfants on observait une seconde semaine conseacutecutive de hausse dans de faibles effectifs (+26 passages soit +31)

La proportion drsquohospitalisations apregraves passage pour suspicion de COVID-19 indicateur de graviteacute agrave lrsquoarriveacutee aux urgences eacutetait en leacutegegravere baisse agrave 35 en semaine S27 (versus 36 en S26 - donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020)

Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 171 631 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

Figure 14 Nombre de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier et depuis le 1er juin 2020 France (source OSCOURreg)

Figure 15 Taux hebdomadaires de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences semaine 27 France (source OSCOURreg)

Situation au 7 juillet 2020 Page 15 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission A partir de cette semaine les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests PCR positifs) en remplacement de lrsquoindicateur R calculeacute agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) Lrsquoavantage de cet indicateur est de repo-ser sur les donneacutees des cas confirmeacutes de COVID-19 et de srsquoappuyer sur un recours au test qui a vocation agrave intervenir rapidement apregraves la survenue des signes eacutevocateurs de COVID-19 Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Le R effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Le nombre de tests positifs peut ecirctre influenceacute par les actions locales de deacutepistage en particulier en cas drsquoidentification de clusters qui permettent drsquoidentifier des infections asymptomatiques Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais doivent ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Les estimations du nombre de reproduction sont baseacutees sur les nombre de tests PCR positifs au SARS-CoV-2 reacutealiseacutes entre le 21 juin et le 27 juin 2020 remonteacutes par le systegraveme SI-DEP

Le nombre de reproduction au niveau de la France meacutetropolitaine est de 105 (intervalle de confiance (IC95 1003-1090) (Tableau 3) et est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (R effectif=090 IC95 086-094) Cet indicateur est significatif en France meacutetropolitaine

Quatre reacutegions ont un nombre de reproduction R estimeacute supeacuterieur agrave 1 de faccedilon significative en Guyane (R=114 IC95 108-121) en diminution pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Nouvelle-Aquitaine (R=132 IC95 104-164) Pays-de-la-Loire (R= 152 IC95 131-173) et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (R = 124 IC95 105-146)

Les reacutegions Bretagne (107 IC95 072-149) Hauts-de-France (106 IC95 094-118) Ile-de-France

(106 IC95 099-113) Normandie (100 IC95 083-117) et La Reacuteunion (147 IC95 093-214) ont des estimations supeacuterieures agrave 1 mais non significativement supeacuterieures (valeur laquo 1 raquo comprise dans lrsquointervalle de confiance) (Tableau 3)

Tableau 3 Nombre de reproduction effectif (R effectif) agrave partir des tests PCR positifs au SARS-COV-2

par reacutegion France entiegravere sur 7 jours glissants du 28 juin au 4 juillet 2020 (Source SI-DEP)

NC le taux de reproduction nrsquoest pas calculable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am

J Epidemiol 2013 178 pp 1505-1512

Reacutegions R effectif Intervalle de confiance (95)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 098 086-112

Bourgogne-Franche-Comteacute 098 074-124

Bretagne 107 072-149

Centre-Val de Loire 097 075-121

Corse NC NC

Grand Est 078 066-091

Hauts-de-France 106 094-118

Ile-de-France 106 099-113

Normandie 100 083-117

Nouvelle-Aquitaine 132 104-164

Occitanie 097 081-115

Pays de la Loire 152 131-173

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 124 105-146

France meacutetropolitaine 105 1003-1094

Guadeloupe NC

La Reacuteunion NC

Martinique NC

Mayotte 076 061-092

Guyane 114 108-121

Situation au 7 juillet 2020 Page 16 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC)

Depuis le 1er mars 2020 1 508 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 105 152 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 4)

minus Lrsquoacircge meacutedian des patients est de 72 ans et 53 sont des hommes

minus 19 457 patients sont deacuteceacutedeacutes 71 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 59 eacutetaient des hommes

minus 77 655 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 07 juillet 2020 7 594 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 538 cas en reacuteanimation

Tableau 4 Nombre de personnes hospitaliseacutees et en reacuteanimation pour COVID-19 le 07 juillet 2020 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars par classe drsquoacircge et par reacutegion France (source SI-VIC)

Figure 16 Evolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 07 juillet France (source SI-VIC)

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

du 10 juin au 16 juin

Surveillance en milieu hospitalier

du 17 juin au 23 juin du 24 juin au 30 juin du 1er au 7 juillet

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

32

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 13: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 13 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 12 Nombre de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute) de COVID-19 (n=6 484) par date de deacutebut des signes du premier cas du 1er mars au 6 juillet 2020 France (hors Ile-de-France)

Figure 13 Nombre moyen (moyenne glissante sur 7 jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes du 1er mars au 6 juillet 2020 en France hors

Ile-de-France

Apregraves la deacutecroissance observeacutee depuis deacutebut avril le nombre de signalements reste tregraves faible depuis deacutebut mai il est infeacuterieur agrave 10 signalements par jour depuis au moins 30 jours en France hors

Ile-de-France (Figure 12)

Le nombre de deacutecegraves chez les reacutesidents en eacutetablissement et agrave lrsquohocircpital a atteint un pic deacutebut avril et deacutecroicirct continuellement depuis ce nombre varie entre 0 et 13 deacutecegraves par jour depuis le 1er Juin et eacutetait toujours infeacuterieur agrave 5 deacutecegraves par jour cette derniegravere semaine en France hors Ile-de-France (Figure 13)

Situation au 7 juillet 2020 Page 14 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (Reacuteseau OSCOUR

reg)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 330 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont

eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode repreacutesentant 05 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence du reacuteseau OSCOURreg

Ces passages eacutetaient en leacutegegravere baisse de 5 par rapport agrave la semaine 26 avec une part drsquoactiviteacute stable (1 402 passages et 05 de lrsquoactiviteacute totale en S26 ndash donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020) (Figure 14)

En semaine 27 sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 enregistreacutes au niveau national 21 ont eacuteteacute enregistreacutes en Icircle-de-France 16 en Guyane 8 en Auvergne Rhocircne-Alpes et 8 en Bretagne

En semaine 27 les passages aux urgences eacutetaient en baisse ou se maintenaient agrave un niveau bas pour la 14egraveme semaine conseacutecutive au niveau national et reacutegional (Figure 15) Chez les enfants on observait une seconde semaine conseacutecutive de hausse dans de faibles effectifs (+26 passages soit +31)

La proportion drsquohospitalisations apregraves passage pour suspicion de COVID-19 indicateur de graviteacute agrave lrsquoarriveacutee aux urgences eacutetait en leacutegegravere baisse agrave 35 en semaine S27 (versus 36 en S26 - donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020)

Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 171 631 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

Figure 14 Nombre de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier et depuis le 1er juin 2020 France (source OSCOURreg)

Figure 15 Taux hebdomadaires de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences semaine 27 France (source OSCOURreg)

Situation au 7 juillet 2020 Page 15 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission A partir de cette semaine les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests PCR positifs) en remplacement de lrsquoindicateur R calculeacute agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) Lrsquoavantage de cet indicateur est de repo-ser sur les donneacutees des cas confirmeacutes de COVID-19 et de srsquoappuyer sur un recours au test qui a vocation agrave intervenir rapidement apregraves la survenue des signes eacutevocateurs de COVID-19 Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Le R effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Le nombre de tests positifs peut ecirctre influenceacute par les actions locales de deacutepistage en particulier en cas drsquoidentification de clusters qui permettent drsquoidentifier des infections asymptomatiques Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais doivent ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Les estimations du nombre de reproduction sont baseacutees sur les nombre de tests PCR positifs au SARS-CoV-2 reacutealiseacutes entre le 21 juin et le 27 juin 2020 remonteacutes par le systegraveme SI-DEP

Le nombre de reproduction au niveau de la France meacutetropolitaine est de 105 (intervalle de confiance (IC95 1003-1090) (Tableau 3) et est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (R effectif=090 IC95 086-094) Cet indicateur est significatif en France meacutetropolitaine

Quatre reacutegions ont un nombre de reproduction R estimeacute supeacuterieur agrave 1 de faccedilon significative en Guyane (R=114 IC95 108-121) en diminution pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Nouvelle-Aquitaine (R=132 IC95 104-164) Pays-de-la-Loire (R= 152 IC95 131-173) et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (R = 124 IC95 105-146)

