Microbiologie · 2020. 6. 25. · Microbiologie. n . Programme Réf.: BAC.W 149. n Objectifs. Remise à niveau des connaissances de bases en bactériologie médicale Conduite et interprétation

Microbiologie

n Bactériologie

BAC.W Pratique journalière en Bactériologie - Remise à niveau 149

BAC.IL Antibiogramme - Module de Base 150

BAC.I Lecture interprétative de l’antibiogramme - Initiation 151

BAC.J Analyse interprétative de l’antibiogramme et résistances bactériennes 152

BAC.BL Détection des mécanismes de résistance aux ß-lactamines chez les bacilles à Gram négatif : de la théorie à la pratique 153

BAC.O Les bactéries anaérobies dans un laboratoire de microbiologie médicale 154

BAC.POU Microbiologie des prélèvements broncho-pulmonaires 155

BAC.MB Mycobactéries et actinomycètes aérobies 156

BAC.G Diagnostic bactériologique des infections génitales chez la femme et des infections du nouveau-né 157

BAC.IST Infections sexuellement transmises 158

n Parasitologie

PAR.H Parasitologie générale 159

PAR.PM Parasitologie médicale 160

PAR.E Techniques journalières en parasitologie intestinale 161

n Mycologie

MYC.C Techniques journalières en mycologie 162

MYC.H Diagnostic des dermatophytoses - Épidémiologie, Clinique, Prélèvements, Examen direct, Isolement et Identification 163

n Virologie

WHSV1 Aéro-biocontaminations et flore fongique atmosphérique 164

VIR.E Virus émergents et réémergents - Approche par la biologie moléculaire et autres techniques de diagnostic 165

BP.I1 Rôle du laboratoire dans le diagnostic des infections virales - Les hépatites virales 166

VIR.A Surveillance des traitements anti-viraux Application au traitement du VIH et des hépatites B et C 167

Microbiologie

n Programme

BAC.WRéf. :

149

n Objectifs

Remise à niveau des connaissances de bases en bactériologie médicaleConduite et interprétation de l’examen bactériologique des principaux produits pathologiques

n Prérequis

Techniques usuelles de Bactériologien Public

Technicien

Durée

LieuFACULTÉ DE PHARMACIE75006 PARIS

Intervenants Pr F. BARBUTPr J. AIRESDr J. COUTURIER

NotesRemise de documentation et support de cours.Outils pédagogiques : Vidéo, Vidéoprojection.Validation des acquis par test QCM/QROC et Quiz.Durée journalière habituelle de formation : 7 h.

Heure de début 1er jour : 10h Heure de fin dernier jour : 16h

PédagogieThéorie 50% - TP 20% - TD 30%

3 jours 21 h

Coût (net)1 350 e

BACTÉRIOLOGIE

Rappels des connaissances de base en bactériologique médicale et actualitésRappels des connaissances de base en bactériologie médicale et actualitésRappels sur l’identification bactérienne classique Les nouvelles méthodes d’identification bactérienne et leur place : biologie moléculaire et spectrométrie de masseL’approche syndromique : intérêts, limitesRappels sur l’étude de la sensibilité aux antibiotiques, méthodes récentes

Examen cyto-bactériologique des produits pathologiques suivants :- E.C.B.U.- Coprocultures- Hémocultures- L.C.R. et autres liquides d’épanchement- Examen cytobactériologique des expectorations (E.C.B.C)- Prélèvements génitaux- Suppurations

Pour chacun de ces examens seront vus :- la conduite de l’examen- les principales bactéries rencontrées- l’interprétation des résultats

Les bases pour la reconnaissance et la différenciation des cristaux observés au cours des E.C.B.U. sont abordées dans le stage CRI.2 (section Biochimie)

SessionDu 15 au 17/09/21

Tél. : 01 42 15 20 31 - Organisme n°11 75 36 54 975 - www.bioformation.orgBIOFORMATION - 309/315, rue Lecourbe 75015 Paris BIOFORMATION - 309/315, rue Lecourbe 75015 Paris

Pratique journalière en BactériologieRemise à niveau

n Programme

BAC.IL Réf. :

150

n Objectifs

Connaître la classification des antibiotiques, leur mode d’actionComprendre les principaux mécanismes de résistanceMaîtriser les différentes techniques de réalisation des antibiogrammesComprendre et savoir interpréter un résultat d’antibiogramme pour les espèces les plus couramment isolées au laboratoire

n Prérequis

Connaissances de base en microbiologien Public

Technicien, Cadre, Biologiste, Ingénieur, Chercheur

Durée

LieuHOSPICES CIVILS DE LYONUNIV. LYON 1 - 69000 LYON

Intervenants Pr F. LAURENT Dr A. CARRICAJODr C. ROURE Dr C. DUPIEUX-CHABERTDr L. POIREL Dr P. VERHOEVEN

NotesRemise de documentation et support de cours.Outils pédagogiques : Vidéoprojection.Validation des acquis par test QCM/QROC.Durée journalière habituelle de formation : 7 h.


