99
Faculté de Pharmacie RAPPORT d’ACTIVITÉ SCIENTIFIQUE 2014 74, route du Rhin - B.P. 60024 - 67401 ILLKIRCH Cédex Tel. : 03.68.85.43.15 - Fax : 03.68.85.41.04 http://www-fac-pharma.u-strasbg.fr/

Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

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Faculté de Pharmacie

RAPPORT

d’ACTIVITÉ SCIENTIFIQUE

2014

7 4 , r o u t e d u R h i n - B . P . 6 0 0 2 4 - 6 7 4 0 1 I L L K I R C H C é d e x

Te l . : 03 .68 .85 .43 .15 - Fax : 03 .68 .85 .41 .04

h t tp : / / www-fac -pha rma .u - s t r a sbg . f r /

Page 2: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

SOMMAIRE

Rapport d’activité scientifique de la Faculté de Pharmacie .................................

Sommaire .................................................................................................................................. 2

Publications en 2014 ................................................................................................................. 3

Répartition des effectifs .......................................................................................... 6

Publications de la faculté de pharmacie .................................................................................... 7

Thèses soutenues en 2014 ......................................................................................................... 8

Unités :

Laboratoire de Conception et d’Application des Molécules Bioactives (UMR 7199) ............. 9

Laboratoire d’Innovation Thérapeutique (UMR 7200) ........................................................... 20

Laboratoire de Biophotonique et Pharmacologie (UMR 7213) .............................................. 43

Équipes :

Borreliose de Lyme (EA 7290) ............................................................................................... 66

Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien. Département des Sciences Analytiques. Equipe de

chimie analytique des molécules bioactives (UMR7178-LC4) .............................................. 75

Centre des études internationales et européennes EA 3994 (Activité J-Y. Pabst) .................. 86

Plates-formes technologiques et plateaux techniques :

Plate-forme de Chimie Biologique Intégrative de Strasbourg (PCBIS) Unité Mixte de Service

(UMS) 3286 CNRS-UdS ......................................................................................................... 87

eBioCyt plate-forme mutualisée de cytomique ............................................................................. 94

Page 3: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Les revues scientifiques et leur facteur d’impact (2014)

Cette liste comporte les revues figurant dans le « Journal Citation Reports » publié

par l’ « Institute for Scientific Information ».

L’« Impact Factor » (IF) est défini comme suit :

NOM DE LA REVUE

INTERNATIONALE

NOMBRE

DE

PARUTIONS

FACTEUR

D’IMPACT

ACS Chem. Biol. 2 5,331

ACS Chem. Neurosci. 1 4,362

ACS Nano 1 12,033

Adv. Drug Deliv. 2 12,707

Adv. Mater. 2 15,409

Allergy 1 6,028

Anal. Chem. 1 5,825

Angew. Chem. Int. Edit. 1 11,336

Ann. Biol. Clin. 1 -

Annal. Chem. 1 5,636

Appl. Environ. Microbiol.. 1 3,952

Arch. Toxicol. 1 5,078

Biochem. Pharmacol. 1 5,009

Biochim. Biophys. Acta – Biomembranes 1 3,431

Biochim. Biophys. Acta – Mol.Basis Dis. 1 4,882

Biochim. Biophys. Acta – Mol. Cell Biol. Lipids 1 5,162

Biochim. Biophys. Acta – Mol. Cell Res. 2 5,019

Biochim. Biophys. Acta – Gen. Subj. 1 4,381

Biochim. Biophys. Proteins Proteomics 1 2,747

Biochem. Pharmacol. 3 5,009

Bioconjugate Chem. 3 4,821

Biomaterials 2 8,312

Biomed. Res. Int. 1 -

Bioorg. Med. Chem. Lett. 1 2,420

Biosens. Bioelectron.. 1 6,409

BMC Infect. Dis. 1 2,561

Cancer Cell Int. 1 2,766

Cancer Immunol. Res. 1 -

Cell Death Dis. 1 5,014

ChemBioChem 1 3,060

Chem. Biol. 1 6,645

Chem. Commun. 4 6,834

Chem.-Eur. J. 2 5,731

Chem. Phys. Lipids 1 2,422

ChemBioChem 1 3,088

ChemMedChem 2 2,968

Clin. Chem. Lab. Med. 1 2,955

Clin. Microbiol. Infect. 2 5,197

Curr. Biol. 1 9,571

nombre de fois que la revue X a été citée durant les 2 dernières années dans diverses publications

nombre d’articles publiés dans la revue X durant ces 2 dernières années IF d’une revue X =

Page 4: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Curr. Pharm. Design 1 3,452

Der Pharmacia Lettre 1 -

Diabetol. Metab. Syndr. 1 2,173

Ethnopharmacologia 1 -

Eur. J. Inorg. Chem. 1 2,942

Eur. J. Med. Chem. 2 3,447

Eur. J. Nutr. 1 -

Eur. J. Org. Chem. 1 3,065

Eur. J. Pharm. Biopharm. 1 4,245

Eur. Surveill. 1 -

Expert Opin. Drug Deliv. 2 4,116

Front. Chem. 1 -

Front. Neurosci. 1 3,656

Front. Pharmacol. 1 -

Green Chem. 1 8,020

IEEE Trans. Biomed. Eng. 1 2,347

Int. J. Pharm. 1 3,785

Int. J. Phytomedicine 1 -

Invest. New Drug 1 -

J. Alzheimers Dis. 1 3,612

J. Appl. Microbiol. 1 2,386

J. Agr. Food Chem. 1 3,107

J. Cardiothorac. Surg. 1 1,028

J. Cardiovasc. Electrophysiol. 1 2,958

J. Chem. Inf. Model. 2 3,738

J. Control. Rel. 2 7,261

J. Cyst. Fibros. 1 3,475

J. Diabetes Complications 1 3,005

J. Immunol. 2 4,922

J. Incl. Phenom. Macrocycl. Chem. 1 1,488

J. Infect. 1 4,017

J. Infect. Dis. 1 2,330

J. Invest. Derm. 1 6,372

J. Med. Chem. 2 5,447

J. Nanosci. Lett. 1 -

J. Org. Chem. 2 4,721

J. Pharm. Bioall. Sci. 2 -

Lab Chip 1 6,115

Lipids 1 1,854

LWT-Food Sci. Technol. 1 2,468

Macromol. Biosci. 1 3,851

Macromol. Rapid Commun. 1 4,608

Magn. Reson. Med. 1 3,571

Mater. Sci. Eng. C-Mater. Biol. Appl. 1 3,088

Med. Mal. Infect. 3 -

Methods Mol. Biol. 2 1,29

Mol. Inf. 1 1,647

M S-Med. Sci. 2 0,671

Nanoscale 1 7,394

Nat. Commun. 2 11,470

Nature 1 41,456

New J. Chem. 1 3,086

Nucleic Acids Res. 2 9,112

Org. Biomol. Chem. 1 3,562

Page 5: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Org. Lett. 1 6,364

Orig. Life Evol. Biosph. 1 1,110

Orthop. Traumatol.-Surg. Res.. 1 1,256

Oxidative Med. Cell. Longev. 1 3,363

Pharm. Res. 1 3,952

Pharmacol. Ther. 1 9,723

Planta Med. 6 2,152

Plos One 7 3,234

Phys. Chem. Chem. Phys. 1 4,493

Radiat. Phys. Chem 1 1,189

RSC Adv. 2 3,840

Res. J. Pharm., Biol. Chem. Sci. 6 -

Shock 1 3,045

Steroids 1 2,716

Tetrahedron 1 2,641

Ticks Tick-Borne Dis. 1 2,878

Tetrahedron 1 2,641

Transpl. Int. 1 2,599

Trends Pharmacol. Sci. 1 11,539

Thromb. Haemost. 1 4,984

Vaccine 1 3,624

Vector-Borne Zoonotic Dis. 1 2,531

Virus Res. 2 2,324

Virology 1 3,321

Page 6: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Personnel ayant participé à la recherche en 2014

Faculté de Pharmacie

Enseignants-chercheurs 62 (+1AHU + 3PAST)

Chercheurs statutaires 42

Personnel non statutaire 101

ITA & IATOS 39

TOTAL 248

(dont 76 HDR)

Le personnel non statutaire comprend :

- les doctorants, à l’exception des Masters (les doctorants en cotutelle sont

pris en compte à raison de 50 %)

- les internes et les praticiens hospitaliers

- les personnels sur contrats temporaires (y compris ATER).

Page 7: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Publications de la Faculté de Pharmacie

CLASSEMENT DES REVUES ET DES PUBLICATIONS

(Faculté de Pharmacie)

2014

(nombre total : 164 publications, dont 141 classées)

Facteur d’impact >10 5 à 10 2 à 5 1 à 2 <1 non

classées

Nbre de Journaux 7 26 60 8 1 14

Nbre de Publications 10 39 81 9 2 23

% des publications

figurant dans le Journal

Citation Reports

6,1 23,78 49,39 5,49 1,22 14,02

Page 8: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

THESES SOUTENUES (FACULTE DE PHARMACIE)

Laboratoires 2014

Laboratoire de Conception et d’Application des Molécules

Bioactives (UMR 7199) 9

Laboratoire d’Innovation Thérapeutique (UMR 7200) 3

Laboratoire de Biophotonique et Pharmacologie (UMR 7213) 3

Borreliose de Lyme (EA 7290) -

Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien, Département des

Sciences Analytiques, Equipe de chimie analytique des

molécules bioactives (UMR 7178 – LC4)

-

Centre des études internationales et européennes EA 3994

(Activité J-Y. Pabst) -

NOMBRE TOTAL 15

Page 9: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Laboratoire de Conception et Application de Molécules Bioactives

UMR 7199 CNRS-UdS

Domaine de

recherche

Chimie et Sciences de la vie et de la santé

Directeur Jean-Serge Rémy

74, route du Rhin - B.P. 60024 - 67401 Illkirch Cedex

Tél. 03 68 85 41 17 - Fax. 03 68 85 43 06 – Email : [email protected]

Site web http://bioorga.u-strasbg.fr

Mot-clés Chimie bioorganique, synthèse chimique, nanotechnologies, biochimie, biogalénique, vectorisation,

photobiologie.

Équipes

BIOVECTOROLOGIE Responsable : Dr. Benoît Frisch

Tél : 03.68.85.41.68 ; E-mail : [email protected]

Thèmes de recherche :

- VACCINS SYNTHETIQUES L’objectif de ce projet est de développer des vaccins synthétiques

prophylactiques ou thérapeutiques dirigés contre une bactérie, un virus ou une tumeur. Ce projet est

basé sur l’utilisation de systèmes nanoparticulaires, notamment de liposomes, comme vecteurs des

éléments indispensables à l’induction d’une réponse immunitaire forte et spécifique. Nous développons

différentes techniques de chimie de bioconjugaison de ces éléments au vecteur. Nous réalisons la

synthèse (adjuvants et molécules de ciblage), la mise au point, la caractérisation et l’évaluation in vitro

et in vivo des différents vecteurs nanoparticulaires formulés

- CHIMIE DES POLYMERES / BIOMATERIAUX Nous utilisons toutes les techniques de

bioconjugaison pour modifier chimiquement différents polymères d’intérêts biologiques (polylysine,

polyglutamique acide, chitosane, hyaluronane…). Ces polymères seront utilisés pour construire des

films de polyélectrolytes auto-assemblés (par la technique de "layer-by-layer") qui vont permettre par

simple recouvrement, la modification de surfaces de biomatériaux (prothèses de types ostéo-

articulaires, dentaires, vaisseaux artificiels…), ceci afin de leur conférer des propriétés nouvelles. Une

nouvelle technique de fabrication de biomatériaux ultracentrifugés en présence de sel à base de

polymères naturels est en cours d’étude. Les premiers résultats sont extrêmement prometteurs tant du

point de vue mécanique, physico-chimique ou toxicologique. Ces nouveaux biomatériaux pourront être

utilisés comme agent de délivrance de principes actifs sous forme d’implant, de microparticules et

même de nanoparticules.

- TOXICOCINETIQUE ET TOXICO-DYNAMIQUE DES NANOPARTICULES

MANUFACTUREES Les effets nocifs des particules ultrafines associées à la pollution atmosphérique,

largement décrits au cours de dernières années, font craindre des effets indésirables des nanoparticules

manufacturées sur la santé. Nos recherches ont pour objectif de contribuer à l’élaboration de

nanoparticules optimisées en termes de toxicité. Notre expérience en expérimentation animale est mise

à profit pour étudier la biodistribution des nanoparticules marquées chez la souris. Ces études de

biodistribution sont associées à une évaluation de la toxicité (mortalité, biochimie clinique des

principaux organes, activité immunomodulatrice ou immunogène)

CHIMIE ET NEUROBIOLOGIE MOLÉCULAIRE

Responsable : Dr. Thomas Grutter

Tél : 03.68.85.41.57 ; E-mail : [email protected]

Responsable : Dr. Alexandre SPECHT

Tél : 03.68.85.41.66 ; E-mail : [email protected]

Thèmes de recherche :

- L’équipe explore les mécanismes moléculaires d’activation de canaux ioniques activés par un ligand.

En particulier, elle s’intéresse aux récepteurs P2X activés par l’ATP extracellulaire qui constituent une

famille émergente de canaux impliqués dans de grandes fonctions physiopathologiques comme les

douleurs neuropathiques. Elle crée également de nouveaux outils optogénétiques permettant d’activer

plus sélectivement ces canaux ioniques par la lumière.

Le groupe de Chimie développe des outils chimiques pour la photo-régulation d’activités biologiques.

Deux stratégies sont envisagées afin de photo-réguler une activité biologique :

- Soit en utilisant une réaction de photo-isomérisation permettant de photo-réguler une interaction ligand-

récepteur.

- Soit en utilisant une réaction de photo-clivage permettant de libérer de façon contrôler un effecteur

biologique sous l’action de la lumière. L’utilisation d’une réaction de photo-clivage est un concept pour

lequel le principal enjeu scientifique actuel réside dans l’utilisation d’une excitation à 2-photon. Ce type

d’excitations permet de palier au problème de résolution spatial qu’engendre l’utilisation classique

Page 10: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

d’une excitation mono-photonique lors de la photolyse et permet de plus, d’envisager une utilisation sur

des tissus ou des organisme vivant du faite d’une plus grande pénétration tissulaire.

VECTEURS : SYNTHESE ET APPLICATIONS THERAPEUTIQUES (V-SAT) Responsable : Dr. Antoine Kichler

Tél : 03.68.85.41.76; E-mail : [email protected]

Thèmes de recherche :

- Transfert de gènes dans les cellules animales : développement de nouveaux vecteurs (nano-micelles

cationiques, dérivés cationiques de fullerènes-hexakis, dendrimères cationiques), galénique supramoléculaire.

- Correction génique par l’intermédiaire d’oligonucléotides modifiés ; oligonucléotides cationiques

(antisens, saut d’exon, ARN interférence).

- Vectorisation d’oligonucléotides.

- Synthèse d’amphiphiles fluorés à propriétés d'auto-assemblage originales, développement de vecteurs

pour la délivrance de principes actifs.

- Synthèse de sondes fluorescentes.

- Chimie des composés organo-phosphorés : méthodologie de synthèse (synthèse et réactivité des

chalcogéno-phosphonates et boranophosphonates), synthèse d'analogues stables de dinucléosides

polyphosphates.

PHARMACIE BIOGALÉNIQUE Responsable : Prof. Thierry Vandamme

Tél : 03.68.85.41.06 ; E-mail : [email protected]

Thèmes de recherche :

- Microencapsulation pour la prédiction de la pharmacocinétique de nouveaux principes actifs ;

développement de nanoémulsions pour l’imagerie médicale, synthèse de nouveaux polymères pour des

applications biomédicales.

SYSTÈMES CHIMIQUES FONCTIONNELS Responsable : Dr. Alain Wagner

Tél : 03.68.85.42.97 ; E-mail : [email protected]

Thèmes de recherche :

- Conception et synthèse des molécules outils pour l’étude de systèmes chimiques et biologiques complexes

(développement de chimie bioorthogonale; déconvolution de cibles; systèmes moléculaires pour le

diagnostic, la vectorisation et l’imagerie médicale; développement d’outils moléculaires pour l’étude de

mécanismes biologiques et chimiques; nouvelles approches thérapeutiques; développement d’outils

analytiques et chémo-informatiques pour l’étude et la modélisation de réactions chimiques complexes).

Nombre de thèses de doctorat soutenues en 2014 : 9

Composition des équipes

SERVICES COMMUNS HAMMERSCHMITT Nathalie AI CNRS

WEHRUNG Patrick IR 1 CNRS

BIOVECTOROLOGIE FRISCH Benoît DR 2 CNRS

BOUREL Line PR 2 Unistra

PONS Françoise PR 2 Unistra

FOURNEL Sylvie PR 2 Unistra

CASSET Anne MCU Unistra

DEGIORGI Marcella MCU Unistra

HEURTAULT Béatrice MCU Unistra

SPANEDDA Maria Vittoria MCU Unistra

SEGUIN Cendrine IE CNRS

KAKHI Zahra ATER

JACOBERGER Célia Doctorante

SALIBA Hannadi Doctorante

CHIMIE ET NEUROBIOLOGIE

MOLÉCULAIRE GRUTTER Thomas DR 2 CNRS

SPECHT Alexandre CR 1 CNRS

GOELDNER Maurice Em. Unistra

NICOUD Jean-François. Em. Unistra

BOLZE Frédéric MCU Unistra

HABERMACHER Chloé Doctorante

HARKAT Mahboubi Doctorant

PIANT Sébastien Doctorante

BARTHOLO Jean-François Doctorant

PEVERINI Laurie Doctorant

GOEGAN Bastien Doctorant

MARTZ Adeline AI CNRS

HANSS David Post-doctorant

LEMOINE Damien Post-doctorant

Page 11: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

VECTEURS : SYNTHESE ET APPLICATIONS

THERAPEUTIQUES (V-SAT) KICHLER Antoine DR 2 CNRS

REMY Jean-Serge DR2 CNRS

LEBEAU Luc DR1 CNRS

KOTERA Mitsuharu DR 2 CNRS

ZUBER Guy CR1 CNRS

NOTHISSEN Marc AI CNRS

NEUBERG Post-doctorant

RIPOLL Manon Doctorante

EL SHAFEY Nelly Doctorante

KERESELIDZE Dimitri Technicien CDD

PHARMACIE BIOGALÉNIQUE

VANDAMME Thierry PR 1 Unistra

ANTON Nicolas MCU Unistra

CHIPER Manuela MCU Unistra

LI Xiang ATER

ATTIA Mohamed Fatty Doctorant

NGUYEN Thi Trinh Lan Doctorante

WALLYN Justine M2/Doctorante

DUCREUX Naïg Licence Pro

Li Juan M2

DIOUF Stagiaire

SYSTÈMES CHIMIQUES FONCTIONNELS WAGNER Alain DR 1 CNRS

MULLER-STEFFNER Hélène CR 1 CNRS

KUHN Isabelle IE CNRS

MOSSER Michel TCN CNRS

LANG Jessica TCN UNISTRA

RECHER Marion Doctorante

COCKENPOT Héloïse (statut IE) Doctorante

DOVGAN Igor Doctorant

THOMAS Eric Doctorant

ZOLJARGAL Baatarkhuu Doctorante

PFLIMLIN Elsa Post-octorante

KING Mathias Post-doctorant

KOLODYCH Sergii Post-doctorant

JACQUES Sylvain Post-doctorant

BAEHR Corinne Post-doctorante

NEUBERG Patrick Post-doctorant

EBEROVA Jitka Post-doctorant

ERSUEGUY Sylvain Post-doctorant

NICOU Laura Stagiaire

Responsible BAATI Rachid DR2 CNRS

DE SOUSA Julien Doctorant

Page 12: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Production scientifique

I – Articles dans des revues avec comité de lecture

• Anton, N. and Vandamme, T. Nanotechnology for Computed Tomography: A Real Potential Recently

Disclosed. Pharm. Res. 2014, 31, 20-34.

• Attia, M.F.; Anton, N.; Chiper, M.; Akasov, R.; Anton, H.; Messaddeq, N.; Fournel, S.; Klymchenko,

AS.; Mély, Y.; Vandamme, T.F. Biodistribution of X-ray iodinated contrast agent in nanoemulsions is

controlled by the chemical nature of the oily core. ACS Nano 2014, 8, 10537-10550.

• Bevilacqua, V. ; King, M. ; Chaumontet, M. ; Nothisen, M. ; Gabillet, S. ; Buisson, D. ; Puente, C. ;

Wagner, A. ; Taran, F. Copper-chelating azides for efficient click conjugation reactions in complex

media. Angew Chem Int Ed Engl. 2014, 53, 5872-5876.

• Egloff, C.; Jacques, S.A.; Nothisen, M.; Weltin, D.; Calligaro, C.; Mosser, M.; Remy, J-S. ; Wagner,

A. Bio-specific and bio-orthogonal chemistries to switch-off the quencher of a FRET-based fluorescent

probe: application to living-cell biothiol imaging. Chem. Commun. 2014, 50(70):10049-51.

• Fend, L.; Gatard-Scheikl, T.; Kintz, J.; Gantzer, M.; Cochin, S.; Fournel, S.; Préville, X. Intravenous

injection of MVA virus targets CD8+ lymphocyte to tumors to control tumor growth upon

combinatorial treatment with a TLR9 agonist. Cancer Immunol. Res. 2014, 2, 1163-74.

• Garcia-Fernández, L.; Herbivo, C.; San Miguel Arranz, V.; Warther, D.; Donato, L.; Specht, A.; del

Campo, A. Dual Photosensitive Polymers with Wavelength-Selective Photoresponse, Adv. Mater.,

2014, 26, 5012–5017.

• Garcia-Fernández, L., Specht, A., del Campo A. A Polyurethane-Based Positive Photoresist,

Macromol. Rapid Commun. 2014, 35 (20), 1801–1807.

• Heurtault, B.; Reix, N.; Meyer, N.; Gasser, F.; Wendling, MJ.; Ratomponirina, C.; Jeandidier, N.;

Sapin, R.; Agin, A. Extensive study of human insulin immunoassays: promises and pitfalls for insulin

analogue deterction and quantification. Clin Chem Lab Med. 2014, 52, 355-362.

• Jakhmola, A.; Anton, N.; Anton, H.; Messaddeq, N.; Hallouard, F.; Klymchenko, A.; Mely, Y.;

Vandamme, T.F. Poly-ε-caprolactone tungsten oxide nanoparticles as a contrast agent for X-ray

computed tomography. Biomaterials 2014, 35 (9), 2981-2986.

• Khan, I.U.; Serra, C.A.; Anton, N.; Vandamme, T.F. Production of nanoparticle drug delivery systems

with microfluidic tools. Expert Opin. Drug Deliv. 2014, 1-16.

• Khan, I.U.; Serra, C.A.; Anton, N.; Li, X.; Akasov, R.; Messaddeq, N.; Kraus, I.; Vandamme, T.F.

Microfluidic conceived drug loaded Janus particles in side-by-side capillaries device. Int. J. Pharm.

2014, 473 (1-2), 239-249.

• Kilin, V.; Anton, H.; Anton, N.; Steed, E.; Vermot, J.; Vandamme, T.F.; Mely, Y.; Klymchenko, A.S.

Counterion-enhanced cyanine dye loading into lipid nano-droplets for single particle tracking in

zebrafish. Biomaterials 2014, Volume 35, Issue 18, Pages 4950-4957.

Page 13: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

• Koniev, O.; Leriche, G.; Nothisen, M.; Remy, J-S.; Strub, J.M.; Schaeffer-Reiss, C.; Van Dorsselaer,

A.; Baati, R.; Wagner, A. Selective irreversible chemical tagging of cysteine with 3-

arylpropiolonitriles. Bioconjugate Chem. 2014, 25, 202-6.

• King, M.; Wagner, A. Developments in the Field of Bioorthogonal Bond Forming Reactions—Past and

Present Trends. Bioconjugate Chem., 2014, 25 (5), 825–839.

• Koniev, O.; Leriche, G.; Nothisen, M.; Remy, J.S.; Strub, J.M.; Schaeffer-Reiss, C.; Van Dorsselaer,

A.; Baati, R.; Wagner, A. Selective Irreversible Chemical Tagging of Cysteine with 3-

Arylpropiolonitriles, Bioconjuate Chem., 2014, 25 (2), 202–206

• Li, X. ; Anton, N. ; Zuber, G. ; Vandamme, T. Contrast agents for preclinical targeted X-ray imaging.

Adv. Drug Deliv. Rev. 2014, 76, 116-1 33.

• Macho-Fernandez, E.; Cruz, L. J.; Ghinnagow, R.; Fontaine, J.; Bialecki, E. Frisch, B. ; Trottein, F.;

Faveeuw, C., Targeted delivery of alpha-galactosylceramide to CD8alpha+ dendritic cells optimizes

type I NKT cell-based antitumor responses. J. Immunol. 2014, 193, 961.

• Mahindhoratep, S.; Bouda, H.A.; El Shafey, N.; Scherman, D.; Kichler, A.; Pichon, C.; Midoux, P.;

Mignet, N.; Bureau, M.F. NF-kB related transgene expression in mouse tibial cranial muscle after

pDNA injection followed or not by electrotransfer. Biochim. Biophys. Acta. 2014, 1840, 3257-3263.

• Nguyen, P.N.; Veschgini, M.; Tanaka, M.; Waton, G.; Vandamme, T.F.; Krafft, M.P. Counteracting

the inhibitory effect of proteins towards lung surfactant substitutes : a fluorocarbon gas helps displace

albumin at the air/water interface. Chem. Commun. 2014,50, 11576-11579.

• Pinel, S. ; Aman, E. ; Erblang, F. ; Dietrich, J. ; Frisch, B. ; Sirman, J. ; Kichler, A. ; Sibler, A. P. ;

Dontenwill, M. ; Schaffner, F. ; Zuber, G., Quantitative measurement of delivery and gene silencing

activities of siRNA polyplexes containing pyridylthiourea-grafted polyethylenimines. J. Control. Rel.,

2014, 182, 1-12.

• Plougastel, L. ; Koniev, O. ; Specklin, S. ; Decuypere, E. ; Créminon, C. ; Buisson, D. ; Wagner, A. ;

Kolodych, S. ; Taran, F. 4-Halogeno-Sydnones for Fast Strain Promoted Cycloaddition with

Cyclooctynes. Chem. Commun. 2014, 50, 9376-9378.

• Postupalenko, V.; Sibler, A.-P.; Desplancq, D.; Nominé, Y.; Spehner, D.; Schultz, P.; Weiss, E.; Zuber,

G. Intracellular delivery of functionally active proteins using self-assembling pyridylthiourea-

polyethylenimine. J. Control. Rel. 2014, 178, 86-94.

• Reisch, A. ; Roger, E. ; Phoeung, T. ; Antheaume, C. ; Orthlieb, C. ; Boulmedais, F. ; Lavalle, P. ;

Schlenoff, J. B. ; Frisch, B. ; Schaaf, P., On the Benefits of Rubbing Salt in the Cut : Self-Healing of

Saloplastic PAA/PAH Compact Polyelectrolyte Complexes. Adv. Mater. 2014, 26, 2547.

• Ronzani C.; Casset, A.; Pons, F. Exposure to multi-walled carbon nanotubes results in aggravation of

airway inflammation and remodeling and in increased production of epithelium-derived innate

cytokines in a mouse model of asthma. Arch Toxicol. 2014, 88, 489-499.

• Supper, S.; Anton, N.; Boisclair, J.; Seidel, N.; Riemenschnitter, M.; Curdy, C.; Vandamme, T.F.

Chitosan / Glucose 1-phosphate as new stable in situ forming depot system for controlled drug delivery

Eur. J. Pharm. Biopharm. 2014, Volume 88, Issue 2, October 2014, Pages 361–373.

Page 14: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

• Supper, S.; Anton, N.; Seidel, N.; Riemenschnitter, M.; Curdy, C.; Vandamme, T.F. Thermosensitive

chitosan/glycerophosphate-based hydrogel and its derivatives in pharmaceutical and biomedical

applications. Expert Opin. Drug Deliv. 2014, 11 (2), 249-267.

• Vandamme, T.F.; Anton, N.; Torchilin, V. Targeted Imaging. Adv. Drug Deliv. Rev. 2014, Volume 76,

30 September 2014, Pages 1.

• Vandamme, T.F. Use of rodents as models of human diseases. J. Pharm. Bioall. Sci. 2014, 6, 2-9.

• Vandamme, T.F. New oral anthelmintic intraruminal delivery device for cattle. J. Pharm. Bioall. Sci.

2014, 6, 31-37.

CLASSEMENT DES REVUES ET DES PUBLICATIONS

2014

(nombre total : 29 publications, dont 26 classées)

Facteur d’impact >10 5 à 10 2 à 5 1 à 2 <1 non

classées

Nbre de Journaux 4 5 8 - - 2

Nbre de Publications 6 9 11 - - 3

% des publications

figurant dans le Journal

Citation Reports

20,69 31,03 37,93 - - 10,34

II – ARTICLES DANS DES REVUES SANS COMITE DE LECTURE

Néant.

III – BREVETS

• 3-aryl propiolonitrile compounds for thiol labeling

Déposé le 4 juillet 2013 en Europe et le 4 juillet 2014 à l’international.

Numéro de la demande internationale : PCT/EP2014/064387

Inventeurs : Oleksandr Koniev, Alain Wagner

• Sydnone derivatives for conjugation of compounds of interest

Déposé le 16 mai 2014, en Europe. Numéro de la demande : EP 14 305 726.3

Inventeurs : Sergii Kolodych, Oleksandr Koniev, Frédéric Taran, Alain Wagner.

Page 15: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

• Iminosydnone derivatives for conjugation and release of compounds of interest

Déposé le 18 juin 2014, en Europe. Numéro de la demande : EP 14 305 933.5

Inventeurs : Sergii Kolodych, Oleksandr Koniev, Frédéric Taran, Alain Wagner.

IV – COMMUNICATIONS AVEC ACTES

Internationales

• Zuber, G. Tailored polymers for cytosolic delivery of proteins, 2nd antibody and protein therapeutic.

Boston, MA, Etats-Unis, Oct 23-24, 2014.

