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UNE DIARRHEE Quelle étiologie ? Dominique GENDREL

UNE DIARRHEE Quelle étiologie · 2018. 4. 11. · Picobirnavirus . Les virus sont les principaux responsables des gastro-entérites . 1990 . RT-PCR . Calicivirus humains ... de l’animal

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  • UNE DIARRHEE Quelle étiologie ?

    Dominique GENDREL

  • Une maman : mes 2 enfants sont vaccinés contre le

    rotavirus, cela m’a couté une fortune et …

    Mon mari et moi, celui de 3 ans et celui de 9 mois AVONS TOUS UNE DIARRHEE

    le lendemain de Noel

    Réponse : ce n’est pas un rotavirus, c’est un NOROVIRUS

  • 288 enfants avec GEA, 120 rotavirus, 71 norovirus 30% des enfants infectés par norovirus le sont au cours

    d’une épidémie familiale de GEA

    30% GEA familiales

  • 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 0

    10

    20

    30

    40

    50

    rotavirus bact & viro neg salmonelles

    Age (mois)

    Hospitalisation pour gastroentérite aigue communautaire

    St Vincent de Paul 1/1/1997-31/12/2001

    18m-3ans > 3 ans ne figurent pas sur le graphique :

    8 Shigelles et 21 Campylobacter jejuni

    936 explorés / 955 hospitalisés Rotavirus : 50.9 %

  • Epidémie de Diarrhées nosocomiales en Hospitalisation Pédiatrique

    • Necker Ped Gen, 1 Oct 2012

    • 1 enfant de 6 mois hospitalisé

    pour bronchiolite depuis 3 j a une GEA brutale , Rota neg

    • Ses parents aussi (depuis l’admission du patient)

    • Du 1 au 4, six autres patients et 1 infirmière ont une GEA nosocomiale brutale (chambres isolées mais contigües)

    • 4/7 sont perfusés • Toutes Rota Neg

  • Les diarrhées nosocomiales à Norovirus sont très sous estimées en Pédiatrie

    • Necker Ped Gen, 1 Oct 2012

    • 1 enfant de 6 mois hospitalisé

    pour bronchiolite depuis 3 j a une GEA brutale Rota neg

    • Ses parents aussi (depuis l’admission du patient)

    • Du 1 au 4, six autres patients et 1 infirmière ont une GEA nosocomiale brutale Rota neg

    • 4/7 sont perfusés • 3 selles testées Noro GGII4 var 2012

  • Virus classiques

    Rotavirus groupe A Norovirus Astrovirus Adénovirus 40/41 Sapovirus

    Les autres

    Aichi virus (Picornaviridae)

    Entérovirus (parechovirus)

    Rotavirus groupe B groupe C

    Coronavirus

    Torovirus

    Picobirnavirus

    Les virus sont les principaux responsables des gastro-entérites

  • 1990 RT-PCR

    Calicivirus humains norovirus: Sapovirus beaucoup moins fréquents

    Norwalk virus Norovirus 1972, Kapikian

    • Amplification, clonage;

    • Expression Virus-Like Particles (VLPs)

    • Séquence nucléotidique et analyses phylogénétiques

    1968 Epidémie à

    Norwalk

    1972 Microscopie électronique

    Ne se multiplient pas en culture cellulaire

    Critères cliniques de Kaplan

    Sapovirus 1977

  • >16 génotypes de norovirus humains

    Classification des Calicividae

    8 génotypes de sapovirus humains

  • Virus responsables de gastroentérites

    0%

    10%

    20%

    30%

    40%

    50%

    60%

    70%

    80%

    90%

    100%

    0-2 (n=149) 2-5 (n=68) 5-65 (n=329) >65 (n=165)Rotavirus Norovirus SapovirusVirus Aichi Adénovirus Astrovirus

    Distribution des virus des gastroentérites en fonction des tranches d’âge Pothier, Dijon

  • 85 % des enfants hospitalisés pour GEA ont < 2 ans Rotavirus (52,5%) Norovirus (12,03%) Adénovirus (3,5%)

    Des recueils uniquement hospitaliers sous-estiment l’importance des norovirus en pédiatrie

