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Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

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INFORMATION

Annuaire disponible en version électronique sur www.canceropole-clara.com/ressources

Si vous souhaitez voir figurer votre plateforme dans l’annuaire en ligne, merci de nous contacter à [email protected]

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4 ANIPATH - Centre d’Histopathologie du Petit Animal de laboratoire

6 ANIPATH Clermont - Plateforme d'anatomo-pathologie du petit animal

8 CERMEP-imagerie du vivant - Centre d'Etude et de Recherche Multimodal et Pluridisciplinaire en imagerie du vivant

10 CICS - Centre Imagerie Cellulaire Santé

12 CIQLE - Centre d'Imagerie Quantitative Lyon-Est

14 Clinatec - Une plateforme technologique translationnelle multidisciplinaire

16 EMPLAT - Plateforme de Microscopie Electronique

18 GAIA - Plateforme d'imagerie nucléaire

20 IRMaGe - Plateforme spécialisée en IRM et neurophysiologie

22 M4D - Imagerie Cellulaire

24 MEC - Plateforme de Microscopie électronique de la Cellule

26 MiBiop - Microscopie pour la Biophysique

28 MicroCell - Microscopie Photonique - Imagerie Cellulaire

30 NanOpTec - Centre de Nano-Opto-Technologies

32 OPTIMAL - Plateforme d'imagerie optique du petit animal

34 PAVIRMA - Plateforme d'irradiation en Auvergne

36 PIM Lyon Tech - Plateforme d'Imagerie Multimodale Lyon Tech

38 Radiograaff - Radiobiologie au Van de Graaff

40 X-Ray CERVO Lyon-Sud - Plateforme d'irradiation par rayons X

42 Imagerie intégrée multimodalité

Imagerie

tissulaire

Imagerie

cellulaire

Imagerie

in-vivo

Irradiation

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ANIPATH

Centre d’Histopathologie du Petit Animal de laboratoire

DOMAINE D’EXPERTISE

Imagerie cellulaire et tissulaire dédiée à l’étude des modèles animaux, histologie

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Jean-Yves SCOAZEC Contact : [email protected]

Faculté de Médecine Lyon-Est (site Laennec), 7 Rue G. Paradin, 69372, Lyon cedex 08

@ http://sfrsantelyonest.univ-lyon1.fr/liens/anipath.html

Appartenance : European Mouse Pathology Workgroup

Equipex PHENOCAN

Effectif : 3

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

ANIPATH, née de la volonté commune de Rhône Alpes Genopole et de l'Université Claude Bernard Lyon 1, est aujourd’hui gérée par l’Université Claude Bernard Lyon 1. La plate-forme s’est initialement orientée vers le phénotypage et l’étude des animaux transgéniques, avant de diversifier progressivement son activité à une très large gamme de modèles animaux.

THEMATIQUE

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EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

La plate-forme fonctionne selon des standards de qualité professionnels et garantit la traçabilité des échantillons. Elle dispose d’équipements lui permettant de traiter des prélèvements cellulaires ou tissulaires, fixés ou congelés (microtome, cryostat, automate d’IHC). Elle est équipée d'outils d'imagerie tissulaire performants, incluant des microscopes conventionnels, un microscope à fluorescence, des systèmes de numérisation d’images et d'analyse morphométrique. Elle peut réaliser à façon des puces tissulaires (TMA), technique récente d’analyse à haut débit d’échantillons tissulaires.

PRESTATIONS PROPOSEES

Anipath est dotée d’un plateau technique et d’un personnel qualifié qui lui permettent de proposer des prestations diversifiées et complémentaires :

- la réalisation de l’ensemble des techniques d’imagerie tissulaire appliquées à l’animal : histologie, histochimie, immunohistochimie, hybridation in situ

- l’interprétation des résultats, en partenariat avec l'utilisateur, grâce au concours d'un réseau d'experts dans les différentes disciplines morphologiques

- le conseil technique aux utilisateurs et l’aide à la réalisation de protocoles d’étude adaptés aux objectifs des chercheurs

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ANIPATH Clermont

Plateforme d'anatomo-pathologie du petit animal

DOMAINE D’EXPERTISE

Analyses anatomo-pathologiques, histologie, immunohistochimie et imagerie fond clair, fluorescence

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Pierre VAL Contact : [email protected]

Campus des Cézeaux, 24 avenue des Landais, 63171, Aubière

@ https://www.gred-clermont.fr/directory/platform/en/anipath

Appartenance : CNRS/INSERM/Université Blaise Pascal

Effectif : 1 AI

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Le plateau technique permet de réaliser le traitement d'échantillons (inclusion paraffine/OCT), les coupes (paraffine/OCT), les colorations histologiques, l'immunohistochimie et l'hybridation in situ sur coupes et tissus entiers. La majorité des process (inclusion, IHC, HIS) est automatisée. Le plateau dispose également de matériel de microscopie permettant la dissection, l'observation et l'acquisition d'images en fond clair et fluorescence. Sont traités aujourd'hui des tissus murins, des plantes et des insectes.

THEMATIQUE

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EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

Processeur de tissus STP120 Microm (déshydratation et passage dans la paraffine). Automate d'inclusion EC350 Microm (inclusion dans la paraffine). Deux microtomes HM340E Microm, un cryostat HM560 Microm. Colorateur HMS70. Automates IHC/HIS sur lames ou tissus entiers Intavis InSitu Pro VSi. Deux loupes binoculaires Leica MZ7.5 avec caméra Leica DFC500. Microscope Zeiss Axioplan 2 avec caméras couleur et N&B.

Moyens biologiques

Modèles animaux de physiopathologie prostatique, épididymaire, testiculaire et surrénalienne (souris transgéniques, KO et KI) Infrastructures spécifiques

Animalerie agréée OGM (capacité 5000 animaux), plateau de transgenèse

CONDITIONS D’ACCES Accès gratuit aux équipes du GReD, facturation pour équipes extérieures

PRESTATIONS PROPOSEES

Le plateau ne fournit pas de prestation. Il assure par contre la formation et l'encadrement d'utilisateurs potentiels. L'assistant ingénieur est disponible pour assurer le bon fonctionnement du plateau (approvisionnement, veille technologique) et la mise au point de protocoles.

© Pierre Val

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CERMEP-imagerie du vivant

Centre d'Etude et de Recherche Multimodal et Pluridisciplinaire en imagerie du vivant

DOMAINE D’EXPERTISE

Imagerie in-vivo pour la recherche sur l'homme et l'animal : TEP, IRM, MEG . Radio-chimie émetteurs de positons.

