46
Jeudi 24 Juin 2021 Webinaire LOINC « Emettre et recevoir des comptes rendus de biologie en LOINC » Animateur : Sylvie CORMONT – APHP & SFIL Bruno GAUTHIER – SFIL & Inovie

Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

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Jeudi 24 Juin 2021

Webinaire LOINC

laquo Emettre et recevoir des comptes rendus de biologie en LOINC raquo

Animateur

Sylvie CORMONT ndash APHP amp SFIL

Bruno GAUTHIER ndash SFIL amp Inovie

Bonnes pratiques pour suivre ce webinaire

2

Les slides seront envoyeacutees par mail aux participants

Communiquer via le tchat vos adresses mail et coordonneacutees pour pouvoir ecirctre

recontacteacutes

Couper votre micro pendant les interventions

Utilisez la fonction laquo lever la main raquo si jamais vous voulez prendre la parole

Le tchat est ouvert pendant la session pour dialoguer si besoin

Introduction

Vous ecirctes hellip

Biologiste Informaticien Acteur reacutegional Autre

Vous avez des attentes particuliegraveres pour ce webinairehellip

Nrsquoheacutesitez pas agrave les partager dans le chat afin que lrsquoon srsquoassure drsquoy reacutepondre

Eacutediteur de logiciel

exploitant le CR-Bio

4

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

Dans quel contexte Le deacutecret sur la biologie ndeg2016-46 du 26 janvier 2016

5

Deacutecret

2016-

46

Le CR-BIO doit ecirctre structureacute

conformeacutement au reacutefeacuterentiel

drsquointeropeacuterabiliteacute deacutenommeacute ldquovolet

compte rendu drsquoexamens de biologie

meacutedicalerdquo Cela srsquoapplique aux

examens biologiques pour un patient

aux examens pour un patient associeacute agrave

un eacutechantillon biologique non humain

La Terminologie LOINC

Le compte rendu des examens

de biologie meacutedicale est

communiqueacute au prescripteur

par voie eacutelectronique leacutechange

se fait en utilisant une

messagerie eacutelectronique

seacutecuriseacutee de santeacute

Pour en savoir plus acceacutedez

au module deacutedieacute

httpsesante-

formationfrcourseindexphpcat

egoryid=9

Le compte rendu des

examens de biologie meacutedicale

est inseacutereacute dans le dossier

meacutedical partageacute degraves lors

qursquoil contribue agrave la

coordination des soins

Lrsquoalimentation du DMP

Lrsquoeacutechange via une

messagerie seacutecuriseacutee

6

Dans quel contexte Le flux drsquoeacutechange du compte rendu drsquoexamen de biologie ndash CR-Bio

Prescripteur de villeLGC

Laboratoire de ville

Leacutegende

Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre en structureacute

(CDAR2 N3) et en MSSanteacute

Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre structureacutes en HL7

ou CDA

Etablissement de Santeacute

SIL du

laboratoireSIH

Autre laboratoire hospitalier

SIL

SIL

Autre laboratoire de ville

SIL

Prescripteur

7

Le Seacutegur Numeacuterique srsquoinscrit dans le cadre de reacutefeacuterence de la strateacutegie e-santeacute avec lrsquoobjectif drsquoagir

comme un acceacuteleacuterateur

En particulier sur la biologie meacutedicale 3 cas drsquousage ont eacuteteacute

prioriseacutes

Lrsquoenvoi systeacutematique des

comptes-rendus structureacutes

(+PDF) de biologie meacutedicale aux meacutedecins correspondants et aux

patients par MSSanteacute

Lrsquoalimentation systeacutematique du

dossier meacutedical partageacute avec

ces mecircmes comptes-rendus

La consultation possible du

dossier meacutedical partageacute par le biologiste meacutedical pour

parcourir un historique de santeacute

2

1

3

Le programme Seacutegur numeacuterique permet drsquoacceacuteleacuterer la feuille de route du virage numeacuterique en santeacute

Dans quel contexte Le Seacutegur du Numeacuterique

8

2 Mds euro drsquoinvestissements seront ainsi consacreacutes

pour les toutes prochaines anneacuteeshellip

Source Seacutegur de la Santeacute ndash Dossier de Presse Juillet 2020

Piliers et 33 mesures

composent le Seacutegur de la

santeacute4

Mds euro drsquoinvestissements

nouveaux preacutevus par la

mesure ndeg919

Mds euro drsquoinvestissements

destineacutes au rattrapage du

retard sur le numeacuterique

en santeacute

2

Source de valeur pour lrsquoacceacuteleacuteration du deacuteploiement

du numeacuterique en santeacute

2Action lsquomise en place drsquoun

financement agrave lrsquousage du

numeacuteriquersquo

1Action lsquofinancement de

lrsquoeacutequipement numeacuteriquersquo

et eacutevolution des services

socles

9

Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement

numeacuterique

10

Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1

specifications adopteacutees

DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en

eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)

DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo

Logiciels concerneacutes

par les dossiers de

speacutecifications (DSL)

CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)

ET pour les cas deacutegradeacutes

PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1

(pour le DMP)

Donneacutees exporteacutees

(DMP et MSS)

- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC

Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)

- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL

- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)

Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes

Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG

- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS

codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires

etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)

- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une

fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant

- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et

par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)

degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur

- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)

- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC

- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute

Speacutecifications

reacutefeacuterentiels

Seacutejour hospitalier

Tous les CR Bio (voir section

suivante)

CR Bio Patient Pro

DMP X X

MSS

patientX

MSS

proX

httpsinteropesantegouvfrEVSClient

detailedResultseamtype=CDAampoid=

1361411255911363114810

Publieacute Mi-juin

11

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

12

Le CDA R2

Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document

Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)

Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante

Deacutefinitions

LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un

codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

13

La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo

Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale

Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique

Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)

Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs

Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays

Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal

2 rue du pontParis 75001

Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal

De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

14

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM

Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par

une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du

CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)

bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)

15

Format Hprim structureacute (V3)

Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur

Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame

Veacutehicule peu drsquoinformations

- En-tecircte 12 lignes

- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement

- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo

Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes

- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis

- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

16

16

Respect des obligations reacuteglementaires

CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3

Obligations Hprim CDAR2 N3

nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO

OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK

La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK

CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99

CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

17

Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 2: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

