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1 Microbiologie Prévisionnelle : un outil opérationnel, Sym’Previus Anthony PINON Institut Pasteur de Lille Olivier COUVERT ADRIA Développement Maîtrise des dangers microbiologiques Bonne connaissance des flores microbiennes et de leurs évolutions dans les produits Procédures expérimentales Délais, coûts Simulation du comportement : Microbiologie prévisionnelle Orienter et Optimiser l’approche expérimentale Actions a priori, études à long terme : acquisition de connaissances sur le comportement des microorganismes

Microbiologie Prévisionnelle : un outil opérationnel, Sym ... · connaissances sur le comportement des microorganismes. 2 Historique Premiers travaux Maîtriser la stérilisation

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Microbiologie Prévisionnelle : un outil opérationnel,

Sym’Previus

Anthony PINON

Institut Pasteur de Lille

Olivier COUVERT

ADRIA Développement

Maîtrise des dangers microbiologiques

� Bonne connaissance des flores microbiennes et de leurs évolutions dans les produits

� Procédures expérimentales� Délais, coûts

� Simulation du comportement : Microbiologie prévisionnelle� Orienter et Optimiser l’approche expérimentale

� Actions a priori, études à long terme : acquisition de connaissances sur le comportement des microorganismes

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Historique

� Premiers travaux� Maîtriser la stérilisation des aliments par la chaleur

� Bigelow� Cinétiques de destruction thermique de spores

� Notions de D et z

� Transposition de barèmes thermiques

Caractérisation d’une courbe de destruction

1 log

D

Log N0

Temps

Log

N

0 5 10 15 20

12

34

56

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3

0

1

2

3

4

5

6

0 20 40 60 80 100 120

95°C

98°C

100°C

Influence de la température

Effet de la température sur D

Temps (mn)

Log N

0

0.5

1.00

1.5

2.0

2.5

3.0

3.5

4.0

94 96 98 100 102 104

Température (°C)

Log

D

Effet de la température sur D : modèle secondaire

1 log

Z

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Historique

� Au début des années 80� Nécessité de décrypter les règles de comportement de

microorganismes (décroissance, croissance)

� Données existantes : diversité des approches méthodologiques utilisées

� Analyse systématique des cinétiques observées pour différentes conditions écologiques

Caractérisation d’une courbe de croissance

temps (h)

Ln (N

)

Ln(N0)

Ln(Nmax)

µµµµmax

λλλλ

Données detest de croissance

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Influence de l’environnement

Effet de la température sur λ et sur µmax

0 50 100 150 200 250

Temps

Population

8°C

11°C

25°C

0.0

0.5

1.0

1.5

2.0

2.5

3.0

0 10 20 30 40 50

Température (°C)

µm

ax (h

-1)

?

Modèle secondaire

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6

0.0

0.5

1.0

1.5

2.0

2.5

3.0

0 10 20 30 40 50

Température (°C)

µm

ax (

h-1

)

Modèle secondaire

Tmin Topt Tmax

µopt

0.0

0.5

1.0

1.5

2.0

2.5

3.0

0 10 20 30 40 50

Température (°C)

µm

ax (

h-1

)

Utilisation du modèle secondaire

0,57

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7

0

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

0 10 20 30 40 50 60

Temps (h)

Log

N

µmax = 0.57 h-1

Equivalence : Tg = 1h13

� Simulation de la croissance à 20°C

Utilisation du modèle secondaire

Modèle secondaire cardinal

µmax = µopt . γ(T) . γ(pH) . γ(aw) …

Paramètres propres au microorganisme

To pH aw acid

Tmin ToptTmax pHmin pHopt pHmax awmin awopt awmax alpha MIC

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Modèle secondaire cardinal

µmax = µopt . γ(T) . γ(pH) . γ(aw) …

Paramètres propres au microorganisme

Paramètre lié au couple microorganisme - aliment

2 aliments avec des T°, pH, aw, conservateurs identiques ne vont pas induire une même croissance microbienne.

