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1MESOPATH- IM@EC and MESONAT registry, CHU, CAEN, Fra nce and 2PNSM, InVS, Saint Maurice, France.
MESOBANKBase Clinicobiologique Multicentrique à visée Nationale pour la recherche épidémiologique et translationnelle
dédiée au MésothéliomeRéunion du 17 juin 2012
F. Galateau-Sallé
• Objectifs et enjeux
• Réseau
• Activités
• Les bases de données
• Gouvernance
• Les difficultés à surmonter
Présentation réseau national , monothématique, multidisciplinaire
Sur le mésothéliome
BCB-Mesobankobjectifs et enjeux
1. promouvoir et optimiser les basesde données des 10 centres de ressources biologiques [CRB] des centres experts du réseau mésothéliome soutenus par l’INCa en une seule et unique base de donnée multicentrique à vocation nationale;
2. optimiser les études épidémiologiques initiées par le PNSM (Programme National de Surveillance du mésothéliome) et l’ISPED et en particulier optimiser les études concernant les mésothéliomes c/o la femme et c/o le sujet jeune;
3. développer des projets collaboratifs ambitieux exploitant le matériel collecté et visant à la découverte et la validation de nouveaux marqueurs de détection précoce (en collaboration avec le Panel International), marqueurs pronostiques;
4. Développer et potentialiser des projets collaboratifs pour la recherche translationnelle (IFCT)
5. permettre la mise en place de projets de grande ampleur en particulier dans le domaine de la génomique (séquençage d’exomes complets).
Principe de base de la BCB = modèle de la TVN PNES poumon
Identification du réseau
• Nom du réseau: MESOBANK
• Logo du réseau: en cours
• Date de création: 1998
• Thématique: ‘’Mésothéliomes malins pleuraux et tumeurs péritonéales rares’’
• Personne contact base de données: Nolwenn Le Stang
• Personne contact pour la collections d’échantillons: Gervais Clarebout
• Personne contact : Plateforme d’imagerie virtuelle et gestion informatique: Thomas Rousvoal
• Personne contact: Gestion qualité: Gaetane Blaizot
• Personne contact: chargée de coordination ressources biologiques du CNO: Charline Frandemiche
• Personne contact: coordination générale-saisie-administration-secrétariat: Adelaïde Obin; [email protected] tel: 0231064925
Réseau
Laboratoire d’Anatomie PathologiqueCHU DE CAENAvenue de la cote de nacre 14033 Caen cedex
Structure(s) administrative(s) de rattachement (employeur) en cas d’appartenance multiple, indiquer tous les organismes)(Intitulé/Adresse /Ville/ Code Postal)
33 2 31 06 44 0733 2 31 06 50 63
Téléphone :Fax
[email protected] électronique :
CNR MESOPATH Laboratoire d’Anatomie PathologiqueChu de Caen14033 Caen Cedex.France
Adresse de correspondance et lieu d’exercice :
Statut/Grade :
MESOBANK: a national multicentric clinicobiological database on mesothelioma for translational research.
Titre :
MrMmePRDrA cocher :
Galateau Sallé FrançoiseNom prénom :
Organisation du réseau
Coordonnateur
Organisation du réseauTutelle
Monsieur le Directeur Adjoint chargé de larecherche clinique et de l'innovationAdresse électronique [email protected]éléphone / Télécopie 02 31 06 48 52 / 47 70
Nom et prénom de la personne chargée du suivi administratif du dossier :Adresse de correspondance :e-mail :Téléphone :Fax :
Etablissement de santé publique261400931
Statut juridique :N°°°° SIREN :Comptable public (oui/non) :
CHU de CAENCHU DE CAENNom du représentant légal M. Angel PIQUEMAL –Directeur GénéralDirecteur général du CHU de CaenAvenue de la cote de nacre 14033 Caen cedex
Nom de l’organisme bénéficiaire de la subvention :Représentant légal (personne dûment habilitée)Nom prénom :(Titre et fonction):Adresse :
7
Besoin de création d’un consortium mésothéliome sur le modèle de la TVN poumon qui a supporté le Programme National d’Excellence sur le poumon [PNES] mis en place par l’INCa.