PédagogieThéorie 50% - TD 50%

5 jours 32 h 30

Coût (net)1 680 e

BACTÉRIOLOGIE

ThéorieQu’est-ce qu’un antibiotique et quelles sont les différentes familles ?

Modes d’action des antibiotiques

Mécanismes de résistance des bactéries aux antibiotiques

Différentes techniques d’antibiogramme- Principes- Intérêts- Limites- Critères de choix- Automatisation

Qualitologie et antibiogrammes

Travaux pratiquesAnalyse des antibiogrammes des espèces les plus couramment isolées au laboratoire- Staphylococcus sp.- Streptococcus sp.- Enterococcus sp.- Pneumocoque- Entérobactéries- Pseudomonas aeruginosa- Haemophilus sp.- Branhamella catharralis-- Neisseria sp.

Interprétation des phénotypes de résistance observés

Antibiogrammes complémentaires



AntibiogrammeModule de Base

n Programme

BAC.IRéf. :

151

n Objectifs

Maîtrise des connaissances théoriques nécessaires à la réalisation et à l’interprétation de l’antibiogramme (méthode en diffusion uniquement, disques)Initiation à la lecture interprétative de l’antibiogramme Maitrise des phénotypes de résistance naturelle des principales bactéries d’intérêt médicale Initiation à la lecture interprétative des phénotypes de résistance acquise

n Prérequis

Connaissances de base en BactériologiePratique de l’antibiogramme en milieu géloséConnaissance des antibiotiques et des familles d’antibiotiquesConnaissance des recommandations du Eucast Comité de l’Antibiogramme de la Société Française de Microbiologie de l’année en cours (http://www.sfm-microbiologie.org)

n Public

Technicien, Biologiste, Enseignant

Durée

LieuBIOFORMATION 75015 PARIS

Intervenants Dr V. LALANDEDr D. DECREet collaborateurs

NotesStage recommandé en aval : BAC.J.Remise du support de cours et d’un polycopié d’exercices d’interprétation.Outils pédagogiques : Vidéoprojection.Validation des acquis par test QCM/QROC.Durée journalière habituelle de formation : 7 h.

Heure de début 1er jour : 9h Heure de fin dernier jour : 15h30


4 jours 25 h

Coût (net)1 550 e

BACTÉRIOLOGIE

Notions théoriques sur l’antibiogramme par diffusion

Mécanismes de résistance aux antibiotiques des bactéries

Lecture et interprétation des phénotypes de résistance naturelle et acquise (les plus fréquents) des groupes bactériens suivants :- Staphylococcus aureus- Streptocoques et Entérocoques- Entérobactéries



Lecture interprétative de l’antibiogramme Initiation

n Programme

BAC.JRéf. :

152

n Objectifs

Maîtriser les mécanismes de résistance des principales espèces bactériennesChoisir judicieusement les antibiotiques à tester, les tests de dépistageConditions de réalisation adaptées et interprétation de la détermination de la sensibilité aux antibiotiques par la méthode des disquesLecture interprétative de l’antibiogramme des principales espèces bactériennes

n Prérequis

Connaissances de base sur les antibiotiques et les mécanismes de résistance ou avoir suivi un stage d’initiation à l’antibiogramme

n Public

Technicien, Biologiste

Durée

LieuFACULTÉ DE MÉDECINE BICHAT75018 PARIS

Intervenants Dr L. LANDRAUDÉquipe Biologique du laboratoire de Microbiologie - Hôpital Louis Mourier

NotesRemise de documentation et support de cours.Outils pédagogiques : Vidéoprojection.Validation des acquis par test QCM/QROC et lecture d’antibiogramme.Durée journalière habituelle de formation : 7h.


