M2R deChloé MONESTIER

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Nicolas Morellet / Michel Goulard

Département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux AquatiquesLaboratoire Comportement et Ecologie de la Faune Sauvage / INRA Toulouse

Département Mathématiques et Informatique AppliquéesUMR 1201 DYNAFOR / INRA Toulouse

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Etudes de sélection des ressources avec hypothèse : ressources ou conditions favorables => fitness (Levins 1968)

Les processus qui gouvernent la mobilité et la sélection de l’habitat sont multifactoriels (Morrison et al. 2006) :

Qualité et quantité des ressources alimentaires Abris Densité de population Densité de compétiteurs Perturbation humaines Prédateurs…

Modifications du paysage notamment agricoles : fragmentation / destruction des habitats variation de disponibilité des ressources et des habitats

Dans ce contexte importance d’étudier comment les espèces s’adaptent à cet environnement changeant

Cas du chevreuil (forte abondance et forte plasticité comportementale)

Chevreuil (Capreolus capreolus) → Espèce d’ongulé la plus répandue en France → Vit dans un paysage fragmenté et anthropique

Objectif Estimer la sélection de l’habitat du chevreuil en

termes de fréquences d’occupation des habitats

Estimer les transitions entre habitats

→ Rôle du chevreuil dans les transferts (tiques, graines, nutriments…)

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Copyright IGN 2000 0 5 km

Localisation : Canton d’Aurignac (N 43°13’, E 0°52’)

Superficie : 11 000 ha

Inclus dans la plateforme LTSER (Long-Term Socio-Ecological Research) des Coteaux de Gascogne

Habitat fragmenté : Massifs forestiers rares (<15%) Prairies et cultures Bosquets Milieu agricole hétérogène

→ Site d’étude représentatif des paysages agricoles modernes

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Données GPS De 2005 à 2011

Suivis intensifs : 1 loc/10 min pendant 24 heures 12 à 17 jours de suivis par

an

94 individus

5

6

• Réalisation du parcellaire (occupation du sol) : parcelles agricoles, routes, haies, bâtis…• Relevés annuels des cultures• Renseignement du SIG

Utilisation d’habitats Mouvement Sélection d’habitats

occupation d’un habitat par l’individu

occupation conditionnéepar le disponible

capacités de déplacementsdes individus

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Variable dépendante :

→ habitat au temps t

Variables explicatives : « Périodes » de la journée

(4 modalités)

« Saisons » (5 modalités)

« Habitat à t-1 »(4 modalités)

« Identité de l’individu »

aube jour crépuscule

nuit

MA MJ JA SO ND

bois prairies

cultures

haies

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Bois

Prairies

Cultures

Haies

→ Modèle de mouvement (données observées) → Equations différentielles stochastiques (EDS)

Cette formulation permet • de passer par des vitesses intégrées• un apprentissage statistique par des modèles additifs

Brillinger et al. (2001), Preisler et al. (2004)

Dérive =Partie déterministe

Diffusion = Partie stochastique

Accroissementsen x et en y

Processus brownien

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)(),(),()( t dBttRD dtttRtdR

Détermination du disponible Modélisation du mouvement par individu Estimation du disponible à t sachant la localisation à t-1 (EDS) 100 simulations/localisation observée Pestiméetraj = proba associée à chaque habitat (bois/haie/prairie/culture)

