Dominique MornetAncien DR2CNRS,Webmaster de l’Unité :PhyMedExp,Université de Montpellier,Inserm U1046, CNRSUMR 9214,34295 Montpellier Cedex5, France.

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LU POUR VOUSPréclinique

L’importance du diagnostic génétique pour la dystrophiemusculaire de DuchenneDominique Mornet

RésuméLa dystrophie musculaire de Duchenne (DMD) et ladystrophie musculaire de Becker sont causées pardes mutations du gène DMD codant la dystrophine.Les grands réarrangements du gène de type délé-tions et/ou duplications sont les mutations les pluscommunes, même si des mutations ponctuelles exis-tent également. Selon les recommandationspubliées, il est important d’avoir un diagnostic exactpour l’accès à une prise en charge adaptée despatients et pour le planning familial. Avec l’émer-gence des thérapies mutation-spécifiques, un dia-gnostic moléculaire précis est maintenant égalementimportant pour évaluer si les patients sont éligiblespour ces traitements. Cette revue discute des diffé-rentes mutations DMD, des techniques diagnosti-ques disponibles pour faire un diagnostic génétiqueà des enfants suspectés d’être atteints de DMD etl’importance d’avoir un diagnostic génétique spéci-fique dans le contexte des thérapies génétiquesémergentes pour la dystrophie musculaire deDuchenne [1].

CommentaireIl est maintenant bien connu que le maintien del’intégrité de la fibre musculaire nécessite des pro-téines situées au niveau du sarcolemme. Ces pro-téines permettent un ancrage et une adhésion struc-turellement fonctionnels avec les fibres voisinesconduisant à une cohésion au sein d’un muscle pourla rendre capable de subir sans rupture les cycles decontraction-relaxation. Mais du côté interne cyto-plasmique de la fibre musculaire, où se situent lesfilaments épais qui glissent sur les filaments fins àl’origine des changements de volume de la fibre, desconnexions se produisent avec un ensemble de pro-téines qui transmettent à la membrane de la fibre lescontractions. Au centre d’un tel ensemble, on trouveune molécule essentielle, la dystrophine, qui va agircomme un amortisseur lors de la contraction desfibres musculaires.La séquence primaire de la dystrophine constituaainsi le premier succès de la génétique inverse àpartir de son gène (DMD) localisé sur le chromo-some sexuel X et qui occupe le locus p21. C’est uneséquence génomique qui couvre plus de 2,5 millionsde paires de bases (Mb), et la séquence codante quirésulte seulement de 79 exons se traduit par unARN-messager de 14 kilobases (kb) [2]. Il va alors

être possible, résultant directement d’une altération(mutation) de ce gène DMD, de diagnostiquer unedystrophie musculaire héréditaire grave, avec uneatrophie musculaire progressive (dystrophie muscu-laire de Duchenne, DMD). Une pathologie moinssévère qui apparaît souvent plus tardivement etconnaît une progression plus lente (dystrophie mus-culaire de Becker, BMD) peut également être dia-gnostiquée.

C’est pourquoi, comme cela est présenté en détaildans l’article en référence [1], même si parfois dansla littérature on trouve de nouvelles études qui pro-posent un diagnostic prénatal non invasif des dys-trophies musculaires de Duchenne et Becker endéveloppant par exemple un dosage haplotype [3],il est important de suivre à la lumière des récentesconnaissances un type de protocole bien standar-disé en vue d’un diagnostic precis. Un rapide aperçude ce protocole qui consiste en trois différentesétapes à suivre est ainsi établi pour réaliser unerecherche standard d’une mutation suspectée sur legène DMD.Comme la majorité des mutations détectables est engénéral obtenue avec la procédure dite par ligaturesmultiplex dépendantes de diverses sondes d’ampli-fication (MLPA, multiplex ligation-dependentprobe amplification) au niveau de l’ADN, cela seratoujours la première étape à effectuer. Toutefois unetechnique plus performante est également dispo-nible [4] et conduit à une identification précise d’unealtération du gène DMD dans 92 % des cas).Puis en seconde étape au vu du profil clinique unséquençage ciblé d’exon(s) sera parfois directementenvisagé. Une mutation est détectée, la dystrophi-nopathie est confirmée. Il faut alors suivre et utiliserla nomenclature standard décrite sur le site dugénome humain Variation Society (http://www.hgvs.org/mutnomen/), pour d’une part notifier leprofil porteur de la mère, et d’autre part inscrire lesite de mutation trouvé chez ce patient dans unregistre dédié.Si ces procédures ne donnent pas de résultat pouridentifier une mutation, une troisième étape pourraêtre programmée avec une biopsie musculaire pourévaluer si la dystrophine est bien localisée dans lesfibres musculaires (étude en Immunofluorescencesur coupe musculaire et analyse de la distributiontotalement et/ou partiellement membranaire) et en

