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UNIVERSITE MOHAMMED V FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE -RABAT- ANNEE : 2011 THESE N°:100 LA QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES EAUX DE BAIGNADE THESE Présentée et soutenue publiquement le :………… PAR Mr. EL ATTIFFI EL OUADRASSI ALI Né le 22/06/1987 à KSAR EL KEBIR Pour l'Obtention du Doctorat en Pharmacie MOTS CLES : Eaux de baignade, Pollution, Risques sanitaires. MEMBRES DE JURY Mr. A.GAOUZI PRESIDENT Professeur de Pédiatrie Mr. M . ZOUHDI RAPPORTEUR Professeur de Microbiologie Mme. S. EL HAMZAOUI Professeur de Microbiologie Mme. S.AOUFI Professeur agrégé de Parasitologie JUGES

LA QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES EAUX DE BAIGNADE

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UNIVERSITE MOHAMMED V

FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE -RABAT-

ANNEE : 2011 THESE N°:100

LA QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES

EAUX DE BAIGNADE

THESE Présentée et soutenue publiquement le :…………

PAR Mr. EL ATTIFFI EL OUADRASSI ALI

Né le 22/06/1987 à KSAR EL KEBIR

PPoouurr ll''OObbtteennttiioonn dduu DDooccttoorraatt eenn PPhhaarrmmaacciiee

MOTS CLES : Eaux de baignade, Pollution, Risques sanitaires.

MEMBRES DE JURY

Mr. A.GAOUZI PRESIDENT

Professeur de Pédiatrie

Mr. M . ZOUHDI RAPPORTEUR

Professeur de Microbiologie

Mme. S. EL HAMZAOUI

Professeur de Microbiologie

Mme. S.AOUFI

Professeur agrégé de Parasitologie

JUGES

UNIVERSITE MOHAMMED V- SOUISSI

FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE - RABAT

DOYENS HONORAIRES :

1962 – 1969 : Docteur Abdelmalek FARAJ

1969 – 1974 : Professeur Abdellatif BERBICH

1974 – 1981 : Professeur Bachir LAZRAK

1981 – 1989 : Professeur Taieb CHKILI

1989 – 1997 : Professeur Mohamed Tahar ALAOUI

1997 – 2003 : Professeur Abdelmajid BELMAHI

ADMINISTRATION :

Doyen : Professeur Najia HAJJAJ

Vice Doyen chargé des Affaires Académiques et estudiantines

Professeur Mohammed JIDDANE

Vice Doyen chargé de la Recherche et de la Coopération

Professeur Ali BENOMAR

Vice Doyen chargé des Affaires Spécifiques à la Pharmacie

Professeur Yahia CHERRAH

Secrétaire Général : Mr. El Hassane AHALLAT

Conservateur : Ahmed ZAHIDI

PROFESSEURS :