PédagogieThéorie 60% - Démo 30% - Étude de cas 10%

4 jours 29 h

Coût (net)1 580 e

BACTÉRIOLOGIE

Les principales causes d’erreurs de l’antibiogramme

Les mécanismes de résistance aux antibiotiques Résistance naturelleRésistance acquise

L’antibiogramme et son interprétation en fonction des phénotypes de résistance :- Staphylocoques- Streptocoques- Entérocoques- Entérobactéries

- Pseudomonas- Acinetobacter, Neisseria, Haemophilus- Campylobacter

Épidémiologie de la résistance

Systèmes experts : Intérêt en pratique



Analyse interprétative de l’antibiogramme et résistances bactériennes

BACTÉRIOLOGIE

n Programme

BAC.BLRéf. :

153

n Objectifs

Maîtriser les mécanismes de résistance aux ß-lactamines des bacilles à Gram négatifChoisir judicieusement les antibiotiques à tester, les tests de dépistagesConditions de réalisation adaptées et interprétation de la détermination de la sensibilité aux ß-lactamines par la méthode des disquesConnaitre et pratiquer les tests d’identification des mécanismes de résistance aux ß-lactamines des entérobactéries (ß-lactamases à spectre étendu et carbapénèmases)

n Pré-requis

Connaissances de base sur les antibiotiques et les mécanismes de résistance ou avoir suivi un stage d’initiation à l’antibiogramme

n Public


Durée


Intervenants Dr L. LANDRAUD Equipe Biologique du laboratoire de Microbiologie - Hôpital Louis Mourier

NotesRemise de documentation et support de cours.Outils pédagogiques : Vidéoprojection.Validation des acquis par test QCM/QROC et synthèse de résistance.Durée journalière habituelle de formation : 7 h.


PédagogieThéorie 50% - TP 40% - Étude de cas 10%

2,5 jours 18 h

Coût (net)1 100 e

Les principales causes d’erreur de l’antibiogramme

Les mécanismes de résistance aux ß-lactamines- Résistance naturelle- Résistance acquise

L’antibiogramme et son interprétation en fonction des phénotypes de résistance :- Entérobactéries- Pseudomonas- Acinetobacter

Tests d’identification des mécanismes de résistance : théorie et pratique- ß-lactamases- carbapénèmase



Détection des mécanismes de résistance aux ß-lactamines chez les bacilles à Gram négatif : de la théorie à la pratique

BACTÉRIOLOGIE

n Programme

BAC.ORéf. :

154

n Objectifs

Connaître les bactéries anaérobies strictes commensales du microbiote humainConnaitre la pathogénicité des bactéries anaérobies strictesSavoir identifier les principaux genres anaérobies stricts rencontrés en bactériologie médicaleConnaitre et savoir étudier la sensibilité des bactéries anaérobies strictes aux antibiotiques

n Prérequis

Bonnes connaissances des manipulations en microbiologien Public


Durée


Intervenants Pr F. BARBUT Pr M.-J. BUTELDr A.-J. WALIGORA-DUPRIETDr L. FERRARIS

NotesRemise de documentation et support de cours.Outils pédagogiques : Microscope couplé à une caméra, Vidéoprojection.Validation des acquis par test QCM/QROC et Quiz.

Heure de début 1er jour : 9h00 Heure de fin dernier jour : 17h

PédagogieThéorie 65% - Démo 25% - Étude de cas / TD 10%

3 jours 21 h

Coût (net)1 350 e

Les bactéries anaérobies strictes commensalesHabitat, composition, fonctions

Les bactéries anaérobies strictes pathogènesPrincipales pathologies dues aux bactéries anaérobies : suppurations, abcès, pathologies spécifiques…Quand rechercher des bactéries anaérobies dans un prélèvement de bactériologie médicale ?Techniques d’isolement, anaérobiose, milieux

Généralités sur l’identification des principales espèces impliquées en pathologie - microgaleries d’identification : intérêt et limites- autres tests utiles- place de l’identification par des techniques de biologie

moléculaire- identification par spectrométrie de masse, intérêt et limites

Pouvoir pathogène, isolement, identification des principaux genres anaérobies stricts - bacilles à gram positif sporulés : Clostridium, Clostridioides- bacilles à gram négatif : Bacteroides, Prevotella,

Porphyromonas, Fusobacterium - bacilles à gram positif non sporulés- cocci à gram positif et négatif

Étude de la sensibilité aux antibiotiques Quand faire un antibiogramme : intérêt, limitesComment réaliser un antibiogramme ?Le point sur la sensibilité des anaérobies



Les bactéries anaérobies dans un laboratoire de microbiologie médicale

BACTÉRIOLOGIE

n Programme

BAC.POURéf. :

155

n Objectifs

Connaître la flore rhino-bucco-pharyngée et les écosystèmes bactériens, les différents types de prélèvements, les bactéries, virus et champignons impliquées dans les infections broncho-pulmonairesConnaître les techniques de diagnosticSavoir interpréter les résultats en faisant une analyse critique SAUF Tuberculose et mycobactéries atypiques

n Prérequis

Connaissance de base en biologien Public

Technicien, Biologiste, Enseignant

Durée


Intervenants Dr C. DUPIEUX Pr F. MORFINPr F. LAURENT Pr M. WALLON Dr G. DESCOURS



PédagogieThéorie 80% - TD 10% - Étude de cas 10%

2 jours 15 h

Coût (net)980 e

Généralités sur les infections broncho-pulmonaires- la muqueuse respiratoire- la physiopathologie des infections pulmonaires