Pourquoi
-Car le mésothéliome est un enjeu de santé publique qui dépasse le cadre occupationnel et qui pose des problèmes majeures de détection précoce en vue d’un traitement efficace ( Dg trop tardif, accès difficile, Chimiothérapie peu efficace, tumeur très localisée ( chirurgie ou chimio local)
-Les thématiques?
-‘initiation et progression tumorale’
-‘Les femmes et les jeunes’
-Les réseaux?
-En France les travaux et l’effort de concertation développé par le réseau national mésothéliome
-PNSM
- Registre MESONAT
- CNR-MESOPATH
- Centre d’Excellence International-MESOPATH IM@EC
-Réseau RENAPE
- Ont permis de constituer un pôle de recherche à potentiel international
- en raison du potentiel d’inclusion des cas recensés
-Par impact de ces activités sur les efforts internationaux de détection précoce et de classification des mésothéliomes.
BCB- MESOBANKAccord de Consortium
Enregistrement National ContinuExhaustifDonnées nominativesStandardisées SécuriséesValidées
MissionsCertificationAmélioration des méthodes diagnostiquesIncidenceReconnaissance medicolégalePanel International
Depuis 1998
Partenariats du réseau
PNSM
=30 Membres
Partenariats du rPartenariats du rééseauseau
Registre MESONATRegistre MESONAT
Enregistrement
National
Continu
Exhaustif
Données nominatives
Standardisées
Sécurisées
Validées
= = 4 Membres+ R4 Membres+ Rééseau seau FrancimFrancim
Partenariats du rPartenariats du rééseauseau
CNR CNR MesopathMesopath
Enregistrement
National
Continu
Non exhaustif
Données nominatives
Standardisées
Sécurisées
Validées
InterconnectionInterconnection des bases des bases MESOPATH/MESONAT/MESOBANK/PNSM/MESOCLIN/RENAPEMESOPATH/MESONAT/MESOBANK/PNSM/MESOCLIN/RENAPE
= 20 Membres
Partenariats du réseauInternational Mesothelioma Excellence
Center MESOPATH IM@ECAllen TAllen TAttanoosAttanoos RRBrambillaBrambilla EEBorszuckBorszuck AACagleCagle PPChurgChurg AAColby TColby TDacicDacic SSFukuoka JFukuoka JGalateauGalateau Salle FSalle FGibbs AGibbs AHammarHammar SSHasletonHasleton PPHenderson DHenderson DHusainHusain AAInaiInai KKKerr KKerr KPopper HPopper HPraet MarlenePraet MarleneRoggliRoggli VVTravisTravis WDWDVignaudVignaud JMJM
Aut
res
rése
aux
22 Membres
Les autres rLes autres rééseauxseauxPartenaires nationaux
MESOCLIN réseau National de prise en charge des mésothéliomes pleuraux
Réseau Renape Réseau National de prise en charge des tumeurs rares du péritoine
Réseau Francim
ISPED Bordeaux
IIMTPIF
AFAQAP
IASLC
OMS
Partenaires locaux et régionaux
INSERM UMR 1086 Cancers et populations
Canceropole NO
Pr A. Elmoataz
RRééglesgles dd’’appartenance du rappartenance du rééseau BCB seau BCB
MESOBANK rMESOBANK réégie par la Gouvernancegie par la Gouvernance
•Modalités d’entrée
•Modalités de sortie
•Droits des membres des différentes catégories
•Devoirs des membres
•Mise en place d’une charte du réseau basée sur la charte du PNES poumon et de la TVN
GouvernanceConseil stratConseil strat éégiquegique
CoordonnateurCoordonnateurExperts des centres experts rExperts des centres experts r éégionauxgionaux
ReprRepr éésentant IFCTsentant IFCTReprRepr éésentants PNSMsentants PNSM
Coordonnateur MESOCLINCoordonnateur MESOCLINReprRepr éésentant de lsentant de l ’’ INCAINCA
ReprRepr éésentant rsentant r ééseau de cancseau de canc éérologie INCArologie INCAUne personnalitUne personnalit éé éétrangtrang èèrere
DirectoirePierre Hainault
Françoise Galateau –SalléReprésentant PNSM
Représentant réseau cancerologie
Responsable qualité
ARC
Experts des centres Référents locaux
17
•Rôle
• Décision de la stratégie scientifique
• Maintien de la sécurité du système et des bases de données