Février, Septembre, Décembre 1973 1. Pr. CHKILI Taieb Neuropsychiatrie

Janvier et Décembre 1976

2. Pr. HASSAR Mohamed Pharmacologie Clinique

Mars, Avril et Septembre 1980

3. Pr. EL KHAMLICHI Abdeslam Neurochirurgie

4. Pr. MESBAHI Redouane Cardiologie

5. Mai et Octobre 1981

6. Pr. BOUZOUBAA Abdelmajid Cardiologie

7. Pr. EL MANOUAR Mohamed Traumatologie-Orthopédie

8. Pr. HAMANI Ahmed* Cardiologie

9. Pr. MAAZOUZI Ahmed Wajih Chirurgie Cardio-Vasculaire

10. Pr. SBIHI Ahmed Anesthésie –Réanimation

11. Pr. TAOBANE Hamid* Chirurgie Thoracique

12. Mai et Novembre 1982

13. Pr. ABROUQ Ali* Oto-Rhino-Laryngologie

14. Pr. BENOMAR M’hammed Chirurgie-Cardio-Vasculaire

15. Pr. BENSOUDA Mohamed Anatomie

16. Pr. BENOSMAN Abdellatif Chirurgie Thoracique

17. Pr. LAHBABI ép. AMRANI Naïma Physiologie

Novembre 1983

18. Pr. ALAOUI TAHIRI Kébir* Pneumo-phtisiologie

19. Pr. BALAFREJ Amina Pédiatrie

20. Pr. BELLAKHDAR Fouad Neurochirurgie

21. Pr. HAJJAJ ép. HASSOUNI Najia Rhumatologie

22. Pr. SRAIRI Jamal-Eddine Cardiologie

Décembre 1984

23. Pr. BOUCETTA Mohamed* Neurochirurgie

24. Pr. EL GUEDDARI Brahim El Khalil Radiothérapie

25. Pr. MAAOUNI Abdelaziz Médecine Interne

26. Pr. MAAZOUZI Ahmed Wajdi Anesthésie -Réanimation

27. Pr. NAJI M’Barek * Immuno-Hématologie

28. Pr. SETTAF Abdellatif Chirurgie

Novembre et Décembre 1985

29. Pr. BENJELLOUN Halima Cardiologie

30. Pr. BENSAID Younes Pathologie Chirurgicale

31. Pr. EL ALAOUI Faris Moulay El Mostafa Neurologie

32. Pr. IHRAI Hssain * Stomatologie et Chirurgie Maxillo-Faciale

33. Pr. IRAQI Ghali Pneumo-phtisiologie

34. Pr. KZADRI Mohamed Oto-Rhino-laryngologie

Janvier, Février et Décembre 1987

35. Pr. AJANA Ali Radiologie

36. Pr. AMMAR Fanid Pathologie Chirurgicale

37. Pr. CHAHED OUAZZANI Houria ép.TAOBANE Gastro-Entérologie

38. Pr. EL FASSY FIHRI Mohamed Taoufiq Pneumo-phtisiologie

39. Pr. EL HAITEM Naïma Cardiologie

40. Pr. EL MANSOURI Abdellah* Chimie-Toxicologie Expertise

41. Pr. EL YAACOUBI Moradh Traumatologie Orthopédie

42. Pr. ESSAID EL FEYDI Abdellah Gastro-Entérologie

43. Pr. LACHKAR Hassan Médecine Interne

44. Pr. OHAYON Victor* Médecine Interne

45. Pr. YAHYAOUI Mohamed Neurologie

Décembre 1988

46. Pr. BENHAMAMOUCH Mohamed Najib Chirurgie Pédiatrique

47. Pr. DAFIRI Rachida Radiologie

48. Pr. FAIK Mohamed Urologie

49. Pr. HERMAS Mohamed Traumatologie Orthopédie

50. Pr. TOLOUNE Farida* Médecine Interne

Décembre 1989 Janvier et Novembre 1990

51. Pr. ADNAOUI Mohamed Médecine Interne

52. Pr. AOUNI Mohamed Médecine Interne

53. Pr. BENAMEUR Mohamed* Radiologie

54. Pr. BOUKILI MAKHOUKHI Abdelali Cardiologie

55. Pr. CHAD Bouziane Pathologie Chirurgicale

56. Pr. CHKOFF Rachid Urologie

57. Pr. KHARBACH Aîcha Gynécologie -Obstétrique

58. Pr. MANSOURI Fatima Anatomie-Pathologique

59. Pr. OUAZZANI Taïbi Mohamed Réda Neurologie

60. Pr. SEDRATI Omar* Dermatologie

61. Pr. TAZI Saoud Anas Anesthésie Réanimation

Février Avril Juillet et Décembre 1991

62. Pr. AL HAMANY Zaîtounia Anatomie-Pathologique

63. Pr. ATMANI Mohamed* Anesthésie Réanimation

64. Pr. AZZOUZI Abderrahim Anesthésie Réanimation

65. Pr. BAYAHIA Rabéa ép. HASSAM Néphrologie

66. Pr. BELKOUCHI Abdelkader Chirurgie Générale

67. Pr. BENABDELLAH Chahrazad Hématologie

68. Pr. BENCHEKROUN BELABBES Abdellatif Chirurgie Générale

69. Pr. BENSOUDA Yahia Pharmacie galénique

70. Pr. BERRAHO Amina Ophtalmologie

71. Pr. BEZZAD Rachid Gynécologie Obstétrique

72. Pr. CHABRAOUI Layachi Biochimie et Chimie

73. Pr. CHANA El Houssaine* Ophtalmologie

74. Pr. CHERRAH Yahia Pharmacologie

75. Pr. CHOKAIRI Omar Histologie Embryologie

76. Pr. FAJRI Ahmed* Psychiatrie

77. Pr. JANATI Idrissi Mohamed* Chirurgie Générale

78. Pr. KHATTAB Mohamed Pédiatrie

79. Pr. NEJMI Maati Anesthésie-Réanimation

80. Pr. OUAALINE Mohammed* Médecine Préventive, Santé Publique et Hygiène

81. Pr. SOULAYMANI Rachida ép.BENCHEIKH Pharmacologie

82. Pr. TAOUFIK Jamal Chimie thérapeutique

Décembre 1992

83. Pr. AHALLAT Mohamed Chirurgie Générale

84. Pr. BENOUDA Amina Microbiologie

85. Pr. BENSOUDA Adil Anesthésie Réanimation

86. Pr. BOUJIDA Mohamed Najib Radiologie

87. Pr. CHAHED OUAZZANI Laaziza Gastro-Entérologie

88. Pr. CHRAIBI Chafiq Gynécologie Obstétrique

89. Pr. DAOUDI Rajae Ophtalmologie

90. Pr. DEHAYNI Mohamed* Gynécologie Obstétrique

91. Pr. EL HADDOURY Mohamed Anesthésie Réanimation

92. Pr. EL OUAHABI Abdessamad Neurochirurgie

93. Pr. FELLAT Rokaya Cardiologie

94. Pr. GHAFIR Driss* Médecine Interne

95. Pr. JIDDANE Mohamed Anatomie

96. Pr. OUAZZANI TAIBI Med Charaf Eddine Gynécologie Obstétrique

97. Pr. TAGHY Ahmed Chirurgie Générale

98. Pr. ZOUHDI Mimoun Microbiologie

Mars 1994

99. Pr. AGNAOU Lahcen Ophtalmologie

100. Pr. AL BAROUDI Saad Chirurgie Générale

101. Pr. BENCHERIFA Fatiha Ophtalmologie

102. Pr. BENJAAFAR Noureddine Radiothérapie

103. Pr. BENJELLOUN Samir Chirurgie Générale

104. Pr. BEN RAIS Nozha Biophysique

105. Pr. CAOUI Malika Biophysique

106. Pr. CHRAIBI Abdelmjid Endocrinologie et Maladies Métaboliques

107. Pr. EL AMRANI Sabah ép. AHALLAT Gynécologie Obstétrique

108. Pr. EL AOUAD Rajae Immunologie

109. Pr. EL BARDOUNI Ahmed Traumato-Orthopédie

110. Pr. EL HASSANI My Rachid Radiologie

111. Pr. EL IDRISSI LAMGHARI Abdennaceur Médecine Interne

112. Pr. EL KIRAT Abdelmajid* Chirurgie Cardio- Vasculaire

113. Pr. ERROUGANI Abdelkader Chirurgie Générale

114. Pr. ESSAKALI Malika Immunologie

115. Pr. ETTAYEBI Fouad Chirurgie Pédiatrique

116. Pr. HADRI Larbi* Médecine Interne

117. Pr. HASSAM Badredine Dermatologie

118. Pr. IFRINE Lahssan Chirurgie Générale

119. Pr. JELTHI Ahmed Anatomie Pathologique

120. Pr. MAHFOUD Mustapha Traumatologie – Orthopédie

121. Pr. MOUDENE Ahmed* Traumatologie- Orthopédie

122. Pr. OULBACHA Said Chirurgie Générale

123. Pr. RHRAB Brahim Gynécologie –Obstétrique

124. Pr. SENOUCI Karima ép. BELKHADIR Dermatologie

125. Pr. SLAOUI Anas Chirurgie Cardio-Vasculaire

Mars 1994

126. Pr. ABBAR Mohamed* Urologie

127. Pr. ABDELHAK M’barek Chirurgie – Pédiatrique

128. Pr. BELAIDI Halima Neurologie

129. Pr. BRAHMI Rida Slimane Gynécologie Obstétrique

130. Pr. BENTAHILA Abdelali Pédiatrie

131. Pr. BENYAHIA Mohammed Ali Gynécologie – Obstétrique

132. Pr. BERRADA Mohamed Saleh Traumatologie – Orthopédie

133. Pr. CHAMI Ilham Radiologie

134. Pr. CHERKAOUI Lalla Ouafae Ophtalmologie

135. Pr. EL ABBADI Najia Neurochirurgie

136. Pr. HANINE Ahmed* Radiologie

137. Pr. JALIL Abdelouahed Chirurgie Générale

138. Pr. LAKHDAR Amina Gynécologie Obstétrique

139. Pr. MOUANE Nezha Pédiatrie

Mars 1995

140. Pr. ABOUQUAL Redouane Réanimation Médicale

141. Pr. AMRAOUI Mohamed Chirurgie Générale

142. Pr. BAIDADA Abdelaziz Gynécologie Obstétrique

143. Pr. BARGACH Samir Gynécologie Obstétrique

144. Pr. BEDDOUCHE Amoqrane* Urologie

145. Pr. BENAZZOUZ Mustapha Gastro-Entérologie

146. Pr. CHAARI Jilali* Médecine Interne

147. Pr. DIMOU M’barek* Anesthésie Réanimation

148. Pr. DRISSI KAMILI Mohammed Nordine* Anesthésie Réanimation

149. Pr. EL MESNAOUI Abbes Chirurgie Générale

150. Pr. ESSAKALI HOUSSYNI Leila Oto-Rhino-Laryngologie

151. Pr. FERHATI Driss Gynécologie Obstétrique

152. Pr. HASSOUNI Fadil Médecine Préventive, Santé Publique et Hygiène

153. Pr. HDA Abdelhamid* Cardiologie

154. Pr. IBEN ATTYA ANDALOUSSI Ahmed Urologie

155. Pr. IBRAHIMY Wafaa Ophtalmologie

156. Pr. MANSOURI Aziz Radiothérapie

157. Pr. OUAZZANI CHAHDI Bahia Ophtalmologie

158. Pr. RZIN Abdelkader* Stomatologie et Chirurgie Maxillo-faciale

159. Pr. SEFIANI Abdelaziz Génétique

160. Pr. ZEGGWAGH Amine Ali Réanimation Médicale

Décembre 1996

161. Pr. AMIL Touriya* Radiologie

162. Pr. BELKACEM Rachid Chirurgie Pédiatrie

163. Pr. BELMAHI Amin Chirurgie réparatrice et plastique

164. Pr. BOULANOUAR Abdelkrim Ophtalmologie

165. Pr. EL ALAMI EL FARICHA EL Hassan Chirurgie Générale

166. Pr. EL MELLOUKI Ouafae* Parasitologie

167. Pr. GAOUZI Ahmed Pédiatrie

168. Pr. MAHFOUDI M’barek* Radiologie

169. Pr. MOHAMMADINE EL Hamid Chirurgie Générale

170. Pr. MOHAMMADI Mohamed Médecine Interne

171. Pr. MOULINE Soumaya Pneumo-phtisiologie

172. Pr. OUADGHIRI Mohamed Traumatologie-Orthopédie

173. Pr. OUZEDDOUN Naima Néphrologie

174. Pr. ZBIR EL Mehdi* Cardiologie

Novembre 1997

175. Pr. ALAMI Mohamed Hassan Gynécologie-Obstétrique

176. Pr. BEN AMAR Abdesselem Chirurgie Générale

177. Pr. BEN SLIMANE Lounis Urologie

178. Pr. BIROUK Nazha Neurologie

179. Pr. BOULAICH Mohamed O.RL.

180. Pr. CHAOUIR Souad* Radiologie

181. Pr. DERRAZ Said Neurochirurgie

182. Pr. ERREIMI Naima Pédiatrie

183. Pr. FELLAT Nadia Cardiologie

184. Pr. GUEDDARI Fatima Zohra Radiologie

185. Pr. HAIMEUR Charki* Anesthésie Réanimation

186. Pr. KANOUNI NAWAL Physiologie

187. Pr. KOUTANI Abdellatif Urologie

188. Pr. LAHLOU Mohamed Khalid Chirurgie Générale

189. Pr. MAHRAOUI CHAFIQ Pédiatrie

190. Pr. NAZI M’barek* Cardiologie

191. Pr. OUAHABI Hamid* Neurologie

192. Pr. SAFI Lahcen* Anesthésie Réanimation

193. Pr. TAOUFIQ Jallal Psychiatrie

194. Pr. YOUSFI MALKI Mounia Gynécologie Obstétrique

Novembre 1998

195. Pr. AFIFI RAJAA Gastro-Entérologie

196. Pr. AIT BENASSER MOULAY Ali* Pneumo-phtisiologie

197. Pr. ALOUANE Mohammed* Oto-Rhino-Laryngologie

198. Pr. BENOMAR ALI Neurologie

199. Pr. BOUGTAB Abdesslam Chirurgie Générale

200. Pr. ER RIHANI Hassan Oncologie Médicale

201. Pr. EZZAITOUNI Fatima Néphrologie

202. Pr. KABBAJ Najat Radiologie

203. Pr. LAZRAK Khalid ( M) Traumatologie Orthopédie

Novembre 1998

204. Pr. BENKIRANE Majid* Hématologie

205. Pr. KHATOURI ALI* Cardiologie

206. Pr. LABRAIMI Ahmed* Anatomie Pathologique

Janvier 2000

207. Pr. ABID Ahmed* Pneumophtisiologie

208. Pr. AIT OUMAR Hassan Pédiatrie

209. Pr. BENCHERIF My Zahid Ophtalmologie

210. Pr. BENJELLOUN DAKHAMA Badr.Sououd Pédiatrie

211. Pr. BOURKADI Jamal-Eddine Pneumo-phtisiologie

212. Pr. CHAOUI Zineb Ophtalmologie

213. Pr. CHARIF CHEFCHAOUNI Al Montacer Chirurgie Générale

214. Pr. ECHARRAB El Mahjoub Chirurgie Générale

215. Pr. EL FTOUH Mustapha Pneumo-phtisiologie

216. Pr. EL MOSTARCHID Brahim* Neurochirurgie

217. Pr. EL OTMANYAzzedine Chirurgie Générale

218. Pr. GHANNAM Rachid Cardiologie

219. Pr. HAMMANI Lahcen Radiologie

220. Pr. ISMAILI Mohamed Hatim Anesthésie-Réanimation

221. Pr. ISMAILI Hassane* Traumatologie Orthopédie

222. Pr. KRAMI Hayat Ennoufouss Gastro-Entérologie

223. Pr. MAHMOUDI Abdelkrim* Anesthésie-Réanimation

224. Pr. TACHINANTE Rajae Anesthésie-Réanimation

225. Pr. TAZI MEZALEK Zoubida Médecine Interne

226. Novembre 2000

227. Pr. AIDI Saadia Neurologie

228. Pr. AIT OURHROUI Mohamed Dermatologie

229. Pr. AJANA Fatima Zohra Gastro-Entérologie

230. Pr. BENAMR Said Chirurgie Générale

231. Pr. BENCHEKROUN Nabiha Ophtalmologie

232. Pr. CHERTI Mohammed Cardiologie

233. Pr. ECH-CHERIF EL KETTANI Selma ²Anesthésie-Réanimation

234. Pr. EL HASSANI Amine Pédiatrie

235. Pr. EL IDGHIRI Hassan Oto-Rhino-Laryngologie

236. Pr. EL KHADER Khalid Urologie

237. Pr. EL MAGHRAOUI Abdellah* Rhumatologie

238. Pr. GHARBI Mohamed El Hassan Endocrinologie et Maladies Métaboliques

239. Pr. HSSAIDA Rachid* Anesthésie-Réanimation

240. Pr. LACHKAR Azzouz Urologie

241. Pr. LAHLOU Abdou Traumatologie Orthopédie

242. Pr. MAFTAH Mohamed* Neurochirurgie

243. Pr. MAHASSINI Najat Anatomie Pathologique

244. Pr. MDAGHRI ALAOUI Asmae Pédiatrie

245. Pr. NASSIH Mohamed* Stomatologie Et Chirurgie Maxillo-Faciale

246. Pr. ROUIMI Abdelhadi Neurologie

Décembre 2001

247. Pr. ABABOU Adil Anesthésie-Réanimation

248. Pr. AOUAD Aicha Cardiologie

249. Pr. BALKHI Hicham* Anesthésie-Réanimation

250. Pr. BELMEKKI Mohammed Ophtalmologie

251. Pr. BENABDELJLIL Maria Neurologie

252. Pr. BENAMAR Loubna Néphrologie

253. Pr. BENAMOR Jouda Pneumo-phtisiologie

254. Pr. BENELBARHDADI Imane Gastro-Entérologie

255. Pr. BENNANI Rajae Cardiologie

256. Pr. BENOUACHANE Thami Pédiatrie

257. Pr. BENYOUSSEF Khalil Dermatologie

258. Pr. BERRADA Rachid Gynécologie Obstétrique

259. Pr. BEZZA Ahmed* Rhumatologie

260. Pr. BOUCHIKHI IDRISSI Med Larbi Anatomie

261. Pr. BOUHOUCH Rachida Cardiologie

262. Pr. BOUMDIN El Hassane* Radiologie

263. Pr. CHAT Latifa Radiologie

264. Pr. CHELLAOUI Mounia Radiologie

265. Pr. DAALI Mustapha* Chirurgie Générale

266. Pr. DRISSI Sidi Mourad* Radiologie

267. Pr. EL HAJOUI Ghziel Samira Gynécologie Obstétrique

268. Pr. EL HIJRI Ahmed Anesthésie-Réanimation

269. Pr. EL MAAQILI Moulay Rachid Neuro-Chirurgie

270. Pr. EL MADHI Tarik Chirurgie-Pédiatrique

271. Pr. EL MOUSSAIF Hamid Ophtalmologie

272. Pr. EL OUNANI Mohamed Chirurgie Générale

273. Pr. EL QUESSAR Abdeljlil Radiologie

274. Pr. ETTAIR Said Pédiatrie

275. Pr. GAZZAZ Miloudi* Neuro-Chirurgie

276. Pr. GOURINDA Hassan Chirurgie-Pédiatrique

277. Pr. HRORA Abdelmalek Chirurgie Générale

278. Pr. KABBAJ Saad Anesthésie-Réanimation

279. Pr. KABIRI EL Hassane* Chirurgie Thoracique

280. Pr. LAMRANI Moulay Omar Traumatologie Orthopédie

281. Pr. LEKEHAL Brahim Chirurgie Vasculaire Périphérique

282. Pr. MAHASSIN Fattouma* Médecine Interne

283. Pr. MEDARHRI Jalil Chirurgie Générale

284. Pr. MIKDAME Mohammed* Hématologie Clinique

285. Pr. MOHSINE Raouf Chirurgie Générale

286. Pr. NABIL Samira Gynécologie Obstétrique

287. Pr. NOUINI Yassine Urologie

288. Pr. OUALIM Zouhir* Néphrologie

289. Pr. SABBAH Farid Chirurgie Générale

290. Pr. SEFIANI Yasser Chirurgie Vasculaire Périphérique

291. Pr. TAOUFIQ BENCHEKROUN Soumia Pédiatrie

292. Pr. TAZI MOUKHA Karim Urologie

Décembre 2002

293. Pr. AL BOUZIDI Abderrahmane* Anatomie Pathologique

294. Pr. AMEUR Ahmed * Urologie

295. Pr. AMRI Rachida Cardiologie

296. Pr. AOURARH Aziz* Gastro-Entérologie

297. Pr. BAMOU Youssef * Biochimie-Chimie

298. Pr. BELMEJDOUB Ghizlene* Endocrinologie et Maladies Métaboliques

299. Pr. BENBOUAZZA Karima Rhumatologie

300. Pr. BENZEKRI Laila Dermatologie

301. Pr. BENZZOUBEIR Nadia* Gastro-Entérologie

302. Pr. BERNOUSSI Zakiya Anatomie Pathologique

303. Pr. BICHRA Mohamed Zakariya Psychiatrie

304. Pr. CHOHO Abdelkrim * Chirurgie Générale

305. Pr. CHKIRATE Bouchra Pédiatrie

306. Pr. EL ALAMI EL FELLOUS Sidi Zouhair Chirurgie Pédiatrique

307. Pr. EL ALJ Haj Ahmed Urologie

308. Pr. EL BARNOUSSI Leila Gynécologie Obstétrique

309. Pr. EL HAOURI Mohamed * Dermatologie

310. Pr. EL MANSARI Omar* Chirurgie Générale

311. Pr. ES-SADEL Abdelhamid Chirurgie Générale

312. Pr. FILALI ADIB Abdelhai Gynécologie Obstétrique

313. Pr. HADDOUR Leila Cardiologie

314. Pr. HAJJI Zakia Ophtalmologie

315. Pr. IKEN Ali Urologie

316. Pr. ISMAEL Farid Traumatologie Orthopédie

317. Pr. JAAFAR Abdeloihab* Traumatologie Orthopédie

318. Pr. KRIOULE Yamina Pédiatrie

319. Pr. LAGHMARI Mina Ophtalmologie

320. Pr. MABROUK Hfid* Traumatologie Orthopédie

321. Pr. MOUSSAOUI RAHALI Driss* Gynécologie Obstétrique

322. Pr. MOUSTAGHFIR Abdelhamid* Cardiologie

323. Pr. MOUSTAINE My Rachid Traumatologie Orthopédie

324. Pr. NAITLHO Abdelhamid* Médecine Interne

325. Pr. OUJILAL Abdelilah Oto-Rhino-Laryngologie

326. Pr. RACHID Khalid * Traumatologie Orthopédie

327. Pr. RAISS Mohamed Chirurgie Générale

328. Pr. RGUIBI IDRISSI Sidi Mustapha* Pneumophtisiologie

329. Pr. RHOU Hakima Néphrologie

330. Pr. SIAH Samir * Anesthésie Réanimation

331. Pr. THIMOU Amal Pédiatrie

332. Pr. ZENTAR Aziz* Chirurgie Générale

333. Pr. ZRARA Ibtisam* Anatomie Pathologique

PROFESSEURS AGREGES :

Janvier 2004

334. Pr. ABDELLAH El Hassan Ophtalmologie

335. Pr. AMRANI Mariam Anatomie Pathologique

336. Pr. BENBOUZID Mohammed Anas Oto-Rhino-Laryngologie

337. Pr. BENKIRANE Ahmed* Gastro-Entérologie

338. Pr. BENRAMDANE Larbi* Chimie Analytique

339. Pr. BOUGHALEM Mohamed* Anesthésie Réanimation

340. Pr. BOULAADAS Malik Stomatologie et Chirurgie Maxillo-faciale

341. Pr. BOURAZZA Ahmed* Neurologie

342. Pr. CHAGAR Belkacem* Traumatologie Orthopédie

343. Pr. CHERRADI Nadia Anatomie Pathologique

344. Pr. EL FENNI Jamal* Radiologie

345. Pr. EL HANCHI ZAKI Gynécologie Obstétrique

346. Pr. EL KHORASSANI Mohamed Pédiatrie

347. Pr. EL YOUNASSI Badreddine* Cardiologie

348. Pr. HACHI Hafid Chirurgie Générale

349. Pr. JABOUIRIK Fatima Pédiatrie

350. Pr. KARMANE Abdelouahed Ophtalmologie

351. Pr. KHABOUZE Samira Gynécologie Obstétrique

352. Pr. KHARMAZ Mohamed Traumatologie Orthopédie

353. Pr. LEZREK Mohammed* Urologie

354. Pr. MOUGHIL Said Chirurgie Cardio-Vasculaire

355. Pr. NAOUMI Asmae* Ophtalmologie

356. Pr. SAADI Nozha Gynécologie Obstétrique

357. Pr. SASSENOU ISMAIL* Gastro-Entérologie

358. Pr. TARIB Abdelilah* Pharmacie Clinique

359. Pr. TIJAMI Fouad Chirurgie Générale

360. Pr. ZARZUR Jamila Cardiologie

Janvier 2005

361. Pr. ABBASSI Abdellah Chirurgie Réparatrice et Plastique

362. Pr. AL KANDRY Sif Eddine* Chirurgie Générale

363. Pr. ALAOUI Ahmed Essaid Microbiologie

364. Pr. ALLALI Fadoua Rhumatologie

365. Pr. AMAR Yamama Néphrologie

366. Pr. AMAZOUZI Abdellah Ophtalmologie

367. Pr. AZIZ Noureddine* Radiologie

368. Pr. BAHIRI Rachid Rhumatologie

369. Pr. BARKAT Amina Pédiatrie

370. Pr. BENHALIMA Hanane Stomatologie et Chirurgie Maxillo Faciale

371. Pr. BENHARBIT Mohamed Ophtalmologie

372. Pr. BENYASS Aatif Cardiologie

373. Pr. BERNOUSSI Abdelghani Ophtalmologie

374. Pr. BOUKLATA Salwa Radiologie

375. Pr. CHARIF CHEFCHAOUNI Mohamed Ophtalmologie

376. Pr. DOUDOUH Abderrahim* Biophysique

377. Pr. EL HAMZAOUI Sakina Microbiologie

378. Pr. HAJJI Leila Cardiologie

379. Pr. HESSISSEN Leila Pédiatrie

380. Pr. JIDAL Mohamed* Radiologie

381. Pr. KARIM Abdelouahed Ophtalmologie

382. Pr. KENDOUSSI Mohamed* Cardiologie

383. Pr. LAAROUSSI Mohamed Chirurgie Cardio-vasculaire

384. Pr. LYAGOUBI Mohammed Parasitologie

385. Pr. NIAMANE Radouane* Rhumatologie

386. Pr. RAGALA Abdelhak Gynécologie Obstétrique

387. Pr. SBIHI Souad Histo-Embryologie Cytogénétique

388. Pr. TNACHERI OUAZZANI Btissam Ophtalmologie

389. Pr. ZERAIDI Najia Gynécologie Obstétrique

AVRIL 2006

423. Pr. ACHEMLAL Lahsen* Rhumatologie

424. Pr. AFIFI Yasser Dermatologie

425. Pr. AKJOUJ Said* Radiologie

426. Pr. BELGNAOUI Fatima Zahra Dermatologie

427 Pr. BELMEKKI Abdelkader* Hématologie

428. Pr. BENCHEIKH Razika O.R.L

429 Pr. BIYI Abdelhamid* Biophysique

430. Pr. BOUHAFS Mohamed El Amine Chirurgie - Pédiatrique

431. Pr. BOULAHYA Abdellatif* Chirurgie Cardio – Vasculaire

432. Pr. CHEIKHAOUI Younes Chirurgie Cardio – Vasculaire

433. Pr. CHENGUETI ANSARI Anas Gynécologie Obstétrique

434. Pr. DOGHMI Nawal Cardiologie

435. Pr. ESSAMRI Wafaa Gastro-entérologie

436. Pr. FELLAT Ibtissam Cardiologie

437. Pr. FAROUDY Mamoun Anesthésie Réanimation

438. Pr. GHADOUANE Mohammed* Urologie

439. Pr. HARMOUCHE Hicham Médecine Interne

440. Pr. HANAFI Sidi Mohamed* Anesthésie Réanimation

441 Pr. IDRISS LAHLOU Amine Microbiologie

442. Pr. JROUNDI Laila Radiologie

443. Pr. KARMOUNI Tariq Urologie

444. Pr. KILI Amina Pédiatrie

445. Pr. KISRA Hassan Psychiatrie

446. Pr. KISRA Mounir Chirurgie – Pédiatrique

447. Pr. KHARCHAFI Aziz* Médecine Interne

448. Pr. LAATIRIS Abdelkader* Pharmacie Galénique

449. Pr. LMIMOUNI Badreddine* Parasitologie

450. Pr. MANSOURI Hamid* Radiothérapie

451. Pr. NAZIH Naoual O.R.L

452. Pr. OUANASS Abderrazzak Psychiatrie

453. Pr. SAFI Soumaya* Endocrinologie

454. Pr. SEKKAT Fatima Zahra Psychiatrie

455. Pr. SEFIANI Sana Anatomie Pathologique

456. Pr. SOUALHI Mouna Pneumo – Phtisiologie

457. Pr. TELLAL Saida* Biochimie

458. Pr. ZAHRAOUI Rachida Pneumo – Phtisiologie

Octobre 2007

458. Pr. LARAQUI HOUSSEINI Leila Anatomie pathologique

459. Pr. EL MOUSSAOUI Rachid Anesthésie réanimation

460. Pr. MOUSSAOUI Abdelmajid Anesthésier réanimation

461. Pr. LALAOUI SALIM Jaafar * Anesthésie réanimation

462. Pr. BAITE Abdelouahed * Anesthésie réanimation

463. Pr. TOUATI Zakia Cardiologie

464. Pr. OUZZIF Ez zohra * Biochimie

465. Pr. BALOUCH Lhousaine * Biochimie

466. Pr. SELKANE Chakir * Chirurgie cardio vasculaire

467. Pr. EL BEKKALI Youssef * Chirurgie cardio vasculaire

468. Pr. AIT HOUSSA Mahdi * Chirurgie cardio vasculaire

469. Pr. EL ABSI Mohamed Chirurgie générale

470. Pr. EHIRCHIOU Abdelkader * Chirurgie générale

471. Pr. ACHOUR Abdessamad * Chirurgie générale

472. Pr. TAJDINE Mohammed Tariq* Chirurgie générale

473. Pr. GHARIB Noureddine Chirurgie plastique

474. Pr. TABERKANET Mustafa * Chirurgie vasculaire périphérique

475. Pr. ISMAILI Nadia Dermatologie

476. Pr. MASRAR Azlarab Hématologie biologique

477. Pr. RABHI Monsef * Médecine interne

478. Pr. MRABET Mustapha * Médecine préventive santé publique et hygiène

479. Pr. SEKHSOKH Yessine * Microbiologie

480. Pr. SEFFAR Myriame Microbiologie

481. Pr. LOUZI Lhoussain * Microbiologie

482. Pr. MRANI Saad * Virologie

483. Pr. GANA Rachid Neuro chirurgie

484. Pr. ICHOU Mohamed * Oncologie médicale

485. Pr. TACHFOUTI Samira Ophtalmologie

486. Pr. BOUTIMZINE Nourdine Ophtalmologie

487. Pr. MELLAL Zakaria Ophtalmologie

488. Pr. AMMAR Haddou * ORL

489. Pr. AOUFI Sarra Parasitologie

490. Pr. TLIGUI Houssain Parasitologie

491. Pr. MOUTAJ Redouane * Parasitologie

492. Pr. ACHACHI Leila Pneumo phtisiologie

493. Pr. MARC Karima Pneumo phtisiologie

494. Pr. BENZIANE Hamid * Pharmacie clinique

495. Pr. CHERKAOUI Naoual * Pharmacie galénique

496. Pr. EL OMARI Fatima Psychiatrie

497. Pr. MAHI Mohamed * Radiologie

498. Pr. RADOUANE Bouchaib* Radiologie

499. Pr. KEBDANI Tayeb Radiothérapie

500. Pr. SIFAT Hassan * Radiothérapie

501. Pr. HADADI Khalid * Radiothérapie

502. Pr. ABIDI Khalid Réanimation médicale

503. Pr. MADANI Naoufel Réanimation médicale

504. Pr. TANANE Mansour * Traumatologie orthopédie

505. Pr. AMHAJJI Larbi * Traumatologie orthopédie

Mars 2009

Pr. BJIJOU Younes Anatomie

Pr. AZENDOUR Hicham * Anesthésie Réanimation

Pr. BELYAMANI Lahcen* Anesthésie Réanimation

Pr. BOUHSAIN Sanae * Biochimie

Pr. OUKERRAJ Latifa Cardiologie

Pr. LAMSAOURI Jamal * Chimie Thérapeutique

Pr. MARMADE Lahcen Chirurgie Cardio-vasculaire

Pr. AMAHZOUNE Brahim* Chirurgie Cardio-vasculaire

Pr. AIT ALI Abdelmounaim * Chirurgie Générale

Pr. BOUNAIM Ahmed * Chirurgie Générale

Pr. EL MALKI Hadj Omar Chirurgie Générale

Pr. MSSROURI Rahal Chirurgie Générale

Pr. CHTATA Hassan Toufik * Chirurgie Vasculaire Périphérique

Pr. BOUI Mohammed * Dermatologie

Pr. KABBAJ Nawal Gastro-entérologie

Pr. FATHI Khalid Gynécologie obstétrique

Pr. MESSAOUDI Nezha * Hématologie biologique

Pr. CHAKOUR Mohammed * Hématologie biologique

Pr. DOGHMI Kamal * Hématologie clinique

Pr. ABOUZAHIR Ali * Médecine interne

Pr. ENNIBI Khalid * Médecine interne

Pr. EL OUENNASS Mostapha Microbiologie

Pr. ZOUHAIR Said* Microbiologie

Pr. L’kassimi Hachemi* Microbiologie

Pr. AKHADDAR Ali * Neuro-chirurgie

Pr. AIT BENHADDOU El hachmia Neurologie

Pr. AGADR Aomar * Pédiatrie

Pr. KARBOUBI Lamya Pédiatrie

Pr. MESKINI Toufik Pédiatrie

Pr. KABIRI Meryem Pédiatrie

Pr. RHORFI Ismail Abderrahmani * Pneumo-phtisiologie

Pr. BASSOU Driss * Radiologie

Pr. ALLALI Nazik Radiologie

Pr. NASSAR Ittimade Radiologie

Pr. HASSIKOU Hasna * Rhumatologie

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Pr. BOUSSOUGA Mostapha * Traumatologie orthopédique