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USCah. Myol. 2016 ; 13 : 70-73

© D. Mornet, publié par EDP Sciences, 2016

DOI : 10.1051/myolog/20161301170 No 13 JUIN 2016 Les cahiers de myologie

Cet article est distribué sous licence « Creative Commons » : http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.fr/,permettant une ré-utilisation du contenu sans restriction à condition de mentionner clairement la source.

estimer la quantité dans le tissu musculaire ainsi pré-levé (étude selon la technique de l’immuno-empreinte sur extraits des protéines du muscle per-mettant d’évaluer si la quantité de dystrophinedétectée est normale, anormale et/ou nulle). Selonle résultat, la détection de dystrophine est totale-ment normale et le diagnostic n’est pas une dystro-phinopathie, la présence de dystrophine est altérée(localisation et/ou quantité) et des études complé-mentaires sont nécessaires. Il faut alors engager uneanalyse de l’ARN pour tenter d’identifier la présenceéventuelle d’un exon cryptique en raison d’unemutation intronique.Cependant, même si cette option n’est présentéequ’en 3e choix par Aartsma-Rus et al. [5], la biopsieest toujours informative. Elle a l’avantage de proposerun matériel susceptible de fournir une réponse rapidesur la présence et/ou l’absence de dystrophine dans lemuscle. De plus, la large panoplie d’anticorps spécifi-ques actuellement disponible va permettre un

dépistage précis de la dystrophine (localisation et/ouquantité) et donc fournir une aide précieuse pourorienter une observation clinique vers un ciblage pré-férentiel sur un ou plusieurs exons à séquencer.En bilan de cette analyse, il s’avère important queles patients soient identifiés le plus tôt possible pourexaminer tous les traitements potentiellement effi-caces au début de l’évolution de la maladie pour unmeilleur bénéfice. En moyenne, actuellement, lespatients sont en général diagnostiqués à l’âge de4,1 ans.Pour conclure, ce travail indique qu’avec les nou-velles thérapies génétiques qui font leur apparition,on pourrait bientôt envisager d’offrir le dépistagenéonatal pour la DMD.

Preclinical studies

LIENS D’INTÉRÊTL’auteur déclare n’avoir aucun lien d’intérêt concernant lesdonnées publiées dans cet article.

RÉFÉRENCES1. Aartsma-Rus A, Ginjaar IB, Bushby K. The importance of genetic diagnosis for Duchenne muscular dystrophy. J Med Genet2016 ; 53 : 145-51.2. Koenig M, Monaco AP, Kunkel LM. The complete sequence of dystrophin predicts a rod-shaped cytoskeletal protein. Cell 1988 ;53 : 219-28.3. Parks M, Court S, Cleary S, et al. Non-invasive prenatal diagnosis of Duchenne and Becker muscular dystrophies by relativehaplotype dosage. Prenat Diagn 2016 Jan 29. doi : 10.1002/pd.4781.4. Okubo M, Minami N, Goto K, et al. Genetic diagnosis of Duchenne/Becker muscular dystrophy using next-generation sequencing :validation analysis of DMD mutations. J Hum Genet 2016 Feb 25. doi : 10.1038/jhg.2016.7.5. Aartsma-Rus A, Ginjaar IB, Bushby K. The importance of genetic diagnosis for Duchenne muscular dystrophy. J Med Genet2016 ; 53 : 145-51.