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Gérard GIMENEZ Contact : [email protected]

59 boulevard pinel, 69677, BRON Cedex

@ www.cermep.fr

Appartenance : FLI ( France Life Imaging )

Labellisation : ISO 9001, IBiSA ( infrastructures Biologie Santé Agronomie)

Effectif : 28

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Mise en œuvre de protocoles d'imagerie in-vivo pour la recherche sur l'homme et l'animal. Techniques d'imagerie disponibles : TEP (tomographie par émission de positons), TDM (tomodensitométrie), TEP/IRM simultanée, IRM (résonance magnétique nucléaire), MEG (magnéto-encéphalographie)

Développement et production de radio-traceurs émetteurs de positons

Développement d'une R&D méthodologique en propre ou en partenariat avec des unités de recherche

Ouvert sur la communauté scientifique académique et l'industrie

THEMATIQUE

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EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

Cyclotron IBA 18 Mev Cyclone 18 / 9. Cellules blindées pour la production de radio-traceurs. Automates de synthèses de radio-traceurs. Système de contrôle qualité des radio-traceurs : HPLC, CPG Caméra TEP/CT SIEMENS BIOGRAPH 64 S IRM 1.5T Siemens Magnetom Sonata. IRM 3T Siemens Magnetom Prisma MEG CTF 275 MicroIRM BRUKER 7T . MicroTEP/CT Siemens Inveon . MicroCT Skyscan 1076 IRM/TEP Biograph mMR

Infrastructures spécifiques

Animalerie rongeurs, porcs, chats Laboratoire de production de radio-traceurs Laboratoire de radio-pharmacie

CONDITIONS D’ACCES Aucune

PRESTATIONS PROPOSEES

Accompagnement administratif et scientifique au montage de protocole d'imagerie

Développement de méthodes

Réalisation des examens d'imagerie

Accompagnement aux traitements des images.

Production de radio-traceurs émetteurs de positons

Hébergement d'animaux (rongeurs, porcs)

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CICS

Centre Imagerie Cellulaire Santé

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Philippe VAGO Contact : [email protected]

Faculté de Médecine, 28 place Henri Dunant, 63000, Clermont Ferrand

Appartenance : Université d'Auvergne

Réseaux : RCCM, AFC

Effectif : 3 ETP(1 IE, 2 Tech)

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Analyse en Microscopie Electronique en Transmission (MET) et en Microscopie Electronique à Balayage (MEB) :

Etudes ultrastructurales pour des échantillons biologiques (tissus, cellules, ...) ou non biologiques (microparticules...)

Immunolocalisation en MET

Analyse en microscopie optique : Tissus, cellules, micro-organismes Immunomarquage (marqueurs enzymatiques ou fluorochromes) Analyse d’images : comptage, colocalisation...

Analyse en cytométrie de flux

Analyse en microdissection laser

Préparation des échantillons pour les études en ME et en histologie

DOMAINE D’EXPERTISE

Microscopie électronique, Microscopie photonique, Cytométrie en flux, Microdissection laser

THEMATIQUE

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© CICS

EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

Microscope Electronique en Transmission Hitachi H-7650 Microscope Electronique à Balayage Jeol 6060-Low Vacuum Microscopes Olympus + caméras (couleur, NB) + logiciel d’analyse d’images Metamorph Cytomètre en flux BD LSRII Microdissecteur Laser Arcturus Pixcell II AFS II, AMW, Ultramicrotome Leica pour la préparation des échantillons en ME. Automate à déshydratation et station à inclusion Microm Microtech, microtomes et cryostat Leica pour la préparation des échantillons en histologie

CONDITIONS D’ACCES Ouvert à tous laboratoires publics ou privés

PRESTATIONS PROPOSEES

Prise en charge complète des projets en microscopies optique et électronique de la préparation des échantillons au rendu des résultats

Expertise technique dans les domaines d’application

Assistance et formation des utilisateurs

Mise à disposition des équipements du CICS

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© CICS

EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

Microscope Electronique en Transmission Hitachi H-7650 Microscope Electronique à Balayage Jeol 6060-Low Vacuum Microscopes Olympus + caméras (couleur, NB) + logiciel d’analyse d’images Metamorph Cytomètre en flux BD LSRII Microdissecteur Laser Arcturus Pixcell II AFS II, AMW, Ultramicrotome Leica pour la préparation des échantillons en ME. Automate à déshydratation et station à inclusion Microm Microtech, microtomes et cryostat Leica pour la préparation des échantillons en histologie

CONDITIONS D’ACCES Ouvert à tous laboratoires publics ou privés

PRESTATIONS PROPOSEES

Prise en charge complète des projets en microscopies optique et électronique de la préparation des échantillons au rendu des résultats

Expertise technique dans les domaines d’application

Assistance et formation des utilisateurs

Mise à disposition des équipements du CICS

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CIQLE

Centre d'Imagerie Quantitative Lyon-Est

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Ruth RIMOKH Contact : [email protected]

Faculté de Médecine Lyon-Est, rue Guillaume Paradin, 69372, Lyon cedex 08

@ http://sfrsantelyonest.univ-lyon1.fr/plateau31-ciqle.html?

Appartenance : GDR2588, RtMfm, RCCM, RECAMIA

Labellisation : plateforme labellisée Ibisa au titre de membre fondateur de Lyon Bio-Image

Effectif : 5 ETP (personnels statutaires)

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Le CIQLE est un centre commun de l’Université Claude Bernard de Lyon et une composante fondatrice de Lyon Bio-Image (Plateforme d'Imagerie Lyonnaise labellisée Ibisa). Sa mission est de mettre à la disposition des communautés académique et industrielle des équipements et des personnels permanents pour les assister dans l’utilisation des appareils, pour préparer leurs échantillons et pour mettre en place des protocoles dans les domaines de la microscopie électronique, photonique et traitement d'images. A ces fins, l’UCBL et l’Inserm y affectent des personnels. L’achat des équipements est co-financé (Inserm, CNRS, HCL, UCBL, SFR, Fondations, Associations, fonds propres) sous la coordination de la SFR Santé Lyon-Est, qui est une Unité Mixte de Service labellisée Inserm, CNRS et UCBL. L'entretien des équipements est assuré par la facturation des prestations.

THEMATIQUE DOMAINE D’EXPERTISE

Microscopie électronique, microscopie photonique (vidéomicroscopie, confocal mono et bi-photon, super-résolution et microinjection cellulaire). Formation, assistance. Expertise et prestation en traitement d'images

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EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

Microscopie électronique : MET Jeol 1400 120 kV, avec caméras numériques et détecteur EDS, robot de cryosubstitution, ultramicrotomes, contrasteur de grille automatisée, système informatisé de suivi des échantillons (logiciel TRACEMET développé en interne). Microscopie photonique : confocal LSM 780 Zeiss mono et multi-photon avec contrôle environnemental, confocal SP5 X laser blanc Leica avec détecteur hybride, STORM haute-résolution Nikon, stations de vidéomicroscopie (Biostation Nikon, axiovert 200-M), logiciels de traitement et de reconsctrucion d'image (ImageJ, Imaris, Amira)

Infrastructures spécifiques

Plateforme installée sur 3 sites : site Laennec 180 m², site Rockefeller 180 m², site Centre Léon Bérard 30 m²)

CONDITIONS D’ACCES Ouvert aux structures académiques, universitaires et industrielles. La réservation des équipements se fait sur le site internet. Les tarifs sont disponibles sur le site internet.

PRESTATIONS PROPOSEES

Microscopie électronique : prestation complète de l'échantillon à l'image en ultrastructure conventionnelle, immunogold sur cellules, tissus, bactéries, virus, pseudoparticule. Assistance pour l'acquisition, la lecture et l'interprétation des images. Microscopie photonique : formation, assistance et expertise dans les domaines de la microscopie plein champ, confocale et haute-résolution. Traitement d'image : formation, conseil et mise en place de protocole de traitements d'images.