Pr. KADI Said * Traumatologie orthopédique

Octobre 2010

Pr. AMEZIANE Taoufiq* Médecine interne

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Pr. EL HAFIDI Naima Pédiatrie

Pr. MALIH Mohamed* Pédiatrie

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Pr. LAMALMI Najat Anatomie pathologique

Pr. ZOUAIDIA Fouad Anatomie pathologique

Pr. BELAGUID Abdelaziz Physiologie

Pr. DAMI Abdellah* Biochimie chimie

Pr. CHADLI Mariama* Microbiologie

ENSEIGNANTS SCIENTIFIQUES

PROFESSEURS

1. Pr. ABOUDRAR Saadia Physiologie

2. Pr. ALAMI OUHABI Naima Biochimie

3. Pr. ALAOUI KATIM Pharmacologie

4. Pr. ALAOUI SLIMANI Lalla Naïma Histologie-Embryologie

5. Pr. ANSAR M’hammed Chimie Organique et Pharmacie Chimique

6. Pr. BOUKLOUZE Abdelaziz Applications Pharmaceutiques

7. Pr. BOUHOUCHE Ahmed Génétique Humaine

8. Pr. BOURJOUANE Mohamed Microbiologie

9. Pr. CHAHED OUAZZANI Lalla Chadia Biochimie

10. Pr. DAKKA Taoufiq Physiologie

11. Pr. DRAOUI Mustapha Chimie Analytique

12. Pr. EL GUESSABI Lahcen Pharmacognosie

13. Pr. ETTAIB Abdelkader Zootechnie

14. Pr. FAOUZI Moulay El Abbes Pharmacologie

15. Pr. HMAMOUCHI Mohamed Chimie Organique

16. Pr. IBRAHIMI Azeddine

17. Pr. KABBAJ Ouafae Biochimie

18. Pr. KHANFRI Jamal Eddine Biologie

19. Pr. REDHA Ahlam Biochimie

20. Pr. OULAD BOUYAHYA IDRISSI Med Chimie Organique

21. Pr. TOUATI Driss Pharmacognosie

22. Pr. ZAHIDI Ahmed Pharmacologie

23. Pr. ZELLOU Amina Chimie Organique

* Enseignants Militaires

DEDICACES

DEDICACES

A LA MEMOIRE DE MA GRANDE MERE HALIMA

KHLIFIA

Ce travail est pour moi le fruit de tes prières.

Que la terre de TOUBA te soit légère.

A MES TRES CHERS PARENTS

EL ATTIFFI EL OUADRASSI AHMED

EL FAILALI NABILA

Dont leurs mérites, leurs sacrifices, leurs qualités humaines

m’ont permis de vivre ce jour :

Les mots me manquent pour exprimer toute la reconnaissance,

la fierté et le profond amour que je vous porte pour les

sacrifices qu’ils ont consenti pour ma réussite, qu’ils trouvent

ici le témoignage de mon attachement ma reconnaissance,

gratitude et respect, que dieu leur préservent bonne santé et

longue vie. Tous mes sentiments de reconnaissance pour vous.

A MES SOEURS : CHEMSS ET YOUSSRA

J’espère atteint le seuil de vos espérances. Que ce travail soit

l’expression de ma profonde affection, je vous remercie pour

le soutient moral et l’encouragement que vous m’avez

accordés.

Je vous souhaite tout le bonheur que vous méritez

En leur souhaitant un brillant avenir.

A MES GRANDS PARENTS

A TOUTE LA FAMILLE EL ATTIFFI

A TOUTE LA FAMILLE EL FILALI

Que je ne pourrais nommer de peur d’en oublier mon

attachement et mes affections les plus sincères

A MES AMI(E) S

A tout ceux qui ont su m’apporter aide et soutient aux

moments propices, Je dédie ce travail, reconnaissant et

remerciant chaleureusement.

INTRODUCTION

REMERCIEMENTS

A NOTRE

MAITRE ET PRESIDENT DE THESE

Monsieur le professeur A.GAOUZI

Professeur de Pédiatrie

Malgré vos multiples occupations, vous avez spontanément

accepté de présider ce jury de thèse.

Votre courtoisie, votre modestie et votre sens des

responsabilités font de vous un maître respecté et estimé par

toute une génération d’étudiants.

Veuillez trouvez ici l’expression de nos remerciements les

plus sincères et de notre profonde reconnaissance.

A NOTRE

MAITRE ET RAPPORTEUR DE THESE

Monsieur le professeur M.ZOUHDI

Professeur de Microbiologie

Vous nous avez confié ce travail et vous avez mis les moyens

nécessaires pour sa réalisation.

Votre disponibilité constante, votre amour du travail bien fait

et votre abord facile forcent l’admiration et le respect.

Puisse ce travail répondre à vos attentes et être le témoignage

de notre profonde et vive gratitude.

A NOTRE

MAITRE ET JUGE DE THESE

Madame le professeur S.AOUFI

Professeur agrégé de Parasitologie

La spontanéité avec laquelle vous avez accepté de juger ce

travail nous réjouit.

Plus qu’un honneur, c’est une joie pour nous, de vous compter

parmi nos juges et de pouvoir profiter de vos compétences.

Nous vous prions, cher Maître, d’accepter nos vifs

remerciements et notre profonde gratitude.

A NOTRE

MAITRE ET JUGE DE THESE

Madame le professeur S.EL HAMZAOUI

Professeur de Microbiologie

Vous nous faites un grand honneur en acceptant de nous

consacrer de votre temps.

Nous sommes sensibles à l’amabilité avec laquelle vous nous

avez accueillie. C’est avec respect et sincérité que nous vous

remercions.

« En cette journée mondiale de l’eau, prenons la résolution d’en

faire plus pour que tous les êtres humains disposent d’eau

salubre. Et réaffirmons notre volonté de mieux gérer les

ressources en eau de notre planète, qui sont la clef de notre

survie et d’un développement durable au XXIe siècle »

KOFI ANNAN.

Journée mondiale de l’eau, 22 mars 2005

Table des matières

INTRODUCTION .............................................................................................................................. 1

I.LE LITTORAL MAROCAIN ...................................................................................................... 4

I.1. Spécificités ....................................................................................................................................... 4

I.2. Pressions ................................................................................................................................................. 4

I.2.1. Urbanisation – littoralisation ........................................................................................ 4

I.2.2. La pression démographique sur le littoral ................................................................. 5

I.2.3. Industrialisation ............................................................................................................ 5

I.2.4. Tourisme ........................................................................................................................ 6

I.2.5. Agriculture ..................................................................................................................... 6

I.2.6. Transport maritime ........................................................................................................ 7

I.2.7. Surexploitation des ressources naturelles .................................................................. 7

II. LES POLLUTIONS MARITIMES ......................................................................................... 8

II.1.Pollution par les eaux usées domestiques ........................................................................ 9

II.2. Pollution par les eaux usées industrielles ...................................................................... 11

II.3. La pollution par les eaux de ruissellement ..................................................................... 11

II.4. La pollution d’origine atmosphérique ............................................................................ 12

II.5. La pollution par les activités maritimes ......................................................................... 12

II.6. La pollution par les déchets solides ............................................................................... 13

II.7. La pollution radioactive ................................................................................................... 14

II.8. La pollution due aux activités estivales ......................................................................... 14

II.9. La pollution thermique ..................................................................................................... 14

II.10. La pollution microbiologique ....................................................................................... 15

II.10.1. Les sources de contamination ......................................................................... 15

II.10.2. Les bactéries ..................................................................................................... 17

II.10.3. Les virus ............................................................................................................ 17

II.10.4. Les protozoaires .............................................................................................. 18

II.10.5. Les helminthes .................................................................................................. 19

II.10.6. Les champignons .............................................................................................. 19

III. L’EVALUATION DE LA QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES EAUX - LES

GERMES INDICATEURS DE CONTAMINATION FECALE ...................................... 20

III.1.Définition des indicateurs bactériens de contamination fécale ................................. .23

III.1.1. Les coliformes totaux ........................................................................................ 23

III.1.2. Les coliformes fécaux ......................................................................................... 24

III.1.3. Les Entérocoques intestinaux ........................................................................... 24

III.1.4. Le rapport coliformes fécaux/streptocoques fécaux ...................................... 25

III.2.Autres indicateurs ............................................................................................................ 25

IV. LES METHODES DE DETECTION DES MICRO-ORGANISMES

INDICATEURS ............................................................................................................................... 27

IV.1. La mise en culture .................................................................................................... 27

IV.2. La problématique des bactéries fécales non cultivables ..................................... 31

IV.3. Les méthodes moléculaires ..................................................................................... 34

IV.4. L’énumération des E. coli viables par hybridation in situ .................................. 36

IV.5. La mesure directe de l’activité β-D-glucuronidasique ........................................ 38

V. LES NORMES DE QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES EAUX DE

BAIGNADE ....................................................................................................................................... 41

VI. LA SURVIE DES BACTERIES DANS LE MILIEU MARIN ....................................... 45

VI.1. Les facteurs influençant la survie des microorganismes en milieu marin .......... 47

VI.1.1. Facteurs physico-chimiques ................................................................................... 47

VI.1.1.1. La dilution ............................................................................................................. 47

VI.1.1.2. L’adsorption .......................................................................................................... 48

VI.1.1.3. La sédimentation ................................................................................................... 48

VI.1.1.4. La lumière............................................................................................................... 48

VI.1.1.5. La température ..................................................................................................... 49

VI.1.1.6. Les variations de pH ............................................................................................ 49

VI.1.1.7. La salinité .............................................................................................................. 49

VI.1.2. Facteurs biologiques ................................................................................................ 50

VII. RISQUES SANITAIRES LIES A LA BAIGNADE DANS LES EAUX

POLLUEES ....................................................................................................................................... 52

VII.1.Introduction ................................................................................................................ .52

VII.2. Historique ................................................................................................................... 52

VII.3. Les microorganismes impliqués et les pathologies observées ............................ 53

VII.3.1. Les bactéries ............................................................................................... 53

VII.3.2. Les virus ...................................................................................................... 55

VII.3.3. Les champignons ....................................................................................... 55

VII.3.4. Les protozoaires ......................................................................................... 56

VII.3.5. Micro-algues et cyanobactéries ................................................................ 56

VII.4. Les risques liés aux contaminants chimiques ....................................................... 57

VIII. LES EPIDEMIES LIEES AUX EAUX DE BAIGNADE ............................................ 59

VIII.1. E. coli O157 :H7 ........................................................................................................ 59

VIII.2. Autres ........................................................................................................................... 60

IX. LA SURVEILLANCE DE LA QUALITE DES EAUX DE BAIGNADE AU

MAROC ............................................................................................................................................. 61

IX.1. Organisation des contrôles ......................................................................................... 61

IX.2. Les procédures d’exécution des programmes ......................................................... 62

IX.3. Qualité hygiénique des plages du Royaume : Saison 2009-2010 .......................... 66

CONCLUSION ET RECOMMANDATIONS........................................................................... 68

RESUMES

ANNEXES

BIBLIOGRAPHIE

1

INTRODUCTION

INTRODUCTION

2

L'hydrosphère est le fondement de la vie et des équilibres écologiques,

ses usages sont donc multiples, mais s'agissant de santé humaine, ils sont

dominés par l'agriculture et l'aquaculture, l'industrie et l'artisanat, surtout, la

fourniture collective ou individuelle d'eau potable, utilisable à des fins

alimentaires (eau de boisson, cuisine) mais aussi domestiques et d'hygiène, et

les loisirs aquatiques, dont la baignade.

Notre civilisation moderne utilise de plus en plus le milieu aquatique

pour les loisirs, les vacances et diverses activités nautiques et ludiques.

Il existe diverses catégories de baignades, aménagées ou non, littorales (eau de

mer) ou intérieures (eau douce: rivière, lac, étang) qui connaissent des

problèmes spécifiques liés à la contamination par des eaux usées, plus ou moins

épurées, ou des eaux de ruissellement qui véhiculent divers polluants.

Si la baignade constitue une activité de loisirs qui permet détente et

exercices physiques bénéfiques pour la santé, elle peut néanmoins présenter

certains risques. Ceux-ci sont liés, soit à la qualité de l’eau, soit à des activités

associées à la baignade et souvent à des comportements.

Le Maroc dispose d’un vaste territoire maritime : le littoral

méditerranéen et atlantique, qui est soumis à la pression démographique sans

cesse croissante des agglomérations urbaines et à l’influence des différentes

activités industrielles, portuaires et touristiques. Il reçoit, en plus, les apports des

3

bassins versants des rivières et des cours d’eau, ainsi qu'une grande partie des

eaux usées urbaines et industrielles.

L’objectif de ce mémoire est :

de déterminer les différents types de pollutions qui peuvent influencer la

qualité des eaux de baignade ;

de définir les méthodes d’évaluation de la qualité microbiologique des

eaux de baignade ;

et d’étudier l’impact sanitaire de la qualité microbiologique des eaux de

baignade.

4

I . LE LITTORAL MAROCAIN :

I.1. Spécificités :

Le Maroc est doté d'une frange littorale qui s’étend sur la façade atlantique

de Cap Spartel à Lagouira (2 934 km) et sur la façade méditerranéenne de Cap

Spartel à Saïdia (512 km). Cette zone côtière constitue un pôle d’attraction

important pour les activités socio-économiques d’intérêt national, compte tenu

de son poids démographique, économique et de sa fonction dans l’organisation

de l’espace national(1).

Ce littoral présente divers milieux physiques tels que les plages, les dunes,

les rivages, les estuaires, les falaises, les lagunes, les vasières, etc.). C’est une

zone complexe, vulnérable fortement convoitée. Il présente une flore et une

faune originale. C’est aussi un espace de conflits, de convergence d’intérêts et

d’acteurs entraînant une littoralisation pesante des côtes(2).

I.2. Pressions :

I.2.1. Urbanisation – littoralisation :

L’urbanisation des côtes a été très marquante ces dernières décennies. Le

taux d’urbanisation en 1971 était de 35 % et il est passé à 42,8 % puis à 51 %

respectivement en 1982 et 1994 pour atteindre 55,1 % en 2004(2).L’urbanisation

classique progresse le long de la côte et aboutit à des formes d’occupation

linéaire.

L’urbanisation touristique planifiée en pleine expansion avec la multiplication

de projets immobiliers et touristiques se développe aux dépens des espaces

vierges.

5

I.2.2. La pression démographique sur le littoral :

La population marocaine recensée en 2004 est estimée à 29,9 millions

d’habitants contre près de 26 millions en 1994(2).

La population côtière représente 60 %. Cela traduit à l'évidence une dynamique

démographique importante aboutissant à une occupation des zones côtières et à

une littoralisation de la population et des activités induites. La densité moyenne

de population au niveau du littoral atlantique est d’environ 162 hab./km² contre

90 hab./ km² au niveau de la méditerranée(2).

A cette pression endogène s’ajoute celle du tourisme , si bien qu’en période de

pointe (juillet-aout), le cumul des résidents (permanents et secondaire) et des

touristes porte les densités littorales à des niveaux très élevés pouvant atteindre

au niveau de certaines zones plus de 300 habitants par kilomètre carré.

I.2.3. Industrialisation :

La côte joue le rôle de pôle nerveux de l'économie nationale du fait de la

concentration industrielle (80 % des effectifs permanents des industries),

touristique (50 % de la capacité d'accueil) et commerciale (92 % du commerce

extérieur)(3).

Cette concentration exerce sur le littoral des pressions à travers notamment les

rejets d’eaux résiduaires générées par ce secteur souvent déversés sans

traitement préalable directement dans le milieu marin.

6

I.2.4. Tourisme :

L'urbanisation touristique planifiée est en pleine expansion dans de

nombreuses régions de la côte, notamment dans les régions de Tanger, Tétouan,

AI Hoceima, Saidia, Rabat-Casablanca et Agadir réduisant le nombre d'espaces

maritimes vierges qui risquent eux-mêmes de ne pas le rester longtemps. Dans

bon nombre de ces régions, l'occupation revêt des formes illicites à cause d'un

déséquilibre flagrant entre offre et demande d'espaces côtiers. On assiste ainsi à

une “durcification” progressive du littoral par la construction de complexes

hôteliers ou de résidences secondaires et la multiplication des infrastructures

d'accompagnement (routes panoramiques, ports de plaisance, etc.). Outre

l’énorme problème des rejets domestiques incontrôlés, ces équipements

touristiques réduisent les possibilités d’échanges entre terre et mer,

déséquilibrant ainsi l’écologie du littoral.

I.2.5. Agriculture :

Dans de nombreuses régions littorales du pays, et particulièrement à

proximité des zones humides, les pratiques agricoles en matière d'utilisation

d'engrais et de pesticides ont souvent un impact considérable sur la qualité des

eaux du fait du drainage des oueds. Ces impacts sont flagrants prés de certains

milieux comme le complexe lagunaire de Oualidia Sidi Moussa où la culture

sous serre a considérablement affecté les eaux de la lagune, ou encore les

lagunes de Moulay Bousselham ou de Khnifiss, où l'agriculture et le

pastoralisme sont des activités importantes(3).

