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Mécanismes moléculaires de la résistancede Plasmodium falciparum aux antipaludiques

Master 1 « Physiopathologie cellulaire et moléculaire »Unité d’enseignement de microbiologie médicale

Denis Filisetti

Laboratoire de Parasitologie des Hôpitaux Universitaires de Strasbourg

Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire du CNRS

1er avril 2011

Faculté

de médecine

Plan du cours

• Enjeux de la question (paludisme)

• Généralités sur les résistances aux traitements

– chloroquine, sulfadoxine, pyriméthamine

• P. falciparum et résistance à la chloroquine

– mécanismes d’action de la chloroquine– mécanismes d’action de la chloroquine

– gène PfMDR1 (pompe à efflux)

– gène PfCRT (canal / transporteur chloroquine)

• P. falciparum et résistance à la pyriméthamine

– métabolisme des bases pyrimidiques

– gène DHFR

– régulation traduction ARNm DHFR

Objectifs pédagogiques

Être capable d’expliquer :

• la résistance de P. falciparum à la chloroquine

• la résistance de P. falciparum à la pyriméthamine

Enjeux de la question

• Le paludisme

– Une des maladies les plus fréquentes :

• 250 000 000 cas de paludisme par an ;

• 1 000 000 de décès par an :• 1 000 000 de décès par an :– 95 % = enfants africains < 5 ans

– Femmes enceintes

– Co-infectés VIH/SIDA

Enjeux de la question

• Distribution géographique du paludisme

Enjeux de la question

• Le paludisme

– Transmis (Anopheles)

– Plasmodium

• falciparum• falciparum

• vivax, ovale, malariae, (knowlesi)

• parasite protozoaire (embranchement apicomplexa)

Enjeux de la question

Embranchement des apicomplexa

mérozoïte

Enjeux de la question

Mérozoïte

Mérozoïte

Pénétration dans le globule rouge

Vacuole parasitophore

Mérozoïte

Globule rouge

Enjeux de la question

Aspect des globules rouges infectés

Enjeux de la question

• Le paludisme

– Fièvre, anémie (toutes les espèces)

– Atteinte grave d’organes (P. falciparum)

Hématie normale Hématie infectéeSphérique protrusions

Enjeux de la question

• Le paludisme

– Fièvre, anémie (toutes les espèces)

– Atteinte grave d’organes (P. falciparum)

• neuropaludisme• neuropaludisme

Enjeux de la question

• Traitement du paludisme à P. falciparum

– Chloroquine (CQ) (NIVAQUINE) : 1946

Généralités résistance

Résistance à la chloroquine chez P. falciparum

Généralités résistance

Résistance à la chloroquine chez P. falciparum

Résistance CQ détectée

Généralités résistance

• Résistances de P. falciparum :

– classification par rapport à CQ :

• classement des pays (1-2-3)

• recommandations de traitement (curatif / préventif)• recommandations de traitement (curatif / préventif)

• Traitement du paludisme à P. falciparum

– Chloroquine (CQ) (NIVAQUINE) : 1946

– Sufladoxine – pyriméthamine (SP)

Généralités résistance

Généralités résistance

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Généralités résistance

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance SP détectée

Généralités résistance

• Traitement du paludisme à P. falciparum

– Chloroquine (CQ) (NIVAQUINE) : 1946

– Sufladoxine – pyriméthamine (SP)

– Artémisinine combinée– Artémisinine combinée

Généralités résistance

Pourquoi étudier et connaitre les mécanismes des résistances ?

• pour détecter plus rapidement la résistance sur le terrain,

• pour améliorer les antipaludiques existants,

• pour aider au développement de nouveaux antipaludiques.

Résistance à la chloroquine

chez Plasmodium falciparum

Hémoglobine

Résistance chloroquine P. falciparum

Globule rouge = environnement hostile pour Plasmodium

Plasmodium falciparum

Résistance chloroquine P. falciparum

Globule rouge = environnement hostile pour Plasmodium

(Vacuole parasitophore)

Résistance chloroquine P. falciparum

Globule rouge = environnement hostile pour Plasmodium

Plasmodium falciparum

Résistance chloroquine P. falciparum

Globule rouge = environnement hostile pour Plasmodium

Plasmodium falciparum

(Vacuole digestive)

Résistance chloroquine P. falciparum

Globule rouge = environnement hostile pour Plasmodium

« The Big Gulp »