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THEMATIQUES

Clinatec

Clinatec: une plateforme technologique translationnelle multidisciplinaire

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : François BERGER Contact : [email protected]

CLINATEC CEA LETI 17 rue des Martyrs, 38054, GRENOBLE cedex 09

@ http://issuu.com/co-influence/docs/plaquette-clinatec-ps

Appartenance : Centre Hospitalier Universitaire de GRENOBLE

INSERM UA 01

GDR Nouvelles méthodologies en imagerie du vivant et Microscopie fonctionelle du vivant

Labellisation : FLI, IBISA

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

CLINATEC est un centre de recherche technologique translationnel associant le CHU de Grenoble, l’INSERM, l’UJF et le CEA-LETI. Sa mission est d’accélérer le transfert de l’innovation technologique au lit du patient dans les meilleures conditions de sécurité. Sa spécificité est dans son domaine de recherche clinique lié aux pathologies neurologiques (neurodégénératifs, handicap et cancer) et dans l’utilisation des micro-nanotechnologies et de l’électronique pour la santé, expliquant sa localisation sur le campus MINATEC. Clinatec est aussi un hôtel à projet ouvert aux industriels et aux chercheurs dans d’autres domaines d’activité qui pourraient bénéficier de ses compétences et de sa plateforme.

THEMATIQUE

DOMAINE D’EXPERTISE

Unité préclinique et clinique pour la validation des dispositifs médicaux innovants participant au développement sécurisé et accéléré de solutions technologiques nouvelles au service des patients, micro-nanosystemes et électronique pour la santé, biomarqueurs

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EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques Secteur clinique: IRM diagnostique et per op 1,5 tesla (première IRM interventionnelle en France), robot chirurgical Medtech, SPECT-CT, MEG, micro-endoscopie confocale (CellVizio), Fluobeam, microscopie de fluorescence interventionelle Secteur préclinique (animalerie): IRM wide bore 4.7 T, microscopie et endoscopie intravitale Un PACS (Picture Archiving and Communication System) centralise l’ensemble des données de l’imagerie Secteur biologie : plateforme Affymetrix, Ion torrent, PCR digital, chaine d’analyse de spectrométrie de masse, imagerie MS, « sample prep » automatisé Moyens biologiques Sérothèque, tumorothèque cerveau et tumeurs cérébrales incluant des ressources cellulaires et moléculaires associées, plusieurs modeles animaux de gliomes chez souris, rats, primates et porcs Infrastructures spécifiques Bloc opératoire et secteur clinique dédié, animalerie avec bloc opératoire et imagerie multimodale (IRM, X, optique) intégrée, laboratoire de culture cellulaire L2

COMMENTAIRES Cette plateforme est animée par une équipe dont les compétences sont dans le domaine de la neuro-oncologie. Cependant elle fonctionne aussi en hôtel à projet et accueille dès à présent des projets pour d'autres organes. Les coordinateurs cliniques apportent les compétences spécifiques et la structure ses compétences méthodologiques.

CONDITIONS D’ACCES Comité scientifique

PRESTATIONS PROPOSEES

CLINATEC est destiné à la validation de preuves de concept précoces dans le domaine des micro-nano-systèmes pour la santé particulièrement en cancérologie. Nous mettons à disposition : 1) un comité de concertation technologique translationnel pour guider le plus tôt possible le dépôt de dossier de recherche clinique auprès des autorités réglementaires 2) Une équipe multidisciplinaire médicale et paramédicale, intégrant ingénieurs, biologistes, mathématiciens 3) une PTF préclinique (modèles gros animaux) 4) une PTF d’imagerie multimodale et interventionnelle 5) une PTF biomarqueur 6) Un secteur clinique dédié à des essais de recherche biomédicale. Son activité inclut des consultations, de l'hospitalisation de jour et de l'hospitalisation complète. Après ces premiers essais sur 5 à 10 patients qui sont la spécificité de clinatec ; le rôle de l'équipe est aussi d'assurer la dissémination de la technologie dans un environnement hospitalier courant et la formation des personnels de santé.

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DOMAINE D’EXPERTISE

Microscopie électronique, cryo-microscopie électronique, microscopie électronique cellulaire, contrôle qualité, particules isolées

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Guy SCHOEHN Contact : [email protected]

IBS 71 Avenue des Martyrs CS 10090, 38044, Grenoble Cedex 9

@ http://www.ibs.fr/groupes/groupe-microscopie-electronique-et/plateforme-de-microscopie/

Appartenance : UMS3518, Partnership for Structural Biology, INSTRUCT

Labellisation : Certification ISO9001

Effectif : 6

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

La plateforme propose trois types de prestations : contrôle qualité (coloration négative), cryo-microscopie électronique et microscopie électronique cellulaire. La plateforme propose également la mise à disposition de ses équipements. Des collaborations scientifiques peuvent être mises en place pour répondre à des demandes précises nécessitant des développements spécifiques.

THEMATIQUE

EMPLAT

Plateforme de Microscopie Electronique

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CLARA / Annuaire des plateformes 2014 17

EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

La plateforme possède 3 microscopes électronique (FEI Tecnai12 120 kV, FEI Tecnai F20 200kV FEG, FEI Tecnai POLARA 300 kV FEG). Les deux derniers microscopes fonctionnent en mode cryo et le Polara sera équipé d'une caméra à détection directe d'électrons dans les mois qui viennent. Plusieurs instruments associés aux microscopes sont également disponibles (évaporateur de carbone, appareil de Glow-Discharge, FEI Vitrobot, scanner d'images haute résolution). Pour la préparation d'échantillons cellulaires, la plateforme possède un automate de cryo-fixation sous haute pression (Leica EM-HPM100), un automate de cryo-préparation (Leica EM-AFS2 + Em-FSP), un (cryo-)ultra-microtome (Leica EM-UC7 + EM-FC7) et un automate d'immuno-marquage (Leica EM-IGL).

COMMENTAIRES La plateforme fait partie de l'Unité Mixte de Service UMS3518 mais est localisée à l'IBS Pour nous contacter : [email protected]

CONDITIONS D’ACCES Les services de la plateforme sont soumis à facturation. Les échantillons doivent respecter le niveau de sécurité L1 ou L2 et être conformes à la déclaration OGM correspondante.

PRESTATIONS PROPOSEES

Contrôle qualité (vérification de l'homogénéité d'un échantillon, détermination de l'état d'oligomérisation de certaines protéines, analyse d'images et reconstruction tridimensionnelle de complexes protéiques). Cryo-microscopie électronique (technique permettant d'observer des échantillons biologiques dans leur état natif, analyse d'images et reconstruction tridimensionnelle de complexes protéiques). Tomographie électronique. Microscopie électronique cellulaire (études morphologiques cellulaires/bactériennes, localisation de protéines au niveau sub-cellulaire). La plateforme propose également la mise à disposition de ses équipements sous certaines conditions.