7

I.2.6. Transport maritime :

Les eaux marocaines méditerranéennes et atlantiques connaissent une

navigation maritime intense. Des centaines de bateaux longent quotidiennement

nos côtes, notamment des pétroliers et des tankers qui constituent une menace

permanente de la pollution marine.

I.2.7. Surexploitation des ressources naturelles :

Le littoral marocain souffre également d’un problème majeur qu’est la

dégradation des dunes et l’érosion des plages, principalement à cause d’une

demande sans cesse croissante en matériaux de construction, en particulier de

sable pour le secteur du bâtiment. Cette demande, estimée à près de 13 millions

de tonnes, et qui sera plus que le double en 2015(3), est en grande partie

satisfaite par des prélèvements, souvent illicites et peu coûteux, au niveau des

plages et des dunes littorales. En effet, de plus de 160 points de prélèvements

recensés, quelques-uns seulement semblent officiellement autorisés.

C’est un problème d’autant plus important qu’il concerne 11 des 16 régions

administratives du pays et près d’une trentaine de communes. Il en résulte que

de nombreuses plages s’appauvrissent en sable (baie de Tanger, Moulay

Bousselham, Monica, Kariat Arekmane) et, selon certaines études (RDH 50,

2005), sur un échantillon de 47 plages analysées 7 ont complètement disparu et

19 sont soumises à une dégradation aiguë.

8

II. LES POLLUTIONS MARITIMES :

La pollution marine est « L’introduction par l’Homme, directement ou

indirectement, de substances ou d’énergies dans le milieu marin, estuaires

compris, et qui a pour conséquence ou est susceptible d’engendrer des effets

nuisibles tels qu’ils porteraient atteinte aux ressources vivantes et à la vie

marine, mettraient la santé humaine en danger, gêneraient les activités marines,

telles que la pêche et autre utilisation légitime de la mer »(4).

Figure 1: Origine de la pollution marine(5).

Atmosphère 20%

Agriculture 20%

Eaux usées 30%

Transport maritime

10%

Rejets liquides

industriels

10%

Plateformes pétrolières

5%

Déchets solides

5%

9

II.1. Pollution par les eaux usées domestiques :

L’évacuation directe dans le milieu marin des eaux usées brutes est à

l’heure actuelle la plus importante source de pollution du littoral marocain. Les

conséquences de ces rejets sur l’équilibre du milieu marin sont nombreuses,

aussi bien sur le plan physico-chimique, chimique que biologique.

Selon un nouveau rapport du Programme des Nations Unies pour

l’environnement (PNUE), une marée montante d’eaux usées menace la santé et

la richesse d’un nombre important d’océans et mers à travers le monde, tandis

que des progrès sont notables en matière de pollution pétrolière et chimique.

Dans de nombreux pays en développement, de 80 à 90 pour cent des eaux usées

déversées sur les côtes sont des effluents bruts, c'est à dire des rejets qui n'ont

pas été traités(6),ainsi que 60 % des eaux usées urbaines rejetées dans la mer

méditerranéenne ne sont pas traitées préalablement(7).

Les eaux usées domestiques (eaux-vannes et eaux ménagères) urbaines

contiennent une multitude d’agents pathogènes excrétés par la voie intestinale

ou urinaire et susceptibles de déclencher des maladies transmissibles. Ces agents

peuvent être classés en quatre catégories principales : les bactéries, les virus, les

parasites et les champignons.

Parmi tous les microorganismes couramment rencontrés dans les eaux usées

urbaines, il est important de distinguer leur origine, ainsi que les pathologies

qu’ils sont susceptibles d’engendrer. En se basant sur ces deux critères, nous

pouvons définir trois catégories de germes(8) :

les germes d’origine tellurique non pathogènes et non infectieux,

10

entraînés par les eaux de ruissellement.

Les germes d’origine fécale, humaine ou animale, le plus

fréquemment non pathogènes, qui regroupent principalement des bactéries, et

sont couramment utilisés comme germes témoins de contamination fécale.

Les germes pathogènes parmi lesquels nous distinguons : certaines

bactéries, les virus et les parasites.

Pour tous ces microorganismes, l’eau représente un vecteur de choix pour

atteindre leur cible. La transmission se fait préférentiellement par voie digestive

(ingestion d’eau d’alimentation ou de baignade contaminée ou d’aliments

souillés comme les coquillages), mais peut également se faire par voie

cutanéo-muqueuse lors des activités de baignades.

La résistance de ces micro-organismes à la salinité du milieu marin diffère

suivant les espèces et varie de quelques dizaines de minutes pour les plus

fragiles à plusieurs semaines pour les plus résistantes.

Ainsi, parmi les espèces les plus résistantes, on peut citer les œufs des parasites

intestinaux (Tænia, Ascaris, etc.), les spores de champignons microscopiques

pathogènes (Candida, Trichophyton, etc.).

Pour les espèces moyennement résistantes dans le milieu marin, il y a les

bactéries pathogènes comme sérotypes de salmonelles, le vibrion cholérique,

certains Pseudomonas (bacille pyocyanique), le staphylocoque doré et

clostridium(9).

Certains facteurs comme la température de l’eau de mer, la teneur en oxygène

dissout et la teneur en matières organiques conditionnent la résistance de micro-

organismes pathogènes dans le milieu marin(10).

11

II.2. Pollution par les eaux usées industrielles :

Généralement, les eaux usées industrielles sont riches en matières minérales et

organiques non ou difficilement biodégradables, surtout les déchets de

l’industrie.

Ces eaux usées sont chargées de substances dérivées de pétrole et en premier

lieu les essences, fuels, et les huiles utilisées dans divers moteurs à combustion.

On trouve aussi les métaux lourds tel que le mercure (appareils électriques,

produits pharmaceutiques), le cadmium (industrie métallurgique), l’argent, le

chrome, le zinc, le cuivre, le plomb.

À côté des métaux lourds, on a les métalloïdes (phosphore, arsenic, fluor et le

chlore), les acides et les cyanures(11, 12), sans oublier les sels qui viennent des

détergents et des engrais chimiques (nitrites, nitrates, orthophosphate).

L’accumulation de ces substances a des impacts directs sur l’équilibre

biologique du milieu marin à moyen ou à long terme et dont les conséquences

sur la faune et la flore marines peuvent être très graves, surtout sur les

ressources halieutiques(10).

II.3. La pollution par les eaux de ruissellement :

Les eaux de ruissellement contiennent surtout des matières en suspension

d'origine végétale, des hydrocarbures, des polluants venant de l'atmosphère

comme le gaz sulfureux, les composés du plomb, les gaz nitreux et carbonique,

des détergents et tout polluant se trouvant accidentellement sur la chaussée(13).

Ces eaux résultent du lessivage et de l’érosion des sols et basins versant par les

eaux de précipitation.

12

II.4. La pollution d’origine atmosphérique :

Les principales sources de la pollution atmosphérique sont les activités

industrielles et la circulation automobile, cette pollution a un impact non

négligeable sur l’équilibre de la faune et de la flore marines et par conséquent

sur les ressources halieutiques.

II.5. La pollution par les activités maritimes :

La navigation maritime et les installations portuaires sont les principaux

responsables de la pollution par les hydrocarbures(HC) aussi bien au voisinage

des côtes qu’en haute mer. Cette pollution peut être soit accidentelle (accidents

maritimes, marées noires, etc.) ou intentionnelle (dégazage des pétroliers en

haute mer, nettoyage des cuves de navires). Il est à noter que pour le Maroc, les

pollutions dues à des accidents en mer ne peuvent être considérées comme un

risque hypothétique, mais comme un danger potentiel et quotidien compte tenu

de l'intensité du trafic aussi bien le long des sites atlantiques que méditerranéens.

A titre d'exemple, la Méditerranée, mer semi-fermée, représente 7 % de la

surface mondiale des eaux, enregistre 17 % de la pollution globale des mers et

se classe ainsi à la première place des mers du monde en terme de pollution

(concentration moyenne de goudron dans les eaux de surface de la Méditerranée

est de 5 mg/m² alors que la moyenne pour tous les océans pour ce paramètre est

de 0.8 mg/m²)(1).

13

II.6. La pollution par les déchets solides :

Ce sont d'abord tous les débris solides qui s'accumulent le long des laisses

de hautes mers: bouteille, sacs et autres récipients en matière plastique, bois,

débris de filets et de filins... Ces déchets proviennent de décharges, autorisées ou

non, le long du littoral et des cours d'eau allant à la mer, des réseaux d'eau

pluviale, des rejets directs d'émissaires sans dégrillage, de l'abandon débris sur la

plage par les baigneurs et les casses croûteuses peu scrupuleuses, du

déversement à partir de navire (commerce et plaisance)... Ces objets constituent

surtout une nuisance visuelle qui déprécie l'attrait d'une plage. Flottant au large,

ils peuvent constituer une entrave à la pêche et à la navigation. Elles peuvent

être l'origine de pollution par hydrocarbures. Dans les laisses de hautes mers, les

déchets les plus fréquents sont les matières plastiques.

Voici quelques exemples de déchets et leur persistance :

Tableau I : déchets en mer par types, par description et par persistance(14)

Déchets Description Persistance

Plastiques Fragments, bâches, sacs et récipients Indéfiniment

Polystyrène Verres, emballages et balises Plus de 30 ans

Caoutchouc Gants, bottes et pneus Plus de 50 ans

Bois Bois Construction, palettes, fragments Plus de 10 ans

Métaux Cannettes, barils d’essence, aérosols et

débris

Plus de 100 ans

Verre Bouteilles, ampoules Environ 4000 ans

Relatifs aux déchets

sanitaires

Tampons, préservatifs, fèces

Environ 30 ans

14

II.7. La pollution radioactive :

La pollution radioactive se trouve au niveau des rejets des centrales

électronucléaires et des centres de traitement des déchets(5).

Cette pollution peut être transportée par des organismes planctoniques ou par

des poissons ayant concentré des éléments radioactifs.

II.8. La pollution due aux activités estivales :

Durant la période estivale, les plages constituent un pôle d’attraction

important pour une population hétérogène. Les différentes études menées à cet

effet, en particulier celles du Ministère de la Santé, du Ministère de

l’Équipement et du Département de l’Environnement an Maroc, ont montré que

les plages les plus polluées sont celles qui reçoivent une forte masse

d’estivants(1).

Les baigneurs peuvent transmettre au milieu marin les germes qu’ils hébergent

au niveau de la peau et des muqueuses.

II.9. La pollution thermique :

Elle est plus rare sur les côtes que dans les rivières du fait du volume et du

brassage des eaux. Certaines implantations industrielles, en particulier les

centrales électriques, consomment de l'eau pour leur refroidissement qu'elles

rejettent ensuite à une température supérieure. Une centrale de 1000 MW utilise

15

et rejette plusieurs dizaines de m³ d'eau par seconde dont la température se

trouve élevée de 7 à 8 °C(5).

Cette élévation de température entraîne :

Une diminution de la teneur de l’eau en oxygène.

Une diminution du pH due à la diminution de l’oxygène dissous.

Une augmentation de la salinité en favorisant l’évaporation.

Stimule la vitesse de multiplication des algues unicellulaires entraînant

l'eutrophisation(5).

II.10. La pollution microbiologique :

II.10.1. Les sources de contamination :

Les sources de pollution microbiologiques sont issues notamment de

mauvais raccordements d'habitations au réseau d'assainissement, de

débordements des réseaux d'eaux usées, de rejets de station d'épuration d'eaux

résiduaires et du ruissellement sur les sols lors des pluies importantes.

L'existence de dispositifs d'assainissement autonome défectueux dans certaines

zones d'habitation, mais aussi la pollution diffuse apportée par les rejets mal

maîtrisés des zones d'élevages, en particulier par temps de pluie, constitue des

causes de pollution microbiologique.

L'impact des rejets sur une zone de baignade dépend de divers facteurs :

quantité de pollution rejetée, éloignement du point de rejet par rapport à la zone

de baignade permettant une certaine auto-épuration des rejets, caractéristiques

de la dispersion des rejets des courants marins, la charge microbienne des rejets,

et de la survie des micro-organismes dans le milieu aquatique.

16

Les baignades constituent une source de pollution, celle-ci est étroitement liée à

la densité des baigneurs et la capacité de renouvellement de l’eau.

Au niveau du sable, la contamination est essentiellement directe, ainsi que cette

contamination peut avoir comme origine l’eau de mer.

Le degré de contamination microbiologique du sable est influencé par plusieurs

facteurs tels que la concentration des polluants, la fréquence de nettoyage des

plages, la capacité de dispersion par les vents, la survie des bactéries et leur

concentration dans les éléments polluants.

Figure 2 : 0rigines des sources potentielles de contamination fécale dans le

milieu marin(15).

17

II.10.2. Les bactéries :

Les bactéries sont des procaryotes de taille variable entre 0,1 et 10 µm.

Elles possèdent tout le matériel cellulaire nécessaire à leur multiplication.

Certaines d’entre elles peuvent être rencontrées sous forme de spores : ce

phénomène de sporulation a lieu en réponse à un environnement qui leur est peu

favorable. Le pouvoir pathogène d’une bactérie est soit spécifique (il engendre

des pathologies spécifiques), soit opportuniste (il ne s’exprime que sur des

individus affaiblis).

L’ingestion est la voie de contamination majoritaire.

L’annexe 1 répertorie différents exemples de bactéries retrouvées dans les eaux

usées(16).

Parmi ces bactéries, les plus connues sont les espèces du genre Salmonella qui

sont presque toutes pathogènes (responsables de fièvres typhoïdes et

paratyphoïdes ainsi que de gastroentérites) et les Escherichia coli dont certaines

souches sont responsables de redoutables gastroentérites et diarrhées.

II.10.3. Les virus :

Les virus sont des organismes de très petite taille (10 à 350 nm). Ils ne sont

constitués que d'une molécule d'ADN ou d'ARN, entourée d'une capside. Ne

possédant ni noyau, ni capacité de synthèse, ce sont des parasites obligatoires

d'une cellule vivante dont ils détournent, à leur profit, les systèmes

enzymatiques, énergétiques et de synthèse.

18

L’infection d’un individu par un virus hydrique se produit dans la majorité des

cas par l’ingestion, sauf pour le Coronavirus où elle peut aussi avoir lieu par

inhalation. Les virus sont relativement spécifiques d'un hôte. Il existe des virus

adaptés à chaque type d'hôtes (animaux, hommes, plantes, champignons, algues,

bactéries). Les virus entériques transmis par ingestion sont, avec les virus

respiratoires transmis par inhalation d'aérosols, les plus importants pour la santé

humaine.

L’annexe 1 recense la plupart des virus que l’on peut trouver dans les eaux

usées ainsi que les symptômes de la maladie qui leur est associée(16).

II.10.4. Les protozoaires :

Les protozoaires sont des organismes unicellulaires eucaryotes, plus

complexes et plus gros que les bactéries. Leur taille varie de quelques microns à

quelques millimètres, mais la plupart des espèces ne dépassent pas quelques

centaines de microns. La plupart des protozoaires pathogènes sont des

organismes parasites et se développent aux dépens de leur hôte. Ils sont souvent

rencontrés dans les eaux où ils se nourrissent de matière organique ou de

bactéries. Certains protozoaires adoptent au cours de leur cycle de vie une forme

de résistance, appelée kyste (en particulier, oocyte pour Cryptosporidium et

kyste pour Giardia).

L’annexe 1 reprend des exemples de protozoaires d’origine hydrique, dont les

plus importants sont Cryptosporidium et Giardia(16).

19

II.10.5. Les helminthes :

Il peut s’agir de vers plats (plathelminthes), ou ronds (némathelminthes), qui

comprennent de nombreuses formes de parasites souvent à l’origine de maladies

très graves. Ce sont pour la plupart, des vers intestinaux, rejetés avec les

matières fécales animales ou humaines (souvent sous forme d’œufs très

résistants). La contamination se fait par voie digestive lors de l’absorption d’eau

contaminée par des œufs ou des larves, ou alors par voie transcutanée c’est à

dire, par fixation puis pénétration de larves à travers la peau.

Différents exemples d’helminthes sont repris en annexe 1(16).

II.10.6. Les champignons :

Ce sont des organismes privés de tout organe de locomotion, incapables

d’effectuer la photosynthèse, et de ce fait, réduit à l’état de parasite ou à celui de

saprophytes (organismes qui tirent leur nourriture de matières organiques en

voie de décomposition).

Les champignons recherchés dans l’eau se transmettent par voie cutanéo-

muqueuse, et sont à l’origine d’affections cutanées. Ce sont les moisissures et

les levures (mycètes unicellulaires).

Parmi les moisissures, nous pouvons citer comme espèces pathogènes :

Allescheria boydii,

Géotrichum candidum,

Aspergillus fumigatus,

Parmi les levures, nous pouvons citer Candida albicans, espèce très répandue,

d’origine fécale, et responsables de diverses mycoses (infections cutanéo-

muqueuses buccales, vaginales et cutanées).

20

III. L’EVALUATION DE LA QUALITE MICROBIOLOGIQUE

DES EAUX - LES GERMES INDICATEURS DE

CONTAMINATION FECALE :

Dans les milieux aquatiques, la détection de tous les pathogènes

potentiels est très difficile et incertaine en raison de(17) :

la très grande variété et diversité des micro-organismes pathogènes qui

peuvent être présents dans l’eau (virus, bactéries, protozoaires…) ;

la faible abondance de chaque espèce de pathogène (nécessité de

concentrer de très grands volumes d’eau pour les détecter) ;

l’inexistence de méthodes standardisées et rapides pour la détection de

tous ces micro-organismes pathogènes.

Même si des outils moléculaires pour détecter plusieurs pathogènes à la fois se

développent progressivement, il est aujourd’hui impossible de fonder la

surveillance en routine de la qualité microbiologique des eaux sur la recherche

des pathogènes. L’évaluation de la qualité microbiologique des eaux est, par

conséquent, basée sur le concept de germes dits « indicateurs de

contamination ». Ces indicateurs ou bactéries indicatrices de contamination

n’ont pas nécessairement par eux-mêmes un caractère pathogène, mais leur

présence indique l’existence d’une contamination par des matières fécales. Leur

concentration est une indication du niveau de risque de présence de micro-

organismes pathogènes.