Les reacutegions Bretagne (107 IC95 072-149) Hauts-de-France (106 IC95 094-118) Ile-de-France

(106 IC95 099-113) Normandie (100 IC95 083-117) et La Reacuteunion (147 IC95 093-214) ont des estimations supeacuterieures agrave 1 mais non significativement supeacuterieures (valeur laquo 1 raquo comprise dans lrsquointervalle de confiance) (Tableau 3)

Tableau 3 Nombre de reproduction effectif (R effectif) agrave partir des tests PCR positifs au SARS-COV-2

par reacutegion France entiegravere sur 7 jours glissants du 28 juin au 4 juillet 2020 (Source SI-DEP)

NC le taux de reproduction nrsquoest pas calculable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am

J Epidemiol 2013 178 pp 1505-1512

Reacutegions R effectif Intervalle de confiance (95)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 098 086-112

Bourgogne-Franche-Comteacute 098 074-124

Bretagne 107 072-149

Centre-Val de Loire 097 075-121

Corse NC NC

Grand Est 078 066-091

Hauts-de-France 106 094-118

Ile-de-France 106 099-113

Normandie 100 083-117

Nouvelle-Aquitaine 132 104-164

Occitanie 097 081-115

Pays de la Loire 152 131-173

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 124 105-146

France meacutetropolitaine 105 1003-1094

Guadeloupe NC

La Reacuteunion NC

Martinique NC

Mayotte 076 061-092

Guyane 114 108-121

Situation au 7 juillet 2020 Page 16 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC)

Depuis le 1er mars 2020 1 508 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 105 152 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 4)

minus Lrsquoacircge meacutedian des patients est de 72 ans et 53 sont des hommes

minus 19 457 patients sont deacuteceacutedeacutes 71 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 59 eacutetaient des hommes

minus 77 655 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 07 juillet 2020 7 594 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 538 cas en reacuteanimation

Tableau 4 Nombre de personnes hospitaliseacutees et en reacuteanimation pour COVID-19 le 07 juillet 2020 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars par classe drsquoacircge et par reacutegion France (source SI-VIC)

Figure 16 Evolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 07 juillet France (source SI-VIC)

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

du 10 juin au 16 juin

Surveillance en milieu hospitalier

du 17 juin au 23 juin du 24 juin au 30 juin du 1er au 7 juillet

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

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Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

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Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

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Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

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Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

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En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 14: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 14 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (Reacuteseau OSCOUR

reg)

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet 2020) 1 330 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont

eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode repreacutesentant 05 de lrsquoactiviteacute totale des services drsquourgence du reacuteseau OSCOURreg

Ces passages eacutetaient en leacutegegravere baisse de 5 par rapport agrave la semaine 26 avec une part drsquoactiviteacute stable (1 402 passages et 05 de lrsquoactiviteacute totale en S26 ndash donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020) (Figure 14)

En semaine 27 sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 enregistreacutes au niveau national 21 ont eacuteteacute enregistreacutes en Icircle-de-France 16 en Guyane 8 en Auvergne Rhocircne-Alpes et 8 en Bretagne

En semaine 27 les passages aux urgences eacutetaient en baisse ou se maintenaient agrave un niveau bas pour la 14egraveme semaine conseacutecutive au niveau national et reacutegional (Figure 15) Chez les enfants on observait une seconde semaine conseacutecutive de hausse dans de faibles effectifs (+26 passages soit +31)

La proportion drsquohospitalisations apregraves passage pour suspicion de COVID-19 indicateur de graviteacute agrave lrsquoarriveacutee aux urgences eacutetait en leacutegegravere baisse agrave 35 en semaine S27 (versus 36 en S26 - donneacutees consolideacutees au 7 juillet 2020)

Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 171 631 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 5 juillet 2020 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode)

Figure 14 Nombre de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par jour et classe drsquoacircge depuis le 26 feacutevrier et depuis le 1er juin 2020 France (source OSCOURreg)

Figure 15 Taux hebdomadaires de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences semaine 27 France (source OSCOURreg)

Situation au 7 juillet 2020 Page 15 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission A partir de cette semaine les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests PCR positifs) en remplacement de lrsquoindicateur R calculeacute agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) Lrsquoavantage de cet indicateur est de repo-ser sur les donneacutees des cas confirmeacutes de COVID-19 et de srsquoappuyer sur un recours au test qui a vocation agrave intervenir rapidement apregraves la survenue des signes eacutevocateurs de COVID-19 Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Le R effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Le nombre de tests positifs peut ecirctre influenceacute par les actions locales de deacutepistage en particulier en cas drsquoidentification de clusters qui permettent drsquoidentifier des infections asymptomatiques Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais doivent ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Les estimations du nombre de reproduction sont baseacutees sur les nombre de tests PCR positifs au SARS-CoV-2 reacutealiseacutes entre le 21 juin et le 27 juin 2020 remonteacutes par le systegraveme SI-DEP

Le nombre de reproduction au niveau de la France meacutetropolitaine est de 105 (intervalle de confiance (IC95 1003-1090) (Tableau 3) et est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (R effectif=090 IC95 086-094) Cet indicateur est significatif en France meacutetropolitaine

Quatre reacutegions ont un nombre de reproduction R estimeacute supeacuterieur agrave 1 de faccedilon significative en Guyane (R=114 IC95 108-121) en diminution pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Nouvelle-Aquitaine (R=132 IC95 104-164) Pays-de-la-Loire (R= 152 IC95 131-173) et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (R = 124 IC95 105-146)

Les reacutegions Bretagne (107 IC95 072-149) Hauts-de-France (106 IC95 094-118) Ile-de-France

(106 IC95 099-113) Normandie (100 IC95 083-117) et La Reacuteunion (147 IC95 093-214) ont des estimations supeacuterieures agrave 1 mais non significativement supeacuterieures (valeur laquo 1 raquo comprise dans lrsquointervalle de confiance) (Tableau 3)

Tableau 3 Nombre de reproduction effectif (R effectif) agrave partir des tests PCR positifs au SARS-COV-2

par reacutegion France entiegravere sur 7 jours glissants du 28 juin au 4 juillet 2020 (Source SI-DEP)

NC le taux de reproduction nrsquoest pas calculable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am

J Epidemiol 2013 178 pp 1505-1512

Reacutegions R effectif Intervalle de confiance (95)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 098 086-112

Bourgogne-Franche-Comteacute 098 074-124

Bretagne 107 072-149

Centre-Val de Loire 097 075-121

Corse NC NC

Grand Est 078 066-091

Hauts-de-France 106 094-118

Ile-de-France 106 099-113

Normandie 100 083-117

Nouvelle-Aquitaine 132 104-164

Occitanie 097 081-115

Pays de la Loire 152 131-173

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 124 105-146

France meacutetropolitaine 105 1003-1094

Guadeloupe NC

La Reacuteunion NC

Martinique NC

Mayotte 076 061-092

Guyane 114 108-121

Situation au 7 juillet 2020 Page 16 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC)

Depuis le 1er mars 2020 1 508 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 105 152 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 4)

minus Lrsquoacircge meacutedian des patients est de 72 ans et 53 sont des hommes

minus 19 457 patients sont deacuteceacutedeacutes 71 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 59 eacutetaient des hommes

minus 77 655 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 07 juillet 2020 7 594 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 538 cas en reacuteanimation

Tableau 4 Nombre de personnes hospitaliseacutees et en reacuteanimation pour COVID-19 le 07 juillet 2020 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars par classe drsquoacircge et par reacutegion France (source SI-VIC)

Figure 16 Evolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 07 juillet France (source SI-VIC)

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

du 10 juin au 16 juin

Surveillance en milieu hospitalier

du 17 juin au 23 juin du 24 juin au 30 juin du 1er au 7 juillet

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

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Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

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Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 15: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 15 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Nombre de reproduction effectif laquoR effectifraquo Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori [1] avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission A partir de cette semaine les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees du dispositif SI-DEP (nombre quotidien de tests PCR positifs) en remplacement de lrsquoindicateur R calculeacute agrave partir des passages aux urgences (OSCOURreg) Lrsquoavantage de cet indicateur est de repo-ser sur les donneacutees des cas confirmeacutes de COVID-19 et de srsquoappuyer sur un recours au test qui a vocation agrave intervenir rapidement apregraves la survenue des signes eacutevocateurs de COVID-19 Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Le R effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ 1 agrave 2 semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de 7 jours) Le nombre de tests positifs peut ecirctre influenceacute par les actions locales de deacutepistage en particulier en cas drsquoidentification de clusters qui permettent drsquoidentifier des infections asymptomatiques Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais doivent ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Les estimations du nombre de reproduction sont baseacutees sur les nombre de tests PCR positifs au SARS-CoV-2 reacutealiseacutes entre le 21 juin et le 27 juin 2020 remonteacutes par le systegraveme SI-DEP