ProtéasesAcides Aminés

Résistance chloroquine P. falciparum

Globule rouge = environnement hostile pour Plasmodium

Acides Aminés

Hémoglobine

Hématine

Oxydation

Vacuole digestive

Globine

Hème

(Protoporphyrine Fe+++)

Toxique pour Plasmodium

Vacuole digestive

Résistance chloroquine P. falciparum

Globule rouge = environnement hostile pour Plasmodium

Hématine Hémozoïne

TOXIQUE

NON TOXIQUE

Cristal

insoluble

Vacuole digestive

Résistance chloroquine P. falciparum

Globule rouge = environnement hostile pour Plasmodium

Hématine Hémozoïne

TOXIQUE

Mécanisme d’action de la chloroquine ?

Vacuole digestive

Résistance chloroquine P. falciparum

Hématine HémozoïneChloroquine

Vacuole digestive

Résistance chloroquine P. falciparum

Mécanisme d’action de la chloroquine ?

Liaison directe ? OUI mais

CQ (1 mM) v. hématine (400 mM)TOXIQUE

Hématine HémozoïneChloroquine

Vacuole digestive

Résistance chloroquine P. falciparum

Mécanisme d’action de la chloroquine ?

TOXIQUE

Hématine HémozoïneChloroquine

HDP

HDP : Heme Detoxifying Protein

?

Vacuole digestive

Résistance chloroquine P. falciparum

Mécanisme d’action de la chloroquine ?

Hématine HémozoïneChloroquine

HémozoïneHématine

Adsorption sur

l’hémozoïne ?

– P. falciparum résistant CQ :

– + vérapamil : réversion résistance (sensible)

Résistance chloroquine P. falciparum

Hypothèse 1

– Réversion résistance cellules cancéreuses au

vérapamil

– Surexpression d’une glycoprotéine P

– Pompe à efflux « transporteur ABC » (ATP Binding

Résistance chloroquine P. falciparum

Hypothèse 1

– Pompe à efflux « transporteur ABC » (ATP Binding

Cassette)

– Pompe à efflux « transporteur ABC »

Résistance chloroquine P. falciparum

Hypothèse 1

D. transmembranaire

D. liant l’ATPATP ATP

Cellule cancéreuse résistante

Cellule cancéreuse sensible

– Pompe à efflux « transporteur ABC »

Résistance chloroquine P. falciparum

Hypothèse 1

ATP ATPAnti mitotique

Cellule cancéreuse résistante

Anti mitotique

Cellule cancéreuse sensible

– Pompe à efflux « transporteur ABC »

Résistance chloroquine P. falciparum

Hypothèse 1

Anti mitotique

Cellule cancéreuse sensible

– Pompe à efflux « transporteur ABC »

Résistance chloroquine P. falciparum

Hypothèse 1

ATP ATP

Anti mitotique

Cellule cancéreuse résistante

– « transporteur ABC » : Pgh1 (paroi vacuole digestive)

– = P. falciparum Multi Drug Resistance (PfMDR1)

Hypothèse 1

Résistance chloroquine P. falciparum

?

P. falciparum sensible CQ

P. falciparum résistant CQ

– « transporteur ABC » Pgh1

• non surexprimé en présence de CQ chez Pf R CQ

• mutations chez Pf R CQ = Pf S CQ (allèles)

Hypothèse 1

Résistance chloroquine P. falciparum

– « transporteur ABC » Pgh1

• mutations augmentent parfois la [CQ]VD

• taux pompage Pgh1 < diffusion passive CQ

Résistance à la chloroquine chez P. falciparum

Hypothèse 1

Résistance chloroquine P. falciparum

• gène muté PfMDR1 ne confère pas de R à Pf S

CQ

– « transporteur ABC » Pgh1

• Orientation vers vacuole digestive

Résistance à la chloroquine chez P. falciparum

Hypothèse 1

Résistance chloroquine P. falciparum

Hypothèse 1 rejetée

Le « transporteur ABC » Pgh1 codé par le gène

PfMDR1 n’est pas le facteur de résistance de P.

falciparum à la CQ

Hypothèse 1

Résistance chloroquine P. falciparum

falciparum à la CQ

– Régions génétiquement différentes (PfSCQ/PfRCQ)

Résistance à la chloroquine chez P. falciparum

Hypothèse 2

Résistance chloroquine P. falciparum

– Croisement gamète male et femelle (PfSCQ/PfRCQ)

– Sélection des PfRCQ en ajoutant CQ

– Etude de liaisons génétiques (marqueurs

polymorphiques)