Un indicateur idéal est par définition une espèce ou un groupe de bactéries qui

présente certaines caractéristiques. Celles-ci sont reprises dans le Tableau II.

21

Tableau II : Caractéristiques d’un indicateur idéal de contamination

fécale(18)

Propriété Caractéristique d’un indicateur

Pathogénicité Pas pathogène

Occurrence Présent en même temps que les pathogènes, absent en absence de

de contamination fécale

Survie Taux de survie similaire à celui des pathogènes

Reproduction Ne se reproduit pas dans les eaux naturelles

Inactivation Inactivé par les différents traitements au même niveau que les pathogènes

Source La seule source dans les eaux naturelles est la contamination fécale

Coût Méthodes de détection bon marché, rapides et faciles à mettre en œuvre

Le choix d’un tel indicateur doit répondre à un certain nombre d’exigences ou

de critères(19) :

ils doivent toujours être présents lorsque les microorganismes pathogènes

sont présents ;

ils doivent apparaître en plus grand nombre que les agents pathogènes

associés;

ils doivent avoir le même comportement que les agents pathogènes dans

l’environnement naturel et au cours des procédés de fabrication ;

ils doivent être mis en évidence, dénombrés et identifiés à l’aide de

techniques simples.

Différents groupes de bactéries sont utilisés comme indicateurs de

contamination fécale dans différents pays et sous différentes juridictions. Les

coliformes totaux et fécaux ont été très longtemps les principaux indicateurs de

contamination fécale mais aujourd’hui, Escherichia coli et les entérocoques

22

intestinaux sont reconnus comme plus appropriés(20, 21) et proposés pour

remplacer les coliformes dans certaines normes de qualité microbiologique des

eaux. Il est cependant important de comprendre les potentialités et les limitations

de ces différents indicateurs. Quelques caractéristiques des indicateurs les plus

couramment utilisés sont présentées ci-dessous :

Coliformes totaux (CT). La pertinence de ce groupe comme indicateur

est aujourd’hui fortement contestée du fait que toutes les espèces incluses

dans les CT ne sont pas spécifiques de la flore intestinale des animaux à

sang chaud. En effet, certaines espèces sont d’origine tellurique ou

aquatique et sont capables de se développer dans l’environnement

aquatique(22, 23).

Coliformes fécaux (CF) (aussi appelés Coliformes Thermotolérants).

Les CF constituent un sous-groupe des CT capables de se développer à

44 °C. Les CF sont considérés comme plus appropriés comme indicateurs

de contamination fécale que les CT. Ce groupe est majoritairement

constitué de Escherichia coli mais comprend aussi des Klebsiellas, des

Enterobacter et des Citrobacter. Certains auteurs ont rapporté la présence

de ces dernières espèces dans des eaux sans qu’aucune contamination

fécale ne soit suspectée(24, 25), tel que , Havelaar(26) montre qu'en

Finlande la majorité des coliformes thermotolérants détectés dans une

eau provenaient d'eaux usées d'industries de bois et de papier.

E. coli. De nombreuses études ont montré que cette espèce était

généralement associée à une source fécale (20, 23, 24, 27-29).

Aujourd’hui E.coli est considéré comme le meilleur indicateur d’une

contamination récente du milieu aquatique par du matériel fécal humain

ou d’animaux à sang chaud(20). Cependant, quelques études (30-32)

23

suggèrent qu’en milieux tropicaux certaines souches d’E. coli puissent

faire partie de la flore autochtone des rivières ; cette espèce ne serait donc

pas un indicateur idéal de contamination fécale en milieux tropicaux.

Entérocoques intestinaux. Ce groupe est aussi considéré comme un bon

indicateur spécifique de la contamination fécale. Plusieurs études ont

montré que l’abondance des entérocoques intestinaux était mieux corrélée

à l’apparition de maladies gastro-intestinales chez les baigneurs

fréquentant des plages aux eaux contaminées que l’abondance des CT ou

CF (33, 34).Le fait que les entérocoques intestinaux survivent plus

longtemps dans le milieu naturel que les E. coli peut constituer un

avantage de ce groupe si l’on cherche à identifier une contamination

fécale ancienne (35, 36)

III.1. Définition des indicateurs bactériens de contamination fécale :

III.1.1. Les coliformes totaux :

Ils sont définis comme l’ensemble des bactéries aérobies et anaérobies

facultatives Gram négatif, non sporulantes, en forme de bâtonnet, qui sont

capables de se multiplier en présence de sels biliaires ou d’autres agents de

surface ayant des propriétés équivalentes et de fermenter le lactose avec

production d’acide et de gaz en 48 heures à 35-37°C.

Les principaux genres inclus dans le groupe sont : Citrobacter, Enterobacter,

Escherichia, Klebsiella et Serratia (37). La presque totalité des espèces est non

pathogène et ne représente pas de risque direct pour la santé (20, 38), à

l’exception de certaines souches d'Escherichia coli (E. coli) ainsi que de rares

bactéries pathogènes opportunistes.

24

III.1.2. Les coliformes fécaux :

Les coliformes fécaux, ou coliformes thermotolérants, sont un sous-

groupe des coliformes totaux capables de fermenter le lactose à une température

de 44,5C°. L’espèce la plus fréquemment associée à ce groupe bactérien est

l'Escherichia coli (E. coli) et, dans une moindre mesure, certaines espèces des

genres Citrobacter, Enterobacter et Klebsiella (20, 39, 40). La bactérie E. coli

représente toutefois 80 à 90 % des coliformes thermotolérants détectés(20, 41).

III.1.3. Les Entérocoques intestinaux :

Ils constituent un sous-groupe des Streptocoques fécaux ; ce sont des

bactéries Gram positives, catalases négatives, en forme de cocci, commensaux

du tube digestif.

Les entérocoques appartiennent au groupe D de Lancefield, les plus

fréquemment isolés sont Enterococcus faecalis et à un moindre degré

Enterococcus faecium(42).

Ils peuvent être définis comme des microorganismes capables de se

développer entre 10 et 45 °C à pH 9,6 et dans 6.5% de NaCl , ou comme des

microorganismes capables de se développer en aérobiose et d’hydrolyser le 4-

methylumbeliferyl β -D Glucoside en présence d’acétate de thallium, acide

nalidixique et 2,3,5- triphenyltetrazolium chloride (TTC).

25

III.1.4. Le rapport coliformes fécaux/streptocoques fécaux :

le rapport coliformes fécaux/entérocoques est un élément informatif de premier

ordre pour déterminer la source de contamination(43) :

Rapport CF/SF Source de contamination

R>4 origine exclusivement humaine

4>R>2 origine mixte à prédominance humaine

2>R>1 origine incertaine

1>R>0.7 origine mixte à prédominance humaine

0.7>R origine principalement animale

Ce rapport doit être, cependant, appliqué avec prudence, car il varie énormément

avec la température de l’eau de mer, l’éloignement de la source de

contamination et avec le temps d’immersion des contaminants.

III.2. Autres indicateurs :

Des études récentes ont mis en évidence le fait que l’abondance de bactéries

indicatrices en général n’était pas bien corrélée à la présence de virus

pathogènes (44-46) . Les bactériophages et plus particulièrement les coliphages

ont été proposés comme des indicateurs spécifiques pour les virus entériques.

Les bactériophages sont des virus qui infectent des bactéries ; ceux qui infectent

en particulier E. coli et les autres coliformes sont appelés des coliphages.

Trois groupes sont actuellement testés comme indicateurs: les coliphages

somatiques, les coliphages anti-mâle à ARN ou phages F-RNA (qui se lient aux

26

pili sexuels des bactéries F+) et les phages infectant Bacteroides fragilis. Cette

approche est en plein développement, mais des limitations pour l’usage des

coliphages comme indicateurs subsistent:

de nombreux paramètres influencent le devenir des coliphages dans les

milieux naturels (densité des bactéries hôtes, et des phages eux-mêmes,

température, pH, etc.) et peu d’informations pertinentes existent à ce

sujet ;

ils sont présents en nombre très variable et leur abondance n’a pas été

démontrée comme ayant un rapport avec l’apparition d’infections ;

finalement, les analyses sont encore très chères et nécessitent une étape

de concentration(47).

Clostridium perfringens a aussi été proposé. Cette bactérie anaérobie stricte ne

se multiplie que dans le tractus intestinal d'animaux à sang chaud et ses spores

résistent remarquablement aux conditions défavorables, beaucoup mieux que les

virus entériques. Cependant, du fait de cette très forte résistance, Clostridium

s'avère être un indicateur trop conservatif et se révèle non corrélé avec les virus

entériques(48).

Une collaboration internationale (Projet virobathe) vise à établir des normes

pour l’énumération des virus dans les eaux à usage récréatif.

Enfin, certains auteurs (22, 49) proposent une évaluation de la qualité

microbiologique des eaux basée sur l’énumération simultanée de plusieurs

indicateurs complémentaires.

27

IV. LES METHODES DE DETECTION DES MICRO-

ORGANISMES INDICATEURS :

IV.1. La mise en culture :

Les méthodes traditionnelles pour l’énumération des bactéries fécales sont

basées sur leur mise en culture. Bien que, ces dernières années, nombre de

publications aient proposé des méthodes alternatives aux méthodes classiques de

dénombrement des bactéries fécales dans les eaux de surface, ces dernières sont

néanmoins encore utilisées de manière systématique pour le contrôle en routine

de la qualité microbiologique des eaux et sont toujours les seules reprises dans

les normes.

Deux grands types de méthodes basées sur la mise en culture sont régulièrement

utilisés :

- La détermination du nombre le plus probable (NPP) : des dilutions

décimales de l’échantillon sont inoculées dans une série de tubes contenant un

milieu de culture liquide spécifique. La loi de Poisson permet de calculer le NPP

sur base de la proportion de tubes positifs dans chaque dilution.

- La méthode de filtration sur membrane (MF) : un volume défini de

l’échantillon est filtré et la membrane est incubée sur un milieu gélosé

spécifique. Différents milieux et conditions d’incubation (temps et température)

peuvent être utilisés selon le type de bactéries fécales recherché(50) . Après

incubation, on dénombre les colonies visibles à l’œil nu et l’on considère que

chaque colonie résulte de la multiplication sur le milieu d’une cellule

bactérienne. Le résultat s’exprime en UFC (unité formant colonie) par unité de

volume.

28

Pour l’énumération des coliformes et des E.coli, les milieux spécifiques

classiques utilisés pour la détermination du NPP ou des UFC possèdent du

lactose et un indicateur pour identifier la production d’acide. Ils contiennent

aussi des détergents et/ou des sels biliaires pour inhiber la croissance des Gram

positifs et des levures.

Le milieu liquide spécifique le plus utilisé en France pour l’énumération des

coliformes dans l’eau est le bouillon lactosé au vert brillant. Les milieux gélosés

spécifiques les plus utilisés pour l’énumération des coliformes sont: le milieu

m-Endo et le milieu lactosé TTC-Tergitol.

Pour augmenter la spécificité et diminuer le temps de réponse des méthodes

basées sur la mise en culture, des propriétés enzymatiques des coliformes et des

E. coli sont aujourd’hui exploitées. La détection de l’activité de la β-D-

galactosidase (une enzyme spécifique des coliformes) et celle de la β-D-

glucuronidase (une enzyme spécifique des E. coli) sont utilisées pour mettre en

évidence la présence de ces bactéries. Des substrats chromogéniques et

fluorogéniques ont été incorporés dans les milieux de culture ; l’hydrolyse de

ces substrats par les enzymes spécifiques donne lieu à des produits colorés ou

fluorescents qui permettent une détection aisée de l’activité enzymatique

ciblée(51). Quelques milieux de culture basés sur ces propriétés enzymatiques

permettent la détection simultanée des coliformes et des E. coli.

Un exemple d’un dénombrement sur gélose d’E. coli est présenté par la

figure 3. Le substrat fluorogénique incorporé à la gélose fait apparaître les

cellules d’E. coli en mauve.

29

Figure 3 : Photographie d’un dénombrement des E. coli sur un milieu de

culture contenant un substrat chromogénique (milieu Chromocult Agar).

Les colonies d’E. coli apparaissent colorées en mauve sur ce milieu(52).

La connaissance des propriétés enzymatiques de ces bactéries a également

permis de développer l’approche dite “defined substrate technique” (53) : Elle

consiste à fournir comme seul substrat dans le milieu, un composé nécessitant

l’activité enzymatique ciblée pour pouvoir être utilisé ; seul le groupe de

bactéries ciblé peut donc croître. Une méthode normalisée (ISO 1899-1) et

miniaturisée est aujourd’hui utilisée pour l’énumération des E. coli pour le

contrôle de routine de la qualité microbiologique des eaux. Dans cette méthode

30

NPP miniaturisée, une microplaque de 96 puits contenant un substrat

fluorogénique pouvant être hydrolysé par la β-D-glucuronidase est utilisé. Après

incubation de la microplaque, 36 h à 44 °C, chaque puit est inoculé avec des

dilutions décimales de l’échantillon d’eau. Les puits positifs sont énumérés sous

illumination UV et le NPP est calculé (voir figure 4).

Figure 4 : Photographie d’un dénombrement des E. coli par la technique

microplaque. Les puits positifs (où il y a eu croissance des E. coli)

apparaissent fluorescents sous illumination UV. Chaque rangée verticale de

puits correspond à une dilution de l’échantillon (échantillon de plus en plus

dilué de gauche à droite). Le nombre de puits fluorescents est compté pour

chaque dilution de l’échantillon ce qui permet une estimation du NPP d’E.

coli dans l’échantillon.

31

Les méthodes basées sur la mise en culture présentent deux inconvénients

majeurs.

Tout d’abord, le temps de réponse est relativement long (de 24 à 48 h pour la

détermination du NPP). Elles ne permettent donc pas de détecter immédiatement

les pollutions fécales en milieu naturel, ce qui constitue un handicap

considérable quand une réponse rapide sur l’état de contamination d’une eau

naturelle est souhaitée, par exemple aux prises d’eau des usines de production

d’eau potable en rivière ou dans les zones de baignade fréquentées.

D’autre part, ces méthodes peuvent sous-estimer le nombre de bactéries fécales

présentes dans un échantillon d’eau, en ne prenant pas en compte celles qui ne

sont plus capables de se diviser.

IV.2. La problématique des bactéries fécales non cultivables :

A l’origine de l’utilisation des méthodes basée sur la mise en culture, on

considérait que la différence entre bactéries «mortes» et bactéries «vivantes »

s’exprimait par la capacité de ces cellules à se multiplier ou pas dans ou sur des

milieux et dans des conditions considérées optimums pour leur croissance.

Aujourd’hui, on sait pertinemment que la frontière entre la vie et la mort d’une

bactérie ne peut être définie par cet unique et simple concept.

En effet, depuis le courant des années 1980, d’importants développements

méthodologiques très variés ont permis de mettre en évidence l’existence d’une

proportion importante de bactéries présentes dans les milieux aquatiques

naturels qui n’étaient pas capables de se développer dans les milieux de culture

(bactéries non cultivables) mais présentaient certaines caractéristiques qui

32

démontraient leur activité ou leur viabilité. Diverses méthodes sont utilisées

pour évaluer l’activité ou la viabilité des bactéries(54) : mesure de l’intégrité

cellulaire comme l’intégrité membranaire ou le potentiel de membrane, mesures

d’activités métaboliques comme l’utilisation d’un substrat ou la synthèse de

protéines, la détection d’une activité respiratoire ou d’une activité enzymatique

ou encore la détection de synthèse d’ARNm ou d’ARNr. Les bactéries

présentant certaines activités mais incapables de se multiplier en culture ont été

intitulées « Bactéries Viables mais Non Cultivables », ou VBNC(55).

Certains auteurs(56, 57) ont proposé l’utilisation du terme ANC (Actives Non

Cultivables) comme plus approprié que le terme VNBC pour décrire ces

bactéries vu que la « viabilité » dont on parle est souvent définie par la mesure

de certaines propriétés cellulaires qui ne sont pas forcement en relation avec la

capacité de ces cellules à se reproduire. Cet état VBNC ou ANC a été mis en

évidence pour des bactéries autochtones du milieu aquatique mais aussi pour

diverses bactéries entériques dans le milieu aquatique(55).

L’habitat naturel des E. coli est l’intestin des animaux à sang chaud qui offre un

environnement à température constante et élevée (37 °C) et des concentrations

élevées en substrats organiques aisément assimilables comme les acides aminés

et les sucres, tous facteurs favorables au développement bactérien.

Une fois rejetées dans le milieu naturel, ces bactéries se trouvent confrontées à

des conditions défavorables telles que la limitation en nutriments, le stress

osmotique, de faibles températures et des variations de pH ainsi que face à de

multiples prédateurs. Une partie de ces bactéries peuvent survivre à ces

conditions défavorables en entrant dans l’état VBNC(58, 59).

En effet, de nombreuses publications montrent qu’après leur introduction dans

un milieu aquatique naturel, les bactéries fécales perdent assez rapidement leur

33

faculté de croître dans ou sur les milieux spécifiques utilisés pour leur

dénombrement mais conservent beaucoup plus longtemps certaines activités

métaboliques (59-61). Différentes études ont, par ailleurs, suggéré que ces

bactéries actives mais non cultivables pouvaient conserver leur pathogénicité

(62, 63). Si les bactéries entériques VBNC présentes dans les milieux aquatiques

sont effectivement capables de « ressusciter » de ce stade « dormant » et de se

reproduire le risque sanitaire serait alors systématiquement sous-estimé par les

méthodes de dénombrement par mise en culture(64).

Aujourd’hui, le concept de bactéries VBNC fait encore l’objet de débats

passionnés sur la signification exacte de cet état(56, 59). Deux visions

divergentes s’opposent(65, 66). La première présente l’état VBNC comme une

stratégie de survie, et donc un processus actif qui conduit à une différenciation.