en chaque point de la trajectoire

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Pestiméetraj

Utilisation d’habitats Mouvement Sélection d’habitats

Modèles Régressions logistiques

multinomiales

ModèlesEquations différentielles

stochastiques

Modèles Régressions logistiques

multinomiales avec offset

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Modèle K AICcDelta AICc

AICc Wt

Habitat(t-1)*périodes+périodes*saisons+identité individus153

28117.70

0.00 1

Périodes*saisons+habitat(t-1)+identité individus126

28130.58

12.88 0

Habitat(t-1)*périodes+saisons+identité individus117

28136.01

18.31 0

Habitat(t-1)*périodes+habitat(t-1)*saisons+périodes*saisons+identité individus

18928138.1

620.46 0

Habitat(t-1)*saisons+périodes*saisons+identité individus162

28149.92

32.22 0

Habitat(t-1)+périodes+saisons+identité individus90

28151.17

33.47 0

Habitat(t-1)*périodes+habitat(t-1)*saisons+identité individus153

28152.90

35.20 0

Habitat(t-1)+périodes+identité individus78

28272.72

155.02 0

Habitat(t-1)+saisons+identité individus81

28583.98

466.28 0

Périodes+saisons+identité individus81

32051.30

3933.60 0

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Modèle K AICcDelta AICc

AICc Wt

Habitat(t-1)*périodes+périodes*saisons+identité individus153

28117.70

0.00 1

Périodes*saisons+habitat(t-1)+identité individus126

28130.58

12.88 0

Habitat(t-1)*périodes+saisons+identité individus117

28136.01

18.31 0

Habitat(t-1)*périodes+habitat(t-1)*saisons+périodes*saisons+identité individus

18928138.1

620.46 0

Habitat(t-1)*saisons+périodes*saisons+identité individus162

28149.92

32.22 0

Habitat(t-1)+périodes+saisons+identité individus90

28151.17

33.47 0

Habitat(t-1)*périodes+habitat(t-1)*saisons+identité individus153

28152.90

35.20 0

Habitat(t-1)+périodes+identité individus78

28272.72

155.02 0

Habitat(t-1)+saisons+identité individus81

28583.98

466.28 0

Périodes+saisons+identité individus81

32051.30

3933.60 0

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Effet de l’habitat au temps t-1 et des périodes sur la sélection d’habitats

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Probabilité d’être dans le bois à t

Périodes de la journée

Probabilité d’être dans le bois à t

Effet de l’habitat au temps t-1 et des périodes sur la sélection d’habitats

Périodes de la journée

• Transitions bois-bois > 55%

15

Effet de l’habitat au temps t-1 et des périodes sur la sélection d’habitats

• Transitions bois-bois > 55%

• + de transitions le jour

• Pas de transitions du milieu ouvert vers le bois la nuit

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Probabilité d’être dans le bois à t

Périodes de la journée

Effet de l’habitat au temps t-1 et des périodes sur la sélection d’habitats

• Transitions prairie-prairie > 60%

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Probabilité d’être dans la prairie à t

Périodes de la journée

Effet de l’habitat au temps t-1 et des périodes sur la sélection d’habitats

• Transitions prairie-prairie > 60%

• + de transitions la nuit

• - de transitions le jour

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Probabilité d’être dans la prairie à t

Périodes de la journée

Effet des périodes et des saisons sur la probabilité d’être dans le bois

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Probabilité d’être dans le bois à t

Périodes de la journée

Effet des périodes et des saisons sur la probabilité d’être dans le bois

• + occupé le jour

• Peu occupé la nuit

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Probabilité d’être dans le bois à t

Périodes de la journée

Effet des périodes et des saisons sur la probabilité d’être dans le bois

• + occupé le jour

• Peu occupé la nuit

• Préférentiellement occupée

en MA, SO et surtout en ND

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Probabilité d’être dans le bois à t

Périodes de la journée

Effet des périodes et des saisons sur la probabilité d’être dans la prairie

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Probabilité d’être dans la prairie à t

Périodes de la journée

Effet des périodes et des saisons sur la probabilité d’être dans la prairie

• Occupation maximale la nuit

• Occupation minimale le jour

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Probabilité d’être dans la prairie à t

Périodes de la journée

Effet des périodes et des saisons sur la probabilité d’être dans la prairie

• Occupation maximale la nuit

• Occupation minimale le jour

• Préférentiellement occupée en

MA et MJ

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Probabilité d’être dans la prairie à t

Périodes de la journée

Opposition bois/milieux ouvert pendant la journée

→ couvert de protection

→ moins de perturbations anthropiques

→ pics d’activité aux levers et couchers du soleil

Prairie plus fréquentée au printemps → alimentation (jeunes pousses)

→ mise bas des chevrettes

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Approche méthodologique novatrice:

‘‘sélection d’habitat conditionnée par les capacités de déplacement de l’individu’’

Mouvements et sélection d’habitats influencés par les saisons et périodes de la journée

Influence des mouvements du chevreuil sur les transferts de tiques, graines, nutriments dans le paysage

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