Grille de cours en 1ère année de formation MAGA - …€¦ · Génie génétique 55 5 Génie biochimique 45 3,5 ... 1 Master en Génie analytique option Biochimie ... A partir d’exercices,

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Catégorie Technique

Grille horaire du Master en Génie analytique option Biochimie

2012-2013 2013-2014

Grille de cours en 1ère année de formation – MAGA

FORMATION Heures ECTS Interdisciplinarité Gestion économique et financière 30 2 Gestion de la qualité 30 2 Communication et langues 30 2 Sciences fondamentales et appliquées Techniques de mesure 30 2 Sciences chimiques appliquées Chimie analytique 75 6 Chimie analytique instrumentale 35 3 Chimie organique 35 3 Génie chimique 30 3 Sciences appliquées aux biotechnologies Biochimie et biotechnologie 55 5 Biochimie et microbiologie 30 3 HEURES TOTALES HE 380 ACTIVITES D’IMMERSION PROFESSIONNELLE1

360

Activités de formation en entreprise 280 20 Projet 80 9 TOTAL 740

1 Activités correspondant au travail en entreprise

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Grille horaire du Master en Génie analytique option Biochimie

2012-2013 2013-2014

Grille de cours en 2e année de formation – MAGA

FORMATION Heures ECTS Interdisciplinarité Gestion de projet 25 2 Gestion environnementale et sécurité 25 2 Sciences fondamentales et appliquées

Statistiques appliquées 45 3,5 Sciences chimiques appliquées

Chimie analytique 15 1,5 Chimie analytique instrumentale 45 3,5 Sciences appliquées aux biotechnologies

Génie enzymatique 30 2 Génie génétique 55 5 Génie biochimique 45 3,5 Techniques d’analyse biochimique 25 2 Cours à option 60 5

Vaccinologie 15 1 Formulation 20 2 Immunologie 25 2 HEURES TOTALES HE 370 30 ACTIVITE D’IMMERSION PROFESSIONNELLE2

360

Activités de formation en entreprise 260 20 TFE 100 10 TOTAL 730

2 Activités correspondant au travail en entreprise


Objectifs et contenus des cours

du Master en Génie analytique option Biochimie

2012-2013 2013-2014

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Master en Génie analytique option Biochimie – 1ère année

Interdisciplinarité

Gestion économique et financière La gestion économique et financière a pour but de présenter les concepts de base du fonctionnement de l’entreprise c’est-à-dire la structure organisationnelle d’une entreprise (les différents départements). Ce cours visera la compréhension des documents annuels comptables d’une entreprise afin d’assurer une liaison avec le développement économique de l’entreprise. Il expliquera le rôle de la comptabilité et analysera un plan comptable et un bilan. A partir d’exercices, l’étudiant s’entraînera à la maîtrise des mécanismes comptables.

Contenus Repérer les différents départements et leurs connections, maîtriser les bases de la comptabilité générale, gérer les budgets d’investissement et de fonctionnement.

Gestion de la qualité La qualité en industrie pharmaceutique et biotechnologique: les GMP et GLP ont pour but de familiariser les futurs masters aux bonnes pratiques de fabrication et aux bonnes pratiques de laboratoire permettant de garantir la qualité des produits selon les normes requises pour leur commercialisation.

Contenus Gestion de la qualité, personnel, locaux et équipements, hygiène, documentation, matières et composants, validation, audit interne, plainte et rappel, sous-traitance.

Communication et langues L’objectif de ce cours est d’entraîner l’étudiant à utiliser l’anglais tant au niveau oral qu’au niveau écrit à des situations qu’il pourrait rencontrer en entreprise(rapport oral ou écrit en anglais, conversation téléphonique, CV, lettre de motivation, entretien d’embauche,…).

Contenus Rédiger divers documents (document technique, présentation technique, lettre de motivation, CV). Expression orale (s’adresser à technicien, un fournisseur, un client, un supérieur ou à un collège).




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Sciences fondamentales et appliquées

Techniques de mesures L’objectif principal visé à travers le cours et les laboratoires consiste à fournir les bases théoriques et les informations nécessaires à la mise en œuvre d’un système de mesure complet à partir d’un cahier des charges. Le cours se compose de trente heures de cours communes à l’ensemble des groupes de cours. Ces heures sont réparties en 18 h de théorie et 12h projet.

Contenus Le cours théorique est structuré de la manière suivante: analyse fonctionnelle des systèmes de mesures, critères de sélection, conditions de travail. L’étude des éléments composants les systèmes de mesures: les capteurs: capteurs de température, capteurs de vitesse, débit, pression et niveau des

fluides. le transmetteur et système d’acquisition: intégration dans un système.