Bonnes pratiques pour suivre ce webinaire

2

Les slides seront envoyeacutees par mail aux participants

Communiquer via le tchat vos adresses mail et coordonneacutees pour pouvoir ecirctre

recontacteacutes

Couper votre micro pendant les interventions

Utilisez la fonction laquo lever la main raquo si jamais vous voulez prendre la parole

Le tchat est ouvert pendant la session pour dialoguer si besoin

Introduction

Vous ecirctes hellip

Biologiste Informaticien Acteur reacutegional Autre

Vous avez des attentes particuliegraveres pour ce webinairehellip

Nrsquoheacutesitez pas agrave les partager dans le chat afin que lrsquoon srsquoassure drsquoy reacutepondre

Eacutediteur de logiciel

exploitant le CR-Bio

4

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

Dans quel contexte Le deacutecret sur la biologie ndeg2016-46 du 26 janvier 2016

5

Deacutecret

2016-

46

Le CR-BIO doit ecirctre structureacute

conformeacutement au reacutefeacuterentiel

drsquointeropeacuterabiliteacute deacutenommeacute ldquovolet

compte rendu drsquoexamens de biologie

meacutedicalerdquo Cela srsquoapplique aux

examens biologiques pour un patient

aux examens pour un patient associeacute agrave

un eacutechantillon biologique non humain

La Terminologie LOINC

Le compte rendu des examens

de biologie meacutedicale est

communiqueacute au prescripteur

par voie eacutelectronique leacutechange

se fait en utilisant une

messagerie eacutelectronique

seacutecuriseacutee de santeacute

Pour en savoir plus acceacutedez

au module deacutedieacute

httpsesante-

formationfrcourseindexphpcat

egoryid=9

Le compte rendu des

examens de biologie meacutedicale

est inseacutereacute dans le dossier

meacutedical partageacute degraves lors

qursquoil contribue agrave la

coordination des soins

Lrsquoalimentation du DMP

Lrsquoeacutechange via une

messagerie seacutecuriseacutee

6

Dans quel contexte Le flux drsquoeacutechange du compte rendu drsquoexamen de biologie ndash CR-Bio

Prescripteur de villeLGC

Laboratoire de ville

Leacutegende

Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre en structureacute

(CDAR2 N3) et en MSSanteacute

Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre structureacutes en HL7

ou CDA

Etablissement de Santeacute

SIL du

laboratoireSIH

Autre laboratoire hospitalier

SIL

SIL

Autre laboratoire de ville

SIL

Prescripteur

7

Le Seacutegur Numeacuterique srsquoinscrit dans le cadre de reacutefeacuterence de la strateacutegie e-santeacute avec lrsquoobjectif drsquoagir

comme un acceacuteleacuterateur

En particulier sur la biologie meacutedicale 3 cas drsquousage ont eacuteteacute

prioriseacutes

Lrsquoenvoi systeacutematique des

comptes-rendus structureacutes

(+PDF) de biologie meacutedicale aux meacutedecins correspondants et aux

patients par MSSanteacute

Lrsquoalimentation systeacutematique du

dossier meacutedical partageacute avec

ces mecircmes comptes-rendus

La consultation possible du

dossier meacutedical partageacute par le biologiste meacutedical pour

parcourir un historique de santeacute

2

1

3

Le programme Seacutegur numeacuterique permet drsquoacceacuteleacuterer la feuille de route du virage numeacuterique en santeacute

Dans quel contexte Le Seacutegur du Numeacuterique

8

2 Mds euro drsquoinvestissements seront ainsi consacreacutes

pour les toutes prochaines anneacuteeshellip

Source Seacutegur de la Santeacute ndash Dossier de Presse Juillet 2020

Piliers et 33 mesures

composent le Seacutegur de la

santeacute4

Mds euro drsquoinvestissements

nouveaux preacutevus par la

mesure ndeg919

Mds euro drsquoinvestissements

destineacutes au rattrapage du

retard sur le numeacuterique

en santeacute

2

Source de valeur pour lrsquoacceacuteleacuteration du deacuteploiement

du numeacuterique en santeacute

2Action lsquomise en place drsquoun

financement agrave lrsquousage du

numeacuteriquersquo

1Action lsquofinancement de

lrsquoeacutequipement numeacuteriquersquo

et eacutevolution des services

socles

9

Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement

numeacuterique

10

Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1

specifications adopteacutees

DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en

eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)

DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo

Logiciels concerneacutes

par les dossiers de

speacutecifications (DSL)

CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)

ET pour les cas deacutegradeacutes

PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1

(pour le DMP)

Donneacutees exporteacutees

(DMP et MSS)

- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC

Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)

- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL

- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)

Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes

Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG

- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS

codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires

etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)

- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une

fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant

- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et

par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)

degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur

- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)

- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC

- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute

Speacutecifications

reacutefeacuterentiels

Seacutejour hospitalier

Tous les CR Bio (voir section

suivante)

CR Bio Patient Pro

DMP X X

MSS

patientX

MSS

proX

httpsinteropesantegouvfrEVSClient

detailedResultseamtype=CDAampoid=

1361411255911363114810

Publieacute Mi-juin

11

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

12

Le CDA R2

Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document

Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)

Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante

Deacutefinitions

LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un

codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

13

La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo

Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale

Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique

Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)

Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs

Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays

Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal

2 rue du pontParis 75001

Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal

De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

14

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM

Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par

une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du

CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)

bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)

15

Format Hprim structureacute (V3)

Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur

Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame

Veacutehicule peu drsquoinformations

- En-tecircte 12 lignes

- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement

- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo

Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes

- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis

- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

16

16

Respect des obligations reacuteglementaires

CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3

Obligations Hprim CDAR2 N3

nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO

OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK

La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK

CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99

CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

17

Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 3: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

Introduction

Vous ecirctes hellip

Biologiste Informaticien Acteur reacutegional Autre

Vous avez des attentes particuliegraveres pour ce webinairehellip

Nrsquoheacutesitez pas agrave les partager dans le chat afin que lrsquoon srsquoassure drsquoy reacutepondre