Le nombre de reproduction au niveau de la France meacutetropolitaine est de 105 (intervalle de confiance (IC95 1003-1090) (Tableau 3) et est en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (R effectif=090 IC95 086-094) Cet indicateur est significatif en France meacutetropolitaine

Quatre reacutegions ont un nombre de reproduction R estimeacute supeacuterieur agrave 1 de faccedilon significative en Guyane (R=114 IC95 108-121) en diminution pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Nouvelle-Aquitaine (R=132 IC95 104-164) Pays-de-la-Loire (R= 152 IC95 131-173) et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (R = 124 IC95 105-146)

Les reacutegions Bretagne (107 IC95 072-149) Hauts-de-France (106 IC95 094-118) Ile-de-France

(106 IC95 099-113) Normandie (100 IC95 083-117) et La Reacuteunion (147 IC95 093-214) ont des estimations supeacuterieures agrave 1 mais non significativement supeacuterieures (valeur laquo 1 raquo comprise dans lrsquointervalle de confiance) (Tableau 3)

Tableau 3 Nombre de reproduction effectif (R effectif) agrave partir des tests PCR positifs au SARS-COV-2

par reacutegion France entiegravere sur 7 jours glissants du 28 juin au 4 juillet 2020 (Source SI-DEP)

NC le taux de reproduction nrsquoest pas calculable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les 7 derniers jours

[1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am

J Epidemiol 2013 178 pp 1505-1512

Reacutegions R effectif Intervalle de confiance (95)

Auvergne-Rhocircne-Alpes 098 086-112

Bourgogne-Franche-Comteacute 098 074-124

Bretagne 107 072-149

Centre-Val de Loire 097 075-121

Corse NC NC

Grand Est 078 066-091

Hauts-de-France 106 094-118

Ile-de-France 106 099-113

Normandie 100 083-117

Nouvelle-Aquitaine 132 104-164

Occitanie 097 081-115

Pays de la Loire 152 131-173

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 124 105-146

France meacutetropolitaine 105 1003-1094

Guadeloupe NC

La Reacuteunion NC

Martinique NC

Mayotte 076 061-092

Guyane 114 108-121

Situation au 7 juillet 2020 Page 16 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC)

Depuis le 1er mars 2020 1 508 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 105 152 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 4)

minus Lrsquoacircge meacutedian des patients est de 72 ans et 53 sont des hommes

minus 19 457 patients sont deacuteceacutedeacutes 71 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 59 eacutetaient des hommes

minus 77 655 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 07 juillet 2020 7 594 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 538 cas en reacuteanimation

Tableau 4 Nombre de personnes hospitaliseacutees et en reacuteanimation pour COVID-19 le 07 juillet 2020 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars par classe drsquoacircge et par reacutegion France (source SI-VIC)

Figure 16 Evolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 07 juillet France (source SI-VIC)

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

du 10 juin au 16 juin

Surveillance en milieu hospitalier

du 17 juin au 23 juin du 24 juin au 30 juin du 1er au 7 juillet

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

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Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

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Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 16: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 16 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Hospitalisations admissions en reacuteanimation retours agrave domicile (donneacutees SI-VIC)

Depuis le 1er mars 2020 1 508 eacutetablissements de santeacute ont deacuteclareacute au moins un cas de COVID-19 hospitaliseacute

Parmi les 105 152 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars (Tableau 4)

minus Lrsquoacircge meacutedian des patients est de 72 ans et 53 sont des hommes

minus 19 457 patients sont deacuteceacutedeacutes 71 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 59 eacutetaient des hommes

minus 77 655 patients sont retourneacutes agrave domicile

Le 07 juillet 2020 7 594 cas de COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France dont 538 cas en reacuteanimation

Tableau 4 Nombre de personnes hospitaliseacutees et en reacuteanimation pour COVID-19 le 07 juillet 2020 et nombre de retours agrave domicile et de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars par classe drsquoacircge et par reacutegion France (source SI-VIC)

Figure 16 Evolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 07 juillet France (source SI-VIC)

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

du 10 juin au 16 juin

Surveillance en milieu hospitalier

du 17 juin au 23 juin du 24 juin au 30 juin du 1er au 7 juillet

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

32

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 17: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 17 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Au 7 juillet 2020 538 cas de COVID-19 sont toujours hospitaliseacutes en reacuteanimation en France et 21 nouvelles

admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees (Figure 18)

Le nombre hebdomadaire de nouvelles admissions en reacuteanimation reste stable en semaine 27 (73 versus

82 en S26) (Figure 18)

Le nombre journalier de cas hospitaliseacutes en reacuteanimation est toujours en diminution depuis le 8 avril (Figure

18) et se maintient depuis le 9 juin en dessous de 1 000 patients

Sur la semaine du 1er au 7 juillet le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de patients

COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane et il est agrave la hausse (79100 000 habitants contre 52 la semaine preacuteceacute-dente) (Figure 19) Dans toutes les autres reacutegions le taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation de pa-tients COVID-19 est infeacuterieur agrave 05100 000 habitants A Mayotte apregraves plusieurs semaines agrave un niveau eacuteleveacute ce taux srsquoest stabiliseacute agrave 04100 000 habitants

Le plus fort taux hebdomadaire drsquohospitalisations (du 1er au 7 juillet) de patients COVID-19 a eacuteteacute observeacute en Guyane (581100 000 habitants) Les taux hebdomadaires drsquohospitalisations eacutetaient infeacuterieurs agrave 5100 000 habitants dans toutes les autres reacutegions (Figure 16) En Guyane le taux drsquohospitalisation eacutetait en augmentation (530100 000 h la semaine preacuteceacutedente) A Mayotte le taux drsquohospitalisation a poursuivi sa diminution (47100 000 habitants cette semaine contre 75100 000 habitants la semaine preacuteceacutedente) Dans toutes les reacutegions de France meacutetropolitaine il a eacuteteacute observeacute une diminution ou une stabilisation agrave des niveaux bas des taux drsquohospitalisations

Le nombre de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a continueacute de deacutecroicirctre en semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) 646 en S27 versus 666 en S26 (Figure 17) Le nombre journalier de cas COVID-19 hospitaliseacutes est

en constante diminution depuis le 14 avril (Figure 17)

Figure 17 Nombre journalier de cas de COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes et nombre drsquoeacutetablissements deacuteclarant depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 7 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Figure 18 Nombre journalier de nouvelles admissions de patients COVID-19 en reacuteanimation depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 donneacutees au 07 juillet 2020 France (source SI-VIC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

32

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 18: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 18 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 continue de

diminuer en semaine 27 (107 en S27 versus 126 en S26) (Figure 20)

Le nombre hebdomadaire des retours agrave domicile de patients COVID-19 apregraves hospitalisation eacutetait de 1 380 en

semaine 27 (versus 1 545 en S26) (Figure 21)

Figure 20 Nombre journalier de nouveaux deacutecegraves survenus au cours drsquoune hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

Figure 19 Evolution du taux hebdomadaire drsquoadmissions en reacuteanimation pour COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion entre le 10 juin et le 7 juillet France (source SI-VIC)

du 17 au 23 juin 2020 du 10 au 16 juin 2020

Figure 21 Nombre journalier de retours agrave domicile de patients apregraves hospitalisation pour COVID-19 depuis le 19 mars et depuis le 1er juin 2020 France donneacutees au 7 juillet 2020 (source SI-VIC)

du 24 au 30 juin 2020 du 1er au 7 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

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Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

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Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 19: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 19 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine

Estimation de la seacuteropreacutevalence des infections par SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine selon lrsquoacircge et

la reacutegion en semaine 11 et 15 2020

Afin de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie drsquoinfections agrave SARS-CoV-2 en population Santeacute publique France a

mis en place une seacuterie drsquoenquecirctes de seacuteropreacutevalence reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale en collaboration avec le