Sciences chimiques appliquées

Chimie analytique Le cours a pour but de fournir aux étudiant(e)s les connaissances nécessaires et suffisantes pour comprendre, voir optimiser, des protocoles d’analyse classique ou instrumentale.

Contenus Partie générale: gravimétrie, les différents équilibres chimiques et leurs applications en analyse classique, la potentiométrie, la conductimétrie. Partie instrumentale: les techniques spectrophotométriques (U.V. – visibles, S.E.A., S.A.A., fluorescence et phosphorescence).




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Chimie analytique instrumentale

Le cours a pour but de fournir aux étudiant(e)s les connaissances nécessaires et suffisantes pour comprendre et optimiser des protocoles d’analyse instrumentale faisant intervenir la chromatographie.

Contenus

Les techniques chromatographiques: généralités, analyses qualitative et quantitative. Chromatographie en phase gazeuse (classique et capillaire) et liquide (partage, adsorption, perméation, échanges d’ions,…).

Préparation des échantillons.

Chimie organique

Synthèse de biomolécules: l’objectif est de prendre connaissance des méthodes employées pour la synthèse des médicaments.

Contenus

Synthèse peptidique, synthèse combinatoire, modélisation moléculaire et étude des interactions entre un médicament et sa cible pharmacocinétique.

Génie chimique

Bases du génie chimique: séparation et purification des constituants, opérations unitaires communes la chimie et la biochimie. Etude approfondie du calcul des décanteurs.

Contenus

Présentation générale des opérations unitaires. Description approfondie de quelques opérations de grand tonnage: distillation, extraction liquide-liquide, absorption gaz-liquide, adsorption.

Fonctionnement et dimensionnement des décanteurs.




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Sciences appliquées aux biotechnologies

Biochimie et biotechnologie

Le cours comporte trois parties:

la première consacrée à des éléments de biochimie générale; la seconde aux techniques électrophorétiques et à la biochromatographie; la troisième aux biocapteurs.

Dans chaque partie, le but du cours sera d’insister sur les thèmes majeurs, régulation, relation structure fonction, de décrire et d’expliquer les techniques les plus importantes de la biochimie industrielle.

Première partie (20h): les enzymes: nature et classification, cinétique Michaëlienne; les éléments de rhéologie appliqués au domaine agroalimentaire (viscosimètre

capillaire et rotatif); la pression osmotique: observation, traitement thermodynamique des solutions

idéales et réelles.

Deuxième partie (20h):

Techniques électrophorétiques: principe général.

Electrophorèse sur papier, acétate de cellulose, agarose et gel de polyacrylamide.

Méthodes de détection, quantification des résultats, Blotting.

Techniques spéciales d’électrophorèse, électrophorèse capillaire et d’électro-

chromatographie.

Eléments de bio-chromatographie: filtration sur gel, IEX, HIC et affinité.

Troisième partie (15h):

Les biocapteurs, les biosenseurs: définition, types de biocapteurs, compléments de

cinétique enzymatique en phases hétérogènes, conception et applications industrielles,

Micro array.




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Biochimie et microbiologie

Cet intitulé regroupe deux parties:

la première partie concerne la problématique des biocontaminations en industrie, leurs

origines, leurs mesures et leur maîtrise par la mise en place de salles blanches;

la deuxième partie est consacrée au suivi d’une formation en culture cellulaire.

L’objectif de cette formation consiste à acquérir les connaissances ainsi que les techniques de

base indispensables à la mise en œuvre de culture de cellules dans le secteur bio

pharmaceutique.

Contenus

Première partie:

Travaux pratiques d’initiation aux techniques de prélèvement et de contrôle des

biocontaminants. Les différentes origines des biocontaminations.

Définition des différentes catégories de salles blanches et des activités pouvant se dérouler à l’intérieur de chacune de ces classes. Aperçu général des technologies utilisées pour construire des salles blanches et des différentes étapes permettant leur élaboration et visite d’une salle blanche. Deuxième partie: Culture cellulaire: aspects théoriques, procédures de travail en salle blanche, mise en pratique des SOP, passage de cellules cultivées en tapis par trypsination, dénombrement des cellules par comptage sur cellule de Thomas, mise en collection, modes de production industriels,…

Activités d’immersion professionnelle Activités de formation en entreprise L’immersion professionnelle permet à l’étudiant de: s’adapter à un milieu de travail; découvrir le secteur d’activité d’une entreprise (marché, fonctionnement, organisation,

missions, relations humaines, gestion,…); poser un regard critique sur le fonctionnement d’une entreprise, d’une équipe, d’un service

et d’un métier en lien avec le cours de gestion; exécuter des tâches en utilisant des technologies appliquées en industrie;