Eacutediteur de logiciel

exploitant le CR-Bio

4

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

Dans quel contexte Le deacutecret sur la biologie ndeg2016-46 du 26 janvier 2016

5

Deacutecret

2016-

46

Le CR-BIO doit ecirctre structureacute

conformeacutement au reacutefeacuterentiel

drsquointeropeacuterabiliteacute deacutenommeacute ldquovolet

compte rendu drsquoexamens de biologie

meacutedicalerdquo Cela srsquoapplique aux

examens biologiques pour un patient

aux examens pour un patient associeacute agrave

un eacutechantillon biologique non humain

La Terminologie LOINC

Le compte rendu des examens

de biologie meacutedicale est

communiqueacute au prescripteur

par voie eacutelectronique leacutechange

se fait en utilisant une

messagerie eacutelectronique

seacutecuriseacutee de santeacute

Pour en savoir plus acceacutedez

au module deacutedieacute

httpsesante-

formationfrcourseindexphpcat

egoryid=9

Le compte rendu des

examens de biologie meacutedicale

est inseacutereacute dans le dossier

meacutedical partageacute degraves lors

qursquoil contribue agrave la

coordination des soins

Lrsquoalimentation du DMP

Lrsquoeacutechange via une

messagerie seacutecuriseacutee

6

Dans quel contexte Le flux drsquoeacutechange du compte rendu drsquoexamen de biologie ndash CR-Bio

Prescripteur de villeLGC

Laboratoire de ville

Leacutegende

Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre en structureacute

(CDAR2 N3) et en MSSanteacute

Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre structureacutes en HL7

ou CDA

Etablissement de Santeacute

SIL du

laboratoireSIH

Autre laboratoire hospitalier

SIL

SIL

Autre laboratoire de ville

SIL

Prescripteur

7

Le Seacutegur Numeacuterique srsquoinscrit dans le cadre de reacutefeacuterence de la strateacutegie e-santeacute avec lrsquoobjectif drsquoagir

comme un acceacuteleacuterateur

En particulier sur la biologie meacutedicale 3 cas drsquousage ont eacuteteacute

prioriseacutes

Lrsquoenvoi systeacutematique des

comptes-rendus structureacutes

(+PDF) de biologie meacutedicale aux meacutedecins correspondants et aux

patients par MSSanteacute

Lrsquoalimentation systeacutematique du

dossier meacutedical partageacute avec

ces mecircmes comptes-rendus

La consultation possible du

dossier meacutedical partageacute par le biologiste meacutedical pour

parcourir un historique de santeacute

2

1

3

Le programme Seacutegur numeacuterique permet drsquoacceacuteleacuterer la feuille de route du virage numeacuterique en santeacute

Dans quel contexte Le Seacutegur du Numeacuterique

8

2 Mds euro drsquoinvestissements seront ainsi consacreacutes

pour les toutes prochaines anneacuteeshellip

Source Seacutegur de la Santeacute ndash Dossier de Presse Juillet 2020

Piliers et 33 mesures

composent le Seacutegur de la

santeacute4

Mds euro drsquoinvestissements

nouveaux preacutevus par la

mesure ndeg919

Mds euro drsquoinvestissements

destineacutes au rattrapage du

retard sur le numeacuterique

en santeacute

2

Source de valeur pour lrsquoacceacuteleacuteration du deacuteploiement

du numeacuterique en santeacute

2Action lsquomise en place drsquoun

financement agrave lrsquousage du

numeacuteriquersquo

1Action lsquofinancement de

lrsquoeacutequipement numeacuteriquersquo

et eacutevolution des services

socles

9

Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement

numeacuterique

10

Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1

specifications adopteacutees

DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en

eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)

DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo

Logiciels concerneacutes

par les dossiers de

speacutecifications (DSL)

CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)

ET pour les cas deacutegradeacutes

PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1

(pour le DMP)

Donneacutees exporteacutees

(DMP et MSS)

- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC

Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)

- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL

- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)

Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes

Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG

- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS

codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires

etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)

- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une

fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant

- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et

par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)

degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur

- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)

- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC

- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute

Speacutecifications

reacutefeacuterentiels

Seacutejour hospitalier

Tous les CR Bio (voir section

suivante)

CR Bio Patient Pro

DMP X X

MSS

patientX

MSS

proX

httpsinteropesantegouvfrEVSClient

detailedResultseamtype=CDAampoid=

1361411255911363114810

Publieacute Mi-juin

11

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

12

Le CDA R2

Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document

Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)

Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante

Deacutefinitions

LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un

codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

13

La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo

Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale

Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique

Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)

Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs

Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays

Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal

2 rue du pontParis 75001

Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal

De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

14

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM

Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par

une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du

CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)

bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)

15

Format Hprim structureacute (V3)

Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur

Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame

Veacutehicule peu drsquoinformations

- En-tecircte 12 lignes

- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement

- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo

Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes

- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis

- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

16

16

Respect des obligations reacuteglementaires

CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3

Obligations Hprim CDAR2 N3

nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO

OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK

La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK

CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99

CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

17

Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 4: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

4

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

Dans quel contexte Le deacutecret sur la biologie ndeg2016-46 du 26 janvier 2016

5

Deacutecret

2016-

46

Le CR-BIO doit ecirctre structureacute

conformeacutement au reacutefeacuterentiel

drsquointeropeacuterabiliteacute deacutenommeacute ldquovolet

compte rendu drsquoexamens de biologie

meacutedicalerdquo Cela srsquoapplique aux

examens biologiques pour un patient

aux examens pour un patient associeacute agrave

un eacutechantillon biologique non humain

La Terminologie LOINC

Le compte rendu des examens

de biologie meacutedicale est

communiqueacute au prescripteur

par voie eacutelectronique leacutechange

se fait en utilisant une

messagerie eacutelectronique

seacutecuriseacutee de santeacute

Pour en savoir plus acceacutedez

au module deacutedieacute

httpsesante-

formationfrcourseindexphpcat

egoryid=9

Le compte rendu des

examens de biologie meacutedicale

est inseacutereacute dans le dossier

meacutedical partageacute degraves lors

qursquoil contribue agrave la

coordination des soins

Lrsquoalimentation du DMP

Lrsquoeacutechange via une

messagerie seacutecuriseacutee

6

Dans quel contexte Le flux drsquoeacutechange du compte rendu drsquoexamen de biologie ndash CR-Bio