Cette hypothèse veut que cet état soit réversible et que dans certaines conditions

ces cellules « ressuscitent » et soient capables de se reproduire. L’autre vision

présente cet état comme une étape irréversible conduisant vers la mort. Ces

cellules seraient capables de maintenir certaines activités métaboliques ou

respiratoires pendant un temps limité mais ne seraient pas capables de

« ressusciter ».

De nombreuses études ont tenté d’induire une « ressuscitation », celle-ci serait la

meilleure mesure d’une réelle viabilité (67-69). Dans la plupart de ces études, la

« ressuscitation » n’a été possible que sur les cultures qui sont restées dans l’état

VBNC pour de courtes périodes de temps(65). D’autres auteurs contestent ces

résultats en suggérant que la croissance observée était due à quelques cellules

cultivables présentes en abondance inférieure à la limite de détection de la

méthode d’énumération par mise en culture utilisée(70).

34

L’intérêt croissant pour le développement de nouvelles méthodes de

dénombrement spécifiques capables de détecter les bactéries fécales dans l’état

VBNC dans les eaux de surface découle tout naturellement de ce qui précède.

IV.3. Les méthodes moléculaires :

Les méthodes moléculaires de détection de bactéries fécales (pathogènes et

indicateurs) ont été l’objet d’un important travail de recherche durant les

dernières années. Les méthodes moléculaires présentent l’avantage d’être

rapides, spécifiques ; elles ne nécessitent pas d’étape de mise en culture mais

présentent l’inconvénient d’être chères et de nécessiter un personnel très

qualifié. De plus, certaines ne font pas toujours la distinction entre les bactéries

vivantes et mortes.

La méthode moléculaire est basée sur l’extraction de l’ADN des micro-

organismes présents dans l’échantillon suivie de la multiplication, par la

technique d’amplification génique, d’une séquence du génome ou ADN

spécifique du micro-organisme recherché. Cette multiplication appelée PCR

(pour Polymerase Chain Reaction en anglais), dont le principe est expliqué à la

figure 4, permet de recopier en plusieurs centaines de millions d’exemplaires le

fragment d’ADN. Il est alors possible de visualiser la présence d’un micro-

organisme présent en très faible nombre dans l’échantillon de départ.

Des variantes de cette technique (PCR compétitive et PCR en temps réel)

permettent aujourd’hui, sur la base du nombre de copies du gène après

amplification, de dénombrer les micro-organismes dans l’échantillon. Ces

méthodes sensibles présentent néanmoins l’inconvénient de ne pas permettre la

distinction entre un micro-organisme vivant et un fragment en bon état

de son ADN présent dans l’échantillon.

35

Figure 5 : Schéma du principe de l’amplification génique (PCR)(52).

36

IV.4. L’énumération des E. coli viables par hybridation in situ :

L’hybridation in situ avec une sonde fluorescente (FISH - Fluorescent In Situ

Hybridisation), consiste à marquer la cellule cible avec une sonde moléculaire

spécifique du micro-organisme ciblé liée à un composé fluorescent.

Cette sonde moléculaire est en fait l’homologue d’une séquence de bases

spécifiques de l’ARN du microorganisme cible.

Dans le cas du micro-organisme cible, la sonde moléculaire se lie par

appariement à la séquence de base homologue de l’ARN de la cellule cible qui

devient fluorescente et détectable en microscopie à épifluorescence. Dans le cas

d’un micro-organisme non-cible, il n’y pas appariement et donc pas de

marquage de la cellule.

Récemment, cette procédure d’hybridation in situ appliquée aux E. coli a été

couplée avec un test de viabilité pour ne détecter en microscopie que les

cellules viables(71).

Ce test consiste à incuber les bactéries dans un milieu riche en présence

d’antibiotiques qui inhibent la division cellulaire ; à la suite de cette incubation,

les cellules actives sont allongées, ce qui permet de les distinguer des inactives.

Cette élongation des cellules actives s’accompagne d’un accroissement du

contenu en ARN sans changer le nombre de bactéries. Ce couplage offre donc le

double avantage de faciliter la détection des bactéries, après marquage par une

sonde moléculaire fluorescente, et de permettre la seule énumération des cellules

actives (cellules présentant une activité métabolique dans les conditions

d’incubation en présence du milieu riche).

Des exemples de dénombrement des E. coli par cette méthode sont présentés par

la figure 6.

37

À l’inverse des méthodes basées sur la mise en culture, cette technique offre

l’avantage de dénombrer l’ensemble des E. coli viables et non pas seulement

les E. coli cultivables (capable de se multiplier sur les milieux de culture), mais

elle présente l’inconvénient d’être relativement lourde à mettre en œuvre et de

nécessiter un personnel formé aux techniques de biologie moléculaire et à la

microscopie.

Cette technique a permis de montrer que la proportion des E. coli viables mais

non cultivables était plus importante dans les milieux peu contaminés par

rapport aux milieux fortement contaminés(52).

Ceci s’explique probablement par le fait que des conditions plus stressantes

(stress nutritionnel, effet de la lumière), qui sont responsables de la plus grande

fraction de bactéries viables mais non cultivables sont rencontrées dans les

milieux les moins contaminés.

Figure 6 : Hybridation in situ avec une sonde moléculaire des E. coli

présents dans un échantillon d’eau usée traitée (10 ml filtrés) (I) et dans un

échantillon d’eau (100 ml filtrés) (II). Sur les deux photos, la flèche « a »

indique une cellule d’E. coli fluorescent en rouge(52).

38

IV.5. La mesure directe de l’activité β-D-glucuronidasique :

La mesure de l’activité de la β-D-glucuronidase des E. coli sans passage

par une étape de mise en culture des échantillons a été proposée comme

alternative aux dénombrements par mise en culture dans les eaux côtières(72).

La méthode consiste à filtrer un échantillon d’eau (en général 100 ml), à

incuber le filtre dans un tampon à pH optimal (6.9) et à température optimale

(44 °C) en présence du substrat fluorogène (4-méthylumbelliferyl-β-D-

glucuronide (MUGlu) en concentration saturante et à mesurer l’apparition de la

fluorescence au cours du temps(73). L’apparition de la fluorescence est due à la

methylumbelliferone (MUF) résultant de l’hydrolyse du substrat MUGlu par la

β-D-glucuronidase des E. coli et est proportionnelle à la quantité d’enzymes

présentes dans l’échantillon qui est elle-même proportionnelle au nombre des

E.coli dans l’échantillon.

Ce protocole permet de mesurer l’activité GLU en moins d’une heure.

Le résultat de la mesure exprimé en terme d’activité enzymatique est converti en

abondance d’E. coli grâce à une calibration du type de celle présentée à la

figure7.

39

Figure 7 : Relation linéaire en coordonnées logarithmiques, entre l’activité

GLU et la concentration en E. coli cultivables (estimée par la méthode «

microplaque »)(52).

La mesure directe de l’activité GLU avec le type de protocole décrit ci-dessus a

été appliquée avec succès à divers types d’échantillons : eaux de mer, eaux

douces et eaux usées (73-75).

Ces différents travaux ont tous montré une corrélation significative entre le Log

de l’activité GLU et celui de l’abondance en coliformes fécaux dénombrés sur

gélose.

La rapidité, la simplicité du protocole expérimental et un coût équivalent à celui

des méthodes de dénombrement sur gélose ont permis de proposer cette

approche comme une méthode rapide pour évaluer la qualité microbiologique

des eaux douces (76) et marines (77).

40

Tel que dans une étude montrant l’efficacité de cette analyse enzymatique, cinq

cents échantillons provenant de différents sites côtiers (côte atlantique française)

et d'eau douce ont été analysés par cette méthode, les résultats obtenus par la

mesure de l'activité β D-glucuronidase sont conformes pour plus de 90 % des

échantillons analysés à ceux estimés par la méthode standard (ISO 9308-3)(78).

De plus, pour moins de 1 % d'échantillons, le niveau de qualité en E. coli peut

être sous-estimé contrairement à la méthode de référence.

Les inconvénients liés à cette méthode sont la nécessité d’une calibration par

rapport à une méthode de mise en culture pour obtenir un résultat exprimé en

concentration d’E. coli ainsi que la possible interférence, dans certaines

conditions environnementales, de micro-organismes non ciblés (bactéries non

E. coli possédant une activité glucuronidasique) et de la turbidité.

41

V. LES NORMES DE QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES

EAUX DE BAIGNADE :

Pour un niveau de contamination microbiologique donné, le risque

sanitaire dépend de l’usage qui est fait de l’eau. L’eau qui est directement

consommée, qui est utilisée comme ressource dans une usine de production

d’eau potable, qui sert pour l’hygiène, la baignade ou pour d’autres activités

récréatives nautiques, ou encore qui est utilisée pour l’irrigation des cultures

n’expose évidemment pas aux mêmes risques sanitaires. De ce fait, des normes

différentes ont été établies pour chacun de ces usages.

Les études épidémiologiques permettent de faire le lien entre l’exposition à un

facteur donné et l’incidence d’infections dues à cette exposition. Elles donnent

une estimation du risque en fonction d’un niveau d’exposition ou dose (dans le

cas des maladies d’origine hydrique, une abondance d’indicateurs) et peuvent

donc être utilisées pour définir des normes appropriées.

Les études épidémiologiques qui conduisent à la définition de normes doivent

être de la plus grande rigueur de façon à entraîner l’adhésion à ces normes.

Néanmoins, ce type d’étude ne donne qu’une estimation statistique d’une

relation risque/facteur contrairement à d’autres méthodes expérimentales, mais

elles sont souvent pour diverses raisons (éthiques, logistiques, financières, etc.)

les seules accessibles. Les limites méthodologiques des études épidémiologiques

sont généralement atteintes lorsqu’il s’agit de mesurer de très faibles

changements du risque, ce qui implique le traitement d’échantillons trop vastes

pour être

accessibles.

42

Des études épidémiologiques sont à l’origine des normes pour la réutilisation

des eaux usées(79) et de la norme pour les eaux à usage récréatif(80)

contrairement aux normes pour l’eau de boisson qui sont basées sur le principe

de précaution (absence totale d’indicateurs de contamination fécale) (81).

Pruss (82) présente une revue des études épidémiologiques disponibles

concernant les eaux à usage récréatif. Sur 22 études identifiées seulement 7

concernaient les eaux douces (83-88). Cette revue met en évidence une forte

corrélation entre l’abondance d’indicateurs et l’occurrence de maladies gastro-

intestinales et montre qu’E. coli est le meilleur indicateur de risque sanitaire

pour les eaux douces.

Pour un usage donné de l’eau, les normes n’ont aucune raison d’être identiques

partout dans le monde. En effet, des facteurs locaux influencent le risque que

constitue un niveau de contamination donné. Ce sont, entre autres :

le background génétique et immunologique de la population, ce dernier

étant lui-même corrélé à la prévalence d’infections diverses dans cette

population et à l’écologie microbienne de la région considérée;

le type de pathogènes présents et leur proportion par rapport aux

indicateurs ;

la différence de survie des microorganismes d’origine fécale dans des

milieux aquatiques différents.

Il faut noter qu’aujourd’hui le niveau des normes est en général établi partout

dans le monde sur base d’études épidémiologiques conduites seulement en

régions tempérées et dont les résultats ne sont probablement pas directement

transposables à d’autres régions comme les régions tropicales ; il semble

43

aujourd’hui important de lancer des études épidémiologiques spécifiques à

chaque région pour y garantir la pertinence des normes de qualité

microbiologique.

Parmi les normes microbiologiques des eaux de baignade, on distingue les

normes proposées par l’OMS et le PNUE et la nouvelle directive Européenne

2006/7/CEE (voir tableaux ci-dessous).

Tableau III : Les normes microbiologiques pour les eaux de baignade

proposées par l’OMS et le PNUE en 1983(89).

Paramètres

Concentration par

100 ml à ne pas

Nombre

minimum

dépasser d'échantillons

50% 90%

du temps

Coliformes

Fécaux

100 1000 10

Streptocoques

Fécaux

100 1000 10

44

Tableau IV : Les normes microbiologiques requises pour les eaux de

baignade déterminée par la directive 2006/7/CEE.

Paramètres Excellente qualité Bonne qualité Qualité suffisante

Entérocoques intestinaux

(CFU /100ml) 100* 200* 185**

Escherichia Coli

(CFU/100ml) 250* 500* 500**

* : évaluation au 95ème percentile

** : évaluation au 90ème percentile

Même si des critiques peuvent être émises sur la manière dont ces normes ont

été établies et sur leur réelle signification sanitaire, personne ne peut nier

l’utilité de leur caractère préventif. Une meilleure gestion du risque sanitaire

associé à l’eau nécessite de poursuivre les études épidémiologiques afin de

mieux appréhender la relation entre la présence des indicateurs et l’apparition de

maladies mais nécessite aussi d’approfondir l’étude de l’écologie des germes

indicateurs et pathogènes dans le milieu aquatique naturel.

45

VI. LA SURVIE DES BACTERIES DANS LE MILIEU MARIN :

Le concept classique d’auto-épuration bactérienne par l’eau de mer a été

longtemps retenu. Jusqu’aux années 70, il était admis que les bactéries

pathogènes d’origine humaine étaient détruites en quelques heures dans l’eau de

mer. La plupart des auteurs considèrent la température et la diminution

d’intensité lumineuse comme seules responsables des décroissances

bactériennes en milieu marin, mais certains n’excluent pas l’intervention

d’autres facteurs défavorables tels que la salinité, les carences en éléments

nutritifs, la sédimentation, l’antibiose entre les bactéries et certaines substances

antibactériennes produites par les algues ou les bactéries marines. Par contre, la

présence de matière organique, notamment dans les sédiments, favoriserait le

processus de survie des E. coli et des salmonelles(90).

Les résultats in vivo de ces expériences ont montré que les E. coli évoluaient

rapidement en 1 à 4 jours vers un état non cultivable dans les milieux carencés

en éléments nutritifs(90). E. coli subit des processus adaptatifs structuraux telle

la diminution de sa taille, un changement de la composition de ses enveloppes,

avec disparition de certaines protéines.

Tout ceci s’accompagne d’une modification de l’activité enzymatique

notamment de la β-galactosidase. Or, comme la numération des coliformes

fécaux en milieu spécifique est fondée sur la dégradation du lactose, liée

essentiellement à l’activité de cette galactosidase, cette méthode peut être remise

en cause pour l’identification des E. coli en milieu marin. Par contre, ces formes

dormantes garderaient leur pouvoir pathogène. Des résultats similaires ont été

retrouvés avec Vibrio, Salmonella et Shigella(90).

46

Les bactéries et virus, hôtes habituels de l’intestin de l’homme et des animaux à

sang chaud, qui arrivent dans le milieu marin, se retrouvent dans un milieu

hostile peu propice à leur croissance. Incapables de se multiplier dans cet

environnement, ces microorganismes vont y survivre plus ou moins longtemps

en fonction des paramètres physiques, chimiques et biologiques du milieu

(figure 8). Les microorganismes sont soit libres dans la masse d’eau, soit

associés à des particules organiques ou minéraux. Suivant le poids de ces

particules, les microorganismes vont être soumis à une dilution tout au long de

l’estuaire ou à une sédimentation favorable à leur concentration. Ainsi, on

estime que les sédiments sont plus contaminés que l’eau environnante et vont

constituer un réservoir potentiel pour une recontamination ultérieure des eaux à

la faveur de la remise en suspension des microorganismes lors des phénomènes

naturels (crues, tempête) ou d’activités humaines (dragages). Le temps de survie

des microorganismes est défini par le temps nécessaire à la disparition de 90%

de la population initiale, exprimé par le T90. De quelques heures à quelques

jours pour les bactéries, cette survie est prolongée, pour les virus, de plusieurs

semaines à plusieurs mois.

47

Figure 8 : Les paramètres physiques, chimiques et biologiques influençant

la survie des germes en milieu marin(15).

VI.1. Les facteurs influençant la survie des microorganismes en

milieu marin :

VI.1.1. Facteurs physico-chimiques :

VI.1.1.1. La dilution :

Elle intervient immédiatement après le rejet. Elle est favorisée par le

mélange des eaux : courants, turbulence et action des marées. On estime que 90

à 99% des bactéries d’égout sont détruites après 48 heures de suspension dans

48

l’eau de mer et que leur nombre décroit avec la distance beaucoup plus

rapidement que l’on pourrait s’y attendre du fait de la simple dilution.

VI.1.1.2. L’adsorption :

C’est la fixation des polluants sur toutes les particules organiques ou

minérales en suspension dans le milieu aquatique. C’est un phénomène bien

connu par lequel les microbes s’accrochent à des corpuscules dont ils suivent le

sort ; l’adsorption contribue donc à un isolement des germes et à une efficace

dissociation de la charge polluante, car elle peut atteindre 90 à 95% des bactéries

et des virus).

VI.1.1.3. La sédimentation :

Directe ou indirecte (après adsorption), elle détermine la disparition

momentanée des microbes. Cette disparition peut être provisoire, car il peut y

avoir remis en suspension des sédiments et des bactéries. Très efficace en eaux

calmes, elle se trouve amoindrie par la turbulence du milieu.

VI.1.1.4. La lumière :

Certaines études ont montré que les coliformes fécaux dans l’eau de mer

sont très sensibles à la lumière solaire(91). Ceci peut être expliqué par l’effet

bactéricide de la fraction UV des radiations solaires sur la cellule, en induisant

des dommages par libération des ions peroxyde qui agissent sur la cellule en la

rendant perméable aux sels inorganiques, ce qui fait varier alors sa pression

osmotique.

49

Une turbidité élevée de l’eau limite la pénétration des rayons UV dans l’eau et

contribue également à réduire l’efficacité des rayons UV vis-à-vis des cellules

microbiennes.

VI.1.1.5. La température :

Généralement les basses températures favorisent la survie des bactéries

dans le milieu marin en limitant leurs dépenses énergétiques par diminution des

activités métaboliques des bactéries(91).

VI.1.1.6. Les variations de pH :

Des travaux ont montré que la survie des coliformes fécaux(CF) a été

influencée par le pH du milieu d’incubation. En effet, les pH basiques entraînent

une nette diminution de la survie des CF(91).

VI.1.1.7. La salinité :

La salinité est aussi un facteur de stress très important que subissent les

bactéries de pollution fécale en arrivant au milieu marin(92), où la bactérie doit

rétablir l’équilibre osmotique entre le milieu extérieur et son cytoplasme. Ce

rétablissement met en jeu des mécanismes complexes qui font appel à

l’augmentation de la concentration de certains solutés (osmo-régulateurs) dans

la bactérie.