2012-2013 2013-2014

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poser un regard critique sur les technologies utilisées (comprendre le principe théorique et pratique);

communiquer efficacement. Démarches d’apprentissage Période d’observation, de recherche d’informations et de leur compilation (de durée variable selon le stage) suivie d’une période de participation active à la compréhension des technologies utilisées pour réaliser l’activité technique demandée. L’étudiant veillera à la tenue de son portfolio d’apprentissage et le fera évoluer au cours du temps. Ce portfolio reprendra les synthèses bimensuelles décrivant le travail et les apprentissages réalisés toutes les deux semaines, la description détaillée des techniques présentées dans les synthèses bimensuelles, les synthèses des recherches bibliographiques, les synthèses des rencontres mensuelles avec le superviseur, des travaux, des documents administratifs. Présentation orale certificative «découverte et intégration en entreprise» devant le tuteur et le superviseur, en entreprise.

Projet Le projet consiste en la réalisation, en entreprise, d’un travail de recherche en liaison avec les activités de l’entreprise dans laquelle l’étudiant effectuera ce travail. Les objectifs généraux du projet sont : exécuter une mission à un métier; réaliser, analyser et présenter un travail scientifique bien défini (optimisation d’une

technique, validation d’une méthode, d’un matériel,…); mettre en application les acquis de la formation théorique et pratique; s’auto-évaluer et mettre en place une méthode d’amélioration continue. Démarches d’apprentissage Apprentissage et manipulation de techniques et/ou de technologies sous la supervision du tuteur ou de son délégué. Analyse des résultats obtenus et discussion de ces résultats en collaboration avec le tuteur et/ou l’équipe du laboratoire d’accueil. Relecture du rapport final écrit et feedback par le tuteur et/ou le superviseur pour améliorer la rédaction.




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Master en Génie analytique option Biochimie – 2ème année

Interdisciplinarité Gestion de projet L’objectif de la formation est de sensibiliser à la gestion de projet d’innovation technologique. Découvrir les outils de base méthodologiques pour gérer un projet et les appliquer à la situation de stage. Innovation technologique: découvrir les caractéristiques spécifiques des projets dans le

domaine de l’innovation technologique; Intégration dans une équipe de projet: comprendre le fonctionnement d’une équipe de

projet, comment s’organiser dans un projet, communiquer et organiser des réunions dans ce cadre.

Contenus

Le fonctionnement d’une entreprise, la notion de projet d’innovation technologique, l’étude de faisabilité – Partenariats, le projet dans l’organisation, la planification d’un projet, le diagramme Gannt, le plan des ressources, la gestion des risques, les facteurs clés de succès du projet, le fonctionnement d’une équipe, la Communication, l’Information et les Parties Prenantes, l’organisation de réunions efficaces.

Gestion sécurité et environnement L’objectif de la formation en biosécurité consiste à prendre connaissance des recommandations de l’OMS au sujet de l’application de codes de bonnes pratiques de laboratoire où sont manipulés des micro-organismes pathogènes. Cette formation attirera l’attention sur l’importance d’une attitude responsable du personnel de laboratoire. Contenus Biosécurité: normes, aspects législatifs, le risque biologique (OGM, micro-organismes pathogènes, aérosols), équipement et pratiques dans les laboratoires L1 à L4.




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Les Postes de Sécurité Microbiologique (PMS), le transport de matériel biologique, pratiques de décontamination. Biosécurité appliquée aux Prions, biosécurité dans le dépistage de l’ESB, gestion pratique de situations d’urgence dans les laboratoires L1 à L4.

Sciences fondamentales et appliquées Statistiques appliquées

Acquérir les concepts en bio statistique pour les essais cliniques et la recherche

pharmaceutique; Acquérir les bases de la planification expérimentale et les étapes de mise en œuvre de ces

plans dans le domaine de la recherche biopharmaceutique. Contenus Statistiques descriptives, inférence statistique, tests d’hypothèses, tests statistiques. Étude d’exemples de tests statistiques appliqués à la recherche pharmaceutique. Bases de la planification expérimentale: théorie et applications, exemple de cas.

Sciences chimiques appliquées Chimie analytique Ce cours a pour but de présenter les diverses méthodes électrochimiques permettant de réaliser une analyse chimique. Contenus Electrochimie: électrogravimétrie, coulométrie, les électrodes à membrane, les méthodes polagraphiques. Chimie analytique instrumentale Le cours a pour but de compléter les connaissances de la chimie analytique instrumentale appliquée à la chimie organique des polymères et macromoléculaire. En particulier, il a pour buts de former les étudiants aux choix d’appareillages les plus judicieux pour une analyse particulière ainsi que d’enseigner aux étudiants les techniques de base d’identification des composés organiques par combinaison synergique des informations tirées des spectres de masse (MS), infrarouge, de résonance magnétique nucléaire (RMN) et ultraviolet (UV).