Centre National de Reacutefeacuterence (CNR) des virus des infections respiratoires (dont la grippe) de lrsquoInstitut Pasteur Il

srsquoagit agrave diffeacuterents temps de lrsquoeacutepideacutemie drsquoestimer la preacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par sexe acircge et

reacutegion de reacutesidence agrave partir drsquoeacutechantillons aleacuteatoires de seacuterums anonymiseacutes issus des seacuterothegraveques (fonds de

tubes) des principaux laboratoires centralisateurs franccedilais Cerba et Eurofins Biomnis (pour la Corse lrsquoensemble

des tubes disponibles ont eacuteteacute utiliseacutes) Les estimations ont eacuteteacute extrapoleacutees agrave la population geacuteneacuterale apregraves

redressement sur la reacutepartition de la population de France meacutetropolitaine par reacutegion de reacutesidence acircge et sexe

(donneacutees Insee 1er janvier 2020) permettant ainsi la comparaison entre reacutegions et dans le temps Lrsquoeacutevaluation

de la preacutevalence drsquoinfection est baseacutee sur le test LuLISA-N deacuteveloppeacutes et calibreacutes par le CNR (cf meacutethodologie)

Nous preacutesentons pour les semaines 11 (9 au 15 mars) et 15 (6 au 12 avril 2020) les preacutevalences des infections agrave SARS-CoV-2

Le nombre de seacuterums analyseacutes srsquoeacutelegraveve agrave 3 221 et 3 084 respectivement pour les semaines 11 et 15

Entre la S11 et S15 la seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 en France meacutetropolitaine a augmenteacute de faccedilon globale passant de 111 [intervalle de confiance agrave 95 006-217] agrave 673 [536-811]

Rapporteacutees agrave la population meacutetropolitaine les donneacutees de seacuteropreacutevalence permettent drsquoestimer que le nombre de personnes infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 srsquoeacutelevait agrave 720 000 [intervalle de confiance agrave 95 389 000 - 1 408 000] et agrave 4 368 000 [3 479 000 - 5 263 000] en semaine 15

Cette augmentation est comparable pour les deux sexes passant de 100 agrave 742 chez lrsquohomme et de

122 agrave 609 chez la femme Pour chacune des mesures une tendance agrave lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence avec lrsquoacircge est observeacutee

A noter que les valeurs ne sont pas distinguables drsquoune preacutevalence nulle pour les classes drsquoacircge infeacuterieures agrave 50 ans lors de la premiegravere mesure en semaine 11 (Tableau 5)

Les tranches drsquoacircge de 50-59 ans et 60-69 ans apparaissent par contre particuliegraverement toucheacutees avec

une preacutevalence de 973 et 1001 respectivement en semaine 15 (Tableau 5) Par ailleurs les niveaux de preacutevalence estimeacutes pour les plus jeunes (591 chez les 0-9 ans et 351 chez les 10-19 ans en semaine 15) attestent drsquoune circulation virale dans cette population apregraves la mi-mars

Par reacutegion les donneacutees de preacutevalences (tous acircges confondus) confirment une diffusion du SARS-CoV-2 agrave

lrsquoensemble des reacutegions meacutetropolitaines avec les preacutevalences les plus eacuteleveacutees observeacutees en semaine 15 dans le Grand-Est (1098 ) et en Ile-de-France (1057 ) et les plus faibles en Corse (061 ) et en Centre-Val de Loire (088 ) (Figure 22)

Tableau 5 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 par tranche drsquoacircge estimeacutee agrave partir du test

seacuterologique LuLISA-N France meacutetropolitaine semaines 11 (du 9 au 15 mars 2020) et 15 (du 6 au 12

avril 2020)

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

32

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 20: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 20 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En prenant en compte les deacutelais meacutedians de seacuteroconversion et drsquoincubation les reacutesultats de la semaine

11 suggegraverent une circulation agrave bas bruit sur lrsquoensemble du territoire franccedilais degraves la semaine 8 (17 au 23 feacutevrier)

Lrsquoaugmentation de la seacuteropreacutevalence en semaine 15 est indicative drsquoune forte progression de la

circulation du virus dans toutes les tranches drsquoacircge de la population ainsi que sur lrsquoensemble du territoire meacutetropolitain

Bien que les personnes acircgeacutees de plus de 60 ans apparaissent avoir eacuteteacute plus exposeacutees agrave lrsquoinfection les jeunes enfants preacutesentent une seacuteropreacutevalence comparable aux adultes

La repreacutesentativiteacute et la capaciteacute de notre eacutechantillonnage de fond de tubes de seacuterums agrave capturer des infections agrave SARS-CoV-2 restent difficiles agrave eacutevaluer pleinement Cependant la reacutepeacutetition de lrsquoeacutechantillonnage dans le temps permet de deacutecrire la dynamique temporo-spatiale de lrsquoeacutepideacutemie

Ces estimations de seacuteropreacutevalence des infections agrave SARS-CoV-2 sont du mecircme ordre de grandeur que

celles drsquoeacutetudes similaires reacutealiseacutees agrave des stades eacutepideacutemiques comparables en avril 2020 en Belgique (de 29 agrave 66 en trois semaines) Espagne (64) et Suisse (de 48 agrave 66)

Les fonds de tubes de la semaine 20 (11 au 17 mai) sont actuellement en cours drsquoanalyse au CNR et

permettront de documenter lrsquoeacutevolution du taux drsquoinfection jusqursquoagrave la fin de la peacuteriode de confinement

Les anticorps neutralisants ont par ailleurs aussi eacuteteacute rechercheacutes par des tests de de pseudo-neutralisation

deacuteveloppeacutes par lrsquoInstitut Pasteur parmi les personnes ayant eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Ces reacutesultats feront lrsquoobjet de futures publications

Meacutethodologique pour deacutefinir le statut drsquoinfection par le SARS-CoV-2 La part de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a eacuteteacute estimeacutee sur la base de la preacutevalence des anticorps

immunoglobulines (Ig) G ciblant la proteacuteine N du virus deacutetecteacutes par LuLISA (Luciferase-Linked ImmunoSorbent Assay)

meacutethode de type ELISA deacuteveloppeacutee par lrsquoInstitut Pasteur Les estimations sont ajusteacutees sur les performances des tests

seacuterologiques4 Conformeacutement aux recommandations de la HAS

5 dans ce contexte de faibles niveaux de preacutevalence

attendus nous avons choisi des seuils de seacuteropositiviteacute correspondant agrave des valeurs de speacutecificiteacute eacuteleveacutee Le seuil de

positiviteacute choisi pour le LuLISA-N correspond agrave une speacutecificiteacute de 99 et une sensibiliteacute de 92

1 Herzog S et al Seroprevalence of IgG antibodies against SARS coronavirus 2 in Belgium a prospective cross-sectional study of residual samples Disponible agrave medRxiv 2020060820125179 doi httpsdoiorg1011012020060820125179 sup2 Estudio ene-covid19primera ronda estudio nacional de sero-epidemiologiacutea de la infeccioacuten por SARS-CoV-2 en Espantildea informe preliminar 13 de mayo de 2020 Instituto de Salud Carlos III httpswwwmscbsgobesgabinetePrensanotaPrensapdf1305130520204528614pdf 3 Stringhini S et al Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Geneva Switzerland (SEROCoV-POP) a population-based study Lancet 2020 Jun 11S0140-6736(20)31304-0 doi 101016S0140-6736(20)31304-0 4 Rogan WJ Gladen B Estimating prevalence from the results of a screening test Am J Epidemiol 1978107(1)71-6 5 HAS Place des tests seacuterologiques dans la strateacutegie de prise en charge de la maladie COVID-19- mai 2020 disponible sur httpswwwhas-santefruploaddocsapplicationpdf2020-05rapport_indications_tests_serologiques_covid-19pdf

Figure 22 Seacuteropreacutevalence de lrsquoinfection par SARS-CoV-2 (tous acircges) par reacutegion estimeacutee agrave partir du

test seacuterologique LuLISA N France meacutetropolitaine semaines 11 (9 au 15 mars 2020 minusA) et

15 (6 au 12 avril 2020 minusB)

Note Les reacutegions pour lesquelles lrsquoestimation nrsquoest pas significativement diffeacuterente de zeacutero sont coloreacutees avec la teinte correspondant agrave une preacutevalence nulle

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

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Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