Une stratégie de délétionCRISPR-Cas9 unique ciblantlamajorité des patients DMD rétablit la fonctionde la dystrophine dans les cellulesmusculaires dérivéesde cellules hiPSDominique Mornet

RésuméLes mutations du gène DMD perturbent le cadre delecture, empêchent la traduction de la dystrophine,et conduisent à la dystrophie musculaire deDuchenne (DMD). Les auteurs décrivent ici une stra-tégie CRISPR/Cas9 applicable à 60 % des patientsporteurs de mutations DMD. Ils ont appliqué cettestratégie à des cellules dérivées de cellules hiPS depatients DMD où la délétion jusqu’à 725 kb du gèneet la jonction des extrémités non-homologues ontréussi à remettre en phase le cadre de lecture dugène DMD. À ce jour, ceci est la plus grande

délétion obtenue par la technique CRISPR/Cas9pour le gène DMD. L’utilisation de cellules hiPS apermis l’évaluation de la dystrophine dans des typescellulaires appropriés de la maladie. Les cardiomyo-cytes et les myotubes dérivés de lignes clonales hiPSexpriment une dystrophine corrigée. La dystrophineportant cette délétion en phase est fonctionnellecomme démontré in vitro et in vivo par l’améliora-tion de l’intégrité membranaire et la restauration ducomplexe des glycoprotéines lié à la dystrophine.En outre, l’expression du micro ARN miR31 estréduite après « rephasage » du cadre de lecture,

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comme cela est observé dans les dystrophies mus-culaires de Becker. Ce travail démontre la faisabilitéde l’utilisation d’une seule paire CRISPR pour cor-riger la phase de lecture pour une majorité depatients DMD [1].

CommentaireDès 2002 [2], on trouve dans la littérature la des-cription d’une nouvelle méthode simple pourdépister les mutations, délétions, duplications sousle terme de MLPA (multiplex ligation probe ampli-fication) au niveau d’un gène. Rapidement laméthode est exploitée et parmi les gènes cibles seraabordée dix ans plus tard l’étude du gène DMD dontle détail est donné dans le travail en référence [3]C’est cette première étape qui va permettre, selonle type d’altérations détectées au sein de la dystro-phine, d’envisager une éventuelle thérapie géniquechez le patient atteint de dystrophinopathie. Maiscomme cette technique ne permet en fait de détecterqu’environ 70 % des altérations sur le gène DMD,il est récemment proposé d’utiliser une techniqueplus performante [4], qui conduit à une identificationdans 92 % des cas).Par ailleurs, dans le domaine de la régénération/réparation d’un tissu comme le tissu musculaire onavait conscience de la présence des cellules satellitesque l’on considère comme les cellules souches dumuscle. Cependant, l’existence d’un nouveau typede cellules souches est par la suite révélée : les sou-ches pluripotentes induites (iPS). Ces cellules se dis-tinguent des cellules souches standards (ES) car ellespeuvent être directement obtenues par transductiontransitoire avec un cocktail de facteurs de transcrip-tion à partir des fibroblastes d’un donneur [5].Cette étape va en effet permettre l’isolement de cel-lules iPS provenant d’un patient, pour servir desource précieuse dans l’étude de la maladie dont ilest affecté et/ou évaluer l’efficacité de divers médi-caments. Néanmoins, de telles cellules peuvent éga-lement être utilisées pour une médecine régénéra-tive. Cependant, l’absence d’une méthode demodification génomique efficace à l’exception desinsertions de gènes par des vecteurs viraux limitadans un premier temps leur utilisation.L’émergence de nouvelles technologies d’édition dugénome va alors grandement faciliter la possibilitéde corriger des altérations génomiques au niveau descellules iPS humaines comme l’indique avec unenouvelle technique prometteuse récemment pro-posée par Li et al. [6] Cette technique permet une