Les différents types de prélèvements- Crachats- Aspiration bronchique- Prélèvement distal protégé- Brossage bronchique- Lavage broncho-alvéolaire- Ponction

Les bactéries de la sphère rhino-bucco-pharyngée et les écosystèmes bactériens à l’état normal

Étude des bactéries/virus/champignons isolées le plus fréquemment au cours des infections broncho-pulmonaires

Approches diagnostiques conventionnelles : examen direct, culture

Approches moléculaires et syndromique

Mise en évidence des principales résistances aux antiinfectieux

Étude de dossiers

Évaluation - Conclusion



Microbiologie des prélèvements broncho-pulmonaires

n Programme

BAC.MBRéf. :

156

n Objectifs

Connaître les caractéristiques cliniques et épidémiologiques de la tuberculose, des infections à Mycobactéries atypiques et à actinomycètes (Nocardia, Rhodococcus, Streptomyces, ...)Maîtriser la démarche diagnostique et la place des différentes techniques utilisées dans le cadre de ces infections (méthodes conventionnelles et moléculaires) Connaître les différentes méthodes d’antibiogramme et l’épidémiologie des résistances de ces micro-organismes Être sensibilisé à la prévention et la législation concernant ces pathologies

n Prérequis

Connaissances de base en microbiologien Public


Durée


Intervenants Pr F. LAURENT Dr M. DUMITRESCUDr A. CARRICAJO Dr P. VERHOEVENDr V. RODRIGUEZ-NAVA



PédagogieThéorie 80% - Étude de cas 20%

4 jours 25 h 30

Coût (net)1 550 e

BACTÉRIOLOGIE

Mycobacterium tuberculosisÉpidémiologiePhysiopathologie et caractéristiques cliniquesDémarche diagnostiqueTraitementPréventionLégislation

Mycobatéries atypiques, Nocardia et autres actynomycètesÉpidémiologiePhysiopathologie et caractéristiques cliniquesDémarche diagnostiqueTraitement

Évaluation de la sensibilité aux antibiotiques (méthodes phénotypiques et moléculaires)

Marqueurs épidémiologiques

Sessions pratiquesÉtude de cas et démarches diagnostiques



Mycobactéries et actinomycètes aérobies

n Programme

BAC.GRéf. :

157

n Objectifs

Savoir décrire les différents types de flore vaginaleIdentifier les infections génitales basses et hautesConnaître les germes responsables d’ISTIdentifier les bactéries responsables d’infections materno-fœtales et néonatales

n Prérequis

Connaissances de base en microbiologie cliniqueTechniques usuelles de bactériologie médicale

n PublicTechnicien, Biologiste

Durée

LieuCHU TOURS - HÔPITAL BRETONNEAU - 37000 TOURS

Intervenants Pr L. MEREGHETTIPr P. LANOTTE

NotesRemise d’un support de cours.Outils pédagogiques : Vidéoprojection,microscopes.Validation des acquis par QCM/QROC.Durée journalière habituelle de formation : 7 h.


PédagogieThéorie 70% - TP 20% - Étude de cas 10%

2 jours 13 h

Coût (net)995 e

BACTÉRIOLOGIE

Microbiote génital féminin- Composition de la flore génitale- Différents types de flores

Infections génitales basses- Mycoses- Vulvovaginites- Vaginoses

Infections génitales hautes- Endocervicites, endométrites et salpingites- Infections sexuellement transmises- Diagnostic par culture et par biologie moléculaire

Infections materno-foetales et néonatales- Bactéries à haut risque infectieux- Dépistage prénatal- Diagnostic des infections néonatales



Diagnostic bactériologique des infections génitales chez la femme et des infections du nouveau-né

BACTÉRIOLOGIE

n Programme

BAC.ISTRéf. :

158

n Objectifs

Connaître les germes responsables d’ISTMettre en œuvre les outils diagnostiques adaptés à chaque situation clinique et à chaque pathogène

n Prérequis

Connaissances de base en microbiologie cliniqueTechniques usuelles de bactériologie médicale

n PublicTechnicien, Biologiste

Durée

LieuCHU TOURS - HÔPITAL BRETONNEAU - 37000 TOURS

Intervenants Pr L. MEREGHETTIPr P. LANOTTE Dr C. LE BRUNPr C. GAUDY-GRAFFIN

NotesRemise d’un support de cours.Outils pédagogiques : Vidéoprojection,microscopes.Validation des acquis par QCM/QROC.Durée journalière habituelle de formation : 7 h.