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Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 21: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 21 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Surveillance de la mortaliteacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Les estimations de la mortaliteacute due agrave la COVID-19 sont baseacutees sur le nombre de patients deacuteceacutedeacutes au cours drsquoune hospitalisation (donneacutees SI-VIC) et le nombre de reacutesidents deacuteceacutedeacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (hors hospitalisation)

Entre le 1er mars et le 7 juillet 2020 29 933 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 19 457 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 10 476 deacutecegraves parmi des reacutesidents en EHPA et autres EMS

Au moins 92 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes sont acircgeacutes de 65 ans ou plus

Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves en France a diminueacute entre les semaines 26 et 27 (124 en S27 vs 164 en S26) Le taux de deacutecegraves hebdomadaire (pour 100 000 habitants) agrave lrsquoeacutechelle nationale est eacutegalement agrave la baisse il eacutetait de 018 en S27 contre 024 en S26

En semaine 27 le plus fort taux de deacutecegraves de patients COVID-19 rapporteacute agrave la population (pour 100 000 habitants) eacutetait observeacute en Guyane (14100 000 h) Pour toutes les autres reacutegions ce taux eacutetait infeacuterieur agrave 05 100 000 habitants (Figure 23)

Les taux hebdomadaires de deacutecegraves (pour 100 000 habitants) continuent de diminuer ou restent stables entre les semaines 26 et 27 dans toutes les reacutegions y compris la Guyane qui passe de 25 deacutecegraves100 000 h en S26 agrave 14100 000 h en S27 (Figure 23)

Semaine 27

Figure 23 Taux de deacutecegraves due agrave la COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves hospitaliers en Ehpa et autres EMS) S24 (du 8 au 14 juin) S25 (du 15 au 21 juin) S26 (du 22 au 28 juin) S27 (29 au 5 juillet) par reacutegion en France (source SI-VIC et ESMS)

Semaine 25 Semaine 24 Semaine 26

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

32

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 22: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 22 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Tableau 6 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves en France du 1er mars au 6 juillet 2020 (donneacutees au 7 juillet 2020) (Source Sante publique France Inserm-CeacutepiDC)

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er

mars 2020 11 145 certificats de deacutecegraves contenaient une mention de COVID-19 parmi les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 6)

minus Lrsquoacircge meacutedian au deacutecegraves eacutetait de 84 ans et 91 avaient 65 ans et plus

minus Les hommes repreacutesentaient 54 de ces deacutecegraves

Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 7 343 deacutecegraves soit 66 des certificats de deacutecegraves Une mention

drsquohypertension arteacuterielle eacutetait indiqueacutee pour 25 de ces deacutecegraves et une mention de pathologie cardiaque pour 34 de ces deacutecegraves

Sur lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes eacutelectroniquement 3 des personnes deacuteceacutedeacutees ne preacutesentaient pas de

comorbiditeacute et eacutetaient acircgeacutees de moins de 65 ans

Sexe n

Hommes 6054 54

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

n n n

0-14 ans 0 0 1 100 1 0

15-44 ans 35 34 68 66 103 1

45-64 ans 278 28 698 72 976 9

65-74 ans 568 33 1 168 67 1 736 16

75 ans ou plus 2 921 35 5 408 65 8 329 75

Tous acircges 3 802 34 7 343 66 11 145 100

Comorbiditeacutes n

Au moins une comorbiditeacute 7343 66

Aucune ou non renseigneacute 3802 34

Description des comorbiditeacutes n

Obeacutesiteacute 439 6

Diabegravete 1196 16

Pathologie respiratoire 958 13

Pathologie cardiaque 2492 34

Hypertension arteacuterielle 1820 25

Pathologie neurologiques 675 9

Pathologie reacutenale 918 13

Immunodeacuteficience 168 2

ce groupe inclut les pathologies neuro-vasculaires et neuro-musculaires 1 preacutesenteacutes en ligne 2 preacutesenteacutes en colonne

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 23: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 23 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes et seront consolideacutees dans les prochaines semaines La hausse de la mortaliteacute observeacutee en Guyane peut ecirctre en lien agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 sans qursquoil ne soit possible agrave ce jour drsquoen estimer la part attribuable preacutecise

Figure 24 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en France de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Mortaliteacute toutes causes

Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national depuis la semaine 18 (du 27 avril au 3 mai) la mortaliteacute est revenue dans les marges de

fluctuation habituelle tous acircges confondus (Figure 24)

Au niveau reacutegional une hausse de la mortaliteacute est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin)

et 26 (du 22 au 28 juin) avec un nombre observeacute de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu sur la semaine 25 (Figure 25) Cet excegraves concerne principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans

On nrsquoobserve pas drsquoexcegraves de mortaliteacute dans les autres reacutegions sur les semaines 23 agrave 26

Figure 25 Mortaliteacute toutes causes toutes classes drsquoacircge confondues en Guyane de la semaine 50-2013 agrave la semaine 26-2020 (Source Santeacute publique France - Insee)

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 24: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 24 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Figure 26 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 25-2020 (Donneacutees

incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 1er juillet) (Source Euromomo)

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

A lrsquoeacutechelle europeacuteenne parmi les 24 pays ou reacutegions qui participent au consortium EuroMOMO (https

wwweuromomoeu) et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France la mortaliteacute est en recul dans la plupart des pays ou reacutegions ayant observeacute un excegraves de mortaliteacute

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait encore observeacute dans 3 paysreacutegions en semaines 22 23 et 24 et dans 2 pays

reacutegions en semaines 25 (Suegravede et Allemagne (Hesse) (Figure 26)

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 25: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 25 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Situation internationale

Au niveau international lrsquoeacutepideacutemie est intense dans de nombreux pays des Ameacuteriques (Etats-Unis Breacutesil Mexique Colombie Peacuterou Chili Argentine) en Asie du Sud-Est (Inde Bangladesh) Asie Centrale (Kazakhstan Kirghizstan) Meacutediterraneacutee orientale (Arabie Saoudite Iran Pakistan Qatar Oman Koweiumlt) La circulation srsquointensifie eacutegalement dans certains pays en Afrique (Algeacuterie Egypte Afrique du Sud) Selon les donneacutees au 6 juillet rapporteacutees par lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute parmi les cas rapporteacutes au cours des derniegraveres 24h la part relative des diffeacuterentes zones geacuteographiques eacutetait la suivante Ameacuteriques (606) Asie du Sud Est (143) Meacutediterraneacutee orientale (86) Europe (84) Afrique (65) Pacifique Occidental (15) En Europe une recrudescence des cas est rapporteacutee dans plusieurs pays drsquoEurope centrale et drsquoEurope de lrsquoEst depuis la mi-juin (Ukraine Moldavie Roumanie Pologne Bulgarie certains pays des Balkans) De plus lrsquoeacutepideacutemie reste active en Suegravede qui preacutesente le taux drsquoincidence au cours des 14 derniers jours le plus eacuteleveacute dans la zone UEEEA (139 100 000 habitants) cet accroissement eacutetant en partie lieacutee agrave une augmentation des tests diagnostiques communautaires Au 3 juillet 2020 pour les 14 derniers jours le taux drsquoincidence moyen rapporteacute par les pays de lrsquoUEEEA et Royaume-Uni eacutetait de 13 100 000 habitants En France il eacutetait de 115 100 000 habitants (Figure 27) Dans les pays de lrsquoEurope de lrsquoOuest et du Sud le niveau de transmission communautaire se maintient agrave un niveau faible par rapport aux vagues eacutepideacutemiques survenues en mars-avril Au 7 juillet le taux drsquoincidence en France au cours des 14 derniers jours eacutetait de 113 100 000 habitants et il eacutetait comparable agrave celui rapporteacute dans les pays limitrophes (hors Luxembourg ougrave une augmentation de lrsquoincidence a reacutecemment eacuteteacute rapporteacutee) Suite agrave lrsquoassouplissement progressif des mesures de restriction dans les pays europeacuteens et de la leveacutee du confinement instaureacute dans certains pays des foyers de cas localiseacutes sont de plus en plus rapporteacutes Des foyers importants ont eacuteteacute identifieacutes agrave la fin du mois de juin dans certains pays Allemagne (usine de transformation de viande Guumltersloh) Royaume-Uni (ville de Leicester) Espagne (reacutegion de Huesca en Aragoacuten reacutegion de Segriaacute en Catalogne et reacutegion de A Marintildea en Galice) Portugal (nord de Lisbonne) Des mesures restrictives et des confinements localiseacutes ont eacuteteacute remis en place dans ces reacutegions pour preacutevenir le risque de diffusion communau-taire Il est noteacute dans de nombreux pays dont la France la survenue de foyers de cas dans certains secteurs industriels (industrie de la viande construction plateforme logistique mines) ou agricoles Les conditions de travail et de vie des travailleurs de ces secteurs associant une forte promiscuiteacute et preacutecariteacute peuvent expliquer la survenue de ces foyers de cas Comme en France des clusters en eacutetablissements hospitaliers et institutions pour personnes acircgeacutees continuent agrave ecirctre rapporteacutes dans les pays europeacuteens Par ailleurs des augmentations de cas ont eacuteteacute rapporteacutees agrave la fin du mois de juin en Suisse et au Luxembourg avec des foyers de cas lieacutes agrave des fecirctes priveacutees (Luxembourg) et la freacutequentation de boites de nuit (Suisse) Dans ces deux pays les autoriteacutes ont eacutemis des recommandations incitant la population agrave respecter les mesures de distanciation