Prescripteur de villeLGC

Laboratoire de ville

Leacutegende

Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre en structureacute

(CDAR2 N3) et en MSSanteacute

Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre structureacutes en HL7

ou CDA

Etablissement de Santeacute

SIL du

laboratoireSIH

Autre laboratoire hospitalier

SIL

SIL

Autre laboratoire de ville

SIL

Prescripteur

7

Le Seacutegur Numeacuterique srsquoinscrit dans le cadre de reacutefeacuterence de la strateacutegie e-santeacute avec lrsquoobjectif drsquoagir

comme un acceacuteleacuterateur

En particulier sur la biologie meacutedicale 3 cas drsquousage ont eacuteteacute

prioriseacutes

Lrsquoenvoi systeacutematique des

comptes-rendus structureacutes

(+PDF) de biologie meacutedicale aux meacutedecins correspondants et aux

patients par MSSanteacute

Lrsquoalimentation systeacutematique du

dossier meacutedical partageacute avec

ces mecircmes comptes-rendus

La consultation possible du

dossier meacutedical partageacute par le biologiste meacutedical pour

parcourir un historique de santeacute

2

1

3

Le programme Seacutegur numeacuterique permet drsquoacceacuteleacuterer la feuille de route du virage numeacuterique en santeacute

Dans quel contexte Le Seacutegur du Numeacuterique

8

2 Mds euro drsquoinvestissements seront ainsi consacreacutes

pour les toutes prochaines anneacuteeshellip

Source Seacutegur de la Santeacute ndash Dossier de Presse Juillet 2020

Piliers et 33 mesures

composent le Seacutegur de la

santeacute4

Mds euro drsquoinvestissements

nouveaux preacutevus par la

mesure ndeg919

Mds euro drsquoinvestissements

destineacutes au rattrapage du

retard sur le numeacuterique

en santeacute

2

Source de valeur pour lrsquoacceacuteleacuteration du deacuteploiement

du numeacuterique en santeacute

2Action lsquomise en place drsquoun

financement agrave lrsquousage du

numeacuteriquersquo

1Action lsquofinancement de

lrsquoeacutequipement numeacuteriquersquo

et eacutevolution des services

socles

9

Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement

numeacuterique

10

Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1

specifications adopteacutees

DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en

eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)

DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo

Logiciels concerneacutes

par les dossiers de

speacutecifications (DSL)

CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)

ET pour les cas deacutegradeacutes

PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1

(pour le DMP)

Donneacutees exporteacutees

(DMP et MSS)

- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC

Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)

- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL

- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)

Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes

Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG

- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS

codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires

etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)

- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une

fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant

- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et

par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)

degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur

- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)

- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC

- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute

Speacutecifications

reacutefeacuterentiels

Seacutejour hospitalier

Tous les CR Bio (voir section

suivante)

CR Bio Patient Pro

DMP X X

MSS

patientX

MSS

proX

httpsinteropesantegouvfrEVSClient

detailedResultseamtype=CDAampoid=

1361411255911363114810

Publieacute Mi-juin

11

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

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20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

12

Le CDA R2

Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document

Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)

Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante

Deacutefinitions

LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un

codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

13

La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo

Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale

Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique

Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)

Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs

Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays

Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal

2 rue du pontParis 75001

Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal

De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

14

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM

Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par

une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du

CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)

bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)

15

Format Hprim structureacute (V3)

Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur

Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame

Veacutehicule peu drsquoinformations

- En-tecircte 12 lignes

- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement

- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo

Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes

- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis

- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

16

16

Respect des obligations reacuteglementaires

CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3

Obligations Hprim CDAR2 N3

nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO

OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK

La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK

CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99

CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

17

Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

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20rsquo

10rsquo

5rsquo

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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

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33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

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20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

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40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

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SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 5: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

Dans quel contexte Le deacutecret sur la biologie ndeg2016-46 du 26 janvier 2016

5

Deacutecret

2016-

46

Le CR-BIO doit ecirctre structureacute

conformeacutement au reacutefeacuterentiel

drsquointeropeacuterabiliteacute deacutenommeacute ldquovolet

compte rendu drsquoexamens de biologie

meacutedicalerdquo Cela srsquoapplique aux

examens biologiques pour un patient

aux examens pour un patient associeacute agrave

un eacutechantillon biologique non humain

La Terminologie LOINC

Le compte rendu des examens

de biologie meacutedicale est

communiqueacute au prescripteur

par voie eacutelectronique leacutechange

se fait en utilisant une

messagerie eacutelectronique

seacutecuriseacutee de santeacute

Pour en savoir plus acceacutedez

au module deacutedieacute

httpsesante-

formationfrcourseindexphpcat

egoryid=9

Le compte rendu des

examens de biologie meacutedicale

est inseacutereacute dans le dossier

meacutedical partageacute degraves lors

qursquoil contribue agrave la

coordination des soins

Lrsquoalimentation du DMP

Lrsquoeacutechange via une

messagerie seacutecuriseacutee

6

Dans quel contexte Le flux drsquoeacutechange du compte rendu drsquoexamen de biologie ndash CR-Bio

Prescripteur de villeLGC

Laboratoire de ville

Leacutegende

Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre en structureacute

(CDAR2 N3) et en MSSanteacute

Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre structureacutes en HL7

ou CDA

Etablissement de Santeacute

SIL du

laboratoireSIH

Autre laboratoire hospitalier

SIL

SIL

Autre laboratoire de ville

SIL

Prescripteur

7

Le Seacutegur Numeacuterique srsquoinscrit dans le cadre de reacutefeacuterence de la strateacutegie e-santeacute avec lrsquoobjectif drsquoagir

comme un acceacuteleacuterateur

En particulier sur la biologie meacutedicale 3 cas drsquousage ont eacuteteacute

prioriseacutes

Lrsquoenvoi systeacutematique des

comptes-rendus structureacutes

(+PDF) de biologie meacutedicale aux meacutedecins correspondants et aux

patients par MSSanteacute

Lrsquoalimentation systeacutematique du

dossier meacutedical partageacute avec

ces mecircmes comptes-rendus

La consultation possible du

dossier meacutedical partageacute par le biologiste meacutedical pour

parcourir un historique de santeacute

2

1

3

Le programme Seacutegur numeacuterique permet drsquoacceacuteleacuterer la feuille de route du virage numeacuterique en santeacute

Dans quel contexte Le Seacutegur du Numeacuterique

8

2 Mds euro drsquoinvestissements seront ainsi consacreacutes

pour les toutes prochaines anneacuteeshellip

Source Seacutegur de la Santeacute ndash Dossier de Presse Juillet 2020

Piliers et 33 mesures

composent le Seacutegur de la

santeacute4

Mds euro drsquoinvestissements

nouveaux preacutevus par la

mesure ndeg919

Mds euro drsquoinvestissements

destineacutes au rattrapage du

retard sur le numeacuterique

en santeacute

2

Source de valeur pour lrsquoacceacuteleacuteration du deacuteploiement

du numeacuterique en santeacute

2Action lsquomise en place drsquoun

financement agrave lrsquousage du

numeacuteriquersquo

1Action lsquofinancement de

lrsquoeacutequipement numeacuteriquersquo

et eacutevolution des services

socles

9

Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement

numeacuterique

10

Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1

specifications adopteacutees

DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en

eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)

DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo

Logiciels concerneacutes

par les dossiers de

speacutecifications (DSL)

CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)

ET pour les cas deacutegradeacutes

PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1

(pour le DMP)

Donneacutees exporteacutees

(DMP et MSS)

- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC

Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)

- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL

- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)

Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes

Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG

- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS

codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires

etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)

- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une

fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant

- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et

par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)

degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur

- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)

- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC

- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute

Speacutecifications

reacutefeacuterentiels

Seacutejour hospitalier

Tous les CR Bio (voir section

suivante)

CR Bio Patient Pro

DMP X X

MSS

patientX

MSS

proX

httpsinteropesantegouvfrEVSClient

detailedResultseamtype=CDAampoid=

1361411255911363114810

Publieacute Mi-juin

11

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

12

Le CDA R2

Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document

Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)

Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante

Deacutefinitions

LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un

codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

13

La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo

Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale

Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique

Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)

Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs

Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays

Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal

2 rue du pontParis 75001

Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal

De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

14

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM

Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par

une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du

CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)

bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)

15

Format Hprim structureacute (V3)

Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur

Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame

Veacutehicule peu drsquoinformations

- En-tecircte 12 lignes

- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement

- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo

Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes

- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis

- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

16

16

Respect des obligations reacuteglementaires

CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3

Obligations Hprim CDAR2 N3

nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO

OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK

La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK

CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99

CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

17

Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

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20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

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Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 6: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

6

Dans quel contexte Le flux drsquoeacutechange du compte rendu drsquoexamen de biologie ndash CR-Bio

Prescripteur de villeLGC

Laboratoire de ville

Leacutegende

Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre en structureacute

(CDAR2 N3) et en MSSanteacute

Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre structureacutes en HL7

ou CDA

Etablissement de Santeacute

SIL du

laboratoireSIH

Autre laboratoire hospitalier

SIL

SIL

Autre laboratoire de ville

SIL

Prescripteur

7

Le Seacutegur Numeacuterique srsquoinscrit dans le cadre de reacutefeacuterence de la strateacutegie e-santeacute avec lrsquoobjectif drsquoagir

comme un acceacuteleacuterateur

En particulier sur la biologie meacutedicale 3 cas drsquousage ont eacuteteacute

prioriseacutes

Lrsquoenvoi systeacutematique des

comptes-rendus structureacutes

(+PDF) de biologie meacutedicale aux meacutedecins correspondants et aux

patients par MSSanteacute

Lrsquoalimentation systeacutematique du

dossier meacutedical partageacute avec

ces mecircmes comptes-rendus

La consultation possible du

dossier meacutedical partageacute par le biologiste meacutedical pour

parcourir un historique de santeacute

2

1

3

Le programme Seacutegur numeacuterique permet drsquoacceacuteleacuterer la feuille de route du virage numeacuterique en santeacute

Dans quel contexte Le Seacutegur du Numeacuterique

8

2 Mds euro drsquoinvestissements seront ainsi consacreacutes

pour les toutes prochaines anneacuteeshellip

Source Seacutegur de la Santeacute ndash Dossier de Presse Juillet 2020

Piliers et 33 mesures

composent le Seacutegur de la

santeacute4

Mds euro drsquoinvestissements

nouveaux preacutevus par la

mesure ndeg919

Mds euro drsquoinvestissements

destineacutes au rattrapage du

retard sur le numeacuterique

en santeacute

2

Source de valeur pour lrsquoacceacuteleacuteration du deacuteploiement

du numeacuterique en santeacute

2Action lsquomise en place drsquoun

financement agrave lrsquousage du

numeacuteriquersquo

1Action lsquofinancement de

lrsquoeacutequipement numeacuteriquersquo

et eacutevolution des services

socles

9

Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement

numeacuterique

10

Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1

specifications adopteacutees

DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en

eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)

DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo

Logiciels concerneacutes

par les dossiers de

speacutecifications (DSL)

CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)

ET pour les cas deacutegradeacutes

PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1

(pour le DMP)

Donneacutees exporteacutees

(DMP et MSS)

- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC

Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)

- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL

- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)

Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes

Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG

- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS

codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires

etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)

- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une

fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant

- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et

par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)

degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur

- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)

- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC

- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute

Speacutecifications

reacutefeacuterentiels

Seacutejour hospitalier

Tous les CR Bio (voir section

suivante)

CR Bio Patient Pro

DMP X X

MSS

patientX

MSS

proX

httpsinteropesantegouvfrEVSClient

detailedResultseamtype=CDAampoid=

1361411255911363114810

Publieacute Mi-juin

11

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

12

Le CDA R2

Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document

Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)

Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante

Deacutefinitions

LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un

codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

13

La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo

Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale

Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique

Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)

Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs

Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays

Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal

2 rue du pontParis 75001

Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal

De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

14

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM

Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par

une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du

CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)

bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)

15

Format Hprim structureacute (V3)

Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur

Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame

Veacutehicule peu drsquoinformations

- En-tecircte 12 lignes

- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement

- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo

Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes

- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis

- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

16

16

Respect des obligations reacuteglementaires

CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3

Obligations Hprim CDAR2 N3

nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO

OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK

La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK

CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99

CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

17

Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 7: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

7

Le Seacutegur Numeacuterique srsquoinscrit dans le cadre de reacutefeacuterence de la strateacutegie e-santeacute avec lrsquoobjectif drsquoagir

comme un acceacuteleacuterateur

En particulier sur la biologie meacutedicale 3 cas drsquousage ont eacuteteacute

prioriseacutes

Lrsquoenvoi systeacutematique des

comptes-rendus structureacutes

(+PDF) de biologie meacutedicale aux meacutedecins correspondants et aux

patients par MSSanteacute

Lrsquoalimentation systeacutematique du

dossier meacutedical partageacute avec

ces mecircmes comptes-rendus

La consultation possible du

dossier meacutedical partageacute par le biologiste meacutedical pour

parcourir un historique de santeacute

2

1

3

Le programme Seacutegur numeacuterique permet drsquoacceacuteleacuterer la feuille de route du virage numeacuterique en santeacute