• Piant, S.; Gug, S.; Warther, D.; Donato, L.; Specht, A.; Goeldner, M.; Nicoud., J-F.; Zemelman, B.;

Loszoncy, A.; Bolze, F. Two photon sensitive photolabile protecting groups: From molecular

engineering to nanostructuration (26-30/04/2014, BIOMED meeting, Miami, USA, oral).

• Habermacher, C.; Lemoine, D.; Martz, A.; Specht, A.; Grutter, T. « Optical dissection of gating in P2X

receptors » (Purine 2014, Bonn, Allemagne, 23/07/2014 au 27/07/2014).

• Lemoine, D.; Habermacher, C.; Martz, A.; Méry, P.-F.; Bertaso, F.; Diverchy, F.; Taly, A.;

Rassendren, F.; Specht, A.; Grutter, T « Optogating: a powerful approach to control an ion-channel

gate » (Purine 2014, Bonn, Allemagne, 23/07/2014 au 27/07/2014).

• Anton, N.; Attia, M.F.; Li, X.; Vandamme T. Nano-emulsions for biomedical imaging. CRS meeting,

14-17 July, Chicago, USA.

Nationales

• Piant, S. ; Specht, A. ; Bolze, F. Nano-strucuration de groupements photolabiles sensibles à

l’irradiation biphotonique (23-27/03/2014. RECOB 15, Aussois, France, Affiche).

• Specht, A. Outils Chimiques pour la photorégulation d’activités biologiques (4-10/10/2014, MIFOBIO

2014, Seignosse, France, oral).

V – COMMUNICATIONS SANS ACTES

• Majdoul, S.; Seye, A.K.; Ingrao, D.; Holic, N.; Vermeer, L.; Kichler, A.; Bechinger, B.; Galy, A.;

Fenard, D. Study of the family of Vectofusin® transduction enhancers. SFTCG, Toulouse, 24-26 mars

2014. (Poster)

• Schartner, V.; Leborgne, C.; Kichler, A. Efficient DNA and siRNA Transfection Mediated by a proline

mutant of the C-Terminal Domain of HIV Viral Protein R. Les journées du Campus d’Illkirch 2014. 7-

8 avril 2014, Illkirch. (Poster)

• Majdoul, S.; Biton, S.; Seye, A.K.; Holic, N.; Vermeer, L.; Kichler, A.; Bechinger, B.; Galy, A.;

Fenard, D. Structure function studies of Vectofusin® transduction enhancers. 17th annual meeting

ASGT. Washington, DC, May 21-24, 2014. (Poster)

• Majdoul, S.; Biton, S.; Seye, A.K.; Holic, N.; Vermeer, L.; Kichler, A.; Bechinger, B.; Galy, A.;

Fenard, D. Structure function studies of Vectofusin lentiviral transduction enhancers in human

hematopoietic stem/progenitor cells. ESGCT, 23-26 octobre 2014, La Hague, Pays-Bas. Poster

• Gossart, J.B.; Meyer, F.; Kichler, A.; Frisch, B.; Robinet, E.; Zuber, G. Investigation of PEI for siRNA-

based hepatic cancer therapy. 8ième Forum du Cancéropôle du Grand Est, 14-15 novembre 2014,

Strasbourg. Communication orale.

• Pierrat, P.; Kereselidze, D.; Lux, M.; Pons, F.; Lebeau, L. New cationic phospholipid-detergent

conjugates for nucleic acid delivery to the lung. Journées du Campus d'Illkirch 2014, Illkirch, 7-

8/04/2014.

Page 16: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

• Piant, S. ; Specht, A. ; Bolze, F. Nanostructuration of two photons phototrigger (7-8/04/2014, Journée

Campus Illkirch, France, Affiche).

• Habermacher, C. ; Lemoine, D. ; Martz, A. ; Specht, A. ; et Grutter, T. « Using azobenzene-containing

derivatives to study ion channel gating » Journées Campus Illkirch 07 – 08 avril 2014.

• Fend, L.; Gatard-Scheikl, T.; Kintz, J.; Gantzer, M.; Schaedler, E.; Rittner, K.; Cochin, S.; Fournel, S.;

and Préville, X. Intravenous injection of MVA virus targets CD8+ T lymphocytes to tumors to control

tumor growth upon combinatorial tretmet with à TLR9 agonist. Annual Meeting of the French Society

for Immunology, 4-6 November 2014, Lilles, France. (Présentation orale)

• Fend, L.; Gatard-Scheikl, T.; Kintz, J.; Gantzer, M.; Schaedler, E.; Rittner, K.; Cochin, S.; Fournel, S.;

and Préville, X. Intravenous injection of a Modified Vaccinia Ankara virus induces intratumoral CD8+

lymphocyte infiltration favoring tumor control in an orthotopic tumor model upon combinatorial

treatment with a TLR9 agonist. Society for immunotherapy of cancer (SITC), 29th Annual Meeting,

November 7-9, 2014, Washington (Poster).

• Wagner, A. Gyf LFCS – Gif / 24-10-2013 Using synthetic chemistry to form and break chemical bonds

in complex or living biological systems.

• Wagner, A. Grenoble 16-01-2014 Using synthetic chemistry to form and break chemical bonds in

complex or living biological systems.

• Wagner, A. Strasbourg ECPM Journée industrielle 17-04-2014 - La chimie organique: une discipline

propice à la valorisation.

• Wagner, A. Paris - Journée Chimie Bio CNRS 6 Juin 2014 - Breaking new ground in the fields of in

cell and in vivo synthetic chemistry.

• Wagner, A. Southampton, Univ. of Southampton – 16 Septembre 2014 - Tribulations of an academic

researcher trying to create start-ups.

• Wagner, A. Paris - ENS – 29 Septembre 2014 - Bioconjugation: A playground for organic chemists.

• Wagner, A. Paris - IPSEN – 23 Octobre 2014 Bioconjugation: A playground for organic chemists or a

fertile ground for pharma innovation ?

VI – CONFERENCES INVITEES

• Lebeau, L. Lipides ionisables pour le développement de vecteurs à ciblage actif pH-contrôlé: vers des

outils pour la délivrance spécifique d'antitumoraux dans les tissus cancéreux. 15ème Journée

Scientifique de la Ligue Régionale contre le Cancer, IGBMC, Illkirch, 03/12/2014.

• Zuber, G. Hydrophobic PEIs for cytosolic delivery of oligonucleotides and proteins. Monsanto, Saint

Louis, MO, Etats-Unis, Oct 16th, 2014

• Zuber, G. Tailored polymers for cytosolic delivery of oligonucleotides and proteins. MNPC Seminar

Series, College of Pharmacy, University of Iowa, Etats-Unis, Oct 22nd, 2014.

• Grutter, T. « Engineering Light-gated P2X Receptors». (20/03/2014, Institut Pasteur, Paris, France).

• Grutter, T. « Engineering Light-gated P2X Receptors ». (14/05/2014, Institut de Biologie Structurale,

Grenoble, France).

• Grutter, T. « Engineering Light-gated P2X Receptors ». (18/06/2014, Université de Lausanne,

Lausanne, Suisse).

• Grutter, T. « Opening of the P2X ion channel with light » (23-27/07/2014, Purine 2014 : Adenine

Nucleosides and Nucleotides in Biomedecine, Bonn, Allemagne).

• Grutter, T. « Casting light on the gating mechanism of P2X receptors » (18-20/09/2014, SPS

Conference on Molecular Approaches to Membrane Transport, Sigtuna, Suède)

• Grutter, T. « Engineering Light-gated P2X Receptors ». (01/10/2014, Institut de Biologie Valrose,

Nice, France)

• Grutter, T. « Coup de projecteur sur les récepteurs P2X ». (17/10/2014, UGSF, Lille, France)

• Grutter, T. « On the gating mechanism of P2X receptors». (20/10/2014, Cycle de conférences sur les

projets interdisciplinaires IdEX-CNRS, Strasbourg, France)

• Grutter, T. « Casting light on the gating mechanism of P2X receptors » (18/11/2014, Aachen

Page 17: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

University, Aachen, Allemagne)

• Specht, A. Outils photochimiques pour l’étude dynamique de phénomènes biologiques (12/06/2014,

Séminaire UMR 6014 COBRA, Université de Rouen, France, séminaire).

• Bourel, L. Chimie pour la Santé: Rencontres et Opportunités. 19 Juin 2014, Ecole Nationale Supérieure

de Chimie de Mulhouse.

• Frisch, B. « Les nanotechnologies: les nanoparticules appliquées à l’oncologie » le 3 avril 2014 à

l’assemblée générale du Crédit mutuel pour la santé au centre de conférence de l’Aar Schiltigheim.

• Frisch, B. « Les saloplastiques : nouveaux biomatériaux ? » le 15-16 Octobre 2014 à Saint-Etienne au

1ère Rencontre Ingénierie pour la Santé (RIS 2014)

VII – OUVRAGES SCIENTIFIQUES (OU CHAPITRES)

• Anton, N.; Vandamme, T. Handbook of Nanoparticles, Chapter: Nano-emulsions, Springer. Mahmood

Aliofkhazraei (Ed.) 2014. ISBN: 978-3-319-13188-7.

VIII – OUVRAGES DE VULGARISATION (OU CHAPITRES)

- Néant

IX – DIRECTION D’OUVRAGES

- Néant

X – AUTRES PUBLICATIONS

• Antoine Kichler et Benoît Frisch. Des bulles de CO2 pour conférer de nouvelles propriétés à des

systèmes de délivrance. Synthèse annuelle de l'OMNT (Observatoire des Micro & NanoTechnologies)

: Avancées, tendances et perspectives, Février 2014, Page 236.

• Kichler, A. et Frisch, B. A new nanoparticle-based glue for gel or tissue assembly. Publications de

l'OMNT Nanomédecine 14, Mars 2014 (Nanomed03−14−3)

• Kichler, A. et Frisch, B. PEG coating improves brain penetration of nanoparticles. Publications de

l'OMNT Nanomédecine 14, Mars 2014 (Nanomed03−14−8)

• Kichler, A. et Frisch, B. Liposome-based oligosaccharide vaccines. Publications OMNT

Nanomédecine 15, Juin 2014 (Nanomed06−14−1).

• Kichler A. et Benoît Frisch, B. Solubilization of nanoparticles by catechol−polyethyleneglycol ligand.

Publications de l'OMNT Nanomédecine 12, Septembre 2013 (Nanomed09−13−4).

• Kichler, A. et Frisch, B. Hyaluronan coating improves tumor targeting of PEG. Publications de

l'OMNT Nanomédecine. Novembre 2014

• Specht, A. Communiqué de presse du CNRS. Structuration micrométrique et tridimensionnelle de

polymères par excitation lumineuse (04/2014).

http://www.cnrs.fr/inc/communication/direct_labos/specht.htm

• Grutter, T. Communiqué de presse du CNRS « 2013, une année avec le CNRS » (06/2014).

• Grutter, T. Specht, A. « Des neurones photosensibles ». L’actu (11/2014).

XI – Autres activités internationales (séminaires, communications et posters internationaux)

• Kakhi, Z.; Pons, F.; Ittel, M.; Frisch, B.; Heurtault, B. XXVIth GTRV Scientific Meeting: intranasal

immunization with a liposomal vaccine prevents the development of lung tumor in mice (décembre

2011, Bruxelles, Belgique).

Page 18: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

• Reix, N.; Heurtault, B.; Gasser, F.; Agin, A. 35th Annual Meeting of the European thyroid

Association: functional sensitivity of the ADVIA Centaur system TSH3-UL assay: from initial

assessment to routine follow-up (septembre 2011, Cracovie, Pologne).

• Spanedda, M.V.; Heurtault, B.; Thomann, J.S.; Monneaux, F.; Creusat, G.; Fournel, S.; Bourel-Bonnet,

L.; Frisch B. 46e International Conferences on Medicinal Chemistry: Synthesis of a series of new

immunoadjuvants to be part of anticancer vaccines cocktails ( juillet 2011, Lyon, poster).

XII – Valorisation (contrats de recherche, partenariats industriels, creations d’entreprises, brevets, information et diffusion scientifique)

Contrats de recherche

• Ligue contre le cancer: Développement de nouveaux vecteurs pH-sensibles pour le ciblage de tissus

tumoraux.

• FRM chimie pour la médecine: Inhibiteurs du facteur de transcription Lim1, un nouvel oncogène dans

le cancer du rein humain, par une approche supramoléculaire nanométrique

• Association Française contre les Myopathies (AFM): Evaluation of the anti-myostatin activity of

peptides deriving from the Small Leucine Rich Proteoglycan family.

• Satt Conectus Alsace: Polymeric NanoDelivery System for siRNA-mediated therapy of

hepatocarcinoma via systemic administration

• Labex Medalis

• La Ligue contre le Cancer (CCIR-GE, 2014): Développement de vecteurs pH-sensibles pour le ciblage

de tissus tumoraux.

• Vaincre la Mucoviscidose/Association Gregory Lemarchal: Phospholipides membranaires modifiés

pour la thérapie génique et applications à la transfection pulmonaire.

• Specht, A. (coordinateur): Contrat ANR JC SVSE5 (2014-2017)

• Grutter, T. (coordinateur): ANR défi « Santé et bien-être » (2014-2018).

• Wagner, A.: ANR "Défi de toute les savoir" (2014-2018)

• ICFRC Project MetabolomiX

• Bourse de thèse Région Alsace-Medalis: new methods toward molecularly defined Antibody-Drug-

Conjugates

Partenariat(s) industriel(s)

• Création(s) d'entreprise(s)

• Syndivia SAS – Created March 2014

Création d’entreprise

- Néant.

XIII - Formation permanente

• Sylvie Fournel

-Participation au Master en Formation continue SACEB (Chimie Biologie Aspects Analytiques)

-"Immunologie aujoud'hui" (12h)

Page 19: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

-"Initiation à la cytométrie en flux" (20h)

-"Immunologie cellulaire et Moléculaire Approfondie" (environ 12h)

Actualisation des connaissances en immunologie (3h),

• Benoît Frisch

-Nouvelles approches de la biogalénique (7h)

• Pons F.

-Modèles expérimentaux animaux des maladies inflammatoires chroniques des voies aériennes.

(Université de Strasbourg, Service de Formation Continue).

• Vandamme T.

-Pharmacotechnie des fortmes solides (25h)

-Pharmacotechnie des formes liquides et semi-solides(25h)

-Formulation des médicaments (25h)

XIV - Organisation de congrès

• Grutter ; T. Président du 25ème Colloque Canaux ioniques en 2014, Oléron, France.

• Specht ; A. Comité d’organisation RECOB15, Aussois, France.

• Bolze ; F. Comité d’organisation MIFOBIO2015, Seignosse, France.

• Sylvie Fournel :

• Membre du comité d'organisation du cours annuel de la Société Française d'Immunologie, Obernay

• Benoît Frisch :

-1ère école d’été SFNano «workshop on tools and models for translation of advanced drug delivery

systems » à Porto Portugal du 2 au 4 octobre 2014. Membre du bureau et du comité d’organisation

(trésorier adjoint).

-SFNano I (Société Française de Nanomédecine) à Nancy du 9 au 12 décembre 2014. Membre du bureau

et du comité d’organisation (trésorier adjoint).

XV - Thèses soutenues

• Nelly El Shafey : soutenance le 05/11/2014 (Etudiante en thèse dans l’UMR 8258 CNRS – UMR-S 1022

Inserm à Paris mais encadré à 50% par AK).

• Jean-François Bartolo: date de soutenance 22 sept. 2014. Directrice de thèse : V. Taly (CNRS, UMRS-1147,

Paris) ; Co-Directeur : A. Specht

• Zahra Kakhi, 25/09/14

• Fend Laetitia, 29/07/14

• Chekkat Neila, 08/12/14

• Oleksander Koniev 09/2014

• Marion Recher 10/2014

• Ikram Ullah Khan 11/2014

• Branko Z. Vranic 12/2014

XVI - HDR soutenues

- Néant

XVII - Distinctions

• Grutter, T.; Specht A. Prix La recherche 2014, catégorie chimie.

Page 20: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

UMR7200

Laboratoire d’Innovation Thérapeutique

Directeur : Marcel HIBERT

Directeur-Adjoint : Didier ROGNAN

Secrétariat/Gestion

Marianne ERHART TCS CNRS (60 %) Françoise HERTH AI CNRS

Chimie–Biologie Intégrative (Responsables M. Hibert/N. Frossard)

Frédéric BIHEL CR1 CNRS

Dominique BONNET CR1 CNRS

Jean-Jacques BOURGUIGNON DR2 CNRS (émérite)

Mélanie BOURJOT MCU (septembre 2014)

Nelly FROSSARD DR2 INSERM

Jacques HAIECH PRCE

Denis HEISSLER DR2 CNRS

Marcel HIBERT PRCE

Marie-Claude KILHOFFER PR1

Martine SCHMITT CR1 CNRS

Nassera TOUNSI MCU

Catherine VONTHRON MCU

Maria ZENIOU-MEYER MCU

Stéphanie RICHÉ TCN CNRS

Séverine SCHNEIDER TCN CNRS

Pedro AQUINO Bourse Brésil (Sciences sans Fontière) (sept 2014-juilllet 2015)

Etienne BERNER M2 (avril – septembre 2014)

Joël Birgé Stagiaire Pharma (mars – sept 2014)

Emilie BLAISE Doctorante Cifre Prestwick (2011 – 2014)

Maud BOLLENBACH Doctorante (Contrat doctoral Unistra) (2013 – 2016)

Jacques BRICARD IE CDD Medalis (mai 2013 – octobre 2014)

Estelle CAUDERLIER M2 (février – juillet 2014)

Wanyin CHEN Doctorante Ligue (oct 2013 – sept 2016)

Laetitia CHEZEAU M2 (janv – mai 2014)

François DAUBEUF Post Doctorant SATT (- octobre 2015)

Jihu DONG Doctorant (Contrat JH) (2011 – 2015)

Hussein FTOUNI Chercheur (Contrat CNRS Interreg/Uds) (- déc 2014)

Jean-Baptiste GALLE Doctorant (Contrat Doctoral Unistra) (2012 – 2015)

François Hallé Doctorant (Contrat Doctoral Unistra) (2012 – 2015)

Iuliia KARPENKO Doctorante (Contrat Doctoral Unistra) (2011– oct 2014)

Mariia KLIACHYNA Post Doctorante Medalis (sept 2013 – octobre 2014)

Christine LEHALLE AI CDD SATT (- mai 2015)

Alicia MICHEL M2 (janv – mai 2014)

Page 21: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Flore NARDELLA Doctorante (Interne des HUS) (2012 - 2016)

Manuel NEVES Chercheur-Ingénieur CDI Industrie (ABScience)

Songlin NIU Post-doc ARC Epstein-Barr (avril 2013 – mars 2015)

Pierre REGENASS Doctorant (Contrat Doctoral Unistra) (2012 – 2015)

Samila SIAVOSHIAN-JEAY Chercheur-Ingénieur CDI Industrie (ABScience)

Patrick WAGNER IE CDD Medalis (- mai 2015)

Xiaomeng WANG M2 (févr – juillet 2014)

Synthèse organique métallocatalysée et Pharmacochimie (Responsable J. Suffert) Gaëlle BLOND CR1 CNRS

Laurent DESAUBRY DR2 CNRS

Morgan DONNARD CR2 CNRS

Nicolas GIRARD MCU

Mihaela GULEA CR1 CNRS

Jean SUFFERT DR1 CNRS

Angèle SCHOENFELDER AI CNRS

Christine BASMADJIAN Doctorante (Cifre AFR) (2011 - 2014)

Sarah BLOUIN Doctorante (contrat doctoral unistra) (2013-2016)

Thomas CASTANHEIRO Doctorant (contrat doctoral IdEx) (2013-2016)

Marine CHARAVIN Doctorante (Contrat Doctoral Région) (octobre 2014)

Amel DJEHAL M2 (mai – juillet 2014)

Jessie JOUSSOT Doctorante (Cifre P. Fabre) (-mars 2015)

Nail McLOUGHLIN Stagiaire ERASMUS (sept-nov. 2014)

Fan ZHANG M2 (janv – juin 2014)

Qian ZHAO Doctorante CIFRE AFR(2013 – 2016)

Chémogénomique Structurale (Responsable D. Rognan) Guillaume BRET IE CNRS

Esther KELLENBERGER MCU

Clarisse MAECHLING MCU

Didier ROGNAN DR1 CNRS

Stéphane AZOULAY Doctorant (Contrat Doctoral Unistra) (2013 – 2016)

Elliot CHRIST M2 (janv – juin 2014)

Franck DA SILVA Contrat Doctoral CNRS/Région Alsace) (2013 – 2016)

Sylvain JACQUES SERVIER (dec. 2013 – sept 2015)

Rémi PATOURET IE SATT Languedoc Roussilon (nov.2013 – nov. 2014)

Yann PHILIPSON T CDD ANR (- décembre 2015)

Noé STURM Doctorant (Univ de Griffith, Australie) (mars 2012–fév. 2016)

Jean-Thomas HEINRICH Stagiaire Pharma (sept. 2014 – janv. 2015)

Pharmacognosie (Responsable A. Lobstein) Laurence GONDET MCU

Annelise LOBSTEIN PR1

Christian MULLER CR1 CNRS

Aurélie URBAIN MCU

Page 22: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Sarah ALI AZOUAZOU Doctorante CCD Lobstein 2013-2015

Florence AUBERON Doctorante (Contrat Doctoral Unistra) (2014 – 2016)

Veronika CAKOVA Chercheur Guerlain (3 ans, janvier 2014 – déc 2016)

Fathi EMHEMMED Doctorant (Bourse Gouvern. lybien) (2011 – 2014)

Lorène GOURGUILLON Doctorante (Contrat doctoral SATT- SEPPIC -BiotechMarine)

(2014 -2017)

Amélie LEICK IE CDI détachée Industrie LOBSTEIN (Biotec Marine)

Kossi METOWOGO ATER (déc. 2013 – octobre 2014)

Michail TSOUKALAS Doctorant (contrat Doctoral Région/Fondation de UdS (2012-

2015)

Dominik

Plateforme technique Pascale BUISINE TCS CNRS (détachée au Service Commun d’Analyses)

Bruno DIDIER IR1 CNRS (50 % UMR7200 ; 50 % UMS3286)

Claire MARSOL IGR IATOS (80 % UMR7200 ; 20 % UMS3286)

Membres associés/détachés Karine ALARCON

Elisa BOMBARDA

Serge DUMONT

Yveline RIVAL

Page 23: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

ACTIVITES DE RECHERCHE

PROJET SCIENTIFIQUE GLOBAL DU LABORATOIRE

La connaissance du Vivant est une quête sans fin. La compréhension des mécanismes biologiques

élémentaires au niveau moléculaire a fait des progrès considérables mais le champ d’investigation est

encore immense. Il reste par ailleurs désormais à remonter de l’élémentaire au complexe selon une

démarche que l’on pourra vouloir ‘réductionniste’ ou ‘holistique’. Il nous semble que notre modeste

contribution à cette recherche sur le Vivant reste plus que jamais pertinente car nous souhaitons concevoir

et fournir les molécules-outils qui permettront d’explorer le Vivant dans tous ses niveaux de complexité,

de la molécule à l’animal entier, jusqu’à l’homme. Aux côtés des nouvelles techniques ‘omiques’

(génomique, protéomique, métabolomique, etc.) il nous semble en effet crucial de pouvoir perturber et

analyser tout système avec la souplesse qu’autorisent les sondes chimiques fonctionnelles. Nous garderons

donc comme projet de recherche le cap que nous nous sommes fixés depuis 15 ans, à savoir :

Rechercher et développer des petites molécules originales

permettant d’étudier le Vivant et de le soigner.

Dans quels domaines ?

Toutes nos équipes contribuent à concevoir et produire des molécules toujours plus diverses et originales,

soit synthétiques soit naturelles, afin d’élargir la palette de substances disponibles pour perturber et

analyser le Vivant. C’est l’occasion de faire progresser les stratégies et les méthodes de modélisation, de

synthèse organique et d’extraction. La diversité structurale engendrée vient enrichir la chimiothèque

nationale et européenne et la probabilité de trouver des touches originales sur des cibles de plus en plus

complexes.

Le bilan du quadriennal précédent montre la force de notre position dans le domaine des Récepteurs

couplés aux protéines G et de leurs voies de signalisation (en particulier le calcium). Cet axe de recherche

est très concurrentiel mais de nombreux processus fondamentaux restent à explorer et à exploiter et notre

avantage compétitif est significatif. Nous poursuivons donc nos travaux sur les projets les plus innovants

dans le domaine, tant en termes mécanistiques (structure, allostérie, oligomérisation fonctionnelle,

marquage) que thérapeutiques (cibles non exploitées).

Nous concentrons nos efforts sur des axes thérapeutiques où les attentes sociétales sont fortes et pour

lesquels nous avons un angle d’attaque fort et original correspondant à une prise de risque certaine mais

calculée. Il s’agit :

1) du système nerveux central avec deux axes forts : la douleur sous l’angle de l’hyperalgésie ; l’amour

sous son angle affect, avec des applications dans l’autisme et la motivation sociétale.

Page 24: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

2) de l’inflammation, avec des concepts thérapeutiques originaux (neutraligands), des biomarqueurs

pertinents et un portfolio de cibles validées.

3) du cancer, avec l’étude et l’inhibition spécifique de cellules souches tumorales.

4) des maladies rares ou négligées, en combinant approche ethnopharmacologique et approche

thérapeutique classique.

Les axes Cancer et Inflammation sont au cœur du Laboratoire d’Excellence MEDALIS et ont été jugés

pertinents et compétitifs par son panel d’experts internationaux.

EQUIPE CHIMIE-BIOLOGIE INTEGRATIVE Responsables : Marcel Hibert, Nelly Frossard 1- Problèmes scientifiques abordés

Notre objectif est de découvrir rapidement des petites molécules permettant de comprendre le Vivant et de

le ‘manipuler’ dans une perspective cognitive ou/et thérapeutique. Nous avons abordé ces problèmes selon

quatre angles correspondant à quatre thématiques :

Thématique 1 : la ‘Chemical Biology’. Nous développons de nouvelles voies de synthèses autour

de ‘Diversophores’ pour produire des sondes originales et potentiellement bioactives. Nous

concevons par ailleurs des sondes traçables pour l’étude mécanistique de RCPG et des

chimiothèques traçables adaptées à la microfluidique pour accélérer et optimiser les études

d’interactomique complexe.

Thématique 2 : Le cancer et l’inflammation. Nous recherchons les mécanismes d’action et

poursuivons le développement thérapeutique des molécules innovantes récemment découvertes,

agissant comme neutraligands de chimiokines ou comme inhibiteurs de cellules souches

cancéreuses. Nous cherchons en parallèle des biomarqueurs cliniques et validons de nouvelles

cibles thérapeutiques.

Thématique 3 : l’amour, la douleur. Nous cherchons et développons de nouveaux composés

agissant sur les récepteurs vasopressine/ocytocine (Amour) et sur divers récepteurs impliqués dans

la douleur et l’hyperalgie.

Thématique 4 : les maladies parasitaires. Notre objectif actuel est d’optimiser par chimie

médicinale les activités antipaludique et/ou leishmanicide de molécules naturelles identifiées par

fractionnement bio-guidé, d’identifier les mécanismes d’action ainsi que les cibles moléculaires

impliqués.

2 – Stratégie adoptée

Identification de cibles moléculaires, de biomarqueurs ou de systèmes biologiques intéressants

d’un point de vue mécanistique ou/et thérapeutique

recherche de ligands et/ou de biomarqueurs par criblage

Page 25: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

conception rationnelle de ligands sur des bases structurales

validation d’essais in vitro et de modèles in vivo pour l’étude des mécanismes biologiques

optimisation des ligands en candidats précliniques

3 – Principaux résultats obtenus

Des nouvelles méthodes et technologies validées originales permettant de lever des verrous

stratégiques ;

Des nouveaux concepts mécanistiques et thérapeutiques ;

Des précurseurs de candidats médicaments sur cancer, inflammation, autisme, douleur, maladies

parasitaires.

SYNTHESE ORGANIQUE METALLOCATALYSEE ET PHARMACOCHIMIE Responsable : Jean Suffert Le laboratoire développe aujourd’hui des méthodologies synthétiques originales autour de la réaction de

cyclocarbopalladation 4-exo-dig. La mise au point de processus synthétiques en cascade menés autour de

cette réaction permet l’élaboration de systèmes polycycliques particulièrement complexes comme par

exemple les fenestradiènes et les cyclooctatriènes. L’application de ces méthodologies dans le domaine de

composés incluant dans leurs structures un atome de soufre ou silicium est actuellement en cours et devrait

permettre l’accès à de nouvelles familles de molécules originales.

Une autre partie de l’équipe s'intéresse tout d'abord à l'obtention de châssis moléculaires complexes par

réaction d'hydroformylation à partir de substrats simples. De plus, une thématique accès pharmacochimie

nous a conduit à participer à la conception de nouvelles plateformes moléculaires anticancéreuses et

anxiolytiques.

EQUIPE CHEMOGENOMIQUE STRUCTURALE

Responsable : D. Rognan

Notre équipe se situe à l’interface de diverses disciplines (Chimie, Biologie, Informatique) et a pour but de

rationaliser et d’accélérer l’identification de molécules bioactives dans deux buts bien précis :

fournir des sondes biochimiques et pharmacologiques permettant d’étudier une protéine cible et

son implication dans des contextes pathologiques,

proposer des touches au chimiste médicinal afin d’en améliorer les propriétés (efficacité,

sélectivité).

Pour ce faire, nous développons et appliquons de nouveaux algorithmes en cheminformatique et

bioinformatique afin de mieux décrire l’espace chimique des ligands, l’espace biologique des cibles et

l’espace protéine-ligand.

Site web: http://bioinfo-pharma.u-strasbg.fr

Page 26: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

PHARMACOGNOSIE ET SUBSTANCES NATURELLES BIOACTIVES

Responsable Annelise Lobstein

1- Problèmes scientifiques abordés

Le domaine d’expertise de l’équipe concerne les substances naturelles obtenues par phytochimie

extractive, et dotées de propriétés nouvellement décrites ou relevant d’un mécanisme d’action original.