Pour plus drsquoinformations sur la situation En Europe European Centre for Disease Prevention and Control Weekly surveillance summary (week 26) mis agrave jour le 4 juillet 2020 Dans le monde Organisation mondiale de la santeacute tableau de bord COVID-19 et Situation report du 6 juillet 2020

Figure 27 Taux drsquoincidence de COVID-19 rapporteacute

pour les semaines 25 et 26 dans les pays de lrsquoUEEAA

(source ECDC)

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

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Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 26: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 26 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Preacutevention

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale Enquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) Reacutesultats vague 1 (23-25 mars) vague 2 (30 mars-1er avril) vague 3 (14-16 avril) vague 4 (20-22 avril) vague 5 (28-30 avril) vague 6 (4-6 mai) vague 7 (13-15 mai) vague 8 (18-20 mai) vague 9 (27-29 mai)

vague 10 (8-10 juin) et vague 11 (22-24 juin 2020)

En termes de mesures de preacutevention les derniers reacutesultats montraient que lrsquoadoption systeacutematique des mesures de preacutevention laquo Saluer sans se serrer la main et arrecircter les embrassades raquo et laquo Garder une dis-tance drsquoau moins 1 megravetre raquo continuaient de diminuer (-15 points depuis la leveacutee du confinement) Lrsquoadoption systeacutematique des mesures drsquohygiegravene (se laver reacuteguliegraverement les mains tousser dans son coude utiliser un mouchoir agrave usage unique) avaient globalement diminueacute depuis la leveacutee du confinement puis srsquoeacutetait stabiliseacutee entre la vague 10 et la vague 11 Le port systeacutematique du masque en public avait progresseacute jusqursquoen vague 8 (deux semaines apregraves la fin du confinement) puis avait diminueacute entre les vagues 9 et 10 et srsquoeacutetait stabiliseacute en vague 11 (Figure 28)

Les indicateurs de santeacute mentale des reacutepondants continuent de srsquoameacuteliorer en vague 11 avec une

diminution significative des eacutetats deacutepressifs des eacutetats anxieux et des problegravemes de sommeil depuis la leveacutee du confinement (Figure 29)

Pas de nouveaux reacutesultats cette semaine mais vous pouvez retrouver tous les reacutesultats disponibles sur le

site de Santeacute publique France

Figure 29 Preacutevalences et eacutevolutions des indicateurs de santeacute mentale et des problegravemes de sommeil ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Figure 28 Freacutequences de ladoption systeacute-matique deacuteclareacutee des mesures de preacutevention et eacutevolutions ( pondeacutereacutes) Enquecircte CoviPrev France meacutetropolitaine 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

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Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

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Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 27: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 27 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

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Etude qualitative ViQuoP Santeacute publique France - Kantar

laquo Vie quotidienne et preacutevention au sein drsquoune communauteacute en ligne agrave lrsquoheure du coronavirus raquo

Suivi de cohorte de mars agrave juin 2020

Les reacutesultats principaux de lrsquoeacutetude ViQuoP sont progressivement partageacutes sur le site de Santeacute publique

France pour les 6 theacutematiques suivantes

minus Evolution des perceptions et pratiques des gestes barriegraveres

minus Adheacutesion et compreacutehension des mesures drsquoisolement et de deacutepistage minus Evolution des perceptions drsquoeacutetat de santeacute et de bien-ecirctre

minus Evolution des consommations de tabac alcool cannabis et autres substances psycho-actives

minus Evolution des pratiques alimentaires de lrsquoactiviteacute physique et de la seacutedentariteacute

minus Evolution des relations sociales affectives et sexuelles

Production drsquooutils de preacutevention

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Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

32

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 28: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 28 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Synthegravese mdash conclusion

En France meacutetropolitaine le pic eacutepideacutemique en milieu communautaire a eacuteteacute observeacute en semaine 13 (23-29 mars) soit une semaine apregraves la mise en œuvre des mesures de confinement de la population geacuteneacuterale le 17 mars 2020 Le nombre hebdomadaire le plus eacuteleveacute de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 a eacuteteacute observeacute au cours de la semaine 14 (30 mars - 5 avril) Les indicateurs ont ensuite suivi des eacutevolutions agrave la baisse

En semaine 27 (du 29 juin au 5 juillet) le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence et le nombre drsquoactes SOS meacutedecins pour suspicion de COVID-19 sont en augmentation en comparaison agrave la

semaine preacuteceacutedente Le nombre de reproduction effectif (R effectif) en France meacutetropolitaine est supeacuterieur agrave 1

Ces reacutesultats sont en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation de la circulation du virus en France

meacutetropolitaine

Les nombres de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 les nombres drsquohospitalisation et nombres drsquoadmission en reacuteanimation qui sont des indicateurs plus tardifs continuent en revanche de montrer des tendances agrave la baisse Le nombre de patients actuellement hospitaliseacutes en reacuteanimation pour COVID-19 est infeacuterieur agrave 600 patients

Bien que ces augmentations soient limiteacutees (nombre hebdomadaire de cas confirmeacutes +14 entre S26 et S27 en France meacutetropolitaine) elles surviennent alors que le recours aux soins et la reacutealisation de tests RT-PCR des personnes preacutesentant des signes cliniques compatibles avec une infection COVID-19 restent tregraves insuffisants Dans le cadre de la surveillance COVIDNet il apparait que seules 17 des personnes ayant preacutesenteacute des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont beacuteneacuteficieacute drsquoune prescription pour un test diagnostique et seules 12 ont rapporteacute avoir eacuteteacute testeacutees en RT-PCR Par voie de conseacutequence les nombres de cas confirmeacutes et les augmentations observeacutees pourraient ecirctre fortement sous-estimeacutes

Lrsquoaugmentation du nombre et des incidences des cas de COVID-19 sont agrave associer agrave lrsquoaccentuation de lrsquoeffort de deacutepistage (augmentation du nombre de patients testeacutes entre les semaines 26 et S27 +26) Cet effort de deacutepistage se traduit par des baisses du taux de positiviteacute des preacutelegravevements en France meacutetropolitaine (-15) Dans la majoriteacute des deacutepartements et reacutegions les taux de positiviteacute et les taux drsquoincidences reacutegionaux sont en baisse ou se maintiennent agrave des niveaux faibles Lrsquoaugmentation des actes SOS meacutedecins qui concernent notamment les moins de 15 ans pourrait en partie srsquoexpliquer par la reprise des activiteacutes scolaires dans le cadre drsquoune augmentation des symptomatologies respiratoires Conformeacutement aux mesures de preacutevention agrave ap-pliquer ces tableaux cliniques ont contribueacute agrave augmenter les demandes de tests pour COVID-19

Au niveau reacutegional les estimations du nombre de reproduction effectif (R effectif) sont significativement supeacuterieures agrave 1 dans 3 reacutegions de France meacutetropolitaine Pays de la Loire Nouvelle-Aquitaine et Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur Le R effectif repreacutesente le nombre moyen de personnes infecteacutees (cas secondaires) par une personne infectieuse (cas index) Le calcul de cet indicateur est effectueacute agrave partir des reacutesultats virologiques (donneacutees SI-DEP) et permet de refleacuteter la dynamique reacutecente de circulation locale du virus Ces estimations peuvent cependant ecirctre influenceacutees par lactiviteacute de diagnostic et les actions locales de deacutepistage Il est ainsi indispensable de les interpreacuteter en tenant compte du contexte local en les mettant en perspective avec les autres indicateurs produits Des analyses contextualiseacutees deacutepartementales reacutealiseacutees par les cellules reacutegionales de Santeacute publique France en lien avec les Agences Reacutegionales de Santeacute permettent une analyse preacutecise de la situation