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Contenus Partie théorique: développement des spectrométries de masse, d’absorption dans

l’infrarouge et de résonance magnétique nucléaire. Partie exercices: 1) choix de la ou les techniques appropriées pour les analyses de petites et

grandes molécules ; 2) interprétation de spectres, identification spectrométrique et spectroscopique de composés organiques.

Sciences appliquées aux biotechnologies

Génie enzymatique Génie enzymatique et ingénierie des protéines: production d’enzymes industriels (extraction, purification,…), immobilisation et applications industrielles (agro-alimentaires, pharmaceutiques et analytique), production de protéines recombinantes, les bioréacteurs enzymatiques.

Génie génétique Bases fondamentales et outils de la biologie moléculaire, génétique des eucaryotes, amplification

génique et séquençage de l’ADN, les mutations, étude de la fonction des gènes, les techniques de

clonage, expression des protéines recombinantes, opérons et transgénèse végétale. Ce cours est

illustré par deux séances de travaux pratiques (transfection bactérienne, extraction du plasmide,

amplification PCR, électrophorèse sur gel d’agarose).

Génie biochimique Le cours a pour but d’initier les étudiants au génie des procédés biologiques, c’est-à-dire l’application des principes du génie à la stratégie de conception, d’ingénierie et de conduite des réacteurs biologiques ainsi qu’au calcul de dimensionnement et de la performance de ces bioréacteurs. Il a également pour but de développer quelques opérations unitaires du génie chimique appliquées au domaine biochimique.




2012-2013 2013-2014

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Contenus Processus microbiologiques:

caractérisation d’un processus microbiologique destiné à un réacteur microbiologique,

rendements des processus biologiques en réacteur, modèles cinétiques de la croissance microbienne.

Génie microbiologique – Modélisation du dimensionnement et de la performance des bioréacteurs : les réacteurs idéaux: le réacteur idéal continu infiniment mélangé (CSTR), le

chemostat de Monod, production cellulaire, formation de produits, écart par rapport au chemostat idéal, contamination;

les réacteurs non idéaux: culture continue en CSTR avec recyclage, culture continue en CSTR étagés, distribution des temps de séjour en réacteur.

Aération et agitation Transposition (scale-up) de l’échelle du laboratoire via l’écuelle pilote à l’échelle

industrielle Stérilisation: processus et procédés Chromatographie préparative et industrielle Opérations unitaires: techniques membranaires (microfiltration, ultrafiltration, osmose

inverse).

Techniques d’analyse biochimique Cours-projet visant à mobiliser les compétences du Master en Génie Analytique au travers de la

réalisation d’un projet de groupe, de la résolution de problèmes spécifiques, du «vécu» des

étudiants,…

Cours à option

Formulation La partie galénique a pour but d’expliquer les formes pharmaceutiques «traditionnelles» ainsi que les plus récentes développées grâce aux techniques modernes (formes vectorisées, nanoparticules, implants). Les formes galéniques du futur seront aussi abordées (cyclodextrines modifiées, matériaux mésoporeux). A construire: formulations en chimie.




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Immunologie La partie immunologie explique les principes de la réaction immunitaire et les acteurs de celle-ci. Elle étudie les différentes techniques immunologiques utilisées dans le monde professionnel pour quantifier et caractériser un échantillon.

Vaccinologie La partie vaccinologie comprend la classification des vaccins et leur mode d’action, la production, le contrôle les vaccins du futur.

Activités d’immersion professionnelle

Activités de formation en entreprise

L’objectif principal est de mettre l’étudiant en situation professionnelle afin qu’il découvre et s’adapte aux réalités et exigences du monde du travail. Contenus Réalisation d’une mission technique débouchant sur la rédaction d’un travail de fin d’études. Démarches d’apprentissage Pour atteindre la mission définie par son tuteur, l’étudiant effectuera diverses tâches (recherche bibliographique, manipulations, respect des procédures, application de protocoles,…). Il sera curieux et s’intéressera au travail réalisé par les membres du personnel travaillant dans le laboratoire d’accueil. Il collaborera avec les personnes exerçant une fonction comparable à celle habituellement confiée à un diplômé de niveau master.

TFE Le travail de fin d’études consiste en la rédaction d’un rapport des travaux scientifiques et techniques réalisés durant la formation en entreprise et en sa présentation finale et sa défense devant jury. Démarches d’apprentissage Le plan de rédaction, les parties théoriques et pratiques, l’interprétation des résultats seront discutés et critiqués sous la guidance du tuteur et du superviseur.

Documents

Grille de cours en 1ère année de formation MAGA - …€¦ · Génie génétique 55 5 Génie biochimique 45 3,5 ... 1 Master en Génie analytique option Biochimie ... A partir d’exercices,