Résistance à la chloroquine chez P. falciparum

Résistance chloroquine P. falciparum

Hypothèse 2

polymorphiques)

– Localisation d’une région de 36 Kb différente entre

PfSCQ et PfRCQ sur le chromosome 7 :

Résistance à la chloroquine chez P. falciparum

Résistance chloroquine P. falciparum

Hypothèse 2

Gène (protéine 424 AA)

7

36 Kb

Résistance à la chloroquine chez P. falciparum

Résistance chloroquine P. falciparum

Hypothèse 2

Etude des mutations dans le gène

R CQ

S CQ

Résistance chloroquine P. falciparum

Hypothèse 2

Etude des mutations dans le gène

S CQ (Soudan)

R CQ

S CQ

Résistance chloroquine P. falciparum

Hypothèse 2

Etude des mutations dans le gène

• Mutation K76T chez Pf S CQ :

⇒ devient résistante à la CQ⇒ devient résistante à la CQ

La résistance de P. falciparum à la CQ est due à la

mutation K76T dans le gène

Résistance chloroquine P. falciparum

S CQ

Mutation K76T = résistance CQ

Etude des mutations dans le gène

S CQ (Soudan)

R CQ

S CQ

D’autres mutation (mineures)

Limites GR

Limites VP

Résistance chloroquine P. falciparum

Localisation de la protéine

La protéine est localisée dans la membrane de la VD

Anticorps @ protéine

transmembranaire

Résistance chloroquine P. falciparum

Protéine transmembranaire

Cytoplasme P. falciparum

Vacuole digestive

Membrane VDMembrane VD

AA identiques (S/R)

AA différents (R)

Plasmodium falciparum Chloroquine Resistance

Transporter (PfCRT)

Résistance chloroquine P. falciparum

Dénomination gène / protéine

– La mutation acidifie la VD

– Favorise le flux de CQ hors de la VD ?

Résistance chloroquine P. falciparum

PfCRT et chloroquine

PfCRT K76 PfCRT T76 PfCRT T76

+ vérapamil

– Canal ou transporteur ?

Résistance chloroquine P. falciparum

PfCRT et chloroquine

– Parfois résistant à CQ

– Gène homologue à PfCRT : PvCRT

– Pas de mutation dans PvCRT chez Pv R CQ

– PvCRT non responsable de la R à CQ chez P. vivax

Résistance chloroquine P. falciparum

Et chez Plasmodium vivax ?

– PvCRT non responsable de la R à CQ chez P. vivax

Résistance à la pyriméthaminechez Plasmodium falciparum

– Utilise les bases puriques de l’être humain (AG)

– Synthèse de novo des bases pyrimidiques (CT)

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

Synthèse ADN / ARN chez P. falciparum

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

Synthèse des bases pyrimidiques

H. sapiens / P. falciparum

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

Synthèse des bases pyrimidiques

H. sapiens / P. falciparum

méthylation

mTHF DHFméthylène tétra hydro folate di hydro folate

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

Synthèse des bases pyrimidiques

H. sapiens

TS Thymidylate synthase

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

Synthèse des bases pyrimidiques

H. sapiens

mTHF DHF

TS

NADPH DHFR

tétra hydro folateTHF

di hydro folate

réductase

Thymidylate synthase

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

mTHF DHF

THF

NADPH

Résistance pyriméthamine P. falciparum

Synthèse des bases pyrimidiques

P. falciparum

mTHF DHF

DHFR

TS

Une seule et même enzyme bifonctionnelle

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

Mécanisme d’action de la pyriméthamine

mTHF

THFNADPH

PYR

P. falciparum

mTHFDHF

DHFR

TS

La pyriméthamine est un analogue structural du DHF (inhibition compétitive)

PYR

DHFR P. falciparum sensible : S108

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

Résistance à la pyriméthamine

DHFR P. falciparum résistant : N108

AA 108 dans le site actif

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

WRA P. falciparum SENSIBLE

Résistance pyriméthamine P. falciparum

Résistance à la pyriméthamine

Site actif DHFR

WRA

(analogue PYR)

NADPH

P. falciparum SENSIBLE

(S108)

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Diminution affinité P. falciparum RESISTANT

Résistance pyriméthamine P. falciparum

Résistance à la pyriméthamine

Site actif DHFR

Diminution affinité

pour WRA (PYR)