En Pays de la Loire lrsquoeacutevolution du R effectif est agrave lier la situation eacutepideacutemiologique en Mayenne Dans ce deacutepartement la situation eacutepideacutemiologique invite agrave la vigilance Les indicateurs virologiques (SI-DEP) sont en augmentation le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 est supeacuterieur agrave 10100 000 habitants (45100 000 en S27) le taux de positiviteacute des preacutelegravevements est supeacuterieur agrave 5 (85 en S27) Six clusters ont eacuteteacute identifieacutes dans ce deacutepartement et un cluster fait deacutesormais lrsquoobjet drsquoune diffusion communautaire Ces indicateurs indiquent une acceacuteleacuteration rapide de la transmission notamment dans la reacutegion de Laval qui ont ameneacute agrave mettre en place des mesures de controcircle de lrsquoeacutepideacutemie renforceacutees Le deacutepistage de la population est actuellement en cours Les autres indicateurs (passages aux urgences hospitalisation) ne montrent en revanche pas drsquoaugmentation agrave cette date Dans les autres deacutepartements de la reacutegion Pays de la Loire les indicateurs eacutepideacutemiologiques lieacutes agrave lrsquoactiviteacute COVID-19 sont globalement stables ou orienteacutes agrave la baisse

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

32

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 29: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

Situation au 7 juillet 2020 Page 29 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deux autres reacutegions preacutesentant des R effectifs significatifs la Nouvelle-Aquitaine et la Provence-Alpes-Cocircte-drsquoAzur si le nombre de cas confirmeacutes le taux drsquoincidence des cas sont en augmentation ils restent agrave des niveaux faibles (lt3100 000 hab et lt06) Les taux de positiviteacute les consultations SOS meacutedecins et les nombres de passages aux urgences restent eacutegalement agrave des niveaux bas Dans ces deux reacutegions les nombres de patients testeacutes sont en augmentation

Les clusters (hors eacutepisodes familiaux en milieux restreints) sont identifieacutes et investigueacutes par les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Au 8 juillet 68 clusters survenus en France meacutetropolitaine sont ainsi encore en cours drsquoinvestigation Le nombre hebdomadaire de clusters signaleacutes est relativement stable sur les 5 derniegraveres semaines Les clusters en cours drsquoinvestigation sont principalement survenus dans des entreprises priveacutees ou publiques des milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) ou des eacutetablissements sociaux drsquoheacutebergement et drsquoinsertion Le signalement de ces clusters depuis la leveacutee du confinement nrsquoest pas une situation inattendue du fait de la poursuite de la circulation du SARS-CoV-2 en France de lrsquoaugmentation importante des capaciteacutes diagnostiques et de la recherche active de cas autour de chaque patient infecteacute [1] En France meacutetropolitaine deux eacutepisodes preacutesentent deacutesormais une diffusion communautaire (Normandie et Pays de la Loire) Les clusters survenus dans les eacutetablissements meacutedico-sociaux (incluant les maisons de retraite Ehpad) ont eacuteteacute suivis tout au long de lrsquoeacutepideacutemie et le nombre de nouveaux eacutepisodes signaleacute par ces eacutetablissements est deacutesormais tregraves faible

Une vigilance particuliegravere meacuterite drsquoecirctre faite notamment sur les clusters survenant dans les milieux familiaux eacutelargis (plusieurs foyers familiaux concerneacutes) qui sont susceptibles drsquoaugmenter au cours de la

peacuteriode estivale

Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves et le taux de deacutecegraves lieacutes au COVID-19 pour 100 000 habitants sont en diminution depuis la semaine 15 (6 au 12 avril) Lrsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes observeacute entre les semaines 12 et 17 (du 16 mars au 26 avril) a eacuteteacute particuliegraverement marqueacute dans les reacutegions Grand Est et Ile-de-France ougrave la circulation du SARS-CoV-2 a eacuteteacute intense La mortaliteacute est deacutesormais revenue dans les marges de fluctuation habituelle en France meacutetropolitaine aussi bien dans les analyses tous acircges confondus que chez les personnes de 65 ans ou plus Un recul de la mortaliteacute est eacutegalement observeacute dans la plupart des pays europeacuteens ayant rapporteacute un excegraves

Les enquecirctes de seacuteropreacutevalence meneacutees en France meacutetropolitaine sont indispensables pour estimer le nombre de personnes infecteacutees pendant la vague eacutepideacutemique passeacutee La proportion de la population ayant eacuteteacute infecteacutee par le SARS-CoV-2 a augmenteacute de faccedilon significative au cours de lrsquoeacutepideacutemie 11 de la population avait eacuteteacute infecteacutee en semaine 11 (du 9 au 15 mars 2020) et ce pourcentage eacutetait de 67 en semaine 15 Rapporteacute agrave la population il peut ainsi ecirctre estimeacute que 720 000 personnes avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 en semaine 11 soit une semaine avant la mise en œuvre des mesures de confinement et qursquoelles eacutetaient 4 368 000 en semaine 15 soit deux semaines apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie Les personnes acircgeacutees de 50 agrave 69 ans sont celles ayant eacuteteacute le plus toucheacutees par llsquoeacutepideacutemie Il est estimeacute qursquoagrave la mi-avril 2020 (S15) 10 des personnes appartenant agrave cette tranche drsquoacircge avaient eacuteteacute infecteacutees par le SARS-CoV-2 Les enfants ont en revanche eacuteteacute moins toucheacutes (6 des 0 agrave 9 ans et 35 des 10 agrave 19 ans) Lrsquoanalyse reacutegionale confirme la diffusion plus importante du SARS-CoV-2 en reacutegion Grand-Est (11 de la population toucheacutee en S15) et en Ile-de-France (106) la Corse et le Centre-Val de Loire ayant en revanche eacuteteacute relativement eacutepargneacutes avec moins de 1 des populations de ces reacutegions toucheacutees Ces reacutesultats suggegraverent eacutegalement une circulation agrave bas bruit du virus degraves la semaine 8 (du 17 au 23 feacutevrier 2020) Cette estimation reacutealiseacutee la semaine apregraves le pic de lrsquoeacutepideacutemie indique que le nombre de cas identifieacutes par la surveillance (pregraves de 170 000 personnes) ne preacutesente qursquoune faible part des personnes infecteacutees Conformeacutement aux recommandations tous les patients preacutesentant des signes COVID-19 nrsquoont pas systeacutematiquement beacuteneacuteficieacute drsquoun test biologique pour confirmer lrsquoinfection De plus le nombre de cas a eacutegalement eacuteteacute sous-estimeacute du fait des patients peu symptomatiques ou asymptomatiques nrsquoayant pas beacuteneacuteficieacute drsquoune confirmation virologique

Situation au 7 juillet 2020 Page 30 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

32

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

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En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

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Dans les deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) lrsquoactiviteacute lieacutee au SARS-CoV-2 eacutetait faible dans les Antilles et agrave La Reacuteunion En revanche agrave Mayotte et en Guyane la situation eacutepideacutemique incite agrave maintenir

une vigilance accrue

En Guyane en semaine 27 les indicateurs restent agrave des valeurs eacuteleveacutees et poursuivent leur augmentation Lrsquoeacutepideacutemie continue de diffuser dans cette reacutegion Le taux drsquoincidence des cas de COVID-19 continue de progresser (458100 000 habitants en S27 vs 436100 000 habitants en S26 Le taux de positiviteacute des patients testeacutes se stabilise (265 en S27 vs 255 en S26) Le R effectif reste significativement supeacuterieur agrave 1 signant la poursuite de la diffusion de lrsquoeacutepideacutemie Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement son augmentation (581100 000 h en S27 vs 530100 000 h en S26) ainsi que le taux drsquoadmission en reacuteani-mation (79100 000 h en S27 vs 52100 000 h en S26) Les douze clusters identifieacutes en Guyane sont deacutesormais consideacutereacutes avoir une diffusion communautaire Un excegraves de la mortaliteacute toutes causes est observeacutee en Guyane sur les semaines 25 (du 15 au 21 juin) et 26 (du 22 au 28 juin) Cet excegraves con-cerne

principalement les personnes acircgeacutees de plus de 65 ans La Guyane est entreacutee en phase 3 le 15 juin 2020

