Article: Estimates of genetic and phenotypic parameters of some growth traits in Common African and...

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Estimates of genetic and phenotypic Estimates of genetic and phenotypic parameters of some growth traits in parameters of some growth traits in

Common African and Alpine crossbred Common African and Alpine crossbred goats.goats.

Duchêne RomainDuchêne Romain TP paraclinique de 2° doctoratTP paraclinique de 2° doctorat

Marichal ThomasMarichal Thomas Service de génétique quantitativeService de génétique quantitative

Sizaire BenoîtSizaire Benoît

1.1. IntroductionIntroduction

Objectif:Objectif: estimation de paramètres estimation de paramètres génétiques et phénotypiques (corrélations, génétiques et phénotypiques (corrélations, héritabilité) de certains traits de héritabilité) de certains traits de croissance (PC, GQM)croissance (PC, GQM)

Mesures provenant d’un projet français Mesures provenant d’un projet français afin d’améliorer le potentiel génétique de afin d’améliorer le potentiel génétique de la race caprine africaine communela race caprine africaine commune

2. Matériel et méthode2. Matériel et méthode

Espèce: caprineEspèce: caprine Race – effectif: Race – effectif:

– race commune africaine (race commune africaine (CACA) ) 838 chevreaux838 chevreaux– croisés entre race alpine française (croisés entre race alpine française (AFAF) (16 ) (16

géniteurs mâles de lignée pure) et race géniteurs mâles de lignée pure) et race commune africaine (géniteurs femelles): commune africaine (géniteurs femelles): 688 688 chevreauxchevreaux

2. Matériel et méthode2. Matériel et méthode

1)1) 16 boucs AF16 boucs AF XX chèvres CAchèvres CA (IA)(IA)

688 CA - AF688 CA - AF

2) boucs CA2) boucs CA XX chèvres CAchèvres CA (aléatoire)(aléatoire)

838 CA838 CA

2. Matériel et méthode2. Matériel et méthode

Standardisation des conditions Standardisation des conditions environnementales pour tous les environnementales pour tous les animaux étudiésanimaux étudiés

MesuresMesures sur les chevreaux: sur les chevreaux:– PC de la naissance à J 210 réparti en 8 classesPC de la naissance à J 210 réparti en 8 classes PC 0 – PC 30 – PC 60 – PC 90 – PC 120 – PC 150 – PC 180 – PC 210 PC 0 – PC 30 – PC 60 – PC 90 – PC 120 – PC 150 – PC 180 – PC 210

– GQM de la naissance à J 210 réparti en 8 GQM de la naissance à J 210 réparti en 8 classesclasses

GQM 1 – GQM 2 – GQM 3 – GQM 4 – GQM 5 – GQM 6 – GQM 7 – GQM 8GQM 1 – GQM 2 – GQM 3 – GQM 4 – GQM 5 – GQM 6 – GQM 7 – GQM 8

2. Matériel et méthode2. Matériel et méthode

Ajustement des donnéesAjustement des données

Utilisation des mesures sur les « croisés » Utilisation des mesures sur les « croisés » afin d’estimer:afin d’estimer:– L’héritabilité des 16 paramètres (8-PC et 8-L’héritabilité des 16 paramètres (8-PC et 8-

GQM)GQM)– La corrélation génétiqueLa corrélation génétique– La corrélation phénotypique entre ces La corrélation phénotypique entre ces

paramètresparamètres

2. Matériel et méthode2. Matériel et méthode

Méthodes statistiques:Méthodes statistiques:– h²: paternal half sibs (PHS): demi-sœurs h²: paternal half sibs (PHS): demi-sœurs

paternelles: paternelles: modèle pèremodèle père h²= 4h²= 4 sigma²s / sigma²t sigma²s / sigma²t sigma²s= variance entre pèressigma²s= variance entre pères Sigma²t = variance totale = variance intra-père + Sigma²t = variance totale = variance intra-père +

variance entre-pèrevariance entre-père

– Corrélations:Corrélations: r (X,Y) = cov (x,y)/ (var(x) ¤ var(y)) r (X,Y) = cov (x,y)/ (var(x) ¤ var(y)) 0,50,5

3. Résultats et discussion3. Résultats et discussion

1.1. Etude des effets Etude des effets 1.1. De la race du géniteurDe la race du géniteur

2.2. Du genre des chevreauxDu genre des chevreaux

3.3. Du type de naissance des chevreauxDu type de naissance des chevreaux

4.4. De l’âge de la génitrice De l’âge de la génitrice

sur le PC (8 classes) et le GQM (8 sur le PC (8 classes) et le GQM (8 classes) des chevreauxclasses) des chevreaux

Interprétation des moyennes et erreurs standards des PC en fonction Interprétation des moyennes et erreurs standards des PC en fonction de la race du géniteur, du genre, du type de naissance et de l’âge de la de la race du géniteur, du genre, du type de naissance et de l’âge de la

mère.mère.