Notre objectif est d’identifier et de valoriser ces substances en mettant à profit la chimiodiversité

moléculaire puisée dans le règne végétal.

Les stratégies mises en place s’appuient à la fois sur notre expertise interne en Pharmacognosie et sur la

consolidation de nos réseaux de collaborations en botanique-chimie et biologie.

- Sélection rationnelle des matières premières terrestres

- Exploration de ressources marines

- Profiling d’extraits complexes puis stratégie de déréplication en vue d’accélérer l’isolement de nouvelles

structures bioactives

- Mise au point de tests adaptés au criblage d’extraits puis fractionnement bioguidé.

- Exploration du mécanisme d’action des molécules purifiées.

3 axes de recherche ont été explorés en 2014 :

Métabolites végétaux et environnement

Sécrétagogues naturels du GLP-1

Substances naturelles pro-apoptotiques

A. Métabolites végétaux et environnement (resp. A. Lobstein)

Plantes halophiles

L’objectif poursuivi est d’identifier les principaux facteurs susceptibles d’impacter le métabolisme

secondaire d’espèces végétales croissant en bord de littoral et soumises à des stress hydrique et salin. Nous

comparons également les capacités biosynthétiques de plantes sauvages, de plantes cultivées et de cellules

souches végétales produites en biofermenteurs.

Nos résultats nous permettent d’assurer une sélection rationnelle des espèces d’intérêt et de les valoriser

tout en préservant leur biotope naturel.

Orchidées tropicales

En associant plusieurs techniques phytochimiques et chromatographiques, notamment grâce au couplage

LC-MS-SPE-RMN et à un préfractionnement par CPC, et grâce à une stratégie de déréplication, nous

avons exploré la composition chimique de deux orchidées de la sous-tribu des Aeridinae. Dix dérivés

phénanthréniques ont été identifiés dans les tiges d’Aerides rosea Lodd. ex. Lindl. & Paxton, dont deux

nouvellement décrits.Quatre stilbénoïdes, trois dérivés d'acides phénoliques et quatre esters d'acide

cinnamique ont été identifiés dans les tiges d’Acampe rigida (Buch.-Ham. ex Sm.) P. F. Hunt.

Nous avons également effectué des dosages de traceurs dans différents échantillons de deux représentants

de la tribu des Vandeae : Vanda teres (Roxb.) Lindl. et Vanda coerulea Griff. ex. Lindl., afin de mettre en

Page 27: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

évidence d’éventuelles variations de composition en fonction des facteurs environnementaux et du stade

de croissance végétative. Nous avons ainsi comparé par LC-MS-MS les teneurs en marqueurs d’activité de

divers échantillons variant selon leur origine (réserve naturelle en Chine, ferme en Thaïlande, serre en

Suisse), l’âge des plantes, leur période de prélèvement (avant, pendant et après floraison) et la nature des

organes sélectionnés (tiges, feuilles, racine).

Enfin, nous avons mis au point des conditions d’isolement préparatif par CPC afin de purifier des

marqueurs biologiques préalablement identifiés dans les tiges de Vanda teres : trois

glucospyranosyloxybenzyl-malates ainsi que leur précurseur biosynthétique.

B. Sécrétagogues naturels du GLP-1 (resp. A. Urbain)

L'un des projets de l'équipe consiste à rechercher de nouveaux candidats médicaments pour le traitement

du diabète de type 2, et plus précisément des sécrétagogues du GLP-1 (glucagon-like peptide-1). En effet,

la sécrétion du GLP-1, hormone impliquée dans la régulation de la glycémie via notamment la production

d'insuline, est diminuée chez les diabétiques de type 2.

Lors d'un criblage cellulaire in vitro, une stimulation de la sécrétion du GLP-1 a été observée avec des

extraits issus d’Apocynacées malgaches et d’Asteracées polynésiennes, aucune de ces espèces n'ayant fait

l’objet jusqu'à présent d’études phytochimique et pharmacologique. Le fractionnement bioguidé des

extraits bioactifs est en cours afin d'identifier la ou les molécule(s) responsable(s) de l'activité observée.

L'identification des principes actifs se fera notamment à l'aide du couplage HPLC-UV-MS/MS-RMN

capillaire.

C. Substances naturelles pro-apoptotiques (resp. CD. Muller)

De nouveaux outils pharmacologiques capables d’activer l’apoptose sur différents modèles cellulaires ont

été générés à partir d’extraits naturels dans le cadre d’un programme européen (FP7- MAREX :

"Exploring Marine Resources for Bioactive Compounds : From Discovery to Sustainable Production and

Industrial Application »). Ce programme nous a donné accès à une importante chimiothèque de molécules

naturelles issues d’organismes marins et constituant des sources potentielles de produits à haute valeur

ajoutée. Des extraits ont été testés pour leurs activités biologiques : anticancéreuses, anti-inflammatoires,

antivirales et anti-coagulantes. A Strasbourg, nous avons apporté notre expertise dans le criblage

anticancéreux grâce à des méthodologies originales en cytomique, utilisant 3 lignées cancéreuses humaine

(testiculaire, hépatique et sanguine) ainsi qu’une lignée cutanée non cancéreuse. L'isolement des

composés bio-actifs suivi par la détermination de leurs structures a permis aux pharmaco-chimistes

slovènes (Pr. Danijel Kikelj, Université de Ljubljana) impliqués dans ce programme européen, de

produire de nouveaux analogues synthétiques bioactifs, capable d’induire l’apoptose par la voie

extrinsèque en activant la caspase-8.

Nombre de thèses de doctorats soutenues en 2014 : 3

Nombre d’HDR soutenues en 2014 : 2

Adresse site internet du/es équipe(s), unité(s), département

http://medchem.unistra.fr/

Production scientifique

Page 28: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

I. Articles dans des revues internationales ou nationales avec comité

de lecture

• Margathe, J.F.; Iturrioz, X.; Alvear-Perez, R.; Marsol, C.; Riche, S.; Chabane, H.; Tounsi, N.; Kuhry,

M.; Heissler, D.; Hibert, M.; Llorens-Cortes C.; Bonnet, D. Structure Activity Relationship Studies

toward the Discovery of Selective Apelin Receptor Agonists. J. Med. Chem. 2014, 57, 2908-2919.

• Mameri, S.; Ako, A.M.; Yesil, F.; Hibert, M.; Lan, Y.H.; Anson, C.E.; Powell, A.K. Coordination

Cluster Analogues of the High-Spin [Mn-19] System with Functionalized 2,6-

Bis(hydroxymethyl)phenol Ligands. Eur. J. Inorg. 2014, 4326-4334.

• Karpenko, I.A.; Kreder,R.; Valencia, C.; Villa, P.; Mendre, C.; Mouillac, B.; Mely, Y.; Hibert, M.;

Bonnet, D.; Klymchenko, A.S. Red Fluorescent Turn-On Ligands for Imaging and Quantifying G

Protein-Coupled Receptors in Living Cells. ChemBioChem 2014, 15, 359-363.

• Karaki, S.; Tran, T.; Ellouze, M.; Schlecht-Louf, G.; Daubeuf, F.; Frossard, N.; Tcherakian, C.; Emilie,

D.; Godot, V. Enforced expression of GILZ in dendritic cells generates regulatory T cells and provides

clinical control of allergic asthma in allergen-sensitised mice. Allergy 2014, 69, 97-97.

• Horvath, D.; Lisurek, M.; Rupp, B.; Kuhne, R.; Specker, E.; von Kries, J.; Rognan, D.; Andersson,

C.D.; Almqvist, F.; Elofsson, M.; Enqvist, P.A.; Gustavsson, A.L.; Remez, N.; Mestres, J.; Marcou, G.;

Varnek, A.; Hibert, M.; Quintana J.; Frank, R. Design of a General-Purpose European Compound

Screening Library for EU-OPENSCREEN. ChemMedChem 2014, 9, 2309-2326.

• Wagner, P.; Bollenbach, M.; Doebelin, C.; Bihel, F.; Bourguignon, J.J.; Salome, C.; Schmitt, M. t-

BuXPhos: a highly efficient ligand for Buchwald-Hartwig coupling in water. Green Chem. 2014, 16,

4170-4178.

• Salome, C.; Wagner, P.; Bollenbach, M.; Bihel, F.; Bourguignon, J.J.; Schmitt, M. Buchwald-Hartwig

reactions in water using surfactants. Tetrahedron 2014, 70, 3413-3421.

• Ruggiu, F.; Gizzi, P.; Galzi, J.L.; Hibert, M.; Haiech, J.; Baskin, I.; Horvath, D.; Marcou, G.; Varnek,

A. Quantitative Structure-Property Relationship Modeling: A Valuable Support in High-Throughput

Screening Quality Control. Anal. Chem. 2014, 86, 2510-2520.

• Regenass, P.; Margathe, J.F.; Mann, A.; Suffert, J.; Hibert, M.; Girard N.; Bonnet, D.

Diastereoselective synthesis of novel aza-diketopiperazines via a domino

cyclohydrocarbonylation/addition process. Chem. Commun. 2014, 50, 9657-9660.

• Reber, L.L.; Daubeuf, F.; Pejler, G.; Abrink M.; Frossard, N. Mast Cells Contribute to Bleomycin-

Induced Lung Inflammation and Injury in Mice through a Chymase/Mast Cell Protease 4-Dependent

Mechanism. J. Immunol. 2014, 192, 1847-1854.

• Reber, L.L.; Frossard, N. Targeting mast cells in inflammatory diseases. Pharmacol. Ther. 2014, 142,

416-435.

• Daubeuf, F.; Frossard, N. Eosinophils and the ovalbumin mouse model of asthma. Methods Mol. Biol.

2014, 1178, 283-93.

Page 29: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

• Nguyen, P.H.; Hammoud, H.; Halliez, S.; Pang, Y.H.; Evrard, J.; Schmitt, M.; Oumata, N.;

Bourguignon, J.J.; Sanyal, S.; Beringue, V.; Blondel, M.; Bihel F.; Voisset, C. Structure-Activity

Relationship Study around Guanabenz Identifies Two Derivatives Retaining Antiprion. Activity but

Having Lost alpha 2-Adrenergic Receptor Agonistic Activity. Acs Chem. Neurosci. 2014, 5, 1075-

1082.

• Moreau, M.; Haiech, J. Calcium signalling as a hub for translational medicine a starting point to model

life Preface. BBA Mol. Cell Res. 2014, 1843, 2283-2283

• Mones, S.; Bordignon, B.; Peiretti, F.; Landrier, J.F.; Gess, B.; Bourguignon, J.J.; Bihel, F.;. Fontes, M.

CamKII inhibitors reduce mitotic instability, connexon anomalies and progression of the in vivo

behavioral phenotype in transgenic animals expressing a mutated Gjb1 gene. Front. Neurosci. 2014, 8,

• Houel, E.; Fleury, M.; Jullian, V.; Vonthron-Senecheau, C.; Nardella, F.; Villa, P.; Odonne, G.;

Eparvier, V.; Deharo, E.; Stien, D. Takamalalme (Psidium acutangulum Mart ex. DC): Understanding

the use of an antimalarial traditional remedy from French Guiana. Planta Med. 2014, 80, 797-797.

• Haiech, J. and Ranjeva, R. When the terminal milestone is reached, there is no more limit. M S-

Medecine Sciences 2014, 30, 44-44.

• Haiech, J; Gendrault, Y.; Kilhoffer, M.C.; Ranjeva, R.; Madec, M.; Lallement, C. A general framework

improving teaching ligand binding to a macromolecule. BBA Mol. Cell Res. 2014, 1843, 2348-2355.

• Gendrault, Y.; Madec, M.; Lallement, C.; Haiech, J. Modeling Biology With HDL Languages: A First

Step Toward a Genetic Design Automation Tool Inspired From Microelectronics. Ieee Trans. Biomed.

Eng. 2014, 61, 1231-1240.

• Feve, M.; Saliou, J.M.; Zeniou, M.; Lennon, S.; Carapito, C.; Dong, A.; Van Dorsselaer, A.; Junier,

M.P.; Chneiweiss, H.; Cianferani, S.; Haiech, J.; Kilhoffer, M.C. Comparative Expression Study of the

Endo-G Protein Coupled Receptor (GPCR) Repertoire in Human Glioblastoma Cancer Stem-like Cells,

U87-MG Cells and Non Malignant Cells of Neural Origin Unveils New Potential Therapeutic Targets.

Plos One 2014, 9.

• Doebelin, C.; Wagner, P.; Bihel, F.; Humbert, N.; Kenfack, C.A.; Mely, Y.; Bourguignon J.J.; Schmitt,

M. Fully Regiocontrolled Polyarylation of Pyridine. J. Org. Chem. 2014, 79, 908-918.

• Daryadel, A.; Bogdanova, A.; Gassmann, M.; Mueller, X.; Zund, G.; Seifert, B.; Lehalle, C.; Frossard

N.; Tavakoli, R. Multikinase inhibitor sorafenib prevents pressure overload-induced left ventricular

hypertrophy in rats by blocking the c-Raf/ERK1/2 signaling pathway. J. Cardiothorac. Surg. 2014, 9,

81.

• Benahmed, M.A.; Elbayed, K.; Daubeuf, F.; Santelmo, N.; Frossard N.; Namer, I.J. NMR HRMAS

Spectroscopy of Lung Biopsy Samples: Comparison Study Between Human, Pig, Rat, and Mouse

Metabolomics. Magn. Reson. Med. 2014, 71, 35-43.

Page 30: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

• Bachstetter, A.D.; Webster, S.J.; Tu, T.; Goulding, D.S.; Haiech, J.; Watterson and D.M.; Van Eldik,

L.J. Generation and Behavior Characterization of CaMKII beta Knockout Mice. Plos One 2014, 9.

• Boussemart, L.; Malka-Mahieu, H.; Girault, I.; Allard, D.; Hemmingsson, O.; Tomasic, G.; Thomas,

M.; Basmadjian, C.; Ribeiro, N.; Thuaud, F.; Mateus, C.; Routier, E.; Kamsu-Kom, N.; Agoussi, S.;

Eggermont, A.M.; Desaubry, L.; Robert, C.; Vagner, S. eIF4F is a nexus of resistance to anti-BRAF

and anti-MEK cancer therapies. Nature 2014, 513, 105.

• Emhemmed, F.; Ali Azouaou, S.; Thuaud, F.; Schini-Kerth, V.; Desaubry, L.; Muller and C.D.;

Fuhrmann, G. Selective anticancer effects of a synthetic flavagline on human Oct4-expressing cancer

stem-like cells via a p38 MAPK-dependent caspase-3-dependent pathway. Biochem. Pharmacol. 2014,

89, 185-96.

• Nakatani, Y.; Ribeiro, N.; Streiff, S.; Gotoh, M.; Pozzi, G.; Desaubry L.; Milon, A. Search for the Most

'primitive' Membranes and Their Reinforcers: A Review of the Polyprenyl Phosphates Theory. Orig.

Life Evol. Biosph. 2014, 44(3):197-208.

• Salome, C.; Narbonne, V.; Ribeiro, N.; Thuaud, F.; Serova, M.; de Gramont, A.; Faivre, S.; Raymond,

E.; Desaubry, L. Benzofuran derivatives as a novel class of inhibitors of mTOR signaling. Eur. J. Med.

Chem. 2014, 74, 41-49.

• Salome, C.; Ribeiro, N.; Chavagnan, T.; Thuaud, F.; Serova, M.; de Gramont, A.; Faivre, S.; Raymond

E.; Desaubry, L. Benzofuran derivatives as anticancer inhibitors of mTOR signaling. Eur J Med Chem.

2014, 81, 181-91.

• Basmadjian, C.; Zhao, Q.; Bentouhami, E.; Djehal, A.; Nebigil, C.G.; Johnson, R.A.; Serova, M.; de

Gramont, A.; Faivre, S.; Raymond E.; Desaubry, L. Cancer wars: natural products strike back. Front.

Chem. 2014, 2, 20.

• Brogi, S.; Tafi, A.; Desaubry L.; Nebigil, C.G. Discovery of GPCR ligands for probing signal

transduction pathways. Front. Pharmacol. 2014, 5, 255.

• Castanheiro, T.; Gulea, M.; Donnard, M.; Suffert, J. Practical Access to Aromatic Thiocyanates by

CuCN-Mediated Direct Aerobic Oxidative Cyanation of Thiophenols and Diaryl Disulfides. Eur. J.

Org. Chem. 2014, 7814-7817.

• Castanheiro, T.; Donnard, M.; Gulea, M.; Suffert, J. Cyclocarbopalladation/Cross-Coupling Cascade

Reactions in Sulfide Series: Access to Sulfur Heterocycles. Org. Lett. 2014, 16, 3060-3063.

• Vu, V. H.; Louafi, F.; Girard, N.; Marion, R.; Roisnel, T.; Dorcet, V.; Hurvois, J.-P. Electrochemical

Access to 8-(1-Phenyl-ethyl)-1,4-dioxa-8-aza-spiro[4.5]decane-7-carbonitrile. Application to the

Asymmetric Syntheses of (+)-Myrtine and Alkaloid (+)-241D. J. Org. Chem. 2014, 79, 3358–3373.

Page 31: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

• Ruat, M.; Hoch, L.; Faure H.; Rognan, D. Targeting of Smoothened for therapeutic gain. Trend.

Pharmacol. Sci. 2014, 35, 237-246.

• Rognan, D. and Varnek, A. A Summer School for Structuring the Chemoinformatics Community. Mol.

Inf. 2014, 33, 390-390.

• Ray, A.M.; Schaffner, F.; Janouskova, H.; Noulet, F.; Rognan, D.; Lelong-Rebel, I.; Choulier, L.;

Blandin, A.F.; Lehmann, M.; Martin, S.; Kapp, T.; Neubauer, S.; Rechenmacher, F.; Kessler H.;

Dontenwill, M. Single cell tracking assay reveals an opposite effect of selective small non-peptidic

alpha 5 beta 1 or alpha v beta 3/beta 5 integrin antagonists in U87MG glioma cells. BBA General

Subjects 2014, 1840, 2978-2987.

• Noel, S.; Hoegy, F.; Rivault, F.; Rognan, D.; Schalk, I.J.; Mislin, G.L.A. Synthesis and biological

properties of thiazole-analogues of pyochelin, a siderophore of Pseudomonas aeruginosa. Bioorg. Med.

Chem. Lett. 2014, 24, 132-135.

• Kuhn, I.; Kellenberger, E.; Cakir-Kiefer, C.; Muller-Steffner, H. Schuber, F. Probing the catalytic

mechanism of bovine CD38/NAD(+) glycohydrolase by site directed mutagenesis of key active site

residues. BBA Proteins and Proteomics 2014, 1844, 1317-1331.

• Horvath, D.; Lisurek, M.; Rupp, B.; Kuhne, R.; Specker, E.; von Kries, J.; Rognan, D.; Andersson,

C.D.; Almqvist, F.; Elofsson, M.; Enqvist, P.A.; Gustavsson, A.L.; Remez, N.; Mestres, J.; Marcou, G.;

Varnek, A.; Hibert, M.; Quintana, J.; Frank, R. Design of a General-Purpose European Compound

Screening Library for EU-OPENSCREEN. ChemMedChem 2014, 9, 2309-2326.

• Gabel, J.; Desaphy, J.; Rognan, D. Beware of Machine Learning-Based Scoring Functions-On the

Danger of Developing Black Boxes. J. Chem. Inf. Model. 2014, 54, 2807-2815.

• Rognan, D. and Bonnet, P. Les chimiothèques et le criblage virtuel. M S-Med. Sci. (Paris) 2014, 30,

1152-1160.

• Desaphy, J. and Rognan, D. sc-PDB-Frag: A Database of Protein-Ligand Interaction Patterns for

Bioisosteric Replacements. J. Chem. Inf. Model. 2014, 54, 1908-1918.

• Borkovec, M.; Koper G.J.M.; Spiess, B. The intrinsic view of ionization equilibria of polyprotic

molecules. New J. Chem. 2014, 38, 5679-5685.

• Tsoukalas, M.; Urbain, A.; Lobstein, A. Three-step isolation of a new pregnane from Cynanchum

marnieranum Rauh (Apocynaceae). Planta Med. 2014, 80, 1418-1418.

• Simo, L.; Azouaou, S.A.; Tsoukalas, M.; Pegnyemb, D.E.; Muller, C.D.; Lobstein, A. Three new

triterpenoid saponins from Albizia glaberrima roots. Planta Med. 2014, 80, 1435-1435.

Page 32: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

• Kiuru, P.; D'Auria, M.V.; Muller, C.D.; Tammela, P.; Vuorela, H.; Yli-Kauhaluoma, J. Exploring

marine resources for bioactive compounds. Planta Med. 2014, 80, 1234-46.

• Emhemmed, F.; Ali Azouaou, S.; Thuaud, F.; Schini-Kerth, V.; Desaubry, L.; Muller, C.D.; Fuhrmann,

G. Selective anticancer effects of a synthetic flavagline on human Oct4-expressing cancer stem-like

cells via a p38 MAPK-dependent caspase-3-dependent pathway. Biochem. Pharmacol. 2014, 89, 185-

96.

• Cakova, V.; Urbain, A.; Antheaume, C.; Rimlinger, N.; Wehrung, P.; Bonte, F.; Lobstein, A.

Identification of phenanthrene derivatives in Aerides rosea (Orchidaceae) using on-line hyphenated

systems. Planta Med. 2014, 80, 1381-1381.

CLASSEMENT DES REVUES ET DES PUBLICATIONS

2014

(nombre total : 50 publications, dont 48 classées)

Facteur d’impact >10 5 à 10 2 à 5 1 à 2 <1 non

classées

Nbre de Journaux 2 10 15 4 1 2

Nbre de Publications 2 12 28 4 2 2

% des publications

figurant dans le Journal

Citation Reports

4 24 56 8 4 4

II. Articles dans des revues sans comité de lecture

Méthodes de criblage in silico de chimiothéques

D. Rognan, D. (2014)

Techniques de l’Ingénieur, PHA1020.

III. Brevets

F. Bihel, M. Fontes, C. Marsol, S. Mones

Procédés et compositions pharmaceutiques pour le traitement de la maladie de charcot-marie-tooth liée au

chromosome x. WO2014095757, 17/12/2012, 2014.

FLT3 receptor Antagonists

Page 33: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

D. Rognan, D, M. Schmitt, JP Leyris, J. Valmier

EP14306225.5 , 31 juillet 2014

F. Bihel, S. Schneider, M. Schmitt, H. Ftouni

Novel non-natural amino acids, their process of preparation and uses thereof. EP14306411, 12/09/2014, 2014.

Composition contenant au moins un inhibiteur de certaines chimiokines, son procédé d’obtention, et son

utilisation dermocosmétique

P. Bernard, C. Pillard, QT Do, JL Galzi, N. Frossard, D. Abboud

Dépôt n° 14/02162.

Composition contenant au moins un inhibiteur de certaines chimiokines, son procédé d’obtention, et son

utilisation dermocosmétique.

P. Bernard, C. Pillard, QT Do, JL Galzi, N. Frossard, D. Abboud

Dépôt n° 14/02163.

IV. Communications avec actes

Internationales

Repositionnement de médicaments comme molécules à activité anti-cellules-souches cancéreuses

MC Kilhoffer

Journées Recherche Santé (JRS) biologie cellulaire, développement & recherche clinique et

translationnelle. Paris 23 Janvier 2014 Invitation Biopark Paris 13e

Deciphering the mechanism of the anti-asthmatic action of the CXCL12 neutraligand, chalcone 4.

F Daubeuf, D Bonnet, V Beckaert, A Ouadi, P Marchand, D Brasse, P Gizzi, M Hibert, JL Galzi and N

Frossard

Lung Science Conference, Estoril, Portugal, mars 2014.

Enforced expression of GILZ in dendritic cells generates regulatory T cells and provides clinical control

of allergic asthma in allergen-sensitized mice.

S. Karaki T. Tran, M. Ellouze, G. Schlecht-Louf , F. Daubeuf, N. Frossard, C. Tcherakian, D. Emilie and

V.Godot

Réunion annuelle de l’European Academy of Allergy and clinical Immunol, Copenhague, Danemark, juin

2014.

Deciphering the mechanism of the anti-asthmatic action of the CXCL12 neutraligand, chalcone 4.

F Daubeuf, D Bonnet, V Beckaert, A Ouadi, P Marchand, D Brasse, P Gizzi, M Hibert, J-L Galzi and N

Frossard

Congrès annuel de l’European Respiratory Society, Munich, Allemagne, Septembre 2014.

Computational approaches to target fishing and ligand profiling.

D. Rognan

Spring meeting, Section Medicinal Chemistry, Royal Netherlands Chemical Society, Utrecht, The

Netherlands, 28 April 2014

IChem : A toolkit for Fingerprinting cavities and protein-ligand complexes.

Page 34: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

D. Rognan

CCG MOE User Group meeting, Strasbourg, 24-25 April 2014

IChem: A toolkit for Fingerprinting cavities and protein-ligand complexes.

D. Rognan

5th French Japanase Worshop for Computational Chemistry, Strasbourg, 30 Jun-1

st Jul 2014.

Purification of orchid’s high value-added secondary metabolites by multi-step centrifugal partition

chromatography.

V Cakova, A Urbain, C Le Quemener, G Audo, F Bonté and A Lobstein

International symposium on chromatography of natural products, Lublin, Pologne, Mai 2014 (short

lecture).

Identification of phenanthrene derivatives in Aerides rosea (Orchidaceae) using on-line hyphenated

systems.

V Cakova, A Urbain, C Antheaume, N Rimlinger, P Wehrung, F Bonte and A Lobstein

Congrès annuel de la GA, Guimares, Portugal, Septembre 2014 (Poster). Planta Medica 2014, 80, 1381-

1381.

Nationales

Néant.

V. Communications sans actes

One-pot Access to Polysubstituted Naphthalenes and Carbocyclic Seven-membered Rings Through

Intramolecular Palladium-Catalyzed Cascade Reactions

J. Joussot, S. Blouin, G. Blond and J. Suffert

Groupe d’Etude de Chimie Organique, GECO 55, Samatan, 24-29 août 2014

VI. Conférences invitées

M Hibert

Autisme : le point sur les nouvelkles pistes thérapeutiques.

4 décembre 2014, Journées STRAS-autisme, Strasbourg

M Hibert and D Bonnet

Fluorescent probes to track GPCR binding and dimerization

21 Octobre 2014, GDR RCPG, Montpellier

M Hibert

Amour, ocytocine, autisme

6 Octobre 2014, Lycée Leclerc, Saverne

M Hibert

Page 35: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Sondes fluorescentes pour la découverte de médicaments

17 Septembre 2014, SyCOCAL IX, Tours.

M Hibert

Chemical biology : contribution to molecular therapeutic innovation

3 Avril 2014, Wangeningen Symposium on Organic Chemistry, Royal Dutch Chemical Society,

Wangeningen, Pays-bas.

D. Bonnet

Fluorescent probes to track GPCR binding and dimerization. GLISTEN (GPCR-Ligand Interactions,

Structures, and Transmembrane Signalling: a European Research Network) conference, Budapest, October

2-4, 2014.

D. Bonnet

Fluorescent probes to track GPCR binding and dimerization.

Annual Meeting of the German Pharmaceutical Society, Trends and Perspectives in Pharmaceutical

Sciences, Frankfurt, September 24-26, 2014.

D. Bonnet

Innovative Fluorescent-Based Approaches to GPCR Screening and Functional Architecture Studies.

Rouen, 50th International Conference on Medicinal Chemistry, 2-4 juillet 2014.

D. Bonnet

Screening in academic environment: scientific and therapeutic outcome,

11èmes

journées de la Chimiothèque Nationale, Orléans, 19-20 juin 2014.

F. Bihel

Translocator protein ligands and novel inducers of metalloproteinases for neuroprotective strategies.

In 2nd International Meeting of the Neuro-Rhine Consortium, Strasbourg (France), 2014.

G. Blond

How to Make Complex Molecules from Simple Starting Material: Palladium mediated catalysis, a

Powerful Tool

Colloque Franco-Indien CEFIPRA “New trends in chemistry and chemical biology”, 10-11 novembre

2014, Pondicherry, INDE.

L. Désaubry

Development of novel anticancer agents that target prohibitins and the translation initiation factor eIF4a

15 Juillet 2014, Centre de Recherche Allemand sur le Cancer, Heidelberg (Allemagne)

L. Désaubry

Pharmacochimie de produits naturels anticancéreux, les flavaglines.

6 Octobre 2014, Institut Parisien de Chimie Moléculaire (CNRS-Université Pierre et Marie Curie)

J. Suffert

How to Make Complex Molecules from Simple Starting Material: the Palladium, a Powerful Tool

Université de Genève, juillet 2014

Page 36: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

J. Suffert

How to Make Complex Molecules from Simple Starting Material: the Palladium, a Powerful Tool

Molecular Complexity in Modern Chemistry Congrès International, Moscou, Sept 2014,

VII. Ouvrages scientifiques (ou chapitres)

Copper-catalyzed C-C bond formation in natural product synthesis: elegant and efficient solution to a key

bond disconnection (book chapter)

N. Blanchard and M. Donnard

chapter 18 in Copper-Mediated Cross-Coupling Reactions; Evano G.; Blanchard, N. Eds.; John Wiley &

Sons: Hoboken, 2014, pp 683-723.

Thin-layer Chromatography of Plants, with Chemical and Biological Detection Methods.

A Urbain and CA Simões-Pires

In: Handbook of Chemical and Biological Plant Analytical Methods, edited by Hostettmann K., Chen S.,

Marston A. and Stuppner H. Chichester, UK: John Wiley & Sons, Ltd, 2014, pp 185-206.

VIII. Ouvrages de vulgarisation (ou chapitres):

Néant.

IX. Direction d'ouvrages

Néant.

X. Autres publications

Néant.