    Eur J Clin Microb Inf Dis 2011, 3 : 361-8

    On peut estimer que, en ambulatoire, 30% des GEA avant 2 ans 60% des GEA entre 2 et 10 ans 80% des GEA de l’adulte sont dues aux NOROVIRUS

  • OMS 2008 Mortalité : 8 795 000 enfants < 5 ans

    Lancet, Mai 2010 49% des morts surviennent dans 5 pays Inde, Nigeria, Zaire, Pakistan, Chine

    Diarrhées 1 336 000 morts < 5 ans Rotavirus : 500 000

  • Norovirus : morbidité-mortalité

    Nbre annuel d’épisode

    diarrhéique

    % attribuable

    aux NoV

    Nbre d’épisodes

    diarrhéiques attribuables

    aux NoV

    Incidence annuelle

    pour 100000 enfants

    Pays industrialisés • Communautaires 7 743 000 11,7% 906 000 1 665 • Hospitalisés 531 000 12,1% 64 200 118 PED • Hospitalisés 9 015 000 12,1% 1 091 000 197 • Décès 1 800 000 12,1% 218 000 39

    MM Patel, EID, 2008

    Pays en développement : environ 100 000 morts par norovirus /an

  • GGII: 19 génotypes

    GGI: 8 génotypes

    Evolution et diversité génétique des Norovirus

    Norovirus humains : GGI, GGII et GIV

    • Aucune transmission de l’animal à l’Homme

    • Norovirus GII.4: Epidémies les plus importantes depuis 10 ans (maisons de retraite)

    Environnement, Alimentaire

    >80% des épidémies

    GGII.4

  • Norovirus GII.4 Evolution et épidémiologie

    Emergence périodique des variants GII.4

    ?

  • Mortalité par diarrhée virale aux USA

    ROTAVIRUS

    60 morts/an Tous < 5 ans

    NOROVIRUS

    100 morts/an 90% > 65 ans

    Souvent GGII4 ou apparentés

    Clin Inf Dis 2012 Pediatrics 2007

  • Enfants avec GEA à Norovirus hospitalisés à St Vincent de Paul T Lecarpentier, Arch Ped 2010

    14 Noro en 2 ans

    9/14 GGII4 ou app 4 diarrhées sanglantes

    tous GGII4

  • Pas de norovirus GGII4 hospitalisés à SVP

    Norovirus GGII4 hospitalisés à SVP

  • 2009

    Underestimation estimation of norovirus & campylobacter in children and young adults

  • Traveller diarrhea in 2 children coming back to Paris

    • Norovirus GG IIb/GG II-3

    • 2 years, 4 days after travel in Madagascar

    • Bloody diarrhea • 39°5 Convulsions

    • Shigella sonnei

    • 2 ans, 38°, Usual diarrhea Father in Mali 8 days before

    H 36 always moderate diarrhea 38 ° Convulsions

  • Hospitalisations for severe diarrhea in traveller children (St Vincent de Paul, Paris)

    1997-2000 2002-2004 Total diarrheas 706 457 Returning traveller (

  • Depuis l’introduction du vaccin anti-rotavirus, les norovirus sont devenus la première cause

    de GEA chez l’enfant aux USA

    NEJM May 2012

  • Les NOROVIRUS sont très fréquents chez l’adulte, comme chez l’enfant

    • Surtout sévères chez les personnes âgées

    • Pas de test rapide fiable pour le moment

    • Leur recherche en routine

    par PCR est difficile

    • Des vaccins sont à

    l’étude, mais pour qui ?

    • La surveillance par les laboratoires de référence doit persister car l’émergence de génotypes à risque est possible

    Diapositive numéro 1Diapositive numéro 2Diapositive numéro 3Diapositive numéro 4Diapositive numéro 5Diapositive numéro 6Diapositive numéro 7Diapositive numéro 8Diapositive numéro 9Diapositive numéro 10Diapositive numéro 11Diapositive numéro 12Diapositive numéro 13Diapositive numéro 14Diapositive numéro 15Diapositive numéro 16Diapositive numéro 17Diapositive numéro 18Diapositive numéro 19Diapositive numéro 20Diapositive numéro 21Diapositive numéro 22Diapositive numéro 23Les NOROVIRUS sont très fréquents�chez l’adulte, comme chez l’enfant