• Gestion de l’optimisation de la base de données
• Mise à disposition des données enregistrées
• Gestion des conflits
• Décisions budgétaires
• Acceptation de nouveaux entrants
• Validation de sortie d’un membre du réseau
• Surveillance des activités du réseau
Le comité stratégiqueConseil scientifique
CRB CRB pour le réseau
Réseau CRB-foie
Processus de réception
Processus de
conservation
Constitution de la base de données
Enregistrement des
Données selon le reglement
interieur
Constitution des collectionsdu Réseau
Valorisation des collections du Réseau et gestion des partenariats scientifiques
Mise à disposition externe
Mise à disposition interne
Gestion du réseau
Gestion des demandes
Management qualité Processus Management
Processus Réalisation
Maintenance Sys Informatique
Gestion financière
Gestion documentaire
Processus Support
CRB CRB pour le réseau
Réseau CRB-foie
Processus de réception
Processus de
conservation
Constitution de la base de données
Enregistrement des
Données selon le reglement
interieur
Constitution des collectionsdu Réseau
Valorisation des collections du Réseau et gestion des partenariats scientifiques
Mise à disposition externe
Mise à disposition interne
Gestion du réseau
Gestion des demandes
Management qualité Processus Management
Processus Réalisation
Maintenance Sys Informatique
Gestion financière
Gestion documentaire
Processus Support
Gestion BCB Modèle C.Degos
Budget détaillé
2012 2013 2014
OrganigrammeMESOPATH
MESOPATH France MESOPATH France F Galateau Salle- chair
TechniciansTechnicians immunoimmunoLeblanc SPetit MC
QualiticianBlaizot G
SecretarySecretary::Obin ALeval M
MESONATMESONATStatistician: N Le StangInvestigator: Blaizot G
monitoring of data: De Quillacq A
MESOPATH NRCMESOPATH NRCHead project Clarebout G
Monitoring of dataMonitoring of dataDe Quillacq AKaranian MSaguet V
MESOPATH PNSMMESOPATH PNSMMonitoring of dataMonitoring of data
De Quillacq APaciencia M
PLATFORMPLATFORMof of
Virtual Virtual slidesslidesEngineer: Rousvoual T
Planchard G
MESOBANKMESOBANKVirtual multicentricNational tissue bank
Phd Clarebout GIngeneer Abonnet V
Karanian M
IM@EC InternationalIM@EC InternationalF. Galateau-Salle -Chair
Researchers
Paciencia M
Brevet M
Karanian M
Saguet V
Planchard G
Lenouares C
Technicians Molecular
Ingeneer Abonnet V
Clinical ResearchAssistant
Chene Y
2009
MESOPATH-IM@EC
Galateau-Sallé
Centre de référence
Réseau MESOPATH
TOM:
• Nouméa Nouvelle Calédonie
AP-HP
Lyon
Bordeaux
Lille
Rouen
Marseille
Caen
Nantes
Grenoble
Nancy
Le Mans
Rouleau v
Abd –Alsamad ICapron FDanel CGroussard O
Foulet A-
Begueret H
de Lajarte Y
Brambilla E-Lantuejoul S
Copin MC
Garbe LGarcia S
Piquenot JM-
Vignaud JM
Sagan CThivolet F-
Rouquette I
Hoffman V
ToulouseToulouseNiceNice
0,3 ETPPU-PHCHU LYONTHIVOLET –BEJUI [email protected]
Equipe 9/Team 9Equipe Lyon
0,3 ETPMCU-PHCHU TOULOUSEDR I. [email protected]. MAZIERES
Equipe 10/Team 10Equipe TOULOUSE
0,3ETPMCU-PHCHU BORDEAUXISPED -LSTE
BEGUERET [email protected]. BROCHARDJP. MERLIO
Equipe 8/Team 8CHU BORDEAUX
0,3ETPMCU-PHCHU NantesINSERM U 892
SAGAN [email protected] 40 16 54 36M. GREGOIREL. CELLERIN
Equipe 7/Team 7CHU NANTES
VIGNAUD JEAN [email protected]. PARIS
Equipe 6/Team 6Equipe CHU NANCY
0,3ETPPU-PHINSERM région 21 et EA 4319
HOFMAN [email protected]. MARQUETTEN.VENISSACC. BONNETAUD
Equipe 5/Team 5Equipe NICE
0,3ETPPU-PHINSERM U774COPIN MARIE [email protected]
Equipe 4/Team 4Equipe LILLE
0,3ETPPU-PHCHU/UJF/INSERM U 823LANTUEJOUL [email protected] 4 76 76 73 77D. MOROT-SIBLOTP. LORIMIER
Equipe 3/Team 3CHU GRENOBLE
0 ,75 ETPDR INSERM UMR-S674JAURAND MARIE [email protected]+33 1 53 72 51 89PAIRON JCLe PIMPEC BARTHES
