Virus à Transmission Entérique MICROBIOLOGIE DCEM1 Mercredi 18 Février 2009 Nicolas LEVEQUE...
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Virus à Transmission Entérique MICROBIOLOGIE DCEM1 Mercredi 18 Février 2009 Nicolas LEVEQUE Laboratoire de Virologie CHU Robert Debré - Reims Mail : [email protected]
Virus à Transmission Entérique MICROBIOLOGIE DCEM1 Mercredi 18 Février 2009 Nicolas LEVEQUE Laboratoire de Virologie CHU Robert Debré - Reims Mail : [email protected]
Virus Transmission Entrique MICROBIOLOGIE DCEM1 Mercredi 18
Fvrier 2009 Nicolas LEVEQUE Laboratoire de Virologie CHU Robert
Debr - Reims Mail : [email protected]
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Virus Transmission Entrique Entrovirus (poliovirus) Hpatite A
Hpatite E Rotavirus Astrovirus Calicivirus Adnovirus
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A. Virus entriques non responsables de diarrhes
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1. Classification et structure Un genre de la Famille des
Picornaviridae Comprend 89 srotypes humains : Poliovirus 1 3
Coxsackievirus A et B Echovirus Enterovirus Les entrovirus
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Oberste et al., 2001 o Classification actuelle : 4 espces A, B,
C, D Classification en constante volution EV96 et 97 (Smura et al.,
J Gen Virol, 2007) EV79-88, EV-97 et EV-100-101 (Oberste et al.,
Virus Res., 2007) Genre Rhinenterovirus 1. Classification et
structure
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1. Classification et structure La capside Canyon = zone
dinteraction virus/rcepteur Pleconaril
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1. Classification et structure Le gnome Petits virus nus ARN
simple brin Daprs Rueckert, 1996 Trs conserve Trs variable
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2. Aspects pidmiologiques Antona et al., EJCMID, 2007
Surveillance de la circulation des entrovirus : Laboratoires
participant au RSE au 1er janvier 2005
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Distribution par tranches dge des diagnostics positifs
dinfection entrovirus, RSE, France, 2000-2004 2. Aspects
pidmiologiques Antona et al., EJCMID, 2007 En % du total des
prlvements Age :
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Saison : Les infections EV voluent toute lanne, y compris en
hiver, sur un fond endmique avec un pic de mai octobre 2. Aspects
pidmiologiques Antona et al., EJCMID, 2007 Saisonnalit des
infections entrovirus, RSE, France, 2000-2004 NB : Semaine 27 ~
Juillet
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Srotype : tous les srotypes sont impliqus mais certains sont
particulirement pidmiognes et mningotropes exemples : E6, E13, E30
Chomel et al., EJCMID, 2003 2. Aspects pidmiologiques Donnes du CNR
de Lyon 1976-2002
Clinique LCR Gorge Sang Selles 2 mois minimum (poliovirus) 1 2
jours 7 14 jours Incubation 1 2 jours 3. Physiopathologie
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Les entrovirus en pathologie humaine : Infections frquentes
Asymptomatique ou bnigne dans plus de 90% des cas Gravissime chez
limmunodprim et le nouveau-n Possibles atteintes cardiaques,
hpatiques ou cutano- muqueuses Virus neurotropes 4. Clinique
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Polios gris et muelos moelle. Infection de la substance grise
de la corne antrieure de la moelle pinire (atteinte des neurones
moteurs). Paralysie ascendante en quelques heures (Paralysies
Flasques Aigus ou PFA). Mortalit entre 5 et 10 % par paralysie des
muscles respiratoires (poumons dacier). Paralysies rsiduelles des
degrs variables. 4. Clinique : La Poliomylite antrieure aigu
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Avant l're vaccinale 600 000 morts infantiles/an 1988 Plan
dradication lanc par lOMS Vaccin Polio Injectable (VPI), Inactiv,
dvelopp par Jonas Salk, contenant les 3 srotypes de virus 1+2+3,
immunit gnrale (IgG) Vaccin Polio Oral (VPO), attnu, Sabin, 3
srotypes, immunit locale + gnrale 4. Clinique : La Poliomylite
antrieure aigu
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VPI Innocuit parfaite Immunognicit parfaite Pas de retour
possible la neurovirulence Administration parentrale Cher VPO
Administration orale et bon march Immunit locale Immunit collective
Possibilit de rversion (1 cas sur 10 7 ) Thermolabile
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19 4. Clinique : La Poliomylite antrieure aigu 350 000 cas dans
125 pays en 1988 1951 en 2005 dans 4 pays
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Les virus des hpatites Hpatite A (HAV) Hpatite B (HBV) Hpatite
C (HCV) Hpatite D (HDV, agent delta) Hpatite E (HEV) Hpatite G
(HGV)
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Virus FamilleAcide nuclique / enveloppe Taux de mortalit %
Infection chronique Mode de transmission HAV HBV HCV HDV HEV HGV
Picornaviridae Hepadnaviridae Filaviridae Satellite
Calicivirus-like Flavivirus ARN / non ADN / oui ARN / oui ARN
0,2-0,4 0,2-1 1-2 2-20 0,2-3 ? non oui non oui (peu svre) fcal-oral
parentral parentral fcal-oral parentral Les virus des hpatites
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Le VHA 1. Structure Famille des Picornaviridae Genre
Hepatovirus Virus nu ARN+ proche des entrovirus 1 seul srotype
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strictement humain Virus strictement humain Contamination
fcale-orale Contamination fcale-orale : directe (mains) ou
indirecte (coquillages, eau). 2. pidmiologie Zone tempre fin
automne sporadique ou petites pidmies limites endmicit faible <
15 % des sujets anticorps 20 ans Zone tropicale toute lanne