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GAIA

Plateforme d'imagerie nucléaire

DOMAINE D’EXPERTISE

Oncologie, métabolisme, neuroscience, cardiologie, imagerie TEP, imagerie SPECT, imagerie CT, échographie

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Catherine GHEZZI Contact : [email protected]

CHU Grenoble Rond point de la Chantourne, 38100, Grenoble

@ http://www.imagerie-grenoble.fr/

Appartenance : France Life Imaging

Labellisation : IbiSa

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

GAIA est localisé au sein de l'UMR 1039 qui regroupe le Laboratoire Radiopharmaceutique Biocliniques (LRB) et la clinique de Médecine Nucléaire du CHU de Grenoble. Cette unité développe depuis plus de 25 ans des radiopharmaceutiques, molécules marquées par des atomes radioactifs et utilisées pour le diagnostic et la thérapie. Les compétences développées sur la plateforme vont du marquage radioactif de composés aux études précliniques et cliniques.

THEMATIQUE

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CLARA / Annuaire des plateformes 2014 18

GAIA

Plateforme d'imagerie nucléaire

DOMAINE D’EXPERTISE

Oncologie, métabolisme, neuroscience, cardiologie, imagerie TEP, imagerie SPECT, imagerie CT, échographie

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Catherine GHEZZI Contact : [email protected]

CHU Grenoble Rond point de la Chantourne, 38100, Grenoble

@ http://www.imagerie-grenoble.fr/

Appartenance : France Life Imaging

Labellisation : IbiSa

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

GAIA est localisé au sein de l'UMR 1039 qui regroupe le Laboratoire Radiopharmaceutique Biocliniques (LRB) et la clinique de Médecine Nucléaire du CHU de Grenoble. Cette unité développe depuis plus de 25 ans des radiopharmaceutiques, molécules marquées par des atomes radioactifs et utilisées pour le diagnostic et la thérapie. Les compétences développées sur la plateforme vont du marquage radioactif de composés aux études précliniques et cliniques.

THEMATIQUE

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EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

Caméra SPECT/CT Bioscan

Caméra PET/CT Bioscan

Caméra Cliniques SPECT et TEP

Echographe Vevo

Autoradiographie

Infrastructures spécifiques

Plateforme animalerie : petits et gros animaux, animalerie agrémentée, microchirurgie

Radiochimie : radio-HPLC, radio-CCM, activimètres, compteurs Gamma et Bêta

CONDITIONS D’ACCES Prestations de services, mise à disposition d'équipements, conseils/expertise, collaborations de recherche académiques / industrielles

PRESTATIONS PROPOSEES

Radiomarquage de divers composés (molécules organiques, protéines, anticorps, sucres, peptides, bactéries, ADN, ARN, cellules,…)

Evaluation in vivo de la pharmacocinétique et de la biodistribution d'une molécule d'intérêt pharmaceutique

Evaluation de l'efficacité thérapeutique de composés d'intérêt (tumeur, ischémie, métabolisme,...)

Etude de phénommènes biologiques chez l'animal en utilisant des radiotraceurs existants (suivi de croissance tumorale, mesures de perfusion cérébrale ou cardiaque, ou encore études métaboliques)

Validation de modèles animaux

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IRMaGe

Plateforme spécialisée en IRM et neurophysiologie

DOMAINE D’EXPERTISE

IRM, neuroimagerie, explorations fonctionnelles (EEG, TMS, NIRS) et métaboliques, imagerie fonctionnelle de la vascularisation

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Chantal REMY Contact : [email protected]

Bâtiment Edmond J. Safra, Université Joseph Fourier - Site Santé, Chemin Fortuné Ferrini, 38700, La Tronche

@ https://irmage.ujf-grenoble.fr/accueil?destination=node/850

Appartenance : France Life Imaging

Labellisation : IbiSa

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Spécialisée en neuroimagerie et explorations fonctionnelles associées, IRMaGe est le partenaire idéal pour accompagner des projets de recherche sur petit animal et primate non humain, des projets de recherche à visée clinique ou cognitive, mais également pour le développement méthodologique d'imagerie et de spectroscopie RMN ou neurophysiologie.

Dans le contexte de la cancérologie, peuvent être réalisés, pour des études pharmacologiques, des suivis longitudinaux du volume tumoral, des œdèmes, du métabolisme, de la vascularisation et de l'angiogenèse sur des modèles orthotopiques ou sous-cutanés (rat ou souris) ou chez l'homme.

THEMATIQUE

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IRMaGe

Plateforme spécialisée en IRM et neurophysiologie

DOMAINE D’EXPERTISE

IRM, neuroimagerie, explorations fonctionnelles (EEG, TMS, NIRS) et métaboliques, imagerie fonctionnelle de la vascularisation

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Chantal REMY Contact : [email protected]

Bâtiment Edmond J. Safra, Université Joseph Fourier - Site Santé, Chemin Fortuné Ferrini, 38700, La Tronche

@ https://irmage.ujf-grenoble.fr/accueil?destination=node/850

Appartenance : France Life Imaging

Labellisation : IbiSa

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Spécialisée en neuroimagerie et explorations fonctionnelles associées, IRMaGe est le partenaire idéal pour accompagner des projets de recherche sur petit animal et primate non humain, des projets de recherche à visée clinique ou cognitive, mais également pour le développement méthodologique d'imagerie et de spectroscopie RMN ou neurophysiologie.

Dans le contexte de la cancérologie, peuvent être réalisés, pour des études pharmacologiques, des suivis longitudinaux du volume tumoral, des œdèmes, du métabolisme, de la vascularisation et de l'angiogenèse sur des modèles orthotopiques ou sous-cutanés (rat ou souris) ou chez l'homme.

THEMATIQUE

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 21

EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

3 IRMs petit animal : 4,7 T, 7,0 T et 9,4 T (rat, souris) - monitoring physiologique 2 IRMs corps entier : 3T 3 EEGs (électro-encéphalographie) haute résolution, compatibles TMS et IRM TMS (stimulation magnétique transcrânienne) neuronaviguée et robotisée Appareil de spectroscopie proche infra-rouge (NIRS) Enregistrements multi-unitaires Coordination possible pour imagerie multimodale (IRM, optique, nucléaire)

Moyens biologiques

Modèles de tumeurs cérébrales

Infrastructures spécifiques

Accès à une plateforme d'animalerie : souris, rats, primates Animalerie agréée ISO9001 Salles de microchirurgie

COMMENTAIRES Lemasson B et al., NMR in Biomedicine 2011; 24:473-482. Lux F et al., Angewandte Chemie int Ed Engl, 2011, 50: 12299 –12303. Coquery N et al., PLoS ONE, 2012; 7:e40567 Lemasson B et al, Radiology. 2012; 265:743-752. Bouchet et al., Radiother Oncol. 2013; 108:143-148.