Equipe 2/Team 2PARIS IDF
0,3ETPPU-PHCHU CAENINSERM ERI3
Galateau Françoise [email protected] 31 06 44 07
Equipe 1/Team 1CHU CAEN
%Statut(b)
Affiliationprincipale(a)
TéléphoneE-mailNom prénom
13/06/2012 23
Projets de recherche : MESOBANK
1. WP 1- Grenoble- Altérations des gènes de réparation de l’ADN
2. WP2- Paris-Approches associant cultures primaires de cellules et prélèvements tumoraux
3. WP3- Nancy-SNIP et gènes de réparation de l’ADN
4. WP4-Lille- Stroma et environnement tumoral-immunité cellulaire
5. WP5-Nice- Détection et caractérisation des cellules circulantes par techniques Cell Search et ISET
6. WP6-Nantes-Validation de marqueurs solides (chimiokine CCL2, lectineet galectine)
7. WP7-Bordeaux- Constitution base clinico-biologique et épidémiologique du mésothéliome c/o la femme
8. WP8-Caen-Initiation et progression tumorale- marqueurs prédictifs de transformation et marqueurs pronostiques p16, NF2, cMet
9. WP9- Caen-Pierre Hainaut et Panel international - Hyperplasie mésothéliale atypique et P53
10.WP9-Lyon- implémentation base clinico-biologique
11. WP10-Toulouse- Constitution base clinico-biologique et épidémiologique du mésothéliome c/o la femme -
EpidEpid éémiologie INVSmiologie INVS --FrancimFrancim
1.1. IncidenceIncidence
2.2. Analyse de tendanceAnalyse de tendance
3.3. Analyse par rAnalyse par réépartition gpartition gééographiqueographique
FiliaireFiliaire de soins CNRde soins CNR --AFAQAPAFAQAP
1.1. Certification diagnostiqueCertification diagnostique
2.2. Evaluation des pratiquesEvaluation des pratiques
3.3. Contrôle qualitContrôle qualitéé techniquetechnique
Recherche acadRecherche acad éémiquemique UMRUMR--S 674 S 674 MC MC JaurandJaurand & D Jean& D Jean
1.1. CIT LNCC (CIT LNCC (transcriptometranscriptome))
2.2. CGH ARRAYCGH ARRAY
3.3. InstabilitInstabilitéé chromosomique et chromosomique et tumorigenicittumorigenicitéé sur des modsur des modèèles de les de souris souris immunodimmunodééficientesficientes
Recherche clinique
- A.Scherpereel Lille U-1019 et UMR 8161, IFR 114 et ERI 3 Caen, M Gregoire Nantes-UMR 892
1. HDAC inhibitors
2. Antiangiogéniques
3. PHRC National MESOTHEL [F. Galateau-Salle]
4. Biomarqueurs sériques ( mesothelin/calretinin/MPF)
5. PHRC National MAPS et BioMAPS[G. Zalcman]
6. Pharmacogénomique
Recherche clinique et de transfertRecherche clinique et de transfert --ERI3ERI3--IFR114IFR114 F. Galateau Sallé, G Clarebout, M Figeac, V Abonnet, G Levallet
1. Biomarqueurs prédictifs de transformation
2. Classification moléculaire courte longue survie ( p 53, délétion et méthylation de p16, NF2 [CGHArray/FISH/RTPCR/Séquençage, immunohistochimie]
3. CGH ARRAY -classification moléculaire-plateform Lille IFR 114
4. C-MET et phospho-c-MET
MESOBANK TVNMESOBANK TVN
Cellules, tissus, serum, ADN, ARN
Recherche Recherche MesonatMesonat
F. F. GalateauGalateau ––Salle, N Le Salle, N Le StangStang
Etude de survieEtude de survie
Analyse des formes inhabituellesAnalyse des formes inhabituelles
Facteurs pronostiquesFacteurs pronostiques-- 8 th TNM IASLC 8 th TNM IASLC CRAB CRAB projectproject
ERS facteurs pronostiquesERS facteurs pronostiques
MESOBANKActivitésBases de données
1. MESOPATH2. Application CCITI3. DATABIOTEC
4. MESOCLIN
26
-Repose sur l’existant: CRB ‘’mésothéliomes’’ AAP collections 2002
-‘’Pour le développement d’une collection de mésothéliomes pour l’étude phénotypique et l’analyse génomique de ces tumeurs’’
-MESOBANK a été initiée en 2002, sélectionnée et soutenue par le Ministère de la recherche et l’INSERM en mars 2002
- Regroupe:
- Le CRB :tumeurs solides: F. Galateau-Sallé ERI 3 INSERM situé à Caen.