PC PC 0 PC 30 PC 60 PC 90 PC 120 PC 150 PC 180 PC 210Race du père Common afr.

Alpine + + + + + + + +Genre Males + + + +

FemmellesType naissance simple +

doubletriplequadruple

Age des mères 3 ans4 ans5 ans6 ans7 ans8 ans + + + +9 ans + + + +

3. Résultats et discussion3. Résultats et discussion

PC: PC: nous remarquons que:nous remarquons que:– La race des progéniteurs (race AF > race CA) La race des progéniteurs (race AF > race CA)

représente la représente la principale source de variationprincipale source de variation, avec un , avec un avantage notable (P<0,001) pour la race AF avantage notable (P<0,001) pour la race AF de J60 à J210de J60 à J210

– Le genre (mâle > femelle) Le genre (mâle > femelle) est assez significatif (P<0.05) est assez significatif (P<0.05) de J0 à J90de J0 à J90

– Les naissances simplesLes naissances simples sont significativement avantagées sont significativement avantagées (P<0.05) par rapport aux autres à (P<0.05) par rapport aux autres à J210J210 seulement seulement

– L’âge important de la génitrice (8 ou 9 ans)L’âge important de la génitrice (8 ou 9 ans) donne donne également un avantage significatif (P<0.05) aux chevreaux également un avantage significatif (P<0.05) aux chevreaux à partir de à partir de J120J120

Interprétation des moyennes et erreurs standards des GQM en Interprétation des moyennes et erreurs standards des GQM en fonction de la race du géniteur, du genre, du type de naissance et de fonction de la race du géniteur, du genre, du type de naissance et de

l’âge de la mère.l’âge de la mère.

GQM GQM 1 GQM 2 GQM 3 GQM 4 GQM 5 GQM 6 GQM 7 GQM 8Sire breed Common afr.

Alpine + + + + + +Genre Males + + + +

FemmellesType naissance simple + +

doubletriplequadruple

Age des mères 3 ans4 ans5 ans6 ans7 ans8 ans9 ans

3. Résultats et discussion3. Résultats et discussion

GQM:GQM: les mêmes constatations peuvent être faites les mêmes constatations peuvent être faites avec les moyennes des GQM; avec les moyennes des GQM; la race des progéniteurs la race des progéniteurs représente la principale source de variation avec un net représente la principale source de variation avec un net avantage pour la race AF.avantage pour la race AF.

3. Résultats et discussion3. Résultats et discussion

Tableau résumant les corrélations génétiques et phénotypiques Tableau résumant les corrélations génétiques et phénotypiques ainsi que les héritabilités des paramètres étudiésainsi que les héritabilités des paramètres étudiés

PC 0 PC 30 PC 60 PC 90 PC 120 PC 150 PC 180 PC 210 GQM 1 GQM 2 GQM 3 GQM 4 GQM 5 GQM 6 GQM 7 GQM 8PC 0 0,68 - -PC 30 + 0,68 - -PC 60 0,54 - -PC 90 0,49 - -PC 120 0,47PC 150 0,44PC 180 0,43PC 210 - 0,39GQM 1 0,39GQM 2 0,45GQM 3 0,44GQM 4 0,32GQM 5 0,27GQM 6 0,15GQM 7 0,11GQM 8 0,37

3. Résultats et discussion3. Résultats et discussion

2.2. Estimation de l’héritabilité:Estimation de l’héritabilité:

- PC: les paramètres les plus héritables PC: les paramètres les plus héritables (0.68, 0.68 et 0.54) sont: PC0, PC30 et (0.68, 0.68 et 0.54) sont: PC0, PC30 et PC60PC60

- GQM:GQM: les paramètres les plus héritables les paramètres les plus héritables (0.45, 0.44 et 0.32) sont: GQM2, GQM3 et (0.45, 0.44 et 0.32) sont: GQM2, GQM3 et GQM 4GQM 4

- Intérêt de faire de la sélection de Intérêt de faire de la sélection de masse sur le PC dans la période de masse sur le PC dans la période de J0 à J60J0 à J60