XI. Autres activités internationales (séminaires, communications et

posters internationaux)

Buchwald–Hartwig reactions in water using surfactants

M. Bollenbach, P. Wagner, C. Salomé, F. Bihel, J.-J. Bourguignon and M. Schmitt

Journées du Campus d'Illkirch, Illkirch (France), April 7 - 8, 2014

Nucleophilic Substitution of Azide Acting as a Pseudo Leaving Group: One-Step Synthesis of Various

Aza Heterocycles

C. Doebelin, M. Schmitt, C. Antheaume, J.-J. Bourguignon and F. Bihel

Journées du Campus d'Illkirch, Illkirch (France), April 7 - 8, 2014

Fully Regiocontrolled Polyarylation of Pyridine

C. Doebelin, P. Wagner, F. Bihel, N. Humbert, C. A. Kenfack, Y. Mely, J.-J. Bourguignon and M. Schmitt

Journées du Campus d'Illkirch, Illkirch (France), April 7 - 8, 2014

Page 37: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Design of a library of putative Neprilysin inducers

H. Ftouni, F. Bihel, J.-J. Bourguignon, C. Klein, M. Maitre, G. Mensah-Nyagan and M. Schmitt

2nd International Meeting of the Neuro-Rhine Consortium, Strasbourg (France), March 28th, 2014

Development of imidazo[1,2-c]quinazolin-5-ones as 18kDa translocator protein (TSPO) ligand

F. Hallé, M. Abarghaz, C. Klein, I. Lejri, M. Schmitt, M. Maitre, A. Eckert, G. Mensah-Nyagan, J.-J.

Bourguignon and F. Bihel

2nd International Meeting of the Neuro-Rhine Consortium, Strasbourg (France), March 28, 2014

Development of imidazo[1,2-c]quinazolin-5-ones as 18kDa translocator protein (TSPO) ligand

F. Hallé, M. Abarghaz, C. Klein, I. Lejri, M. Schmitt, M. Maitre, A. Eckert, G. Mensah-Nyagan, J.-J.

Bourguignon and F. Bihel

50th International conference on Medicinal Chemistry, RICT, Rouen (France), July 2 - 4, 2014

Development of imidazo[1,2-c]quinazolin-5-ones as 18kDa translocator protein (TSPO) ligand

F. Hallé, M. Abarghaz, C. Klein, I. Lejri, M. Schmitt, M. Maitre, A. Eckert, G. Mensah-Nyagan, J.-J.

Bourguignon and F. Bihel

21st Young Research Fellow Meeting, Montpellier (France), March 24 - 25, 2014

Development of imidazo[1,2-c]quinazolin-5-ones as 18kDa translocator protein (TSPO) ligand

F. Hallé, M. Abarghaz, C. Klein, I. Lejri, M. Schmitt, M. Maitre, A. Eckert, G. Mensah-Nyagan, J.-J.

Bourguignon and F. Bihel

Journées du Campus d'Illkirch, Illkirch (France), April 7 - 8, 2014

New synthesis strategies around palladium catalysis: A one-pot access to [4.6.4.6]fenestradienes and

cyclooctatrienes

M. Charpenay, G. Blond and J. Suffert

French American Chemical Society Symposium, juin 2014, Avignon

One-pot access to polysubstituted naphthalenes and seven-membered carbocyclics through intramolecular

palladium-catalyzed cascade reactions

J. Joussot, G. Blond and J. Suffert

French American Chemical Society Symposium, juin 2014, Avignon

Discovery of new anticancer agents that target prohibitins to inhibit Ras/C-Raf signaling.

F. Thuaud, C. Basmadjian, Q. Zhao, C. Nebigil, P. Gernot, J. Neumann, M. Li-Weber and L. Désaubry

2nd EACR Conference on Cell Death in Cancer, Amsterdam, 30 Janvier-1er Février 2014.

IChem : a novel toolkit to detect, describe and compare protein/ligand complexes in the Protein Data

Bank.

J. Desaphy and D. Rognan

4th Strasbourg Summer School in Chemoinformatics, Strasbourg, 23-37 juin 2014

PPiome: 3D mapping of protein-protein interfaces.

F. Da Silva and D. Rognan

4th Strasbourg Summer School in Chemoinformatics, 23-37 juin 2014

Rational design of ligands targeting GPCR heterodimers.

S. Azoulay, D. Rognan

4th Strasbourg Summer School in Chemoinformatics, Strasbourg, 23-37 juin 2014

Page 38: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Beware of machine learing-based scoring fucntions.

J. Gabel, J. Desaphy and D. Rognan

4th Strasbourg Summer School in Chemoinformatics, Strasbourg, 23-37 juin 2014

sc-PDB: a 3D database of druggable binding sites.

J. Desaphy, G. Bret, D. Rognan and E. Kellenberger

5th French Japanase Workshop in Computational Chemistry, Strasbourg, 30 Jun – 1

st Jul 2014.

IChem : a novel toolkit to detect, describe and compare protein/ligand complexes in the Protein Data

Bank.

J. Desaphy and D. Rognan

5th French Japanase Workshop in Computational Chemistry, Strasbourg, 30 Jun – 1

st Jul 2014.

PPiome: 3D mapping of protein-protein interfaces.

F. Da Silva and D. Rognan

5th French Japanase Workshop in Computational Chemistry, Strasbourg, 30 Jun – 1

st Jul 2014.

Rational design of ligands targeting GPCR heterodimers.

S. Azoulay and D. Rognan

5th French Japanase Workshop in Computational Chemistry, Strasbourg, 30 Jun – 1

st Jul 2014.

Beware of machine learing-based scoring fucntions.

J. Gabel, J. Desaphy and D. Rognan

5th French Japanase Workshop in Computational Chemistry, Strasbourg, 30 Jun – 1

st Jul 2014.

sc-PDB: a 3D database of druggable binding sites.

J. Desaphy, G. Bret, D. Rognan and E. Kellenberger

5th French Japanase Workshop in Computational Chemistry, Strasbourg, 30 Jun – 1

st Jul 2014.

Arundiquinone, a new phenanthrenequinone identified in Arundina graminifolia (Orchidaceae) by on-line

HPLC-DAD-MS-SPE-UV/NMR hyphenated technique.

F.Auberon, V.Cakova, C.Antheaume, B.Schaeffer, F.Bonté and A.Lobstein

30th International Symposium on Chromatography, Salzburg, Autriche;

XII. Valorisation (contrats de recherche, partenariats industriels,

créations d'entreprises, brevets, information et diffusion scientifique)

Contrats de recherche

Contrats européens / réseaux d’excellence :

M. Hibert

• « Contrat d’investissement d’avenir LABEX » GSC2 (2014)

N. Frossard/JJ. Bourguignon

• « Contrat d’investissement d’avenir LABEX » Anti-TNF (2014)

E. Kellenberger

• « Contrat d’investissement d’avenir LABEX » « CD38 »(2014)

Page 39: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

C. Muller

• « FTP Marex » (2010-2014)

ANR et autres appels à projets publics :

M. Hibert

• FRM (2011 - 2014)

Grands Equipements pour la Recherche Médicale : LC/MS/NMR

• ANR (2014 – 2018)

« Ocytocine et autisme : innovation thérapeutique »

J. Haiech

• ANR (2014 – 2016)

« Calcium-GlioStem »

N. Frossard

• ANR AIR-CPG (Gestion SATT-CONECTUS) (2012 – 2014)

J.J. Bourguignon

• ANR Blanc (2012 – 2015)

« Combattre l’ataxie de Friedreich »

• Interreg IV Rhin Superieur (2012 – 2015)

« Neurogénèse et Neuroprotection»

• ANR Blanc (2011 – 2015) Commune avec D. Rognan

« Modulation pharmacologique de la voie BDNF-TRKB dans les modèles

de dépression et de douleur chronique »

• Fondation ARC (2012 – 2015)

« Virus Epstein-Barr »

D. Rognan

• ANR Blanc (2011 – 2015) Commune avec J.J. Bourguignon

« Modulation pharmacologique de la voie BDNF-TRKB dans les modèles de

Dépression et de douleur chronique »

Contrats Industriels :

N. Frossard • ABScience (2012 - 2015)

“Etude de l’effet de composés dans des modèles animaux d’inflammation »

E. Kellenberger

• SERVIER (2014 - 2015)

“Controlling calcium level in cardiomyocytes by novel inhibitor of the CD38/ADPR cyclase

activity»

Page 40: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

A. Lobstein

• GUERLAIN (2013 - 2016)

« Exploration phytochimique et biologique d’extraits d’orchidées »

Autres contrats :

N. Frossard (Projet Financement SATT Conectus) • AIR-CPG (2012 - 2014) D. Rognan (Gestion INSERM Délégation Languedoc/Roussillon)

• Mise au point d’une série de molécules chimiques afin d’augmenter l’affinité des hits (2013 – 2014) D. Rognan (Gestion SATT Languedoc/Roussillon)

• Biodol Therapeutics (2013 – 2014) Prestations de service :

D. Rognan (Gestion SATT Conectus)

• NATUREX : Criblage in silico (2013 - 2014)

D. Rognan (Gestion SATT Conectus)

• SYNERGIC Lyon Cancer : Etude de chemoinformatique pour le laboratoire CD3 -Lyon (2013

- 2014)

N. Frossard (Gestion SATT Conectus)

• GIE CERBM : Airway flexivent in ORMDL3 mice (2013 – 2015)

N. Frossard (Gestion SATT Conectus)

• GIE CERBM : CGV airway flexivent in ORMDL3 mice and airway flexivent in IRAK4 mice

(2014-2015)

A. Lobstein (Gestion SATT Conectus)

• BIOTECH MARINE : Etude et valorisation industrielle d’halophytes du littoral breton :

biodiversité chimique et biologique (2013 – 2016)

Accompagnement thèses CIFRE :

J.J. Bourguignon

• Cifre PRESTWICK (2011 - 2014)

L. Désaubry

• Cifre AAREC Filia Research (2011 - 2014)

« Synthèse de nouveaux agents anticancéreux dérivés des flavaglines »

L. Désaubry

• Cifre AAREC Filia Research (2013 - 2016)

« Synthèse et évaluation antitumorale de nouveaux ligands des prohibitines »

J. Suffert

• Accompagnement Bourse BDI Pierre Fabre (2011 - 2014)

« Mise au point de nouvelles voies de synthèses originales de molécules d’intérêt

thérapeutique dans le domaine de l’oncologie et du SNC »

Page 41: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

D. Rognan

• Contrat doctoral 2013 Région Alsace/CNRS (2013 - 2016)

« Pplome cartographie 3D des interfaces protéine-protéine droguables t conception

rationnelle d’inhibiteurs

Subventions

N. Frossard

Bourse Région (2011 – 2014)

J.J. Bourguignon

Projet Ecleir - Feder – Subvention Région Alsace (2012 – 2014)

L. Désaubry

Projet Cardioregeneration – Subvention Région Alsace (2012 – 2014)

XIII. Formation permanente

Néant.

XIV. Organisation de congrès

J. Suffert, M. Donnard

FACS XV à Avignon (french American Chemical Society XV) 1-5 juin 2014

G. Blond

GECO : Groupe d’Etude de Chimie Organique, GECO 55, Samatan, août 2014

M. Donnard, F. Bihel, C. Vonthron

Journée Campus Illkirch sur l’imagerie médicale 7-8 avril 2014

D. Rognan

Strasbourg 4th Summer School on Chemoinformatics: CheminfoS3 , Strasbourg, France, 23-27 Juin 2014

D. Rognan

5th French-Japanese Workshop on Computational Methods in Chemistry, Strasbourg, 30 June-1st July

2014

XV. Thèses soutenues

M. Charavin, Doctorat de l’Université de Strasbourg

"Synthèse d’agonistes non-peptidiques du récepteur de la prokineticine »

22 Septembre 2014.

E. Blaise, Doctorat de l’Université de Strasbourg

Page 42: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

"Contribution à l'étude chimique et pharmacochimique de dérivés mono- bi- et tricycliques de

pyridazines"

26 septembre 2014

I Karpenko, Doctorat de l’Université de Strasbourg

«Conception, synthèse et évaluation de sondes fluorescentes et de radioligands TEP des récepteurs de

l’ocytocine et de la vasopressine»

16 octobre 2014

XVI. HDR soutenues

G. Blond

« La cyclocarbopalladation 4-exo-dig : un puissant outil pour la synthèse de châssis moléculaires

complexes »

18 novembre 2014

D. Bonnet

« Chemobiologie des récepteurs couplés aux protéines G : conception et synthèse de sondes moléculaires

pour une application mécanistique et thérapeutique »

15 décembre 2014

XVII. Distinctions

M Hibert

Membre titulaire de l’Académie Nationale de Pharmacie

17 Décembre 2014

Page 43: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

LABORATOIRE DE BIOPHOTONIQUE ET PHARMACOLOGIE

UMR CNRS 7213

Directeur : Yves MELY

Equipe 1 : BIOPHOTONIQUE DES INTERACTIONS MOLECULAIRES ET CELLULAIRES

Responsable : Yves MELY

Equipe 2 : SIGNALISATION TUMORALE ET CIBLES THERAPEUTIQUES Responsable : Monique DONTENWILL

Equipe 3 : PHARMACOLOGIE EXPERIMENTALE ET THERAPEUTIQUE Responsable : Valérie SCHINI-KERTH

Domaine de Sciences de la vie et de la santé

recherche :

Composante : Faculté de Pharmacie

Directeur : Yves MELY

Faculté de Pharmacie 74 route du Rhin CS 60024 67401 ILLKIRCH CEDEX Tél. 03 68 85 42 78 secrétariat Fax 03 68 85 43 13 E-mail: [email protected]

Site web: http://www-lbp.unistra.fr

Mot-clés : Biophysique, imagerie cellulaire, microscopies de fluorescence quantitatives et de haute

résolution, fluorophores sensibles à l’environnement, interactions moléculaires ; biologie

cellulaire, glioblastomes, intégrines, FAK, Pharmacologie cellulaire et moléculaire , biochimie,

biologie moléculaire, athérosclérose, LRP1, polyphénols.

Thèmes de Y. MELY : Physique et chimie pour l’imagerie et la vectorisation ; Protéines virales : recherche :

structures et interactions. M. DONTENWILL : Intégrine alpha5beta1, un marqueur diagnostique, pronostique et une cible thérapeutique pour les tumeurs solides ; FAK et tumorigénèse ; Signalisation intégrée. V. SCHINI-KERTH : Physiopathologie cardiovasculaire ; Régulation de l’angiogenèse vasculaire et tumorale : mécanismes épigénétiques et polyphénols ; Physiopathologie des maladies métaboliques.

Page 44: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Résumé des activités de recherche, pour 2014, par équipe : L’objectif général de l’UMR 7213 CNRS est d’étudier des cibles biologiques d’intérêt thérapeutique potentiel, par des approches multi-disciplinaires à des échelles allant du moléculaire jusqu'à l’animal entier, afin de mieux comprendre les mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués dans diverses pathologies et proposer ainsi de nouvelles pistes thérapeutiques. Le laboratoire comprend près de 150 personnes à l’année, dont une soixantaine de statutaires, réparties en trois équipes : • Equipe 1 : Biophotonique des interactions moléculaires et cellulaires • Equipe 2 : Signalisation tumorale et cibles thérapeutiques • Equipe 3 : Pharmacologie expérimentale et thérapeutique Les activités de l’équipe Biophotonique des interactions moléculaires et cellulaires (responsable Y. Mély) se situent à l’interface biophysique/biologie/chimie. Ces activités, fondées sur l’étude, par des méthodes de fluorescence, des interactions biomoléculaires en solution et en milieu cellulaire, font de l’équipe une référence dans les domaines de la fluorescence et de la protéine de la nucléocapside de VIH-1. Deux axes de recherche principaux sont développés en synergie.

Le premier axe (resp. A. Klymchenko) porte sur le développement de techniques et de méthodologies en vue de caractériser des interactions entre molécules d’intérêt biologique en solution et en milieu cellulaire. Dans ce cadre, nous avons développé des techniques d’imagerie quantitative, incluant un microscope à deux photons combinant la spectroscopie à corrélation de fluorescence (FCS) et l’imagerie par temps de vie de fluorescence (FLIM), ainsi qu’un microscope de molécule unique. Plus récemment, nous avons développé des systèmes avancés d’imagerie à haute résolution, comprenant un microscope PALM/STORM, un microscope STED et une combinaison microscopie à force atomique et microscopie à réflexion totale interne en fluorescence. Ces systèmes avancés permettent d’obtenir des images avec une résolution nanométrique, nous donnant ainsi accès à des détails d’une finesse sans précédent dans les systèmes biologiques que nous étudions. Ces instruments de très haute performance sont au centre de nombreux projets, tant en interne qu’en collaboration avec des équipes externes. En parallèle, nous avons une importante activité de développement de sondes fluorescentes. En nous basant sur des colorants sensibles à l’environnement, nous avons développé des sondes et des analogues d’acides aminés fluorescents, dans le but d’étudier des peptides viraux, des peptides cellules-perméants et des liaisons ligands/récepteurs cibles (en collaboration avec l’UMR 7200). Ces sondes ont également été utilisées avec succès pour caractériser des particules virales et des émulsions lipidiques à applications biomédicales. Nous avons également développé de nouvelles nanoparticules organiques fluorescentes, en particulier des nanoparticules polymériques de PLGA encapsulant des rhodamines ou des pérylène diimides, présentant une excellente brillance, une alternance éteint/allumé sur l’ensemble de la particule et une faible toxicité. Nous avons aussi développé des gouttelettes lipidiques hautement brillantes pour le suivi de particules uniques dans le poisson zèbre (en collaboration avec l’UMR 7199). Sur la base de nos développements instrumentaux et de sondes fluorescentes, nous avons pu réaliser un grand nombre de collaborations avec des laboratoires de l’IGBMC, IBPM, IBMC et ESBS, pour résoudre de nombreuses questions biologiques.

Le second axe de recherche (resp Y. Mély et H. de Rocquigny) repose sur les applications de ces techniques et méthodologies à des problématiques biologiques, notamment dans le cas de protéines virales de VIH-1. Une part importante de nos activités a porté sur la protéine de la nucléocapside de VIH-1 (NCp7 libre ou en tant que domaine de la polyprotéine Gag), qui joue un rôle clé dans le cycle viral de HIV-1. Nous avons poursuivi la caractérisation du mécanisme de liaison et des propriétés chaperonnes des acides nucléiques. Nous nous sommes également intéressés au devenir de la NCp7 dans les cellules, ainsi qu’à son rôle dans le mécanisme d’assemblage des particules virales. Par ailleurs, nous avons mis en évidence plusieurs partenaires cellulaires qui pourraient être recrutés par cette protéine virale au cours des différentes étapes du cycle. Tous ces récents résultats soulignent l’importance de la NCp7 dans le pouvoir infectieux du VIH et la désigne comme une cible essentielle pour le développement de molécules anti-virales. Nous poursuivons donc, dans le cadre d’un consortium européen, la recherche d’inhibiteurs de cette protéine. Une série de molécules chefs de file, capable d’inhiber le cycle viral, a été identifiée. Nos

Page 45: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

travaux ont également permis de montrer que les interactions dynamiques de la protéine Tat avec ses acides nucléiques cibles sont essentielles pour ses fonctions dans le cycle viral. Nous avons également un axe de recherche sur la protéine UHRF1, une protéine modulatrice en épigénétique, pour laquelle nous caractérisons le mécanisme d’action et les interactions avec divers partenaires cellulaires.

Les recherches de l’équipe Signalisation tumorale et cibles thérapeutiques (responsable : M.

Dontenwill) concernent la caractérisation de cibles thérapeutiques en oncologie. Elles reposent sur deux axes thématiques complémentaires, dont le but est de caractériser les fonctions des intégrines et de la FAK (Focal Adhesion Kinase) dans les cellules normales et tumorales. Les aspects fondamentaux de l’axe intégrine/FAK sont explorés dans l’agressivité tumorale, dans la migration et l’invasion cellulaires et dans la résistance aux thérapies :

Le premier axe concerne les intégrines et le cancer, en s'intéressant à l’intégrine α5β1 (ou récepteur à la fibronectine) comme cible thérapeutique pour certaines tumeurs solides. Nous combinons une exploration moléculaire et fonctionnelle de cette intégrine et d’un de ses régulateurs intracellulaires, la cavéoline-1, avec une recherche translationnelle vers la clinique humaine. Notre projet de recherche veut aboutir à la proposition d’une nouvelle signature moléculaire pour les tumeurs cérébrales et de thérapies ciblées originales anti-tumorales. Il se divise en quatre parties complémentaires : (i) la validation de l’intégrine α5β1 comme marqueur diagnostique et cible thérapeutique dans les tumeurs cérébrales et la caractérisation de nouveaux antagonistes spécifiques ; (ii) la caractérisation de l’intégrine α5β1 comme un acteur des résistances innée et acquise aux thérapies anti-cancéreuses ; (iii) l’exploration des effets de la cavéoline-1 et de l’intégrine α5β1 sur la progression tumorale ; (iv) l’étude des interactions entre intégrine α5β1 et autres cibles thérapeutiques des tumeurs cérébrales (récepteur à l’EGF, au VEGF). Nos études sont menées de façon parallèle sur des lignées cellulaires tumorales in vitro et des xénogreffes de biopsies humaines in vivo. Nous avons en particulier démontré in vitro et in vivo l’intérêt d’une association antagoniste d’intégrine/chimiothérapie pour induire la mort des cellules tumorales par apoptose, ouvrant ainsi de nouvelles perspectives thérapeutiques. Les travaux en cours permettent également de suggérer une implication de l’intégrine α5β1 dans la résistance à une thérapie ciblant le récepteur à l’EGF. Une démarche originale de caractérisation de nouveaux antagonistes de l’intégrine α5β1 a abouti à la proposition de plusieurs molécules pouvant être valorisées. Des molécules aptamères ARN ciblant l’intégrine α5β1 ont également été caractérisées et seront utilisées comme sondes d’imagerie de tumeurs exprimant l’intégrine in vitro et in vivo. L’expression différentielle de l’intégrine dans certaines tumeurs cérébrales de haut grade pourrait provenir d’une hétérogénéité inhérente des cellules souches tumorales. Une relation cavéoline-intégrine a également été mise en évidence dans les tumeurs des VADS. Toutes ces données fondamentales nous permettent de proposer des thérapies innovantes pour des populations stratifiées de patients dans une démarche de médecine translationnelle et personnalisée.

Le deuxième axe (responsable : P. Rondé) concerne le rôle du microenvironnement tumoral dans le contrôle des processus de migration et d’invasion cellulaire. Notre projet de recherche veut aborder trois aspects fondamentaux et complémentaires du processus d’invasion tumoral : (1) l’étude des mécanismes régulant la polarité cellulaire ; (2) la caractérisation des voies de signalisation et des mécanismes moléculaires de la mécanotransduction ; (3) l’étude de la dynamique et de l’activité des invadopodes. Nos recherches sont centrées, dans un premier temps, sur la protéine kinase FAK (Focal Adhesion Kinase), qui joue un rôle fondamental dans la progression de nombreux cancers. FAK est une protéine cytoplasmique ubiquitaire retrouvée notamment au sein des complexes d’adhérence, structures hautement dynamiques permettant la motilité cellulaire. Grâce au développement de plusieurs techniques résolutives de microscopie, dont la microscopie de force de traction couplée à l’utilisation de mutants de FAK ayant différents niveaux de phosphorylation, nous avons montré que FAK est un commutateur moléculaire permettant soit le désassemblage des adhérences focales, soit la formation de lamellipodes via différentes voies de signalisation. Nous avons également mis en évidence une interaction de FAK avec un moteur moléculaire essentiel au maintien de la polarité cellulaire. Enfin, nous avons étudié le rôle de FAK dans la formation des invadopodes des mélanomes de souris. Les invadopodes sont des structures cellulaires qui se forment dans les cellules tumorales à fort potentiel invasif comme les mélanomes ou les carcinomes mammaires. Nos données permettent de proposer un modèle suivant lequel en fonction de signaux du microenvironnement tumoral, FAK oriente la machinerie cellulaire vers une voie migratoire ou invasive. Parallèlement, nos travaux en cours visent à rechercher des inhibiteurs d’interactions protéiques

Page 46: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

essentielles au processus invasif. Ainsi, nos données montrent que l’inhibition des interactions FAK-paxillin altère la dynamique des adhérences focales et diminue la migration et l’invasion cellulaire. Nos observations contribueraient à une meilleure compréhension de la motilité accrue de certaines cellules tumorales. L’objectif de l’équipe Pharmacologie expérimentale et thérapeutique (responsable V. Schini-Kerth) est

l’acquisition d’informations innovantes et pertinentes concernant les mécanismes moléculaires et

cellulaires impliqués dans l’initiation et le développement de pathologies cardiovasculaires majeures,

comme l’athérothrombose, l’hypertension artérielle, le diabète, ainsi que le vieillissement. Les recherches

de l’équipe reposent sur deux axes principaux et incluent des investigations allant de la cellule jusqu’à

l’animal entier.

Le premier axe de recherche (responsable V. Schini-Kerth) s’intéresse aux mécanismes impliqués dans

l’altération de la fonction endothéliale en condition physiologique et physiopathologique, et évalue le

potentiel protecteur de produits naturels sur la fonction endothéliale. L’endothélium régule finement

l’homéostasie vasculaire par le biais de nombreux facteurs, parmi lesquels les facteurs vasorelaxants, tels

que le monoxyde d’azote (NO) ou le facteur hyperpolarisant dérivé de l’endothélium (EDHF), et les

facteurs vasoconstricteurs. Le moindre déséquilibre de cette délicate balance entre facteurs vasorelaxants

et vasoconstricteurs aboutit à une dysfonction endothéliale, caractérisée par une diminution de la

relaxation vasculaire induite par l’endothélium et l’induction d’une réponse pro-inflammatoire. Bien

qu’initialement décrite dans l’hypertension artérielle et l’athérothrombose, cette dysfonction endothéliale

est associée à un nombre plus large de situations physiologiques et physiopathologiques, parmi lesquelles

figurent le vieillissement vasculaire, l’obésité, les diabètes de type I et II, les dyslipidémies et le syndrome

coronarien. L’apparition de la dysfonction endothéliale est associée à l’émission de microparticules à

activités pro-inflammatoires, pro-apoptotiques et pro-coagulantes dans la circulation sanguine. L’équipe a

montré que les certains produits naturels en particulier des produits riches en anthocyanes ou en oméga 3

stimulent l’activation de la fonction endothéliale dans des modèles cellulaires in vitro, des organes isolés

ex vivo, et des modèles in vivo. Les effets bénéfiques des produits actifs sur la fonction endothéliale sont

principalement dus à la formation endothéliale soutenue de NO et, à un degré moindre, d’EDHF. La

caractérisation des mécanismes impliqués a indiqué un rôle déterminant de la voie de signalisation redox-

sensible impliquant la voie Src/PI3-kinase/Akt aboutissant à l’activation par phosphorylation de la NO

synthase endothéliale (eNOS), de certains motifs structuraux polyphénoliques et de certaines formulations

d’oméga 3 dans l’activation de la fonction endothéliale. De plus, la capacité de produits naturels à

prévenir et/ou améliorer la dysfonction endothéliale a pu être mise en évidence dans plusieurs modèles in

vivo de pathologies cardiovasculaires associées à une dysfonction endothéliale, et qu’elle implique leur

capacité à retarder l’induction de la sénescence endothéliale. En effet, certains produits naturels sont

capables de retarder l’induction d’une sénescence endothéliale en prévenant l’apparition d’une diminution

progressive de la formation endothéliale de NO, de l’induction d’un stress oxydant, et de la formation de

microparticules pro-sénescentes. Une cible majeure de l’effet bénéfique des produits naturels est la

suractivation du système angiotensine local et de son récepteur AT1 dans la paroi artérielle pathologique,

dont la normalisation prévient la formation de microparticules pro-sénescentes. L'analyse des propriétés et

de l'origine cellulaire des microparticules circulantes chez les patients atteints de complications

cardiovasculaires a montré en les comparant avec celles de volontaires sains que ces microparticules pro-

sénescentes sont spécifiquement porteuses de caractéristiques pro-thrombotiques, comme une forte

activité facteur tissulaire. L’utilisation combinée de modèles animaux et cellulaires avec l’utilisation de

sondes lipidiques développées dans l’équipe 1, a montré que les agents pro-inflammatoires ou infectieux

comme le TNF-alpha ou le LPS induisent in vivo ou in vitro des remodelages de la membrane plasmique

caractéristiques et la génération de microparticules dont les propriétés d’effecteur cellulaire sont

spécifiques de l’agoniste et accessibles à un contrôle pharmacologique.

Le deuxième axe (responsable : P. Boucher) traite de la physiopathologie de l’athérosclérose, à l’origine

de la plupart des maladies cardiovasculaires. Les maladies cardiovasculaires représentent 30% de la

Page 47: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

mortalité dans le monde, et parmi ces pathologies, la principale est une inflammation chronique de la paroi

des vaisseaux, l’athérosclérose. Chez la souris, l’athérosclérose peut être reversée expérimentalement en

diminuant le taux de lipides circulants. Classiquement, cette régression correspond à une diminution du

cholestérol dans les cellules spumeuses qui migrent hors de la plaque et à une diminution de l’état

inflammatoire. Même si l’on ne connaît pas encore les mécanismes moléculaires à l’origine de cette

réponse, le développement de molécules visant à limiter ou à faire régresser l’accumulation de cholestérol

sont d’un intérêt thérapeutique majeur pour la prise en charge des patients. Par des études chez la souris

génétiquement modifiée, nous avons caractérisé les mécanismes physiopathologiques par lesquels LRP1

protège contre l'athérosclérose. Nous avons montré que LRP1 protège contre l’hyperplasie de la paroi

vasculaire et la formation de cellule spumeuses. LRP1 stimule un ligand de la voie Wnt, Wnt5a que nous

avons identifié comme un inhibiteur de l’accumulation intracellulaire du cholestérol. Notre objectif est

d’évaluer le potentiel thérapeutique de Wnt5a et de molécules "Wnt5a-like" dans l’athérosclérose.

Nous avons également montré que la voie de signalisation LRP1/Wnt5a jouait un rôle important dans la

calcification de la plaque d'athérosclérose en stimulant dans les cellules musculaires lisses une voie Wnt5a

prochondrogénique. Cette voie est inhibée par un antagoniste de Wnt5a, sFRP2, que nous avons identifié

comme étant un gène cible de PPARγ. Ainsi, les agonistes de PPARγ sont d’un intérêt thérapeutique

potentiel pour la prévention de la calcification vasculaire, à l’origine de l’instabilité de la plaque.