- Le CRB: lignées cellulaires: MC. Jaurand UMR-S 674 Zucman Rossi Institut Jean Deaudet.
- Est constituée de 10 tumorothèques labéllisées INCa associées aux centres régionaux d’expertise.
-Regroupe tous les blocs d’inclusion en paraffine des cas signalés et certifiés du CNR MESOPATH
BCB-MESOBANK-TVN
27
Concerne les prConcerne les prééllèèvements suivantsvements suivants:- tous les prélèvements de Mésothéliome:
poumon, plèvre, péritoine, péricarde
- les pathologies pleurales cancéreuses
- les pathologies pleurales non cancéreuses
- les épanchements pleuraux
La congélation des prélèvements est effectuée dans toutes les TMTs selon les critères de qualité définis par le groupe de valorisation des ressources biologiques de l’INCA et recommandations de l’HAS;
Les tissus sains et tumoraux sont conservés à –80°C
Les collections ont été déclarées: DC-2008-586
Accord CNIL pour les prélèvements recensés au PNSM et à MESONAT
Accord CNIL en cours pour les prélèvements recensés dans le CNR MESOPATH
BCB-MESOBANK-TVN
Mesobankles pré-requis
Mes
oban
K
1. Critères de qualité mis en place par l’INCA (groupe de valorisation des ressources biologiques)
2. Certification de tous les cas de mésothéliomes signalés
3. Saisir les annotations minimales du catalogue INCA
3. Consentement signé ou de non opposition signé par le patient et le clinicien
4. Règles d’accès aux informations (CNIL, propriété intellectuelle des données, règles de confidentialité)
5. Procédure de rétrocession avec traçabilité (MTA)
6. Certification NFS 96 900
7. Charte de fonctionnement INCa-AFAQAP-Registres
Mét
hode
s Diagnostic du pathologiste initial
Trois experts relisent en aveugle les lames histologiquessans la connaissance de l’exposition à l’amiante ou des informations
cliniques
Diagnostic de mésothéliome Expertise collective mensuelle
(quorum 11 experts)
Accord Désaccord
Diagnosticde mésothéliome
exclu
Accord
Diagnostic de mésothéliome
Diagnosticde mésothéliome
exclu
Diagnosticde mésothéliome
incertain
Activités du réseauProcédure de certification du diagnostic
Anatomopathologique 95% des cas sont relus par cette procédure
Expertise clinique
Activités du réseau L’existant
Les données épidémiologiques
Année d’incidence
1998-2000
2001-2003
2004-2006
2007-2010
2011 Total
PNSMPlèvre
410 (47%)
544 (48%)
633 (50%)
976 (49%)
53 (47%)
2616 (49%)
CNRPlèvre
416 (47%)
530 (47%)
565 (45%)
933 (46%)
56 (50%)
2500 (46%)
Péritoine53
(6%)53
(5%)67
(5%)103 (5%)
3 (3%)
279 (5%)
Total 879 1127 1265 2012 112 5395
N mésothéliomes validés: bilan au 10 avril 2012
31
Activités du réseau mésothéliome
Gestion des échantillons
Sites participants
Actuellement 1253 prélèvements cryopréservés et 2810 blocs de paraffine constituent la MESOBANK
Répartition des prélèvements
Tumorothèque Responsable Nbre de prélèvements Congé lation depuis Accréditation SiteCaen Pr. F. Galateau Sallé 731 1990 NF-96-900 en cours
Paris Banque de cellules M.C. Jaurand 50 1988 NF-96-900 en cours Grenoble Pr. D. Moro-Sibilot 15 1990 iSO 9001et NF96-900 en 2008
Lille Pr. MC. Copin 116 2003 NF-96-900 en cours
Nice Pr. P. Hofman 71 2004 NF S96-900 depuis 2010
15189 en cours Nancy J. M. Vignaud 40 1989 ISO 9001 en 2008Nantes Pr. JF Mosnier 56 2004 NF-96-900 en cours
Bordeaux Pr. JF Merlio 40 2006 NF-96-900 en cours Lyon Pr. F.Thivolet-Bejui 29 2002 NF-96-900 en cours
Toulouse Dr. Gomez-Brouchet 105 2004 NF-96-900 en cours
Données hétérogènes d’un site à un autre à peaufiner car n=mésos certifiés MESOPATH ou non ? Données du catalogue INCA?