Dans quel contexte Le Seacutegur du Numeacuterique

8

2 Mds euro drsquoinvestissements seront ainsi consacreacutes

pour les toutes prochaines anneacuteeshellip

Source Seacutegur de la Santeacute ndash Dossier de Presse Juillet 2020

Piliers et 33 mesures

composent le Seacutegur de la

santeacute4

Mds euro drsquoinvestissements

nouveaux preacutevus par la

mesure ndeg919

Mds euro drsquoinvestissements

destineacutes au rattrapage du

retard sur le numeacuterique

en santeacute

2

Source de valeur pour lrsquoacceacuteleacuteration du deacuteploiement

du numeacuterique en santeacute

2Action lsquomise en place drsquoun

financement agrave lrsquousage du

numeacuteriquersquo

1Action lsquofinancement de

lrsquoeacutequipement numeacuteriquersquo

et eacutevolution des services

socles

9

Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement

numeacuterique

10

Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1

specifications adopteacutees

DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en

eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)

DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo

Logiciels concerneacutes

par les dossiers de

speacutecifications (DSL)

CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)

ET pour les cas deacutegradeacutes

PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1

(pour le DMP)

Donneacutees exporteacutees

(DMP et MSS)

- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC

Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)

- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL

- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)

Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes

Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG

- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS

codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires

etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)

- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une

fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant

- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et

par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)

degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur

- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)

- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC

- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute

Speacutecifications

reacutefeacuterentiels

Seacutejour hospitalier

Tous les CR Bio (voir section

suivante)

CR Bio Patient Pro

DMP X X

MSS

patientX

MSS

proX

httpsinteropesantegouvfrEVSClient

detailedResultseamtype=CDAampoid=

1361411255911363114810

Publieacute Mi-juin

11

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

12

Le CDA R2

Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document

Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)

Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante

Deacutefinitions

LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un

codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

13

La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo

Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale

Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique

Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)

Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs

Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays

Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal

2 rue du pontParis 75001

Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal

De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

14

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM

Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par

une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du

CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)

bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)

15

Format Hprim structureacute (V3)

Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur

Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame

Veacutehicule peu drsquoinformations

- En-tecircte 12 lignes

- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement

- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo

Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes

- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis

- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

16

16

Respect des obligations reacuteglementaires

CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3

Obligations Hprim CDAR2 N3

nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO

OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK

La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK

CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99

CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

17

Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 8: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

8

2 Mds euro drsquoinvestissements seront ainsi consacreacutes

pour les toutes prochaines anneacuteeshellip

Source Seacutegur de la Santeacute ndash Dossier de Presse Juillet 2020

Piliers et 33 mesures

composent le Seacutegur de la

santeacute4

Mds euro drsquoinvestissements

nouveaux preacutevus par la

mesure ndeg919

Mds euro drsquoinvestissements

destineacutes au rattrapage du

retard sur le numeacuterique

en santeacute

2

Source de valeur pour lrsquoacceacuteleacuteration du deacuteploiement

du numeacuterique en santeacute

2Action lsquomise en place drsquoun

financement agrave lrsquousage du

numeacuteriquersquo

1Action lsquofinancement de

lrsquoeacutequipement numeacuteriquersquo

et eacutevolution des services

socles

9

Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement

numeacuterique

10

Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1

specifications adopteacutees

DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en

eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)

DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo

Logiciels concerneacutes

par les dossiers de

speacutecifications (DSL)

CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)

ET pour les cas deacutegradeacutes

PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1

(pour le DMP)

Donneacutees exporteacutees

(DMP et MSS)

- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC

Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)

- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL

- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)

Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes

Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG

- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS

codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires

etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)

- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une

fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant

- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et

par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)

degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur

- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)

- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC

- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute

Speacutecifications

reacutefeacuterentiels

Seacutejour hospitalier

Tous les CR Bio (voir section

suivante)

CR Bio Patient Pro

DMP X X

MSS

patientX

MSS

proX

httpsinteropesantegouvfrEVSClient

detailedResultseamtype=CDAampoid=

1361411255911363114810

Publieacute Mi-juin

11

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

12

Le CDA R2

Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document

Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)

Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante

Deacutefinitions

LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un

codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

13

La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo

Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale

Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique

Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)

Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs

Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays

Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal

2 rue du pontParis 75001

Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal

De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

14

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM

Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par

une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du

CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)

bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)

15

Format Hprim structureacute (V3)

Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur

Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame

Veacutehicule peu drsquoinformations

- En-tecircte 12 lignes

- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement

- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo

Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes

- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis

- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

16

16

Respect des obligations reacuteglementaires

CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3

Obligations Hprim CDAR2 N3

nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO

OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK

La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK

CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99

CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

17

Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

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33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 9: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

9

Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement

numeacuterique

10

Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1

specifications adopteacutees

DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en

eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)

DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo

Logiciels concerneacutes

par les dossiers de

speacutecifications (DSL)

CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)

ET pour les cas deacutegradeacutes

PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1

(pour le DMP)

Donneacutees exporteacutees

(DMP et MSS)

- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC

Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)

- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL

- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)

Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes

Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG

- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS

codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires

etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)

- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une

fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant

- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et

par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)

degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur

- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)

- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC

- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute

Speacutecifications

reacutefeacuterentiels

Seacutejour hospitalier

Tous les CR Bio (voir section

suivante)

CR Bio Patient Pro

DMP X X

MSS

patientX

MSS

proX

httpsinteropesantegouvfrEVSClient

detailedResultseamtype=CDAampoid=

1361411255911363114810

Publieacute Mi-juin

11

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

12

Le CDA R2

Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document

Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)

Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante

Deacutefinitions

LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un

codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

13

La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo

Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale

Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique

Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)

Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs

Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays

Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal

2 rue du pontParis 75001

Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal

De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

14

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM

Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par

une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du

CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)

bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)

15

Format Hprim structureacute (V3)

Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur

Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame

Veacutehicule peu drsquoinformations

- En-tecircte 12 lignes

- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement

- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo

Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes

- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis

- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

16

16

Respect des obligations reacuteglementaires

CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3

Obligations Hprim CDAR2 N3

nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO

OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK

La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK

CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99

CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

17

Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 10: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

10

Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1

specifications adopteacutees

DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en

eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)

DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo

Logiciels concerneacutes

par les dossiers de

speacutecifications (DSL)

CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)

ET pour les cas deacutegradeacutes

PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1

(pour le DMP)

Donneacutees exporteacutees

(DMP et MSS)

- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC

Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)

- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL

- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)

Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes

Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG

- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS

codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires

etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)

- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une

fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant

- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et

par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)

degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur

- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)

- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC

- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute

Speacutecifications

reacutefeacuterentiels

Seacutejour hospitalier

Tous les CR Bio (voir section

suivante)

CR Bio Patient Pro

DMP X X

MSS

patientX

MSS

proX

httpsinteropesantegouvfrEVSClient

detailedResultseamtype=CDAampoid=

1361411255911363114810

Publieacute Mi-juin

11

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

12

Le CDA R2

Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document

Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)

Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante

Deacutefinitions

LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un

codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

13

La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo

Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale

Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique

Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)

Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs

Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays

Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal

2 rue du pontParis 75001

Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal

De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

14

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM

Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par

une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du

CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)

bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)

15

Format Hprim structureacute (V3)

Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur

Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame

Veacutehicule peu drsquoinformations

- En-tecircte 12 lignes

- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement

- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo

Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes

- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis

- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

16

16

Respect des obligations reacuteglementaires

CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3

Obligations Hprim CDAR2 N3

nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO

OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK

La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK

CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99

CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

17

Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

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20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

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33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

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10rsquo

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SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

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POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

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45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

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Page 11: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

11

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

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Le CDA R2

Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document

Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)

Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante

Deacutefinitions

LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un

codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

13

La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo

Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale

Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique

Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)

Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs

Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays

Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal

2 rue du pontParis 75001

Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal

De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM

Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par

une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du

CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)

bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)

15

Format Hprim structureacute (V3)

Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur

Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame

Veacutehicule peu drsquoinformations

- En-tecircte 12 lignes

- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement

- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo

Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes

- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis

- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

16

16

Respect des obligations reacuteglementaires

CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3

Obligations Hprim CDAR2 N3

nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO

OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK

La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK

CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99

CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

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Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

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Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

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20rsquo

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En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

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bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

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Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

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34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

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Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

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SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

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Questionnaire de satisfaction

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45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

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Page 12: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

12

Le CDA R2

Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document

Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)

Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante

Deacutefinitions

LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un

codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

13

La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo

Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale

Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique

Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)

Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs

Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays

Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal

2 rue du pontParis 75001

Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal

De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

14

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM

Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par

une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du

CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)

bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)

15

Format Hprim structureacute (V3)

Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur

Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame

Veacutehicule peu drsquoinformations

- En-tecircte 12 lignes

- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement

- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo

Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes

- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis

- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

16

16

Respect des obligations reacuteglementaires

CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3

Obligations Hprim CDAR2 N3

nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO

OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK

La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK

CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99

CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

17

Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

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Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

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Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

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Conseil en

biologie meacutedicale

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com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

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Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 13: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

13

La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo

Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale

Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique

Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)

Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs

Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays

Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal

2 rue du pontParis 75001

Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal

De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique

14

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM

Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par

une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du

CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)

bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)

15

Format Hprim structureacute (V3)

Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur

Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame

Veacutehicule peu drsquoinformations

- En-tecircte 12 lignes

- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement

- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo

Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes

- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis

- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

16

16

Respect des obligations reacuteglementaires

CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3

Obligations Hprim CDAR2 N3

nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO

OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK

La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK

CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99

CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

17

Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

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Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

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Web httpwwwphastf

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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

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Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

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Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

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Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

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9

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sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

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du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 14: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

14

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM

Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par

une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du

CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain

bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)

bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)

15

Format Hprim structureacute (V3)

Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur

Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame

Veacutehicule peu drsquoinformations

- En-tecircte 12 lignes

- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement

- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo

Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes

- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis

- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

16

16

Respect des obligations reacuteglementaires

CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3

Obligations Hprim CDAR2 N3

nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO

OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK

La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK

CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99

CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

17

Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

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En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

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Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 15: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

15

Format Hprim structureacute (V3)

Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur

Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame

Veacutehicule peu drsquoinformations

- En-tecircte 12 lignes

- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement

- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo

Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes

- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis

- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

16

16

Respect des obligations reacuteglementaires

CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3

Obligations Hprim CDAR2 N3

nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO

OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK

La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK

CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99

CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

17

Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

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Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 16: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

16

16

Respect des obligations reacuteglementaires

CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3

Obligations Hprim CDAR2 N3

nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO

OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK

La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK

CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99

CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

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Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

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Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 17: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

17

Respect des obligations normatives

Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

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20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

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En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 18: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS

REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX

Une meilleure identification du patient

et des professionnels de santeacute dans le

compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des

reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de

Santeacute INShellip)

TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE

Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des

groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie

baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne

contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par

groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)

TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE

Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute

drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement

lrsquoauteur

FORMAT STANDARD INTERNATIONAL

Un format de compte rendu baseacute sur le standard international

Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30

nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS

Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un

professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats

eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale

Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la

visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse

preacutecise

Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP

MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS

Beacuteneacutefices pour les biologistes

Beacuteneacutefices pour les prescripteurs

Beacuteneacutefices pour les patients

CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale

18

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

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litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

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Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

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bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

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Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

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JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

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Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

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com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

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Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

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Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

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sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 19: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

19

20

Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

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33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

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SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

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POUR ALLER

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Questionnaire de satisfaction

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4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

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Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

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Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

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Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

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Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

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esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

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Programme de la formation

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 21: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

Crsquoest quoi

LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques

Ccedila sert agrave quoi

Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux

Comment

Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute

Qui doit inteacutegrer cette terminologie

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM

codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 22: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

22

Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute

Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)

Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)

Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H

Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses

Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)

Technique (type of method)

Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee

Exemple

53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL

AnalyteCode LOINC Grandeur

Temporaliteacute

Milieu Eacutechelle Technique

5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

23

Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

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Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

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Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

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Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

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Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

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Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

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94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

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4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

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Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

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documents-cda

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Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

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Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

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Ensembles drsquoobservations regroupeacutees

par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip

par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA

par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 24: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

1 Le LOINC international

2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais

3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo

Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs

Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)

La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes

NABM ont un alignement avec LOINC

Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)

La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats

91 177 codes

55 192

codes

5526

codes

24

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 25: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

25

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

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biologie meacutedicale

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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

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Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

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Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

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Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

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des services et produits de lrsquoagence

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sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

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26

En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie

Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de

bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande

drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie

meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un

prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse

- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute

bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

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3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

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Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

Merci de votre participation

Page 27: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

27

bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties

1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)

2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription

3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

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35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

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Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

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Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

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sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

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Page 28: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

