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A L I M E N T A T I O N
A G R I C U L T U R E
E N V I R O N N E M E N TLes Lundis de la SGQA – H. Larroque - 22/01/2007
Domaine expérimental du Pin-Au-Haras
Les expérimentations génétiques laitières
Y. Gallard, J. Vandenbrock (Le Pin)J.J. Colleau, D. Boichard, H. Larroque (SGQA)
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Détection de QTL dans un croisement Normand x Holstein
Races très différentes sur leur aptitude à produire, la qualité du lait, la morphologie, la mobilisation corporelle…
Dispositif F2• familles de pleines sœurs F2 de taille importante (pour des bovins) en recourant au transfert d’embryons
Le Pin5 - La thématique
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Reproduction et conduite du troupeau
Transfert d’embryons et sexage partiel (40 donneuses collectées 3 fois / an)
Les embryons: 1/3 transférés en frais, 1/3 sexés, 1/3 congelés
220 vêlages de receveuses, 120 premières lactations
Réforme lors de la 2ième ou au début de la 3ième lactation
Le Pin5 - La création des familles
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Le Pin5 - La création des familles
10 70F1 1- 4 F1 par F01995
1 F0 2- 4 F05 NO 12 PHF0
5 PH 13 NO
1993
691F2 10 F2 par F1 1997 - 2003
(3 à 21 pleines soeurs)
Fin des L1 fin 2006
Structure familiale finale
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Le Pin5 – Les mesures phénotypiques
• Quantité et composition du lait
• Microfabrication fromagère (40 l de lait) (A. Delacroix : UBLO - Jouy ) • Plasmine (D. Dupont : SRTL - Poligny)
• Composition en acides gras du lait, taille des globules gras (P. Faverdin, C.Hurtaud, UMR PL - Rennes)
• Métabolisme de la lactation, mobilisation corporelle (P. Faverdin: UMR PL - Rennes)
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Le Pin5 – Les mesures phénotypiques
• Mammites (J.C. Ogier: UBLO - Jouy )
• Reproduction, précocité, cyclicité post partum(P. Monget, J. Saumande: PRC - Nouzilly)
• Aptitude à la traite(P.G. Marnet: UMR PL - Rennes)
• Coloration(J.J. Lauvergne: UMR GDA - Jouy , A.Oulmouden: UMR GMA - Limoges)
• Pointage morphologique (UPRAs Prim’Holstein et Normande)
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Le Pin5 – Les marqueurs
Genome Scan : 169 marqueurs microsatellitesLABOGENA
LGBC
Typage des caséinesLGBC
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Le Pin5 – Les analyses
Une primo détection en 2004 (sur des caractères de production et de morphologie)
• Des phénotypes et des typages partiels
• Un test du logiciel d’analyse (QTLMAP) pour ce type de dispositif
• Des premiers résultats encourageants:Analyse du TB => ségrégation de DGAT1
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Le Pin5 – Les perspectives
• Une analyse complète qui démarre
• Poursuite des recherches sur les QTL
• Affiner la position et les effets de certains QTL
• Caractériser les QTL par une approche de génomique fonctionnelle
➟ Le Pin6: procréation de nouveaux individus F2 des mêmes familles puis production d’une génération « avancée »
➟ participation au projet Agenae: GenoMilkFat (GMF)
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Le Pin5 Le Pin6
La transition
• F2 encore vivantes insuffisantes
• Recréer des F2 hors protocole à partir d’un stock d’embryons congelés
➟ grandes familles de F2 bien caractérisées
• Création d’une génération supplémentaire: Mâle F1 X Femelle F2= « F3 »
• Calendrier:Campagnes 2003 2004 2005 2006 2007
Décongélation d ’embryons F25 familles Production d ’embryons F3
Procréation des F3
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GenoMilkFat: Projet GENANIMAL 2005 Porteur du Projet : Koenraad Duhem (CNIEL) Responsable scientifique : Patrice Martin (INRA-GPL)
Projet: GenoMilkFat
Biologie intégrative de la fonction mammaire et adaptabilité de la matière grasse laitière
Impact des facteurs génétiques et alimentaires sur les caractéristiques de la matière grasse laitière et sur les propriétés
techno-fonctionnelles des constituants du lait
Financement:Partenariat :
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Globule Gras
GénétiqueQTLs &
Polymorphismes
AlimentationFourrages
Supp. lipidique
Micelle de caséines
Génomiquefonctionnelle
Biologie cellulaire
Impact sur la composition du lait et sur les propriétés techno-fonctionnellesde ses constituants
BiochimieTechnologie
* Matière Grasse Laitière* * Acides Gras
MGL*TB, profil AG, …
Cellule épithélialemammaire
Globule Gras
GénétiqueQTLs &
Polymorphismes
AlimentationFourrages
Supp. lipidique
Micelle de caséines
Génomiquefonctionnelle
Biologie cellulaire
Impact sur la composition du lait et sur les propriétés techno-fonctionnellesde ses constituants
BiochimieTechnologie
* Matière Grasse Laitière* * Acides Gras
Globule Gras
GénétiqueQTLs &
Polymorphismes
AlimentationFourrages
Supp. lipidique
Micelle de caséines
Génomiquefonctionnelle
Biologie cellulaire
Impact sur la composition du lait et sur les propriétés techno-fonctionnellesde ses constituants
BiochimieTechnologie
* Matière Grasse Laitière* * Acides Gras
MGL*TB, profil AG, …
Cellule épithélialemammaire
Projet: GenoMilkFat
Le principe:
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Début 2007
Etude de l’effet du génotype sur l’activité du tissu mammaire
DGAT1 (GCGC) faibleDGAT1 (AAAA) fort
Juin 2007 Déc. 2007 Juin 2008 Déc. 2008
Etude de l’effet Génotype X Alimentation sur l’activité du tissu mammaireLe Pin Theix
Caractérisation phénotypique fine du lait
Choix des animaux
Projet: GenoMilkFat
Sur l’ensemble du troupeau en L1: camp 2005-2006-2007
8 paires de pleines soeurs
Génomique fonctionnelle: Analyse du Transcriptome et du Protéome
Le calendrier:
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Le Pin: un domaine en mutation
BORCULO:
un pôle viande
2006-2007 4 abrisréhabilitationautomatisation
2010-2011Réhabilitation hangars 1 et 2
2009Construction unité de contrôle aliment V.A
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ERMITE:
un pôle lait
2008Construction stabulation 80 V.L. (avec C.I.?)
Le Pin: un domaine en mutation
Une salle de traite commune
2 troupeaux:Elevage (UMRPL)Génétique (SGQA)
Des moyens en commun
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Le Pin: un domaine qui communique !
A vos agendas: prochaines Prairiales
Jeudi 14 Juin 2007 sur le site du domaine du Pin-Au-Harashttp://www.prairiales-normandie.com/index.html