50

Ainsi, les fortes variations de salinité d’un milieu à l’autre ont tendance à

empêcher l’accoutumance des bactéries allochtones à leur nouveau milieu, ce

qui conduit à la décroissance de leur nombre.

Des auteurs(93) ont souligné également que la présence de particules organiques

permet aux microorganismes de lutter plus efficacement contre le stress salin.

VI.1.2. Facteurs biologiques :

Compétition interspécifique: la présence des microorganismes autochtones, plus

aptes à se multiplier dans leur milieu naturel, implique la décroissance des

bactéries allochtones.

Prédation : On peut citer les :

-Bactéries prédatrices : comme les Bdellovibrio (groupe de bactéries de petite

taille qui se fixent sur d’autres bactéries pour les « dévorer » ; ce sont des

vibrions très mobiles qui n’attaquent que les bactéries Gram négatives); et les

Myxobactéries (germes à Gram négatif ayant pour singularité d’hydrolyser les

molécules insolubles, de lyser les cellules bactériennes et de les utiliser comme

substrat).

-Les bactériophages : extrêmement répondus dans la nature ; ils parasitent et

détruisent bactéries et Cyanophycées. Ils peuvent détruire une population

bactérienne entière ou seulement une partie de celle-ci, s’intégrer dans le

chromosome pour établir la lysogénie.

-Les prédateurs microphages : Ce sont tous les organismes qui se nourrissent de

microbes. Ils sont représentés par les amibes, les flagellés, les ciliés ou des êtres

plus évolués tels que les mollusques filtrants qui absorbent une grande quantité

51

de bactéries et de virus avec leur nourriture. Il faut souligner que pour ces deux

derniers, les germes absorbés ne sont pas nécessairement détruits.

L’oligotrophie : peut être liée à l’absence de substances nutritives ou à la non

biodisponibilité de la matière organique.

52

VII. RISQUES SANITAIRES LIES A LA BAIGNADE DANS LES

EAUX POLLUEES :

VII.1. Introduction :

La baignade dans les eaux naturelles peut entraîner un contact plus ou

moins intense avec des germes pathogènes qui peuvent être présents dans l’eau

en plus ou moins grande quantité. Les pathologies associées à ces germes

concernent la sphère O.R.L., l’appareil digestif, les yeux et la peau, et une

grande variété d’agents pathogènes présents dans les eaux naturelles sont

responsables de ces diverses maladies dont les plus fréquentes sont répertoriées

dans l’annexe 2.

Le risque encouru par le baigneur dépend de plusieurs facteurs :

du niveau de contamination de l’eau,

de l’état de santé du baigneur,

des modalités de la baignade (durée, immersion de la tête…).

La transmission des microorganismes peut se faire par voie féco-orale

(ingestion d’eau) ou par contact avec la peau et les muqueuses(94).

VII.2. Historique :

Jusqu’en 1975 environ, les risques sanitaires liés à la baignade ont été ignorés.

À partir des années 1980, plusieurs personnes s’intéressent à ces risques,

notamment Cabelli et Foulon aux États-Unis.

Les études réalisées révèlent une convergence certaine entre les pathologies

observées (diarrhées, vomissements, nausées,…) et l’existence d’une pollution

53

fécale marquée. Lors de différentes études, il s’avère que les baigneurs

présentent plus de troubles gastro-intestinaux que les non-baigneurs, tout comme

les baigneurs des zones soumises à des pollutions fécales comparés à ceux des

zones saines.

Les travaux de Foulon (1983) ont mis en évidence l’apparition de troubles

dermatologiques et d’affections O.R.L. attribués à la baignade et plus

précisément aux conditions de baignade (avec immersion ou non de la tête par

les baigneurs).

Toutefois, l’ingestion d’eau apparaît comme le mode principal d’agression

et l’on suppose qu’un baigneur ingère de 75 à 100 ml d’eau lorsqu’il nage la tête

sous l’eau(95).

Prüss(96) a réalisé une synthèse bibliographique épidémiologique. Il ressort de

cette synthèse que la mauvaise qualité microbiologique des eaux de baignade est

souvent corrélée à l’apparition de pathologies plus ou moins graves chez

l’homme.

VII.3. Les microorganismes impliqués et les pathologies observées :

Les micro-organismes pathogènes les plus fréquemment rencontrés dans les

eaux douces et salées sont repris dans l’annexe 2, ainsi que les pathologies dont

ils sont responsables.

VII.3.1. Les bactéries :

Les bactéries pathogènes incluent des espèces d’origine fécale humaine ou

animale, qui appartiennent aux genres Shigella (S. sonnei et flexneri),

Salmonella, Campylobacter (C. jejuni et C. coli), Yersinia (Y. enterocolitica),

Escherichia (E. coli pathogènes) et Vibrio (V. cholerae)(52).

54

D’autres bactéries pathogènes comme les Legionellas (L. pneumophila) et

certaines espèces du genre Vibrio ne sont pas des bactéries d’origine entérique

mais des pathogènes dont l’habitat naturel est l’environnement et plus

particulièrement les systèmes aquatiques.

Les bactéries pathogènes opportunistes peuvent être d’origine fécale. Elles

appartiennent à une grande diversité de genres comme les genres Pseudomonas,

Aeromonas, Klebsiella, Flavobacterium, Enterobacter,Citrobacter, Serratia,

Acinetobacter, Proteus, Providencia et Mycobacterium, et Nocardia. Ces

pathogènes opportunistes affectent essentiellement des sujets sensibles comme

les enfants, les personnes âgées ou les immunodéprimés.

Les entérobactéries pathogènes induisent essentiellement des gastro-entérites qui

se déclarent dans les quarante-huit heures qui suivent la baignade(97).

Dermatites, infections des yeux et de la sphère ORL font aussi partie des risques

sanitaires liés à la présence de ces bactéries dans les eaux de baignade.

La fièvre typhoïde est causée par Salmonella typhi, maladie infectieuse aiguë et

contagieuse, elle est la première maladie pour laquelle une augmentation

d’occurrence a été observée chez les baigneurs(98). Les Salmonella paratyphi

A, B et C sont également à l'origine de fièvres entériques.

Staphylococcus aureus est à l’origine d’infections cutanées. Les enfants (moins

de 16 ans) sont les plus touchés par ces troubles de santé.

Leptospira interrogans responsable de la leptospirose, portée par certains

animaux infectés (rats, bétail, chiens,…), qui la rejettent dans leurs urines, est

présent dans les eaux douces et les berges boueuses. La leptospirose, maladie

d’origine animale, transmissible à l’homme, se transmet essentiellement par voie

indirecte, lors de baignades en eau douce. Les leptospires pénètrent dans

55

l'organisme par l'intermédiaire de plaies, de lésions cutanées ou par les

muqueuses. La contamination par voie digestive (absorption d'aliments souillés

par les urines d'animaux malades) est exceptionnelle.

VII.3.2. Les virus :

Les virus pathogènes d’origine fécale (virus de l’hépatite A, entérovirus,

rotavirus, calicivirus astrovirus, norovirus) sont souvent à l’origine de maladies

transmises par les eaux polluées.

Le virus de Norwalk et les virus Norwalk-like sont à l’orgine de gastro-entérites

ayant une période d’incubation de 15 à 48 heures, alors que celles engendrées

par des rotavirus se déclarent principalement au bout de 2 à 4 jours. Les

adénovirus peuvent, eux, induire des gastro-entérites ayant des périodes

d’incubation pouvant aller jusqu’à deux semaines(97).Virus Norwalk et

Norwalk-like sont principalement responsables d’épidémies de

gastro-entérites chez les adultes alors que les rotavirus et astrovirus sont à

l’origine d’épidémies chez les enfants.

Entérovirus et adénovirus sont aussi responsables de problèmes respiratoires.

Ces pathologies observées à la suite d’une baignade, ont été classées dans la

catégorie « Acute Febrile Respiratory Illness » .Fièvre, maux de tête et de

gorge, douleurs dans le corps, fatigue, anorexie et toux comptent parmi ces

troubles respiratoires.

VII.3.3. Les champignons :

Les champignons sont présents dans les eaux de mer. Penicillium spp.,

Aspergillus spp. et Alternaria spp sont les champignons filamenteux le plus

souvent retrouvés dans les eaux de baignade. Candida spp. est, quant à elle, la

56

levure la plus communément dosée dans les eaux de mer. Ces levures et

champignons sont à l’origine d’infections oculaires, respiratoires, de la sphère

ORL, de la peau et de dérangements gastriques.

7.3.4. Les protozoaires :

Des protozoaires tels que Giardia (sous forme kystique) et que les oocytes de

Crytosporidium survivent dans l’eau de mer. Les oocytes de Toxoplasma

gondii est, lui, infectieux s’il est sous forme sporulée. Ces formes sporulées ont

une durée de vie de quelques mois dans l’eau de mer.

Les pathologies induites par ces parasites sont principalement des gastro-

entérites. Les diarrhées parasitiques ont des périodes d’incubation variant entre

sept et dix jours(97).

7.3.5. Micro-algues et cyanobactéries :

De nombreuses espèces toxiques de dinoflagellés, de diatomées, de

nanoflagellés et de cyanobactéries (algues de couleur bleu-vert) présentes dans

le milieu marin provoquent des pathologies humaines. La toxicité de ces micros-

algues pour l’homme tient aux toxines qu’elles libèrent. Le principal danger

vient de ce qu’elles s’accumulent dans les fruits de mer et les poissons qui sont

ensuite consommés par l’homme, chez qui elles provoquent des intoxications.

La « dermatite du baigneur » (ou « des nageurs ») est un eczéma de contact

sévère qui se manifeste après immersion dans de l’eau de mer où se trouvent des

efflorescences de certaines espèces de cyanobactéries. Elle provoque des

démangeaisons et des brûlures dans les minutes ou dans les heures qui suivent la

baignade. Des composés toxiques comme l’aplysiatoxine, la

57

débromoaplysiatoxine et la lyngbyatoxine A ont été isolés dans les

cyanobactéries marines. Ils sont très inflammatoires et contribuent dans une

large mesure aux tumeurs de la peau(99).

Nodularia spumigena a été la première cyanobactérie reconnue comme mortelle

chez l’animal. Elle produit une hépatotoxine, la nodularine, qui provoque

d’importantes hémorragies du foie chez les mammifères et altère la structure de

cet organe.

L’inhalation d’embruns chargés de fragments de dinoflagellés ou de toxines

(brévétoxines) libérés dans l’écume par des micros-algues lysées peut être

dangereuse pour l’homme. Les signes et symptômes sont une irritation sévère de

la conjonctive et des muqueuses (en particulier celles du nez) suivie d’une toux

persistante, d’éternuements et de picotements des lèvres.

VII.4. Les risques liés aux contaminants chimiques :

Il arrive que des contaminants chimiques naturels ou anthropiques pénètrent

dans les eaux de surface ou se déposent sur les plages. L’exposition est un

facteur crucial à prendre en compte pour déterminer le risque d’intoxication par

les produits chimiques présents dans les eaux de baignade. Le type d’activités de

loisir pratiquées est donc important. L’exposition se fait par contact direct avec

la peau, les yeux et les muqueuses, par inhalation ou par ingestion(99).

La fréquence, l’ampleur et la probabilité de l’exposition sont des critères

déterminants pour évaluer le risque lié à un contaminant donné.

Par exemple, le chrome rejeté par les tanneries peut provoquer des irritations

importantes et peut engendrer des cancers de la peau.

58

Le mercure, contenu dans les détergents, peut donner des allergies et des

complications neurologiques quand il est avalé.

Plusieurs autres métaux lourds tels que l’argent, le cuivre, le plomb et le

cadmium peuvent avoir des conséquences très nuisibles.

59

VIII. LES EPIDEMIES LIEES AUX EAUX DE BAIGNADE :

VIII.1. E. coli O157 :H7 :

À l’échelle mondiale, la plupart des épidémies liées à l’ingestion d’eau

contaminée par des E. coli sont associées à des baignades dans des eaux de

surface naturelles (en rivière, lac, ou étang) ou dans des piscines ou des

pataugeoires(100, 101). Ces épidémies étaient dues à des souches E. coli

O157:H7 , mais aussi à des souches E. coli non-O157. La plupart du temps, ces

épidémies étaient associées à une forte contamination microbiologique des eaux

ou à un traitement (chloration) insuffisant des eaux de piscine et de

pataugeoire(102).

La première flambée d’E. coli 0157: H7 associée à l'eau de loisirs est survenue

à l'été 1991. L'épidémie a concerné 21 cas d’E. coli 0157: H7, tous associés à la

baignade dans le lac Bleu près de Portland, Oregon(103).

Quatre autres foyers d’E. coli 0157: H7 ont été épidémiologiquement liés à la

baignade dans les lacs d'eau douce (103). En août 1999, 36 patients ont élaboré

E. coli 0157: H7. La plupart avaient des antécédents de la natation dans le lac

Battle Ground, situé à Battle Ground Lake State Park dans le comité de Clark, à

Washington (28 nageurs et nageuses de 8 contacts, 35 selles-culture ont

confirmé, une sérologie confirmée).

Entre 1997 et 2000, la plupart des épidémies liées à l’ingestion accidentelle

d’eau de baignade survenues aux États-Unis étaient dues à des E. coli

pathogènes(102).

En 2001, quatre cas d’E. coli O157:H7 ont été déclarés à la Direction de santé

publique de Montréal-Centre. Il s’agissait de quatre jeunes garçons, âgés entre 3

et 7 ans. Suite aux enquêtes épidémiologiques, l’eau de baignade à une plage

60

publique de la région de Montréal pouvait être le facteur d’exposition commun à

tous les cas(104).

VIII.2. Autres :

La shigellose : en 1994, une épidémie de shigellose à Shigella sonnei de 59 cas

liée à des baignades dans un lac de l’Ain dans la région de RHÔNE-ALPES en

France s’est produite(105).

La schistosomiase : en 1996, 54 cas de dermatite cercarienne dues au

shistosoma sp. sont survenus dans la région du Québec, dont 52 cas élaborés lors

de baignade dans des lacs, et 2 cas produits lors de baignade dans une plage

publique(106).

La cryptosporidiose :

En 1988, 60 cas de cryptosporidiose furent rapportés dans le comté de Los

Angeles(USA). Tous les individus infectés étaient nageurs et leur seul lien

était l’utilisation d’une piscine contaminée par C.parvum(107).

Entre 1983 et 2005, 149 épidémies de cryptosporidiose se sont

enregistrées en Angleterre et Pays de Galles dont 43 sont dus au

contamination de piscines(108).

61

IX. LA SURVEILLANCE DE LA QUALITE DES EAUX DE

BAIGNADE AU MAROC :

IX.1. Organisation des contrôles :

La surveillance de la qualité des eaux de baignade est organisée conjointement

par le Ministère de l’Équipement et des Transports (MET) et le Secrétariat

d’État chargé de l’Eau et de l’Environnement (SEEE), selon les normes

marocaines et internationales (OMS et PNUE).

Sa mise en œuvre est réalisée par :

le Laboratoire National de L’Environnement relevant du Secrétariat

d’État chargé de l’Eau et de l’Environnement ;

le Laboratoire Public d’Essais et d’Études (LPEE) par l’intermédiaire de

l’unité mobile du Centre d’Études et de Recherche de l’Environnement et

de la Pollution (CEREP) pour le compte du Ministère de l’Équipement et

des Transports.

En 2010, 129 plages (35 au niveau de la Méditerranée et 94 au niveau de

l’Atlantique) réparties sur 23 wilayas et provinces ont fait l’objet de surveillance

de la qualité microbiologique(2).

Le nombre de plages objet du Programme national de surveillance évolue depuis

plusieurs années. Il est passé de 50 en 1999 à 129 plages en 2010 comme le

montre la figure 9.

62

Figure 9 : Evolution du nombre des plages au Maroc

IX.2. Les procédures d’exécution des programmes :

Les eaux de baignade des plages couvertes par le programme font l’objet de

contrôle entre les mois, mai et septembre, avec une campagne de référence au

mois de février. La fréquence des prélèvements est bimensuelle durant la saison

balnéaire.

Les sites de surveillance sont choisis en fonction de l’importance de leur

fréquentation, de la nature des lieux (Relief, forme du rivage…) et des risques

particuliers de pollution (rejet d’eaux usées…).

0

20

40

60

80

100

120

140

50

79 79 79 79 86

92 93

100

114

129

63

L’évaluation de la qualité des eaux porte sur la recherche des paramètres

microbiologiques [coliformes fécaux (Escherichia coli) et streptocoques fécaux

(entérocoques)] conformément à la norme nationale NM 03.7.200, aux normes

internationales et directives de l’OMS/PNUE, applicables à la surveillance

sanitaire des eaux de baignade.

L’évaluation des résultats relatifs à la qualité des eaux de baignade est basée sur

un traitement statistique des résultats issus des analyses microbiologiques. Cette

évaluation conduit à une classification de la qualité des eaux selon la grille de la

norme marocaine.

Cette grille de qualité dresse les fourchettes de valeurs limites (guides et

impératives) à prendre en considération (cf. tableau ci-dessous) :

Tableau V : les nombres guides et les nombres impératifs selon la norme

marocaine.

Paramètres microbiologiques Valeurs guides (VG) par

100 ml

valeurs impératives (VI) par

100 ml

Coliformes fécaux 100 2000

Streptocoques fécaux 100 400

64

Pour le classement des eaux de baignade, quatre catégories (ou classes) sont

distinguées, à savoir :

Catégorie A : Eaux de bonne qualité pour la baignade

Au moins 80 % des résultats en E.coli ou en coliformes fécaux sont

inférieurs ou égaux au nombre guide (100/100 ml).

Au moins 95 % des résultats en E.coli ou en coliformes fécaux sont

inférieurs ou égaux au nombre impératif (2000/100ml).

Au moins 90 % des résultats en streptocoques fécaux sont inférieurs ou

égaux au nombre guide (100/100ml).

