44
Faculté de Médecine de Marseille, Aix-Marseille Université [email protected] Sciences Economiques & Sociales de la Santé & T raitement de l’Information Médicale Dr Julien Mancini Nombre de sujets nécessaires

Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

  • Upload
    others

  • View
    2

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Faculté de Médecine de Marseille, Aix-Marseille Université

[email protected]

Sciences Economiques & Sociales de la Santé& Traitement de l’Information Médicale

Dr Julien Mancini

Nombre de sujets nécessaires

Page 2: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Plan

1. Rappels

2. Situation

3. Puissance

4. Nombre de sujets nécessaires

5. Calcul

6. Comparaison de 2 pourcentages

7. Conclusion

Page 3: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

I. Rappels

Variabilité individuelle:

Individus tous différents

Variable: mesures différentes /individus

Distribution de la variable

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul7. Pourcentage6. Conclusion

Page 4: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul7. Pourcentage6. Conclusion

0

0,02

0,04

0,06

0,08

0,1

0,12

m

s2

0

0,02

0,04

0,06

0,08

0,1

0,12

m

s2

Page 5: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul7. Pourcentage6. Conclusion

0

0,02

0,04

0,06

0,08

0,1

0,12

m

sA2

sB2

0

0,02

0,04

0,06

0,08

0,1

0,12

m

sA2

sB2

Page 6: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Groupe A Groupe B

nA: nombre de sujets

mA: moyenne

s2A: variance

nB

mB

s2B

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul7. Pourcentage6. Conclusion

Page 7: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Groupe A Groupe B

nA: nombre de sujets

mA: moyenne

s2A: variance

nB

mB

s2B

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul7. Pourcentage6. Conclusion

Page 8: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Groupe A Groupe B

nA: nombre de sujets

mA: moyenne

s2A: variance

nB

mB

s2B

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul7. Pourcentage6. Conclusion

Page 9: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Groupe A Groupe B

nA: nombre de sujets

mA: moyenne

s2A: variance

nB

mB

s2B

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul7. Pourcentage6. Conclusion

Page 10: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Groupe A Groupe B

nA

mA

s2A

nB

mB

s2B

?

mA=mB

Test de comparaison de 2 moyennes

?

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul7. Pourcentage6. Conclusion

Page 11: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

II. Situation

Avant de débuter une étude:

Construction du protocole

Exemple:Facteur de risque de paludisme : présent (A)/absent (B)

Parasitémie à P. falciparum chez les enfants

Mais

2 groupes 2 observations différentes

Si la différence existe

pouvoir séparer les 2 groupes

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Page 12: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Analogie: le microscope

Si le biologiste ne voit rien

augmenter le grossissement

refaire le prélèvement

"ne rien voir" "n'existe pas"

Pouvoir séparateur1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Page 13: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Analogie: le microscope

Augmenter le grossissement :

dépend de la dimension

Pour un test : dépend de l'effet mA-mB

prendre plus d'enfants

Refaire le prélèvement :

Pour un test : prendre un autre échantillon (biais de sélection ?)

Pouvoir Séparateur = Puissance 1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Page 14: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

0

0,02

0,04

0,06

0,08

0,1

0,12

mAmB

mA mB

mA mB

mA mB

A B

B

B

B

A

A

A

0

0,02

0,04

0,06

0,08

0,1

0,120

0,02

0,04

0,06

0,08

0,1

0,12

mAmB

mA mB

mA mB

mA mB

A B

B

B

B

A

A

A

0

0,02

0,04

0,06

0,08

0,1

0,12

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Page 15: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

III. Puissance

2 Risques

Risque de 1ère espèce

=prob(rejet H0/H0 vraie)

=prob(Zzseuil /H0 vraie)

H0

-zseuil zseuil

0

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Page 16: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

H0

-zseuil zseuil

0

2 Risques

Risque de 1ère espèce

=prob(rejet H0/H0 vraie)

=prob(Zzseuil /H0 vraie)

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Page 17: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Risque de 2ème espèce

=prob(non rejet H0/H1 vraie)

=prob(Z<zseuil /H1 vraie)

-zseuil zseuil0

Puissance

1-

=prob(rejet H0/H1 vraie)

=prob(Zzseuil /H1 vraie)

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Page 18: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Capacité d'un test à montrer une différence

Dépend:

de la différence minimale d'intérêt

du nombre de sujets

de la variance

du risque

Puissance1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Page 19: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

IV. NSN

Pouvoir séparer les 2 groupes

Combien de sujets faut-il inclure dans chaque groupe ?