µµopt opt 11 µµopt opt 22

Modèle secondaire cardinal

µmax = µopt . γ(T) . γ(pH) . γ(aw) …

Paramètres propres au microorganisme

Paramètre lié au couple microorganisme - aliment

Connaissance des paramètres :

� Possibilité de simuler dans de nouvelles conditions

� Nouvel aliment = nouveau µopt : test de croissance

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Expertise

asso

ciée

Logicie

l commercia

l

Applica

tion

sur alim

ent

Destru

ction

thermique

Décro

issance

Croissa

nce

ApplicationsCentres support

Logiciels

xxxxxx

Simulations avec prise en compte de l’aliment

GIS Sym’Previus

Sym’Previus

xx

Logiciel spécifique des produits de la mer,Simulation de croissance de microorganismes pathogènes et d’altération

DIFRESSeafood Spoilageand SafetyPredictor

xxxx

Simulation sur milieu de culture,

Prise en compte de l’aliment via l’expertise de l’IFR

IFRComBase Predictor

xxx

Simulation sur milieu de culture,Pas de prise en compte de l’aliment

USDAPMP

xxxx

1er logiciel commercialisé, puis abandonné,Simulation sur milieu de culture,Pas de prise en compte de l’aliment

MAFF(Agricult. Minist. UK)

Food MicroModel

SymSym’’PreviusPrevius

SystSystèème de prme de préévision du comportementvision du comportementdes microdes micro--organismes dans les alimentsorganismes dans les aliments

Domaines étudiés :

. Croissance bactérienne (cinétique & interface)

. Destruction thermique (pasteurisation / stérilisation)

. Décroissance

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Les partenaires du projetLes partenaires du projet

- Centres recherche publics. INRA, ENV Alfort

- Centres ACTIA. Actilait, ADRIA Développement, ADRIA Normandie,Aérial, Ifip institut du porc, Institut Pasteur de Lille

- Industriels. Bel, Bongrain, Danone, Pernod Ricard

- Pouvoirs publics

. Ministère de la Recherche & DGAL

. Région Bretagne

- AFSSA

ObjectifsObjectifs

Créer un logiciel de Microbiologie Prévisionnelle

- Opérationnel et accessible aux industriels

- Permettant l’exploitation des données industrielles(autocontrôles, tests de croissance, données bibliographiques…)

dans le but de donner une réponse personnalisée, proche de l’aliment et du site de production

- Aide à la décision . Estimation des durées de vie. Optimisation des procédés. Développement de nouveaux produits (accélérer l’innovation). Assurer la sécurité sanitaire. Argumenter les plans HACCP

(identifier les CCP, fixer des limites critiques)

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Base de données- données bibliographiques- données industrielles- résultats de projets de recherche

Logiciel de destruction thermique- Ajustement- Simulation- Calcul de VP / VS- Paramètres de Ball (fh, jh)

Logiciel de simulation de croissance - Ajustement- Simulation

Interfaces Croissance / Non croissance

Les outils Sym’Previus :

Tools package

Base de données- données bibliographiques- données industrielles- résultats de projets de recherche

Logiciel de destruction thermique- Ajustement- Simulation- Calcul de VP / VS- Paramètres de Ball (fh, jh)

Les outils Sym’Previus :

Logiciel de simulation de croissance- Ajustement- Simulation

Interfaces Croissance / Non croissance

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Base de données- données bibliographiques- données industrielles- résultats de projets de recherche

Logiciel de destruction thermique- Ajustement- Simulation- Calcul de VP / VS- Paramètres de Ball (fh, jh)

Logiciel de simulation de croissance- Ajustement- Simulation

Interfaces Croissance / Non croissance

Les outils Sym’Previus :

6 espèces disponibles :

- 3 Bacillus cereus- 1 Clostridium perfringens- 4 Escherichia coli- 2 Listeria monocytogenes- 1 Salmonella Typhimurium- 1 Staphylococcus aureus

- N’importe quelle souche pour lesquelles les paramètres de thermorésistance sont connus.