Nous travaillons également sur le rôle physiopathologique d’un partenaire de LRP1, la protéine

adaptatrice ShcA. ShcA se fixe au niveau d’un résidu tyrosine du motif NPxY du domaine cytoplasmique

de LRP1. Nous avons montré que ShcA est essentiel à l’adipogenèse, et que son invalidation dans le

myocarde modifie le complexe costamère et entraine une insuffisance cardiaque sévère.

Page 48: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Liste du personnel affecté en 2014 à l’Unité :

EQUIPE 1 :

BIOPHOTONIQUE DES INTERACTIONS MOLECULAIRES ET CELLULAIRES (resp. Y. Mély)

ANTON Halina CR2 CNRS

ARNTZ Youri MC Unistra (HDR)

BOUDIER Christian CR1 INSERM (HDR)

BOUTANT Emmanuel MC Unistra

COLLOT Mayeul CR2 CNRS

DARLIX Jean-Luc DRCE émérite CNRS (HDR)

de ROCQUIGNY Hugues CR1 INSERM (HDR)

DIDIER Pascal MC Unistra

DUPORTAIL Guy DR2 émérite CNRS (HDR)

GODET Julien MC PH Unistra/HUS

KLYMCHENKO Andrey DR2 CNRS (HDR)

LESSINGER Jean-Marc PUPH2 Unistra/HUS (HDR)

MELY Yves PRCE2 Unistra (HDR)

MOUSLI Marc CR1 CNRS (HDR)

PRZYBILLA Frédéric MC Unistra

REAL Eleonore MC Unistra

REISCH Andreas MC Unistra

SCHNEIDER Claude MCHC Unistra

HUMBERT Nicolas IE2 CNRS

RICHERT Ludovic IR2 CNRS

************

SHARMA Kamal Kant Post-doctorant

ANDREIUK Bohdan Doctorant

ASHRAF Waseem Doctorant

BOUCHAALA Redouane Doctorant

EL MEKDAD Hala Doctorante

ELMESHRI Salahedin Doctorant

GHOSE Avisek Doctorant

GLUSHONKOV Oleksandr Doctorant

KARNIB Hassan Doctorant

KEMPF Noémie Doctorante

KILIN Vasyl Doctorant

KOVALENKO Lesia Doctorante

KREDER Rémy Doctorant

LYSOVA Iryna Doctorante

PIRES Manuel Doctorant

SHARMA Rajhans Doctorant

SHOLOKH Marianna Doctorante

SHULOV Ievgen Doctorant

TAHA Nedal Doctorante

TROFYMCHUK Kateryna Doctorante

ZGHEIB Sarwat Doctorante

Page 49: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

EQUIPE 2 :

SIGNALISATION TUMORALE ET CIBLES THERAPEUTIQUES (resp. M. Dontenwill)

ANDRE Philippe MCHC Unistra (HDR)

CHOULIER Laurence CR1 CNRS

DE MEY Jan PR1 Unistra (HDR)

DONTENWILL Monique DR2 CNRS (HDR)

DUJARDIN Denis MC Unistra

ETIENNE-SELLOUM Nelly MC Unistra

GIES Jean-Pierre PRCE Unistra (HDR)

KERAVIS Thérèse CR1 INSERM

LEHMANN Maxime PR2 Unistra (HDR)

LELONG-REBEL Isabelle CR1 Unistra (HDR)

LUGNIER Claire DR1 émérite CNRS (HDR)

MARTIN Sophie CR1 CNRS

RONDE Philippe CR1 CNRS (HDR)

SICK Emilie MC Unistra

TAKEDA Kenneth DR1 CNRS (HDR)

CARL Philippe IR2 CNRS

NOULET Fanny IE2 CNRS

STEFFAN Tania TCN CNRS

***********

CARRE Gaëlle Post-doctorante

KRIFA Mounira Post-doctorante

RAY Anne-Marie Post-doctorante

SCHAFFNER Florence Post-doctorante

BLANDIN Anne-Florence Doctorante

RENNER Guillaume Doctorant

EQUIPE 3 :

PHARMACOLOGIE EXPERIMENTALE ET THERAPEUTIQUE (resp. V. Schini-Kerth)

AUGER Cyril CR2 CNRS (HDR)

BERETZ Alain PRCE Unistra (HDR)

BOUCHER Philippe PR2 Unistra (HDR)

BRUBAN-SCHANN Véronique MC Unistra

BUCHER Bernard DR2 CNRS (HDR)

FUHRMANN Guy CR1 CNRS

KERTH Paul PR PAST Unistra

MATZ-WESTPHAL Rachel MC Unistra

OSWALD Monique PH HUS (HDR)

SCHINI-KERTH Valérie PRCE Unistra (HDR)

TERRAND Jérôme MC Unistra

TOTI Florence PR2 Unistra (HDR)

Page 50: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

VAN OVERLOOP Bruno MCHC Unistra (HDR)

CHABERT Philippe IR2 CNRS

JUSTINIANO Hélène TCN CNRS

LACOFFRETTE Evelyne TCE CNRS

POLLET Brigitte AJT CNRS

HOST Lionel Technicien CDD Unistra

**************

ALHOSIN Mahmoud Post-doctorant

BURBAN Mélanie Post-doctorante

LEÓN GONZÁLEZ Antonio José Post-doctorant

AL ZAIDAWI Sejad Doctorant

AMISSI Said Doctorant

BOPP Claire Doctorante

HANNON Raed Doctorant

JENTY Marion Doctorante

JESEL Laurence Doctorante

KASSEM Mohamad Doctorant

KHEMAIS Sonia Doctorante

NGUYEN Phuong Nga Doctorante

NIAZI Zahid Rasul Doctorant

RASHID Sherzad Doctorant

ZGHEEL Faraj Doctorant

SERVICES COMMUNS :

BARTHEL Ingrid TCS CNRS

FOUR Ludovic AI CNRS

MORCIANO Michel AI CNRS

VAUCHELLES Romain IE2 CNRS

WERNERT Marlyse AI CNRS

Page 51: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Production

I. Articles dans des revues internationales ou nationales avec comité de

lecture répertoriées par l’AERES ou dans les bases de données

internationales

• Attia, M.F.; Anton, N.; Chiper, M.; Akasov, R.; Anton, H.; Messaddeq, N.; Fournel, S.; Klymchenko,

AS.; Mély, Y.; Vandamme, T.F. Biodistribution of X-ray iodinated contrast agent in nanoemulsions is controlled by the chemical nature of the oily core. ACS Nano 2014, 8, 10537-10550.

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• Baratli, Y.; Charles, A.L.; Wolff, V.; Ben Tahar, L.; Smiri, L.; Bouitbir, J.; Zoll, J.; Sakly, M.; Auger, C.; Vogel, T.; Abdelmelek, H.; Teourbi, O.; Geny, B. Age modulates Fe3O4 nanoparticles liver toxicity: dose-dependent decrease in mitochondrial respiratory chain complexes activities and coupling in middle-aged as compared to young rats. BioMed Res. Int. 2014, 474081.

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• Zamotaiev, O.M.; Postupalenko, V.Y.; Shvadchak, V.V.; Pivovarenko, V.G.; Klymchenko, A.S.; Mely, Y. Monitoring penetration interactions with lipid membranes and cell internalization using a new hydration-sensitive fluorescent probe. Org. Biomol. Chem. 2014, 12, 7036-7044.

• Zargarian, L.; Tisne, C.; Barraud, P.; Morrellet, N.; Rene, B.; Mely, Y.; Fosse, P.; Mauffret, O. Dynamics of linker residues modulate the nucleic acid binding properties of the HIV-1 nucleocapsid protein zinc fingers. PLoS One 2014, 9, e102150.

• Zgheel, F.; Alhosin, M.; Rashid, S.; Burban, M.; Auger, C.; Schini-Kerth, V.B. Redox-sensitive induction of Src/PI3-kinase/Akt and MAPKs pathways activate eNOS in response to EPA:DHA 6:1. PLoS One 2014, 9, e105102.

Page 55: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

CLASSEMENT DES REVUES ET DES PUBLICATIONS

2014

(nombre total : 56 publications, dont 54 classées)

Facteur d’impact >10 5 à 10 2 à 5 1 à 2 <1 non

classées

Nbre de Journaux 3 13 24 4 0 2

Nbre de Publications 3 16 31 4 0 2

% des publications

figurant dans le Journal

Citation Reports

5,36 28,57 55,36 7,14 0 3,57

II. Articles dans des revues internationales ou nationales avec comité de

lecture NON répertoriées par l’AERES ou dans les bases de données

internationales

C. AUGER & V.B. SCHINI-KERTH. Potentiel des polyphénols à améliorer la protection vasculaire en stimulant la fonction endothéliale. Cahiers de nutrition et de diététique 49, 160-172, 2014.

III. Articles dans des revues sans comité de lecture

Néant.

IV. Brevets

C. LUGNIER, S. MULLER, F. MONNEAUX & J.J. BOURGUIGNON. Traitement du lupus et inhibiteurs de

PDE4. Brevet d'invention (PCT) au CANADA n 2645093 du 6 mars 2007 délivré le 13 mai 2014.

V. Communications avec actes

Internationales

Néant.

Nationales

Page 56: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

C. AUGER, B. POLLET, C. MARX, D. BENCHABANE & V.B. SCHINI-KERTH. Polyphenol-rich

blackcurrant juice induces NO-mediated relaxation in porcine coronary artery rings via a copper- and iron-

dependent redox-sensitive activation of the Src/PI3-kinase/Akt/eNOS pathway. Printemps de la

Cardiologie, Strasbourg, 24-25 avril 2014. Arch. Cardiovasc. Dis. 6, Suppl. 1, 0179, 2014

VI. Communications orales sans actes

G. CARRE, J. PELUSO, C.D. MULLER, J.P. GIES, V. KELLER, N. KELLER & P. ANDRE. Détermination

de l’efficacité antibactérienne du TiO2 par cytométrie. 10ème

congrès de la Société française de

microbiologie, Paris, 31 mars – 1er

avril 2014

C. GLEIZES, A. CONSTANTINESCU, M. ABBAS, B. YVER, L. KESSLER & F. TOTI. Liraglutide protects

β cells from proinflammatory tissue factor bearing microparticles, interest for pancreatic islets

transplantation. Journées du campus d’Illkirch (JCI 2014), Illkirch, 7-8 avril 2014

J. GODET, M. BONGIOVANNI, M. PALAYRET, L. TOSATTO, D. KLENERMAN & S.F. LEE. Mapping

hydrophobicity in biological sample with 40nm resolution. Congrès de la Société Française de

Biophysique, Guéthary, 10-13 novembre 2014

I.A. KARPENKO, A.S. KLYMCHENKO, R. KREDER, B. MOUILLAC, Y. MELY, M. HIBERT & D. BONNET.

Red fluorescent turn-on ligands for G protein-coupled receptors in living cells. Journées du campus

d’Illkirch (JCI 2014), Illkirch, 7-8 avril 2014

A.S. KLYMCHENKO, A. REISCH, P. DIDIER, L. RICHERT, S. ONCUL, Y. ARNTZ & Y. MÉLY. Minimized

self-quenching and collective switching of hundreds of dyes inside polymer nanoparticles. XXVth IUPAC

Symposium on Photochemistry, Bordeaux, 13-18 juillet 2014

R. KREDER, Z. DARWICH, O.A. KUCHERAK, Y. MELY & A.S. KLYMCHENKO. Solvatochromic probes

with FRET quencher detect selectively ordered and disordered phases in plasma membranes of living

cells. Journées du campus d’Illkirch (JCI 2014), Illkirch, 7-8 avril 2014

G. RENNER, H. JANOUSKOVA, A.M. RAY, F. NOULET, L. CHOULIER, N. ETIENNE-SELLOUM, M.

LEHMANN, I. LELONG-REBEL, S. MARTIN & M. DONTENWILL. Targeting α5β1 integrin improves the

pro-apoptotic arm of p53 activation in glioblastoma. Journées du campus d’Illkirch (JCI 2014), Illkirch, 7-8

avril 2014

P. RONDE & P. CARL. Microscopie de force de traction et dynamique de FAK. Ecole thématique

interdisciplinaire en MIcroscopie FOnctionnelle en BIOlogie (MiFoBio) du GDR2588, Seignosse, 4-10

octobre 2014

N. TAHA, S. ZGHEIB, K.K. SHARMA, E. REAL & Y. MELY. Study of the interaction between the HIV-1

nucleocapsid protein (NC) and the cellular protein Unr : implication on the viral IRES dependent

translation. Journées du campus d’Illkirch (JCI 2014), Illkirch, 7-8 avril 2014

VII. Communications par affiche

M. ABBAS, P.N. NGUYEN, G. SHALOM, T. PORTO RIBEIRO, L. JESEL, E. HAMADE, R. ABOU-MEHRI,

F. TOTI, V.B. SCHINI-KERTH & O. MOREL. Cyclosporine A prevents the induction of replicative

senescence in cultured coronary artery endothelial cells: role of eNOS-derived NO and the p53/p21 and

p16 pathways. Printemps de la Cardiologie, Strasbourg, 24-25 avril 2014

M. ABBAS, E. HAMADE, R. ABOU MERHI, V.B. SCHINI-KERTH, F. TOTI & O. MOREL. Microparticles

released by replicative senescence in cultured endothelial cells promote premature senescence

associated with an impaired NO formation and oxidative stress. European Society of Cardiology (ESC)

Congress 2014, Barcelone, Espagne, 30 août – 3 septembre 2014

Page 57: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

M. ABBAS, F. TOTI, V.B. SCHINI-KERTH, E. HAMADE, R. ABOU MERHI, & O. MOREL. Cyclosporine A

prevents replicative senescence-related endothelial dysfunction promoting pro-thrombotic and pro-

coagulant responses in cultured coronary artery endothelial cells: role of p66 Shc and p. European Society

of Cardiology (ESC) Congress 2014, Barcelone, Espagne, 30 août – 3 septembre 2014

S. AMISSI, J. BOISRAMÉ-HELMS, M. BURBAN, S. RASHID, C. AUGER, F. TOTI, F. MEZIANI & V.B.

SCHINI-KERTH. Lipid emulsions used in parenteral nutrition induce endothelial dysfunction in porcine

coronary artery rings: role of oxidative stress and cyclooxygenase-derived vasoconstrictors. Printemps de

la Cardiologie, Strasbourg, 24-25 avril 2014

S. AMISSI, J. BOISRAME-HELMS, M. BURBAN, S. RASHID, C. AUGER, F. TOTI, F. MEZIANI & V.B.

SCHINI-KERTH. Lipid emulsions used in parenteral nutrition induce endothelial dysfunction in porcine

coronary artery rings: role of oxidative stress and cyclooxygenase-derived vasoconstrictors. Journées du

campus d’Illkirch (JCI 2014), Illkirch, 7-8 avril 2014

C. BECK, C. BOEHLER, J. GUIROUILH-BARBAT, M.E. BONNET, G. ILLUZZI, P. RONDE, L.R.

GAUTHIER, N. MAGROUN, A. RAJENDRAN, B.S. LOPEZ, R. SCULLY, F.D. BOUSSIN, V. SCHREIBER

& F. DANTZER. PARP3 affects the relative contribution of homologous recombination and

nonhomologous end-joining pathways. Journées du campus d’Illkirch (JCI 2014), Illkirch, 7-8 avril 2014

A.F. BLANDIN, A.M. RAY, G. RENNER, S. MARTIN, L. CHOULIER, F. SCHAFFNER, I. LELONG-

REBEL, M. DONTENWILL & M. LEHMANN. Role of alpha5 beta1 integrin in EGFR oncogenic activity in

glioblastoma. Journées du campus d’Illkirch (JCI 2014), Illkirch, 7-8 avril 2014

A.F. BLANDIN, A.M. RAY, H. JANOUSKOVA, S. MARTIN, L. CHOULIER, F. SCHAFFNER, I. LELONG-

REBEL, M. DONTENWILL & M. LEHMANN. Role of alpha5 beta1 integrin in EGFR oncogenic activity in

glioblastoma. 5th French cell adhesion club symposium, Marseille,15-16 mai 2014

G. CARRE, E. HAMON, S. ENNAHAR, M.C. LETT, J.P. GIES, P. HORVATOVICH, V. KELLER, N.

KELLER & P. ANDRE. TiO2 photocatalysis damages lipids and proteins in Escherichia coli. Séminaire de

microbiologie de Strasbourg, Strasbourg, 3 avril 2014

L. CHOULIER, P. FECHTER, A.M. RAY, A.F. BLANDIN, G. RENNER, F. NOULET, N. ETIENNE-

SELLOUM, I. LELONG-REBEL, S. MARTIN, M. LEHMANN & M. DONTENWILL. Selection of RNA

aptamers against integrin α5β1. 8ème

forum du Cancéropôle Grand Est, Strasbourg, 20-21 novembre 2014

X. DELABRANCHE, J. BOISRAME-HELMS, P. ASFAR, A. BERGER, F. ZOBAIRI, T. LAVIGNE, L.

GRUNEBAUM, F. TOTI, F. MEZIANI & Y. MOOTIEN. Endothelial-derived microparticles contribute to

disseminate intra-vascular coagulopathy during septic shock. Printemps de la Cardiologie, Strasbourg, 24-

25 avril 2014

C. DOEBELIN, P. WAGNER, F. BIHEL, N. HUMBERT, C.A. KENFACK, Y. MELY, J.J. BOURGUIGNON &

M. SCHMITT. Fully regiocontrolled polyarylation of pyridine. Journées du campus d’Illkirch (JCI 2014),

Illkirch, 7-8 avril 2014

M. DONTENWILL, H. JANOUSKOVA, G. RENNER, A.M. RAY, F. NOULET, L. CHOULIER, N. ETIENNE-

SELLOUM, M. LEHMANN, I. LELONG-REBEL & S. MARTIN. Improved cytotoxic therapy by dual

targeting of α5β1 integrin and p53 pathway in glioblastoma. EACR, Munich, Allemagne, 2014

S. EL MESHRI, P. DIDIER, H. ANTON, L. RICHERT, Y. MELY & H. de ROCQUIGNY. Intracellular

localization of the HIV-1 Gag (NC) during the assembly of the viral particle: a quantitative fluorescence

microscopy approach. Journées du campus d’Illkirch (JCI 2014), Illkirch, 7-8 avril 2014

A. GHOSE, P. DIDIER, Y. MELY, O. MALTSEV, L. HINTERMANN, M. SLIWA, M. REBARZ, B.

KUKOVEC, & P. NAUMOV. pH dependent photophysical profile of oxyluciferin for biomedical applications.

Journées du campus d’Illkirch (JCI 2014), Illkirch, 7-8 avril 2014

Page 58: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

J. GODET, M. PALAYRET, M. BONGIOVANNI, D. KLENERMAN & S.F. LEE. Three-dimensional single-

molecule light-sheet microscopy using a double-helix point spread function. 1st Lightsheet fluorescence

microscopy international conference, Barcelone, Espagne, 25-26 septembre 2014

N. IDRIS KHODJA, T. PORTO RIBEIRO, G. SILVA, M. ABBAS, M. KHELOUFI, C. AUGER, J.O. LEE &

V.B. SCHINI-KERTH. Blackcurrant juice prevents endothelial dysfunction and vascular oxidative stress in

the mesenteric artery of cirrhotic rats with hepatopulmonary syndrome. Printemps de la Cardiologie,

Strasbourg, 24-25 avril 2014

V. KILIN, N. BARTHES, F. GRANGER, C. BOUDIER, C. BIRCK, M. RUFF, A. BURGER & Y. MELY. DNA

epigenetic modification monitored by new fluorescence based tools. Journées du campus d’Illkirch (JCI

2014), Illkirch, 7-8 avril 2014

K. KOLLI-BOUHAFS, E. SICK, F. NOULET, J.P. GIES, J. DE MEY & P. RONDE. Opposite role of FAK in

migration and invasion of melanoma cells. 6ème

Forum du Canceropole Grand-Est, Strasbourg 14-15

novembre 2014

I. LYSOVA, H. ANTON, J. GODET, P. DIDIER, F. PRZYBILLA, C. SPIEGELHALTER & Y. MELY.

Intracellular distribution of HIV-1 nucleocapsid protein. Journées du campus d’Illkirch (JCI 2014), Illkirch,

7-8 avril 2014

Y. MELY, V. KILIN, O. GLUSHONKOV, L. RICHERT & A. KLYMCHENKO. ESIPT-based fluorescent

probe for imaging lipid domains in membranes. 248th ACS National meeting, San Francisco, Etats-Unis,

10-14 août 2014

M. MLIH, L. HOST, S. MARTIN, N. NIEDERHOFFER, L. MONASSIER, J. TERRAND, N. MESSADDEQ,

M. RADKE, M. GOTTHARDT, V. BRUBAN-SCHANN, F. KOBER, M. BERNARD, E. CANET-SOULAS, P.

BOUCHER & R. MATZ-WESTPHAL. ShcA is required for the spatial organization of the costamere/Z-disk

network during heart development. Printemps de la Cardiologie, Strasbourg, 24-25 avril 2014

P.N. NGUYEN, M. ABBAS, S. PERRIER, T. PORTO RIBEIRO, E. EPAILLY, O. MOREL, J.P.

MAZZUCOTELLI, L. KESSLER, F. TOTI & V.B. SCHINI-KERTH. Levels of oxidative stress and markers

of senescence in the internal mammary artery of aged cardiac bypass surgery patients with respect to the

presence of hypertension and diabetes. Printemps de la Cardiologie, Strasbourg, 24-25 avril 2014

S. RASHID, N. IDRIS KHODJA, C. AUGER, M. ALHOSIN, N. BOEHM, M. OSWALD-MAMMOSSER &

V.B. SCHINI-KERTH. Blackcurrant juice prevents endothelial dysfunction and vascular oxidative stress in

the mesenteric artery of cirrhotic rats with hepatopulmonary syndrome. Printemps de la Cardiologie,

Strasbourg, 24-25 avril 2014

Z. RASUL, G.C. DA SILVA, T. PORTO RIBEIRO, F. ZGHEEL, C. AUGER & V.B. SCHINI-KERTH.

Chronic oral intake of the omega 3 optimized formulation EPA:DHA 6:1 protects against angiotensin II-

induced hypertension and endothelial dysfunction in rats. European Society of Cardiology (ESC)

Congress 2014, Barcelone, Espagne, 30 août – 3 septembre 2014

A.M. RAY, L. CHOULIER, M. LEHMANN, I. LELONG-REBEL, S. MARTIN, L. BRINON, P. VILLA, D.

ROGNAN & M. DONTENWILL. In silico screening and cell-based assay for identification of α5β1 integrin

allosteric antagonists, 5th French cell adhesion club symposium, Marseille,15-16 mai 2014

G. RENNER, H. JANOUSKOVA, A.M. RAY, F. NOULET, L. CHOULIER, N. ETIENNE-SELLOUM, M.

LEHMANN, I. LELONG-REBEL, S. MARTIN & M. DONTENWILL. Targeting α5β1 integrin improves the

pro-apoptotic arm of p53 activation in glioblastoma, 5th French cell adhesion club symposium,

Marseille,15-16 mai 2014

K. TROFYMCHUK, A. REISCH, Y. MELY & A.S. KLYMCHENKO. Ultrabright switchable organic

nanoparticles. Journées du campus d’Illkirch (JCI 2014), Illkirch, 7-8 avril 2014

A.N. YAO, P. CHABERT, M. KAMAGATE, C. AUGER, H. DIE-KACOU & V.B. SCHINI-KERTH.

Chloroform extract of Phyllanthus amarus potentiates relaxation induced by isoproterenol on porcine

coronary artery rings. Journées du campus d’Illkirch (JCI 2014), Illkirch, 7-8 avril 2014

Page 59: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

F. ZGHEEL, M. ALHOSIN, S. RASHID, C. AUGER & V.B. SCHINI-KERTH. The EPA: DHA 6:1-evoked

endothelium-dependent NO-mediated relaxation in the coronary artery involves a copper-dependent pro-

oxidant response triggering the PI3-kinase/Akt-mediated activation of eNOS. Printemps de la Cardiologie,

Strasbourg, 24-25 avril 2014

S. ZGHEIB, H. ANTON, E. REAL & Y. MELY. Dynamic imaging (tracking) of cytoplasmic and nuclear HIV-

1 complexes. Journées du campus d’Illkirch (JCI 2014), Illkirch, 7-8 avril 2014

VIII. Conférences invitées

Conférences invitées dans un congrès national ou international

M. DONTENWILL. Projet INTEGLIO – Confirmation préclinique in vivo de l’intégrine alpha5beta1

/statut de p53 comme marqueurs prédictifs de la réponse au TMZ de

glioblastomes humains. Applications à une thérapie ciblée. 8e forum

Cancéropôle Grand Est, Strasbourg, 20-21 novembre 2014

C. LUGNIER. Les phosphodiestérases des nucléotides cycliques : cibles thérapeutiques

multimodales. Printemps de la Cardiologie : recherche fondamentale et clinique,

Strasbourg, 24-25 avril 2014

S. MARTIN. Pivotal role of caveolin-1 in metastasis of head and neck squamous cell

carcinoma 8e forum Cancéropôle Grand Est, Strasbourg, 20-21 novembre 2014

Y. MELY. Quantitative fluorescence imaging for monitoring intracellular interactions of HIV-

1 Proteins. XIth Advanced Imaging Methods workshop. Berkeley, Etats-Unis, 29-

31 janvier 2014

Y. MELY. Characterization of the properties and role of the HIV-1 nucleocapsid protein by

fluorescence based techniques, and use of the obtained information for

developing antiviral strategies. Vth European Workshop in Drug Synthesis,

Certosa di Pontignano, Sienne, Italie, 18-23 mai 2014

Y. MELY. Investigation of protein/nucleic acid interactions by fluorescence-based

techniques. 6th Physics of lipid matter: modern problems. Kiev, Ukraine, 23-25

mai 2014

Y. MELY. Site-selective characterization of protein-nucleic acid interactions by using

environment-sensitive nucleotide and amino-acid analogues. 9th international

Weber symposium, Kauai, Hawaii, Etats-Unis, 15-20 juin 2014

Y. MELY. Monitoring the intracellular dynamics and interactions of HIV-1 proteins by

quantitative fluorescence imaging techniques. 6th Advanced Optical Methods

Workshop, Shenzhen, Chine, 14-16 juillet 2014

Y. MELY. Environment-sensitive fluorescent amino-acid and nucleoside analogues for

monitoring protein-membrane and protein-nucleic acid interactions. Fluorescent

molecules and their building blocks: design and applications, La Jolla, Etats-

Unis, 6-9 août 2014

Y. MELY. Development of ESIPT-based fluorescent L-amino acid analogues: applications

in monitoring protein/ligand interactions. 248th ACS National meeting, San

Francisco, Etats-Unis, 10-14 août 2014

Y. MELY Environment sensitive fluorescent nucleoside analogues: applications in

protein/nucleic acid interactions. 41th International symposium on nucleic acids

chemistry, Kitakyushu, Japon, 5-7 novembre 2014

Page 60: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

V. SCHINI-KERTH. Potential of natural products to protect the vascular system in health and

diseases. 17th World congress of basic & clinical pharmacology (WCP 2014),

Capetown, Afrique du Sud, 13-18 juillet 2014

V. SCHINI-KERTH. Role of polyphenols in improving endothelial dysfunction in diabetes. SFRR-

Europe 2014 Meeting “Free radicals: insights in signaling and adaptative

homeostasis”, Paris, 5-7 septembre 2014

V. SCHINI-KERTH. Potential cardiovascular protective effects of fruit-derived polyphenols. 2014

International Symposium and Annual meeting "Lifelong health and Wellness

from Nutrition and Food", Daejeon, Corée du Sud, 27-29 octobre 2014

Conférences invitées hors congrès

M. DONTENWILL. Integrins as therapeutic targets in Oncology, workshop. Pierre Fabre R&D,

Toulouse, 24 avril 2014

M. DONTENWILL. Les Intégrines : cibles thérapeutiques en oncologie. De la recherche

fondamentale vers une application clinique. Université technologique de Troyes,

5 juin 2014

G. DUPORTAIL. 3-Hydroxyflavones fluorescent probes. A toolkit for biomembrane research.

West Bengal State University, Kolkata, Inde, 2 janvier 2014

Y. MELY. Characterization of the properties and role of the HIV-1 nucleocapsid protein by

fluorescence based techniques. Palladin Institute of Biochemistry, Kiev, Ukraine,

26 mai 2014

V. SCHINI-KERTH. Improvement of vascular health by nutrition-derived polyphenols and omega 3

PUFAs via an increased eNOS-derived NO formation. Future Wellness

Research – From Bench to Clinic, Séoul, Corée du Sud, 30 octobre 2014

IX. Ouvrages scientifiques (ou chapitres)

Ouvrages

Y. LANDRY & J.P. GIES. : Pharmacologie : des cibles à la thérapeutique – 3e édition. Dunod, Paris,

juin 2014 (500 pages). Cet ouvrage a été sélectionné par le Ministère de la Culture dans le cadre du

programme CAMPUS 2014-2015 et mis à disposition des étudiants d’Afrique francophone.

Chapitres d’ouvrages

P. CHABERT, C. AUGER, J. PINCEMAIL & V.B. SCHINI-KERTH. Overview of plant derived antioxidants.

In: Systems biology of free radicals and anti-oxidants (ed. I. Laher). Springer, Germany, Vol. 2, pp

4005-4022, 2014 (ISBN 978-3-64230-019-6)

A. CIMARELLI & J.L. DARLIX. HIV-1 reverse transcription. In: Human Retroviruses, Methods and

protocols, Methods in Molecular Biology (ed. E. Vicenzi, G. Poli). Humana Press, Springer, Vol. 1087,

pp 55-70, 2014 (ISBN 978-1-62703-669-6)

J. TABART, C. KEVERS, N. DARDENNE, V.B. SCHINI-KERTH, A. ALBERT, J. DOMMES, J.O.

DEFRAIGNE & J. PINCEMAIL. Chapter 30 - Deriving a global antioxidant score for commercial juices by

multivariate graphical and scoring techniques: applications to blackcurrant juice. In: Processing and

Page 61: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Impact on Antioxidants in Beverages (ed. V. Preedy). Academic Press, pp 301-307, 2014 (ISBN 978-

0-12-404738-9)

X. Ouvrages de vulgarisation (ou chapitres):

Néant.