Objectif :

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Page 20: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Nombre de sujets nécessaire

pouvoir séparer 2 groupes (=puissance)

pour un effet (=différence) donné

pour une variance donnée

avec un risque d'erreur fixé

Définition1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Page 21: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Puissance d'un test statistique:

Capacité à montrer

un effet

lorsqu'il existe

En général puissance 80%

1. Le pouvoir séparateur

Paramètres1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Page 22: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Paramètres

2. L’effet

Différence minimale d'intérêt:

=mA-mB

Exemple :

Facteur de risque présent (A) vs absent (B)

Groupe A: mA= 5000 parasites /l

Groupe B: mB= 4500 parasites /l

Groupe A: mA= 5000 parasites /l

Groupe B: mB= 600 parasites /l

Pas d'intérêt

Intérêt++

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Page 23: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Choix difficile

Fonction du problème

Critères:

Biologiques

Cliniques

Pas statistique

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

L’effet

Page 24: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Variabilité de l'ensemble

Donnée par la connaissance:

Littérature

Étude préliminaire

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

3. La variance

Paramètres

Page 25: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

%5

Séparer 2 groupes à tort

mA-mB2z2z-

22

0mA-mB

2z2z- 2z-

22

0

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

4. Le risque d’erreur

Paramètres

Page 26: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

V. Calcul

Déterminer les 4 paramètres

Puissance 80% z puis.=-0,842 (loi Normale)

Différence minimale d'intérêt =3000

Variance (étude préliminaire) : s2=75.106

Risque =5% z /2=1,96 (loi Normale)

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Page 27: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

nombre de sujets nécessaires par groupe :

222

2

2 puisA zzs

n

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Formule

Page 28: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

222

2

2 puisA zzs

n

connaissance

À définir

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Formule

nombre de sujets nécessaires par groupe :

Page 29: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

222

2

2 puisA zzs

n

connaissance

À définir=5%

1,96

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

nombre de sujets nécessaires par groupe :

Formule

Page 30: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

222

2

2 puisA zzs

n

connaissance

À définir=5%

1,96

1-=80%

-0,842

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

nombre de sujets nécessaires par groupe :

Formule

Page 31: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

22

6

)842,0(96,13000

10.752 An

85,130An

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

nombre d'enfants nécessaires par groupe :

Calcul

Page 32: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Il faut inclure 131 enfants par groupe pour que:

on ait 80% de chance

de détecter un effet de +3000

pour une variance de s2=75.106

et avec un risque de =5%

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Résultat

Page 33: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Conditions d'applications de la formule

nA et nB 30

ou

Distributions Normales

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Application

Page 34: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Nombre d'enfants à inclure :

Au cours de l'étude : 10% de perte

inclure +10%

Au total : 131+14=145 enfants par groupe

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Inclusion

Page 35: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

VI. Pourcentages

Comparaison de 2 pourcentages observées

(Test Bilatéral)

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcent.7. Conclusion

2

21

2

2

)arcsin(arcsin2 PP

zzn

puis

A

Page 36: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

connaissance

VI. Pourcentages

Comparaison de 2 pourcentages observées

(Test Bilatéral)

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcent.7. Conclusion

2

21

2

2

)arcsin(arcsin2 PP

zzn

puis

A

À définir

Page 37: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

connaissance

=5%

1,96

VI. Pourcentages

Comparaison de 2 pourcentages observées

(Test Bilatéral)

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcent.7. Conclusion

2

21

2

2

)arcsin(arcsin2 PP

zzn

puis

A

À définir

Page 38: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

connaissance

=5%

1,96

1-=80%

-0,842

VI. Pourcentages

Comparaison de 2 pourcentages observées

(Test Bilatéral)

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcent.7. Conclusion

2

21

2

2

)arcsin(arcsin2 PP

zzn

puis

A

À définir

Page 39: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Exemple

Nouvelle étude :

Complication du paludisme chez les enfants

Facteur de risque de complication :

présent (A) / absent (B)

Risque de complication :

Avec le facteur de risque = 20%

Contre 10% dans la population de référence

(test bilatéral, puissance de 80% et seuil de significativité fixé à 5%)

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcent.7. Conclusion

Page 40: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Calcul1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcent.7. Conclusion

2

2

)20.0arcsin10.0(arcsin2

)842,0(96,1

An

7,194

)142,0(2

802,22

2

An

Page 41: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Résultat1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcent.7. Conclusion

Il faut inclure 195 enfants par groupe pour :

avoir 80% de chance

de détecter un effet de +10%

pour une probabilité de base de 10%

avec un risque de =5%

Page 42: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

VII. Conclusion

Nombre de sujets

nécessaire pour qu'un test statistique

puisse

avoir la puissance suffisante

pour montrer un effet minimum

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Page 43: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

Drs Julien Mancini – Jean Gaudart, SESSTIM, Faculté de Médecine, Aix-Marseille Université, 2018

Défaut de méthodologie

ne pas voir l'effet

d'un facteur de risque

d'un nouveau traitement

1. Rappels2. Situation3. Puissance4. NSN5. Calcul6. Pourcentage7. Conclusion

Éthique

Page 44: Principes de l’Evidence Based-Medicine (médecine basée sur

RéférencesJean Bouyer: Méthodes statistiques, Médecine-Biologie, éditions INSERM

[email protected]

http://sesstim.univ-amu.fr/

UMR1252 Sciences Economiques & Sociales de la Santé & Traitement de l’Information Médicale