correction précise d’une altération génétique en uti-lisant le système CRISPR-Cas9, et peut s’appliquerchez l’homme à partir de la nouvelle source de cel-lules souches dites induites iPS provenant d’unpatient donneur.Dans les travaux présentés par Young et al. [1], lesauteurs démontrent et illustrent dans plusieursschémas récapitulatifs la possibilité d’utiliser uneunique paire de répétitions palindromiques courtesrégulièrement espacées de nucléotides en l’associantà l’endonucléase Cas9 (CRISPR/Cas9) pour cor-riger le cadre de lecture dans la majorité des cas depathologie DMD.Une telle stratégie est applicable chez environ 60 %de la population des patients atteints de dystrophi-nopathie. Ce sera donc une stratégie personnaliséepuisqu’elle va tenir compte du type de mutation/délétion que possède le gène DMD du patient consi-déré. Selon le type de délétion/mutation présent ausein du muscle du patient DMD, il est possible, avecle protocole suggéré par Young et al. [1], de sup-primer en une seule étape une zone comprise entreles exons 45 et 55. La méthode va permettred’obtenir une dystrophine dont une portion interneest absente et de réaliser une élimination personna-lisée, par exemple de l’exon 46 à 51, ou aumaximum une lecture directe sautant de l’exon 44vers l’exon 56, comme cela a été observé avec ladétection d’une mini-dystrophine tronquée d’originenaturelle chez un patient qui ne présentait qu’unprofil bénin d’une dystrophie musculaire de Becker(BMD).En outre, dans ce travail [1], les auteurs observentune restauration d’une dystrophine tronquée asso-ciée avec le bêta-dystroglycane in vivo après unegreffe de cellules musculaires dérivées de celluleshiPSC appliquée chez le modèle murin de la DMD.Un schéma général récapitulatif des diverses étapesmentionnées plus haut est proposé par les auteurs.Il suggère qu’une application à l’homme pourrait-être prometteuse car elle conduira à une améliora-tion de la qualité de vie du patient DMD vers le statutmoins sévère de patient BMD. Ajoutons qu’une tellestratégie si elle est applicable dans le cadre de laDMD elle peut s’appliquer efficacement dans le casde la FSHD [7].

Preclinical studies

LIENS D’INTÉRÊTL’auteur déclare n’avoir aucun lien d’intérêt concernant lesdonnées publiées dans cet article.

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RÉFÉRENCES1. Young CS, Hicks MR, Ermolova NV, et al. A single CRISPR-Cas9 deletion strategy that targets the majority of DMD patientsrestores dystrophin function in hiPSC-derived muscle cells. Cell Stem Cell 2016 Feb 10. pii: S1934-5909(16)00022-9.2. Schouten JP, McElgunn CJ, Waaijer R, et al. Relative quantification of 40 nucleic acid sequences by multiplex ligation-dependentprobe amplification. Nucleic Acids Res 2002 ; 30 : e57.3. Verma PK, Dalal A, Mittal B, Phadke SR. Utility of MLPA in mutation analysis and carrier detection for Duchenne musculardystrophy. Indian J Hum Genet 2012 ;18 : 91-4.4. Okubo M, Minami N, Goto K, et al. Genetic diagnosis of Duchenne/Becker muscular dystrophy using next-generation sequencing:validation analysis of DMD mutations. J Hum Genet 2016 Feb 25. doi: 10.1038/jhg.2016.7.5. Takahashi K, Tanabe K, Ohnuki M, et al. Induction of pluripotent stem cells from adult human fibroblasts by defined factors. Cell2007 ; 131 : 861-72.6. Li HL, Gee P, Ishida K, Hotta A. Efficient genomic correction methods in human iPS cells using CRISPR-Cas9 system. Methods2015 Oct 23. pii : S1046-2023(15)30133-X.7. Himeda CL, Jones TI, Jones PL. Scalpel or straitjacket : CRISPR/Cas9 approaches for muscular dystrophies. Trends PharmacolSci 2016 Feb 22. pii: S0165-6147(16)00025-0.

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