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie se poursuit bien que les indicateurs soient en baisse En semaine 27 les indica-

teurs restent encore agrave des niveaux eacuteleveacutes comme en teacutemoignent le taux drsquoincidence des cas de COVID-19

(34100 000 habitants en S27 vs 46100 000 habitants en S26) et le taux de positiviteacute des preacutelegravevements

(114 en S27 vs 183 en S26) Le taux drsquohospitalisation continue eacutegalement agrave diminuer (47100 000 h en

S27 vs 75 en S26) et le taux drsquoadmission en reacuteanimation pour COVID-19 se stabilise agrave 04100 000 habitants

Il nrsquoy a plus de cluster en cours

En France meacutetropolitaine et dans les DROM les personnes les plus gravement toucheacutees par cette eacutepideacutemie sont les patients acircgeacutes de plus de 65 ans ainsi que les patients preacutesentant des comorbiditeacutes Les donneacutees de surveillance montrent que les enfants sont moins toucheacutes par le COVID-19 (moins de 1 des patients hospitaliseacutes et des deacutecegraves)

La surveillance des professionnels de santeacute fait lrsquoobjet drsquoune surveillance particuliegravere Du fait des faibles nombres de cas rapporteacutes ces derniegraveres semaines ces donneacutees ne paraissent plus dans le Point eacutepideacutemiolo-gique hebdomadaire Lrsquoensemble des reacutesultats sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute libeacuteraux peuvent srsquoils ont eacuteteacute atteints par le SARS-CoV-2 participer agrave lrsquoenquecircte proposeacutee sur le site du Geres

Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

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Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

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12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

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En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

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Situation au 7 juillet 2020 Page 31 Point eacutepideacutemiologique COVID-19

En conclusion

En France meacutetropolitaine la circulation du virus tend agrave augmenter comme en teacutemoignent lrsquoaugmentation

de lrsquoincidence des cas de COVID-19 lrsquoaugmentation des nombres de cas ainsi que le R effectif qui est

significativement supeacuterieur agrave 1 Cette nouvelle tendance si elle est concomitante drsquoune augmentation du

nombre de tests RT-PCR reacutealiseacutes nrsquoen indique pas moins une transmission qui permet au virus de se

maintenir voire de progresser Elle srsquoinscrit eacutegalement dans le contexte ougrave une proportion tregraves insuffisante de

patients preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 ont recours aux soins et reacutealisent un test

diagnostic

En Mayenne la situation eacutepideacutemiologique a rapidement eacutevolueacute avec agrave la fois une incidence et un taux de

positiviteacute eacuteleveacute en lien avec des clusters critiques dont certains sont survenus dans des abattoirs et des

eacutetablissements meacutedicaux sociaux La situation du deacutepartement teacutemoigne du fort potentiel eacutevolutif qui

demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables Comme

lrsquoindique lrsquoexpeacuterience reacutecente de plusieurs pays Europeacuteens des clusters de cette nature peuvent aboutir agrave

des situations insuffisamment controcircleacutees pouvant justifier des mesures de gestion plus contraignantes

En Guyane lrsquoeacutepideacutemie lieacutee au SARS-CoV-2 continue sa progression le pic eacutepideacutemique nrsquoa pas encore eacuteteacute

deacutepasseacute sur ce territoire

A Mayotte lrsquoeacutepideacutemie est deacutesormais en phase deacutecroissante bien que la circulation virale reste agrave un niveau

eacuteleveacute

La poursuite de la circulation virale invite ainsi agrave maintenir la plus grande vigilance La perspective

des congeacutes drsquoeacuteteacute susceptibles de favoriser les comportements agrave risque notamment dans le cadre

drsquoeacutevegravenements et de regroupement familiaux ou amicaux et la diminution de lrsquoadoption systeacutematique

des mesures de preacutevention par la population (deacutefaut de respect de la distance physique de lavage des

mains du port du masque embrassades saluer en se serrant les mainshellip) sont des facteurs susceptibles

de favoriser la reprise de lrsquoeacutepideacutemie

Si les augmentations observeacutees restent agrave ce jour modeacutereacutees elles invitent agrave la plus grande vigilance

Afin drsquoeacuteviter toute reprise de lrsquoeacutepideacutemie il apparait indispensable que la population adopte

rigoureusement les mesures de preacutevention preacuteconiseacutees et que chaque personne preacutesentant des

symptocircmes eacutevocateurs de COVID-19 consulte un meacutedecin dans les plus brefs deacutelais reacutealise un test

diagnostic et respecte les mesures drsquoisolement

Situation au 7 juillet 2020 Page Point eacutepideacutemiologique COVID-19

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directeur adjoint de publication

Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr

Diffusion Santeacute publique France

12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

32

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

Nos partenaires et les sources de donneacutees

SurSaUDreg OSCOURreg SOS Meacutedecins Reacuteseau Sentinelles SI-VIC CeacutepiDC

Pour en savoir plus sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

A lrsquointernational OMS et ECDC

Un numeacutero vert 0 800 130 000 (appel gratuit) a eacuteteacute mis en place (7j7 24h24) Cette plateforme permet dobtenir des informations sur le COVID-19 et des conseils

Page 32: COVID-19 : point épidémiologique du 9 juillet 2020

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Dr Jean-Claude Desenclos Equipe de reacutedaction

Sophie Vaux Fatima Ait El Belghiti Ceacuteline Caserio-Schonemann Yann Le Strat Anne Fouillet Julien Durand Laure Fonteneau Fanny Chereau Ceacutecile Forgeot Harold Noel Gabrielle Jones Steacutephane Levu Scarlett Georges Cocircme Daniau Marie-Michegravele Thiam Laurian Lassara Seacutebastien Monluc Pierre Arwidson Guillaume Spaccaferri Julie Figoni Linda Lasbeur Enguerrand Du-Roscoat Daniel Levy-Bruhl Jean-Michel Lecrique Christophe Leacuteon Camille Pelat Edouard Chatignoux Ceacutecile Brouard Claire Sauvage Christophe Bonaldi Anne-Sophie Bar-ret Laetitia Gouffeacute-Benadiba Yann Savitch

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

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12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Cedex Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication 9 juillet 2020

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Meacutethodes

Le dispositif de surveillance du COVID-19 en population est assureacute agrave partir de plusieurs sources de donneacutees afin de documenter lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en meacutedecine de ville et agrave lrsquohocircpital recours au soin admissions en reacuteanimation surveillance virologique et deacutecegraves Les objectifs de la surveillance sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en terme de morbiditeacute et de mortaliteacute Ci-dessous une description succincte de chaque surveillance avec sa date de deacutebut Reacuteseau Sentinelles nombre de cas drsquoinfections respiratoires aigueumls lieacutes au SARS-COV2 en consultation et teacuteleacuteconsultation en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie permettant drsquoestimer le nombre de cas dans la communauteacute Cette surveillance clinique est compleacuteteacutee par une surveillance virologique (deacutebut le 16 mars) SurSaUDreg (OSCOURreg et SOS Meacutedecins) donneacutees de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (utilisation de codes speacutecifiques) (depuis le 24 feacutevrier)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre drsquohospitalisations pour COVID-19 patients en reacuteanimation ou soins intensifs ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge seacuteveacuteriteacute eacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars)

IRA dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico sociaux (ESMS) nombre drsquoeacutepisodes de cas drsquoinfection respiratoire basse (IRA) et de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 en ESMS ainsi que le nombre de cas et deacutecegraves par eacutetablissement (depuis le 28 mars)

Donneacutees de mortaliteacute (Insee) Nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (2 agrave 3 semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Mesures et suivi de lrsquoadoption des mesures de protection et de la santeacute mentale eacutevolution de lrsquoadoption des mesures de protection et eacutevolution de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression (eacutechelle HAD) niveau de satisfaction de vie actuelle)

Recensement des cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement sur les donneacutees depuis le 1

er mars 2020 (depuis le 22 avril 2020 )

SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematiquement des reacutesultats des laboratoires de tests pour SARS-COV-2 (depuis le 13 mai)

Taux de reproduction effectif laquo R raquo (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) estimeacute se-lon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai)

Pour en savoir plus sur

Les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France

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En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute

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