1,5 jour 11 h

Coût (net)850 e

Bactéries responsables d’IST- Chlamydia trachomatis- Neisseria gonorrhoeae- Mycoplasma genitalium- Autres mycoplasmes génitaux- Treponema pallidum (syphilis)- Autres bactéries responsables d’ulcérations génitales

Virus responsables d’IST- Human papillomavirus



Infections sexuellement transmises

n Programme

PAR.H Réf. :

159

n Objectifs

Acquérir des connaissances de base en parasitologie afin de mener à bien les analyses de parasitologie réalisées dans un laboratoire polyvalent hospitalier ou privé

n Prérequis

Diplôme de technicien d’analyses biologiques ou équivalentn Public

Technicien, Cadre, Biologiste

Durée


Intervenants Dr S. HOUZE Dr D. HAOUCHINEDr N. ARGY

NotesRemise de documentation et support de cours.Outils pédagogiques : Vidéoprojection.Validation des acquis par reconnaissance sur lame.Durée journalière habituelle de formation : 7 h.

Heure de début 1er jour : 9h30 Heure de fin dernier jour : 16h30

PédagogieTP 50% - Théorie 30% - Démo 10% - TD 10%

5 jours 33 h

Coût (net)1 690 e

PARASITOLOGIE

Rappels sur les parasitesClassification, notions générales sur les cycles parasitairesHelminthes : Nématodes, Trématodes, CestodesProtozoaires : Rhizopodes, Sporozoaires, Flagellés, CiliésNotions sur les ectoparasites

Les parasitoses humainesRelations hôtes-parasitesNotions d’épidémiologie, de thérapeutique, de prophylaxie

Généralités sur les analyses de parasitologie

Coprologie parasitaireParasites les plus couramment observés : amibes, Giardia, oxyure, Ascaris…Réalisation des techniques de concentration et reconnaissances microscopiques

Parasites génito-urinairesÉtude de Trichomonas vaginalis

Parasites sanguinsParasites les plus couramment observés : Plasmodium, Leishmania, Toxoplasma, trypanosomes, filairesRéalisation de frottis et diagnostic différentiel des Plasmodium spp.



Parasitologie générale

n Programme

PAR.PMRéf. :

160

n Objectifs

Maitriser les techniques de base en Parasitologie Médicale et la conduite de l’examen parasitologique des selles et du sang

n Prérequis

Notions de Parasitologie Médicale : - Définition et classification des parasites responsables de pathologies humaines

digestives ou sanguines - Connaissance des cycles parasitaires concernant les parasites traités : mode de

contamination, agent vecteur, hôtes définitifs et intermédiaires- Principaux signes cliniques

n Public


Durée

LieuFACULTÉ DE PHARMACIE13000 MARSEILLE

Intervenants Pr. N. AZAS Dr A. DUMÈTREDr M. CASANOVA Dr A. COHEN

NotesRemise de documentation et support de cours.Outils pédagogiques : Vidéoprojection, échantillon de selles formolées.Validation des acquis par identification microscopique de parasites et test QCM/QROC.Durée journalière habituelle de formation : 7 h.


PédagogieTD 30% - Théorie 30% - TP 30% - Démo 10%

3 jours 19 h

Coût (net)1 350 e

PARASITOLOGIE

Phase pré-analytiqueExamen parasitologique au laboratoire

- Généralités- Qualité du prélèvement- Prélèvements et orientations diagnostiques

Phase analytiqueTechniques de base en coprologie parasitaire

- Conduite d’un examen de selles- Choix des techniques en fonction de la feuille de

demande- Examen direct et techniques de conservation et de

fixation des éléments parasitaires- Techniques de concentration parasitaire

Identification des parasites en coprologie parasitaire- Helminthes : Nématodes, Trématodes et Cestodes- Protozoaires : Amibes, Flagellés, Microsporidies

et Coccidies intestinales- Éléments non parasitaires / Diagnostic différentiel

Diagnostic des parasitoses du sang (identification)- Paludisme- Toxoplasmose- Trypanosomiases- Leishmanioses- Filarioses

Phase post-analytique Interprétation et rendu de résultats



Parasitologie médicale

n Programme

PAR.ERéf. :