Etude de cohérence à prévoir (Frank Morin de l’IFCT)
n= cellules ? Tissu tumoral? Tissu sain?
13/06/2012 32
Nombre de prélèvements congelés susceptibles de rentrer dans la MESOBANK
Lyon
Bordeaux
Lille
Nantes
Caen
Paris banque de cellules
Grenoble
Nancy
Toulouse
Nice
La MESOBANK
TVNTVN--MESOBANKMESOBANK-- rrééferentielferentiel INCA spINCA spéécifique cifique mméésothsothééliomeliome
Gestion des annotations Gestion des annotations Identifiant patientIdentifiant patient
N°pt initial
N°pt expert
N°Mesopath
N°Mesoclin
N°Renape
PrPrééllèèvementvement
Cellules, Tissus, sérum, ADN etc..
Produits dérivés
ExpositionExposition
Amiante, Virus, Infection, fibres Amiante, Virus, Infection, fibres ccééramiques, nano particulesramiques, nano particules
TabacTabac
AntAnt ééccéédentsdents
CancerCancer
PresentationPresentation cliniqueclinique
PresentationPresentation radiologiqueradiologique
PresentationPresentation pleuroscopiquepleuroscopique
Facteurs de Facteurs de comorbiditcomorbiditééss
SuiviSuivi
Statut vital Statut vital
DteDte de dernide dernièères nouvellesres nouvelles
Le prLe pr ééllèèvementvement
NN°° du prdu pr ééllèèvement initialvement initialNN°° MESOBANKMESOBANK
Date Date CryopreservationCryopreservationDDéélai de lai de cryoprcryopr ééservationservation
Produits dProduits d éérivesrivesQtQtéé ADN/ARNADN/ARN
QualitQualit éé ARN/ADNARN/ADN
ContrContr öölele histologiquehistologiqueNNéécrose Fibrose tissu saincrose Fibrose tissu sain
IbncidentsIbncidents de congde cong éélationlation
Type cytologique/histologique Type cytologique/histologique TNM
Dg code ADICAP/ CIMDg code ADICAP/ CIM --O3O3
ImmunophenotypeImmunophenotypeBiologie molBiologie mol ééculaireculaireFISH p16, FISH p16, NF2, NF2, p53p53
TraitementTraitementChirurgie/Chirurgie/ pleurecctomiepleurecctomie //
chimiotherapiechimiotherapie //immunotherpieimmunotherpie
RecidivesRecidives
Identifiant patientIdentifiant patientN°pt initialN°pt expertN°Mesopath
NN°° du prdu pr ééllèèvement vement NN°° MESOBANKMESOBANK
Date Date CryopreservationCryopreservationDDéélai de lai de cryoprcryopr ééservationservation
Dg Type cytologique/histologiqueDg Type cytologique/histologiqueDg code ADICAP/ ICD0Dg code ADICAP/ ICD0
ImmunophenotypeImmunophenotypeBiologie molBiologie mol ééculaireculaireFISH p16, FISH p16, NF2, NF2, p53p53
TraitementTraitementChirurgie/Chirurgie/ pleurecctomiepleurecctomie //
chimiotherapiechimiotherapie //immunotherpieimmunotherpie
Activités du réseau Mésothéliome
Mes
oban
K
Les codes ADICAP/CIMO-3 du CRB de Caen sont issus des comptes rendus d’anatomie-pathologiques situés sous Diamic.