3. Résultats et discussion3. Résultats et discussion

Tableau résumant les corrélations génétiques et phénotypiques Tableau résumant les corrélations génétiques et phénotypiques ainsi que les héritabilités des paramètres étudiésainsi que les héritabilités des paramètres étudiés

PC 0 PC 30 PC 60 PC 90 PC 120 PC 150 PC 180 PC 210 GQM 1 GQM 2 GQM 3 GQM 4 GQM 5 GQM 6 GQM 7 GQM 8PC 0 0,68 - -PC 30 + 0,68 - -PC 60 0,54 - -PC 90 0,49 - -PC 120 0,47PC 150 0,44PC 180 0,43PC 210 - 0,39GQM 1 0,39GQM 2 0,45GQM 3 0,44GQM 4 0,32GQM 5 0,27GQM 6 0,15GQM 7 0,11GQM 8 0,37

3. Résultats et discussion3. Résultats et discussion

- ° Corrélations phénotypiques:° Corrélations phénotypiques:- - entre le PC 0 et les autres PC: positives et hautes entre le PC 0 et les autres PC: positives et hautes (P<0.01) et diminution avec l’augmentation de l’âge(P<0.01) et diminution avec l’augmentation de l’âge

- entre les PC et les GQM: positives et hautes- entre les PC et les GQM: positives et hautes

°° Corrélations Corrélations génétiquesgénétiques : :- entre les PC et les GQM: - entre les PC et les GQM: positives et hautespositives et hautes SAUF: SAUF:

° GQM 6 et PC de J0 à J90° GQM 6 et PC de J0 à J90

° GQM 7 et PC de J0 à J90° GQM 7 et PC de J0 à J90

3. Résultats et discussion3. Résultats et discussion

---- ---- La corrélation négative La corrélation négative observée entre GQM 6-7 et le PC observée entre GQM 6-7 et le PC nous montre l’importance nous montre l’importance d’effectuer la sélection d’effectuer la sélection avant le avant le sevragesevrage

---- ainsi, la corrélation génétique ---- ainsi, la corrélation génétique observée va permettre, en observée va permettre, en sélectionnant sur le poids au plus sélectionnant sur le poids au plus jeune âge, d’atteindre le poids de jeune âge, d’atteindre le poids de commercialisation dans un délai plus commercialisation dans un délai plus bref (bref (pléiotrophiepléiotrophie))

4. Conclusion – intérêt dans la 4. Conclusion – intérêt dans la profession profession

Les chevreaux croisés CA-AF Les chevreaux croisés CA-AF présentent un présentent un avantage pondéralavantage pondéral significatif par rapport à la race CAsignificatif par rapport à la race CA

La La sélectionsélection sur le PC va permettre sur le PC va permettre une amélioration du GQM des une amélioration du GQM des chevreaux, au vu de la corrélation chevreaux, au vu de la corrélation génétique positive entre ces génétique positive entre ces paramètres.paramètres.

5. Critique5. Critique Pour chaque résultat obtenu, l’auteur s’appuie Pour chaque résultat obtenu, l’auteur s’appuie

sur d’sur d’autres étudesautres études réalisés auparavant; réalisés auparavant; démarche très scientifique.démarche très scientifique.

Les Les résultatsrésultats, bien que non identiques, suivent , bien que non identiques, suivent malgré tout la même tendance; l’auteur justifie malgré tout la même tendance; l’auteur justifie ces écarts par l’utilisation de méthodes ces écarts par l’utilisation de méthodes statistiques différentes (ig régression de la statistiques différentes (ig régression de la descendance sur les parents vs PHS), les erreurs descendance sur les parents vs PHS), les erreurs d’échantillonnage, …d’échantillonnage, …

Les Les effectifseffectifs de départ étant relativement de départ étant relativement élevés, ils ne représentent pas une source de élevés, ils ne représentent pas une source de biais notable.biais notable.

6. Bibliographie6. Bibliographie

Estimates of genetic and phenotypic Estimates of genetic and phenotypic parameters of some growth traits in parameters of some growth traits in Common African and Alpine Common African and Alpine crossbred goats;crossbred goats; M. Mourad, M.R. M. Mourad, M.R. AnousAnous

Cours de génétique quantitative de Cours de génétique quantitative de 1° doctorat; J. Detilleux1° doctorat; J. Detilleux

Cours de statistique de 1° et 2° Cours de statistique de 1° et 2° candidature; P. Leroy, F. Farnircandidature; P. Leroy, F. Farnir