161

n Objectifs

Acquérir les connaissances de base nécessaires pour maîtriser l’examen parasitologique des selles en pratique quotidienne : méthodes de recherche et d’identification des parasites intestinauxApprécier leur rôle pathogène

n Prérequis

Expérience de travail en laboratoire (manipulation, usage du microscope)Stage intensif - ouvert aux techniciens, cadres techniques et biologistes, y compris débutants - nécessitant une faculté d’assimilation rapide

n Public


Durée

LieuFACULTÉ DE MÉDECINE BICHAT 75018 PARIS

Intervenants Dr G. GALEAZZI Pr G. DREYFUSSMme F. ARDOIN Mme G. BRISSON

NotesRemise d’une documentation spécialisée.Outils pédagogiques : Vidéoprojection.Validation des acquis par lecture de lames.Durée journalière habituelle de formation : 7 h.


PédagogieTP 60% - Théorie 40%

4,5 jours 32 h

Coût (net)1 710 e

PARASITOLOGIE

Rappel des techniques de base de l’examen parasitologique des sellesConduite à tenirMéthodes de colorationMéthodes de concentration

Observations de parasites adultes et étude microscopique des éléments parasitaires comprenant la mensuration microscopiqueAmibesFlagellésCoccidies et autres protozoaires observés au cours du SIDA (cryptosporidies, microsporidies)NématodesCestodesDouvesSchistosomes

Épidémiologie et diagnostic biologique des principales parasitoses digestives

Évaluation des connaissances acquises



Techniques journalièresen parasitologie intestinale

n Programme

MYC.CRéf. :

162

n Objectifs

Maîtriser les techniques de base appliquées en Mycologie : prélèvement, examen direct, isolementIdentifier les espèces pathogènes les plus communément isolées en Mycologie médicaleIdentifier les principales espèces contaminantesApprécier leur rôle pathogène et leur importance en hygiène hospitalière

n Prérequis

Expérience de travail en laboratoire (manipulation, usage du microscope…)Stage intensif - ouvert aux techniciens, cadres techniques et biologistes, y compris débutants - nécessitant une faculté d’assimilation rapide

n Public


Durée


Intervenants Dr G. GALEAZZI Pr G. DREYFUSSDr A. PAUGAM Mme G. BRISSONMme N. SAMADET

NotesRemise d’une documentation spécialisée.Outils pédagogiques : Vidéoprojection.Possibilité de se constituer une mycothèque.Durée journalière habituelle de formation : 7 h.



5 jours 35 h

Coût (net)1 720 e

MYCOLOGIE

Rappel des techniques de base :Prélèvement mycologiqueExamen direct, ensemencementTechniques d’identification

Epidémiologie et clinique des principales mycoses 1 - Candidoses, Cryptococcose, Pityriasis versicolor

2 - Dermatophytoses et pseudo-dermatophytoses

3 - Aspergilloses

Conduite du diagnostic biologique d’une mycose :1 - Identification des principales levures isolées au

laboratoire : Candida sp., Cryptococcus sp., Trichosporum sp., Malassezia furfur …

2 - Identification des principaux dermatophytes pathogènes

3 - Identification des aspergillacés et des champignons contaminants les plus souvent isolés

Critères d’appréciation du rôle pathogène

Évaluation des connaissances acquises



Techniques journalières en mycologie

MYCOLOGIE

n Programme

MYC.HRéf. :

163

n Objectifs

Préciser la biologie et l’écologie des Dermatophytes et connaître l’épidémiologie des dermatophytoses Savoir reconnaître une lésion évocatrice de dermatophytose devant les différentes formes cliniquesConnaître l’importance d’une bonne exécution et de l’abondance du prélèvementReconnaître la prééminence de l’examen direct pour affirmer le diagnosticSavoir isoler et identifier les Dermatophytes

n Prérequis

Savoir utiliser un microscope optiqueConnaître les techniques de base de microbiologie

n Public


Durée

LieuFACULTÉ DE MÉDECINE34000 MONTPELLIER

Intervenants Dr N. BOURGEOIS Pr L. LACHAUDDr M. SASSO Dr P. RISPAILet collaborateurs

NotesRemise d’un support de cours (polycopié, CD, lames).Outils pédagogiques : Vidéoprojection, cultures, lames.Validation des acquis par test QCM/QROC.