Hyperplasie mésothéliale
Mésothéliome malin
Mesotheliome bénin
720806756
90533M7P6
90523M7P4
90513M7P2
90503M7P0
90530M0P6
90520M0P4
90510M0P2
Code CIMO-3Code ADICAP
Acteurs impliquésCHU Caen; Groupe MESOPATH, service informatique
Réseau Mesopath ; Réseau national référent sur le mésothéliome
Réseau IMEC ; International Mesothelioma Excellence Center
CCITI; Centre Compétence International Tele Image
Leica Microsystems ; SCN400 – Scanner de lames
Medical records Mesopath applicationSlide identification
(2d barcode)
DigitalizationSlidesHes + IHC
Local Archiving
National Expertise
Quality check
Mesopath/expertise virtuelle en
production-juin 2011
Conservation de toutes les images scannées pour la MESOBANK
Bilan:
55O cas
4250 lames
4To de stockage
MESOPATH
https://mesopath-srv1.chu-caen.fr/mesopath/https://mesopath-srv1.chu-caen.fr/mesopath/
MESOPATH – Consensus 3 diagnostics
MESOPATH – CR des analyses
1h09 – 70 j
21 min – 8 j
Min-Max
21 jExpertise complète(délai entre arrivée du prél et fin d’expertise)
1,2J2nd Lecture
MoyenneDélais
Télé-expertise au 14/11/2011
MESOPATH – FRC- MESOCLIN
MESOPATH – FRC-MESOCLIN suite….,
Gestion des donnéesLes logiciels
•Logiciel: Databiotec
•Saisie des prélèvements et des échantillons
•Saisie des annotations cliniques: anatomopathologiques et biologiques
Gestion de la localisation du stockage (DATABIOTEC)
Gestion des donnéesLes logiciels
•Logiciel CCITI
•Base ACCESS MESOPATH
•Base ACCESS PNSM
•Logiciel DATABIOTEC
•Logiciel DIAMIC
Existant
MESOPATH
PNSM
DATABIOTEC
MESOCLIN
RENAPE
MESOBANK
suprabase
TVN meso
Taille de la base = 70 M
Outils: n de lignes attendues
(14000 dossiers patients, 1200 pts/an
DATA
TMT régionales
croisement annotations croisement annotations registre MESONAT, registre MESONAT, CNR MESOPATH, CNR MESOPATH, MESOCLIN et RENAPE MESOCLIN et RENAPE
Catalogue Catalogue INCaINCa + donn+ donnéées spes spéécifiques cifiques éétiologiques tiologiques mesomeso+ cliniques et th+ cliniques et théérapeutiquesrapeutiques
Affichage INCAAffichage INCA
Administration maintenance
Chercheurs
Export annotations
Plateforme WEB centrale pour la saisie des données
Droit d’accés selon le profil utilisateurs à définir
TVN –MESOBANK
Utilisation finale des données
DATA
• Suite Réseau
• Mise en place de la supra base BCB MESOBANK
• Coordination MESOCLIN
• Mise en place de la Charte de fonctionnement
Discussion, perspectives Questions à résoudre
� N. Le Stang
� V.Abonnet
� A. de Quillacq� C. Fleury
� A. Obin
� T Rousvoal� A. Jehan
� S. Leblanc
� S. Lecot-Cotigny� MC. Petit
� P. Brochard
� M.Goldberg� E.Imbernon
� M. Letourneux
� JC. Pairon� InVs, Hopital St Maurice
� I Abdalsamad
� E Brambilla
� H.Begueret� F Capron
� MC Copin
� AY Delajartre� A Foulet -Rogé
� L Garbe
� O Groussard� JM Piquenot
� F Thivolet
� JM Vignaud� Mesopath� TCBN- N.Rousseau
� C Frandemiche
o E; Brambilla
o P.Cagle (USA)
o Churg (Canada)
o T.Colby(USA)
o A.Gibbs (UK)
o S. Hammar(USA)
o P.Hasleton (UK)
o DW.Henderson (AUS)
o K.Inai (Japan)
o M.Praet (Belgium)
o V.Roggli(USA)
o W.Travis(USA)
o International mesothelioma panel
Acknowledgments
Merci
Questions?
Fin