28

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs

bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication

bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute

bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC

LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes

deacutedition

Niveau

minimum

de

comparab

iliteacute

Techniqu

e

discrimin

ante ON

Uniteacute

recommand

eacutee

Uniteacute

UCUM

Preacutesenc

e

systeacutema

CR

ON

Date de

validatio

n

Version

VP

Statu

t

Versio

n de

litem

corrigeacute

Date de

retrait

ASIP

Remplac

eacute par

60474-

4

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique Comptage

automate

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N

150720

17 V115

Inact

if

ASIP

V111

0

15012

019 14196-0

14196-

0

Reacuteticulocytes

[NombreVolume] Sang

Numeacuterique

Reacuteticulocyt

es1 N 109L 109L N 150120

19 V1110 Actif

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

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Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

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sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

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Page 29: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

29

bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)

14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)

2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)

bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire

bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte

rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de

deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir

compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1

Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute

30

Navigation dans les concepts

du jeu de valeurs

Teacuteleacutechargement

en format XLS

Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

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Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

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Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

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1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

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Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

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40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

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20rsquo

10rsquo

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15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

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0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

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POUR ALLER

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Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

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1

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2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

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4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

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Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

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du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

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du jeu de valeurs

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3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs

Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

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Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

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Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

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Alors je lrsquoimpleacutemente dans

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2

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JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

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94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

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POUR ALLER

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Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

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o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

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1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

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4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

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biologie

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des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

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Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip

1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr

2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu

de valeurs circuit de biologie et cliquer sur

Proposer31

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC

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Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

32

33

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

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3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

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15rsquo

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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

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Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

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Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

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Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

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Code Interne lt=gt Code Loinc

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Code

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2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

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3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

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5 Exemple drsquoapplication

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SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

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94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

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1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

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Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

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Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

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1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

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Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

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Code

trouveacute

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Code Interne lt=gt Code Loinc

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Code Interne lt=gt Code Loinc

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1

2

3

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4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

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Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

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Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

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Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

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Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

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5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

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Questionnaire de satisfaction

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Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

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MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

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Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

46

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Page 34: Webinaire LOINC - esante.gouv.fr

34

La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis

Le SIL doit assurer la gestion de

plusieurs catalogues drsquoexamens et la

correspondance sur ces catalogues

Pour en savoir plus sur les SIL qui

permettent cette gestion

httpsmssantefrlbmsil

Le biologiste doit reacutealiser le

transcodage entre ses codes

drsquoanalyses internes et la nomenclature

LOINC

Le jeu de valeurs laquo circuit de la

biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel

Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs

et de son alignement avec le catalogue

degraves la sortie drsquoune nouvelle version

Tacircche approximativement de 4 jours en

temps plein pour un biologiste (REX)

Des regravegles de gestion de la

comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies

Choix des codes LOINC avec ou

sans technique renseigneacutee

Choix drsquoutiliser un mecircme code

LOINC pour plusieurs techniques

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de

transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

(page suivante)

35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation

o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

Merci drsquoavance pour vos retours

45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC

Transcodage

fait par un

industriel

Transcodage

manuel par le

biologiste

21

Description de la meacutethode

Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son

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transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC

Comment la mettre en œuvre

Faire appel agrave un des industriels connus

Description de la meacutethode

Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en

LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses

2 faccedilons de proceacuteder

transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre

de seacutelection de chapitres LOINC

transcodage par identification des examens les plus freacutequents

transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le

laboratoire

Comment la mettre en œuvre

Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes

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35

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

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laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

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Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

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1

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3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

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Web

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Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

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40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

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Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

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Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

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4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

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biologie

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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire

1

Transcodage

manuel par le

biologiste

Reacutecupeacuteration de la derniegravere

version du jeu de valeurs

laquo circuit de la biologie raquo sur le

site Bioloincfr

Je cherche mon code dans le jeu

de valeurs en veacuterifiant bien

lrsquouniteacute

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je recherche mon code dans

un plus grand JDV le

laquo LOINC Franccedilais raquo

Code

trouveacute

Alors je lrsquoimpleacutemente dans

mon systegraveme

Code Interne lt=gt Code Loinc

Je demande lrsquoajout du code

sur le site Bioloincfr36

1

2

3

3

4

4

JDV = Jeu de valeurs

Bonne pratique

Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code

interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de

technique

Oui

Non

Oui

Non

37

Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

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Web

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Compte rendu

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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

94

50

0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

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42

POUR ALLER

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Questionnaire de satisfaction

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1

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2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

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5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

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Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir

Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC

Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC

Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente

Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence

Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC

Possibiliteacute 1

Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes

Possibiliteacute 2

Arriveacutee du flux

Reconnaissance des codes LOINCidentiques

Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

41

Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

X = preacutelegravevement non conforme

94

50

0-6

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0-6

94762-294762-2

5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP

Temps

drsquoeacutechange

Posez-nous vos questions

42

POUR ALLER

PLUS LOINhellip

Ressources disponibles

Questionnaire de satisfaction

Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait

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o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9

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45

Ressources disponibles

1

Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr

Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome

2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr

3

Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr

questionssfilassofr

4Pour mieux connaitre les offres techniques

MSSanteacute httpsmssantefretsoffres

5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6

Pour se former aux enjeux de

lrsquointeropeacuterabiliteacute

Outils de tests compte rendu drsquoexamen de

biologie

httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-

documents-cda

7

Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr

8

Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-

santesihhopen

Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie

preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935

163ampcategorieLien=id

9

10

Ressources disponibles

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

des services et produits de lrsquoagence

du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer

sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute

esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble

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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage

5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations

38

Aide agrave la deacutecision

meacutedicale ndash IA

Web

httpsbiologbookfrtran

scodification-loinc

Contact

contactbiologbookfr

Compte rendu

augmenteacute

Web httpsmedicusail

pagescolingua

Contact

francemedicusai

Opeacuterateur

drsquointeropeacuterabiliteacute

Web httpwwwphastf

rciolab

Conseil en

biologie meacutedicale

Contact

philippechatrongmail

com

C2Bio

Intelligence

Artificielle (IA)

Web

httpsonaoscomsolutions

Contact

Guilhemmayoralonaosc

om

namratapatelonaoscom

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio

39

40

Dans quel contexte

1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees

2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale

3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC

5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

20rsquo

10rsquo

5rsquo

15rsquo

SIDEP

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Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

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3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo

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5 Exemple drsquoapplication

Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

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10rsquo

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SIDEP

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Programme de la formation

10rsquo

15rsquo

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10rsquo

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SIDEP

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Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)

Utilisation des mecircmes codes par tous

Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute

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Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6

Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2

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