XI. Direction d'ouvrages

XII. Autres publications

O. MOREL, M. ABBAS & V. SCHINI-KERTH. Letter by Morel et al regarding article “Ischemic

postconditioning during primary percutaneous coronary intervention: the effects of postconditioning on

myocardial reperfusion in patients with ST-segment elevation myocardial infarction (POST) randomized

trial”. Circulation 130, e53, 2014

Page 62: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

XIII. Autres activités internationales

M. LEHMANN : Editorial board du World Journal of Biological Chemistry (2013-)

Y. MELY : Chair of the Permanent Steering Committee of the Methods and Applications

in Fluorescence conference series (2011-)

Y. MELY : Editorial board de The protein journal (2011-)

Y. MELY : Editorial board de Open Journal of Biophysics (2011-)

Y. MELY : Editorial board de ISRN biochemistry (2011-)

Y. MELY : Editorial board de Peer J. (2012-2014)

Y. MELY : Editorial board de Conference papers in biology (2012-)

Y. MELY : Editorial board de Journal of Viruses (2012-)

Y. MELY : Editorial board de Biochemical Compounds (2012-)

Y. MELY : Editor in chief of Methods and Applications in Fluorescence (2012-)

P. RONDE : Editorial board de ISRN “Cell Biology” (2012-)

P. RONDE : Editorial board de “Journal of Cell Adhesion” (2012-)

Collaborations internationales en cours

- M. DONTENWILL : Collaboration avec le Pr H. KESSLER, Technische Universität München

(Allemagne).

- M. DONTENWILL : Collaboration avec le Pr M. HUMPHRIES, University of Manchester

(Royaume-Uni).

- M. DONTENWILL : Collaboration avec le Dr HEROLD-MENDE, University of Heidelberg

(Allemagne).

- J. GODET. Core programme FN. Host-microbes interactions via bacterial extracellular small

RNAs. Collaboration avec J. Fritz, Luxembourg Centre for Systems Biomedicine, Université de

Luxembourg (2014/2016)

- M. LEHMANN. Collaboration avec le Pr. Gyorgy VEREB, University of Debrecen (Hongrie)

- Y. MELY. PHC franco-ukrainien Dnipro (2013-14). Analyse dynamique et mécanistique de la

protéine de la nucléocapside de VIH-1 en interaction avec ses ligands: suivi site-sélectif par des

sondes fluorescentes sensibles à l’environnement. Collaboration avec le Pr O. ZAPOROZHETS,

Université Nationale Taras Chevchenko de Kiev.

- Y. MELY. Projet européen Thinpad 2012-15. FP7-HEALTH-2013-INNOVATION-2. Targeting the

HIV-1 Nucleocapsid Protein to fight Antiretroviral Drug Resistance. Collaboration avec M. BOTTA

(Université de Sienne) et J.M. GATTELL (Université de Barcelone).

- Y. MELY : Thèse en co-tutelle d’Irina LYSOVA avec l’Université Nationale Taras Shevchenko de

Kiev (Pr Igor DMITRUK).

- A. KLYMCHENKO : Thèse en co-tutelle de Ievgen SHULOV avec l’Université Nationale Taras

Shevchenko de Kiev (Pr Vasyl PIVOVARENKO).

Page 63: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

- A. KLYMCHENKO : Thèse en co-tutelle de Bohdan ANDREIUK avec l’Université Nationale Taras

Shevchenko de Kiev (Pr Vasyl PIVOVARENKO).

- P. RONDE : Collaboration avec le Pr. K. HODIVALA-DILKE, Barts Cancer Institute, Londres,

Royaume-Uni.

- P. RONDE : Collaboration avec le Dr. P. DALHAIMER, University of Tennessee, Knoxville, Etats-

Unis.

- V. SCHINI-KERTH, C. AUGER, F. TOTI & P. CHABERT : partenariat Hubert Curien STAR franco-

coréen de 2014 à 2016.

- Y. MELY : participation de l’équipe 1 au programme européen COST (CM 1403 « The European

upconversion network »). (2014/2015)

- V. SCHINI-KERTH, C. AUGER, F. TOTI et P. CHABERT : participation du groupe SCHINI-

KERTH au programme STAR (Partenariat Hubert Curien (PHC) franco-coréen). (2014/2016)

- M. LEHMANN : programme BALATON (Partenariat Hubert Curien (PHC) franco-hongrois)

(2014/2015)

XIV. Valorisation (contrats de recherche, partenariats industriels, créations

d'entreprises, information et diffusion scientifique)

Contrats industriels

SANOFI PASTEUR – 2013-2015 ; responsable Y. MELY SCHWABE – 2013-2014; responsable V. SCHINI-KERTH HARMONIC PHARMA –2013-2014 ; responsable C. LUGNIER DIPTA – 2013-2014 ; responsable J.P. GIES LFB – 2011-2014 ; responsable F. MEZIANI

Contrats publics

ANR Femtostack – 2011-2014 ; responsable Y. MELY ANR Senstable – 2011-2015 ; responsable Y. MELY ANR FluometADN – 2012-2015 ; responsable Y. MELY ANR Cellmemprobes – 2012-2014 ; responsable A. KLYMCHENKO ANR Nex-Starwall – 2013-2016 ; responsable P. BOUCHER Contrat européen THINPAD – 2013-2016 ; responsable Y. MELY FRC Chimie – 2013-2016 ; responsable Y. MELY PROJET SATT CONECTUS – 2014 ; responsable M. DONTENWILL CONTRAT SATT CONECTUS-REGION ALSACE – 2014-2017 ; responsable P. ANDRE PROJET SATT – DICD – 2013-2015 ; responsable F. TOTI

Autres contrats / subventions

LA LIGUE CONTRE LE CANCER – 2014 ; responsable S. MARTIN LA LIGUE CONTRE LE CANCER – 2014 ; responsable M. LEHMANN LA LIGUE CONTRE LE CANCER – 2014 ; responsable G. FUHRMANN CANCEROPOLE – 2013-2014 ; responsable M. DONTENWILL ARC 2013-2014 ; responsable M. DONTENWILL FONDATION POUR LA RECHERCHE MEDICALE – 2012-2015 ; responsable P. BOUCHER FONDATION POUR LA RECHERCHE MEDICALE– 2012-2015 ; responsable Y. MELY ANRS (Agence Nationale de Recherche sur le Sida) – 2013-2014 ; responsable Y. MELY ANRS (Agence Nationale de Recherche sur le Sida) – 2013-2015 ; responsable Y. MELY

Page 64: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

ANRS (Agence Nationale de Recherche sur le Sida) – 2014-2016 ; responsable H. DE ROCQUIGNY INTERNATIONAL HUMAN FRONTIER SCIENCE PROGRAM – 2011-2015 ; responsable P. DIDIER ADRER – 2014 ; responsable V. SCHINI-KERTH VAINCRE LA MUCOVISCIDOSE – 2014 . responsable F. TOTI

Partenariat industriel Néant.

Création d'entreprise Néant.

Information et diffusion scientifique

Néant.

XV. Organisation de congrès

P. ANDRE : membre du comité d’organisation du Séminaire de microbiologie de Strasbourg, 3

avril 2014

C. AUGER : membre du comité d'organisation des Journées Campus d’Illkirch 2014 (JCI 2014),

sur le thème Imagerie et Santé, Illkirch, 7-8 avril 2014.

E. BOUTANT : membre du comité d'organisation des Journées Campus d’Illkirch 2014 (JCI 2014),

sur le thème Imagerie et Santé, Illkirch, 7-8 avril 2014.

L. CHOULIER : membre du comité d'organisation des Journées Campus d’Illkirch 2014 (JCI 2014), sur le

thème Imagerie et Santé, Illkirch, 7-8 avril 2014.

Y. MELY : co-organisateur du congrès « Fluorescent Biomolecules and their Building Blocks

Design and Applications (FB3) », University of California, San Diego, La Jolla, CA,

Etats-Unis, 6-9 août 2014

XVI. Thèses soutenues

Hala EL MEKDAD, 11 avril 2014 : Caractérisation de l’interaction entre Gag(NCp7) et la protéine cellulaire RPL7 : aspects moléculaires et fonctionnels. C. SCHWARTZ, examinateur ; S. BOUAZIZ et T. OHLMANN, rapporteurs externes ; H. de ROCQUIGNY, directeur de thèse.

Sherzad RASHID, 18 juin 2014 : Endothelial dysfunction in portal hypertension: role of the oxidative stress

and the renin-angiotensin-aldosterone system. J. CILLARD et A.T. DINH-XUAN, rapporteurs externes ; F.

de BLAY, examinateur ; V.B. SCHINI-KERTH et M. OSWALD-MAMMOSSER, co-directeurs de thèse.

Noémie KEMPF, 26 juin 2014 : Mise en évidence et caractérisation de l'interaction de la protéine de la

nucléocapside (NCp7) du VIH-1 avc des membranes lipidiques. C. TISNE, O. MAUFFRET, rapporteurs

externes ; P.E. MILHIET et B. BECHINGER, examinateurs ; Y. ARNTZ et Y. MELY, co-directeurs de

thèse.

XVII. HDR soutenues

Néant.

Page 65: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

XVIII. Distinctions

Néant.

XIX. Formation permanente

Transfert des compétences de l'Unité vers l'extérieur

Outre la forte implication de notre unité dans la formation initiale et continue des pharmaciens au sein de

la Faculté de Pharmacie, et des étudiants de plusieurs Masters, notre unité consacre également des

efforts importants au transfert de compétences vers le monde socio-professionnel. Ce transfert se décline

sous différentes formes :

Plusieurs membres de l'Unité sont responsables ou participent régulièrement dans des Formations Permanentes, le plus souvent au sein du DEPUdS (Département d'Education Permanente de l'Unistra) :

- Y. MELY : Principes et applications des techniques de fluorescence (avec la participation d’A.

Klymchenko, P. Didier, L. Richert, N. Humbert, F. Przybilla, A. Reisch et H. de Rocquigny)

- V. SCHINI-KERTH : Pharmacologie générale (avec la participation de R. Matz-Westphal)

- P. RONDE : Microscopie confocale (avec la participation de R. Vauchelles et P. Carl)

- P. RONDE : Microscopie multimodale (avec la participation de R. Vauchelles et P. Carl)

- D. DUJARDIN et JAN DE MEY : Vidéo-microscopie sur cellules vivantes : de l'optimisation des

conditions d'acquisition à l'analyse du film (avec la participation de R. Vauchelles)

- M. LEHMANN : Adhérence et migration cellulaire (avec la participation de M. Dontenwill, P.

Rondé, R. Vauchelles)

- M. LEHMANN : Bases moléculaires et techniques de la mort cellulaire (avec la participation de

M. Dontenwill, N. Etienne-Selloum, S. Martin, F. Toti)

Tutorats et encadrements de stages.

De nombreux étudiants de différentes écoles, de BTS, d’IUT… sont régulièrement encadrés dans l’unité, pour compléter leur formation pratique.

XX. Séminaires organisés

21 octobre 2014 – Pr Gyorgy VEREB - University of Debrecen, Medical and Health Science Center, Faculty of Medicine, Department of Biophysics and Cell Biology, Hongrie – Immunotherapies targeting HER2: problems and solutions. 26 mai 2014 – Dr Joe WINSON – Professor of Chemistry, Department of Chemistry, University of Scranton, PA, Etats-Unis – Where do polyphenols go when they reach the blood?

Page 66: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Virulence bactérienne précoce

EA7290

Directeur : Docteur Gilles Prévot

Equipe mixte : médecine-pharmacie

Groupe : BORRÉLIOSE DE LYME :

Domaine de

recherche:

Sciences de la vie et de la santé

Composantes: UFR de Sciences Médicales, UFR de Sciences Pharmaceutiques

Directeur: Professeur Benoît Jaulhac

Institut de Bactériologie de l'Université de Strasbourg

3, rue de Koeberlé 67000 STRASBOURG

Tél. : 03 69 55 14 27 (ligne directe) – 03 69 55 03 33 (plateau technique) –

03 69 55 14 52 - Fax : 03 69 55 16 98

E mail: [email protected] ; [email protected]

Docteur Nathalie Boulanger (UFR Sciences Pharmaceutiques)

Faculté de Pharmacie

74, route du Rhin - BP 60024

67401 Illkirch

Institut de bactériologie

Faculté de Médecine

3, rue Koeberlé

67000 Strasbourg

Tél. : 03 68 85 41 25

e-mail : [email protected] ; [email protected]

Site web: https://www.chru-strasbourg.fr/Hus/HTML/centreRef/borrelia/index.jsp?id=1

Mot-clés: Borrelia, tique, immunité innée, inflammation cutanée, protéomique

Thèmes de

recherche:

Borréliose de Lyme

Page 67: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

EA 7290: Virulence bactérienne précoce

Equipe mixte : médecine-pharmacie

Groupe : BORRÉLIOSE DE LYME :

Groupe Staphylococcus

PREVOST Gilles, MCU-PH, HDR, ResponsableBIERRY Guillaume, MCU-PHBOURCIER Tristan, PU-PHJEHL François, MCU-PH, HDRLEFEVRE Sophie, AHURIEGEL Philippe, MCU-PH JOVER Emmanuel, CNRS – CR1LEVEQUE Dominique, PH, HDRLAVIGNE Thierry, MCU-PH

TAWK Mira, PhDMOUSSAOUI Wardi, PostDocCONSTANTINESCU Andreij, phD

KELLER Daniel, IGEPETER Vincent, AJT

Groupe Borrelia

BOULANGER Nathalie, MCU-AH, HDR, ResponsableJAULHAC Benoît, PU-PH, HDRDe MARTINO Sylvie, MCU-PHHANSMANN Yves, PU-PH, HDRSCHRAMM Frédéric, MCU-PH

QUENTIN Bernard, PhDGOLDSTEIN Valérie, PhDGRILLON Antoine, AHU, PhD

BARTHEL Cathy, IGECOLLIN Elody, IGEWEISHAUPT Sandi, AJT

Centre National de Référence Borrelia

JAULHAC Benoît, DirecteurBOULANGER NathalieDe MARTINO SylvieZILLIOX Laurence

EA7290: Virulence bactérienne précocePREVOST Gilles

(Facultés de médecine et de pharmacie)

N. Boulanger dirige l’équipe « Borréliose de Lyme » depuis le 1er

Janvier 2013.

Cette équipe de recherche est adossée au Centre National de Référence pour les

Borrelia, dirigé par le Prof B. Jaulhac. Depuis janvier 2012, l’intégralité du CNR Borrelia

est à Strasbourg et BJ, SDM et NB en font partie.

Court résumé des activités de recherche (par équipe, par domaine, ...) du groupe Borreliose

de Lyme :

Nous avons une approche multidisciplinaire sur la borréliose de Lyme qui se base sur l’expertise de

biologistes (EA 7290 médecins, pharmaciens et scientifiques) et de chimistes de l’IPHC de Cronenbourg

(Prof L. Sabatier).

Recherche fondamentale :

Page 68: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

- Analyse du rôle de la piqûre de tique et des molécules à activités anti-inflammatoires dans la salive de

tique, dans la transmission précoce de la borréliose de Lyme,

- Approche translationnelle sur l’analyse du rôle de la peau dans la transmission de la bactérie sur

cellules cutanées humaines primaires, sur modèle murin et sur des biopsies de patients atteints de

borréliose de Lyme.

Recherche appliquée :

- Mise au point d’une technique diagnostic sur biospies cutanées par spectrométrie de masse ;

- Travail à la mise au point d’un vaccin chez le chien contre la borréliose de Lyme ;

- Etude épidémiologique sur le vecteur dans la Région Alsace afin d’analyser le risque acarologique et de

réaliser une cartographie des zones à risque de borréliose de Lyme et autres agents infectieux transmis par

la tique Ixodes ricinus (Anaplasmose, encéphalite à tique, fièvre récurrente).

La borréliose de Lyme, infection bactérienne due à Borrelia burgdorferi, est transmise par la tique Ixodes.

C’est la maladie à transmission vectorielle la plus fréquente de l’Hémisphère Nord, elle est endémique en

Alsace et dans plusieurs pays européens. Nous nous intéressons à l’étude des interfaces essentielles

rencontrées par la bactérie au cours de l’évolution de la maladie.

Borrelia est transmise par la piqûre d’un arthropode-vecteur, la tique. Cette bactérie, en plus de son

adaptation propre à l’environnement, utilise la salive de la tique pour faciliter sa survie chez l’hôte

vertébré. Cette salive a un effet immunosuppresseur sur la réponse adaptative de l’hôte. L’effet de la

salive de tique sur l’immunité innée de l’hôte vertébré est moins connu. Une protéine de tique, salp15 se

fixe à une lipoprotéine de la bactérie, Osp C (outer surface protein) afin d’échapper à la reconnaissance

par les cellules dendritiques et les lymphocytes T.

Nous analysons comment la bactérie, au moment de la piqûre, stimule l’immunité innée de la peau et la

module grâce à la salive de tique, permettant la multiplication locale de Borrelia dans la peau puis sa

dissémination dans l’organisme. Nous avons développé deux approches expérimentales pour étudier le

rôle de l’interface cutanée et des cellules résidentes de la peau dans la survie de la bactérie : un modèle in

vitro sur cellules primaires humaines et un modèle in vivo sur souris. Nous analysons comment le site

initial cutané est essentiel pour la pathogénie ultérieure de la bactérie. Nous avons montré que la bactérie

induit une inflammation cutanée qui est réprimée par un extrait brut de glandes salivaires de tiques. Ce

travail vise à définir le rôle de la tique dans le cycle de développement de la bactérie, et à identifier des

protéines clefs de la salive comme éléments de la pathogénicité de la bactérie.

L'étude sur le vecteur et l’identification des protéines de Borrelia par protéomique nous ont permis la mise

au point de nouveaux outils diagnostiques par protéomique et la mise en place d’un projet vaccinal chez le

chien pour cette pathologie.

- le nombre de thèses de doctorats soutenues en 2014 : 0

Page 69: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

- l'adresse internet du/es équipe(s), unité(s), département :

http://www.chru-strasbourg.fr/Les-centres-de-reference/Borrelia

- la liste des publications et informations de vos unités/laboratoires de recherche pour l'année

2014 sous la forme suivante :

I. Articles dans des revues avec comité de lecture

N. Boulanger

• Bernard, Q.; Jaulhac, B.; Boulanger, N. Smuggling across the border: How arthropod-borne pathogens

evade and exploit the host defense system of the skin. J. Invest. Derm. 2014, 134:1211-1219.

• Pages, F.; Dautel, H.; Duvallet, G.; deGentile, L.; Boulanger, N. Repellents for human use: prevention

of tick bites and tick-borne diseases. Vector-Borne Zoonotic Dis. 2014, 14(2):85-93.

Jaulhac et autres membres de l’equipe

• Dessau, RB.; Fingerle, V.; Gray, J.; Hunfeld, KP.; Jaulhac, B.; Kristoferitsch, W.; Stanek, G.; Strle, F.

The authors reply to comments on "The lymphocyte transformation test for the diagnosis of Lyme

borreliosis has currently not been shown to be clinically useful." CMI 2014

http://dx.doi.org/10.1111/1469-0691.12583. Clin. Microbiol. Infect. 2014, Volume 20, Issue 10, pages

O785–O786.

• Vandenesch, A.; Turbelin, C.; Couturier, E.; Arena, C.; Jaulhac, B.; Ferquel, E.; Choumet, V.;

Saugeon, C.; Coffinieres, E.; Blanchon, T.; Vaillant, V.; Hanslik, T. Incidence and hospitalisation rates

of Lyme borreliosis, France, 2004 to 2012. Euro Surveill. 2014 Aug 28;19(34).

• Schramm, F.; Gauthier-Clerc, M.; Fournier, JC.; McCoy, KD.; Barthel, C.; Postic, D.; Handrich, Y.; Le

Maho, Y.; Jaulhac, B. First detection of Borrelia burgdorferi sensu lato DNA in king penguins

(Aptenodytes patagonicus halli). Ticks Tick Borne Dis. 2014 Oct;5(6):939-42.

• Gagnard, JC.; Lefebvre, N.; Jaulhac, B.; Christmann, D.; Jahn, C.; Hansmann, Y. Pyélonéphrite chez

les patients porteurs de pyélostomie au long cours : étude observationnelle rétrospective sur 16 cas.

Med. Mal. Infect. 2014 Jun;44(6 Suppl):56.

• Gagnard, JC.; Jaulhac, B.; Weiss, L.; Christmann, D.; Jehl, F.; Hansmann, Y. Intérêt des tests du

pouvoir bactéricide des associations antibiotiques dans les colonisations à Burkholderia chez les

patients atteints de mucoviscidose. Med. Mal. Infect. 2014 Jun;44(6 Suppl):53.

• François, N.; Martinot, M.; Bonomi, O.; DeMartino, S.; Jaulhac, B.; Christmann, D.; Hansmann, Y.

Évolution dans le mode de transmission de la tularémie enAlsace : à propos d'une analyse descriptive

de 50 cas. Med. Mal. Infect. 2014 Jun;44(6 Suppl):37.

• Piroth, L.; Pechinot, A.; Di Martino, V.; Hansmann, Y.; Putot, A.; Patry, I.; Hadou, T.; Jaulhac, B.;

Chirouze, C.; Rabaud, C.; Lozniewski, A.; Neuwirth, C.; Chavanet, P.; Minello, A. Evolving

Page 70: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

epidemiology and antimicrobial resistance in spontaneous bacterial peritonitis: a two-year

observational study. BMC Infect. Dis. 2014 May 23;14:287.

• Blanc, F.; Philippi, N.; Cretin, B.; Kleitz, C.; Berly, L.; Jung, B.; Kremer, S.; Namer, IJ.; Sellal, F.;

Jaulhac, B.; de Seze, J. Lyme neuroborreliosis and dementia. J. Alzheimers Dis. 2014;41(4):1087-93.

• Meddeb, M.; Maurer, M.; Grillon, A.; Scheftel, JM.; Jaulhac, B. [Comparison of routine use of two

chromogenic media ChromID CPS (bioMérieux) and UriSelect4 (Bio-Rad) for the detection of

Escherichia coli and major uropathogenics in urine]. Ann. Biol. Clin. (Paris). 2014 Mar-Apr;72(2):224-

30.

• Dessau, RB.; Fingerle, V.; Gray, J.; Hunfeld, KP.; Jaulhac, B.; Kahl, O.; Kristoferitsch, W.; Stanek, G.;

Strle, F. The lymphocyte transformation test for the diagnosis of Lyme borreliosis has currently not

been shown to be clinically useful. Clin. Microbiol. Infect. 2014 Oct;20(10):O786-7.

• Thomas, L.; Mailles, A.; Desestret, V.; Ducray, F.; Mathias, E.; Rogemond, V.; Didelot, A.; Marignier,

S.; Stahl, JP.; Honnorat, J. Steering Committee and Investigators Group. Autoimmune N-methyl-D-

aspartate receptor encephalitis is a differential diagnosis of infectious encephalitis. J. Infect. 2014

May;68(5):419-25.

• Martinot, M.; Oswald, L.; Parisi, E.; Etienne, E.; Argy, N.; Grawey, I.; De Briel, D.; Zadeh, MM.;

Federici, L.; Blaison, G.; Koebel, C.; Jaulhac, B.; Hansmann, Y.; Christmann, D. Immunoglobulin

deficiency in patients with Streptococcus pneumoniae or Haemophilus influenzae invasive infections.

Int. J. Infect. Dis. 2014 Feb;19:79-84.

II. Articles dans des revues sans comité de lecture

• Boulanger N. (2014). La peau : un acteur clef dans les pathologies a transmission vectorielle. Lettre du

CNEV (Centre National d’Expertise sur les Vecteurs, Numéro 5, mai 2014).

• Boulanger N. (2014). Prévention contre les tiques. Dermatologie Actualités N 141, Avril-Mai 2014)

III. Brevets

Néant.

Page 71: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

CLASSEMENT DES REVUES ET DES PUBLICATIONS

2014

(nombre total : XX publications classées)

Facteur d’impact >10 5 à 10 2 à 5 1 à 2 <1 non

classées

Nbre de Journaux - 1 1 - - -

Nbre de Publications - 1 1 - - -

% des publications

figurant dans le Journal

Citation Reports

- 50 50 - - -

IV. Communications avec actes

Internationales

• Bernard Q., Gallo R., Jaulhac B., Lipsker D., Nakatsuji T., Luft B., Yang X., Boulanger N. (2014)

TLR2/TLR3 crosstalk during the early transmission of Lyme borreliosis. 20-21 octobre 2014, Vichy,

France. 4th international symposium on the skin physiology. Premier prix de recherche pour Quentin

Bernard.

• Bernard Q., Gallo R., Nakatsuji T., Jaulhac B., Boulanger N. The TLR2/TLR3 crosstalk in the skin and

its involvement in the physiopathology of Lyme borreliosis. Gordon conference on Spirochetes,

Ventura, California, January 18-24, 2014

• Schnell G., Westermann B., Bœuf A., Jaulhac B. Boulanger N., Sabatier L. SRM as a new efficient

detection tool for the early diagnosis of Lyme disease. 62nd Conference American Society for mass

spectrometry, June 15-19, 2014. Baltimore, USA.

• Westermann B, Schnell G., Grillon A., Boeuf A., Jaulhac B., Boulanger N., Ehret-Sabatier L. (2014).

Discovery and targeted proteomics for the diagnosis of lyme disease. Brixen/Bressanone, Italie, 3 au 09

août 2014.

• Schnell, G., Bœuf, A., Westermann, B., Jaulhac, B., Carapito, C., Boulanger, N., Sabatier, L. SRM as a

new efficient detection tool for the early diagnosis of the Lyme disease : 20th International Mass

Spectrometry Conference (IMSC), 24-29 août 2014, Genève, Suisse.

Nationales

Page 72: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

• Bernard Q., Gallo R., Nakatsuji T., Jaulhac B., BoulangerN. Le Crosstalk TLR2/TLR3 au niveau de la

peau et son implication dans la physiopathologie de la Borréliose de Lyme. Montpellier, REID, Février

2014.

• Goldstein V., George JC., Zilliox L., Delena C., Jaulhac B., Ferquel E., Boulanger N. Surveillance du

vecteur Ixodes ricinus en Alsace en 2012 et 2013. Montpellier, REID, Février 2014

• Goldstein V., Jaulhac B., George JC, Zilliox L., Delena C., Ferquel E., Boulanger N. Borréliose de

Lyme : Surveillance du vecteur Ixodes ricinus en Alsace en 2012 et 2013. Société Francaise de

Parasitologie, Reims, 21-23 Mai 2014.

• Bernard Q., Gallo R., Jaulhac B., Lipsker D., Nakatsuji T., Luft B., Yang X., Boulanger N. Potential

role of the crosstalk TLR2/TLR3 during the early transmission of Lyme borreliosis. Journée de la

fédération de Médecine de Strasbourg, 1-2 juillet 2014. Prix de thèse pour Quentin Bernard.

V. Communications sans actes

• DeMartino S., Jaulhac B., Boulanger N., Gastinger G., Reitzer C., Hansmann Y., Christmann D.

Survey of threetick borne diseases in Alsace, France: Lyme disease, Tick borne encephalitis and

Anaplasmosis. Journée Mondiale sur les maladies à transmission vectorielle, Fribourg (Allemagne), 7

avril 2014.

• Grillon A., Westermann B., Jaulhac B., Sabatier L., Boulanger N. Tropisme cutané de Borrelia

burgdorferi sensu stricto dans le développement de la borréliose de Lyme : mise en évidence sur un

modèle murin. Journées de Microbiologie de Strasbourg, 3 Avril 2014.

• Boulanger N., Reitzer C. Prévention sur les tiques et les maladies transmises. ARENA (Association

Régionale pour l’initiation à l’environnement et à la Nature en Alsace). Sélestat, 26 juin 2014.

• Boulanger N. Prévention sur les tiques et les maladies transmises. Petite Camargue Alsacienne (Haut-

Rhin) 4 juillet 2014.

VI. Conférences invitées

• Boulanger N., Reitzer C. Prévention des maladies transmises par les tiques. Séminaire DPPS, 13 mai

2014, Agence Régionale de Santé, Alsace.

VII. Ouvrages scientifiques (ou chapitres)

Néant.

Page 73: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

VIII. Ouvrages de vulgarisation (ou chapitres):

Néant.

IX. Direction d'ouvrages

Néant.

X. Autres publications

Néant.

XI. Autres activités internationales (séminaires, communications et posters internationaux)

XII. Valorisation (contrats de recherche, partenariats industriels, créations d'entreprises,

brevets, information et diffusion scientifique)

Contrats de recherche

- 2012-2015 : Bourse de la Région Alsace pour la thèse de Quentin Bernard: ½ financement

- 2012-2015 : Bourse de la DGA pour la thèse de Quentin Bernard: ½ financement.

- 2012-2016: Centre de référence Borrelia

Partenariat(s) industriel(s) :

- Société Virbac : projet vaccinal chez le chien, phase de prématuration.

Missions d’expertise internationale :

- Fondation franco-américaine Fulbright. Membre du Jury de sélection. Paris. 6 Mars 2014.

- Ministère de la Santé Hollandais. Rapport d’Expertise de financements sur les tiques et maladies

transmises. Juin 2014. « Midterm review report Strategic Research RIVM

XIII. Formation permanente

Page 74: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

• Boulanger N. APPEPU – Formation continue pour les pharmaciens d’officine : Actualités en

entomologie médicale. Strasbourg le 10 février 2014, Mulhouse le 17 février 2014.

XIV. Organisation de congrès

XV. Thèses soutenues

XVI. HDR soutenues

XVII. Distinctions

Journée de la fédération de Médecine de Strasbourg, 1-2 juillet 2014. Prix de thèse pour Quentin

Bernard.

4th international symposium on the skin physiology. Premier prix de recherche pour Quentin

Bernard. 20-21 octobre 2014, Vichy, France.