Base de données- données bibliographiques- données industrielles- résultats de projets de recherche

Logiciel de destruction thermique- Ajustement- Simulation- Calcul de VP / VS- Paramètres de Ball (fh, jh)

Logiciel de simulation de croissance- Ajustement- Simulation

Interfaces Croissance / Non croissance

Les outils Sym’Previus : Nombre de réductions décimales

22% 78%

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Base de données- données bibliographiques- données industrielles- résultats de projets de recherche

Logiciel de destruction thermique- Ajustement- Simulation- Calcul de VP / VS- Paramètres de Ball (fh, jh)

Logiciel de simulation de croissance- Ajustement- Simulation

Interfaces Croissance / Non croissance

Les outils Sym’Previus :

Base de données- données bibliographiques- données industrielles- résultats de projets de recherche

Logiciel de destruction thermique- Ajustement- Simulation- Calcul de VP / VS- Paramètres de Ball (fh, jh)

Logiciel de simulation de croissance- Ajustement- Simulation

Interfaces Croissance / Non croissance

Les outils Sym’Previus :

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Base de données- données bibliographiques- données industrielles- résultats de projets de recherche

Logiciel de destruction thermique- Ajustement- Simulation- Calcul de VP / VS- Paramètres de Ball (fh, jh)

Logiciel de simulation de croissance- Ajustement- Simulation

Interfaces Croissance / Non croissance

Les outils Sym’Previus :

- Principaux micro-organismes pathogènes d’intérêt en agro-alimentaire :

. 12 souches de Listeria monocytogenes,

. 5 souches de Salmonella,

. 10 souches de Escherichia coli,

. 9 souches de Bacillus cereus

. 7 souches de Staphylococcus aureus

� plusieurs souches par espèces bactériennes,permettent de prendre en compte la variabilité biologique

Microorganismes disponibles dans le logiciel de simulation

- Micro-organismes d’altération :

. Bactéries lactiques : Enterococcus, Lactobacillus, Lactococcus, Leuconostoc spp

. Coliformes : Serratia, Citrobacter, Enterobacter

. Bacillus licheniformis

. Pseudomonas putida et P. fluorescens,

. Shewanella

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Évaluer le comportement d’un microorganisme dans un aliment, sous l’effet de différents facteurs :

� le pH

� l’activité de l’eau (aw)

� Les acides organiques

� la température

- en conditions de conservation statiques

- en conditions de conservation dynamiques (rupture de la chaîne du froid, affinage d’un produit…)

� Temps de réaction réduits

Aide à la décision en cas de lots détectés positifs

HACCP et quantification des dangers

� Aide à la détermination des points sensibles au cours d’un procédé

� Mesurer l’impact d’une rupture de chaîne du froid :- Camion frigorifique défectueux- Mode de consommation

Qualification des procédés

� Quantification et optimisation des traitements thermiques

Intérêts de Sym’Previus

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Aide à la détermination de la DLC

� Comment conserver en tenant compte de l’aspect nutrition- réduction des taux de sucres et de sels des aliments- quelles conséquences sur le développement bactérien ?

Aide à la formulation

� Maîtriser le développement bactérien par les « bons » inhibiteurs

� Tester différents scénarii de conservation

� Développer des produits encore plus sûrs- à partir de quelle acidité ou taux de sucre / sel,tel pathogène sera totalement inhibé

Intérêts de Sym’Previus

Travail permanent sur la base de données

- Veille bibliographique- Ajout de nouvelles espèces bactériennes

Développement continu de la microbiologie prévisionnelle

- Acquisition de nouveaux modèles et nouveaux paramètres

Extension des prévisions

- Milieux de non croissance ou de destruction athermique- Approche probabiliste de l’estimation de l’exposition du consommateur aux dangers microbiologiques

Un outil évolutif

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Module d’interrogation

Base de données

Utilisateur abonné

Module de simulation

Internet

Outil Sym’Previus

Centres d’expertise

@

Accès à Sym’Previuswww.symprevius.org