CONDITIONS D’ACCES Prestations de services, mise à disposition d'équipements, conseils, collaborations de recherche académiques / industrielles

PRESTATIONS PROPOSEES

Développement méthodologiques (animal, homme) Phénotypage de souris transgéniques Suivi de l'évolution de pathologies (animal, homme) Études pharmacologiques (animal, homme) Evaluation de l'efficacité de nouveaux traitements (animal, homme) Imagerie cellulaire et moléculaire (animal) Évaluation de nouveaux agents de contraste (animal) Recherche cognitive (homme) Exploration fonctionnelles cérébrales (homme) Evaluation de la compatibilité RMN de matériaux Etude d'échantillons tissulaires à haute résolution

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CLARA / Annuaire des plateformes 2014 22

M4D

Imagerie Cellulaire

DOMAINE D’EXPERTISE

Vidéo microscopie, microscopie confocale, cytométrie en flux

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Jean-Philippe KLEMAN Contact : [email protected]

IBS UMR 5075 (CNRS CEA UJF)- Campus EPN - 71 avenue des Martyrs, 38044, Grenoble Cedex 9

@ http://www.ibs.fr/plates-formes/autres-instruments-et/imagerie-cellulaire/

Appartenance : Integrated Structural Biology - Grenoble UMS 3518 (CNRS CEA UJF EMBL)

French Integrated Structural Biology network (FrisBi) - IBISA

Plateforme de Biologie Structurale - Grenoble

Labellisation : ISO 9001:2008 LRQA du 3 juillet 2011

Effectif : 3 permanents

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

La plate-forme accueille les utilisateurs dans un environnement de niveau L2 (pièce de culture dédiée). Nous mettons à disposition nos microscopes (vidéomicroscope et confocal à roue de Nipkow - Olympus Perkin-Elmer et Andor) optimisés pour l'étude de cellules vivantes. Nous sommes également équipés d'un cytomètre en flux (Miltenyi Biotech) capable de mesurer les fluorescences de 8 canaux simultanément, compatibles avec l'étude des protéines fluorescentes (Ex. 405, 488 et 561nm).

THEMATIQUE

Page 23: Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 23

EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

Vidéo-microscope inversé à épifluorescence motorisé, chambre d'incubation, Z-piezo, 4 canaux fluo, DIC, 20X 40X et 60X, acquisition CCD

Microscope confocal inversé motorisé à roue de Nipkow, chambre d'incubation, CO2, Z-piezo, 6 canaux fluo, DIC, 20X 40X 60X et 100X, acquisition dual EMCCD, module FRAP/PA

Cytomètre en flux : 3 lasers, 8 canaux fluo, échantillonneur robotisé

Infrastructures spécifiques

Pièce de culture L2 dédiée

Ordinateurs permettant le traitement des données

Légende : acquisition confocale (60x NA 1,42; EMCCD iXon Ultra - Andor; Z=44x0,28µm) cellules NIH-3T3 exprimant HA-Survivine (Rouge) et transfectées par une construction GFP du transporteur membranaire AIT (vert). ADN (Bleu, DAPI). © F. Lacroix – IBS

CONDITIONS D’ACCES Formation obligatoire et inscription sur le calendrier des réservations

PRESTATIONS PROPOSEES

Nos instruments sont mis à disposition des utilisateurs après une formation obligatoire dispensée par nos soins sur l'instrument concerné. Les utilisateurs sont également formés pour l'utilisation des logiciels d'acquisition et de traitement des données. Des ordinateurs pour le traitement sont mis à disposition. L'accès est possible après réservation du matériel (calendrier).

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CLARA / Annuaire des plateformes 2014 24

MEC

Plateforme de Microscopie Electronique de la Cellule

DOMAINE D’EXPERTISE

Neurosciences, oncologie, vascularisation, spermatozoides, ovaires

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Karin PERNET-GALLAY Contact : [email protected]

Grenoble Institut des Neurosciences

chemin Fortuné Ferrini, 38700, La Tronche

@ neurosciences.ujf-grenoble.fr/

Appartenance : INSERM U836

Université Jopseph Fourier

Labellisation : plateforme Ibisa

Effectif : 2

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Inclusion Epon pour études morphololgiques

Immunomarquage à l'or sur des cryosections pour l'immunolocalisation de protéines

THEMATIQUES

Page 25: Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 25

EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

Microscope électronique à transmission (JEOL 1200 EX)

Ultra-(cryo)-microtome (Ultracut S, Leica)

Appareil de congélation haute Pression (HPM100, Leica)

Appareil de cryosubstitution (AFS2 Leica)

Infrastructures spécifiques

Laboratoire pour l'inclusion

Local pour la coupe et la préparation cryo des échantillons

Pièce pour le microscope électronique

CONDITIONS D’ACCES Facturation à l'heure

PRESTATIONS PROPOSEES

Mise à disposition

Microscope électronique à transmission (JEOL 1200 EX)

Ultra-(cryo)-microtome (Ultracut S, Leica)

Appareil de congélation haute pression (HPM100, Leica)

Appareil de cryosubstitution (AFS2 Leica)

Mesures morphométriques (iTEM, Olympus)

Inclusion Epon pour analyse morphologique

Méthode de Tokuyasu pour immunomarquage

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CLARA / Annuaire des plateformes 2014 26

MiBiop

Microscopie pour la Biophysique

DOMAINE D’EXPERTISE

Microscopie à forces de traction, imagerie ultra-sensible en milieu diffusant, mesure de mobilité moléculaire, optique adaptative, microscopie à force atomique, biophysique

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Antoine DELON Contact : [email protected]

140, rue de la physique - Université Joseph Fourier - Domaine universitaire, 38402, Saint Martin d'Hères Cedex 9

Appartenance : Laboratoire Interdisciplinaire de Physique (LIPhy)

UJF (Université de Grenoble 1) et CNRS

GDR 2588 (Microscopie fonvtionnelle du vivant)

Effectif : Environ 110 pers. (non permanents compris)

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Le plateau MiBiop est un lieu de développement instrumental et méthodologique, qui met à disposition de ses utilisateurs des instruments de microscopie uniques par leurs performances en termes de sensibilité, de fonctionnalité et de précision. Ce sont en général des prototypes qu’on ne retrouve pas sur une autre plate-forme. Développés au laboratoire par des chercheurs, ils répondent aux besoins des chercheurs : super-résolution, microscopie à force de traction, microscopie à corrélation de fluorescence, optique adaptative, microscopie non linéaire, microscopie à force atomique.

THEMATIQUE

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CLARA / Annuaire des plateformes 2014 27

EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

Microscope bi-photonique droit de très grande étendues spectrale (680 – 1080 nm)

Microscope FCS et multi-FCS (488 et 637 nm)

Microscopes pour multi-FRAP, photoactivation/photoinactivation

Microscope confocal pour l'optique adaptative (561 nm)

Microscope pour la mesure de forces de traction

Microscope à force atomique couplé à un microscope inversé (en milieu liquide)

Microscopie ultra-sensible d’objets en milieux diffusants par rétro-diffusion à 1080 nm

Spectrofluorimètre Jobin-Yvon en absorption (250 – 1000 nm) et fluorescence (290 – 850 nm)

Micro-fabrication

CONDITIONS D’ACCES Compte-tenu de l'axe développement de la plate-forme, nous privilégions les "prestations" sous forme collaborative.