anticorps prsents chez la plupart des enfants endmicit forte 70-100
% des sujets anticorps 20 ans
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Incubation variable : 1 mois (4 6 semaines) Une hpatite virale
volue en trois phases : Pr-ictrique (4 7 jours) : troubles
digestifs, asthnie, rash, arthralgies Ictrique (8 30 jours) :
ictre, oligurie, dcoloration des selles Phase de convalescence
(plusieurs mois) Il existe des formes cliniques majeures (hpatite
fulminante) ou mineures, voire inapparentes (Influence de lge +++)
3. Clinique
Srologie Srologie / tests ELISA : IgG + IgM (3 mois) PCR srique
4. Diagnostic de lhpatite A
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Prvention de lhpatite A hygine = rgles dhygine (cf transmission
fcale-orale, transmission par leau) 5. Prvention Vaccin contre le
VHA Vaccin contre le VHA = vaccin inactiv ; 1 injection + rappel 1
an + rappel 10 ans (Havrix) vaccin combin VHA + VHB (Twinrix)
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Caliciviridae ARN monocatnaire de polarit positive Virus nu
pidmies transmission fcale-orale Asie (Indes), Afrique et Amrique
du sud Hpatite aigu en 2 10 semaines Grave chez femme enceinte, 3me
trimestre (mortalit 20%) Diagnostic srologique Le VHE
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B. Virus entriques responsables de diarrhes
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Over a 3 day period, one sick fisherman contaminated 23,000
bushels of oysters sold in about 14 states with a single strain of
norovirus
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En 2005: 14 outbreaks on 10 ships Some repeated after cleanup
By sequence, some linked to common sources Multiple modes of spread
Food, person- to-person
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La majorit des pisodes de gastro-entrite sont dues des virus
Absence de diagnostic tiologique dans la plupart des cas 1910, Ito
(Japon) pseudo-cholera infantile 1929, Zahorsky (St Louis, USA)
Winter vomiting syndrome Virus Hiver Bactries et parasites t Reflte
lamlioration du traitement des eaux Sude : Prvalence ts annes 30 =
hivers des annes 80 Virus responsables de diarrhes
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Rotavirus Calicivirus Norovirus (virus de Norwalk) et Sapovirus
Astrovirus Adnovirus
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1. Structure des virus Types 40 et 41
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Famille des Reoviridae ARN gnomique bicatnaire en 11 segments
Capside icosadrique Pas denveloppe 7 srotypes : A G A, B et C chez
lHomme A Monde entier B Chine principalement C rares pidmies 1.1.
Les Rotavirus
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Observs pour la premire fois en 1975 en microscopie lectronique
morphologie en toile Famille des Astroviridae Virus nu ARN
monocatnaire + 8 srotypes 1.2. Les Astrovirus
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Famille des Caliciviridae Dpressions rgulires la surface de la
capside calice Virus nus ARN monocatnaire de polarit positive 2
genres / 2 gnotypes : Norovirus et Sapovirus Norovirus = Virus de
Norwalk (pidmie de gastro-entrites survenue en 1972 dans la ville
de Norwalk (Ohio) 1977 Virus Sapporo 1.3. Les Calicivirus
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Famille des Adenoviridae, genre Mastadenovirus ADN bicatnaire
Capside icosadrique Pas denveloppe 51 srotypes humains 6
sous-groupe de A F Adnovirus 40 et 41 1.4. Les Adnovirus
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2. Modes de transmission Fcale-orale Infectivit leve (10 100
particules virales) Transmission directe : Rotavirus, adnovirus
Transmission indirecte : virus Norwalk. Grande quantit de virus
dans les selles (10 10 virus /ml de selles) Virus nus = rsistants
en milieu extrieur
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3. Epidmiologie Pic dincidence des infections svres entre 6 et
24 mois L'un des premiers motifs de consultation en mdecine et
principalement en pdiatrie Morbidit leve / impact conomique
important 3 millions de consultations mdicales/an en France 220 000
hospitalisations aux USA chez lenfant de 3 millions de dcs annuels
dans les PIVD
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3. Epidmiologie
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30-50 % des gastro-entrites aigus de lenfant 70 % des
gastro-entrites aigus dans 1re anne de vie Touchera tous les
enfants avant lge de 5 ans 140 millions de cas/an 18 millions
diarrhes svres (90% des gastro-entrites hospitalises) 600 800 000
dcs 3.1. pidmiologie des rotavirus
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3.1. les rotavirus Pays dvelopps : principale cause
dhospitalisation des nourrissons 1ere cause dinfections
nosocomiales pdiatriques (15 %) Dcembre janvier : concomittantes
des pidmies de viroses respiratoires (VRS, grippe) engorgement
hpitaux
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1.5 9% des selles denfants diarrhiques 1 2% des selles denfants
asymptomatiques pidmies de gastro-entrites en collectivit Hpitaux,
maisons de retraite, crches 75% des enfants sropositifs 10 ans 3.2.
les Astrovirus
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1re cause GEA dans les pays dvelopps 85% des gastro-entrites
tout ge confondu aux Pays-bas Adulte > enfants pidmies de
gastro-entrites collectivits maisons de retraite, hpitaux, crches
bateaux de croisire, Consommation eau, aliments et coquillages
souills 3.3. les calicivirus
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Cause endmique de gastro-entrites (5%) dans les collectivits
maisons de retraite, hpitaux, crches et orphelinats Tout ge Chez
lenfant +++