Examen Examen CytoBactériologique des CytoBactériologique des

UrinesUrines

Thanh Doco-LecompteMaladies Infectieuses et tropicales

2ème journée CISPRILOR

Quiz

Chez une femme de 45 ans - qui présente une symptomatologie de cystite- qui a fait deux épisodes de cystite dans l’année (il y a 4 mois

et 6 mois)- qui ne présente pas d’autres antécédents

faut-il :

– systématiquement faire un ECBU ?

– ne le faire que si la BU est douteuse ?

– ne le faire que si la BU est négative ?

– ne le faire que si la BU est positive ?

Indications de l’ECBU

• Pyélonéphrite aiguë simple et compliquée

• Cystite compliquée (y compris femme enceinte)

• Cystite récidivante

• Prostatite aiguë ou chronique

Quiz 1

Chez une femme de 45 ans - qui présente une symptomatologie de cystite- qui a fait deux épisodes de cystite dans l’année (il y a 4

mois et 6 mois)- qui ne présente pas d’autres antécédents

faut-il :

– systématiquement faire un ECBU ? : non – ne le faire que si la BU est douteuse ? : oui– ne le faire que si la BU est négative ? : non– ne le faire que si la BU est positive ? : non

Bandelette urinaire

•2ème jet urines

•Pas de toilette préalable

•Recueil dans un récipient propre, non nécessairement stérile

Bandelette urinaire

•Leucocyturie : dosage de la leucoyte estérase ; seuil >104/ml

•Nitrites : transformation des nitrates en nitrites par bactéries ayant une nitrate réductase ; seuil déterminant >105UFC/ml

•Lecture à air ambiant

Interprétation de la bandelette urinaire• Bandelette négative : leucocytes -, nitrites-

• Bandelette positive : leucocytes + ± nitrites +

• Faux négatifs pour les nitrites :– bactériurie faible (dilution des urines, séjour des urines dans la

vessie < 4 heures, compte de bactéries trop faible) ;– régime restreint en nitrates, pH urinaire acide ou traitement

diurétique ;– infection causée par certaines bactéries non productives de

nitrites comme les infections à streptocoques, entérocoques, Acinetobacter spp. ou à S. saprophyticus.

• Bandelette positive n’affirme pas l’infection urinaire mais a une excellente valeur d’orientation

• Très bonne valeur prédictive négative (> 95%)

Indications de la bandelette urinaire• Suspicion de cystite simple : seule la bandelette est indiquée

– Bandelette négative pour les leucocytes et les nitrites (Ni – et LE –) : envisager un autre diagnostic (vaginite, cystalgie à urines claires,...)

– Bandelette positive pour les leucocytes et/ou les nitrites (Ni + et /ou LE +) : traitement probabiliste.

• Autres IU : bandelette en complément de l’ECBU– ne se substituent pas à l’ECBU

• BU peu utilisée en France, – Cf étude de cohorte : 7916 patientes et 1700 généralistes. BU

dans 24,5 % des cas seulement(Les infections urinaires de la femme en médecine générale. Presse Med. 2006; 35:1235-

40)

Indication de L'ECBU, patients symptomatiques

• Enfant (<15 ans)

• Homme

• Femme si : – bandelette urinaire douteuse– enceinte– anomalies du tractus urinaire– plus de 4 épisodes de cystites dans l’année ou si

dernier épisode date de moins de 3 mois– ayant des facteurs de risque d’antibio-résistance – Pyélonéphrite

Indication de L'ECBU, suivi des patients

• Inutile dans la cystite compliquée

• Inutile dans la PNA simple – sauf si évolution défavorable dans les 72 heures qui

suivent le début du traitement– Pas d’ECBU à un mois

• Dans les PNA compliquées et la prostatie aiguë :– ECBU dans les 48-72 heures après le début du

traitement – ECBU 4 à 6 semaines après l’arrêt du traitement

Indications de L'ECBU, patients Indications de L'ECBU, patients asymptomatiquesasymptomatiques

• Patient devant bénéficier d’une intervention dans la sphère urogénitale

• Femme enceinte – bandelette urinaire positive – surveillance systématique (diabète, menace d’accouchement

prématuré, hyperalbuminurie, antécédents d’infection urinaire à répétition ou de pyélonéphrite, uropathie sous jacente)

•Tout patient à risque élevé de complication tel que diabétique avec bandelette urinaire positive

Conditions de prélèvement, adulte non sondé

• de préférence : urines de la première miction du matin

• à défaut : à plus de 4 heures d’une miction précédente

• en dehors des périodes de menstruation (sinon port de tampon)

• avant tout traitement antibiotique si possible (sinon le signaler)

• déroulement du prélèvement (en général par le patient lui-même ou au laboratoire) – lavage de mains – toilette intime soigneuse au savon ou avec un

antiseptique (lingette, compresse) :