PRESTATIONS PROPOSEES

Imagerie ultra-sensible en milieu fortement diffusant

Optique adaptative

Imagerie profonde de tissus biologiques

Mesures de forces exercées par des cellules sur des substrats microstructurés

Mesure de mobilité et d’interactions moléculaires dans des cellules vivantes

Microscopie à force atomique ; mesure de l’adhérence et de la rhéologie cellulaire

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CLARA / Annuaire des plateformes 2014 28

MicroCell

Microscopie Photonique - Imagerie Cellulaire

DOMAINE D’EXPERTISE

Prestations et développement des applications innovantes en microscopie de fluorescence, détection des mobilités et des complexes moléculaires, cytomtrie de flux et tri cellulaire

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Alexei GRICHINE Contact : [email protected]

IAB, CRI-U823, Domaine de la Merci, Rond point de la Chantourne, 38706, La Tronche

@ http://www-iab.ujf-grenoble.fr/plf_d.php?b=2&c=23&i=9

Appartenance : GDR 2588, RTmfm

Labellisation : GIS IBiSA, Imagerie Sciences du Vivant - In Vitro (ISdV)

Effectif : 5

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Le plateau Micro-Cell IAB fait partie de la plate-forme grenobloise Imagerie Sciences du Vivant (ISdV) de l’Université Joseph Fourier, labellisée par le GIS IBiSA. Il est localisé au sein de l’Institut Albert Bonniot (IAB), Centre de Recherche Inserm/UJF (U823). Les techniques de microscopie de fluorescence dans la cellule vivante sont le cœur de métier de ce plateau. Nos points forts : microscopie confocale et biphotonique, spectroscopie de fluorescence, développements technologiques et méthodologiques, équipements de pointe, microscopies sur cellules vivantes. MicroCell offre : prestations de services, mise à disposition d’équipements, formations théoriques et pratiques, collaborations de recherche académique / industrielle.

THEMATIQUES

Page 29: Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 29

EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques Equipements d’imagerie 4 stations confocales (dont 2 spectrales) (LSM710, 510, Andromeda) 2 modules de spectroscopie à corrélation (Confocor2 ,3) 2 systèmes biphotoniques et FLIM (SPC830) 4 vidéomicroscopes inversés, motorisées 2 modules TIRF et FRAP 5 microscopes droits, motorisés Equipements de cytometrie 2 analyseurs (LSR2, Accuri), 1 trieur (BD FACS Aria) 5 postes informatiques dédiés à l’analyse Logiciels d’acquisition et d’analyse : MetaMorph, ZEN, AxioVision, Volocity, SPCImage, SimFCS, Origin, DIVA Equipements complémentaires accessibles : spectrophotomètre, spectrofluorimètres, équipements de métrologie Infrastructures spécifiques 100 m2 de surface dédiée à l'imagerie de fluorescence à bas niveau de lumière et température stabilisée, équipement de culture cellulaire, salle d'analyse et traitement des données

© IAB CRI U823, équipe 1

CONDITIONS D’ACCES Tout laboratoire académique ou privé, accès via Floralis/UJF : Valentine PANEL - 04 56 00 60 42, responsable scientifique : Dr. Yves USSON - 04 56 52 00 74, responsable technique : Dr. Alexeï GRICHINE - 04 76 54 94 89

PRESTATIONS PROPOSEES

Imagerie cellulaire multiparamétrique : migration cellulaire, localisation subcellulaire, interactions in situ, dynamique moléculaire, photomanipulations Microscopie confocale (3D, spectrale, ultrarapide, FRAP, FLIP, FRET, photoactivation, anisotropie, imagerie en comptage de photons) Spectroscopie à corrélation de fluorescence (FCS, FCCS, RICS) Microscopie biphotonique (2PE, SHG, NIR-NIR, Spectroscopie d’excitation 2P) Microscopie de fluorescence à onde évanescente TIRF et photo(in-)activation (CALI, PA) Optogénétique et photomanipulations multidimentionnelles en cellule vivante Imagerie en durée de vie de fluorescence (TCSPC-FLIM, FAD) Microscopie à épifluorescence et contrastes transmises, vidéomicroscopie Imagerie 3D par illumination structurée Traitement et analyse d’images et données spectrales

Page 30: Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 30

NanOpTec

Centre de Nano-Opto-Technologies

DOMAINE D’EXPERTISE

Imagerie et spectroscopie de nanomatériaux et de milieux biologiques (nanoparticules métalliques, nanoparticules diélectriques dopées par des terres rares, molécules et biomolécules, interfaces, membranes cellulaires,…)

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Pierre-François BREVET Contact : [email protected]

Centre NanOpTec, Dép. de Physique, 14 rue Enrico Fermi, Bât. G. Lippmann, UCBL La DOUA, 69622, Villeurbanne

@ http://nanoptec.univ-lyon1.fr/

Appartenance : ORA - Pôle Optique Rhône-Alpes

RTmfm - Microscopie Photonique de Fluorescence Multidimensionnelle

LBI associé - Lyon Bio -Image

Effectif : environ 70, majoritairement des permanents de l'Institut Lumière Matière (ILM)

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Les activité de la plateforme NanOpTec s’articulent autour de l'imagerie et la spectroscopie de nanomatériaux et de milieux biologiques (nanoparticules métalliques, nanoparticules diélectriques dopées par des terres rares, molécules et biomolécules, interfaces, membranes cellulaires,…), notamment à l’échelle du nano-objet unique ce qui constitue l’originalité des approches menées au Centre. Ces études nécessitent en particulier le développement de nouvelles méthodes de microscopie optique linéaire et non linéaire.

THEMATIQUES

Page 31: Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 31

EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

AFM

Dispositifs de spectroscopie de nanoparticules uniques (absorption et diffusion)

Dispositif de spectroscopie SHG aux interfaces et de particules piégées

Microscope confocal achromatique

Microscope confocal multiphotonique (visible, biphoton, SHG, THG)

Microscope confocal SHG

Moyens biologiques

Les utilisateurs du centre NanOpTec apportent leur propres échantillons (agrégats cellulaires, tissus biologiques, ADN…).

CONDITIONS D’ACCES Si vous souhaitez réaliser des mesures au Centre NanOpTec, la procédure consiste à en faire la demande à son directeur.

PRESTATIONS PROPOSEES

Les activités de la plateforme s’appuient sur les équipes de recherche des laboratoires fondateurs. Le Centre est aussi ouvert aux collaborations internes à l’établissement et plus largement aux collaborations extérieures.

Page 32: Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 32

OPTIMAL

Plateforme d'imagerie optique du petit animal

DOMAINE D’EXPERTISE

Oncologie, thérapie ciblée du cancer, drug delivery, nanoparticules, angiogénèse

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Véronique JOSSERAND Contact : [email protected]

Institut Albert Bonniot, BP170 La Tronche

38042 Grenoble cedex 9

@ http://www.imagerie-grenoble.fr/

Appartenance : France Life Imaging

Labellisation : IbiSa

Effectif : 4

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Au sein de l’équipe «Thérapie ciblée, diagnostic précoce et imagerie du cancer» dirigée par le Dr Jean-Luc Coll de l’INSERM U823, l’équipe OPTIMAL s’est développée sous la direction du Dr Véronique Josserand pour promouvoir l’innovation technologique et méthodologique dans le domaine de l’imagerie optique du petit animal.

OPTIMAL permet à l'ensemble des chercheurs du monde académique ou industriel d'avoir accès à des méthodes d'imagerie sophistiquées, sous la forme de projet collaboratifs ou de prestations de service prises en charge par du personnel hautement spécialisé.