Page 75: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien

Département des Sciences Analytiques

EQUIPE DE CHIMIE ANALYTIQUE

DES MOLECULES BIOACTIVES

UMR 7178 –LC4

Responsable : Eric MARCHIONI

Fédération: Chimie, Polymères, Matériaux

Domaine de

recherche:

Sciences de l'Aliment, Chimie analytique

Composante: Faculté de pharmacie

Directeur: Eric MARCHIONI

Faculté de Pharmacie

74, route du Rhin

BP 60024

67401 Illkirch

Tél. 03 68 85 43.26

Email: [email protected]

Site web: http://www.iphc.cnrs.fr/

http://www.iphc.cnrs.fr/-CASA-.html

Mot-clés: Produits de santé - Aliment - Ionisation - Vitamines - Phytostérols - Phospholipides -

Méthodes d'analyse.

Thèmes de

recherche:

Analyse des produits de santé. Mise au point de protocoles d'analyse des phytostérols,

esters de phytostérols, de leurs dérivés oxydés, des vitamines du groupe B et des

phospholipides. Authenticité et qualité des aliments. Caractérisation des bactéries

probiotiques. Extraction de principes actifs.

Page 76: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

ORGANIGRAMME DE L’EQUIPE

Enseignants-chercheurs BERGAENTZLE Martine MC

BINDLER Françoise MC (HDR) Retraite depuis le 1er septembre 2014

ENNAHAR Saïd MC (HDR)

JULIEN-DAVID Diane MC

MADELEINE-LORDEL Sonia MC

MARCHIONI Eric PR (HDR)

MARCIC Christophe MC

Personnel non statutaire OSTERMANN Mathieu Doctorant UdS

THIHARA RODRIGUES Flávio Doctorant Université de Sao Paulo (Brésil)

TERFASSI Sihem Doctorante Université de Constantine (Algérie)

CHEMAM Yasmine Doctorante Université de Constantine (Algérie)

RAMIREZ Fernando Jonathan Lona Doctorant Université de Mexico (Mexique)

CASADO MUÑOZ María del Carmen Doctorante Université Jaén (Espagne)

ALIOUA Souad Doctorante Université d’Annaba (Algérie)

HAMMI Ikram Doctorante UdS Cotutelle Université de Fès,

Maroc)

BALDE Mamadou Doctorant UdS Cotutelle Université Dakar,

Sénégal)

KAISER Romain Technicien CDD

Personnel ITARF BENELHOCINE Myriam (50%) AT

ZHAO Minjie IR

ATER MOZEIKA Michel octobre 2012 - septembre 2014

BITAR Manale septembre 2014 – septembre 2015

Post Doctorant CLAYEUX Céline octobre 2012-septembre 2015

Stagiaires BEAUGE Guillaume (sept 2013-mars 2014) Stagiaire de DAFSP2

BONNE Loïc (mars - août 2014) Stagiaire de DAFSP2

ZIMMERMANN Hugues (sept 2013-mars 2014) Stagiaire de DAFSP2

NORD Geoffrey (sept 2013-jan 2014) M2 Sciences du Médicament

GUILLAUME Justine (sept 2013-jan 2014) M2 Sciences du Médicament

GUEYDAN Philippe-Julien (sept 2014-déc.2014) UE Immersion Laboratoire

MURDAMOOTHOO Dawson (oct. 2014-déc.2014) UE Immersion Laboratoire

TIBI Pierre-Olivier (mars 2014- août 2014) Stagiaire de DAFSP2

UZAN-MEVORAH Sarah (mars 2014- août 2014) Stagiaire de DAFSP2

YUAN Ye (juin- août 2014) M1Sciences du Médicament

YAZICI Nurcihan (mars-juin 2014) M2 Sciences analytiques

Page 77: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

XIAO Zhe (février –juin 2014) M2 Sciences analytiques

RESUME DES ACTIVITES DE RECHERCHE

Les activités de l’Equipe Camba, membre du département des Sciences Analytiques (DSA) de l’Institut

Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC, UMR 7178) se situent en continuité avec les objectifs présentés

par la direction de l’IPHC lors des engagements pris devant la commission d’Evaluation de l’AERES. Il

s’agit de la mise au point de méthodes d’analyse innovantes destinées à évaluer le potentiel chimique,

biologique et microbiologique des produits naturels pour protéger la santé humaine contre les pathologies

modernes (diabètes, cardiovasculaires, …), les cancers.... L’objectif est d’assurer une chimio (bio-)

prévention nutritionnelle destinée à permettre à la population de mieux vivre, de mieux vieillir. La

recherche de l’Equipe Camba s’articule autour de trois axes principaux : la mise au point de méthodes

originales pour l’analyse de composés présents à l’état de traces dans des matrices complexes, l’étude de

l’impact des procédés de transformation, la mise au point de nouveaux médicaments et la recherche de

biomarqueurs de pathologies rares.

1. Mise au point de méthodes originales d’analyse de composés présents à

l’état de traces

COUPLAGE CHROMATOGRAPHIQUE PAR DETECTION D’UNE ACTIVITE

ANTIRADICALAIRE CLHP-AOx Après avoir été mise en place dans les boissons, la méthode de détection de l’activité anti-radicalaire (LC-

AOx) a été utilisée afin de déterminer les composés phénoliques antioxydants présents dans les racines de

différentes variétés de piloselles.

La piloselle (Hieracium pilosella) est une plante vivace pouvant atteindre 15 à 30 cm et se développant

sous forme de tapis dense. Elle possède de nombreuses propriétés thérapeutiques (antibiotiques,

diurétiques, astringentes, cicatrisantes, etc.), et est également utilisée dans l’entretien du sol en viticulture.

En effet, de par son effet allélopathique, elle évite la propagation du chiendent, du liseron, et des autres

adventices à proximité des vignes.

Les analyses des composés antioxydants ont permis d’identifier deux groupes de piloselles. Mais

globalement, les extraits de racines de piloselles sont majoritairement composés d’acide chlorogénique et

de ses dérivés. La présence d’acide chlorogénique en concentration importante possèdent un pouvoir

antibactérien, fongicide et herbicide pouvant nuire à d'autres plantes.

Le travail de séparation et de caractérisation des composés présentant des propriétés antiradicalaires dans

les aliments produits en Alsace a été prolongé cette année encore (Projet EVA 2011-2015). Il s’agissait de

séparer les extraits apolaires dégraissés qui présentaient des activités très intéressantes, tout au moins pour

trois des aliments sélectionnés. Un stagiaire de Master SACEB (Sciences Analytiques) s’est penché sur

cette thématique et a permis de mettre au point une méthode de séparation générique des composés

présents dans les extraits apolaires dégraissés d’une quinzaine de fruits et légumes alsaciens. Les pics les

plus intenses ont été microfractionnés et identifiés grâce à des techniques spectrales disponibles sur la

plateforme d’analyse spectrale PACSI (GDS 3070) de notre faculté.

En parallèle, il a été procédé à la confirmation biologique des activités antiradicalaires retrouvées dans les

extraits gras des 15 fruits et légumes étudiés. Cette étude a nécessité la mise au point d’un protocole

permettant réalisation d’une µ-émulsion (taille 200 nm, homogène et stable) afin de pouvoir exposer ces

extraits liposolubles aux cultures de lignées cellulaire RINm5F et ainsi de démontrer que les extraits gras

sélectionnés protégeaient bien les cellules d’un stress radicalaire.

Dans le cadre d’une collaboration avec l’Université de Constantine, une étude, impliquant deux

doctorantes constantinoises, a permis l’analyse d’un large spectre d'espèces végétales issues de la

Page 78: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

pharmacopée traditionnelle algérienne et un important panel d'espèces endémiques du Tassili, peu étudiées

jusqu’à présent sur le plan phytochimique. Le choix des espèces ainsi que la préparation des échantillons,

les étapes d’extraction par solvants et les purifications chromatographiques sur colonne ouverte ont été le

fait de la partie constantinoise. Le fractionnement bioguidé, tout comme l’identification des fractions

présentant une activité antiradicalaire, l’isolement des molécules bioactives ainsi que leur identification

ont été réalisés à Strasbourg. Neuf papiers ont été publiés et trois posters ont été présentés en 2014 dans le

cadre de cette fructueuse collaboration.

EXTRACTION ET ANALYSE DE SUBSTANCES ANTHALGIQUES NATURELLES La découverte de molécules neuroactives pouvant calmer la douleur est un sujet de recherche

pharmaceutique en plein expansion. Il a été prouvé que les huiles essentielles de nombreuses plantes

contiennent de molécules terpéniques permettant de soulager la douleur. Dans le cadre d’une collaboration

avec une entreprise privée, nous avons mis au point des méthodes d’extraction des molécules terpéniques.

Les techniques d’extraction des terpènes utilisées sont l’hydrodistillation (technique conventionnelle pour

l’extraction des huiles essentielles), l’extraction par solvant pressurisé (ASE) et la micro-extraction sur

phase solide (SPME). Les analyses ont été réalisées par chromatographie en phase gazeuse couplée à un

spectromètre de masse. Ceci nous a permis de dresser le profil terpéniques de cinq matrices alimentaires

(Cumin, Fenouil, cannelle, noix de muscade et clous de girofle).

LES THIOLS VARIETAUX L’arôme d’agrumes retrouvé dans certains cépages de vin provient de molécules appelées thiols variétaux,

tels que le 3-mercapto-hexan-1-ol (3MH), le 3-mercapto-hexyl acétate (3MHA) et le 4-mercapto-4-

méthylpentan-2-one (4MMP). Cependant la faible concentration des thiols volatils en solution rend leur

dosage difficile et requiert des méthodes couteuses et/ou toxiques pour l’environnement et la santé. Une

nouvelle méthode de dosage a donc été testée. Cette méthode porte sur la dérivation des thiols avant

analyse. L’agent de dérivation utilisé est le propiolate d’éthyle. Les thiols réagissent avec le propiolate

d’éthyle pour former un acrylate qui est ensuite analysé par GC-MS. Les premiers travaux menés se sont

focalisés sur la synthèse de l’acrylate et sa détection pour permettre l’analyse des thiols dans le vin.

ANALYSE DES VITAMINES HYDROSOLUBLES La mise au point d’un protocole d’analyse globale simultanée des vitamines du groupe B s’est poursuivie

en 2014 en mettant à profit la séparation chromatographique obtenue ainsi que l’optimisation des

transitions MS/MS pour permettre la quantification simultanée de l’ensemble des vitamines du groupe B.

Le dosage des vitamines du groupe B a pu être effectué dans des matrices alimentaires supplémentées

(boissons multivitaminées, comprimés multivitaminés) ne nécessitant pas de traitement enzymatique

préalable à l’analyse chromatographique. Les résultats obtenus dans ces matrices sont en accord avec les

teneurs effectivement ajoutées.

Pour permettre l’application de la méthode de dosage à des matrices alimentaires non supplémentées, un

traitement multienzymatique est nécessaire pour libérer les formes vitaminiques liées dans la matrice. Des

études préliminaires ont ainsi été menées afin de mettre au point un protocole d’extraction commun à

l’ensemble des vitamines.

LE DEVELOPPEMENT DE POLYMERES A EMPREINTES MOLECULAIRES Dans le cadre d'une thèse en cotutelle avec le Brésil, l'extraction sélective du profenofos, pesticide interdit

en Europe mais autorisé dans d'autres région, a été envisagée. Pour cela, des polymères à empreintes

moléculaires permettant l'extraction sélective du profenofos dans les échantillons ont été synthétisé.

Différentes phases polymériques ont été synthétisées et testées en tant que support d'extraction sur phase

solide du profenofos. En 2014, plusieurs stagiaires ont poursuivi ce travail avec l'optimisation des

polymères afin d'obtenir la phase la plus sélective possible. L'Etude s'est poursuivie par la caractérisation

des différents polymères dont la sélectivité a été démontrée afin de vérifier la reproductibilité de la

Page 79: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

procédure de synthèse, des procédures d'extraction optimisées, et la capacité du polymère en termes de

rétention sélective du profénofos.

2. Impact des procédés de transformation

DEGRADATION DES PESTICIDES LORS D’UN TRAITEMENT IONISANT. C’est dans le cadre d’une thèse en co-tutuelle avec l’Université de Sao Paulo (Brésil) que ce travail a été

réalisé. Nous nous sommes intéressés à la dégradation d’un pesticide organophosphorés, le profénofos,

ainsi qu’à la formation de ces produits de dégradation suite à un traitement ionisant. Cet insecticide est

autorisé au Brésil dans la culture par exemple du café, des pastèques, du coton, des haricots verts… mais

est interdit en France. Dans un premier temps nous avons déterminé la cinétique de dégradation de ce

pesticide en solution aqueuse et identifié les produits de radio-dégradation à l’aide d’une méthode

d’analyse par chromatographie en phase gazeuse couplé à un spectromètre de masse (CPG-SM) mise au

point au laboratoire. Les travaux ont montré que pour une dose de 12 kGy, 94 % de profenofos était

dégradé. De plus un produit de radio-dégradation a pu être identifié grâce au spectre de masse et la

cinétique de formation de ce produit a pu être déterminée. La seconde partie des travaux portait sur le

suivi de la dégradation après un traitement ionisant du profenofos déposé sur un aliment. Pour cela une

méthode d’extraction QuEChERS a été utilisée suivi une analyse par CPG-SM/SM. Les analyses ont

montré que pour une dose de 12 kGy, seulement 40 % de profenofos était dégradé En parallèle une

technique d’extraction sélective du profenofos par polymères à empreintes moléculaires a été mise au

point dans le but de simplifier et d’améliorer la méthode d’extraction du profenofos dans un matrice

complexe telle que l’aliment.

3. Mise au point de nouveaux médicaments

ANALYSE DES PEPTIDES BIOACTIFS DES BACTERIES PROBIOTIQUES L’utilisation de l’antagonisme naturel entre microorganismes dans l’objectif d’éliminer des

bactéries indésirables et de favoriser le développement d’une flore inoffensive, voire bénéfique, est une

idée fascinante dans la lutte contre des pathogènes, non seulement dans les aliments ou l’environnement,

mais également dans l’organisme humain. Cette dernière application suscite de plus en plus d’intérêt étant

donné le problème grandissant des microorganismes multi-résistants aux traitements antibiotiques. A ce

jour toutefois, les recherches dans ce domaine sont largement consacrées à l’écosystème intestinal et à

l’intérêt des bactéries lactiques dans la modulation de cet écosystème. De nombreuses espèces appartenant

à la flore lactique sont aujourd’hui utilisées en tant que probiotiques. Parmi les nombreux aspects de

l’activité probiotique, il y a la lutte contre la prolifération de certains microorganismes pathogènes

opportunistes présents au sein de la flore intestinale tels que des levures du genre Candida et des bactéries

comme Clostridium difficile. Ainsi, l’un des critères les plus recherchés chez probiotiques est la

production de métabolites antimicrobiens, notamment les peptides antibactériens.

Bon nombre de bactéries lactiques produit de tels peptides, appelées bactériocines. Il s’agit de

peptides synthétisés par voie ribosomique et qui sont dotés d’une activité bactéricide très importante. Au

sein de l’équipe de recherche CAMBA, de nombreuses souches productrices de tels peptides ont été

isolées, caractérisées et utilisées dans la lutte contre des pathogènes. La production de bactériocines offre

aux souches lactiques productrices un avantage compétitif considérable et leur permet de modifier la

composition d’un microbiote à leur avantage afin de s’y établir plus facilement. Les bactériocines

présentent aussi de nombreux effets bénéfiques pour l’homme et jouent un rôle important dans l’équilibre

de l’écosystème intestinal notamment. Les bactériocines semblent aujourd’hui particulièrement

prometteuses dans le domaine de la santé pour lutter contre des infections bactériennes affectant non

seulement le système gastro-intestinal, mais aussi d’autres écosystèmes microbiens du corps humain.

La thèse de doctorat de Mlle Ikram HAMMI (cotutelle Université de Fès) porte sur l’étude de du

potentiel antimicrobien de souches bactériennes isolés d’une grande variété de produits fermentés

Page 80: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

marocains. Il s’agit d’abord de constituer une collection de souches bactériennes ayant une activité anti-

microbienne. La recherche de ces souches cible principalement les espèces connues pour leur innocuité

(bactéries lactiques) produisant des composés antimicrobiens de nature peptidique (bactériocines). Les

souches présentant l’activité la plus intéressante (spectre et intensité) voient leurs peptides antimicrobiens

purifiés et leurs structures déterminées. Plusieurs de ces peptides ayant des masses moléculaires allant de

4622,07 Da à 7145, 06 Da ont ainsi été identifié.

L’étude des bactériocines et la détermination de nouvelles structures servent plusieurs objectifs.

Ceci permet d’abord aux études structure-fonction d’avoir lieu afin de comprendre le mode d’action des

bactériocines, ainsi que les phénomènes de résistance généralement liés à l’usage de tout agent

antimicrobien. Ensuite, ceci permet éventuellement de découvrir des structures plus efficaces du point de

vue de l’intensité de leur activité ou encore de leur spécificité. Et enfin, il s’agit de démontrer, ce qui est

déjà une évidence aujourd’hui, que la production des bactériocines n’est pas un phénomène rare comme

on le pensait il y a encore quelques années, mais une caractéristique largement répandue chez les bactéries

et en particulier les espèces lactiques.

Les conditions optimales de production des bactériocines sont déterminées dans un milieu de

culture riche, puis une sélection est faite parmi les bactéries productrices de celle(s) présentant le meilleur

potentiel pour une application contre des pathogènes.

L’étude des phénomènes de résistance éventuels, non seulement aux bactériocines, mais aussi aux

antibiotiques, est également l’un des aspects de cette étude. Un travail portant sur ces antimicrobiens a été

mené par Mlle CASADO MUÑOZ. Ce travail, en cours de publication, a permis d’identifier une dizaine

de biomarqueurs protéomiques de résistance à deux classes d’antibiotiques communs.

ADMINISTRATION DE L’INSULINE PAR VOIE ORALE Ce travail porte sur la mise au point un système fiable, non toxique et reproductible au cours du temps

d’administration orale d’insuline. Il regroupe le CEED (Centre Européen d’Etude du Diabète), l’institut

Charles Sadron, notre Equipe de recherche et des industriels. Une technique originale de double

encapsulation a donc été développée pour lutter contre l’environnement digestif acide et faciliter

l’absorption intestinale de l’insuline. Notre travail porte sur l’analyse de l’insuline à chaque étape de la

formulation. Une méthode par chromatographie liquide haute performance couplée à un détecteur à

barrette de diode a été mise au point, permettant la détection de l’insuline ainsi que toutes les impuretés

susceptibles d’être présentes.

Les travaux ont montré qu’il n’y avait pas de dégradation de l’insuline lors du processus de formulation.

De nouvelles études in vitro portant sur la résistance gastrique des particules ainsi que sur le passage de la

barrière intestinale de l’insuline sont en cours. Nous participons également à cette étude en dosant

l’insuline à l’aide de la méthode d’analyse mise au point.

4. Recherche de biomarqueurs de pathologies rares

ANALYSE DE LA COMPOSITION EN ACIDES GRAS DE SANG DE COHORTES SLA La sclérose latérale amyotrophique (SLA) est une pathologie présentant vraisemblablement un lien avec le

métabolisme des acides gras. Une analyse par chromatographie en phase gazeuse de la composition

sanguine en acides gras de patients atteints de SLA a été effectuée afin d’identifier d’éventuels marqueurs

diagnostiques et pronostiques de cette maladie.

Il a été montré que les teneurs en palmitoléate (16:1) et oléate (18:1) ainsi que les indices de stearoyl-

CoA desaturase (16:1/16:0 et 18:1/18:0) augmentaient significativement chez les patients atteints de SLA.

De plus, le rapport 16:1/16:0 dans les cellules sanguines serait un facteur indépendant de pronostic

concernant la survie des malades, les patients présentant un rapport 16:1/16:0 élevé ayant une durée de

survie allongée de 10 mois par rapport à ceux présentant de faibles rapports 16:1/16:0.

5. Transferts de technologies vers le grand public et les industries

Page 81: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

TRADITIONAL FOOD NETWORK TO IMPROVE THE TRANSFER OF KNOWLEDGE

FOR INNOVATION” TraFooN Projet Européen, FP7. Ce projet a commencé au mois de novembre 2013 et pour une durée de 3 ans. Il est

coordonné par le partenaire Allemand de l’université de Hohenheim et compte 29 partenaires à travers

l’Union Européenne (24 laboratoires de recherche et 5 associations européens de PME venant d’Espagne,

d’Italie, des Pays bas, du Portugal, de Slovénie, de République Tchèque, de Belgique, de Suisse et

d’Autiche).

Ce projet a pour but de permettre aux PME d’avoir accès aux résultats des différents laboratoires de

recherches partenaires du projet. C’est un transfert de connaissances des laboratoires de recherches vers

les PME. Seules les entreprises produisant des aliments traditionnels contenant de fruits, légumes,

champignons et graines sont concernées dans ce projet.

Dans ce projet, notre équipe est impliquée uniquement dans le groupe de travail portant sur les aliments

traditionnels à base de légumes. La première étape du projet a été d’identifiée les besoins ou problèmes

des PME françaises produisant des aliments traditionnels à base de légumes, à l’aide d’un questionnaire

élaboré par l’un de nos partenaires. Nous avons obtenu un taux de réponse de 8 % provenant

essentiellement de producteurs de choux et de choucroute. Nous avons ainsi pu identifier leurs principaux

problèmes : le grisonnement de la choucroute, le choix dans les produits phytosanitaires, la valorisation

des déchets…

La seconde étape du projet sera de leur apporter des réponses à l’aide des résultats de recherche de tous

les laboratoires européens partenaires par le biais de conférences, colloques.

KEEP HEALTHY KIDS (KHK)

Ce projet, financé dans le cadre de l’effort de rapprochement des états membres de l’UE rassemble des

entreprises travaillant dans le développement de Nouvelles Technique de communication du Pays Basque

Espagnol et de la Région Alsace et un centre de recherche amont, le CNRS. Il s’agit d’étudier le

comportement nutritionnel d’enfant obèse (ainsi que celui de toute leur famille) afin de les aider, par le

biais de jeux implantés sur smartphone à sortir de leur condition d’obésité. Notre contribution concerne

l’étude comportementale et nutritionnelle des sujet concernés (Cohortes des régions Alsace et Provence

Cote d’Azur).

Production scientifique

I – Articles dans des revues avec comité de lecture

Hamon, E.; Horvatovich, P.; Marchioni, E.; Aoudé-Werner, D.; Ennahar, S. Investigation of

potential markers of acid resistance in Lactobacillus plantarum by comparative proteomics, J.

Appl. Microbiol. 2014, 116, 134-144.

Van der Werf, R.; Khalil, A.; Marcic, C.; Sigrist, S.; Marchioni, E. Antioxidant capacity in

green and roasted coffee extracts, LWT-Food Sci. Technol. 2014, 58, 77-85.

Fink, A.; Rüfer, C.E.; Le Grandois, J.; Roth, A.; Aoude-Werner, D.; Marchioni, E.; Bub, A.;

Barth, S.W. Dietary walnut oil modulates liver steatosis in the obese Zucker rat, Eur. J. Nutr.

2014, 53, 645–660. Belkacem, S.; Belbache, H.; Boubekri, C.; Mosset, P.; Rached-Mosbah, O.; Marchioni, E.;

Benayache, S.; Benayache, F. Chemical constituents from Centaurea parviflora Desf., Res. J.

Pharm., Biol. Chem. Sci. 2014, 5, 1275-1279. Benayache, F.; Boureghda, A.; Ameddah, S.; Marchioni, E.; Benayache, F.; Benayache, S.

Flavonoids from Thymus numidicus Poiret, Der Pharmacia Lettre 2014, 6, 50-54.

Page 82: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Julien David, D.; Zhao, M.; Geoffroy, P.; Miesch, M.; Raul, F.; Aoudé-Werner, D.; Ennahar,

S.; Marchioni, E. Analysis of sitosteryl oleate esters in phytosterols esters enriched foods by

HPLC-ESI-MS2, Steroids 2014, 84, 84-91.

Song, B.S.; Choi, S.J.; Jin, Y.B.; Park, J.H.; Kim, J.K.; Byun, E.B.; Kim, J.H.; Lee, J.W.; Kim,

G.S.; Marchioni, E. A critical review on toxicological safety of 2-alkylcyclobutanones, Radiat.

Phys. Chem. 2014, 103, 188-193.

Zhou, L.; Zhao, M.; Bindler, F.; Marchioni, E. Comparison of the Volatiles Formed by

Oxidation of Phosphatidylcholine with Triglyceride in Model Systems, J. Agric. Food Chem.

2014, 62, 8295−8301.

Mezhoud, S.; Mekkiou, R.; Chalard, P.; Figueredo, G.; Marchioni, E.; Benayache, F.;

Benayache, S. Comparative essential oil composition of flowers and leaves of Warionia

saharae Benth. & Coss, Res. J. Pharm., Biol. Chem. Sci. 2014, 5, 1367-1372.

Mechehoud; Y.; Chalard, P.; Figueredo, G.; Marchioni, E.; Benayache, F.; Benayache, S.

Chemical composition of the essential oil of Ononis angustissima (Lam.) Batt. et Trab, Res. J.

Pharm., Biol. Chem. Sci. 2014, 5, 1307-1310.

Mechehoud, Y.; Chalard, P.; Figueredo, G.; Marchioni, E.; Benayache, F.; Benayache, S.

Chemical composition of the essential oil of haplophyllum tuberculatum (Forssk.) L.A. Juss.

From Algeria, Res. J. Pharm., Biol. Chem. Sci. 2014, 5, 1416-1419.

Carré, G.; Hamon, E.; Ennahar, S.; Estner, M.; Lett, M.C.; Horvatovich, P.; Gies, J.P.; Keller,

V.; Keller, N.; André, P. TiO2 photocatalysis damages lipids and proteins in Escherichia coli,

Appl. Environ. Microbiol. 2014, 80, 2573-2581.

Belloum, Z.; Chalard, P.; Figueredo, G.; Marchioni, E.; Zao, M.; Benayache, F.; Benayache,

S. Chemical composition of the essential oil of Salvia verbenaca (L.) Briq. ssp clandestina (L.)

Pugsl., Res J Pharm Biol Chem Sci. 2014, 5(6), 262-265.

Mohammadi, S.; Chalard, P.; Figueredo, G.; Marchioni, E.; Zao, M.; Benayache, F.;

Benayache, S. Chemical composition of the essential oil of Salvia aegyptiaca L., Res J Pharm

Biol Chem Sci. 2014, 5(6), 207-210.

Chebbah, K.; Marchioni, E.; Menad, A.; Mekkiou, R.; Sarri, D.; Ameddah, S.; Boumaza, O.;

Seghiri, R.; Benayache, S.; Benayache, F. Preliminary phytochemical screening, analysis of

phenolic compounds and antioxidant activity of Genista cephalantha Spach. (Fabaceae),

International journal of phytomedicine 2014, 6(3).

CLASSEMENT DES REVUES ET DES PUBLICATIONS

2014

(nombre total : 15 publications, dont 6 publications classées)

Facteur d’impact >10 5 à 10 2 à 5 1 à 2 <1 non

classées

Nbre de Journaux - - 5 1 - 4

Page 83: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Nbre de Publications - - 5 1 - 9

% des publications

figurant dans le Journal

Citation Reports

- - 33,3 6,7 - 60

II. Articles dans des revues sans comité de lecture

Néant

III. Brevets

Néant

IV. Communications avec actes Néant

Internationales

Communications orales

1. Dal, S.; Van der Werf, R.; Walter, C.; Bietiger, W.; Seyfritz, E.; Mura, C.; Péronet, C.; Le

Grandois, J.; Werner, D.; Ennahar, S.; Digel, F.; Pinget, M.; Jeandidier, N.; Marchioni, E.;

Sigrist, S. Rééquilibrage alimentaire et enrichissement en antioxydants naturels : une nouvelle

approche dans la prévention du diabète de type 2 chez l’animal, Journées Francophones de

Nutrition, 10-12 décembre 2014, Bruxelles (Belgique).

Communications par affiches à des congrès

1. Clayeux, C.; Ennahar, S.; Steyer, D. Screening of the antioxidants compounds of white

Alsatian wines, Congrès International Wine Active Compounds, 2014, 26-28 mars 2014,

Beaune (France).

2. Le Grandois, J.; Araujo, M.M.; Hamon, E.; Bergaentzlé, M.; Marchioni, E.; Deborde, J.L.;

Werner, D. Comparison of two chromatographic methods using LC-MS² for simultaneous

determination of water-soluble vitamins- -International Vitamin Conference 12-15 Mai 2014,

Washington (USA).

3. Rodrigues, F.T.; Marchioni, E.; Kuntz, F.; Villavicencio, A.L.C.H..; Julien-David, D.

Evaluation of profenofos in aqueous solution by electrons beam, 4th International Nuclear

Chemistry Congress, 14-19 septembre 2014, Maresias, SP (Brézil).

4. Benayache, S.; Aissaoui, M.; Lassed, S.; Zama, D.; Leon, F.; Marchioni, E.; Brouard, I.;

Oliveira, P.; Benayache, F. New bioactive molecules from reseda alphonsi, Chemical

Page 84: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Technologies and Chemical Engineering Conference (Chemtech’14), 23-25 octobre 2014,

Istambul (Turquie).

5. Essaid, C.; Boudjerda, A.; Marchioni, E.; Leon, F.; Brouard, I.; Benayache, S.; Benayache,

F. New Coumarins and other constituents from Pituranthos battandieri Maire (Apiaceae) ,

CHEMTECH 14 Chemical Engeneering and Chemical Technologies Conference , 23-25

October 2014, Istanbul (Turquie).

6. Dal-Ros, S.; Van der Werf, R.; Walter, C.; Bietiger, W.; Seyfritz, E.; Mura, C.; Péronet, C.;

Legrandois, J.; Werner, D.; Ennahar, S.; Digel, F.; Pinget, M.; Jeandidier, N.; Marchioni, E.;

Sigrist, S. Apports bénéfiques des antioxydants naturels dans la prévention du diabète de

type 2 chez l’animal. SFD 2014 – Congrès de la Société Francophone du Diabète, 11-14

Mars 2014, Paris (France).

7. Aissaoui, M.; Leon, F.; Brouard, I.; Benayache, F.; Benayache, S. Three new Phenolic

Rhamnoside compounds and a new spermidine alkaloids from Reseda alphonsii (Coss) Müll

Arg. 5 th Chemistry Conference, 26-29 Avril 2014, Abha (Saoudi Arabia).