•chez la femme : de la vulve, des grandes et des petites lèvres en les écartant, et du méat urétral

•chez l’homme : du prépuce et du méat urétral– rincer à l’eau stérile– éliminer le premier jet d’urine (environ 20 ml)– recueillir les 20 à 30 ml suivants dans un flacon stérile

sans toucher le flacon– fermer hermétiquement le flacon

Conditions de prélèvement, adulte non sondé

•lavage de mains (préleveur : parent ou personnel de santé)

•utiliser un collecteur stérile après désinfection soigneuse du périnée (savon ou antiseptique – rinçage à l’eau stérile)

• ne pas laisser le collecteur en place plus d’une ½ heure (passé ce délai remplacer le collecteur par un collecteur neuf)

– transvaser les urines dans un flacon stérile dès le recueil réalisé

– puis idem que contexte habituel

Conditions de prélèvement,  nourrisson/jeune enfant

• lavage de mains (préleveur : personnel de santé)

• recueil par ponction (seringue + aiguille stérile) dans la paroi de la sonde (sur site spécifique si il existe) après désinfection (alcool iodé : 1 minute)

• si changement de sonde : faire prélèvement sur nouvelle sonde

• ne pas prélever les urines dans le sac collecteur

• ne pas déconnecter la sonde du sac pour prélever les urines

Conditions de prélèvement, adulte sondé

Conservation et transport

• Pas de modification significative de la bactériurie jusqu’à 24 h à 4°C

• Modification significative de la bactériurie au-delà de 2 h à 22°C

• Mais, au-delà de 12 h, les leucocytes peuvent s’altérer et se grouper en amas

2

2,5

3

3,5

4

4,5

5

5,5

6

6,5

0h 1 h 2 h 3h 6h 24h

E. coli 22°C E. coli 4°C

Conditions de transport

•acheminer le flacon le plus rapidement possible (< 2 heures) au laboratoire

•à défaut le conserver à 4 °C (< 12 heures) ou utiliser des systèmes de recueil contenant de l’acide borique (température ambiante 24-48 heures)

Interprétation

• Examen direct (urines homogénéisée, à fort grossissement x1000), coloration de Gram– Présence de bactéries = bactériurie 105 unités formant

colonies (UFC)

• Leucocyturie pathologique : 104 leucocytes/ml ou 10/mm3

• Cultures> 103 UFC/ml pour les cystites aiguës à E. coli et autres

entérobactéries notamment Proteus spp, Klebsiella spp et pour S. saprophyticus

>105 UFC/ml pour les cystites à autres bactéries (notamment entérocoque)

> 104 UFC/ml pour les pyélonéphrites et prostatites.

Interprétation de l’ECBU Leucocytes/ml ≥104 <104

Bactériurie (UFC/ml)

≥105 104 103 104 ≥105

Nombre d’espèces

1 ou 2 1 1 2 1 ou 2

Niveau de pathogénicité suivant les espèces

1 ou 2 ou 3 1 ou 2 1 1 1 ou 2 ou 3

Infection probable

oui Non sauf si ID

Dans les autres cas refaire ECBU

Niveau 1 : bactéries considérées pathogènes même en cas de bactériurie faible (≥103UFC/ml) : E coli, Proteus, KlebsiellaS saprophyticus

Niveau 2 : bactéries souvent impliquées (notamment dans les IUN) :entérobactéries autres que E coliS aureusEntérocoquesCorynebacterium urealyticumP aeruginosa

Niveau 3 : bactéries dont l’implication est peu probable :Staphyloocques à coagulase négative (≠ S saprophyticus)S agalactiaeAerococcus urinaePseudomonaceae≠ P aeruginosaAcinetobacter sppStenotophomonas maltophilia

Niveau 4 : espèces appartenant aux flores uréthrales et génitales, à considérer en général comme des contaminants (streptocoques hémolytiques, Gardnerella vaginalis, Lactobacillus spp, bacilles corynéformes ≠ Corynebacterium urealyticum

Difficultés d’interprétation

• Bactériurie sans leucocytes – Souillure de l’ECBU– Colonisation urinaire– Infection urinaire débutante

• Absence de leucocytes dans d’authentiques IU : – si ECBU trop précoce– Neutropénique– Examen trop tardif après prélèvement (lyse des

leucocytes)

Refaire ECBU

E. coli (54%)

P. mirabilis (5%)

Klebsiella sp

Autresentérobactéries

Autres

Autres

Aforcopi-Bio 4ème trimestre 200311 Laboratoires de ville

Enquête réseau antibiolor commission biologie

(n = 1234)(n = 1234)

E. coli E. coli (78,3%)(78,3%)P. mirabilis P. mirabilis (8%)(8%)

K. pneumoniae K. pneumoniae (5%)(5%)Enterobacter Enterobacter spp. (2%)spp. (2%)