THEMATIQUE

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CLARA / Annuaire des plateformes 2014 32

OPTIMAL

Plateforme d'imagerie optique du petit animal

DOMAINE D’EXPERTISE

Oncologie, thérapie ciblée du cancer, drug delivery, nanoparticules, angiogénèse

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Véronique JOSSERAND Contact : [email protected]

Institut Albert Bonniot, BP170 La Tronche

38042 Grenoble cedex 9

@ http://www.imagerie-grenoble.fr/

Appartenance : France Life Imaging

Labellisation : IbiSa

Effectif : 4

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Au sein de l’équipe «Thérapie ciblée, diagnostic précoce et imagerie du cancer» dirigée par le Dr Jean-Luc Coll de l’INSERM U823, l’équipe OPTIMAL s’est développée sous la direction du Dr Véronique Josserand pour promouvoir l’innovation technologique et méthodologique dans le domaine de l’imagerie optique du petit animal.

OPTIMAL permet à l'ensemble des chercheurs du monde académique ou industriel d'avoir accès à des méthodes d'imagerie sophistiquées, sous la forme de projet collaboratifs ou de prestations de service prises en charge par du personnel hautement spécialisé.

THEMATIQUE

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 33

EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

Imagerie de bioluminescence in vivo Imagerie de fluorescence 2D in vivo en temps réel aux longueurs d’ondes de 480 à 800 nm Imagerie FRET in vivo, imagerie de fluorescence 3D in vivo Imagerie de fluorescence macroscopique à capacité de zoom de 1 à 1600x aux longueurs d’ondes de 360 à 750 nm Systèmes portatifs d’imagerie de fluorescence pour l’imagerie per opératoire des petits et gros animaux Imagerie microCT à haute résolution (<14 µm) Tous nos instruments sont équipés de systèmes d’anesthésie gazeuse et de maintien de température

CONDITIONS D’ACCES Prestations de services personnalisées, mise à disposition d'équipements, conseils, collaborations de recherche académiques / industrielles

PRESTATIONS PROPOSEES

Etudes pharmacocinétiques de biodistribution in vivo Nombreuses lignées cancéreuses bioluminescentes Développement à façon de lignées cancéreuses bioluminescentes Nombreux modèles in vivo pour l’oncologie Evaluation de l’efficacité thérapeutique de candidats anticancéreux Imagerie de l’angiogénèse in vivo Imagerie per opératoire en fluorescence temps réel Evaluation de vecteurs pour la thérapie génique in vivo Suivi d’infections bactériennes, virales ou fongiques in vivo

Moyens biologiques

Nombreuses lignées cellulaires cancéreuses murines ou humaines exprimant la luciférase de façon stable. Nombreux modèles animaux de cancers murins ou humains implantés en sous cutané ou sur leur site naturel (orthotopique) ou sur leur site métastatique

Infrastructures spécifiques

Animalerie agréée pour l'hébergement des souris (y compris nudes et transgéniques) et des rats Laboratoire de culture cellulaire

Page 34: Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 34

PAVIRMA

Plateforme d'irradiation en Auvergne

DOMAINE D’EXPERTISE

Irradiateur X de petits echantillons pour de la recherche

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Serge ALZIARI Contact : [email protected]

Campus des Cezeaux, 24 avenue des Landais, 63170, AUBIERE

@ http://start.univ-bpclermont.fr/rubrique17.html

Appartenance : UBP-START (structure de l’Université Blaise Pascal)

Labellisation : ASN

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Equipé d’un irradiateur X (opérationnel) et d’un générateur neutron (en cours), il permet de réaliser des irradiations de matériel biologique (cellules eucaryotes, bactéries, petits animaux, végétaux, autres préparations biologiques…) et non biologique (polymères, composants électroniques…).

THEMATIQUE

Page 35: Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 34

PAVIRMA

Plateforme d'irradiation en Auvergne

DOMAINE D’EXPERTISE

Irradiateur X de petits echantillons pour de la recherche

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Serge ALZIARI Contact : [email protected]

Campus des Cezeaux, 24 avenue des Landais, 63170, AUBIERE

@ http://start.univ-bpclermont.fr/rubrique17.html

Appartenance : UBP-START (structure de l’Université Blaise Pascal)

Labellisation : ASN

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Equipé d’un irradiateur X (opérationnel) et d’un générateur neutron (en cours), il permet de réaliser des irradiations de matériel biologique (cellules eucaryotes, bactéries, petits animaux, végétaux, autres préparations biologiques…) et non biologique (polymères, composants électroniques…).

THEMATIQUE

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 35

EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques Dans sa première phase (Pavirma 1), elle est équipée d'un irradiateur à rayon X de 320KV, autoprotégé et pouvant délivrer jusqu'à 5KGy, avec un débit de dose max de 13Gy/min. La chambre d'irradiation (102x86x75cm) permet d'irradier des échantillons de grande taille ou de petits animaux. Moyens biologiques Un "laboratoire de biologie", comprenant une hotte à flux laminaire, un incubateur à CO2, une centrifugeuse, un bloc froid, deux microscopes (dont un inversé à contraste de phase) et une paillasse équipée, complète l'équipement de cette plateforme.

CONDITIONS D’ACCES Accès libre sur demande aupres du responsable de la plateforme

PRESTATIONS PROPOSEES

Irradiations X tariffées à l'heure, le prix de l'heure d'irradiation dépend de l'appartenance du demandeur (EPST, Université, PME..)

Page 36: Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 36

PIM Lyon Tech

Plateforme d'Imagerie Multimodale Lyon Tech

DOMAINE D’EXPERTISE

IRM, optique, ultra-sons

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Denis GRENIER Contact : [email protected]

Domaine scientifique de la Doua - CREATIS- 7 avenue Jean Capelle, 69621, VILLEURBANNE

@ http://www.creatis.insa-lyon.fr/site/

Appartenance : France Life Imaging

Labex PRIMES, Labex CELYA

Effectif : 4 ingénieurs, 1 technicien

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

PIM Lyon Tech est une plate-forme préclinique qui couvre un large domaine d'applications :

- Tests non invasifs ex vivo ou in vivo - Développements méthodologiques : imagerie et spectroscopie par résonance

magnétique, imagerie ultrasonore, imagerie optique - Elastographie - Imagerie haute résolution - Imagerie anatomique, fonctionnelle - Etudes de pathologies sur modèles animaux avec le suivi longitudinal associé - Tests de compatibilité IRM de matériaux

THEMATIQUES

Page 37: Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 37

EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

IRM : 4,7 T dédié au petit animal

US : 3 échographes

Optique : laser pulsé et échographe (photoacoustique), endoscope fibré, endoscope rigide, spectromètre multicanaux, endomicroscope confocal fibré Cell-Vizio (MKT®)

Anesthésie gazeuse

Monitoring petit animal

Infrastructures spécifiques

Agrément pour l'utilisation d'animaux à des fins scientifiques : numéro A 69 266 1401

PRESTATIONS PROPOSEES

PIM Lyon Tech propose la réalisation de prestations d'imagerie en adéquation avec la demande : organisation du protocole expérimental, acquisition et analyse des résultats.

La plate-forme est équipée de matériels dédiés à l'expérimentation sur le petit animal.

Les ingénieurs de la plate-forme sont habilités à expérimenter sur le petit animal. La plate-forme dispose aussi d'un cluster de calcul et d'un accès à la grille de calcul EGEE pour faciliter le traitement massif des donnés acquises.