PédagogieTP 40% - Théorie 20% - Démo 20% - Étude de cas 20%

2,5 jours 17 h

Coût (net)1 250 e

Définition, taxonomie, biologie et écologie des Dermatophytes impliqués en pathologie cutanéo-phanérienne chez l’Homme en Europe

Épidémiologie des dermatophytoses

Formes cliniques des dermatophytoses humaines européennes

Multiplicité des aspects cliniques, espèces impliquées, réservoirs, modes de contamination, éventuelle contagiosité

Apport au diagnostic de l’examen sous rayonnement ultra-violet (« lampe de Wood »)

Modalités de prélèvement de squames, poils, duvets et cheveux, fragments d‘ongle et de matière sous-unguéale

Prééminence de l’examen direct dans le diagnostic biologique, modalités d’examen direct après éclaircissement et après coloration. Démonstrations sur lames

Cultures mycologiques : milieux d’isolement et d’identification, modalités d’ensemencement et délais de croissance

Caractères macroscopiques et microscopiques d’identification spécifique d’Epidermophyton floccosum, des Microsporum (M. audouini, M. canis, M. gypseum,…), des Trichophyton (T. interdigitale, T. mentagrophytes, T. rubrum, T. soudanense, T. tonsurans, T. verrucosum, T. violaceum, …) et de quelques champignons filamenteux « opportunistes » impliqués dans les onychopathies fongiques (Aspergillus spp., Fusarium spp., Neoscytalidium spp, Onychocola spp., Scopulariopsis spp., …)

Apport des nouvelles techniques à l’identification des Dermatophytes (spectrométrie de masse, biologie moléculaire)

Démonstrations : Dermatophytes et Champignons filamenteux opportunistes- Examen direct de l’échantillon biologique (techniques,

lecture de lames)- Isolement et identification (cultures sur boîte et sur lame)

Synthèse et évaluation



Diagnostic des dermatophytoses Épidémiologie, Clinique, Prélèvements, Examen direct, Isolement et Identification

n Programme

WHSV1Réf. :

164

n Objectifs

Comprendre l’importance et les méthodes de contrôle de l’aéro-biocontamination fongiqueAcquérir les bases théoriques et pratiques de la reconnaissance des espèces fongiques de la flore atmosphérique (secteurs hospitaliers, agro-alimentaires, environnementaux, etc.)Initiation à l’identification de certaines espèces fongiques par biologie moléculaire

n Prérequis

Techniques usuelles en mycologien Public


Durée

LieuFACULTÉ DE MÉDECINE ET PHARMACIE - 69008 LYON

Intervenants Dr V. RODRIGUEZ-NAVADr D. BLAHA et collaborateurs

NotesRemise de documentation et support de cours. Outils pédagogiques : Vidéoprojection.Matériels utilisés : Microscopes, thermocycleur.Validation des acquis par identification de souches fongiques.Durée journalière habituelle de formation : 7 h.



3 jours 18 h

Coût (net)1 290 e

MYCOLOGIE

Généralités sur les champignons

Multiplication asexuée et identification

Reproduction sexuée et classification

Aéro-biocontamination et méthodes de contrôles

Reconnaissance des principales espèces opportunistes et contaminantes

Place de la détermination moléculaire des espèces fongiques (initiation et démonstration)

TRAVAUX PRATIQUES

Étude de genres : (liste non contractuelle et non limitative)Absidia, Acremonium, Alternaria, Anixiopsis, Aspergillus, Aureobasidium, Beauveria, Botrytis, Chaetomium, Cladosporium, Dreschlera, Fusarium, Geotrichum, Mucor, Paecilomyces, Penicillium, Phoma, Pseudaallescheria, Rhizopus, Scopulariopsis, Stachybothrys, Stemphylium, Trichoderma, Ulocladium, Verticillium, Wallemia, etc.



Aéro-biocontaminations et flore fongique atmosphérique

VIROLOGIE

n Programme

VIR.ERéf. :

165

n Objectifs

Comprendre les facteurs liés à l’émergence et la réémergence de nouveaux virus pathogènes pour l’hommeConnaître les règles de sécurité applicables au laboratoire lors de l’émergence de nouveaux agents infectieux et les techniques de diagnostic utilisables (Biologie Moléculaire et autres tests)

n Prérequis

Niveau Bac +2 ou 3n Public

Technicien, Cadre, Biologiste, Ingénieur, Médecin

Durée

LieuBIOFORMATION75015 PARIS

Intervenants Dr M. CERVANTES Dr Q. LEHINGRAT et collaborateurs

NotesRemise d’un support de cours. Outils pédagogiques : Vidéoprojection.Validation des acquis par test QCM/QROC.Durée journalière habituelle de formation : 7 h.