(mais pas pour DHF)NADPH

P. falciparum RESISTANT

(N108)N

• Mutation diminue affinité DHFR pour la pyriméthamine

Résistance pyriméthamine P. falciparum

Résistance à la pyriméthamine

Site actif DHFR

• Mutation diminue affinité DHFR pour la pyriméthamine

• DHF transformé en THF puis mTHF

• La synthèse de dTMP a de nouveau lieu

% de croissance cellulaire

100

P. falciparum

Fibroblaste humain

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

DHFR et pyriméthamine

50

Fibroblaste humain

Concentrations inhibitrices 50 (CI50)

0,1 nM 5 000 nM

WRA inhibe 50 000 fois plus la DHFR de Plasmodium

Concentration WRA

(PYR)

– Affinité PYR pour DHFR Plasmodium > affinité PYR

pour DHFR humaine ?

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

DHFR et pyriméthamine

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

DHFR et pyriméthamine

AA différents (H. sapiens / P. falciparum)

Affinité DHFR Plasmodium > affinité DHFR humaine ?

• Constantes d’inhibition réaction DHF – THT

identiques pour les deux DHFR

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

DHFR et pyriméthamine

Inhibition DHFR Plasmodium > DHFR humaine

n’est pas due à une différence d’affinité

En d’autres termes, la CI50 de la PYR devrait être la même

chez Plasmodium et l’Homme

Introduction du gène de la DHFR humaine dans P. falciparum

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

DHFR et pyriméthamine

100

% de croissance cellulaire

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

DHFR et pyriméthamine

P. falciparum

Fibroblaste humain

Concentration WR (PYR)

50

0,1 nM 5 000 nM

Concentrations inhibitrices 50 (CI50)

1000 nM

P. falciparum devient aussi « insensible » à la PYR que des cellules humaines

Fibroblaste humain

P. falciparum + DHFR humaine

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

traitement WRA traitement WRA

Résistance pyriméthamine P. falciparum

DHFR et pyriméthamine

sans

Quantité de DHFR produite

après

Plasmodium humaine Plasmodium humaine

1 2 3 4

1

6

36

La quantité de DHFR humaine est régulée

Elle s’adapte à la présence de PYR

– SANS PYR :

L’ARN messager de la DHFR est fixé sur l’enzyme DHFR (Homme et Plasmodium)

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

Régulation de la DHFR

(Homme et Plasmodium)

Absence traduction ARNm DHFR (rétro contrôle – )

– SANS PYR :

L’ARN messager de la DHFR est fixé sur l’enzyme DHFR (Homme et Plasmodium)

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

Régulation de la DHFR

(Homme et Plasmodium)

ARNm DHFR humaine fixé dans site actif protéine

ARNm DHFR Plasmodium pas fixé dans site actif

* *

Pyriméthamine et DHFR

– AVEC PYR chez l’Homme :

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

Régulation de la DHFR

Libération de l’ARNm DHFR humaine

Pyriméthamine et DHFR

– AVEC PYR chez l’Homme :

Résistance à la pyriméthamine chez P. falciparum

Résistance pyriméthamine P. falciparum

Régulation de la DHFR

Traduction ARNm DHFR humaine

Synthèse de DHFR et de dTMP

Quantité DHFR > capacité inhibition de la PYR

dTMP

Résistance pyriméthamine P. falciparum

– AVEC PYR chez Plasmodium :

Régulation de la DHFR

L’ARNm de la DHFR n’est pas libéré

La quantité d’enzyme DHFR Plasmodium n’augmente pas

DHFR Pf inhibibée totalement par PYR

Pas de dTMP synthétisé

dTMP

• Sulfadoxine (DHPS)

• Artémisinine (?)

Autres résistance chez P. falciparum

• Defining the role of PfCRT in Plasmodium falciparum chloroquine

resistance.

Bray, PG, et al. Molecular Microbiology 2005. 56(2):323-33.

• Divergent regulation of dihydrofolate reductase between malaria

parasite and human host.

Bibliographie du cours

parasite and human host.

Zhang, K., et al. Science 2002. 296(5567):545-7.

• When the host is smarter than the parasite.

Goldberg, DE. Science 2002. 296(5567):482-3.

• Organisation Mondiale de la Santé / Paludisme :

http://www.who.int/topics/malaria/fr

• Nations Unies « Faire reculer le paludisme »

http://www.rollbackmalaria.org/

Pour approfondir

http://www.rollbackmalaria.org/

• Fonds Mondial de Lutte contre le Sida, la Tuberculose et le Paludisme

http://www.theglobalfund.org/fr/

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