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CLARA / Annuaire des plateformes 2014 38

Radiograaff

Radiobiologie au Van de Graaff

DOMAINE D’EXPERTISE

Radiobiologie

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Michaël BEUVE Contact : [email protected]

IPNL, Campus de la Doua 4 Enrico Fermi, 69622, Villeurbanne

Appartenance :

Plateforme du LabEx PRIMES, de l'infrastructure nationale France Hadron, du GdR MI2B / réseau RESPlaNDir (http://www.mi2b.fr/spip.php?article30)

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Irradiation avec des protons de 3 MeV avec contrôle dosimétrique pour les études de la réponse de cellules biologiques, de détecteurs, de films radiosensibles...

THEMATIQUE

Page 39: Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 38

Radiograaff

Radiobiologie au Van de Graaff

DOMAINE D’EXPERTISE

Radiobiologie

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Michaël BEUVE Contact : [email protected]

IPNL, Campus de la Doua 4 Enrico Fermi, 69622, Villeurbanne

Appartenance :

Plateforme du LabEx PRIMES, de l'infrastructure nationale France Hadron, du GdR MI2B / réseau RESPlaNDir (http://www.mi2b.fr/spip.php?article30)

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Irradiation avec des protons de 3 MeV avec contrôle dosimétrique pour les études de la réponse de cellules biologiques, de détecteurs, de films radiosensibles...

THEMATIQUE

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 39

EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

Dose uniforme sur un disque de 2 cm de diamètre à +/- 3%, dose absolue à mieux que +/- 5%, débit de dose < 10Gy/min

Enceinte thermostatée, porte échantillion automatisé

Laboratoire de cultures cellulaires avec materiel standard (PSM, surpression, incubateurs, congélateurs, hotte chimique, microscope, compteur cellulaire...)

CONDITIONS D’ACCES Tarifs selon prestation, signature d'une charte précisant les conditions d'accès

PRESTATIONS PROPOSEES

Irradiation de cellules en monocouche, de détecteurs, de films...

Accès à un laboratoire de cultures cellulaires

Page 40: Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 40

X-Ray CERVO Lyon-Sud

Plateforme d'irradiation par rayons X

DOMAINE D’EXPERTISE

Radiobiologie, irradiations photoniques cellulaires et du petit animal

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Claire RODRIGUEZ-LAFRASSE Contact : [email protected]

Plateforme CERVO - Faculté de Médecine Lyon-Sud, 69921, Oullins cedex

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

L'irradiateur XRad 320 (PXI) est sous la responsabilité du Laboratoire de Radiobiologie Cellulaire et Moléculaire (équipe 4 de l'EMR3738 - Pr C. Rodriguez-Lafrasse) qui s'intéresse aux mécanismes de la radiorésistance tumorale et développe des traitements adjuvants radiosensibilisants. Les irradiations photoïques sont réalisées sur lignées cellulaires en culture et petit animal (souris, rats).

THEMATIQUE

Page 41: Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 41

EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques

Irradiateur XRad 320 (PXI)

Infrastructures spécifiques

Plateforme technologique CERVO Lyon-Sud

CONDITIONS D’ACCES Contacter C. Rodriguez-Lafrasse par e-mail

PRESTATIONS PROPOSEES

Irradiations cellulaires et du petit animal

Page 42: Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 42

Imagerie intégrée multimodalité

DOMAINE D’EXPERTISE

Cancérologie, radiopharmaceutique, ciblage, imagerie TEP petit animal, imagerie TDM petit animal, scintigraphie, imagerie de bioluminescence, imagerie de fluorescence, autoradiographie digitale quantitative corps entier

INFORMATIONS GENERALES

Responsable de la plateforme : Elisabeth MIOT-NOIRAULT Contact : [email protected]

UMR 990 INSERM/UdA, 63005, clermont Ferrand cédex

@ http://www.clermont-universite.fr/PLATE-FORME-D-IMAGERIE

Appartenance : INSERM/Université d'Auvergne

Effectif : 2 ETP

DESCRIPTION DE L’ACTIVITE

Les champs d'application concernent:

(i) les études scanner X de caractérisation anatomique et structurale (ex: mesure de densité minérale osseuse), avec ou sans injection d'agent de contraste,

(ii) les études de biodistribution et pharamcocinétique de substances d'intérêt (absorption, distribution, métabolisme, excrétion) tant in vivo qu'ex vivo apres marquage radioactif ou fluorescent

(iii) le suivi longitudinal de pathologies évolutifs et de leur réponse à la thérapie, au moyen de traceurs pertinents (croissance tumorale, prolifération, activité métabolique glucidique, inflammation, remaniement osseux, cartilage, hypoxie, MMP,...)

THEMATIQUE

Page 43: Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 43

EQUIPEMENTS DEDIES

Moyens techniques Les équipements d'imagerie sont les suivants: (i) un système autoradiographique quantitatif digital permettant l'analyse corps entier rat et souris (betaImager, Biospace), (ii) deux têtes de détection de gamma camera permettant l'imagerie scintigraphique gamma, plane et tomographique (gammaImager, Biospace), (iii) un scanner X petit animal (Explore CT120, GE Healthcare), (iv) un imageur TEP petit animal (ExploreVista, GE Healthcare), (v) un equipement d'imagerie optique permettant l'imagerie 2D et 3D en bioluminescence et fluorescence in vivo (IvisSpectrum, Perkin Elmer).

CONDITIONS D’ACCES Les équipements sont ouverts à la communauté scientifique académique et aux sociétés privées, sous forme de collaboration ou de prestations de services.

PRESTATIONS PROPOSEES

Située à l'UMR 990 iNSERM/UdA, le plateau d'imagerie intégrée multimodalité in vivo a pour objectif d'offrir à la communauté scientifique des études "multi-échelles", pouvant aller de la caractérisation tissulaire de l'échantillon, à l'exploration fonctionnelle in vivo chez le petit animal. Les équipements de haute technologie du plateau permettent de proposer, tant des approches structurales et anatomiques à haute résolution (50 µm in vivo pour le scanner), que fonctionnelles après administration de composés radiomarqués, fluorescents ou bien encore de cellules bioluminescentes.

Moyens biologiques Notre unité possède l'expertise nécessaire pour le développement de modèles expérimentaux en cancérologie, tant in vitro (culture en 2 ou 3 dimensions telle que sphéroïdes), qu'in vivo (modèles de xénogreffes ou orthotopiques). Les modèles qui sont développés en routine sont principalement: le mélanome, le chondrosarcome, l'ostéosarcome, les tumeurs mammaires, de colons, de prostate, de lymphome… Infrastructures spécifiques Notre unité dispose des infrastructures nécessaires à l'hébergement des animaux (animalerie agrée), l'hébergement temporaire des animaux pendant la durée de leur examen (armoires ventilées dédiées), y compris pour les animaux ayant reçu une administration de traceur radioactif (armoire ventilées plombées), les équipements nécessaires au radiomarquage (enceintes blindées, automates de radiosynthèse), les locaux nécessaires à la culture cellulaire et aux études de pharmacologie.

Page 44: Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

CLARA / Annuaire des plateformes 2014 1

www.canceropole-clara.com

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