Catégorie B : Eaux de qualité moyenne pour la baignade

L’eau est de qualité moyenne lorsque le nombre impératif fixé par la directive

pour les E.coli ou coliformes fécaux est respecté dans au moins 95 % des

prélèvements (2000/100 ml), les conditions relatives aux nombres guides n’étant

pas, en tout ou en partie vérifiées.

Les eaux classées en catégorie

7

Les eaux classées en catégorie A ou B sont conformes à la norme

65

Catégorie C : Eaux momentanément polluées

L’eau des points de surveillance pour lesquels la fréquence de dépassement du

nombre impératif pour E.coli ou coliformes fécaux est comprise entre 5 % et

33,3 % est considérée comme pouvant être momentanément polluée.

Cette pollution peut faire l’objet de mesures immédiates ou à moyen terme,

permettant d’améliorer définitivement la qualité de l’eau.

Il est important de noter que si moins de 20 prélèvements sont effectués pendant

toute la saison sur un point, un seul dépassement du nombre impératif en E.coli

ou coliformes fécaux, suffit pour entraîner le classement de la plage en

catégorie C.

Catégorie D : Eaux de mauvaise qualité

Lorsque, pour le paramètre E.coli ou coliformes fécaux, les conditions relatives

aux nombres impératifs sont dépassées au moins une fois sur trois, l’eau de

baignade concernée est considérée comme de mauvaise qualité. Toutes les zones

classées en catégorie D durant deux années de suite doivent être interdites à la

baignade, sauf si des améliorations significatives apparaissent.

Les eaux classées en catégorie C ou D ne sont pas conformes à la norme

66

IX.3. Qualité hygiénique des plages du Royaume : Saison 2009-2010

333 stations de prélèvements ont fait l’objet d’un nombre suffisant de

prélèvements pour le classement et ont permis de déclarer 322 stations (soit 96,7

%) de qualité microbiologique conforme aux exigences réglementaires pour la

baignade. La quasi-totalité des 11 stations (soit 3,3 %) déclarées non conformes

pour la baignade de la saison 2009-2010 subit l’influence des rejets d’eaux

usées ou connaît une forte concentration de baigneurs, conjuguées à

l’insuffisance des infrastructures d’hygiène(2).

Figure 10 : Qualité hygiénique des plages au Maroc 2009-2010

3,30%

96,50%

Non conformes C et D Conformes A et B

67

Figure11 : Evolution de la qualité hygiénique des plages au Maroc

0

10

20

30

40

50

60

70

80

Catégorie A

Catégorie B

Catégorie C

Catégorie D

68

INTRODUCTION

CONCLUSION

ET

RECOMMANDATIONS

69

Au terme de cette recherche, nous avons constaté que les sources de

pollution des eaux de baignade sont nombreuses, dont les rejets des eaux usées

(domestiques et industrielles) constituent la source la plus importante de la

pollution des eaux de mer dans le monde, surtout dans les pays en

développement.

L’influence de ces pollutions se manifeste au niveau de la qualité

microbiologique des eaux plus qu’au niveau de la qualité physicochimique.

Ainsi que l’altération de la qualité microbiologique des eaux de baignade peut

entrainer des risques non négligeables sur la santé humaine, ces risques se

représentent principalement sous forme de gastro-entérites, dermatites, et

infections des yeux et de la sphère O.R.L .

Pour l’évaluation de la qualité de ces eaux, on utilise des germes indicateurs qui

montrent l’existence d’une contamination par les matières fécales, dont E.coli

reste le meilleur indicateur d’une contamination récente de l’eau par le matériel

fécal, même que des études récentes proposent d’autres indicateurs comme les

coliphages.

L’évolution de la biologie moléculaire a permis d’apporter de nouvelles

méthodes de détection de germes indicateurs qui sont plus spécifiques et rapides,

mais ces méthodes sont chères.

La qualité des eaux de baignade et globalement l’hygiène des plages s’est

nettement améliorée au cours des cinq dernières années sur le littoral marocain,

70

certaines zones présentent encore une vulnérabilité due aux rejets directs et aux

apports telluriques en particulier en temps de pluies.

Une dynamique de refonte de la réglementation régissant la qualité des eaux de

baignade est actuellement en marche en Europe, le Maroc suit également et

progressivement cette dynamique.

Afin de hausser davantage le niveau de gestion de la qualité des eaux de

baignade et être proactif devant une éventuelle déviation de la qualité, il

convient de mettre en place ce qui suit :

• élaboration de profils de vulnérabilité des eaux de baignade (détermination des

divers flux, hiérarchisation selon le degré d’impact, voies de transfert, fréquence

d’apparition) ;

• maîtrise des risques sanitaires en cas de dysfonctionnement de systèmes

d’assainissement, fortes précipitations… en vue de prédire le rayon d’impact, sa

durée et son moment d’apparition ;

• activer la mise en place des stations d'épuration des eaux usées et des

dispositifs d'assainissement nécessaires et adéquats, aussi bien pour les rejets

solides que pour les rejets liquides, au niveau des villes côtières ;

• mettre en place et appliquer les dispositifs législatifs et réglementaires

nécessaires pour préserver le littoral, notamment par l'activation de la

promulgation de la loi sur la protection du littoral, les normes de rejets liquides,

etc. ;

• veiller au respect des dispositions des textes réglementaires régissant le littoral,

notamment celles relatives aux carrières et aux études d'impact sur

l'environnement ;

• créer une institution nationale chargée de l'aménagement des zones côtières ;

71

• doter les littoraux de schémas directeurs d'aménagement ; et les plages de plans

d'aménagements d'infrastructures de loisirs, d'hygiène et de sécurité ;

• renforcer le contrôle de l'exploitation illicite et anarchique du sable des dunes

côtières ;

• doter les ports en moyens de dépollution nécessaires ;

• renforcer les plages en moyens matériels et humains pour la sécurité, l'hygiène

et le nettoyage des plages ;

• poursuivre les actions de sensibilisation de la population sur la qualité et la

propreté des plages ;

• utiliser les différents moyens de communication pour informer la population

sur la qualité des plages ;

• améliorer le cadre d'investissement sur le littoral en procédant à la mise en

place des infrastructures de base et en améliorant la cadre de vie dans la zone

littorale.

Enfin, il faudrait arriver un jour à mettre en place un organisme autonome et

efficace doté de moyens technique, financier et institutionnel capables de faire

respecter la nature.

CONCLUSION

ET

RECOMMANDATIONS

RESUMES

CONCLUSION

ET

RECOMMANDATIONS

RESUMES

Résumé

Titre : LA QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES EAUX DE BAIGNADE

Auteur : EL ATTIFFI EL OUADRASSI ALI

Mots clés : Eaux de baignade, Pollution, Risques sanitaires

Les eaux de baignade constituent une part importante des loisirs actifs au

monde. La qualité hygiénique de ces eaux est d’une importance capitale.

Le risque sanitaire lié à la pollution des eaux de baignade est avant tous

microbiologique. La transmission des microorganismes peut se faire par

ingestion d’eau ou par contact direct avec la peau et les muqueuses.

Principalement amenés par les rejets des eaux usées, les bactéries et les

virus d’origine fécale sont les principaux microorganismes qui altèrent la qualité

sanitaire des eaux de baignade.

Le contrôle des eaux de baignade repose essentiellement sur la détection et

l’énumération de bactéries indicatrices de risque fécale (les coliformes

thérmotolérants, E. coli, entérocoques), et de certaines bactéries pathogènes

(salmonelles). Ce contrôle est réalisé selon des méthodes classiques

d’énumération après mise en culture sur milieu spécifique, et des méthodes

enzymatiques pour E. coli .Par ailleurs, les progrès récents de la biologie

moléculaire ont développé des techniques pour rechercher divers types de

bactéries et virus tel que les entérovirus.

Les eaux de baignade sont généralement classées en quatre catégories, dont

les catégories A et B sont conformes, et les catégories C et D ne sont pas

conformes à la norme.

Summary

Title: MICROBIOLOGICAL QUALITY OF BATHING WATER

Author: EL ATTIFFI OUADRASSI ALI

Keywords: Bathing Water, Pollution, Health Hazards

Bathing waters are an important part in active leisure in the world. The

hygienic quality of these waters is of paramount importance.

The health risk associated with pollution of bathing water is above all

microbiological. The transmission of microorganisms can be achieved by

ingestion of water or by direct contact with skin and mucous membranes.

Mainly brought about by discharges of sewage, bacteria and viruses of fecal

origin are the main microorganisms that affect the sanitary quality of bathing

water.

Monitoring of bathing water is mainly based on the detection and enumeration

of fecal indicator bacteria risk (thermotolerant coliforms, E. coli, enterococci),

and certain pathogenic bacteria (Salmonella). This control is performed

according to standard methods of enumeration after culturing in specific

medium, and enzymatic methods for E. coli. In addition, recent advances in

molecular biology have developed techniques to search for various types of

bacteria and viruses such as enteroviruses.

Bathing waters are usually classified into four categories, including

Category A and B are consistent, and categories C and D are not compliant.

ملخص

انسببحت بهن انكشوبونوجت: انجودة العىوان

عه انودساس انعطف: الكاحب

انخبطش انصحت,: يبه انسببحت، انخهود الكلماث الزئيسيت

األنشطت ف انعبنى. نوعت هزه انبه يبه االسخحبو حشكم جضءا هبيب ف أولبث انفشاغ و

أهت لصوى.حشكم انصحت

يكشوبونوجت. وكن ححمك ه لبم كم شء يبه انسببحت انخبطش انصحت انشحبطت بخهود

انكشوببث عن طشك انفى ين انبء أو عن طشك االحصبل انببشش يع انجهذ واألغشت انخمبل

انخبطت.

انبكخشب وانفشوسبث ين اصم بشاص ، جهبج أسبسب ين لبم عن حصشف يبه انصشف انصح

.انسببحت ه انكبئنبث انذلمت انشئست انخ حؤرش عهي نوعت يبه

)انمونونبث يؤششةانسببحت عهي انكشف وحعذاد بكخشب انبشاص وحسخنذ أسبسب يشالبت يبه

انخحهت نهحشاسة، كوال، انعوت( ، وانبكخشب انسببت نأليشاض )انسبنونال(. خى حنفز هزه

.نهمونونت األنضتانعذ بعذ صسع ف وسط يعن ، وانطشق و انكالسكتانشلببت وفمب نهطشق

حمنبث يخمذيت نهبحذ عن يخخهف وضعج انحذزت ف يجبل انبونوجب انجضئت انخطوساث ,إضبفت

أنواع انبكخشب وانفشوسبث يزم انفشوسبث انعوت.

Dو Cيخنبسمت ، وفئبث Bو Aوعبدة يب حصنف يبه انسببحت ف أسبع فئبث، بب ف رنك انفئت

نسج يخوافمت.

ANNEXES

Annexe 1(16) : Liste de quelques pathogènes des eaux usées et leurs symptômes Bactéries

Enterococcus faecalis la résistance à presque tous les antibiotiques

Gastro-entérites, autres infections

Salmonella Typhoïde, gastro-entérites et septicémie

Shigella Diarrhées

Enterobacter Cystites, pleurésies, méningites

Yersinia enterocolitica Diarrhée

Legionella Pneumonie, autres maladies respiratoires

Escherichia Coli Diarrhée

(certaines souches)

Campylobacter jejuni Gastro-entérites , diarrhées (l’infection entérique

bactérienne la plus répandue en Amérique du Nord)

Staphylococcus Affections cutanées et sous cutanées

Pseudomonas aeruginosa Infections ORL, septicémies

Virus

Entérovirus :

-Coxsackievirus A et B Méningite, conjonctivite, péricardite, myocardite,

diarrhée, encéphalite

-Echovirus Méningite, conjonctivite, péricardite, myocardite,

diarrhée, encéphalite

-Poliovirus Paralysie, méningite, fièvres

Virus de Norwalk violente gastro-entérite qui dure de 24 à 48

heures

Virus de l’hépatite A hépatite A

Virus de l’hépatite E Hépatite E

Rotavirus Gastro-entérites

Reovirus Maladie respiratoire, entérite

Caicivirus Diarrhée

Coronavirus Gastro-entérites

Adénovirus Infections respiratoires, infections conjonctivales

Protozoaires

Giardia lamblia Douleurs abdominales, diarrhée (la giardiase est maintenant

l’infection humaine entérique non bactérienne ayant la plus forte

incidence)

Cryptosporidium parvum Diarrhées accompagnées de douleurs abdominales, de vomissement et de

fièvre

Toxoplasma Toxoplasmose

Microsporidium Diarrhée

Helminthes

Taenia Diarrhée, douleur musculaire

Ascaris Troubles digestifs

Annexe 2 : Principaux groupes et genres d’agents pathogènes responsables de maladies d’origine hydrique(17).

Groupes de micro-organismes Pathogènes Pathologies

Entérovirus (polio, écho, coxsackie

Méningite, paralysie, fièvres, myocardie,

problèmes respiratoires et diarrhée Hépatite A et E Infections hépatiques Norovirus Diarrhée / gastro-entérite Sapporovirus Diarrhée / gastro-entérite Virus

Rotavirus Diarrhée / gastro-entérite

Astrovirus Diarrhée

Adenovirus Diarrhée, infections oculaires et problèmes respiratoires Reovirus Problèmes respiratoires et entériques Salmonella Fièvre typhoïde et diarrhée Shigelia Diarrhée

Campylobacter Diarrhée (cause première des

intoxications alimentaires) Yersinia enterolitica Diarrhée Bactéries Escherichia coli O157 :H7 et certaines Diarrhée risque de complications autres souches (urémie hémolytique) chez les enfants Legionella pneumophila Pneumonie et autres infections Respiratoires

Naegleria

Méningo-encéphalite

Entomoeba histolytica Dysenterie amibienne

Giardia lamblia Diarrhée chronique

Protozoaires Cryptosporidium parvum Diarrhée sévère, mortelle chez les

individus immunodéprimés

Cyclospora

Diarrhée

Microsporidies incluant Entercytozoan spp., Encephalitozoan spp., Septata spp., Pleistophora spp., Nosema spp

Diarrhées chroniques, affaiblissement, problèmes pulmonaires, oculaires, musculaires et rénaux

Cyanobact éries

Diarrhée par ingestion des toxines

Microcystis produites par ces organismes (la toxine

microcystine est impliquée dans des

Anabaena Pathologies neurologiques liées à l’ingestion de neurotoxines

Aphanizomenon Pathologies neurologiques liées à l’ingestion de neurotoxines

Phytoplancton toxique Dinophysis Intoxications diarrhéiques

Alexandrium Pathologies neurologiques liées à l’ingestion de neurotoxines

Helminthes Ascaris lumbricoides Ascariasis

INTRODUCTION

CONCLUSION

ET

RECOMMANDATIONS

BIBLIOGRAPHIE

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l’Environnement du Maroc. Milieux Humains Chapitre IV. Accessible à

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SSeerrmmeenntt ddee GGaalliieenn

JJee jjuurree eenn pprréésseennccee ddeess mmaaîîttrreess ddee cceettttee ffaaccuullttéé ::

-- DD’’hhoonnoorreerr cceeuuxx qquuii mm’’oonntt iinnssttrruuiitt ddaannss lleess pprréécceepptteess ddee mmoonn aarrtt eett ddee lleeuurr ttéémmooiiggnneerr mmaa rreeccoonnnnaaiissssee eenn rreessttaanntt ffiiddèèllee àà lleeuurr rreennsseeiiggnneemmeenntt..

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أن أراقب هللا ف مهنتأن أراقب هللا ف مهنت --

أن أبجل أساتذت الذن تعلمت على أدهم مبادئ مهنت وأعترف لهم أن أبجل أساتذت الذن تعلمت على أدهم مبادئ مهنت وأعترف لهم --

لتعالمهم.لتعالمهم.بالجمل وأبقى دوما وفا بالجمل وأبقى دوما وفا

أن أزاول مهنت بوازع من ضمري لما فه صالح الصحة العمومة، وأن أن أزاول مهنت بوازع من ضمري لما فه صالح الصحة العمومة، وأن --

ال أقصر أبدا ف مسؤولت وواجبات تجاه المرض وكرامته اإلنسانة.ال أقصر أبدا ف مسؤولت وواجبات تجاه المرض وكرامته اإلنسانة.

أن ألتزم أثناء ممارست للصدلة بالقوانن المعمول بها وبأدب السلوك أن ألتزم أثناء ممارست للصدلة بالقوانن المعمول بها وبأدب السلوك --

والشرف، وكذا باالستقامة والترفع.والشرف، وكذا باالستقامة والترفع.

األسرار الت قد تعهد إلى أو الت قد أطلع علها أثناء القام األسرار الت قد تعهد إلى أو الت قد أطلع علها أثناء القام أن ال أفش أن ال أفش --

بمهام، وأن ال أوافق على استعمال معلومات إلفساد األخالق أو تشجع بمهام، وأن ال أوافق على استعمال معلومات إلفساد األخالق أو تشجع

األعمال اإلجرامة.األعمال اإلجرامة.

ألحضى بتقدر الناس إن أنا تقدت بعهودي، أو أحتقر من طرف زمالئ ألحضى بتقدر الناس إن أنا تقدت بعهودي، أو أحتقر من طرف زمالئ --

إن أنا لم أف بالتزامات.إن أنا لم أف بالتزامات.

""شهدشهد "وهللا على ما أقول"وهللا على ما أقول

جامعة محمد الخامس كلية الطب والصيدلة بالرباط

100أطروحة رقم : 2011سىـت 4

الجودة الميكروبيولوجية لمياه السباحة

أطزوحت

قذمج وووقشج عالويت يوم 4........................

مه طزف

السيد: العطيفي الودراسي علي

بالقصز الكبيز. 22/00/1321المشداد في

لـنـيـل شـهـادة الـدكـتـوراه فــي الصيدلة .الصحيةالمخاطر –التلوث –مياه السباحة : الكلماث األساسيت

المكووت مه األساحذةححج إشزاف اللجىت

رئيس أحمذ كاوسي 4 السيذ أسخبر ف طب األطفبل مشزف ميمون سهذي السيذ 4 أسخبر ف عهى األحبء انذلمت 4 سكيىت الحمشاوي السيذة

أسخبرة ف عهى األحبء انذلمت سارة عوفي 4ة السيذ

أسخبرة يبشصة ف عهى انطفهبث

BIBLIOGRAPHIE

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