Nationales Néant

V. Communications sans actes Néant

VI. Conférences invitées

1. Marchioni, E. “2-ACBs analysis for the chemical detection of low dose irradiated foods”,

Consultants Group Meeting on “New Methods for the Detection and Quantification of

Irradiation in Intercepted Insects”, Joint FAO/IAEA Programme, Vienne (Autriche) 10-14

Mars 2014.

2. Ennahar, S.; Marchioni, E. Techniques analytiques d’étude des aliments dits fonctionnels.

Isolement et purification bio-guidés de molécules actives. Université Sidi Mohamed ben

Abdallah. Fès, Maroc. 16 décembre 2014.

VII. Ouvrages scientifiques (ou chapitres) Néant

VIII. Ouvrages de vulgarisation (ou chapitres) Néant

IX. Direction d'ouvrages Néant

X. Autres publications Néant

XI. Autres activités internationales Néant

Page 85: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

XII. Valorisation Néant

Contrats

Contrats nationaux

1. « EVA: Stress oxydant et diabète », Convention de Recherche N°383-11 et développement

d’une durée de 36 mois financée par la Région Alsace notifiée le 8 avril 2011

2. « Analyse du rôle de l’acide docosahexaénoïque dans la Sclérose Latérale Amyotrophique »,

convention de recherche d’une durée de 2 ans, notifiée le 21 aout 2012 et financée par

l’association ARS

3. « Innovations Analytiques », Convention constituant l'Unité Mixte Technologique UMT 11.3

d'une durée de 5 ans, notifiée en novembre 2011 et financée par l'ACTIA.

4. «Analyse de composés volatils» contrat de collaboration de recherche avec la Société

Twistaroma.

Contrat internationaux

1. Valorisation des extraits végétaux, étude phytochimique et pharmacologique, applications

socio-économiques ", Projet Tassili N°12MDU856, notifiée le 16 janvier 2011, d’une durée

de 4 ans et financé par EGIDE

2. Valorization of natural ressources from Madagascar. Convention de partenariat notifié le 15

octobre 2012 avec le Dr Charles ANDRIANJARA de l’Institut Malgache de Recherches

Appliquées (IMRA).

3. « Keep Healthy Kids » financé par les fonds structuraux européens Lead Era (FEDER),

d’une durée de trois années, (72 k€), notifié en novembre 2013

4. “Trafoon”, Contrat Européen du FP7 “Traditional Food Network to improve the transfer of

knowledge for innovation”, programme FP7-KBBE-2013-7. Notifé le 17 mai 2013

XIII. Formation permanente Néant

XIV. Organisation de congrès Néant

XV. Thèses soutenues Néant

XVI. HDR soutenues Néant

XVII. Distinctions Néant

Page 86: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

EA 3994

Centre des études internationales et européennes

Faculté de droit,

Université de Strasbourg

(Activité J-Y. Pabst)

- la liste du personnel affecté à vos départements/unités de recherche (permanents, doctorants, ITA, ...)

- un court résumé des activités de recherche (par équipe, par domaine, ...)

- le nombre de thèses de doctorats soutenues en 2013

- l'adresse internet du/es équipe(s), unité(s), département

[email protected]

I. Articles dans des revues avec comité de lecture

I. Publications scientifiques

Lehmann, H. ; Pabst, J-Y. ; Weniger, B. L’écorce de Monésia : identité botanique, composition

phytochimique et utilisations thérapeutiques, Ethnopharmacologia, 52,76-78, 2014.

II. Conférences prononcées à l’Université III. Participation à des colloques nationaux et internationaux IV. Prix de thèse

XV. Thèses soutenues

STAEDELIN Marie (50 %) Methodological approaches for the benefit-risk assessment of medicinal

products in European regulatory decision-making : A special emphasis on a quantitative approach the

MultiCriteria Decision Analysis “MCDA” Method. Thèse soutenue le 28 mars 2014.

Page 87: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Plate-forme de Chimie Biologique Intégrative de Strasbourg

(PCBIS)

Unité Mixte de Service (UMS) 3286 CNRS-UdS

Directeur : Pascal VILLA

Secrétariat : Sylvie DOUESSIN (T CNRS 50 %)

Gestion : Claire Guth (AI CNRS 20 %)

Créée en 1999, la PCBIS, possède une chaîne de ressources et de compétences permettant

d’accélérer la découverte de molécules bioactives. Ses prestations spécifiques s’étendent de la

molécule aux tests in vitro et in vivo et s’articulent autour de différents services ouverts aux

laboratoires publics ou privés. La PCBIS est aujourd’hui spécialisée dans le développement de tests à

façon et la mise à disposition d’appareils et de technologies. Pour mieux répondre aux attentes de ses

collaborateurs et améliorer continuellement la qualité de ses prestations la PCBIS s’est engagée dans

une démarche Qualité. Elle est aujourd’hui certifiée NF X50-900 et ISO 9001.

Les services « Criblage »et « Ciblothèque » assurent la validation et la miniaturisation des

modèles biologiques, ainsi que la production des cibles moléculaires et cellulaires. Maîtrisant les outils

validés par l’industrie pharmaceutique, le service « Criblage » réalise les tests robotisés des molécules

sur les modèles biologiques et l’analyse des résultats afin d’initier la recherche de nouvelles molécules

bio-actives.

Les appareils et technologies sont également mis à disposition des utilisateurs pour réaliser leurs

expériences dans un environnement contrôlé.

Le service « Chimiothèque » collecte et conditionne des molécules synthétisées par les chimistes

ainsi que des produits naturels destinés au criblage et propose des études de relations structure-activité.

Le service d’analyses (TechMedILL) permet d’évaluer les propriétés ADME-Toxicité des

molécules actives.

CRIBLAGE

Activités :

Criblage à façon robotisé

> 10000 mesures par jour (fluorescence, anisotropie, HTRF, FRET, luminescence, BRET,

absorbance, alpha-screen…)

Développement de tests pharmacologiques automatisés

Tests moléculaires in vitro (ligand - récepteur, tests enzymatiques...)

Tests cellulaires sur bactéries et cellules eucaryotes (libération de facteurs solubles, survie

cellulaire, croissance cellulaire, cicatrisation cellulaire après blessure, toxicité...)

Mise à disposition de robots et lecteurs avec formation et/ou accompagnement

Equipe :

VILLA Pascal IR CNRS 100 %

GIORIA Sophie IE CNRS 100 %

KNITTEL-OBRECHT Adeline T CDI 100 %

MATOUSSI Soraya Stagiaire master

ALAMI MERROUNI Ilyass Stagiaire master ERASMUS

Page 88: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

LORNAGE Xavière Stagiaire ingénieur ESBS

MARIN Annick Post-doc CDD Microfluidique 100%

BECK Yannick Post-doc CDD microfluidique 100%

CHIMIOTHEQUE

Activités :

Gestion de chimiothèques (dont la collection de plus de 6000 molécules (chimiques et naturelles)

de l’UMR 7200)

Gestion d’une base de données (MDL ISIS/Base) et Activity Base

Etudes de relations structure/activité

Re-synthèse de molécules actives issues des criblages

Equipe :

DIDIER Bruno IR CNRS 50 %

MARSOL Claire IGR UdS 20 %

BUISINE Pascale T CNRS 20 % (mise à disposition au PACSI)

CIBLOTHEQUE

Activités :

Développement et miniaturisation de tests pharmacologiques

Production de cibles biologiques thérapeutiques (GPCRs, kinases, etc.)

Clonage, expression et production de protéines et de lignées cellulaires

Mise à disposition d’équipements et formations d’utilisateurs

Equipe :

SCHMITT-VALENCIA Christel IE CNRS 80 %

ADMETox

Activités :

Développement de tests ADME-tox

Evaluation des propriétés pharmacocinétiques de molécules biologiquement actives

1. Propriétés moléculaires

1. Solubilité

2. Log P / log D

3. pKa

4. Stabilité chimique

5. PAMPA

6. Stabilité plasmatique

7. Liaison aux protéines plasmatique

2. Tests cellulaires

1. Perméabilité Caco-2

2. Cytotoxicité

3. Métabolisme in vitro (Stabilité métabolique, CYP recombinants, identification des

métabolites, intéractions pharmacologiques)

4. Interactions médicamenteuses (induction des cytochromes P450)

3. in vivo

1. Pharmacocinétique

Page 89: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

2. Passage de la barrière hémato-encéphalique

3. Modèles animaux

Equipe :

GIZZI Patrick IE CNRS 100 %

DAUBEUF François IE CDD 10 %

I – Articles dans des revues avec comité de lecture

• Maletta, M.; Orlov, I.; Roblin, P.; Beck, Y.; Moras, D.; Billas, IM.; Klaholz, BP. The palindromic

DNA-bound USP/EcR nuclear receptor adopts an asymmetric organization with allosteric domain

positioning. Nat. Commun. 2014, 5:4139. IF = 10.742

• Margathe, JF.; Iturrioz, X.; Alvear-Perez, R.; Marsol, C.; Riché, S.; Chabane, H.; Tounsi, N.; Kuhry,

M.; Heissler, D.; Hibert, M.; Llorens-Cortes, C; Bonnet, D. Structure-Activity Relationship Studies

toward the Discovery of Selective Apelin Receptor Agonists. J. Med. Chem. 2014, 57, 2908-2919 IF =

5.480

• Ruggiu, F.; Gizzi, P.; Galzi, JL.; Hibert, M.; Haiech, J.; Baskin, I.; Horvath, D.; Marcou, G.; Varnek,

A. QSPR modelling – a valuable support in HTS quality control. Anal. Chem. 2014, 86(5):2510-2520.

IF = 5.825

• Karpenko, I.A.; Kreder, R.; Valencia, C.; Villa, P.; Mendre, C.; Mouillac, B.; Mély, Y.; Hibert, M.;

Bonnet D.; Klymchenko, A. S. Red Fluorescent Turn-On Ligands for Imaging and Quantifying G

Protein-Coupled Receptors in Living Cells. ChemBioChem. 2014, 15: 359-363. IF = 3.060

CLASSEMENT DES REVUES ET DES PUBLICATIONS

2014

(nombre total : 4 publications classées)

Facteur d’impact >10 5 à 10 2 à 5 1 à 2 <1 non

classées

Nbre de Journaux 1 2 1 - -

Nbre de Publications 1 2 1 - -

% des publications

figurant dans le Journal

Citation Reports

25 50 25 - -

II – ARTICLES DANS DES REVUES SANS COMITE DE LECTURE

Néant

Page 90: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

III – BREVETS

Néant

IV – COMMUNICATIONS AVEC ACTES

Internationales

• Adeline Obrecht, Christel Valencia, Bruno Didier, Sophie Gioria, Claire Marsol, Patrick Gizzi, Pascale

Buisine, Yannick Beck, Annick Marin, Pascal Villa PCBIS: Chemical libraries, biological models,

technological tools and early ADMETox for laboratories Journées RICT (SCT) Rouen : 2 au 4 juillet

2014

• Christel Valencia, Jean-François Margatte, Sophie Gioria, Adeline Obrecht, Nicolas Humbert, Hugues

de Rocquigny, Marcel Hibert, Elodie Dupuis, Pascal Villa, Dominique Bonnet INNOVATIVE HTRF

BINDING ASSAY TO SCREEN THE APELIN RECEPTOR USING TAG-LITE® TECHNOLOGY

Journées RICT (SCT) Rouen : 2 au 4 juillet 2014

• Houël, E., Fleury, M., Jullian, V., Vonthron-Sénécheau, C., Nardella, F., Villa, P., Odonne, G.,

Eparvier, V., Deharo, E., Stien, D., Takamalaimë (Psidium acutangulum Mart ex DC) : understanding

the use of an antimalarial traditional remedy from French Guiana. 797). American Society of

Pharmacognosy 2014 Annual Meeting, Oxford, MS (USA), 2-6/08/2014: (Planta Medica 10(80), July

2014.

• L Mailly, F Xiao, J Lupberger, G Wilson, C Leboeuf, P Aubert, F Duong, I Fofana, C Thumann, S

Bandiera, M Lütgehetmann, T Volz, C Davis, H Harris, E Girardi, B Chane-Woon-Ming, N Fletcher, R

Bartenschlager, P Pessaux, P Meuleman, P Villa, S Pfeiffer, M Heim, M Zeisel, M Neunlist, M

Dandri, J McKeating, E Robinet, T Baumert. Clearance of persistent hepatitis C virus infection using a

monoclonal antibody specific for tight junction protein claudin-1. Banff, 7-11 September, 2014 21st

International Symposium on Hepatitis C Virus and Related Viruses (Canada)

• RAY AM, CHOULIER L, LEHMANN M, LELONG-REBEL I, MARTIN S, BRINO L, VILLA P,

ROGNAN, D & DONTENWILL M. In silico screening and cell-based assay for identification of α5β1

integrin allosteric antagonists, 5e French cell adhesion club symposium, Marseille,15-16 mai 2014.

Nationales

• Adeline Obrecht, Christel Valencia, Bruno Didier, Sophie Gioria, Claire Marsol, Patrick Gizzi, Pascale

Buisine, Yannick Beck, Annick Marin, Pascal Villa. PCBIS: Chemical libraries, biological models,

technological tools and early ADMETox for laboratories. Journées de la Chimiothèque Nationale, 19-

20 juin 2014, Orléans.

• Patrick Gizzi, Adeline Obrecht, Pascal Villa Cytochrome P450 induction assay with cryopreserved

hepatocytes Journées de la Chimiothèque Nationale, 19-20 juin 2014, Orléans.

V – COMMUNICATIONS SANS ACTES

Internationales

Page 91: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Nationales

• Hubert Aviolat, Sophie Gioria, Chantal Weber, Pascal Villa, Yvon Trottier and Fabrice A. C. Klein

SynAggreg: a new high-throughput in vitro aggregation assay to identify synergistic effects of

aggregation modulator compounds and for drug screening. Journées Campus Illkirch 7-8 avril 2014

Communication orale

• François Daubeuf, Dominique Bonnet, Virgile Beckaert, Ali Ouadi, Patrice Marchand, David Brasse,

Patrick Gizzi, Marcel Hibert, Jean-luc Galzi, Nelly Frossard. Unravelling the mechanism of action of

chalcone 4, a CXCL12 neutraligand, in asthma Posters : Journées Campus Illkirch 7-8 avril 2014

• Yannick BECK, Annick MARIN, Raphaël CALBRIX, Pascal VILLA, Andrew GRIFFITHS. High-

resolution dose-response screening using droplet-based microfluidic Posters : Journées Campus Illkirch

7-8 avril 2014

• Patrick Gizzi, Adeline Obrecht, Pascal Villa Cytochrome P450 induction assay with cryopreserved

hepatocytes Posters: Journées Campus Illkirch 7-8 avril 2014

VI – CONFERENCES INVITEES

• P Villa High Throughput screening en microfluidique. Conférence ELRIGfr-GENOTOUL Toulouse

15-16 octobre 2014

• P. Villa « Criblage pharmacologique et molécules innovantes à vocation thérapeutique » : journée PSP

France Strasbourg, 14 octobre 2014

• P. Villa: “Chemical biology: the way to find chemical keys for life’s locks” conference IGBMC,

Illkirch, 11 avril 2014.

VII – OUVRAGES SCIENTIFIQUES (OU CHAPITRES)

VIII – OUVRAGES DE VULGARISATION (OU CHAPITRES)

IX – DIRECTION D’OUVRAGES

X – AUTRES

Collaborations ou prestations de service pour industriels

• Domain Therapeutics

• Prestwick Chemical

• L’Oréal

• Cellipse Grenoble

• Harmonic Pharma Nancy

• ABIVAX Montpellier

• Manros Roscoff

Page 92: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Collaborations ou prestations de service pour laboratoires académiques

• UMR 7242 Illkirch

• UMR 7213 Illkirch

• UMR 7199 Illkirch

• UMR 7200 Illkirch

• IGBMC Illkirch

• UPR 9022 IBMC Strasbourg

• Université de Bamako, MALI

• Institut Pasteur Guyane

• Telecom Physique Strasbourg; ICube

• Université de Lomé, TOGO

• LabEx Medalis Strasbourg

• Unité 1110 INSERM, Strasbourg

• Institut Curie Paris

• UPMC Sorbonne Universités Paris

• Faculté de Médecine de Nancy- EA 7300 Nancy

• AFMB Polytech Marseille

• UMR 7509 Strasbourg

• UMR 5250 Grenoble

• CERMN Caen

• Institut Pasteur Paris

• UMR 8076 BioCIS Paris

• IBMC Strasbourg

• EA4566 Université de Haute Alsace Mulhouse

• UMR 7177 Strasbourg

XIII - Formation permanente

Participation aux formations permanentes ou enseignements:

- Utilisation des méthodes de fluorescence dans le criblage à haut débit (Illkirch organisé par P. Villa)

- Méthodes et applications de la fluorescence (Illkirch organisé par Y. Mély)

- Initiation à la culture cellulaire (Illkirch, organisé par J.P. Gies et P. André)

- Ecole d’Ingénieurs ESBS et Master Pharma et Telecom physique TIC santé.

- Ecole d’été Medalis

XIV - Organisation de congrès

Ecole thématique CNRS : « CRIBLAGE BIOLOGIQUE: IMPACT EN CHEMO-BIOLOGIE ET

INNOVATION THERAPEUTIQUE » La Petite Pierre, 17 au 19 septembre 2014

XV - Thèses soutenues

XVI - HDR soutenues

Page 93: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

XVII – Distinctions

Plate-forme Nationale labelisée IBiSA

Membre du LabEx Medalis

Certification ISO 9001

Certification NF X50-900

Page 94: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Plate-forme eBioCyt

UPS 1401-Unistra

Directeur : Christian D. MULLER - CR1 CNRS

Directrice adjointe : Geneviève UBEAUD-SEQUIER – PUPH

I. COMPOSITION DE L’EQUIPE EN 2014

- COMITE DE PILOTAGE

Geneviève Ubeaud-Séquier, PU-PH en phamacocinétique, experte nationale en toxicologie

Jean-Pierre Gies, PU en signalisation cellulaire, expertise en pharmacologie

Serge Dumont, MCU en biologie cellulaire, expertise en cycle cellulaire

Christian D Muller, CR1 CNRS, pharmacologue, expert international en cytomique

- INGENIEUR DE RECHERCHE : poste en attente de création

Jean Peluso, Dr., post-doc MAREX, FP7 (2011/14): faisant fonction du 1/1 au 31/08/2014

- STAGIAIRES :

Encadrant CD MULLER

Daniel KARA, 3ème

année de thèse, Université de Prague (Tchèquie)

Sanja VRBEK, pharmacien, StemChem–CM 1106, Université de Ljubljana (Slovénie)

Dominik NABERGOJ, pharmacien, StemChem–CM 1106, Université de Ljubljana (Slovénie)

Cansu PALA, master, Marex FP-7, Université de EGE (Turquie)

Encadrant : G. Ubeaud-Séquier

Sagot Lucie pharmacien (UE Initiation à la recherche) Unistra

- CONSEIL SCIENTIFIQUE

Jean-Luc VONESCH, Direction du Centre d'Imagerie Photonique de l'IGBMC, Illkirch

Dominique DUMAS, Direction du PTIBC-IBISA UMR 7561 CNRS, Nancy

Corinne Laplace-Builhé, Direction du PFICC, IGR, Paris

Sylviane MULLER, Direction Medialis UPR 3572 CNRS, IBMC, Strasbourg

Georges HOUIN, Direction IFB, PurpanCHU de Toulouse

Page 95: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

II THEMES DE RECHERCHE et DOMAINE D’EXPERTISE

DOMAINE D’EXPERTISE.

eBioCyt est une plate-forme de mise au point de bio-essais pharmacologiques et pharmacocinétiques en

micro-volumes et lecture rapide mais aussi de tests en routine de réponse cellulaire permettant le criblage

à haut contenu au format 96 puits.

En 2014, eBioCyt a rempli plusieurs de ses missions :

a. Répondu aux besoins des utilisateurs pour l’acquisition de données en cytométrie (flux et image) et

l’analyse de ces données et réaliser des prestations de service en fonction des capacités (infrastructures,

équipement, personnel et expertise) de la structure.

b. Mis à disposition le matériel et les techniques pour réaliser des études de microscopie à fluorescence et

cytométrie.

e. Permis un transfert technologique et de savoir-faire notamment par collaboration avec les UMR de la

faculté.

f. Valorisé le savoir faire par des publications

COMPETENCES.

eBioCyt est une plate-forme de test en routine avec des méthodologies originales en cytomique (toxicité,

inflammation, apoptose). Les appareillages actuels de la plate-forme, tous au format 96 puits, sont 3

cytomètres capillaires plus 1 cytomètre pour cellules adhérentes de dernière génération. La salle de culture

cellulaire de la plateforme eBioCyt (3 hottes à flux laminaire 1 incubateur) est actuellement partagée avec

l’EA 7293 du Pr. Laurence Kessler récemment installée à la Faculté de Pharmacie. Ainsi eBioCyt a

accepté que les étudiants de l'EA 7293 puissent utiliser la salle de culture cellulaire le temps qu'il soit

remédié à leur situation et afin de permettre une meilleure gestion des manipulations. L'EA 7293 bénéficie

du matériel existant dans la salle de culture de l’eBioCyt et a installé en plus, un deuxième incubateur

CO2.

THEMES DE RECHERCHE

A. La scramblase, nouvelle cible thérapeutique (resp. C.D. Muller)

La scramblase comme nouvelle cible thérapeutique pour induire l’apoptose des cellules cancéreuses dans

les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin et leurs cancers associés est un projet de recherche

conduit sous la direction et responsabilité scientifique de CD Muller. Marex a permis le recrutement d'un

ingénieur de recherche, le Dr. J Peluso (2011-2014); les travaux sur le mécanisme d'action des molécules

naturelles les plus actives sont réalisés dans notre laboratoire en collaboration avec Pr. Danijel Kikelj de la

Faculté de Pharmacie de l’Université de Ljubljana (Slovénie) par 2 étudiants pharmaciens (Mlle Sanja

Vrbek et Mr Dominik Nabergoj) en détachement sur un financement ERASMUS puis COST StemChem–

CM 1106. Ce projet prend place dans le domaine de la compréhension des mécanismes d'activation de

l'apoptose dans les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin (MICI) et leurs cancers associés. Il

s’inscrit dans une stratégie de recherche de nouvelles molécules ayant des propriétés pharmacologiques

Page 96: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

capables d’enrayer tout développement d'un cancer colorectal. L’enzyme Phospholipide scramblase 1

(PLSCR1) est surexprimée dans les cancers colorectaux (CRC) et le cancer métastatique du foie. La

réduire au silence à l’aide de siRNA inhibe la prolifération, l'adhérence, la migration et l'invasion dans des

cellules de lignée humaine de métastase du colon, ce qui suggère que PLSCR1 contribue à la

tumorigénicité et la progression tumorale du CRC. PLSCR1 peut ainsi être une cible de thérapie

potentielle pour les CRC. La Phospholipide scramblase 1 (PLSCR1) membre de la famille de gène

PLSCR est donc impliquée dans des processus cellulaires multiples comme le mouvement des

phospholipides, la régulation des gènes, l’immunoactivation, la prolifération cellulaire et l'apoptose. A la

lecture de ces résultats bibliographiques et fort de nos résultats préliminaires, l'inhibition de la scramblase

est une nouvelle voie thérapeutique de choix bien qu'encore peu explorée à ce jour. Les outils

pharmacologiques issus du projet MAREX associés aux différents modèles que nous avons su développer

au laboratoire, devraient nous donner rapidement accès à de nouvelles voies thérapeutiques anti-

cancéreuses en étudiant de manière approfondie les activités de la scramblase.

B. Transporteurs et hépatotoxicités médicamenteuses idiosyncrasiques. (resp. G.

Ubeaud-Séquier)

Le foie étant un organe de détoxification, de nombreux enzymes et transporteurs membranaires sont

impliqués dans l’élimination hépatobiliaire des molécules et dans l’apparition de pathologies

inflammatoires et d’hépatotoxicité médicamenteuse.

L'hépatotoxicité idiosyncrasique des médicaments résulte généralement d'une hypersensibilité induite par

les médicaments qui se produit de manière imprévisible chez des individus sensibles, à l'origine de 13%

des cas d'insuffisance hépatique aiguë. Ce type de toxicité représente un obstacle majeur au

développement de médicaments en raison du manque de tests de dépistage préclinique. Lors d’un stress

inflammatoire, les modifications de la production de médiateurs de l’inflammation sont susceptibles de

faire varier le métabolisme hépatique et l’élimination biliaire des médicaments, par altération des

mécanismes impliquant les enzymes (CYP450s, UGTs..) et les transporteurs membranaires (ABC, SLC).

Une modification de leur activité peut entraîner des effets toxiques. Aussi est-il primordial d’évaluer les

changements fonctionnels de l’ensemble des transporteurs dans un contexte inflammatoire pour pouvoir

prédire la toxicité idiosyncrasique potentielle des médicaments.

I. PRODUCTION SCIENTIFIQUE

1. Articles dans des revues internationales ou nationales avec comité de lecture

Ali Azouaou, S.; Emhemmed, F.; Idris-Khodja, N.; Lobstein, A.; Schini-Kerth, V.; Muller, C. D.;

Fuhrmann, G. Selective ROS-dependent p53-associated anticancer effects of the hypoxoside derivative

rooperol on human teratocarcinomal cancer stem-like cells. Invest New Drug 2014 DOI

10.1007/s10637-014-0182-6.

Emhemmed, F.; Azouaou, S.; Thuaud, F.; Schini-Kerth, V.; Desaubry, L.; Muller, C. D.; Fuhrmann, G.

Selective anticancer effects of a synthetic flavagline on human Oct4-expressing cancer stem-like cells

via a p38 MAPK-dependent caspase-3-dependent pathway. Biochem Pharmacol. 2014, 89, 185-96.

Kiuru, P.; D'Auria, M.V.; Muller, C.D.; Tammela, P.; Vuorela, H.; Yli-Kauhaluoma, J. Exploring

Marine Resources for Bioactive Compounds, Planta Med. 2014, 80, 1234-46.

Minker C.; Duban, L.; Karas, D.; Järvinen, P.; Lobstein, A.; Muller, C.D. Impact of Procyanidins from

Page 97: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Different Berries on Caspase 8 Activation in Colon Cancer. Oxidative Med. Cell. Longev. 2014, Article

ID 154164.

CLASSEMENT DES REVUES ET DES PUBLICATIONS

2014

(nombre total : 4 publications, dont 3 publications classées)

Facteur d’impact >10 5 à 10 2 à 5 1 à 2 <1 non

classées

Nbre de Journaux - - 3 - - 1

Nbre de Publications - - 3 - - 1

% des publications

figurant dans le Journal

Citation Reports

- - 66,7 - - 33,3

II. Brevets

Néant

III. Conférences données à l’invitation du comité d’organisation dans un congrès

national ou international

Muller CD

1. Scramblase, a new therapeutic target to induce apoptosis in cancer stem cells, COST Action CM1106,

Budapest, Hungaria 27-28 May 2014

2. Cytomic Screening for the Discovery of New Anticancer Natural Molecule from Extracts of Marine

Origins, CMCB-2014, Dalian Hi-tech Industrial Zone, China 25-29 april 2014

3. Cytomic analysis of Hepatotoxicity ESCCA 2nd International Summer School on Cytometry (ISSC)

Valencia, Spain 15 July 2014

4. Cytomic in Biotherapy Assessment ESCCA 2nd International Summer School on Cytometry (ISSC)

Valencia, Spain 16 July 2014

5. Principes fondamentaux de la cytométrie, Journées de formation pratiques en cytométrie, AFC, Saint

Malo, France 6-7 mai 2014

6. Couplage Image et Flux, Journées de formation pratiques en cytométrie, AFC, Saint Malo, France 6-7

mai 2014

7. Proanthocyanidins Extracted From Berries Induce Apoptosis By Activation Of Caspase-8 In Human

Colon Cancer Cell Lines. Colloque sur les Molécules et Ingrédients Santé MIS 2014, Quimper, France

21-22 mai 2014

Page 98: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

IV. Séminaires aux Universités et grand public

Néant

V. Formations sur la plateforme eBioCyt

Néant

Muller CD

3ème année TIC-santé (http://www.telecom-sante.fr/) Parcours Thérapeutiques Innovantes - biocapteurs

optiques, Telecom Physique, Strasbourg TP 6 heures sur eBioCyt, Année Universitaire 2013-14 et 2014-

15

Master Assurance qualité microbiologique des produits de santé Master Analyse du médicament, TP

Cytomique 4 heures, 2014

VI. Organisation de congrès

Muller CD

Co-organisateur du joint Annual Meetings of the French Society for Immunology and the French

Cytometry Association (AFC). Lille, 4-6 Novembre 2014

VII. Activités particulières

Muller CD

Expert auprès du CONICYT’s International Cooperation Programme of Chile

Chargé de cours ESCCA 2nd International Summer School on Cytometry (ISSC) Valencia, Spain

G. Ubeaud-Séquier

Membre du collège d’expert national en toxicologie du GIS - plateforme française pour le développement

des méthodes alternatives à l’expérimentation animale

VIII – VALORISATION (contrats de recherche, partenariats industriels, créations

d’entreprises, brevets, information et diffusion scientifique)

Contrats européens / réseaux d’excellence :

C.D. Muller WP leader projet européen MAREX FP7 2011/14

StemChem–CM 1106, COST 2014-2016

Prestations de service

3 UMR CNRS et 2 EA de l'UdS: 210 heures de cytométrie en 2014

University of Belgrade, Faculty of Technology and Metallurgy Karnegijeva 4

P.O. Box 3503, 11120 Belgrade, Serbia.

Page 99: Faculté de Pharmacie - Université de Strasbourg

Univerzita Palackého v Olomouci, Ustav lékaøské, Chemie a biochemie, Hnivotinska 3

775 15 Olomouc, CZ.

Guava/MilliporeMerck, 39 route industrielle de la Hardt 67120, Molsheim France

Nexcelom Bioscience Ltd, Unit 5 Greenheys Building, Manchester Science Park, Pencroft Way,

Manchester UK.