Heure de début 1er jour : 9h30 Heure de fin deuxième jour : 17h


2 jours 13 h

Coût (net)960 e

Structure et classification de virus

Historique des épidémies et retours d’expériences

Lien entre les zoonoses et les émergences de nouveaux agents pathogènes

Facteurs climatiques et sociodémographiques liés à l’émergence et réémergence de nouveaux virus

Règles de sécurité et manipulation au laboratoire devant un nouvel agent infectieux

Rappels de biologie moléculaire et cellulaire

Techniques appliquées au diagnostic et à la recherche de nouveaux virus- PCR en temps réel / multiplexage - Détection d’anticorps- Séquençage (classique, haut débit et portable)- Culture virale

Travaux Dirigés :Études de cas et mises en situation



Virus émergents et réémergents - Approche par la biologie moléculaire et autres techniques de diagnostic

n Programme

BP.I1 Réf. :

166

n Objectifs

Fournir au technicien de laboratoire et au biologiste, les bases utiles pour situer l’impact des analyses et aider à l’interprétation cliniqueActualisation des connaissances sur les virus des hépatites virales A, B, C, Delta, E (virologie, épidémiologie, histoire naturelle, diagnostic, thérapeutique)Maîtrise des demandes d’analyse en fonction du contexte cliniqueInterprétation des résultats et suivi des patients à moyen et long termesPoint sur l’évolution des techniques de diagnosticFocus phase pré-analytique et accréditation de ces dosages

n Prérequis

Pas de prérequis pour le personnel technique de laboratoiren Public


Durée

LieuBIOFORMATION75015 PARIS

Intervenants Dr. J. MARLETet collaborateurs

NotesRemise d’un support de cours.Outils pédagogiques : Vidéoprojection.Étude approfondie de cas cliniques sur divers thèmes.Durée journalière habituelle de formation : 7 h.



2 jours 14 h

Coût (net)980 e

VIROLOGIE

Rappels Caractéristiques des virus des hépatites virales A à E et des pathologies associéesÉpidémiologie et histoire naturelle

Diagnostic et suivi des hépatites virales Description, place et indications des différentes méthodes de diagnosticSchémas d’évolution et signification des différents marqueurs sérologiques et moléculaires de l’infection Prise en charge thérapeutique et suivi au laboratoire

Profils sérologiques atypiques et difficultés diagnostiques

Mutants du VHB : HBs et précore Mutants de résistance aux antiviraux (VHB, VHC)Co-infection VIH et immunodépression

Les marqueurs de fibrose et d’activité

Étude de cas concrets - Difficultés diagnostiques Proposition de prestation de conseils

Synthèse du stage



Rôle du laboratoire dans le diagnostic des infections virales - Les hépatites virales

VIROLOGIE

n Programme

VIR.ARéf. :

167

n Objectifs

Pratique de la surveillance du traitement anti-viral :- lors d’une infection par le VIH - dans les hépatites B et C chroniques

n Prérequis

Diplôme de technicien d’analyse médicale, DUT option analyse biologique, BTS option biochimie ou biologie appliquée, ou diplômes équivalents

n Public

Technicien, Cadre, Biologiste, Ingénieur, Chercheur

Durée

LieuC.H.R.U., HÔPITAL BRETONNEAU37000 TOURS

Intervenants Pr C. GAUDY-GRAFFIN Dr K. STEFICDr J. MARLET

NotesRemise de documentation et support de cours.Outils pédagogiques : Vidéoprojection.Appareils utilisés : Automates de PCR temps réel, Logiciels d’analyses de séquences et d’alignement.Outils d’interprétation des mutations de résistance.Durée journalière habituelle de formation : 7 h.


PédagogieThéorie 50% - Étude de cas - TD 50%

2 jours 10 h

Coût (net)980 e

1 - Formation théorique : multiplicité des antiviraux Présentation des différents cibles d’action des molécules antivirales – leur place dans le cycle de replicationLes molécules actuelles, les molécules futuresLes outils virologiques de la surveillance des traitements. Mesure de la charge virale / caractérisation des mutants d’échappementLes réponses virologiques à court terme et à long termeDéfinition d’algorithmes raisonnés pour éviter les échecs thérapeutiques ou les excès de prescriptions

2 - Démonstrations :La charge virale en PCR temps réel quantitative : interprétation, précautions et limiteLa recherche des mutations d’échappement par le séquençage des gènes clefs

3 - Ateliers pratiques :À partir de situations cliniques réelles : mise en situation d’interprétation de résultats de PCR quantitative et de prise de décision pour le séquençageIdentification des mutations significatives et implication pour le clinicienRédaction d’un compte-rendu de résultats



Surveillance des traitements anti-viraux Application au traitement du VIH et des hépatites B et C

Documents

Microbiologie · 2020. 6. 25. · Microbiologie. n . Programme Réf.: BAC.W 149. n Objectifs. Remise à niveau des connaissances de bases en bactériologie médicale Conduite et interprétation